Changeset 4293


Ignore:
Timestamp:
02/25/19 11:37:49 (2 years ago)
Author:
acosce
Message:

update IPSLCMCHT configuration

  • add interaction between surf and chm by default
  • add vegetation patch
  • add management in orchidee.card for BVOC
Location:
CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/EXPERIMENTS/IPSLCMCHT/S_pdControl/COMP/inca.card

    r4287 r4293  
    1818#coupled model with ORCH 
    1919#if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
    20 CoupOrchInca=n 
     20CoupOrchInca=y 
    2121#active or not chemistry flux in output  
    2222calcul_flux=n 
     
    3535         
    3636[BoundaryFiles] 
    37 List=(${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/SAD_Pa/sadclim_lmdz_phy_${year}.nc     ,   sad.nc      ) 
     37List=(${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/SAD_Pa/sadclim_lmdz_phy_${year}.nc       ,   sad.nc              ),\ 
     38     (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/ANT/${RESOL_ATM_XY}/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     39     (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/BBG/${RESOL_ATM_XY}/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     40     (${R_IN}/CHM/AIRCRAFT/IPCC_AR6.2/${RESOL_ATM_XY}/aircraft_${year}_phy.nc     ,   aircraft_mth.nc     ) 
    3841 
    39 ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                                        ,   npp.nc              )\ 
    40             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3clim_lmdz_phy_2000.nc                 ,   o3clim.nc           )\ 
    41             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc                     ,   o3lin.nc            )\ 
    42             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/lglived.dat                             ,   lglived.dat         )\ 
    43             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/aircraft_2000_phy.nc     ,   aircraft_mth.nc     )\ 
    44             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_zero_lmdz_phy.nc                 ,   aircraft_hs.nc      )\ 
    45             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/sflx_lmdz_GHG_phy.nc,        sflx_GHG.nc         )\ 
    46             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/sflx_lmdz_MISC_phy.nc,       sflx_MISC.nc        )\ 
    47             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/sflx_lmdz_NAT_phy.nc,        sflx_NAT.nc         )\ 
    48             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/sflx_lmdz_ANT_2000_phy.nc,   sflx_ANT.nc         )\ 
    49             (/ccc/work/cont003/gen2201/p24haug/INPUT/CMIP6/sflx_lmdz_BBG_2000_phy.nc,   sflx_BBG.nc         )\ 
    50             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                                    ,   landuse.nc          )\ 
    51             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt                                     ,   rhvEC.txt           )\ 
    52             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wthEC.txt                                     ,   wthEC.txt           )\ 
    53             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/clyEC.txt                                     ,   clyEC.txt           )\ 
    54             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wth.dat                                       ,   wth.dat             )\ 
    55             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/cly.dat                                       ,   cly.dat             )\ 
    56             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhv.dat                                       ,   rhv.dat             )\ 
    57             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                                    ,   phototable.dat      ) 
    5842 
     43ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                                  ,   npp.nc              )\ 
     44            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3clim_lmdz_phy_2000.nc           ,   o3clim.nc           )\ 
     45            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/o3coeff_lmdz_phy.nc               ,   o3lin.nc            )\ 
     46            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/lglived.dat                       ,   lglived.dat         )\ 
     47            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/STRAT/hikari_zero_lmdz_phy.nc           ,   aircraft_hs.nc      )\ 
     48            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_GHG_${RESOL_ATM_XY}.nc         ,   sflx_GHG.nc         )\ 
     49            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_MISC_${RESOL_ATM_XY}.nc        ,   sflx_MISC.nc        )\ 
     50            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_NATnobio_${RESOL_ATM_XY}.nc    ,   sflx_noBioNAT.nc    )\ 
     51            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc                              ,   landuse.nc          )\ 
     52            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt                               ,   rhvEC.txt           )\ 
     53            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wthEC.txt                               ,   wthEC.txt           )\ 
     54            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/clyEC.txt                               ,   clyEC.txt           )\ 
     55            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/wth.dat                                 ,   wth.dat             )\ 
     56            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/cly.dat                                 ,   cly.dat             )\ 
     57            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhv.dat                                 ,   rhv.dat             )\ 
     58            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/new_phototable.dat                      ,   phototable.dat      ) 
    5959 
    6060 
    6161[ParametersFiles] 
    6262List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/inca.def, .),\ 
    63         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml, .)  ,\ 
     63        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/context_inca.xml  , .) ,\ 
    6464        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/field_def_inca.xml, .) ,\ 
    65         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml , file_def_inca_restart.xml ),\ 
    66         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER_daily.xml, file_def_inca_daily.xml), \ 
    67         (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER_monthly.xml, file_def_inca_monthly.xml), \ 
     65        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_restart.xml         , file_def_inca_restart.xml ),\ 
     66        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER_daily.xml  , file_def_inca_daily.xml   ),\ 
     67        (${MODIPSL}/modeles/INCA/src/INCA_XML/file_def_inca_NMHC_AER_monthly.xml, file_def_inca_monthly.xml ),\ 
    6868        (${MODIPSL}/bin/inca.dat, inca.dat) 
    6969 
     
