Modifications apportées à IPSLCM5A

Voici la liste des modifications apportées à IPSLCM5A. Chaque modification est datée, documentée et argumentée.

LMDZ

Modification dans la branche LMDZ4_AR5

26 juillet 2010

Nouvelle revision 1420 dans mod.def [1096] :

• Modification des niveaux de sorties LMDZ pour diminuer le stockage CMIP5. levels for some outputs to diminsh the CMIP5 storage voir ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1419
• Test sur itau_dyn pour avoir un demarrage avec des dates correctes : voir ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1420

16 juillet 2010

Nouvelle révision 1417 dans mod.def [1090] : Correction de bug dans le calcul de la variable diagnostique ec550aer "Extinction at 550nm", dans LMDZ, voir ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1417 .

15 juillet 2010

Nouvelle revision 1415 dans mod.def : [1088] Passage a la version cosp.v1.3 pour le Lidar et ISCCP Corrections de bugs pour ISCCP et optimisation pour le Lidar Modification de cosp_input_nl.txt : ISCCP_TOPHEIGHT_DIRECTION=2 : [1089]

12 juillet 2010

Dans piControl/PARAM/physiq.def_L39 : ajout de la paramétrisation de la sortie de Aga. Sortie au niveau 2 (au lieu de 4).

9 juillet 2010

• Ajout du traceur Aga "Age de l'air stratosphérique" (F. Lott). Nouvelle révision 1410 mise dans mod.def : [1079]. Voir ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1405 et correction de bug ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1410. Pour ne pas augmenter le temps de calcul, les traceurs radon et plomb sont enlevé du traceur.def.
• Modification du fichier traceur.def et traitement de Aga comme variable 3D : [1080]
• A noter : trusting en rouge qui repère le changement du fichier traceur.def (11 juillet)

22 juin 2010

Correction de bug dans le fichier limit_netcdf.F90, appelé par le programme create_etat0_limit. Ce bug faisait planter le programme sur vargas et en local avec g95 mais ca tournait sur brodie. Nouveau révision 1402, voir : ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1402 . Le programme create_etat0_limit (synonyme à ce0l) est incontournable pour les configurations de LMDZ forcé.

ORCHIDEE

Passage [1044] de la branche orchidee_1_9_4_AR5 au tag orchidee_1_9_5 le 01 juin 2010. Modifications dans le tag orchidee_1_9_5 depuis le 01/06/2010 :

5 août 2010

src_stomate/stomate_lpj.f90 : passage version 1.26

• But : l'initialisation de 3 variables du LAND COVER CHANGE de sortie CMIP5 ne se faisaient qu'à la fin de l'année. C'est un bogue qui plantait certains runs couplés et rendait incorrecte ces sorties CMIP5. Elle a donc été déplacée dans ce module d'appel des sorties.
• Message :
  

  MM: move for correct initialization of LAND COVER CHANGE total variables
  This is a strong bug. Tag orchidee_1_9_5 will be pushed. Please update your code
  (using "cvs update" command).
  

• liens : ​view, ​diff

src_stomate/stomate_lcchange.f90 : passage version 1.6

• But : remonter les calculs des flux totaux dans stomate_lpj.f90
• Message : le même que pour stomate_lpj.f90
• liens : ​view, ​diff

29 juillet 2010

src_sechiba/intersurf.f90 : passage version 1.85

• But : corriger des unités sur les flux de carbone associés au LAND USE.
• Message :
  

  PC : correct units for CONVFLUX, CFLUX_PROD10, CFLUX_PROD100, HARVEST_ABOVE.
  

• liens : ​view, ​diff

16 juin 2010

src_sechiba/intersurf.f90 : passage version 1.84

• But : diminution de sorties non désirées dans la sortie HF sechiba
• Message :
  

  MaFo, MM: correct a mistake in fluxop_scinsec2 definition.
  This give a lot of unwanted variables in HF SECHIBA history file and
  again this is assimilated as a bug. The tag orchidee_1_9_5 will be pushed on
  this new version.
  

