source: XIOS/trunk/src/io/nc4_data_output.cpp @ 881

Last change on this file since 881 was 881, checked in by oabramkina, 5 years ago

Commit for UGRID norms: bad allocations have been taken care of.

  • Property copyright set to
    Software name : XIOS (Xml I/O Server)
    http://forge.ipsl.jussieu.fr/ioserver
    Creation date : January 2009
    Licence : CeCCIL version2
    see license file in root directory : Licence_CeCILL_V2-en.txt
    or http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.html
    Holder : CEA/LSCE (Laboratoire des Sciences du CLimat et de l'Environnement)
    CNRS/IPSL (Institut Pierre Simon Laplace)
    Project Manager : Yann Meurdesoif
    yann.meurdesoif@cea.fr
  • Property svn:executable set to *
File size: 100.0 KB
Line 
1#include "nc4_data_output.hpp"
2
3#include <boost/lexical_cast.hpp>
4#include "attribute_template.hpp"
5#include "group_template.hpp"
6
7#include "file.hpp"
8#include "calendar.hpp"
9#include "context.hpp"
10#include "context_server.hpp"
11#include "netCdfException.hpp"
12#include "exception.hpp"
13
14namespace xios
15{
16      /// ////////////////////// Dfinitions ////////////////////// ///
17      CNc4DataOutput::CNc4DataOutput
18         (const StdString & filename, bool exist)
19            : SuperClass()
20            , SuperClassWriter(filename, exist)
21            , filename(filename)
22      {
23    SuperClass::type = MULTI_FILE;
24      }
25
26      CNc4DataOutput::CNc4DataOutput
27         (const StdString & filename, bool exist, bool useClassicFormat, bool useCFConvention,
28          MPI_Comm comm_file,bool multifile, bool isCollective, const StdString& timeCounterName)
29            : SuperClass()
30            , SuperClassWriter(filename, exist, useClassicFormat, useCFConvention, &comm_file, multifile, timeCounterName)
31            , comm_file(comm_file)
32            , filename(filename)
33            , isCollective(isCollective)
34      {
35    SuperClass::type = (multifile) ? MULTI_FILE : ONE_FILE;
36      }
37
38      CNc4DataOutput::~CNc4DataOutput(void)
39    { /* Ne rien faire de plus */ }
40
41      ///--------------------------------------------------------------
42
43      const StdString & CNc4DataOutput::getFileName(void) const
44      {
45         return (this->filename);
46      }
47
48      //---------------------------------------------------------------
49
50      void CNc4DataOutput::writeDomain_(CDomain* domain)
51      {
52        if (domain->type == CDomain::type_attr::unstructured)
53        {
54          if (SuperClassWriter::useCFConvention)
55            writeUnstructuredDomain(domain) ;
56          else
57            writeUnstructuredDomainUgrid(domain) ;
58          return ;
59        }
60
61         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
62         CContextServer* server=context->server ;
63
64         if (domain->IsWritten(this->filename)) return;
65         domain->checkAttributes();
66
67         if (domain->isEmpty())
68           if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return;
69
70         std::vector<StdString> dim0, dim1;
71         StdString domid = domain->getDomainOutputName();
72         StdString appendDomid  = (singleDomain) ? "" : "_"+domid ;
73         if (isWrittenDomain(domid)) return ;
74         else setWrittenDomain(domid);
75
76
77         StdString dimXid, dimYid ;
78
79         bool isRegularDomain = (domain->type == CDomain::type_attr::rectilinear);
80         switch (domain->type)
81         {
82           case CDomain::type_attr::curvilinear :
83             dimXid     = StdString("x").append(appendDomid);
84             dimYid     = StdString("y").append(appendDomid);
85             break ;
86           case CDomain::type_attr::rectilinear :
87             dimXid     = StdString("lon").append(appendDomid);
88             dimYid     = StdString("lat").append(appendDomid);
89             break;
90         }
91
92         StdString dimVertId = StdString("nvertex").append(appendDomid);
93
94         string lonid,latid,bounds_lonid,bounds_latid ;
95         string areaId = "area" + appendDomid;
96/*
97         StdString lonid_loc = (server->intraCommSize > 1)
98                             ? StdString("lon").append(appendDomid).append("_local")
99                             : lonid;
100         StdString latid_loc = (server->intraCommSize > 1)
101                             ? StdString("lat").append(appendDomid).append("_local")
102                             : latid;
103*/
104
105         try
106         {
107           switch (SuperClass::type)
108           {
109              case (MULTI_FILE) :
110              {
111  //               if (domain->isEmpty()) return;
112
113                 if (server->intraCommSize > 1)
114                 {
115  //                 SuperClassWriter::addDimension(lonid, domain->zoom_ni.getValue());
116  //                 SuperClassWriter::addDimension(latid, domain->zoom_nj.getValue());
117                 }
118
119                 switch (domain->type)
120                 {
121                   case CDomain::type_attr::curvilinear :
122                     dim0.push_back(dimYid); dim0.push_back(dimXid);
123                     lonid = StdString("nav_lon").append(appendDomid);
124                     latid = StdString("nav_lat").append(appendDomid);
125                     break ;
126                   case CDomain::type_attr::rectilinear :
127                     lonid = StdString("lon").append(appendDomid);
128                     latid = StdString("lat").append(appendDomid);
129                     dim0.push_back(dimYid);
130                     dim1.push_back(dimXid);
131                     break;
132                 }
133
134                 bounds_lonid = StdString("bounds_lon").append(appendDomid);
135                 bounds_latid = StdString("bounds_lat").append(appendDomid);
136
137                 SuperClassWriter::addDimension(dimXid, domain->zoom_ni_srv);
138                 SuperClassWriter::addDimension(dimYid, domain->zoom_nj_srv);
139
140                 if (domain->hasBounds)
141                   SuperClassWriter::addDimension(dimVertId, domain->nvertex);
142
143                 if (server->intraCommSize > 1)
144                 {
145                   this->writeLocalAttributes(domain->zoom_ibegin_srv,
146                                              domain->zoom_ni_srv,
147                                              domain->zoom_jbegin_srv,
148                                              domain->zoom_nj_srv,
149                                              appendDomid);
150
151                   if (singleDomain)
152                    this->writeLocalAttributes_IOIPSL(dimXid, dimYid,
153                                                      domain->zoom_ibegin_srv,
154                                                      domain->zoom_ni_srv,
155                                                      domain->zoom_jbegin_srv,
156                                                      domain->zoom_nj_srv,
157                                                      domain->ni_glo,domain->nj_glo,
158                                                      server->intraCommRank,server->intraCommSize);
159                 }
160
161                 if (domain->hasLonLat)
162                 {
163                   switch (domain->type)
164                   {
165                     case CDomain::type_attr::curvilinear :
166                       SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
167                       SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
168                       break ;
169                      case CDomain::type_attr::rectilinear :
170                        SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
171                        SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim1);
172                        break ;
173                   }
174
175                   this->writeAxisAttributes(lonid, isRegularDomain ? "X" : "", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
176                   this->writeAxisAttributes(latid, isRegularDomain ? "Y" : "", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
177
178                   if (domain->hasBounds)
179                   {
180                     SuperClassWriter::addAttribute("bounds", bounds_lonid, &lonid);
181                     SuperClassWriter::addAttribute("bounds", bounds_latid, &latid);
182
183                     dim0.clear();
184                     dim0.push_back(dimYid);
185                     dim0.push_back(dimXid);
186                     dim0.push_back(dimVertId);
187                     SuperClassWriter::addVariable(bounds_lonid, NC_FLOAT, dim0);
188                     SuperClassWriter::addVariable(bounds_latid, NC_FLOAT, dim0);
189                   }
190                 }
191
192                 dim0.clear();
193                 dim0.push_back(dimYid);
194                 dim0.push_back(dimXid);
195
196
197  // supress mask               if (server->intraCommSize > 1)
198  // supress mask               {
199  // supress mask                  SuperClassWriter::addVariable(maskid, NC_INT, dim0);
200  // supress mask
201  // supress mask                  this->writeMaskAttributes(maskid,
202  // supress mask                     domain->data_dim.getValue()/*,
203  // supress mask                     domain->data_ni.getValue(),
204  // supress mask                     domain->data_nj.getValue(),
205  // supress mask                     domain->data_ibegin.getValue(),
206  // supress mask                     domain->data_jbegin.getValue()*/);
207  // supress mask               }
208
209                 //SuperClassWriter::setDefaultValue(maskid, &dvm);
210
211                 if (domain->hasArea)
212                 {
213                   SuperClassWriter::addVariable(areaId, NC_FLOAT, dim0);
214                   SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("cell_area"), &areaId);
215                   SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("m2"), &areaId);
216                 }
217
218                 SuperClassWriter::definition_end();
219
220                 if (domain->hasLonLat)
221                 {
222                   switch (domain->type)
223                   {
224                     case CDomain::type_attr::curvilinear :
225                       SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0);
226                       SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0);
227                       break;
228                     case CDomain::type_attr::rectilinear :
229                       CArray<double,1> lat = domain->latvalue_srv(Range(fromStart,toEnd,domain->zoom_ni_srv)) ;
230                       SuperClassWriter::writeData(CArray<double,1>(lat.copy()), latid, isCollective, 0);
231                       CArray<double,1> lon=domain->lonvalue_srv(Range(0,domain->zoom_ni_srv-1)) ;
232                       SuperClassWriter::writeData(CArray<double,1>(lon.copy()), lonid, isCollective, 0);
233                       break;
234                   }
235
236                   if (domain->hasBounds)
237                   {
238                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lon_srv, bounds_lonid, isCollective, 0);
239                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lat_srv, bounds_latid, isCollective, 0);
240                   }
241                 }
242
243                 if (domain->hasArea)
244                   SuperClassWriter::writeData(domain->area_srv, areaId, isCollective, 0);
245
246                 SuperClassWriter::definition_start();
