Changeset 1019 for CONFIG/IPSLCM


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05/17/10 16:03:00 (12 years ago)
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cetlod
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CE : Update IPSLCM5A config for AR5 version of PISCES model

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CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A
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  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/EXP00/COMP/pisces.card

    r992 r1019  
    2323 
    2424[SmoothFiles] 
    25 List=   () 
     25List=  () 
    2626 
    2727[ParametersFiles] 
     
    6161Patches = (Patch_20091030_histcom_time_axis, Patch_20091118_mask) 
    6262GatherWithInternal = (nav_lon, nav_lat, deptht, time_counter) 
    63 TimeSeriesVars2D = (AlkaliniSFC, BFeSFC, BSiSFC, CHLTSFC, CaCO3SFC, DCHLSFC, DFeSFC, DICSFC, DOCSFC, DSiSFC, FerSFC, GOCSFC, INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, NCHLSFC, NFeSFC, NH4SFC, NO3SFC, O2MIN, O2SFC, PFETSFC, PHSFC, PHY2SFC, PHYSFC, PHYTSFC, PO4SFC, POCSFC, POCTSFC, SFeSFC, SiSFC, ZO2MIN, ZOO2SFC, ZOOSFC, ZOOTSFC) 
     63TimeSeriesVars2D = (INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, O2MIN, ZO2MIN ) 
    6464ChunckJob2D = NONE 
    6565TimeSeriesVars3D = (CHLT, EXPC, EXPCAL, EXPFE, EXPSI, PFET, PHYT, POCT, TPBFE, TPNEW, TPP, ZOOT) 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/EXP00/PARAM/iodef.xml

    r970 r1019  
    203203 
    204204      <!-- ptrc on T grid --> 
    205  
     205           
    206206     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    207        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" /> 
     207       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    208208       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    209        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mol-C/L" /> 
    210        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    211        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    212        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    213        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    214        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    215        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    216        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    217        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    218        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    219        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    220        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" /> 
    221        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    222        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    223        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    224        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" /> 
    225        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" /> 
    226        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    227        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    228        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    229        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    230        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
     209       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
     210       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     211       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     212       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
     213       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="molSi/L" /> 
     214       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
     215       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
     216       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="molC/L" /> 
     217       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     218       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
     219       <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
     220       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
     221       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
     222       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
     223       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
     224       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
     225       <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
     226       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     227       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
     228       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
     229       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     230       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    231231     </group> 
    232232 
     