    7878 
    7979[OutputFiles] 
    80 List=   (inca1d_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_emi.nc        ,  NONE                  ),\ 
    81         (inca1d_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_species.nc    ,  Post_1D_inca_species  ),\ 
    82         (inca1d_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_dep.nc        ,  NONE                  ),\ 
    83         (inca1d_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_chem.nc       ,  Post_1D_inca_chem     ),\ 
    84         (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc       ,  Post_1D_inca_aero     ),\ 
    85         (inca1d_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_phtrate.nc    ,  NONE                  ),\ 
    86         (inca1d_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_reacflux.nc   ,  NONE                  ),\ 
    87         (inca1d_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_washrate.nc   ,  NONE                  ),\ 
    88         (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc    ,  Post_1D_inca_forcage  ),\ 
    89         (inca1d_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_veget.nc      ,  Post_1D_inca_veget    ),\ 
    90         (inca1m_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_emi.nc        ,  NONE                  ),\ 
    91         (inca1m_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_species.nc    ,  NONE                  ),\ 
    92         (inca1m_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_dep.nc        ,  NONE                  ),\ 
    93         (inca1m_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_chem.nc       ,  NONE                  ),\ 
    94         (inca1m_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_aero.nc       ,  NONE                  ),\ 
    95         (inca1m_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_phtrate.nc    ,  NONE                  ),\ 
    96         (inca1m_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_reacflux.nc   ,  NONE                  ),\ 
    97         (inca1m_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_washrate.nc   ,  NONE                  ),\ 
    98         (inca1m_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_forcage.nc    ,  NONE                  ),\ 
    99         (inca1m_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_veget.nc      ,  NONE                  ),\ 
    100         (aerosols_from_inca.nc  ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_aerosols_from_inca.nc,  NONE                        ),\ 
    101         (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc   ,  NONE                  )  
     80List=   (inca1d_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_emi.nc          ,  Post_1D_inca_emi      ),\ 
     81        (inca1d_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_species.nc      ,  Post_1D_inca_species  ),\ 
     82        (inca1d_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_dep.nc          ,  NONE                  ),\ 
     83        (inca1d_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_chem.nc         ,  Post_1D_inca_chem     ),\ 
     84        (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc         ,  Post_1D_inca_aero     ),\ 
     85        (inca1d_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_phtrate.nc      ,  NONE                  ),\ 
     86        (inca1d_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_reacflux.nc     ,  NONE                  ),\ 
     87        (inca1d_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_washrate.nc     ,  NONE                  ),\ 
     88        (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc      ,  Post_1D_inca_forcage  ),\ 
     89        (inca1d_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_veget.nc        ,  Post_1D_inca_veget    ),\ 
     90        (inca1m_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_emi.nc          ,  NONE                  ),\ 
     91        (inca1m_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_species.nc      ,  NONE                  ),\ 
     92        (inca1m_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_dep.nc          ,  NONE                  ),\ 
     93        (inca1m_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_chem.nc         ,  NONE                  ),\ 
     94        (inca1m_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_aero.nc         ,  NONE                  ),\ 
     95        (inca1m_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_phtrate.nc      ,  NONE                  ),\ 
     96        (inca1m_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_reacflux.nc     ,  NONE                  ),\ 
     97        (inca1m_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_washrate.nc     ,  NONE                  ),\ 
     98        (inca1m_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_forcage.nc      ,  NONE                  ),\ 
     99        (inca1m_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_veget.nc        ,  NONE                  ),\ 
     100        (aerosols_from_inca.nc  ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_aerosols_from_inca.nc,  NONE                  ),\ 
     101        (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc     ,  NONE                  )  
    102102 
    103103 
     