247
248                 break;
249              }
250              case (ONE_FILE) :
251              {
252                 SuperClassWriter::addDimension(dimXid, domain->global_zoom_ni);
253                 SuperClassWriter::addDimension(dimYid, domain->global_zoom_nj);
254
255                 if (domain->hasBounds)
256                   SuperClassWriter::addDimension(dimVertId, domain->nvertex);
257
258                 if (domain->hasLonLat)
259                 {
260                   switch (domain->type)
261                   {
262                     case CDomain::type_attr::curvilinear :
263                       dim0.push_back(dimYid); dim0.push_back(dimXid);
264                       lonid = StdString("nav_lon").append(appendDomid);
265                       latid = StdString("nav_lat").append(appendDomid);
266                       SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
267                       SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
268                       break;
269
270                     case CDomain::type_attr::rectilinear :
271                       dim0.push_back(dimYid);
272                       dim1.push_back(dimXid);
273                       lonid = StdString("lon").append(appendDomid);
274                       latid = StdString("lat").append(appendDomid);
275                       SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
276                       SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim1);
277                       break;
278                   }
279
280                   bounds_lonid = StdString("bounds_lon").append(appendDomid);
281                   bounds_latid = StdString("bounds_lat").append(appendDomid);
282
283                   this->writeAxisAttributes
284                      (lonid, isRegularDomain ? "X" : "", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
285                   this->writeAxisAttributes
286                      (latid, isRegularDomain ? "Y" : "", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
287
288                   if (domain->hasBounds)
289                   {
290                     SuperClassWriter::addAttribute("bounds", bounds_lonid, &lonid);
291                     SuperClassWriter::addAttribute("bounds", bounds_latid, &latid);
292
293                     dim0.clear();
294                     dim0.push_back(dimYid);
295                     dim0.push_back(dimXid);
296                     dim0.push_back(dimVertId);
297                     SuperClassWriter::addVariable(bounds_lonid, NC_FLOAT, dim0);
298                     SuperClassWriter::addVariable(bounds_latid, NC_FLOAT, dim0);
299                   }
300                 }
301
302                 if (domain->hasArea)
303                 {
304                   dim0.clear();
305                   dim0.push_back(dimYid); dim0.push_back(dimXid);
306                   SuperClassWriter::addVariable(areaId, NC_FLOAT, dim0);
307                   SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("cell_area"), &areaId);
308                   SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("m2"), &areaId);
309                   dim0.clear();
310                 }
311
312                 SuperClassWriter::definition_end();
313
314                 switch (domain->type)
315                 {
316                   case CDomain::type_attr::curvilinear :
317                   {
318                     std::vector<StdSize> start(2) ;
319                     std::vector<StdSize> count(2) ;
320                     if (domain->isEmpty())
321                     {
322                       start[0]=0 ; start[1]=0 ;
323                       count[0]=0 ; count[1]=0 ;
324                     }
325                     else
326                     {
327                       start[1]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->global_zoom_ibegin;
328                       start[0]=domain->zoom_jbegin_srv-domain->global_zoom_jbegin;
329                       count[1]=domain->zoom_ni_srv ; count[0]=domain->zoom_nj_srv ;
330                     }
331
332                     if (domain->hasLonLat)
333                     {
334                       SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0,&start,&count);
335                       SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0,&start,&count);
336                     }
337                     break;
338                   }
339                   case CDomain::type_attr::rectilinear :
340                   {
341                     if (domain->hasLonLat)
342                     {
343                       std::vector<StdSize> start(1) ;
344                       std::vector<StdSize> count(1) ;
345                       if (domain->isEmpty())
346                       {
347                         start[0]=0 ;
348                         count[0]=0 ;
349                         SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0,&start,&count);
350                         SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0,&start,&count);
351
352                       }
353                       else
354                       {
355                         start[0]=domain->zoom_jbegin_srv-domain->global_zoom_jbegin;
356                         count[0]=domain->zoom_nj_srv ;
357                         CArray<double,1> lat = domain->latvalue_srv(Range(fromStart,toEnd,domain->zoom_ni_srv)) ;
358                         SuperClassWriter::writeData(CArray<double,1>(lat.copy()), latid, isCollective, 0,&start,&count);
359
360                         start[0]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->global_zoom_ibegin;
361                         count[0]=domain->zoom_ni_srv ;
362                         CArray<double,1> lon=domain->lonvalue_srv(Range(0,domain->zoom_ni_srv-1)) ;
363                         SuperClassWriter::writeData(CArray<double,1>(lon.copy()), lonid, isCollective, 0,&start,&count);
364                       }
365                     }
366                     break;
367                   }
368                 }
369
370                 if (domain->hasBounds)
371                 {
372                   std::vector<StdSize> start(3);
373                   std::vector<StdSize> count(3);
374                   if (domain->isEmpty())
375                   {
376                     start[2] = start[1] = start[0] = 0;
377                     count[2] = count[1] = count[0] = 0;
378                   }
379                   else
380                   {
381                     start[2] = 0;
382                     start[1] = domain->zoom_ibegin_srv - domain->global_zoom_ibegin;
383                     start[0] = domain->zoom_jbegin_srv - domain->global_zoom_jbegin;
384                     count[2] = domain->nvertex;
385                     count[1] = domain->zoom_ni_srv;
386                     count[0] = domain->zoom_nj_srv;
387                   }
388
389                 SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lon_srv, bounds_lonid, isCollective, 0, &start, &count);
390                 SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lat_srv, bounds_latid, isCollective, 0, &start, &count);
391                 }
392
393                 if (domain->hasArea)
394                 {
395                   std::vector<StdSize> start(2);
396                   std::vector<StdSize> count(2);
397
398                   if (domain->isEmpty())
399                   {
400                     start[0] = 0; start[1] = 0;
401                     count[0] = 0; count[1] = 0;
402                   }
403                   else
404                   {
405                     start[1] = domain->zoom_ibegin_srv - domain->global_zoom_ibegin;
406                     start[0] = domain->zoom_jbegin_srv - domain->global_zoom_jbegin;
407                     count[1] = domain->zoom_ni_srv;
408                     count[0] = domain->zoom_nj_srv;
409                   }
410
411                   SuperClassWriter::writeData(domain->area_srv, areaId, isCollective, 0, &start, &count);
412                 }
413
414                 SuperClassWriter::definition_start();
415                 break;
416              }
417              default :
418                 ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
419                       << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
420                       << " not implemented yet !");
421           }
422         }
423         catch (CNetCdfException& e)
424         {
425           StdString msg("On writing the domain : ");
426           msg.append(domid); msg.append("\n");
427           msg.append("In the context : ");
428           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
429           msg.append(e.what());
430           ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain_(CDomain* domain)", << msg);
431         }
432
433         domain->addRelFile(this->filename);
434      }
435
436    //--------------------------------------------------------------
437
438    void CNc4DataOutput::writeUnstructuredDomainUgrid(CDomain* domain)
439    {
440      CContext* context = CContext::getCurrent() ;
441      CContextServer* server=context->server ;
442
443      if (domain->IsWritten(this->filename)) return;
444      domain->checkAttributes();
445      if (domain->isEmpty())
446        if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return ;
447
448      std::vector<StdString> dim0;
449      StdString domid = domain->getDomainOutputName();
450      StdString domainName = domain->name;
451      domain->assignMesh(domainName);
452      //domain->mesh->createMesh(domain->lonvalue_srv, domain->latvalue_srv, domain->bounds_lon_srv, domain->bounds_lat_srv);
453      domain->mesh->createMeshEpsilon(domain->lonvalue_srv, domain->latvalue_srv, domain->bounds_lon_srv, domain->bounds_lat_srv);
454
455      StdString node_x = domainName + "_node_x";
456      StdString node_y = domainName + "_node_y";
457
458      StdString edge_x = domainName + "_edge_x";
459      StdString edge_y = domainName + "_edge_y";
460      StdString edge_nodes = domainName + "_edge_nodes";
461
462      StdString face_x = domainName + "_face_x";
463      StdString face_y = domainName + "_face_y";
464      StdString face_nodes = domainName + "_face_nodes";
465
466      StdString dimNode = "n" + domainName + "_node";
467      StdString dimEdge = "n" + domainName + "_edge";
468      StdString dimFace = "n" + domainName + "_face";
469      StdString dimVertex = "n" + domainName + "_vertex";
470      StdString dimTwo = "Two";
471
472      if (!SuperClassWriter::dimExist(dimTwo)) SuperClassWriter::addDimension(dimTwo, 2);
473      if (!isWrittenDomain(domid))
474      {
475        dim0.clear();
476        SuperClassWriter::addVariable(domainName, NC_INT, dim0);
477        SuperClassWriter::addAttribute("cf_role", StdString("mesh_topology"), &domainName);
478        SuperClassWriter::addAttribute("node_coordinates", node_x + " " + node_y, &domainName);
479      }
480
481      try
482      {
483        switch (SuperClass::type)
484        {
485          case (ONE_FILE) :
486          {
487            // Adding nodes
488            if (domain->nvertex == 1)
489            {
490              if (!SuperClassWriter::varExist(node_x) || !SuperClassWriter::varExist(node_y))
491              {
492                SuperClassWriter::addDimension(dimNode, domain->mesh->nbNodes);
493                dim0.clear();
494                dim0.push_back(dimNode);
495                SuperClassWriter::addVariable(node_x, NC_FLOAT, dim0);
496                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &node_x);