    234234 
    235235     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    236        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"            axis_ref="deptht" /> 
    237        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    238        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    239        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"         axis_ref="deptht" /> 
    240        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    241        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    242        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    243        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    244        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    245        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    246        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    247        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    248        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    249        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    250        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol-N/m2/s"      /> 
    251        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol-C/m2/s"      /> 
    252        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
    253        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol-Si/m2/s"     /> 
    254        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol-C/m2/s"      /> 
    255        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s"      /> 
    256        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s"      /> 
    257        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" /> 
     236       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
     237       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     238       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     239       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
     240       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     241       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     242       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     243       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     244       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     245       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     246       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     247       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     248       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     249       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     250       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
     251       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
     252       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
     253       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="molSi/m2/s"     /> 
     254       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
     255       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
     256       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
     257       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
    258258       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
    259259       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
    260260       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
    261        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
     261       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"     /> 
    262262     </group> 
    263263 
    264  
    265264      <!-- dbio_T on T grid : variables available with key_diaar5 --> 
    266         
    267      <group id="dbio_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">   
    268        <field id="PHYT"        description="Total phytoplankton Concentration"                   unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
    269        <field id="ZOOT"        description="Total zooplankton Concentration"                     unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
    270        <field id="CHLT"        description="Total chlorophyll Concentration"                     unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
    271        <field id="POCT"        description="Total carbon particles Concentration"                unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
    272        <field id="PFET"        description="Total biogenic Iron Concentration"                   unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
    273        <field id="TPP"         description="Total Primary production of phyto"                   unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    274        <field id="TPNEW"       description="New Primary production of phyto"                     unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    275        <field id="TPBFE"       description="Total biogenic iron production"                      unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
    276        <field id="EXPC"        description="Export of carbon"                                    unit="mol-C/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    277        <field id="EXPFE"       description="Export of biogenic iron"                             unit="mol-Fe/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
    278        <field id="EXPSI"       description="Export of Silicate"                                  unit="mol-Si/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
    279        <field id="EXPCAL"      description="Export of Calcite"                                   unit="mol-C/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    280        <field id="DICSFC"      description="Dissolved inorganic Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
    281        <field id="AlkaliniSFC" description="Total Alkalinity Concentration at surface"           unit="eq/L"    /> 
    282        <field id="O2SFC"       description="Oxygen Concentration at surface"                     unit="mol-C/L" /> 
    283        <field id="CaCO3SFC"    description="Calcite Concentration at surface"                    unit="mol-C/L" /> 
    284        <field id="PO4SFC"      description="Phosphate Concentration at surface"                  unit="mol-C/L" /> 
    285        <field id="POCSFC"      description="Small organic carbon Concentration at surface"       unit="mol-C/L" /> 
    286        <field id="SiSFC"       description="Silicate Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    287        <field id="PHYSFC"      description="Nanophytoplankton Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    288        <field id="ZOOSFC"      description="Microzooplankton Concentration at surface"           unit="mol-C/L" /> 
    289        <field id="DOCSFC"      description="Dissolved organic Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    290        <field id="PHY2SFC"     description="Diatoms Concentration at surface"                    unit="mol-C/L" /> 
    291        <field id="ZOO2SFC"     description="Mesozooplankton Concentration at surface"            unit="mol-C/L" /> 
    292        <field id="BSiSFC"      description="Diatoms Silicate Concentration at surface"           unit="mol-C/L" /> 
    293        <field id="FerSFC"      description="Dissolved Iron Concentration at surface"             unit="mol-C/L" /> 
    294        <field id="BFeSFC"      description="Big iron particles Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    295        <field id="GOCSFC"      description="Big organic carbon Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    296        <field id="SFeSFC"      description="Small iron particles Concentration at surface"       unit="mol-C/L" /> 
    297        <field id="DFeSFC"      description="Diatoms iron  Concentration at surface"              unit="mol-C/L" /> 
    298        <field id="DSiSFC"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration at surface"  unit="mol-C/L" /> 
    299        <field id="NFeSFC"      description="Nano iron Concentration at surface"                  unit="mol-C/L" /> 
    300        <field id="NCHLSFC"     description="Nano chlorophyl Concentration at surface"            unit="mol-C/L" /> 
    301        <field id="DCHLSFC"     description="Diatoms chlorophyl Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    302        <field id="NO3SFC"      description="Nitrates Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    303        <field id="NH4SFC"      description="Ammonium Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    304        <field id="PHYTSFC"     description="Total phytoplankton Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
    305        <field id="ZOOTSFC"     description="Total zooplankton Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    306        <field id="CHLTSFC"     description="Total chlorophyll Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    307        <field id="POCTSFC"     description="Total carbon particles Concentration at surface"     unit="mol-C/L" /> 
    308        <field id="PFETSFC"     description="Total biogenic Iron Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
     265     <group id="dbio_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
     266       <field id="PHYT"        description="Total phytoplankton Concentration"                   unit="molC/L"     axis_ref="deptht" /> 
     267       <field id="ZOOT"        description="Total zooplankton Concentration"                     unit="molC/L"     axis_ref="deptht" /> 
     268       <field id="CHLT"        description="Total chlorophyll Concentration"                     unit="gChl/L"     axis_ref="deptht" /> 
     269       <field id="POCT"        description="Total carbon particles Concentration"                unit="molC/L"     axis_ref="deptht" /> 
     270       <field id="PFET"        description="Total biogenic Iron Concentration"                   unit="molFe/L"     axis_ref="deptht" /> 
     271       <field id="TPP"         description="Total Primary production of phyto"                   unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     272       <field id="TPNEW"       description="New Primary production of phyto"                     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     273       <field id="TPBFE"       description="Total biogenic iron production"                      unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     274       <field id="EXPC"        description="Export of carbon"                                    unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
     275       <field id="EXPFE"       description="Export of biogenic iron"                             unit="molFe/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     276       <field id="EXPSI"       description="Export of Silicate"                                  unit="molSi/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     277       <field id="EXPCAL"      description="Export of Calcite"                                   unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    309278       <field id="PHSFC"       description="PH at surface"                                       unit="-"       /> 
    310279       <field id="INTDIC"      description="DIC content"                                         unit="kg/m2"   /> 
    311        <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol-C/L" /> 
     280       <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="molC/L" /> 
    312281       <field id="ZO2MIN"      description="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"       /> 
    313        <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol-N/m2/s"  /> 
    314        <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol-C/m2/s"  /> 
    315        <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol-C/m2/s"  /> 
    316        <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol-C/m2/s"  /> 
    317        <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="mol-C/m2/s"  /> 
    318        <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol-Fe/m2/s" /> 
    319        <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol-Si/m2/s" /> 
    320        <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="mol-Si/m2/s" /> 
     282       <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="molN/m2/s"  /> 
     283       <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="molC/m2/s"  /> 
     284       <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="molC/m2/s"  /> 
     285       <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="molC/m2/s"  /> 
     286       <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="molC/m2/s"  /> 
     287       <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="molFe/m2/s" /> 
     288       <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="molSi/m2/s" /> 
     289       <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="molSi/m2/s" /> 
    321290     </group> 
    322         
     291 
    323292    </field_definition> 
    324293     
     