• liens : ​view, ​diff

16 juin 2010

src_sechiba/intersurf.f90 : passage version 1.83

• But : supprimer la variable dss de la sortie HF SECHIBA
• Message :
  

  MM: correct the operation name of the histdef of dss variable in HF of sechiba history.
  This is assimilated as a bug then the TAG orchidee_1_9_5 will be pushed on this new version.
  

• liens : ​view, ​diff

09 juin 2010

src_sechiba/intersurf.f90 : passage version 1.82

• But : diminution de sorties non désirées dans la sortie HF sechiba
• Message :
  

  MaFo, MM : STOMATE variables were still in level 1 for high frequency history output for SECHIBA.
  

• liens : ​view, ​diff

Diagnostics

1-29 septembre 2010

• Mise en conformité des variables produites en TS dans les différentes configuration : piControl [1147], historical [1148] et EXP00 [1149]

6 septembre 2010

• lmdz.card : Ajout des variables COSP dans les TS des simulations historical et piControl. Voir [1130].

3 septembre 2010

• lmdz.card : Mise en conformité des variables TS de lmdz avec les options du code. Voir [1122], [1126], [1128] et [1129]

4 aout 2010

Bug non-corrigé dans LMDZ4 : Un bug a été trouvé dans dans libf/phylmd/newmicro.F. Cette bug n'a pas était corrigé et les diagnostiques suivant sont erronées : reffclwc, reffclws, lcc3dcon, lcc3dstra. Le bug existe dans le code depuis que ces diagnostiques ont été ajouté dans le code, voir ​http://lmdz.lmd.jussieu.fr/trac/changeset/1337 . Une correction n'existe pas encore.

29 juillet 2010

Modification diagnostics et monitoring stomate :

• le monitoring stomate a été revu
• les unités de ces 4 variables ont été modifiées (gC/m2/yr) : harvest_above, convflux, cflux_prod10, cflux_prod100 . Voir : ​modif intersurf (Password required)
• la commande à passer pour modifier l'attribut des anciens fichiers est : ncatted. A passer sur les variables rangées en série temporelle ainsi :
  • CONVFLUX : ncatted -O -a units,CONVFLUX,m,c,"gC/m2/yr" OOL_AR5_REF_10000101_12501231_1M_CONVFLUX.nc
  • CFLUX_PROD10 : ncatted -O -a units,CFLUX_PROD10,m,c,"gC/m2/yr" OOL_AR5_REF_10000101_12501231_1M_CFLUX_PROD10.nc
  • CFLUX_PROD100 : ncatted -O -a units,CFLUX_PROD100,m,c,"gC/m2/yr" OOL_AR5_REF_10000101_12501231_1M_CFLUX_PROD100.nc
  • HARVEST_ABOVE : ncatted -O -a units,HARVEST_ABOVE,m,c,"gC/m2/yr" OOL_AR5_REF_10000101_12501231_1M_HARVEST_ABOVE.nc
• Modification prise en compte dans IPSLCM5A. Voir [1117]

24 juin 2010

• Modification : diagnostic NEMO
• Voir : ​https://forge.ipsl.jussieu.fr/nemo/ticket/682
• Voir : modification incluse là : ​https://forge.ipsl.jussieu.fr/nemo/changeset/1952
• Voir : modification mod.def : [1069]

Outils

13 juillet 2010

• rebuild associé IOIPSL à v2_2_1 sur cesium

12 juillet 2010

• libIGCM_v_1_8 : post-traitements sur cesium pour les simus SX9.

8 juillet 2010

• nco/4.0.1 sur la frontale mercure :
  • la librairie nco/3.9.4 sur la frontale mercure est buggée. Voir mail à ce sujet.
  • utilisation de la librairie nco/4.0.1 et netcdf/4.1.1 dans les 2 fichiers d'initialisation : ~p86ipsl/.atlas_env_mercure01_ksh et ~p86ipsl /.atlas_env_mercure01_csh

30 juin 2010

• libIGCM v1_7 :
  • ​312 : ncwa se bloque sur la frontale de mercure. Travailler sur 2 fichiers évite cela. Non. nco/3.9.4 est buggué.