497                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Longitude of mesh nodes."), &node_x);
498                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &node_x);
499                SuperClassWriter::addVariable(node_y, NC_FLOAT, dim0);
500                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &node_y);
501                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Latitude of mesh nodes."), &node_y);
502                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &node_y);
503              }
504            } // domain->nvertex == 1
505
506            // Adding edges and nodes, if nodes have not been defined previously
507            if (domain->nvertex == 2)
508            {
509              // Nodes
510              if (!SuperClassWriter::varExist(node_x) || !SuperClassWriter::varExist(node_y))
511              {
512                SuperClassWriter::addDimension(dimNode, domain->mesh->nbNodes);
513                dim0.clear();
514                dim0.push_back(dimNode);
515                SuperClassWriter::addVariable(node_x, NC_FLOAT, dim0);
516                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &node_x);
517                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Longitude of mesh nodes."), &node_x);
518                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &node_x);
519                SuperClassWriter::addVariable(node_y, NC_FLOAT, dim0);
520                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &node_y);
521                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Latitude of mesh nodes."), &node_y);
522                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &node_y);
523              }
524              // Edges
525              if (!SuperClassWriter::varExist(edge_x) || !SuperClassWriter::varExist(edge_y))
526              {
527                SuperClassWriter::addAttribute("edge_node_connectivity", edge_nodes, &domainName);
528                SuperClassWriter::addAttribute("edge_coordinates", edge_x + " " + edge_y, &domainName);
529                SuperClassWriter::addDimension(dimEdge, domain->mesh->nbEdges);
530                dim0.clear();
531                dim0.push_back(dimEdge);
532                SuperClassWriter::addVariable(edge_x, NC_FLOAT, dim0);
533                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &edge_x);
534                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic longitude of mesh edges."), &edge_x);
535                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &edge_x);
536                SuperClassWriter::addVariable(edge_y, NC_FLOAT, dim0);
537                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &edge_y);
538                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic latitude of mesh edges."), &edge_y);
539                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &edge_y);
540                dim0.clear();
541                dim0.push_back(dimEdge);
542                dim0.push_back(dimTwo);
543                SuperClassWriter::addVariable(edge_nodes, NC_INT, dim0);
544                SuperClassWriter::addAttribute("cf_role", StdString("edge_node_connectivity"), &edge_nodes);
545                SuperClassWriter::addAttribute("long_name", StdString("Maps every edge/link to two nodes that it connects."), &edge_nodes);
546                SuperClassWriter::addAttribute("start_index", 0, &edge_nodes);
547              }
548            } // domain->nvertex == 2
549
550            // Adding faces, edges, and nodes, if edges and nodes have not been defined previously
551            if (domain->nvertex > 2)
552            {
553              // Nodes
554              if (!SuperClassWriter::varExist(node_x) || !SuperClassWriter::varExist(node_y))
555              {
556                SuperClassWriter::addDimension(dimNode, domain->mesh->nbNodes);
557                dim0.clear();
558                dim0.push_back(dimNode);
559                SuperClassWriter::addVariable(node_x, NC_FLOAT, dim0);
560                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &node_x);
561                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Longitude of mesh nodes."), &node_x);
562                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &node_x);
563                SuperClassWriter::addVariable(node_y, NC_FLOAT, dim0);
564                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &node_y);
565                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Latitude of mesh nodes."), &node_y);
566                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &node_y);
567              }
568              // Edges
569              if (!SuperClassWriter::varExist(edge_x) || !SuperClassWriter::varExist(edge_y))
570              {
571                SuperClassWriter::addAttribute("edge_coordinates", edge_x + " " + edge_y, &domainName);
572                SuperClassWriter::addAttribute("edge_node_connectivity", edge_nodes, &domainName);
573                SuperClassWriter::addDimension(dimEdge, domain->mesh->nbEdges);
574                dim0.clear();
575                dim0.push_back(dimEdge);
576                SuperClassWriter::addVariable(edge_x, NC_FLOAT, dim0);
577                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &edge_x);
578                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic longitude of mesh edges."), &edge_x);
579                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &edge_x);
580                SuperClassWriter::addVariable(edge_y, NC_FLOAT, dim0);
581                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &edge_y);
582                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic latitude of mesh edges."), &edge_y);
583                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &edge_y);
584                dim0.clear();
585                dim0.push_back(dimEdge);
586                dim0.push_back(dimTwo);
587                SuperClassWriter::addVariable(edge_nodes, NC_INT, dim0);
588                SuperClassWriter::addAttribute("cf_role", StdString("edge_node_connectivity"), &edge_nodes);
589                SuperClassWriter::addAttribute("long_name", StdString("Maps every edge/link to two nodes that it connects."), &edge_nodes);
590                SuperClassWriter::addAttribute("start_index", 0, &edge_nodes);
591              }
592              // Faces
593                SuperClassWriter::addAttribute("face_coordinates", face_x + " " + face_y, &domainName);
594                SuperClassWriter::addAttribute("face_node_connectivity", face_nodes, &domainName);
595                SuperClassWriter::addDimension(dimFace, domain->mesh->nbFaces);
596                SuperClassWriter::addDimension(dimVertex, domain->mesh->nvertex);
597                dim0.clear();
598                dim0.push_back(dimFace);
599                SuperClassWriter::addVariable(face_x, NC_FLOAT, dim0);
600                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("longitude"), &face_x);
601                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic longitude of mesh faces."), &face_x);
602                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_east"), &face_x);
603                SuperClassWriter::addVariable(face_y, NC_FLOAT, dim0);
604                SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("latitude"), &face_y);
605                SuperClassWriter::addAttribute("longname_name", StdString("Characteristic latitude of mesh faces."), &face_y);
606                SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("degrees_north"), &face_y);
607                dim0.clear();
608                dim0.push_back(dimFace);
609                dim0.push_back(dimVertex);
610                SuperClassWriter::addVariable(face_nodes, NC_INT, dim0);
611                SuperClassWriter::addAttribute("cf_role", StdString("face_node_connectivity"), &face_nodes);
612                SuperClassWriter::addAttribute("long_name", StdString("Maps every face to its corner nodes."), &face_nodes);
613                SuperClassWriter::addAttribute("start_index", 0, &face_nodes);
614            } // domain->nvertex > 2
615
616            SuperClassWriter::definition_end();
617
618            if (!isWrittenDomain(domid))
619            {
620              if (domain->nvertex == 1)
621              {
622                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
623                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
624              }
625              else if (domain->nvertex == 2)
626                            {
627                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
628                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
629                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lat, edge_y, isCollective, 0);
630                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lon, edge_x, isCollective, 0);
631                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_nodes, edge_nodes);
632                            }
633              else
634              {
635                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
636                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
637                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lat, edge_y, isCollective, 0);
638                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lon, edge_x, isCollective, 0);
639                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_nodes, edge_nodes);
640                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_lat, face_y, isCollective, 0);
641                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_lon, face_x, isCollective, 0);
642                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_nodes, face_nodes);
643              }
644              setWrittenDomain(domid);
645            } // !isWrittenDomain
646            else
647            {
648              if (domain->nvertex == 1)
649              {
650                if ( (!domain->mesh->edgesAreWritten) && (!domain->mesh->facesAreWritten) )
651                {
652                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
653                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
654                }
655              }
656              if (domain->nvertex == 2)
657              {
658                if (!domain->mesh->facesAreWritten)
659                {
660                  if (!domain->mesh->nodesAreWritten)
661                  {
662                    SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
663                    SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
664                  }
665                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lat, edge_y, isCollective, 0);
666                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lon, edge_x, isCollective, 0);
667                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_nodes, edge_nodes);
668                }
669              } 
670              if (domain->nvertex > 2)
671              {
672                if (!domain->mesh->edgesAreWritten)
673                {
674                  if (!domain->mesh->nodesAreWritten)
675                  {
676                    SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lat, node_y, isCollective, 0);
677                    SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->node_lon, node_x, isCollective, 0);
