Changeset 3254


Ignore:
Timestamp:
05/17/17 09:49:43 (6 years ago)
Author:
flavoni
Message:

update

Location:
CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev
Files:
8 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/COMP/lim3.card

    r3219 r3254  
    2828 
    2929[OutputFiles] 
    30 List=   (${config_UserChoices_JobName}_1m_icemod.nc, ${R_OUT_ICE_O_M}/${PREFIX}_1M_icemod.nc, Post_1M_icemod ) 
     30List=   (${config_UserChoices_JobName}_1m_icemod.nc, ${R_OUT_ICE_O_M}/${PREFIX}_1M_icemod.nc, Post_1M_icemod ),\ 
     31        (${config_UserChoices_JobName}_1m_SBC_scalar.nc, ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1M_SBC_scalar.nc , NONE  ),\ 
     32        (${config_UserChoices_JobName}_1m_SBC.nc       , ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1M_SBC.nc        , NONE  ) 
     33 
    3134 
    3235[Post_1M_icemod] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/COMP/opa9.card

    r3219 r3254  
    6565[RestartFiles] 
    6666List=   (${config_UserChoices_JobName}_${NEMO_END}_restart.nc,  restart.nc, restart.nc), \ 
     67        (${config_UserChoices_JobName}_icebergs_${NEMO_END}_restart.nc,  restart_icebergs.nc, restart_icebergs.nc), \ 
    6768        (EMPave.dat,  EMPave.dat, EMPave_old.dat) 
    6869 
    … …  
    7677        (${config_UserChoices_JobName}_1y_grid_V.nc    , ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1Y_grid_V.nc     , NONE          ),\ 
    7778        (${config_UserChoices_JobName}_1y_grid_W.nc    , ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1Y_grid_W.nc     , NONE          ),\ 
    78         (${config_UserChoices_JobName}_1y_SBC.nc       , ${R_OUT_OCE_O_Y}/${PREFIX}_1Y_SBC.nc        , NONE          ),\ 
    7979        (${config_UserChoices_JobName}_1m_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_M}/${PREFIX}_1M_grid_T.nc     , Post_1M_grid_T),\ 
    8080        (${config_UserChoices_JobName}_5d_grid_T.nc    , ${R_OUT_OCE_O_D}/${PREFIX}_5D_grid_T.nc     , NONE          ),\ 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/COMP/pisces.card

    r3221 r3254  
    4444List=   (${config_UserChoices_JobName}_1y_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_Y}/${PREFIX}_1Y_ptrc_T.nc    , Post_1Y_ptrc_T   ) , \ 
    4545        (${config_UserChoices_JobName}_1y_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_Y}/${PREFIX}_1Y_diad_T.nc    , Post_1Y_diad_T   ) , \ 
     46        (${config_UserChoices_JobName}_1y_bioscalar.nc     , ${R_OUT_MBG_O_Y}/${PREFIX}_1Y_bioscalar.nc , Post_1Y_bioscalar) , \ 
    4647        (${config_UserChoices_JobName}_1m_ptrc_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_ptrc_T.nc    , Post_1M_ptrc_T   ) , \ 
    4748        (${config_UserChoices_JobName}_1m_diad_T.nc        , ${R_OUT_MBG_O_M}/${PREFIX}_1M_diad_T.nc    , Post_1M_diad_T   )  
    … …  
    4950 
    5051[Post_1D_bioscalar] 
    51 Patches = () 
    52 GatherWithInternal = (time_counter, time_instant, time_instant_bounds) 
    53 TimeSeriesVars2D = (pno3tot, ppo4tot, psiltot, palktot, pfertot, tcflx, tcflxcum, tcexp, tintpp, tnfix, tdenit) 
    54 ChunckJob2D = OFF 
    55 TimeSeriesVars3D = () 
    56 ChunckJob3D = 50Y 
    57 Seasonal=OFF 
    58  
    59 [Post_1M_bioscalar] 
    6052Patches = () 
    6153GatherWithInternal = (time_counter, time_instant, time_instant_bounds) 
    … …  
    8476Seasonal=ON 
    8577 
     78[Post_1Y_bioscalar] 
     79Patches = () 
     80GatherWithInternal = (time_counter, time_instant, time_instant_bounds) 
     81TimeSeriesVars2D = (pno3tot, ppo4tot, psiltot, palktot, pfertot, tcflx, tcflxcum, tcexp, tintpp, tnfix, tdenit) 
     82ChunckJob2D = OFF 
     83TimeSeriesVars3D = () 
     84ChunckJob3D = 50Y 
     85Seasonal=OFF 
     86 
    8687[Post_1Y_ptrc_T] 
    8788Patches = () 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/clim/config.card

