wiki:Modipsl_ada

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Travailler sur Ada

Index?/Environnement de Calcul/Ada



Documentation IDRIS

Voir : http://www.idris.fr/ada/

Environnement minimum sur ada

  • Voir fichier typique .bash_login dans ~rpsl035/.bash_login

Il faut avoir accès à :

  • fcm :
    export PATH=~rpsl035/FCM/bin:$PATH 
    



Premiers essais

LMDZ

  • 7/1/2013
    • Compilation OK : fichiers arch accessibles sur trunk (à partir de la rev. 1705)
    • Execution : sequentiel, MPI, MPI/OpenMP, OpenMP OK, les benchs (quelques jours en 48x36x19 ; compilation en mode "dev") donnent des restarts identiques. Youpi.

IPSLCM5

  • 7/1/2013 :compilation
    • IOIPSL : OK
    • FCM : OK
    • LMDZ AR4, ajouter arch ADA et modifier makelmdz_fcm (netcdf)
    • NEMO : ajouter 3 lignes
    • XMLF90 : ajouter arch ADA
    • OASIS : OK
  • execution
    • 1 mois OK, lancement job ultra simple
  • post-traitement
    • sur ada

Commandes de gestion de Jobs sur ada

  • La limite de temps dans les jobs se compte en temps réel. 1h sur 32 procs compte pour 32h. Attention à ne pas avoir trop de temps sur 1 processeur.
  • llsubmit --> soumissions de job
  • llcancel --> suppression de job
  • llq -u login --> indique tous les jobs en queue ou running pour login
  • Astuce : paramétrer l'affichage de llq pour avoir les noms de jobs : llq -u $(whoami) -f %jn %id %st %c %dq %h -W
  • Post-mortem : jar , jar -l #jobid#, pour avoir le lendemain du job les informations détaillées : mémoire, temps réel, efficacité, ...



Compilation

N'oubliez pas de verifier que votre PATH contient bien le path pour l'outil FCM : ~rpsl035/FCM/bin .
Plus d'infos .



Comment choisir le nombre de processus demandés ?

La méthode de parallélisation de LMDZ impose la règle suivante : il faut au moins 3 bandes de latitude par processus Si vous avez choisi un trop grand nombre de processus la simulation s'arrête avec le message suivant :

Arret : le nombre de bande de lattitude par process est trop faible (<2).
  ---> diminuez le nombre de CPU ou augmentez la taille en lattitude

Pour modifier le nombre de processus il faut changer la valeur de la variable JobNumProcTot dans config.card AVANT de lancer la commande ins_job.



Les post-traitement

Les post-traitements se font aussi sur ada.



Compiler IPSLCM5A

  • 7/1/13 : début des essais
    • compilation IOIPSL OK



Faire une simulation avec le modèle IPSLCM5A

  • Repérer un état initial à utiliser :
    • Attention : create_etat0_limit ne fonctionne pas actuellement sur vargas. Il est compilé en parallèle (pour gagner du temps) et l'executable tourne sur le nombre de procs demandé par le job : 32 (ou 16). Comme ce n'est pas prévu dans ce0l, il s'arrête. Il faut donc partir d'un état initial créé autrement : autre simulation, ce0l executé ailleurs, par exemple sur brodie.
  • Tester si les espaces temporaires peremttent de faire les rebuild avec !rebuildFromWorkdir

Spécificités libIGCM sur ada

Comment refaire une simulation et avoir exactement les mêmes résultats?

Attention pour reproduire exactement la même simulation, sur ada, il faut utiliser le même fichiers Bands d'équilibrage des calculs.

Voir COMP/lmdz.card.