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08/13/18 12:49:23 (5 years ago)
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cetlod
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updating NEMO_v6 configurations

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CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6
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  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/ARCH/arch-X64_IRENE.fcm

    r3871 r3992  
    3939%OASIS_LIB           -L%OASIS_HOME/lib -lpsmile.MPI1 -lscrip -lmct -lmpeu 
    4040 
    41 %CPP                 cpp 
     41%CPP                 cpp -P -nostdinc 
    4242%FC                  mpif90 -c -cpp 
    4343%FCFLAGS             -i4 -r8 -O3 -fp-model precise 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA025_LIM3/ia/COMP/opa9.card

    r3885 r3992  
    6464        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml     , field_def_nemo-opa.xml ), \ 
    6565        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/file_def_nemo-opa.xml      , file_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    66         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml                  , iodef.xml              ) 
     66        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                       , iodef.xml               ) 
    6767 
    6868[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA025_LIM3_PISCES/ia/COMP/opa9.card

    r3885 r3992  
    6464        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml     , field_def_nemo-opa.xml ), \ 
    6565        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/file_def_nemo-opa.xml      , file_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    66         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/eORCA025_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml                  , iodef.xml              ) 
     66        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                       , iodef.xml               ) 
    6767 
    6868[RestartFiles] 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/core/clim/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5959[ParametersFiles] 
    6060List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    61         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    6261        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    6362        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6766        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/ping_ocean.xml         , ping_ocean.xml      ), \ 
    6867        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     68        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6969        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    7070 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/core/clim/config.card

    r3874 r3992  
    5252IOS= (xios_server.exe, xios.x, 1MPI) 
    5353#On ADA use 16 mpi for xios 
    54 #IOS= (xios_server.exe, xios.x, 16MPI) 
     54#IOS= (xios_server.exe, xios.x, 24MPI) 
    5555#======================================================================== 
    5656#D-- Restarts - 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/core/ia/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5757[ParametersFiles] 
    5858List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    59         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    6059        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    6160        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6564        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/ping_ocean.xml         , ping_ocean.xml      ), \ 
    6665        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     66        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6767        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6868 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/core/ia/config.card

    r3874 r3992  
    5252IOS= (xios_server.exe, xios.x, 1MPI) 
    5353#On ADA use 16 mpi for xios 
    54 #IOS= (xios_server.exe, xios.x, 16MPI) 
     54#IOS= (xios_server.exe, xios.x, 24MPI) 
    5555#======================================================================== 
    5656#D-- Restarts - 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/jra/ia/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5858[ParametersFiles] 
    5959List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    60         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    6160        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    6261        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6665        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/ping_ocean.xml         , ping_ocean.xml      ), \ 
    6766        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     67        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6868        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6969 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_LIM3_PISCES/jra/ia/config.card

    r3874 r3992  
    5252IOS= (xios_server.exe, xios.x, 1MPI) 
    5353#On ADA use 16 mpi for xios 
    54 #IOS= (xios_server.exe, xios.x, 16MPI) 
     54#IOS= (xios_server.exe, xios.x, 24MPI) 
    5555#======================================================================== 
    5656#D-- Restarts - 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_OFF_PISCES/ia/COMP/pisces.card

    r3961 r3992  
    6262        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    6363        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    64         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml                      , iodef.xml                     ), \ 
    6564        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    6665        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_${RESOL_OCE}piC_cfg                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    6766        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_${RESOL_OCE}_cfg                                     , namelist_pisces_cfg           ), \ 
     67        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6868        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces.xml                                             , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
    6969 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA1_OFF_PISCES/ia/config.card

    r3874 r3992  
    4747MBG= (orca1offpisces.exe, nemo, 432MPI) 
    4848IOS= (xios_server.exe, xios.x, 1MPI) 
     49##### On Ada use 24 xios 
     50####IOS= (xios_server.exe, xios.x, 24MPI) 
    4951#======================================================================== 
    5052#D-- Restarts - 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/core/clim/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5656[ParametersFiles] 
    5757List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    58         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    5958        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    6059        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6362        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml , field_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    6463        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     64        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6565        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6666 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/core/ia/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5656[ParametersFiles] 
    5757List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    58         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    5958        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    6059        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6362        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml , field_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    6463        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     64        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6565        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6666 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/dfs5/ia/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5555[ParametersFiles] 
    5656List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    5857        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    5958        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6261        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml , field_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    6362        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     63        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6464        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6565 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_LIM3_PISCES/jra/ia/COMP/opa9.card