    148148ChunckJob3D = NONE 
    149149Seasonal=OFF 
     150 
     151[Post_1D_inca_emi] 
     152Patches= () 
     153GatherWithInternal = (lon, lat, presnivs, time_centered, time_centered_bounds, time_counter, area) 
     154TimeSeriesVars2D = (emich3oh,emic2h5oh,emic2h6,emic3h8,emic2h4,emic3h6,emic2h2,emialken,emich3cho,emich3coch3,emich3cooh,emiisop,emiapin ) 
     155ChunckJob2D = NONE 
     156TimeSeriesVars3D = () 
     157ChunckJob3D = NONE 
     158Seasonal=OFF 
     159 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/EXPERIMENTS/IPSLCMCHT/S_pdControl/COMP/orchidee.card

    r3651 r4293  
    1010 
    1111VEGET_UPDATE=0Y 
     12CHEMISTRY_BVOC=y 
    1213 
    1314[InitialStateFiles] 
    14 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc,        . ), \ 
    15         (${R_IN}/SRF/routing.nc,            . ), \ 
    16     (${R_IN}/SRF/PFTmap_1850to2005_AR5_LUHa.rc2/PFTmap_IPCC_2000.nc, PFTmap.nc), \ 
    17         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     15List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc       , .),\ 
     16        (${R_IN}/SRF/routing.nc           , .),\ 
     17        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .),\ 
     18        (${R_IN}/SRF/PFTmap_1850to2005_AR5_LUHa.rc2/PFTmap_IPCC_2000.nc, PFTmap.nc) 
    1819 
    1920[BoundaryFiles] 
    2021List= () 
    21 ListNonDel= () 
     22ListNonDel= (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc, .), \ 
     23            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc, .) 
     24 
    2225 
    2326[SmoothFiles] 
     
    2528 
    2629[ParametersFiles] 
    27 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)   ,\ 
    28         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .)  ,\ 
    29         (${R_IN}/SRF/routing.nc,            . ), \ 
    30         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)   ,\ 
    31     (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     30List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}             , orchidee.def),\ 
     31        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml , .),\ 
     32        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml  , .),\ 
     33        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
    3234 
    3335[RestartFiles] 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/EXPERIMENTS/IPSLCMCHT/pdControl/COMP/inca.card

    r4236 r4293  
    1818#coupled model with ORCH 
    1919#if yes, you need to put to CHEMISTRY_BVOC=y in orchidee.def and decomment lines for fertilizer and bbg in orchidee.card 
    20 CoupOrchInca=n 
     20CoupOrchInca=y 
    2121#active or not chemistry flux in output  
    2222calcul_flux=n 
     
    3535         
    3636[BoundaryFiles] 
    37 List=() 
     37List=(${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/ANT/${RESOL_ATM_XY}/sflx_lmdz_ANT_${year}_phy.nc,   sflx_ANT.nc         ),\ 
     38     (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/BBG/${RESOL_ATM_XY}/sflx_lmdz_BBG_${year}_phy.nc,   sflx_BBG.nc         ),\ 
     39     (${R_IN}/CHM/AIRCRAFT/IPCC_AR6.2/${RESOL_ATM_XY}/aircraft_${year}_phy.nc     ,   aircraft_mth.nc     ) 
     40 
    3841 
    3942ListNonDel= (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/npp.nc                ,   npp.nc              )\ 
    4043            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/o3clim.nc             ,   o3clim.nc           )\ 
    4144            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/so4.nc                ,   so4.nc              )\ 
    42             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/aircraft.nc           ,   aircraft_mth.nc     )\ 
    43             (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/sflx_nitrate.nc       ,   sflx_p2p.nc         )\ 
     45            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_GHG_${RESOL_ATM_XY}.nc         ,   sflx_GHG.nc         )\ 
     46            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_MISC_${RESOL_ATM_XY}.nc        ,   sflx_MISC.nc        )\ 
     47            (${R_IN}/CHM/SFLX/IPCC_AR6.2/sflx_lmdz_NATnobio_${RESOL_ATM_XY}.nc    ,   sflx_noBioNAT.nc    )\ 
    4448            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/landuse.nc            ,   landuse.nc          )\ 
    4549            (${R_IN}/CHM/INCA${RESOL_CHM}/rhvEC.txt             ,   rhvEC.txt           )\ 
     