    656625          <field ref="EXPSI"       /> 
    657626          <field ref="EXPCAL"      /> 
    658           <field ref="DICSFC"      /> 
    659           <field ref="AlkaliniSFC" /> 
    660           <field ref="O2SFC"       /> 
    661           <field ref="CaCO3SFC"    /> 
    662           <field ref="PO4SFC"      /> 
    663           <field ref="POCSFC"      /> 
    664           <field ref="SiSFC"       /> 
    665           <field ref="PHYSFC"      /> 
    666           <field ref="ZOOSFC"      /> 
    667           <field ref="DOCSFC"      /> 
    668           <field ref="PHY2SFC"     /> 
    669           <field ref="ZOO2SFC"     /> 
    670           <field ref="BSiSFC"      /> 
    671           <field ref="FerSFC"      /> 
    672           <field ref="BFeSFC"      /> 
    673           <field ref="GOCSFC"      /> 
    674           <field ref="SFeSFC"      /> 
    675           <field ref="DFeSFC"      /> 
    676           <field ref="DSiSFC"      /> 
    677           <field ref="NFeSFC"      /> 
    678           <field ref="NCHLSFC"     /> 
    679           <field ref="DCHLSFC"     /> 
    680           <field ref="NO3SFC"      /> 
    681           <field ref="NH4SFC"      /> 
    682           <field ref="PHYTSFC"     /> 
    683           <field ref="ZOOTSFC"     /> 
    684           <field ref="CHLTSFC"     /> 
    685           <field ref="POCTSFC"     /> 
    686           <field ref="PFETSFC"     /> 
    687           <field ref="PHSFC"       /> 
    688627          <field ref="INTDIC"      /> 
    689628          <field ref="O2MIN"       /> 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/EXP00/PARAM/namelist_pisces_ORCA2

    r944 r1019  
    4141   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4242   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     43   caco3r     =  0.15      ! mean rain ratio 
    4444/ 
    4545!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/EXP00/PARAM/namelist_top_ORCA2

    r944 r1019  
    2020   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
    2121! 
    22 !              !    name   !           title of the field              !   units   ! initial data ! save   ! 
    23 !              !           !                                           !           ! from file    ! or not !  
    24 !              !           !                                           !           ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.      ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    31    tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    32    tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    33    tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    34    tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    35    tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    36    tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    37    tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    38    tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    39    tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    40    tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    41    tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    42    tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    43    tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    44    tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    45    tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    46    tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    47    tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    48    tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
     22!              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
     23!              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
     24!              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     25   tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     26   tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
     27   tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'molO2/L' ,  .true.     ,  .true. 
     28   tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     29   tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     30   tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     31   tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'molSi/L' ,  .true.     ,  .true. 
     32   tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     33   tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     34   tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     35   tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     36   tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     37   tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     38   tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'molFe/L' ,  .true.     ,  .true. 
     39   tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     40   tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     41   tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     42   tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     43   tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     44   tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     46   tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     47   tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     48   tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
    4949/ 
    5050!----------------------------------------------------------------------- 
     
    5656   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    5757   ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    58    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smolar. scheme  
    59    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smolar. scheme  
    60    crosster         =  .false.  !  computes Smolar crossterms (T) or not (F) 
     58   rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smol-Car. scheme  
     59   ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smol-Car. scheme  
     60   crosster         =  .false.  !  computes Smol-Car crossterms (T) or not (F) 
    6161/ 
    6262!----------------------------------------------------------------------- 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/historical/COMP/pisces.card

    r988 r1019  
    2323 
    2424[SmoothFiles] 
    25 List=   () 
     25List=  () 
    2626 
    2727[ParametersFiles] 
     