    r3219 r3254  
    8080#D-- ICE - 
    8181[ICE] 
    82 WriteFrequency="1M 1D" 
     82WriteFrequency="1M" 
    8383Restart= n 
    8484##-- Last day of the experience used as restart 
    … …  
    9393#D-- MBG - 
    9494[MBG] 
    95 WriteFrequency="1D 1M 1Y" 
     95WriteFrequency="1M 1Y" 
    9696Restart= n 
    9797##-- Last day of the experience used as restart 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-lim3.xml

    r3219 r3254  
    116116        </file> 
    117117 
    118         <file id="file37" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    119           <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
    120           <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
    121           <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"   /> 
    122           <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"   /> 
    123           <field field_ref="masstot"      name="scmastot"   /> 
    124           <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"   /> 
    125           <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"   /> 
    126118 
    127           <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"   /> 
    128           <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   /> 
    129           <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   /> 
    130           <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   /> 
    131           <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />  
    132           <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   /> 
    133           <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   /> 
    134           <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   /> 
    135           <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   /> 
     119       <file id="file37" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
     120          <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
     121          <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
     122          <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
     123          <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  /> 
     124          <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  /> 
     125          <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  /> 
     126          <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   /> 
     127          <!-- ice and snow --> 
     128          <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" /> 
     129          <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" /> 
    136130        </file> 
    137131 
    138         <file id="file38" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
     132 
     133     <file id="file38" name_suffix="_SBC_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    139134          <!-- global contents --> 
    140           <field field_ref="ibgvol_tot"    name="ibgvol_tot"   /> 
    141           <field field_ref="sbgvol_tot"    name="sbgvol_tot"   /> 
    142           <field field_ref="ibgarea_tot"   name="ibgarea_tot"  /> 
    143           <field field_ref="ibgsalt_tot"   name="ibgsalt_tot"  /> 
    144           <field field_ref="ibgheat_tot"   name="ibgheat_tot"  /> 
    145           <field field_ref="sbgheat_tot"   name="sbgheat_tot"  /> 
    146            
    147           <!-- global drifts (conservation checks) --> 
    148           <field field_ref="ibgvolume"     name="ibgvolume"    /> 
    149           <field field_ref="ibgsaltco"     name="ibgsaltco"    /> 
    150           <field field_ref="ibgheatco"     name="ibgheatco"    /> 
    151           <field field_ref="ibgheatfx"     name="ibgheatfx"    /> 
    152            
    153           <!-- global forcings  --> 
    154           <field field_ref="ibgfrcvoltop"  name="ibgfrcvoltop" /> 
    155           <field field_ref="ibgfrcvolbot"  name="ibgfrcvolbot" /> 
    156           <field field_ref="ibgfrctemtop"  name="ibgfrctemtop" /> 
    157           <field field_ref="ibgfrctembot"  name="ibgfrctembot" /> 
    158           <field field_ref="ibgfrcsal"     name="ibgfrcsal"    /> 
    159           <field field_ref="ibgfrchfxtop"  name="ibgfrchfxtop" /> 
    160           <field field_ref="ibgfrchfxbot"  name="ibgfrchfxbot" /> 
     135          <field field_ref="ibgvol_tot"    name="ibgvol_tot"   /> 
     136          <field field_ref="sbgvol_tot"    name="sbgvol_tot"   /> 
     137          <field field_ref="ibgarea_tot"   name="ibgarea_tot"  /> 
     138          <field field_ref="ibgsalt_tot"   name="ibgsalt_tot"  /> 
     139          <field field_ref="ibgheat_tot"   name="ibgheat_tot"  /> 
     140          <field field_ref="sbgheat_tot"   name="sbgheat_tot"  /> 
     141 
     142          <!-- global drifts (conservation checks) --> 
     143          <field field_ref="ibgvolume"     name="ibgvolume"    /> 
     144          <field field_ref="ibgsaltco"     name="ibgsaltco"    /> 
     145          <field field_ref="ibgheatco"     name="ibgheatco"    /> 
     146          <field field_ref="ibgheatfx"     name="ibgheatfx"    /> 
     147 
     148          <!-- global forcings  --> 
     149          <field field_ref="ibgfrcvoltop"  name="ibgfrcvoltop" /> 
     150          <field field_ref="ibgfrcvolbot"  name="ibgfrcvolbot" /> 
     151          <field field_ref="ibgfrctemtop"  name="ibgfrctemtop" /> 
     152          <field field_ref="ibgfrctembot"  name="ibgfrctembot" /> 
     153          <field field_ref="ibgfrcsal"     name="ibgfrcsal"    /> 
     154          <field field_ref="ibgfrchfxtop"  name="ibgfrchfxtop" /> 
     155          <field field_ref="ibgfrchfxbot"  name="ibgfrchfxbot" /> 
    161156        </file> 
    162157 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-opa.xml