    7175 
    7276[OutputFiles] 
    73 List=   (inca1d_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_emi.nc        ,  NONE                  ),\ 
    74         (inca1d_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_species.nc    ,  Post_1D_inca_species  ),\ 
    75         (inca1d_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_dep.nc        ,  NONE                  ),\ 
    76         (inca1d_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_chem.nc       ,  Post_1D_inca_chem     ),\ 
    77         (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc       ,  Post_1D_inca_aero     ),\ 
    78         (inca1d_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_phtrate.nc    ,  NONE                  ),\ 
    79         (inca1d_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_reacflux.nc   ,  NONE                  ),\ 
    80         (inca1d_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_washrate.nc   ,  NONE                  ),\ 
    81         (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc    ,  Post_1D_inca_forcage  ),\ 
    82         (inca1d_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_veget.nc      ,  Post_1D_inca_veget    ),\ 
    83         (inca1m_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_emi.nc        ,  NONE                  ),\ 
    84         (inca1m_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_species.nc    ,  NONE                  ),\ 
    85         (inca1m_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_dep.nc        ,  NONE                  ),\ 
    86         (inca1m_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_chem.nc       ,  NONE                  ),\ 
    87         (inca1m_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_aero.nc       ,  NONE                  ),\ 
    88         (inca1m_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_phtrate.nc    ,  NONE                  ),\ 
    89         (inca1m_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_reacflux.nc   ,  NONE                  ),\ 
    90         (inca1m_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_washrate.nc   ,  NONE                  ),\ 
    91         (inca1m_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_forcage.nc    ,  NONE                  ),\ 
    92         (inca1m_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_veget.nc      ,  NONE                  ),\ 
    93         (aerosols_from_inca.nc  ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_aerosols_from_inca.nc,  NONE                        ),\ 
    94         (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc   ,  NONE                  )  
     77List=   (inca1d_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_emi.nc          ,  Post_1D_inca_emi      ),\ 
     78        (inca1d_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_species.nc      ,  Post_1D_inca_species  ),\ 
     79        (inca1d_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_dep.nc          ,  NONE                  ),\ 
     80        (inca1d_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_chem.nc         ,  Post_1D_inca_chem     ),\ 
     81        (inca1d_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_aero.nc         ,  Post_1D_inca_aero     ),\ 
     82        (inca1d_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_phtrate.nc      ,  NONE                  ),\ 
     83        (inca1d_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_reacflux.nc     ,  NONE                  ),\ 
     84        (inca1d_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_washrate.nc     ,  NONE                  ),\ 
     85        (inca1d_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_forcage.nc      ,  Post_1D_inca_forcage  ),\ 
     86        (inca1d_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_D}/${PREFIX}_1D_inca_veget.nc        ,  Post_1D_inca_veget    ),\ 
     87        (inca1m_emi.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_emi.nc          ,  NONE                  ),\ 
     88        (inca1m_species.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_species.nc      ,  NONE                  ),\ 
     89        (inca1m_dep.nc          ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_dep.nc          ,  NONE                  ),\ 
     90        (inca1m_chem.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_chem.nc         ,  NONE                  ),\ 
     91        (inca1m_aero.nc         ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_aero.nc         ,  NONE                  ),\ 
     92        (inca1m_phtrate.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_phtrate.nc      ,  NONE                  ),\ 
     93        (inca1m_reacflux.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_reacflux.nc     ,  NONE                  ),\ 
     94        (inca1m_washrate.nc     ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_washrate.nc     ,  NONE                  ),\ 
     95        (inca1m_forcage.nc      ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_forcage.nc      ,  NONE                  ),\ 
     96        (inca1m_veget.nc        ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_veget.nc        ,  NONE                  ),\ 
     97        (aerosols_from_inca.nc  ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_aerosols_from_inca.nc,  NONE                  ),\ 
     98        (inca_oxydants.nc       ,      ${R_OUT_CHM_O_M}/${PREFIX}_1M_inca_oxydants.nc     ,  NONE                  )  
    9599 
    96100 
     