    6161Patches = (Patch_20091030_histcom_time_axis, Patch_20091118_mask) 
    6262GatherWithInternal = (nav_lon, nav_lat, deptht, time_counter) 
    63 TimeSeriesVars2D = (AlkaliniSFC, BFeSFC, BSiSFC, CHLTSFC, CaCO3SFC, DCHLSFC, DFeSFC, DICSFC, DOCSFC, DSiSFC, FerSFC, GOCSFC, INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, NCHLSFC, NFeSFC, NH4SFC, NO3SFC, O2MIN, O2SFC, PFETSFC, PHSFC, PHY2SFC, PHYSFC, PHYTSFC, PO4SFC, POCSFC, POCTSFC, SFeSFC, SiSFC, ZO2MIN, ZOO2SFC, ZOOSFC, ZOOTSFC) 
     63TimeSeriesVars2D = (INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, O2MIN, ZO2MIN ) 
    6464ChunckJob2D = NONE 
    6565TimeSeriesVars3D = (CHLT, EXPC, EXPCAL, EXPFE, EXPSI, PFET, PHYT, POCT, TPBFE, TPNEW, TPP, ZOOT) 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/historical/COMP/pisces.driver

    r972 r1019  
    1111} 
    1212 
    13     ##--Variables used by OPA -- 
    14  
    15  
    1613    ##--Variables used by MBG -- 
    1714 
     
    2320    PAT_TOP_LRSTTR=$( supergrep ln_rsttr          ${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_${RESOL_OCE} ) 
    2421    PAT_TOP_NRSTTR=$( supergrep nrsttr            ${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_${RESOL_OCE} ) 
     22    PAT_PIS_ATCCO2=$( supergrep atcco2            ${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_${RESOL_OCE} ) 
    2523    PAT_PIS_LRIVER=$( supergrep ln_river          ${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_${RESOL_OCE} ) 
    2624 
     
    6058    fi 
    6159 
     60    ##-- GHG forcing for the current year 
     61    IPCC_PIS_CO2=`grep Annee_${year} CO2_1765_2005.txt | awk -F= '{print $2}'` 
     62 
    6263    ##-- Update namelist_top and namelist_pisces  
    6364 
     
    6869    IGCM_sys_Mv namelist_top.tmp namelist_top 
    6970 
    70     sed -e "s%${PAT_PIS_LRIVER}%          ln_river=${PISCES_LRIVER}%"                \ 
     71    sed -e "s%${PAT_PIS_ATCCO2}%          atcco2=${IPCC_PIS_CO2}%"                \ 
     72        -e "s%${PAT_PIS_LRIVER}%          ln_river=${PISCES_LRIVER}%"                \ 
    7173        namelist_pisces > namelist_pisces.tmp 
    7274 
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    219        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    220        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" /> 
    221        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
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    223        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    224        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" /> 
    225        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" /> 
    226        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    227        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    228        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
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     210       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     211       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
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    237        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
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    240        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
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    244        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    245        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    246        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    247        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    248        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    249        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    250        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol-N/m2/s"      /> 
    251        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol-C/m2/s"      /> 
    252        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
    253        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol-Si/m2/s"     /> 
    254        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol-C/m2/s"      /> 
    255        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s"      /> 
    256        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s"      /> 
    257        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" /> 
     236       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
     237       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     238       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     239       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
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     249       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     250       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
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     254       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
     255       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
     256       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
     257       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
    258258       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
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    284        <field id="PO4SFC"      description="Phosphate Concentration at surface"                  unit="mol-C/L" /> 
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    288        <field id="ZOOSFC"      description="Microzooplankton Concentration at surface"           unit="mol-C/L" /> 
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    293        <field id="FerSFC"      description="Dissolved Iron Concentration at surface"             unit="mol-C/L" /> 
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    300        <field id="NCHLSFC"     description="Nano chlorophyl Concentration at surface"            unit="mol-C/L" /> 
    301        <field id="DCHLSFC"     description="Diatoms chlorophyl Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
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     270       <field id="PFET"        description="Total biogenic Iron Concentration"                   unit="molFe/L"     axis_ref="deptht" /> 
     271       <field id="TPP"         description="Total Primary production of phyto"                   unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     272       <field id="TPNEW"       description="New Primary production of phyto"                     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     273       <field id="TPBFE"       description="Total biogenic iron production"                      unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     274       <field id="EXPC"        description="Export of carbon"                                    unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
     275       <field id="EXPFE"       description="Export of biogenic iron"                             unit="molFe/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     276       <field id="EXPSI"       description="Export of Silicate"                                  unit="molSi/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     277       <field id="EXPCAL"      description="Export of Calcite"                                   unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    309278       <field id="PHSFC"       description="PH at surface"                                       unit="-"       /> 
    310279       <field id="INTDIC"      description="DIC content"                                         unit="kg/m2"   /> 
    311        <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol-C/L" /> 
     280       <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="molC/L" /> 
    312281       <field id="ZO2MIN"      description="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"       /> 
    313        <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol-N/m2/s"  /> 
    314        <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol-C/m2/s"  /> 
    315        <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol-C/m2/s"  /> 
    316        <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol-C/m2/s"  /> 
    317        <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="mol-C/m2/s"  /> 
    318        <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol-Fe/m2/s" /> 
    319        <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol-Si/m2/s" /> 
    320        <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="mol-Si/m2/s" /> 
     282       <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="molN/m2/s"  /> 
     283       <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="molC/m2/s"  /> 
     284       <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="molC/m2/s"  /> 
     285       <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="molC/m2/s"  /> 
     286       <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="molC/m2/s"  /> 
     287       <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="molFe/m2/s" /> 
     288       <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="molSi/m2/s" /> 
     289       <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="molSi/m2/s" /> 
    321290     </group> 
    322         
     291 
    323292    </field_definition> 
    324293     
     