678                  }
679                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lat, edge_y, isCollective, 0);
680                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_lon, edge_x, isCollective, 0);
681                  SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->edge_nodes, edge_nodes);
682                }
683                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_lat, face_y, isCollective, 0);
684                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_lon, face_x, isCollective, 0);
685                SuperClassWriter::writeData(domain->mesh->face_nodes, face_nodes);
686              }
687            }// isWrittenDomain
688
689            SuperClassWriter::definition_start();
690
691            break;
692          } // ONE_FILE
693
694          case (MULTI_FILE) :
695          {
696            break;
697          }
698
699          default :
700          ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
701          << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
702          << " not implemented yet !");
703          } // switch
704        } // try
705
706        catch (CNetCdfException& e)
707        {
708          StdString msg("On writing the domain : ");
709          msg.append(domid); msg.append("\n");
710          msg.append("In the context : ");
711          msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
712          msg.append(e.what());
713          ERROR("CNc4DataOutput::writeUnstructuredDomain(CDomain* domain)", << msg);
714        }
715
716  domain->addRelFile(this->filename);
717  }
718
719    //--------------------------------------------------------------
720
721    void CNc4DataOutput::writeUnstructuredDomain(CDomain* domain)
722      {
723         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
724         CContextServer* server=context->server ;
725
726         if (domain->IsWritten(this->filename)) return;
727         domain->checkAttributes();
728
729         if (domain->isEmpty())
730           if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return ;
731
732         std::vector<StdString> dim0, dim1;
733         StdString domid = domain->getDomainOutputName();
734         if (isWrittenDomain(domid)) return ;
735         else setWrittenDomain(domid);
736
737         StdString appendDomid  = (singleDomain) ? "" : "_"+domid ;
738
739
740         StdString dimXid = StdString("cell").append(appendDomid);
741         StdString dimVertId = StdString("nvertex").append(appendDomid);
742
743         string lonid,latid,bounds_lonid,bounds_latid ;
744         string areaId = "area" + appendDomid;
745
746         try
747         {
748           switch (SuperClass::type)
749           {
750              case (MULTI_FILE) :
751              {
752                 dim0.push_back(dimXid);
753                 SuperClassWriter::addDimension(dimXid, domain->zoom_ni_srv);
754
755                 lonid = StdString("lon").append(appendDomid);
756                 latid = StdString("lat").append(appendDomid);
757                 bounds_lonid = StdString("bounds_lon").append(appendDomid);
758                 bounds_latid = StdString("bounds_lat").append(appendDomid);
759                 if (domain->hasLonLat)
760                 {
761                   SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
762                   SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
763                   this->writeAxisAttributes(lonid, "", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
764                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addAttribute("bounds",bounds_lonid, &lonid);
765                   this->writeAxisAttributes(latid, "", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
766                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addAttribute("bounds",bounds_latid, &latid);
767                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addDimension(dimVertId, domain->nvertex);
768                 }
769                 dim0.clear();
770                 if (domain->hasBounds)
771                 {
772                   dim0.push_back(dimXid);
773                   dim0.push_back(dimVertId);
774                   SuperClassWriter::addVariable(bounds_lonid, NC_FLOAT, dim0);
775                   SuperClassWriter::addVariable(bounds_latid, NC_FLOAT, dim0);
776                 }
777
778                 dim0.clear();
779                 dim0.push_back(dimXid);
780                 if (domain->hasArea)
781                 {
782                   SuperClassWriter::addVariable(areaId, NC_FLOAT, dim0);
783                   SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("cell_area"), &areaId);
784                   SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("m2"), &areaId);
785                 }
786
787                 SuperClassWriter::definition_end();
788
789                 if (domain->hasLonLat)
790                 {
791                   SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0);
792                   SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0);
793                   if (domain->hasBounds)
794                   {
795                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lon_srv, bounds_lonid, isCollective, 0);
796                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lat_srv, bounds_latid, isCollective, 0);
797                   }
798                 }
799
800                 if (domain->hasArea)
801                   SuperClassWriter::writeData(domain->area_srv, areaId, isCollective, 0);
802
803                 SuperClassWriter::definition_start();
804                 break ;
805              }
806
807              case (ONE_FILE) :
808              {
809                 lonid = StdString("lon").append(appendDomid);
810                 latid = StdString("lat").append(appendDomid);
811                 bounds_lonid = StdString("bounds_lon").append(appendDomid);
812                 bounds_latid = StdString("bounds_lat").append(appendDomid);
813                 dim0.push_back(dimXid);
814                 SuperClassWriter::addDimension(dimXid, domain->ni_glo);
815                 if (domain->hasLonLat)
816                 {
817                   SuperClassWriter::addVariable(latid, NC_FLOAT, dim0);
818                   SuperClassWriter::addVariable(lonid, NC_FLOAT, dim0);
819
820                   this->writeAxisAttributes(lonid, "", "longitude", "Longitude", "degrees_east", domid);
821                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addAttribute("bounds",bounds_lonid, &lonid);
822                   this->writeAxisAttributes(latid, "", "latitude", "Latitude", "degrees_north", domid);
823                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addAttribute("bounds",bounds_latid, &latid);
824                   if (domain->hasBounds) SuperClassWriter::addDimension(dimVertId, domain->nvertex);
825                 }
826                 dim0.clear();
827
828                 if (domain->hasBounds)
829                 {
830                   dim0.push_back(dimXid);
831                   dim0.push_back(dimVertId);
832                   SuperClassWriter::addVariable(bounds_lonid, NC_FLOAT, dim0);
833                   SuperClassWriter::addVariable(bounds_latid, NC_FLOAT, dim0);
834                 }
835
836                 if (domain->hasArea)
837                 {
838                   dim0.clear();
839                   dim0.push_back(dimXid);
840                   SuperClassWriter::addVariable(areaId, NC_FLOAT, dim0);
841                   SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", StdString("cell_area"), &areaId);
842                   SuperClassWriter::addAttribute("units", StdString("m2"), &areaId);
843                 }
844
845                 SuperClassWriter::definition_end();
846
847                 std::vector<StdSize> start(1), startBounds(2) ;
848                 std::vector<StdSize> count(1), countBounds(2) ;
849                 if (domain->isEmpty())
850                 {
851                   start[0]=0 ;
852                   count[0]=0 ;
853                   startBounds[1]=0 ;
854                   countBounds[1]=domain->nvertex ;
855                   startBounds[0]=0 ;
856                   countBounds[0]=0 ;
857                 }
858                 else
859                 {
860                   start[0]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->global_zoom_ibegin;
861                   count[0]=domain->zoom_ni_srv ;
862                   startBounds[0]=domain->zoom_ibegin_srv-domain->global_zoom_ibegin;
863                   startBounds[1]=0 ;
864                   countBounds[0]=domain->zoom_ni_srv ;
865                   countBounds[1]=domain->nvertex ;
866                 }
867
868                 if (domain->hasLonLat)
869                 {
870                   SuperClassWriter::writeData(domain->latvalue_srv, latid, isCollective, 0,&start,&count);
871                   SuperClassWriter::writeData(domain->lonvalue_srv, lonid, isCollective, 0,&start,&count);
872                   if (domain->hasBounds)
873                   {
874                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lon_srv, bounds_lonid, isCollective, 0,&startBounds,&countBounds);
875                     SuperClassWriter::writeData(domain->bounds_lat_srv, bounds_latid, isCollective, 0,&startBounds,&countBounds);
876                   }
877                 }
878
879                 if (domain->hasArea)
880                   SuperClassWriter::writeData(domain->area_srv, areaId, isCollective, 0, &start, &count);
881
882                 SuperClassWriter::definition_start();
883
884                 break;
885              }
886              default :
887                 ERROR("CNc4DataOutput::writeDomain(domain)",
888                       << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
889                       << " not implemented yet !");
890           }
891         }
892         catch (CNetCdfException& e)
893         {
894           StdString msg("On writing the domain : ");
895           msg.append(domid); msg.append("\n");
896           msg.append("In the context : ");
897           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
898           msg.append(e.what());
899           ERROR("CNc4DataOutput::writeUnstructuredDomain(CDomain* domain)", << msg);
900         }
901         domain->addRelFile(this->filename);
902      }
903      //--------------------------------------------------------------
904
905      void CNc4DataOutput::writeAxis_(CAxis* axis)
906      {
907        if (axis->IsWritten(this->filename)) return;
908        axis->checkAttributes();
909        int zoom_size_srv  = axis->zoom_size_srv;
910        int zoom_begin_srv = axis->zoom_begin_srv;
911        int zoom_size  = (MULTI_FILE == SuperClass::type) ? zoom_size_srv
912                                                              : axis->global_zoom_n;
913        int zoom_begin = (MULTI_FILE == SuperClass::type) ? zoom_begin_srv
914                                                              : axis->global_zoom_begin;
915
916        if ((0 == zoom_size_srv) && (MULTI_FILE == SuperClass::type)) return;
917
918        std::vector<StdString> dims;
919        StdString axisid = axis->getAxisOutputName();
920        if (isWrittenAxis(axisid)) return ;
921        else setWrittenAxis(axisid);
922
923        try
924        {
925          SuperClassWriter::addDimension(axisid, zoom_size);
926          if (axis->hasValue)
927          {
928            dims.push_back(axisid);