    141145ChunckJob3D = NONE 
    142146Seasonal=OFF 
     147 
     148[Post_1D_inca_emi] 
     149Patches= () 
     150GatherWithInternal = (lon, lat, presnivs, time_centered, time_centered_bounds, time_counter, area) 
     151TimeSeriesVars2D = (emich3oh,emic2h5oh,emic2h6,emic3h8,emic2h4,emic3h6,emic2h2,emialken,emich3cho,emich3coch3,emich3cooh,emiisop,emiapin ) 
     152ChunckJob2D = NONE 
     153TimeSeriesVars3D = () 
     154ChunckJob3D = NONE 
     155Seasonal=OFF 
     156 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/EXPERIMENTS/IPSLCMCHT/pdControl/COMP/orchidee.card

    r3283 r4293  
    1010 
    1111VEGET_UPDATE=0Y 
     12CHEMISTRY_BVOC=y 
    1213 
    1314[InitialStateFiles] 
    14 List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc,        . ), \ 
    15         (${R_IN}/SRF/routing.nc,            . ), \ 
    16     (${R_IN}/SRF/PFTmap_1850to2005_AR5_LUHa.rc2/PFTmap_IPCC_2000.nc, PFTmap.nc), \ 
    17         (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .) 
     15List=   (${R_IN}/SRF/soils_param.nc       , .),\ 
     16        (${R_IN}/SRF/routing.nc           , .),\ 
     17        (${R_IN}/SRF/cartepente2d_15min.nc, .),\ 
     18        (${R_IN}/SRF/PFTmap_1850to2005_AR5_LUHa.rc2/PFTmap_IPCC_2000.nc, PFTmap.nc) 
    1819 
    1920[BoundaryFiles] 
    2021List= () 
    21 ListNonDel= () 
     22ListNonDel= (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_fertilizer_1995.nc, .), \ 
     23            (${R_IN}/SRF/chemistry/orchidee_bbg_clim.nc, .) 
     24 
    2225 
    2326[SmoothFiles] 
     
    2528 
    2629[ParametersFiles] 
    27 List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}, orchidee.def)   ,\ 
    28         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml, .)  ,\ 
    29         (${R_IN}/SRF/routing.nc,            . ), \ 
    30         (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml, .)   ,\ 
    31     (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
     30List=   (${SUBMIT_DIR}/PARAM/orchidee.def_${DefSuffix}             , orchidee.def),\ 
     31        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/file_def_orchidee.xml , .),\ 
     32        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/context_orchidee.xml  , .),\ 
     33        (${MODIPSL}/modeles/ORCHIDEE/src_xml/field_def_orchidee.xml, .) 
    3234 
    3335[RestartFiles] 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/GENERAL/DRIVER/orchidee.driver

    r3283 r4293  
    6060    fi 
    6161 
     62    # Activate calcul of chemistry BVOC 
     63    if [ ! X${orchidee_UserChoices_CHEMISTRY_BVOC} = X ] ; then 
     64        IGCM_comp_modifyDefFile nonblocker orchidee.def CHEMISTRY_BVOC ${orchidee_UserChoices_CHEMISTRY_BVOC} 
     65    else 
     66        IGCM_comp_modifyDefFile nonblocker orchidee.def CHEMISTRY_BVOC n 
     67    fi 
    6268 
    6369    ## 2. Mangement of output and modifications of related xml files 
  • CONFIG/UNIFORM/v6/IPSLCM5A2CHT/GENERAL/PARAM/orchidee.def_Choi

    r3283 r4293  
    7979VEGET_UPDATE = _AUTO_ 
    8080 
     81# Take carbon from atmosphere if carbohydrate reserve too small, PFT dependent 
     82# Set to y for all pft except C4 grass (pft=11) and tropical C3 grass (pft=14) 
     83ALWAYS_INIT =  y, y, y, y, y, y, y, y, y, y, n, y, y, n, y 
     84 
    8185# Do not use default fire module 
    8286FIRE_DISABLE = y 
     
    9094# CHEMISTRY_OK_BVOC ([FLAG]) :  Activate chemistry    {OK_SECHIBA} 
    9195# default =  n  
    92 CHEMISTRY_BVOC =  n 
     96CHEMISTRY_BVOC = _AUTO_ 
    9397 
    9498# CO2 FOR BVOC - WILKINSON ([FLAG]) :  CO2 inhibition effect for isoprene based on Wilkinson approach?    {CHEMISTRY_OK_BVOC } 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.