28 juin 2010

• libIGCM v1_7 :
  • ​310 :
    • retour à TMPDIR sur mercure. Attention à avoir suffisamment de quota en SCRATCHDIR.
    • Initialisation de CompletedFlag
  • ​308 : mise à jour cesium pour les post-traitements issus de titane.

25 juin 2010

• nco/3.9.4 :
  • amélioration des performances. Voir : ​Intranet IPSL
  • utilisation de module load nco/3.9.4 dans les 2 fichiers d'initialisation : ~/.atlas_env_mercure01_ksh ~/.atlas_env_mercure01_csh

Forcages

Forcage solaire et volcans

23 juillet 2010

• historical : Mise à jour du fichier SOLARANDVOLCANOES_1610_2008.txt. Vous le trouverez disponible dans le répertoire qui suit (sur mercure): /dmnfs/cont003/p86ipsl/IGCM/BC/ATM/IPSLCM5A/IPCC_AR5/HISTORIQUE/. La version précédente de ce fichier est nommée SOLARANDVOLCANOES_1610_2008_V0.txt. Plus d'infos là : ​historical2

12 juillet 2010

• historical. Voir COMP/lmdz.card et lmdz.driver : Utilisation du fichier : SOLARANDVOLCANOES_1610_2008.txt

Fichiers ozone

25 octobre 2010

• Passage à la nouvelle version 2 des fichiers climoz.
• Inclusion dans les comptes communs des fichiers ozones sans cycle saisonnier permettant de finir les simulations ayant démarré avec ces fichiers.
• Voir : ​http://forge.ipsl.jussieu.fr/igcmg/wiki/InfosOzone

30 septembre 2010

• Passage à la version 2 des fichiers climoz. Voir : [1150] [1151]

Fichiers de concentrations d'aérosols

• Passage à la version 2 des fichiers aerosols. Modifs sur le traitement des 5 premières années. duplication 1855 au lieu de moyenne glissante 5 4 3 2 1.

22 septembre

HISTORIQUE (/dmnfs/cont003/p86ipsl/IGCM/BC/ATM/IPCLM5A/LMD9695/AR5/HISTORIQUE/): les fichiers de concentrations d'aérosols pour les années 1996 à 2005 ont été refait à partir de LOI_IPCC_3 et LOI_IPCC_RCP85sstA2. Les précédents fichiers ont été sauvegardé en _v0, pour rappel ils avaient été créé avec LOI_IPCC_3 et LOI_IPCC_RCP85 qui contenait des erreurs dans ses sst et dans les émissions de POM

RCP8.5 (/dmnfs/cont003/p86ipsl/IGCM/BC/ATM/IPCLM5A/LMD9695/AR5/RCP85/): les fichiers de concentrations d'aérosols pour les années 2006 à 2095 ont été réalisé à partir de la simulation LOI_IPCC_RCP85sstA2

RCP4.5 (/dmnfs/cont003/p86ipsl/IGCM/BC/ATM/IPCLM5A/LMD9695/AR5/RCP45/): les fichiers de concentrations d'aérosols pour les années 2006 à 2095 ont été réalisé à partir de la simulation LOI_IPCC_RCP45

Pour plus d'informations sur les simulations LOI_IPCC_xxx voir ​ici

30 juin 2010

Il y avait un soucis numérique dans les fichiers de concentrations d'aérosols pour l'année 1905. Après correction ça touche les fichiers aerosols_11YearsClim_${period}.nc de 1900 à 1910 (dus aux moyennes glissantes sur 11 ans) dans $DMFDIR/IGCM/STORAGE/BC/ATM/LMD9695/AR5/HISTORIQUE et $DMFDIR/IGCM/STORAGE/BC/ATM/LMD144142/AR5/HISTORIQUE

Les fichiers buggués ont été conservés avec le nom aerosols_11YearsClim_${period}_bug.nc