929            SuperClassWriter::addVariable(axisid, NC_FLOAT, dims);
930
931            if (!axis->name.isEmpty())
932              SuperClassWriter::addAttribute("name", axis->name.getValue(), &axisid);
933
934            if (!axis->standard_name.isEmpty())
935              SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", axis->standard_name.getValue(), &axisid);
936
937            if (!axis->long_name.isEmpty())
938              SuperClassWriter::addAttribute("long_name", axis->long_name.getValue(), &axisid);
939
940            if (!axis->unit.isEmpty())
941              SuperClassWriter::addAttribute("units", axis->unit.getValue(), &axisid);
942
943            if (!axis->positive.isEmpty())
944            {
945              SuperClassWriter::addAttribute("axis", string("Z"), &axisid);
946              SuperClassWriter::addAttribute("positive",
947                                             (axis->positive == CAxis::positive_attr::up) ? string("up") : string("down"),
948                                             &axisid);
949            }
950
951            StdString axisBoundsId = axisid + "_bounds";
952            if (!axis->bounds.isEmpty())
953            {
954              dims.push_back("axis_nbounds");
955              SuperClassWriter::addVariable(axisBoundsId, NC_FLOAT, dims);
956              SuperClassWriter::addAttribute("bounds", axisBoundsId, &axisid);
957            }
958
959            SuperClassWriter::definition_end();
960
961            switch (SuperClass::type)
962            {
963              case MULTI_FILE:
964              {
965                CArray<double,1> axis_value(zoom_size_srv);
966                for (int i = 0; i < zoom_size_srv; i++) axis_value(i) = axis->value_srv(i);
967                SuperClassWriter::writeData(axis_value, axisid, isCollective, 0);
968
969                if (!axis->bounds.isEmpty())
970                  SuperClassWriter::writeData(axis->bound_srv, axisBoundsId, isCollective, 0);
971
972                SuperClassWriter::definition_start();
973
974                break;
975              }
976              case ONE_FILE:
977              {
978                CArray<double,1> axis_value(zoom_size_srv);
979                axis_value = axis->value_srv;
980
981                std::vector<StdSize> start(1), startBounds(2) ;
982                std::vector<StdSize> count(1), countBounds(2) ;
983                start[0] = startBounds[0] = zoom_begin_srv-axis->global_zoom_begin;
984                count[0] = countBounds[0] = zoom_size_srv;
985                startBounds[1] = 0;
986                countBounds[1] = 2;
987                SuperClassWriter::writeData(axis_value, axisid, isCollective, 0, &start, &count);
988
989                if (!axis->bounds.isEmpty())
990                  SuperClassWriter::writeData(axis->bound_srv, axisBoundsId, isCollective, 0, &startBounds, &countBounds);
991
992                SuperClassWriter::definition_start();
993
994                break;
995              }
996              default :
997                ERROR("CNc4DataOutput::writeAxis_(CAxis* axis)",
998                      << "[ type = " << SuperClass::type << "]"
999                      << " not implemented yet !");
1000            }
1001          }
1002        }
1003        catch (CNetCdfException& e)
1004        {
1005          StdString msg("On writing the axis : ");
1006          msg.append(axisid); msg.append("\n");
1007          msg.append("In the context : ");
1008          CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1009          msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1010          msg.append(e.what());
1011          ERROR("CNc4DataOutput::writeAxis_(CAxis* axis)", << msg);
1012        }
1013        axis->addRelFile(this->filename);
1014     }
1015
1016     //--------------------------------------------------------------
1017
1018     void CNc4DataOutput::writeGridCompressed_(CGrid* grid)
1019     {
1020       if (grid->isScalarGrid() || grid->isWrittenCompressed(this->filename)) return;
1021
1022       try
1023       {
1024         CArray<bool,1> axisDomainOrder = grid->axis_domain_order;
1025         std::vector<StdString> domainList = grid->getDomainList();
1026         std::vector<StdString> axisList   = grid->getAxisList();
1027         int numElement = axisDomainOrder.numElements(), idxDomain = 0, idxAxis = 0;
1028
1029         std::vector<StdString> dims;
1030
1031         if (grid->isCompressible())
1032         {
1033           StdString varId = grid->getId() + "_points";
1034
1035           int nbIndexes = (SuperClass::type == MULTI_FILE) ? grid->getNumberWrittenIndexes() : grid->getTotalNumberWrittenIndexes();
1036           SuperClassWriter::addDimension(varId, nbIndexes);
1037
1038           dims.push_back(varId);
1039           SuperClassWriter::addVariable(varId, NC_INT, dims);
1040
1041           StdOStringStream compress;
1042           for (int i = numElement - 1; i >= 0; --i)
1043           {
1044             if (axisDomainOrder(i))
1045             {
1046               CDomain* domain = CDomain::get(domainList[domainList.size() - idxDomain - 1]);
1047               StdString domId = domain->getDomainOutputName();
1048               StdString appendDomId  = singleDomain ? "" : "_" + domId;
1049
1050               switch (domain->type)
1051               {
1052                 case CDomain::type_attr::curvilinear:
1053                   compress << "y" << appendDomId << " x" << appendDomId;
1054                   break;
1055                 case CDomain::type_attr::rectilinear:
1056                   compress << "lat" << appendDomId << " lon" << appendDomId;
1057                   break;
1058                 case CDomain::type_attr::unstructured:
1059                   compress << "cell" << appendDomId;
1060                   break;
1061               }
1062               ++idxDomain;
1063             }
1064             else
1065             {
1066               CAxis* axis = CAxis::get(axisList[axisList.size() - idxAxis - 1]);
1067               compress << axis->getAxisOutputName();
1068               ++idxAxis;
1069             }
1070
1071             if (i != 0) compress << ' ';
1072           }
1073           SuperClassWriter::addAttribute("compress", compress.str(), &varId);
1074
1075           grid->computeCompressedIndex();
1076
1077           CArray<int, 1> indexes(grid->getNumberWrittenIndexes());
1078           std::map<int, CArray<size_t, 1> >::const_iterator it;
1079           for (it = grid->outIndexFromClient.begin(); it != grid->outIndexFromClient.end(); ++it)
1080           {
1081             const CArray<size_t, 1> compressedIndexes = grid->compressedOutIndexFromClient[it->first];
1082             for (int i = 0; i < it->second.numElements(); i++)
1083               indexes(compressedIndexes(i)) = it->second(i);
1084           }
1085
1086           switch (SuperClass::type)
1087           {
1088             case (MULTI_FILE):
1089             {
1090               SuperClassWriter::writeData(indexes, varId, isCollective, 0);
1091               break;
1092             }
1093             case (ONE_FILE):
1094             {
1095               if (grid->doGridHaveDataDistributed())
1096                 grid->getDistributionServer()->computeGlobalIndex(indexes);
1097
1098               std::vector<StdSize> start, count;
1099               start.push_back(grid->getOffsetWrittenIndexes());
1100               count.push_back(grid->getNumberWrittenIndexes());
1101
1102               SuperClassWriter::writeData(indexes, varId, isCollective, 0, &start, &count);
1103               break;
1104             }
1105           }
1106         }
1107         else
1108         {
1109           for (int i = 0; i < numElement; ++i)
1110           {
1111             StdString varId, compress;
1112             CArray<int, 1> indexes;
1113             bool isDistributed;
1114             StdSize nbIndexes, totalNbIndexes, offset;
1115             int firstGlobalIndex;
1116
1117             if (axisDomainOrder(i))
1118             {
1119               CDomain* domain = CDomain::get(domainList[idxDomain]);
1120               StdString domId = domain->getDomainOutputName();
1121
1122               if (!domain->isCompressible()
1123                    || domain->type == CDomain::type_attr::unstructured
1124                    || domain->isWrittenCompressed(this->filename)
1125                    || isWrittenCompressedDomain(domId))
1126                 continue;
1127
1128               StdString appendDomId  = singleDomain ? "" : "_" + domId;
1129
1130               varId = domId + "_points";
1131               switch (domain->type)
1132               {
1133                 case CDomain::type_attr::curvilinear:
1134                   compress = "y" + appendDomId + " x" + appendDomId;
1135                   break;
1136                 case CDomain::type_attr::rectilinear:
1137                   compress = "lat" + appendDomId + " lon" + appendDomId;
1138                   break;
1139               }
1140
1141               const std::vector<int>& indexesToWrite = domain->getIndexesToWrite();
1142               indexes.resize(indexesToWrite.size());
1143               for (int n = 0; n < indexes.numElements(); ++n)
1144                 indexes(n) = indexesToWrite[n];
1145
1146               isDistributed = domain->isDistributed();
1147               nbIndexes = domain->getNumberWrittenIndexes();
1148               totalNbIndexes = domain->getTotalNumberWrittenIndexes();
1149               offset = domain->getOffsetWrittenIndexes();
1150               firstGlobalIndex = domain->ibegin + domain->jbegin * domain->ni_glo;
1151
1152               domain->addRelFileCompressed(this->filename);
1153               setWrittenCompressedDomain(domId);
1154               ++idxDomain;
1155             }
1156             else
1157             {
1158               CAxis* axis = CAxis::get(axisList[idxAxis]);
1159               StdString axisId = axis->getAxisOutputName();
1160
1161               if (!axis->isCompressible()
1162                    || axis->isWrittenCompressed(this->filename)
1163                    || isWrittenCompressedAxis(axisId))
1164                 continue;
1165
1166               varId = axisId + "_points";
1167               compress = axisId;
1168
1169               const std::vector<int>& indexesToWrite = axis->getIndexesToWrite();
1170               indexes.resize(indexesToWrite.size());
1171               for (int n = 0; n < indexes.numElements(); ++n)
1172                 indexes(n) = indexesToWrite[n];
1173
1174               isDistributed = axis->isDistributed();
1175               nbIndexes = axis->getNumberWrittenIndexes();
1176               totalNbIndexes = axis->getTotalNumberWrittenIndexes();
1177               offset = axis->getOffsetWrittenIndexes();
1178               firstGlobalIndex = axis->begin;
1179
1180               axis->addRelFileCompressed(this->filename);
1181               setWrittenCompressedAxis(axisId);
1182               ++idxAxis;
1183             }
1184
1185             if (!varId.empty())
1186             {
1187               SuperClassWriter::addDimension(varId, (SuperClass::type == MULTI_FILE) ? nbIndexes : totalNbIndexes);
1188
1189               dims.clear();
1190               dims.push_back(varId);
1191               SuperClassWriter::addVariable(varId, NC_INT, dims);
1192
1193               SuperClassWriter::addAttribute("compress", compress, &varId);
1194
1195               switch (SuperClass::type)
1196               {
1197                 case (MULTI_FILE):
1198                 {
1199                   indexes -= firstGlobalIndex;