    r3219 r3254  
    7676 
    7777 
    78         <file id="file4" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    79           <field field_ref="DIC"      /> 
    80           <field field_ref="Alkalini" /> 
    81           <field field_ref="O2"       /> 
    82           <field field_ref="PO4"      /> 
    83           <field field_ref="Si"       /> 
    84           <field field_ref="Fer"      /> 
    85           <field field_ref="NCHL"     /> 
    86           <field field_ref="DCHL"     /> 
    87           <field field_ref="NO3"      /> 
    88         </file> 
    89  
    90         <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    91           <field field_ref="Cflx"     /> 
    92           <field field_ref="Dpco2"    /> 
    93         </file> 
    94  
    9578      </file_group> 
    9679 
    … …  
    11396          <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
    11497          <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    115         </file> 
    116  
    117         <file id="file11" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    11898          <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
    119           <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
    120           <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
    121           <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
    122           <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  /> 
    123           <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  /> 
    124           <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  /> 
    125           <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   /> 
    12699          <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
    127100          <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
    128101          <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
    129102          <field field_ref="precip"       name="precip"   /> 
    130           <!-- ice and snow --> 
    131           <field field_ref="snowpre" /> 
    132           <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" /> 
    133           <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" /> 
    134103        </file> 
     104 
    135105 
    136106        <file id="file12" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    … …  
    192162        </file> 
    193163 
    194         <file id="file16" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" > 
    195           <field field_ref="DIC"      /> 
    196           <field field_ref="Alkalini" /> 
    197           <field field_ref="O2"       /> 
    198           <field field_ref="CaCO3"    /> 
    199           <field field_ref="PO4"      /> 
    200           <field field_ref="POC"      /> 
    201           <field field_ref="Si"       /> 
    202           <field field_ref="PHY"      /> 
    203           <field field_ref="ZOO"      /> 
    204           <field field_ref="DOC"      /> 
    205           <field field_ref="PHY2"     /> 
    206           <field field_ref="ZOO2"     /> 
    207           <field field_ref="DSi"      /> 
    208           <field field_ref="Fer"      /> 
    209           <field field_ref="BFe"      /> 
    210           <field field_ref="GOC"      /> 
    211           <field field_ref="SFe"      /> 
    212           <field field_ref="DFe"      /> 
    213           <field field_ref="GSi"      /> 
    214           <field field_ref="NFe"      /> 
    215           <field field_ref="NCHL"     /> 
    216           <field field_ref="DCHL"     /> 
    217           <field field_ref="NO3"      /> 
    218           <field field_ref="NH4"      /> 
    219         </file> 
    220164 
    221         <file id="file17" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" > 
    222           <field field_ref="PH"       /> 
    223           <field field_ref="PAR"      /> 
    224           <field field_ref="PPPHYN"    /> 
    225           <field field_ref="PPPHYD"   /> 
    226           <field field_ref="PPPHYP"   /> 
    227           <field field_ref="PPNEWN"   /> 
    228           <field field_ref="PPNEWD"   /> 
    229           <field field_ref="PPNEWP"   /> 
    230           <field field_ref="PBSi"     /> 
    231           <field field_ref="PFeN"     /> 
    232           <field field_ref="PFeD"     /> 
    233           <field field_ref="PCAL"     /> 
    234           <field field_ref="DCAL"     /> 
    235           <field field_ref="GRAZ1"    /> 
    236           <field field_ref="GRAZ2"    /> 
    237           <field field_ref="EPC100"   /> 
    238           <field field_ref="EPFE100"  /> 
    239           <field field_ref="EPSI100"  /> 
    240           <field field_ref="EPCAL100" /> 
    241           <field field_ref="Cflx"     /> 
    242           <field field_ref="Dpco2"    /> 
    243           <field field_ref="Heup"     /> 
    244           <field field_ref="Nfix"     /> 
    245         </file> 
    246165     </file_group>    
    247166 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/file_def_nemo-pisces.xml

    r3219 r3254  
    4949      <file_group id="1y" output_freq="1y"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    5050         
    51         <file id="file22" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    52           <field field_ref="e3t"      /> 
    53           <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
    54           <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
    55           <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
    56           <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
    57           <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
    58           <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
    59           <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
    60           <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
    61           <field field_ref="mldkz5"   /> 
    62           <field field_ref="mldr10_1" /> 
    63           <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
    64           <field field_ref="sbt"      /> 
    65           <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
    66           <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    67         </file> 
    68  
    6951        <file id="file23" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" > 
    7052          <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field> 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v7_dev/GENERAL/PARAM/namelist_lim3_ORCA2_cfg

    r3186 r3254  
    1414&namicerun     !   Generic parameters 
    1515!------------------------------------------------------------------------------ 
     16  cn_icerst_in  = "restart_ice_in" 
    1617/ 
    1718!------------------------------------------------------------------------------ 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.