    656625          <field ref="EXPSI"       /> 
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    689628          <field ref="O2MIN"       /> 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/historical/PARAM/namelist_pisces_ORCA2

    r944 r1019  
    4141   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4242   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     43   caco3r     =  0.15      ! mean rain ratio 
    4444/ 
    4545!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/historical/PARAM/namelist_top_ORCA2

    r944 r1019  
    2020   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
    2121! 
    22 !              !    name   !           title of the field              !   units   ! initial data ! save   ! 
    23 !              !           !                                           !           ! from file    ! or not !  
    24 !              !           !                                           !           ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.      ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    31    tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    32    tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    33    tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    34    tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    35    tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    36    tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    37    tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    38    tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    39    tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    40    tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    41    tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    42    tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    43    tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    44    tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    45    tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    46    tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    47    tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    48    tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
     22!              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
     23!              !           !                                           !            ! from file    ! or not !  
     24!              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     25   tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     26   tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
     27   tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'molO2/L' ,  .true.     ,  .true. 
     28   tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     29   tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     30   tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     31   tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'molSi/L' ,  .true.     ,  .true. 
     32   tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     33   tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     34   tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     35   tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     36   tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     37   tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     38   tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'molFe/L' ,  .true.     ,  .true. 
     39   tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     40   tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     41   tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     42   tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     43   tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     44   tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     46   tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     47   tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     48   tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
    4949/ 
    5050!----------------------------------------------------------------------- 
     
    5656   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    5757   ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    58    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smolar. scheme  
    59    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smolar. scheme  
    60    crosster         =  .false.  !  computes Smolar crossterms (T) or not (F) 
     58   rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smol-Car. scheme  
     59   ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smol-Car. scheme  
     60   crosster         =  .false.  !  computes Smol-Car crossterms (T) or not (F) 
    6161/ 
    6262!----------------------------------------------------------------------- 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/piControl/COMP/pisces.card

    r992 r1019  
    2323 
    2424[SmoothFiles] 
    25 List=   () 
     25List=  () 
    2626 
    2727[ParametersFiles] 
     
    6161Patches = (Patch_20091030_histcom_time_axis, Patch_20091118_mask) 
    6262GatherWithInternal = (nav_lon, nav_lat, deptht, time_counter) 
    63 TimeSeriesVars2D = (AlkaliniSFC, BFeSFC, BSiSFC, CHLTSFC, CaCO3SFC, DCHLSFC, DFeSFC, DICSFC, DOCSFC, DSiSFC, FerSFC, GOCSFC, INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, NCHLSFC, NFeSFC, NH4SFC, NO3SFC, O2MIN, O2SFC, PFETSFC, PHSFC, PHY2SFC, PHYSFC, PHYTSFC, PO4SFC, POCSFC, POCTSFC, SFeSFC, SiSFC, ZO2MIN, ZOO2SFC, ZOOSFC, ZOOTSFC) 
     63TimeSeriesVars2D = (INTDIC, INTNFIX, INTPBFE, INTPBSI, INTPCAL, INTPNEW, INTPP, INTPPPHY, INTPPPHY2, O2MIN, ZO2MIN ) 
    6464ChunckJob2D = NONE 
    6565TimeSeriesVars3D = (CHLT, EXPC, EXPCAL, EXPFE, EXPSI, PFET, PHYT, POCT, TPBFE, TPNEW, TPP, ZOOT) 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/piControl/PARAM/iodef.xml