1200                   SuperClassWriter::writeData(indexes, varId, isCollective, 0);
1201                   break;
1202                 }
1203                 case (ONE_FILE):
1204                 {
1205                   std::vector<StdSize> start, count;
1206                   start.push_back(offset);
1207                   count.push_back(nbIndexes);
1208
1209                   SuperClassWriter::writeData(indexes, varId, isCollective, 0, &start, &count);
1210                   break;
1211                 }
1212               }
1213             }
1214           }
1215
1216           if (!dims.empty())
1217             grid->computeCompressedIndex();
1218         }
1219
1220         grid->addRelFileCompressed(this->filename);
1221       }
1222       catch (CNetCdfException& e)
1223       {
1224         StdString msg("On writing compressed grid : ");
1225         msg.append(grid->getId()); msg.append("\n");
1226         msg.append("In the context : ");
1227         CContext* context = CContext::getCurrent();
1228         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1229         msg.append(e.what());
1230         ERROR("CNc4DataOutput::writeGridCompressed_(CGrid* grid)", << msg);
1231       }
1232     }
1233
1234     //--------------------------------------------------------------
1235
1236     void CNc4DataOutput::writeTimeDimension_(void)
1237     {
1238       try
1239       {
1240        SuperClassWriter::addDimension(getTimeCounterName());
1241       }
1242       catch (CNetCdfException& e)
1243       {
1244         StdString msg("On writing time dimension : time_couter\n");
1245         msg.append("In the context : ");
1246         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1247         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1248         msg.append(e.what());
1249         ERROR("CNc4DataOutput::writeTimeDimension_(void)", << msg);
1250       }
1251     }
1252
1253      //--------------------------------------------------------------
1254
1255      void CNc4DataOutput::writeField_(CField* field)
1256      {
1257         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1258         CContextServer* server=context->server ;
1259
1260         std::vector<StdString> dims, coodinates;
1261         CGrid* grid = field->grid;
1262         if (!grid->doGridHaveDataToWrite())
1263          if (SuperClass::type==MULTI_FILE) return ;
1264
1265         CArray<bool,1> axisDomainOrder = grid->axis_domain_order;
1266         int numElement = axisDomainOrder.numElements(), idxDomain = 0, idxAxis = 0;
1267         std::vector<StdString> domainList = grid->getDomainList();
1268         std::vector<StdString> axisList   = grid->getAxisList();
1269
1270         StdString timeid  = getTimeCounterName();
1271         StdString dimXid,dimYid;
1272         std::deque<StdString> dimIdList, dimCoordList;
1273         bool hasArea = false;
1274         StdString cellMeasures = "area:";
1275         bool compressedOutput = !field->indexed_output.isEmpty() && field->indexed_output;
1276
1277         for (int i = 0; i < numElement; ++i)
1278         {
1279           if (axisDomainOrder(i))
1280           {
1281             CDomain* domain = CDomain::get(domainList[idxDomain]);
1282             StdString domId = domain->getDomainOutputName();
1283             StdString appendDomId  = singleDomain ? "" : "_" + domId ;
1284
1285             if (compressedOutput && domain->isCompressible() && domain->type != CDomain::type_attr::unstructured)
1286             {
1287               dimIdList.push_back(domId + "_points");
1288               field->setUseCompressedOutput();
1289             }
1290
1291             switch (domain->type)
1292             {
1293               case CDomain::type_attr::curvilinear:
1294                 if (!compressedOutput || !domain->isCompressible())
1295                 {
1296                   dimXid     = StdString("x").append(appendDomId);
1297                   dimIdList.push_back(dimXid);
1298                   dimYid     = StdString("y").append(appendDomId);
1299                   dimIdList.push_back(dimYid);
1300                 }
1301                 dimCoordList.push_back(StdString("nav_lon").append(appendDomId));
1302                 dimCoordList.push_back(StdString("nav_lat").append(appendDomId));
1303                 break ;
1304               case CDomain::type_attr::rectilinear:
1305                 if (!compressedOutput || !domain->isCompressible())
1306                 {
1307                   dimXid     = StdString("lon").append(appendDomId);
1308                   dimIdList.push_back(dimXid);
1309                   dimYid     = StdString("lat").append(appendDomId);
1310                   dimIdList.push_back(dimYid);
1311                 }
1312                 break ;
1313               case CDomain::type_attr::unstructured:
1314               {
1315           if (SuperClassWriter::useCFConvention)
1316           {
1317            dimXid     = StdString("cell").append(appendDomId);
1318            dimIdList.push_back(dimXid);
1319            dimCoordList.push_back(StdString("lon").append(appendDomId));
1320            dimCoordList.push_back(StdString("lat").append(appendDomId));
1321          }
1322           else
1323           {
1324            StdString domainName = domain->name;
1325            if (domain->nvertex == 1)
1326            {
1327              dimXid     = "n" + domainName + "_node";
1328              dimIdList.push_back(dimXid);
1329              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_node_x"));
1330              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_node_y"));
1331            }
1332            else if (domain->nvertex == 2)
1333            {
1334              dimXid     = "n" + domainName + "_edge";
1335              dimIdList.push_back(dimXid);
1336              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_edge_x"));
1337              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_edge_y"));
1338            }
1339            else
1340            {
1341              dimXid     = "n" + domainName + "_face";
1342              dimIdList.push_back(dimXid);
1343              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_face_x"));
1344              dimCoordList.push_back(StdString(domainName + "_face_y"));
1345            }
1346          }  // ugrid convention
1347        }  // case unstructured domain
1348             }
1349
1350             if (domain->hasArea)
1351             {
1352               hasArea = true;
1353               cellMeasures += " area" + appendDomId;
1354             }
1355             ++idxDomain;
1356           }
1357           else
1358           {
1359             CAxis* axis = CAxis::get(axisList[idxAxis]);
1360             StdString axisId = axis->getAxisOutputName();
1361
1362             if (compressedOutput && axis->isCompressible())
1363             {
1364               dimIdList.push_back(axisId + "_points");
1365               field->setUseCompressedOutput();
1366             }
1367             else
1368               dimIdList.push_back(axisId);
1369
1370             dimCoordList.push_back(axisId);
1371             ++idxAxis;
1372           }
1373         }
1374
1375/*
1376         StdString lonid_loc = (server->intraCommSize > 1)
1377                             ? StdString("lon").append(appendDomid).append("_local")
1378                             : lonid;
1379         StdString latid_loc = (server->intraCommSize > 1)
1380                             ? StdString("lat").append(appendDomid).append("_local")
1381                             : latid;
1382*/
1383         StdString fieldid = field->getFieldOutputName();
1384
1385//         unsigned int ssize = domain->zoom_ni_loc.getValue() * domain->zoom_nj_loc.getValue();
1386//         bool isCurvilinear = (domain->lonvalue.getValue()->size() == ssize);
1387//          bool isCurvilinear = domain->isCurvilinear ;
1388
1389         nc_type type ;
1390         if (field->prec.isEmpty()) type =  NC_FLOAT ;
1391         else
1392         {
1393           if (field->prec==2) type = NC_SHORT ;
1394           else if (field->prec==4)  type =  NC_FLOAT ;
1395           else if (field->prec==8)   type =  NC_DOUBLE ;
1396         }
1397
1398         bool wtime   = !(!field->operation.isEmpty() && field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::once);
1399
1400         if (wtime)
1401         {
1402
1403            //StdOStringStream oss;
1404           // oss << "time_" << field->operation.getValue()
1405           //     << "_" << field->getRelFile()->output_freq.getValue();
1406          //oss
1407            if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant) coodinates.push_back(string("time_instant"));
1408            else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered) coodinates.push_back(string("time_centered"));
1409            dims.push_back(timeid);
1410         }
1411
1412         if (compressedOutput && grid->isCompressible())
1413         {
1414           dims.push_back(grid->getId() + "_points");
1415           field->setUseCompressedOutput();
1416         }
1417         else
1418         {
1419           while (!dimIdList.empty())
1420           {
1421             dims.push_back(dimIdList.back());
1422             dimIdList.pop_back();
1423           }
1424         }
1425
1426         while (!dimCoordList.empty())
1427         {
1428           coodinates.push_back(dimCoordList.back());
1429           dimCoordList.pop_back();
1430         }
1431
1432         try
1433         {
1434           SuperClassWriter::addVariable(fieldid, type, dims);
1435
1436           if (!field->standard_name.isEmpty())
1437              SuperClassWriter::addAttribute
1438                 ("standard_name",  field->standard_name.getValue(), &fieldid);
1439
1440           if (!field->long_name.isEmpty())
1441              SuperClassWriter::addAttribute
1442                 ("long_name", field->long_name.getValue(), &fieldid);
1443
1444           if (!field->unit.isEmpty())
1445              SuperClassWriter::addAttribute
1446                 ("units", field->unit.getValue(), &fieldid);
1447
1448            if (!field->valid_min.isEmpty())
1449              SuperClassWriter::addAttribute
1450                 ("valid_min", field->valid_min.getValue(), &fieldid);
1451
1452           if (!field->valid_max.isEmpty())
1453              SuperClassWriter::addAttribute
1454                 ("valid_max", field->valid_max.getValue(), &fieldid);
1455
1456            if (!field->scale_factor.isEmpty())
1457              SuperClassWriter::addAttribute
1458                 ("scale_factor", field->scale_factor.getValue(), &fieldid);
1459
1460             if (!field->add_offset.isEmpty())
1461              SuperClassWriter::addAttribute
1462                 ("add_offset", field->add_offset.getValue(), &fieldid);
1463
1464           SuperClassWriter::addAttribute
1465                 ("online_operation", field->operation.getValue(), &fieldid);
1466
1467          // write child variables as attributes
1468
1469
1470           vector<CVariable*> listVars = field->getAllVariables() ;
1471           for (vector<CVariable*>::iterator it = listVars.begin() ;it != listVars.end(); it++) writeAttribute_(*it, fieldid) ;
1472
1473
1474           if (wtime)
1475           {
1476              CDuration freqOp = field->freq_op.getValue();
1477              freqOp.solveTimeStep(*context->calendar);
1478              StdString freqOpStr = freqOp.toStringUDUnits();
1479              SuperClassWriter::addAttribute("interval_operation", freqOpStr, &fieldid);
1480