    r3861 r3992  
    5555[ParametersFiles] 
    5656List=   (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_ref                            , namelist_ref        ), \ 
    57         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml              , iodef.xml           ), \ 
    5857        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/context_nemo.xml       , context_nemo.xml    ), \ 
    5958        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/domain_def_nemo.xml    , domain_def_nemo.xml ), \ 
    … …  
    6261        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-opa.xml , field_def_nemo-opa.xml  ), \ 
    6362        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/NAMELIST/${RESOL_OCE}/namelist_${opa9_UserChoices_forcing}_${exptype}_cfg, namelist_cfg), \ 
     63        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                , iodef.xml               ), \ 
    6464        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/file_def_nemo-opa.xml                                    , file_def_nemo-opa.xml   ) 
    6565 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_OFF_PISCES/clim/COMP/pisces.card

    r3961 r3992  
    5757        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    5858        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml    , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    59         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml                      , iodef.xml                     ), \ 
    6059        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    6160        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_cfg                                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    6261        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_cfg                                                  , namelist_pisces_cfg           ), \ 
     62        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml               ), \ 
    6363        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                     , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
    6464 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/EXPERIMENTS/ORCA2_OFF_PISCES/ia/COMP/pisces.card

    r3961 r3992  
    5858        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-pisces.xml      , field_def_nemo-pisces.xml     ), \ 
    5959        (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/field_def_nemo-inerttrc.xml , field_def_nemo-inerttrc.xml), \ 
    60         (${MODIPSL}/modeles/NEMOGCM/CONFIG/ORCA1_LIM3_PISCES/EXP00/iodef.xml                      , iodef.xml                     ), \ 
    6160        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_${RESOL_OCE}${EXPTYPE}_offline_cfg                          , namelist_cfg                  ), \ 
    6261        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_top_cfg                                                     , namelist_top_cfg              ), \ 
    6362        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/namelist_pisces_cfg                                                  , namelist_pisces_cfg           ), \ 
     63        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/XML/iodef.xml                                                        , iodef.xml               ), \ 
    6464        (${SUBMIT_DIR}/PARAM/file_def_nemo-pisces_offline.xml                                     , file_def_nemo-pisces.xml      ) 
    6565 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/DRIVER/xios.driver

    r3961 r3992  
    2424    fi 
    2525 
     26   # Add include of nemo context in iodef.xml 
     27    # In iodef.xml add on next line after "COMPONENT CONTEXT" 
     28    #  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/> 
     29    echo '<context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>' > add.tmp 
     30    if [ X"$( echo ${config_UserChoices_ExpType} | grep CMIP6 )" != "X" ] ; then 
     31        echo '<context id="nemo" src="./ping_nemo.xml"/>' >> add.tmp 
     32        echo '<context id="nemo" src="./dr2xml_opa9.xml"/>' >> add.tmp 
     33    fi 
     34    cp iodef.xml iodef.xml.tmp 
     35    sed -e "/ALL CONTEXT/r add.tmp" \ 
     36        iodef.xml.tmp > iodef.xml 
     37    rm iodef.xml.tmp add.tmp 
     38 
    2639    IGCM_debug_PopStack "IOS_Update" 
    2740} 

  • CONFIG/UNIFORM/v6/NEMO_v6/GENERAL/PARAM/XML/iodef.xml

    r3961 r3992  
    2828        <variable_group id="parameters" > 
    2929          <variable id="using_server" type="bool">true</variable> 
    30           <variable id="info_level" type="int">100</variable> 
    31           <variable id="print_file" type="bool">true</variable> 
     30          <variable id="info_level" type="int">1</variable> 
     31          <variable id="print_file" type="bool">false</variable> 
    3232          <variable id="using_oasis" type="bool">false</variable> 
    3333          <variable id="oasis_codes_id" type="string" >oceanx</variable> 
    3434        </variable_group> 
     35        <variable id="activate_non_distributed_transformation" type="bool">true</variable> 
     36        <variable id="recv_field_timeout" type="double">3000.0</variable> 
    3537 
    3638    </variable_definition> 
    … …  
    4244  <!-- =========================================================================================================== --> 
    4345 
    44       <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/> 
    45       <context id="nemo" src="./ping_nemo.xml"/> 
    46       <context id="nemo" src="./dr2xml_opa9.xml"/> 
     46  <!-- ALL CONTEXT : the context will be add automatically by xios.driver               --> 
    4747   
    4848</simulation> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.