    r970 r1019  
    203203 
    204204      <!-- ptrc on T grid --> 
    205  
     205           
    206206     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">   
    207        <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" /> 
     207       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="molC/L" /> 
    208208       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L"    /> 
    209        <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mol-C/L" /> 
    210        <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    211        <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    212        <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    213        <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    214        <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    215        <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    216        <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" /> 
    217        <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" /> 
    218        <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    219        <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" /> 
    220        <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" /> 
    221        <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    222        <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    223        <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" /> 
    224        <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" /> 
    225        <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" /> 
    226        <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" /> 
    227        <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" /> 
    228        <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" /> 
    229        <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
    230        <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" /> 
     209       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="molO2/L" /> 
     210       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     211       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     212       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="molC/L" /> 
     213       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="molSi/L" /> 
     214       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="molC/L" /> 
     215       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="molC/L" /> 
     216       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="molC/L" /> 
     217       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="molC/L" /> 
     218       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="molC/L" /> 
     219       <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="molC/L" /> 
     220       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="molFe/L" /> 
     221       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="molFe/L" /> 
     222       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="molC/L" /> 
     223       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="molFe/L" /> 
     224       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="molFe/L" /> 
     225       <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="molC/L" /> 
     226       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="molC/L" /> 
     227       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="gChl/L" /> 
     228       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="gChl/L" /> 
     229       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="molC/L" /> 
     230       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="molC/L" /> 
    231231     </group> 
    232232 
     