1481              CDuration freqOut = field->getRelFile()->output_freq.getValue();
1482              freqOut.solveTimeStep(*context->calendar);
1483              SuperClassWriter::addAttribute("interval_write", freqOut.toStringUDUnits(), &fieldid);
1484
1485              StdString cellMethods = "time: ";
1486              if (field->operation.getValue() == "instant") cellMethods += "point";
1487              else if (field->operation.getValue() == "average") cellMethods += "mean";
1488              else if (field->operation.getValue() == "accumulate") cellMethods += "sum";
1489              else cellMethods += field->operation;
1490              if (freqOp.resolve(*context->calendar) != freqOut.resolve(*context->calendar))
1491                cellMethods += " (interval: " + freqOpStr + ")";
1492              SuperClassWriter::addAttribute("cell_methods", cellMethods, &fieldid);
1493           }
1494
1495           if (hasArea)
1496             SuperClassWriter::addAttribute("cell_measures", cellMeasures, &fieldid);
1497
1498           if (!field->default_value.isEmpty())
1499           {
1500              double default_value = field->default_value.getValue();
1501              float fdefault_value = (float)default_value;
1502              if (type == NC_DOUBLE)
1503                 SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, &default_value);
1504              else
1505                 SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, &fdefault_value);
1506           }
1507           else
1508              SuperClassWriter::setDefaultValue(fieldid, (double*)NULL);
1509
1510            if (field->compression_level.isEmpty())
1511              field->compression_level = field->file->compression_level.isEmpty() ? 0 : field->file->compression_level;
1512            SuperClassWriter::setCompressionLevel(fieldid, field->compression_level);
1513
1514           {  // Ecriture des coordonnes
1515
1516              StdString coordstr; //boost::algorithm::join(coodinates, " ")
1517              std::vector<StdString>::iterator
1518                 itc = coodinates.begin(), endc = coodinates.end();
1519
1520              for (; itc!= endc; itc++)
1521              {
1522                 StdString & coord = *itc;
1523                 if (itc+1 != endc)
1524                       coordstr.append(coord).append(" ");
1525                 else  coordstr.append(coord);
1526              }
1527
1528              SuperClassWriter::addAttribute("coordinates", coordstr, &fieldid);
1529
1530           }
1531         }
1532         catch (CNetCdfException& e)
1533         {
1534           StdString msg("On writing field : ");
1535           msg.append(fieldid); msg.append("\n");
1536           msg.append("In the context : ");
1537           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1538           msg.append(e.what());
1539           ERROR("CNc4DataOutput::writeField_(CField* field)", << msg);
1540         }
1541      } // writeField_()
1542
1543      //--------------------------------------------------------------
1544
1545      void CNc4DataOutput::writeFile_ (CFile* file)
1546      {
1547         StdString filename = file->getFileOutputName();
1548         StdString description = (!file->description.isEmpty())
1549                               ? file->description.getValue()
1550                               : StdString("Created by xios");
1551
1552         singleDomain = (file->nbDomains == 1);
1553
1554         try
1555         {
1556       if (SuperClassWriter::useCFConvention)
1557             this->writeFileAttributes(filename, description,
1558                                       StdString("CF-1.5"),
1559                                       StdString("An IPSL model"),
1560                                       this->getTimeStamp());
1561           else
1562             this->writeFileAttributes(filename, description,
1563                                       StdString("UGRID"),
1564                                       StdString("An IPSL model"),
1565                                       this->getTimeStamp());
1566
1567
1568           if (!appendMode)
1569             SuperClassWriter::addDimension("axis_nbounds", 2);
1570         }
1571         catch (CNetCdfException& e)
1572         {
1573           StdString msg("On writing file : ");
1574           msg.append(filename); msg.append("\n");
1575           msg.append("In the context : ");
1576           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1577           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1578           msg.append(e.what());
1579           ERROR("CNc4DataOutput::writeFile_ (CFile* file)", << msg);
1580         }
1581      }
1582
1583      void CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var, const string& fieldId)
1584      {
1585        StdString name = var->getVariableOutputName();
1586
1587        try
1588        {
1589          if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int || var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int32)
1590            addAttribute(name, var->getData<int>(), &fieldId);
1591          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int16)
1592            addAttribute(name, var->getData<short int>(), &fieldId);
1593          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_float)
1594            addAttribute(name, var->getData<float>(), &fieldId);
1595          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_double)
1596            addAttribute(name, var->getData<double>(), &fieldId);
1597          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_string)
1598            addAttribute(name, var->getData<string>(), &fieldId);
1599          else
1600            ERROR("CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var, const string& fieldId)",
1601                  << "Unsupported variable of type " << var->type.getStringValue());
1602        }
1603       catch (CNetCdfException& e)
1604       {
1605         StdString msg("On writing attributes of variable with name : ");
1606         msg.append(name); msg.append("in the field "); msg.append(fieldId); msg.append("\n");
1607         msg.append("In the context : ");
1608         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1609         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1610         msg.append(e.what());
1611         ERROR("CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var, const string& fieldId)", << msg);
1612       }
1613     }
1614
1615     void CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var)
1616     {
1617        StdString name = var->getVariableOutputName();
1618
1619        try
1620        {
1621          if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int || var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int32)
1622            addAttribute(name, var->getData<int>());
1623          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_int16)
1624            addAttribute(name, var->getData<short int>());
1625          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_float)
1626            addAttribute(name, var->getData<float>());
1627          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_double)
1628            addAttribute(name, var->getData<double>());
1629          else if (var->type.getValue() == CVariable::type_attr::t_string)
1630            addAttribute(name, var->getData<string>());
1631          else
1632            ERROR("CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var)",
1633                  << "Unsupported variable of type " << var->type.getStringValue());
1634        }
1635       catch (CNetCdfException& e)
1636       {
1637         StdString msg("On writing attributes of variable with name : ");
1638         msg.append(name); msg.append("\n");
1639         msg.append("In the context : ");
1640         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1641         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1642         msg.append(e.what());
1643         ERROR("CNc4DataOutput::writeAttribute_ (CVariable* var)", << msg);
1644       }
1645     }
1646
1647      void CNc4DataOutput::syncFile_ (void)
1648      {
1649        try
1650        {
1651          SuperClassWriter::sync() ;
1652        }
1653        catch (CNetCdfException& e)
1654        {
1655         StdString msg("On synchronizing the write among processes");
1656         msg.append("In the context : ");
1657         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1658         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1659         msg.append(e.what());
1660         ERROR("CNc4DataOutput::syncFile_ (void)", << msg);
1661        }
1662      }
1663
1664      void CNc4DataOutput::closeFile_ (void)
1665      {
1666        try
1667        {
1668          SuperClassWriter::close() ;
1669        }
1670        catch (CNetCdfException& e)
1671        {
1672         StdString msg("On closing file");
1673         msg.append("In the context : ");
1674         CContext* context = CContext::getCurrent() ;
1675         msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1676         msg.append(e.what());
1677         ERROR("CNc4DataOutput::syncFile_ (void)", << msg);
1678        }
1679
1680      }
1681
1682      //---------------------------------------------------------------
1683
1684      StdString CNc4DataOutput::getTimeStamp(void) const
1685      {
1686         const int buffer_size = 100;
1687         time_t rawtime;
1688         struct tm * timeinfo = NULL;
1689         char buffer [buffer_size];
1690
1691         time ( &rawtime );
1692         timeinfo = localtime ( &rawtime );
1693         strftime (buffer, buffer_size, "%Y-%b-%d %H:%M:%S %Z", timeinfo);
1694
1695         return (StdString(buffer));
1696      }
1697
1698      //---------------------------------------------------------------
1699
1700      void CNc4DataOutput::writeFieldData_ (CField*  field)
1701      {
1702        CContext* context = CContext::getCurrent();
1703        CContextServer* server = context->server;
1704        CGrid* grid = field->grid;
1705
1706        if (!grid->doGridHaveDataToWrite())
1707          if (SuperClass::type == MULTI_FILE || !isCollective) return;
1708
1709        StdString fieldid = field->getFieldOutputName();
1710
1711        StdOStringStream oss;
1712        string timeAxisId;
1713        if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant) timeAxisId = "time_instant";
1714        else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered) timeAxisId = "time_centered";
1715
1716        StdString timeBoundId = getTimeCounterName() + "_bounds";
1717
1718        StdString timeAxisBoundId;
1719        if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant) timeAxisBoundId = "time_instant_bounds";
1720        else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered) timeAxisBoundId = "time_centered_bounds";
1721
1722        if (!field->wasWritten())
1723        {
1724          if (appendMode && field->file->record_offset.isEmpty())
1725          {
1726            field->resetNStep(getRecordFromTime(field->last_Write_srv) + 1);
1727          }
1728
1729          field->setWritten();
1730        }
1731
1732
1733        CArray<double,1> time_data(1);
1734        CArray<double,1> time_data_bound(2);
1735        CArray<double,1> time_counter(1);
1736        CArray<double,1> time_counter_bound(2);
1737
1738        bool wtime = (field->getOperationTimeType() != func::CFunctor::once);
1739
1740        if (wtime)
1741        {
1742          Time lastWrite = field->last_Write_srv;
1743          Time lastLastWrite = field->lastlast_Write_srv;
1744
