Entête des jobs et commandes vargas

Cette page décrit les entêtes des jobs sur vargas ainsi que les commandes à lancer pour avoir un exécutable simple ou un couplé.

Un executable séquentiel

• Entête du job

• Commande

  time ./create_etat0_limit.e
  

Un executable parallélisé avec OpenMP seulement

• Entête du job

  # @ job_type = serial
  # @ parallel_threads = 4
  

• Commande

  time ./gcm.e
  

  • Résultat : poe lance 1 tâche et 4 threads avec le programme : gcm.e

Un executable parallélisé avec MPI seulement

• Entête du job

  # @ job_type = parallel
  # @ total_tasks = 32
  # @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
  # @ resources = ConsumableCpus(1)
  

• Commande

  time ./gcm.e
  

• Résultat : poe lance 32 tâches, avec toute le même programme : gcm.e

Un executable parallélisé avec MPI et OpenMP

• Entête du job

  # @ job_type = parallel
  # @ total_tasks = 16
  # @ parallel_threads = 4
  # @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=48"
  

  • Commande

    time ./gcm.e
    

  • Résultat : poe lance 16 tâches, avec toute le même programme : gcm.e sur 4 threads

Un couplé avec Oasis sur 1 proc, NEMO sur 5 procs et LMDZ sur 26 procs, MPI seul

• Entête du job

  # @ total_tasks = 32
  # @ environment = "BATCH_NUM_PROC_TOT=32"
  # @ resources = ConsumableCpus(1)
  

• Commande

   time poe -pgmmodel mpmd -cmdfile ./run_file
  

  • avec run_file contenant, oasis en premier obligatoirement:

    ./oasis
    ./opa.xx
    ...
    ./lmdz.x
    ...
    

• Résultat : poe lance 32 tâches : 1 oasis, 26 lmdz et 5 opa

Un couplé avec Oasis sur 1 proc, NEMO sur 5 procs et LMDZ sur 12 procs MPI et 4 tâches OpenMP

• Entête du job :

  # NEW : 2 Noeuds
  # @ task_geometry={(0)(1,2,3)}
  

• Commande :

  time poe -pgmmodel mpmd -cmdfile ./run_file
  

  • avec run_file contenant, oasis en premier :

    ./oasis
    ./opa.xx
    ...
    env OMP_NUM_THREADS=4 ./lmdz.x
    ...