    234234 
    235235     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
    236        <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"            axis_ref="deptht" /> 
    237        <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    238        <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"        axis_ref="deptht" /> 
    239        <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"         axis_ref="deptht" /> 
    240        <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    241        <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    242        <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    243        <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    244        <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    245        <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    246        <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    247        <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    248        <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    249        <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol-C/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
    250        <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol-N/m2/s"      /> 
    251        <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol-C/m2/s"      /> 
    252        <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
    253        <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol-Si/m2/s"     /> 
    254        <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol-C/m2/s"      /> 
    255        <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s"      /> 
    256        <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s"      /> 
    257        <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" /> 
     236       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
     237       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     238       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" /> 
     239       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" /> 
     240       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     241       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     242       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     243       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     244       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="molSi/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     245       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     246       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="molFe/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     247       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     248       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     249       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="molC/m3/s"   axis_ref="deptht" /> 
     250       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="molN/m2/s"      /> 
     251       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="molC/m2/s"      /> 
     252       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="molFe/m2/s"     /> 
     253       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="molSi/m2/s"     /> 
     254       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="molC/m2/s"      /> 
     255       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="molC/m2/s"      /> 
     256       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="molC/m2/s"      /> 
     257       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="molC/m2/s/uatm" /> 
    258258       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"            /> 
    259259       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"            /> 
    260260       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"               /> 
    261        <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s"     /> 
     261       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="molFe/m2/s"     /> 
    262262     </group> 
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    271        <field id="POCT"        description="Total carbon particles Concentration"                unit="mol-C/L"     axis_ref="deptht" /> 
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    273        <field id="TPP"         description="Total Primary production of phyto"                   unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    274        <field id="TPNEW"       description="New Primary production of phyto"                     unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
    275        <field id="TPBFE"       description="Total biogenic iron production"                      unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
    276        <field id="EXPC"        description="Export of carbon"                                    unit="mol-C/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    277        <field id="EXPFE"       description="Export of biogenic iron"                             unit="mol-Fe/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
    278        <field id="EXPSI"       description="Export of Silicate"                                  unit="mol-Si/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
    279        <field id="EXPCAL"      description="Export of Calcite"                                   unit="mol-C/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    280        <field id="DICSFC"      description="Dissolved inorganic Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
    281        <field id="AlkaliniSFC" description="Total Alkalinity Concentration at surface"           unit="eq/L"    /> 
    282        <field id="O2SFC"       description="Oxygen Concentration at surface"                     unit="mol-C/L" /> 
    283        <field id="CaCO3SFC"    description="Calcite Concentration at surface"                    unit="mol-C/L" /> 
    284        <field id="PO4SFC"      description="Phosphate Concentration at surface"                  unit="mol-C/L" /> 
    285        <field id="POCSFC"      description="Small organic carbon Concentration at surface"       unit="mol-C/L" /> 
    286        <field id="SiSFC"       description="Silicate Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    287        <field id="PHYSFC"      description="Nanophytoplankton Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    288        <field id="ZOOSFC"      description="Microzooplankton Concentration at surface"           unit="mol-C/L" /> 
    289        <field id="DOCSFC"      description="Dissolved organic Concentration at surface"          unit="mol-C/L" /> 
    290        <field id="PHY2SFC"     description="Diatoms Concentration at surface"                    unit="mol-C/L" /> 
    291        <field id="ZOO2SFC"     description="Mesozooplankton Concentration at surface"            unit="mol-C/L" /> 
    292        <field id="BSiSFC"      description="Diatoms Silicate Concentration at surface"           unit="mol-C/L" /> 
    293        <field id="FerSFC"      description="Dissolved Iron Concentration at surface"             unit="mol-C/L" /> 
    294        <field id="BFeSFC"      description="Big iron particles Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    295        <field id="GOCSFC"      description="Big organic carbon Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    296        <field id="SFeSFC"      description="Small iron particles Concentration at surface"       unit="mol-C/L" /> 
    297        <field id="DFeSFC"      description="Diatoms iron  Concentration at surface"              unit="mol-C/L" /> 
    298        <field id="DSiSFC"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration at surface"  unit="mol-C/L" /> 
    299        <field id="NFeSFC"      description="Nano iron Concentration at surface"                  unit="mol-C/L" /> 
    300        <field id="NCHLSFC"     description="Nano chlorophyl Concentration at surface"            unit="mol-C/L" /> 
    301        <field id="DCHLSFC"     description="Diatoms chlorophyl Concentration at surface"         unit="mol-C/L" /> 
    302        <field id="NO3SFC"      description="Nitrates Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    303        <field id="NH4SFC"      description="Ammonium Concentration at surface"                   unit="mol-C/L" /> 
    304        <field id="PHYTSFC"     description="Total phytoplankton Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
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    308        <field id="PFETSFC"     description="Total biogenic Iron Concentration at surface"        unit="mol-C/L" /> 
     265     <group id="dbio_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
     266       <field id="PHYT"        description="Total phytoplankton Concentration"                   unit="molC/L"     axis_ref="deptht" /> 
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     269       <field id="POCT"        description="Total carbon particles Concentration"                unit="molC/L"     axis_ref="deptht" /> 
     270       <field id="PFET"        description="Total biogenic Iron Concentration"                   unit="molFe/L"     axis_ref="deptht" /> 
     271       <field id="TPP"         description="Total Primary production of phyto"                   unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     272       <field id="TPNEW"       description="New Primary production of phyto"                     unit="molC/m3/s"  axis_ref="deptht" /> 
     273       <field id="TPBFE"       description="Total biogenic iron production"                      unit="molFe/m3/s" axis_ref="deptht" /> 
     274       <field id="EXPC"        description="Export of carbon"                                    unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
     275       <field id="EXPFE"       description="Export of biogenic iron"                             unit="molFe/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     276       <field id="EXPSI"       description="Export of Silicate"                                  unit="molSi/m2/s" axis_ref="deptht" /> 
     277       <field id="EXPCAL"      description="Export of Calcite"                                   unit="molC/m2/s"  axis_ref="deptht" /> 
    309278       <field id="PHSFC"       description="PH at surface"                                       unit="-"       /> 
    310279       <field id="INTDIC"      description="DIC content"                                         unit="kg/m2"   /> 
    311        <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="mol-C/L" /> 
     280       <field id="O2MIN"       description="Oxygen minimum concentration"                        unit="molC/L" /> 
    312281       <field id="ZO2MIN"      description="Depth of oxygen minimum concentration"               unit="m"       /> 
    313        <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="mol-N/m2/s"  /> 
    314        <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="mol-C/m2/s"  /> 
    315        <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="mol-C/m2/s"  /> 
    316        <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="mol-C/m2/s"  /> 
    317        <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="mol-C/m2/s"  /> 
    318        <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="mol-Fe/m2/s" /> 
    319        <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="mol-Si/m2/s" /> 
    320        <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="mol-Si/m2/s" /> 
     282       <field id="INTNFIX"     description="Nitrogen fixation rate : vert. integrated"           unit="molN/m2/s"  /> 
     283       <field id="INTPPPHY"    description="Vertically integrated primary production by nanophy" unit="molC/m2/s"  /> 
     284       <field id="INTPPPHY2"   description="Vertically integrated primary production by diatom"  unit="molC/m2/s"  /> 
     285       <field id="INTPP"       description="Vertically integrated primary production by phyto"   unit="molC/m2/s"  /> 
     286       <field id="INTPNEW"     description="Vertically integrated new primary production"        unit="molC/m2/s"  /> 
     287       <field id="INTPBFE"     description="Vertically integrated of biogenic iron production"   unit="molFe/m2/s" /> 
     288       <field id="INTPBSI"     description="Vertically integrated of biogenic Si production"     unit="molSi/m2/s" /> 
     289       <field id="INTPCAL"     description="Vertically integrated of calcite production"         unit="molSi/m2/s" /> 
    321290     </group> 
    322         
     291 
    323292    </field_definition> 
    324293     
     
    656625          <field ref="EXPSI"       /> 
    657626          <field ref="EXPCAL"      /> 
    658           <field ref="DICSFC"      /> 
    659           <field ref="AlkaliniSFC" /> 
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    689628          <field ref="O2MIN"       /> 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/piControl/PARAM/namelist_pisces_ORCA2

    r944 r1019  
    4141   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    4242   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    43    caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio 
     43   caco3r     =  0.15      ! mean rain ratio 
    4444/ 
    4545!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
  • CONFIG/IPSLCM/IPSLCM5A/piControl/PARAM/namelist_top_ORCA2

    r944 r1019  
    2020   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. tracer restart name (output) 
    2121! 
    22 !              !    name   !           title of the field              !   units   ! initial data ! save   ! 
    23 !              !           !                                           !           ! from file    ! or not !  
    24 !              !           !                                           !           ! or not       !        ! 
    25    tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    26    tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.      ,  .true. 
    27    tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    28    tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    29    tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    30    tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    31    tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    32    tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    33    tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    34    tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    35    tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    36    tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    37    tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    38    tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    39    tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    40    tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    41    tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    42    tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    43    tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    44    tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    45    tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    46    tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
    47    tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .true.      ,  .true. 
    48    tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'mol-C/L' ,  .false.     ,  .true. 
     22!              !    name   !           title of the field              !   units    ! initial data ! save   ! 
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     24!              !           !                                           !            ! or not       !        ! 
     25   tracer(1)   = 'DIC     ' , 'Dissolved inorganic Concentration      ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     26   tracer(2)   = 'Alkalini' , 'Total Alkalinity Concentration         ',  'eq/L '   ,  .true.     ,  .true. 
     27   tracer(3)   = 'O2      ' , 'Dissolved Oxygen Concentration         ',  'molO2/L' ,  .true.     ,  .true. 
     28   tracer(4)   = 'CaCO3   ' , 'Calcite Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     29   tracer(5)   = 'PO4     ' , 'Phosphate Concentration                ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     30   tracer(6)   = 'POC     ' , 'Small organic carbon Concentration     ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     31   tracer(7)   = 'Si      ' , 'Silicate Concentration                 ',  'molSi/L' ,  .true.     ,  .true. 
     32   tracer(8)   = 'PHY     ' , 'Nanophytoplankton Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     33   tracer(9)   = 'ZOO     ' , 'Microzooplankton Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     34   tracer(10)  = 'DOC     ' , 'Dissolved organic Concentration        ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     35   tracer(11)  = 'PHY2    ' , 'Diatoms Concentration                  ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     36   tracer(12)  = 'ZOO2    ' , 'Mesozooplankton Concentration          ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     37   tracer(13)  = 'BSi     ' , 'Diatoms Silicate Concentration         ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     38   tracer(14)  = 'Fer     ' , 'Dissolved Iron Concentration           ',  'molFe/L' ,  .true.     ,  .true. 
     39   tracer(15)  = 'BFe     ' , 'Big iron particles Concentration       ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     40   tracer(16)  = 'GOC     ' , 'Big organic carbon Concentration       ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     41   tracer(17)  = 'SFe     ' , 'Small iron particles Concentration     ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     42   tracer(18)  = 'DFe     ' , 'Diatoms iron  Concentration            ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     43   tracer(19)  = 'DSi     ' , 'Sinking biogenic Silicate Concentration',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     44   tracer(20)  = 'NFe     ' , 'Nano iron Concentration                ',  'molFe/L' ,  .false.    ,  .true. 
     45   tracer(21)  = 'NCHL    ' , 'Nano chlorophyl Concentration          ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     46   tracer(22)  = 'DCHL    ' , 'Diatoms chlorophyl Concentration       ',  'gChl/L'  ,  .false.    ,  .true. 
     47   tracer(23)  = 'NO3     ' , 'Nitrates Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .true.     ,  .true. 
     48   tracer(24)  = 'NH4     ' , 'Ammonium Concentration                 ',  'molC/L'  ,  .false.    ,  .true. 
    4949/ 
    5050!----------------------------------------------------------------------- 
     
    5656   ln_trcadv_muscl2 =  .false.  !  MUSCL2 scheme + cen2 at boundaries 
    5757   ln_trcadv_smolar =  .false.  !  SMOLAR scheme 
    58    rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smolar. scheme  
    59    ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smolar. scheme  
    60    crosster         =  .false.  !  computes Smolar crossterms (T) or not (F) 
     58   rsc              =  1.       !  tuning coefficient for Smol-Car. scheme  
     59   ncortrc          =  1        !  number of corrective phases for Smol-Car. scheme  
     60   crosster         =  .false.  !  computes Smol-Car crossterms (T) or not (F) 
    6161/ 
    6262!----------------------------------------------------------------------- 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.