1745          if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant)
1746            time_data(0) = lastWrite;
1747          else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered)
1748            time_data(0) = (lastWrite + lastLastWrite) / 2;
1749
1750          if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant)
1751            time_data_bound(0) = time_data_bound(1) = lastWrite;
1752          else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered)
1753          {
1754            time_data_bound(0) = lastLastWrite;
1755            time_data_bound(1) = lastWrite;
1756          }
1757
1758          if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::instant)
1759            time_counter(0) = lastWrite;
1760          else if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::centered)
1761            time_counter(0) = (lastWrite + lastLastWrite) / 2;
1762          else if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::record)
1763            time_counter(0) = field->getNStep() - 1;
1764
1765
1766          if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::instant)
1767            time_counter_bound(0) = time_counter_bound(1) = lastWrite;
1768          else if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::centered)
1769          {
1770            time_counter_bound(0) = lastLastWrite;
1771            time_counter_bound(1) = lastWrite;
1772          }
1773          else if (field->file->time_counter == CFile::time_counter_attr::record)
1774            time_counter_bound(0) = time_counter_bound(1) = field->getNStep() - 1;
1775        }
1776
1777         bool isRoot = (server->intraCommRank == 0);
1778
1779         if (!field->scale_factor.isEmpty() || !field->add_offset.isEmpty())
1780         {
1781           double scaleFactor = 1.0;
1782           double addOffset = 0.0;
1783           if (!field->scale_factor.isEmpty()) scaleFactor = field->scale_factor;
1784           if (!field->add_offset.isEmpty()) addOffset = field->add_offset;
1785           field->scaleFactorAddOffset(scaleFactor, addOffset);
1786         }
1787
1788         try
1789         {
1790           size_t writtenSize;
1791           if (field->getUseCompressedOutput())
1792             writtenSize = grid->getNumberWrittenIndexes();
1793           else
1794             writtenSize = grid->getWrittenDataSize();
1795
1796           CArray<double,1> fieldData(writtenSize);
1797           if (!field->default_value.isEmpty()) fieldData = field->default_value;
1798
1799           if (field->getUseCompressedOutput())
1800             field->outputCompressedField(fieldData);
1801           else
1802             field->outputField(fieldData);
1803
1804           if (!field->prec.isEmpty() && field->prec == 2) fieldData = round(fieldData);
1805
1806           switch (SuperClass::type)
1807           {
1808              case (MULTI_FILE) :
1809              {
1810                 SuperClassWriter::writeData(fieldData, fieldid, isCollective, field->getNStep() - 1);
1811                 if (wtime)
1812                 {
1813                   SuperClassWriter::writeData(time_data, timeAxisId, isCollective, field->getNStep() - 1);
1814                   SuperClassWriter::writeData(time_data_bound, timeAxisBoundId, isCollective, field->getNStep() - 1);
1815                   if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::none)
1816                   {
1817                     SuperClassWriter::writeData(time_counter, getTimeCounterName(), isCollective, field->getNStep() - 1);
1818                     if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::record)
1819                       SuperClassWriter::writeData(time_counter_bound, timeBoundId, isCollective, field->getNStep() - 1);
1820                   }
1821                 }
1822                 break;
1823              }
1824              case (ONE_FILE) :
1825              {
1826                const std::vector<int>& nZoomBeginGlobal = grid->getDistributionServer()->getZoomBeginGlobal();
1827                const std::vector<int>& nZoomBeginServer = grid->getDistributionServer()->getZoomBeginServer();
1828                const std::vector<int>& nZoomSizeServer  = grid->getDistributionServer()->getZoomSizeServer();
1829
1830                std::vector<StdSize> start, count;
1831
1832                if (field->getUseCompressedOutput())
1833                {
1834                  if (grid->isCompressible())
1835                  {
1836                    start.push_back(grid->getOffsetWrittenIndexes());
1837                    count.push_back(grid->getNumberWrittenIndexes());
1838                  }
1839                  else
1840                  {
1841                    CArray<bool,1> axisDomainOrder = grid->axis_domain_order;
1842                    std::vector<StdString> domainList = grid->getDomainList();
1843                    std::vector<StdString> axisList   = grid->getAxisList();
1844                    int numElement = axisDomainOrder.numElements();
1845                    int idxDomain = domainList.size() - 1, idxAxis = axisList.size() - 1;
1846                    int idx = nZoomBeginGlobal.size() - 1;
1847
1848                    start.reserve(nZoomBeginGlobal.size());
1849                    count.reserve(nZoomBeginGlobal.size());
1850
1851
1852                    for (int i = numElement - 1; i >= 0; --i)
1853                    {
1854                      if (axisDomainOrder(i))
1855                      {
1856                        CDomain* domain = CDomain::get(domainList[idxDomain]);
1857
1858                        if (domain->isCompressible())
1859                        {
1860                          start.push_back(domain->getOffsetWrittenIndexes());
1861                          count.push_back(domain->getNumberWrittenIndexes());
1862                          idx -= 2;
1863                        }
1864                        else
1865                        {
1866                          if ((domain->type) != CDomain::type_attr::unstructured)
1867                          {
1868                            start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1869                            count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1870                          }
1871                          --idx;
1872                          start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1873                          count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1874                          --idx;
1875                        }
1876                        --idxDomain;
1877                      }
1878                      else
1879                      {
1880                        CAxis* axis = CAxis::get(axisList[idxAxis]);
1881
1882                        if (axis->isCompressible())
1883                        {
1884                          start.push_back(axis->getOffsetWrittenIndexes());
1885                          count.push_back(axis->getNumberWrittenIndexes());
1886                        }
1887                        else
1888                        {
1889                          start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1890                          count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1891                        }
1892
1893                        --idxAxis;
1894                        --idx;
1895                      }
1896                    }
1897                  }
1898                }
1899                else
1900                {
1901
1902                  CArray<bool,1> axisDomainOrder = grid->axis_domain_order;
1903                  std::vector<StdString> domainList = grid->getDomainList();
1904                  std::vector<StdString> axisList   = grid->getAxisList();
1905                  int numElement = axisDomainOrder.numElements();
1906                  int idxDomain = domainList.size() - 1, idxAxis = axisList.size() - 1;
1907                  int idx = nZoomBeginGlobal.size() - 1;
1908
1909                  start.reserve(nZoomBeginGlobal.size());
1910                  count.reserve(nZoomBeginGlobal.size());
1911
1912                  for (int i = numElement - 1; i >= 0; --i)
1913                  {
1914                    if (axisDomainOrder(i))
1915                    {
1916                      CDomain* domain = CDomain::get(domainList[idxDomain]);
1917                      if ((domain->type) != CDomain::type_attr::unstructured)
1918                      {
1919                        start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1920                        count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1921                      }
1922                      --idx ;
1923                      start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1924                      count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1925                      --idx ;
1926                      --idxDomain;
1927                    }
1928                    else
1929                    {
1930                      start.push_back(nZoomBeginServer[idx] - nZoomBeginGlobal[idx]);
1931                      count.push_back(nZoomSizeServer[idx]);
1932                      --idx;
1933                     }
1934                  }
1935                }
1936
1937                SuperClassWriter::writeData(fieldData, fieldid, isCollective, field->getNStep() - 1, &start, &count);
1938                if (wtime)
1939                {
1940                   SuperClassWriter::writeTimeAxisData(time_data, timeAxisId, isCollective, field->getNStep() - 1, isRoot);
1941                   SuperClassWriter::writeTimeAxisData(time_data_bound, timeAxisBoundId, isCollective, field->getNStep() - 1, isRoot);
1942                   if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::none)
1943                   {
1944                     SuperClassWriter::writeTimeAxisData(time_counter, getTimeCounterName(), isCollective, field->getNStep() - 1, isRoot);
1945                     if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::record)
1946                       SuperClassWriter::writeTimeAxisData(time_counter_bound, timeBoundId, isCollective, field->getNStep() - 1, isRoot);
1947                   }
1948                }
1949
1950                break;
1951              }
1952            }
1953         }
1954         catch (CNetCdfException& e)
1955         {
1956           StdString msg("On writing field data: ");
1957           msg.append(fieldid); msg.append("\n");
1958           msg.append("In the context : ");
1959           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
1960           msg.append(e.what());
1961           ERROR("CNc4DataOutput::writeFieldData_ (CField*  field)", << msg);
1962         }
1963      }
1964
1965      //---------------------------------------------------------------
1966
1967      void CNc4DataOutput::writeTimeAxis_
1968                  (CField*    field,
1969                   const boost::shared_ptr<CCalendar> cal)
1970      {
1971         StdOStringStream oss;
1972
1973         if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::once) return ;
1974
1975//         oss << "time_" << field->operation.getValue()
1976//             << "_" << field->getRelFile()->output_freq.getValue();
1977
1978//         StdString axisid = oss.str();
1979//         if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::centered) axisid="time_centered" ;
1980//         else if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant) axisid="time_instant" ;
1981
1982         StdString axisid("time_centered") ;
1983         StdString axisBoundId("time_centered_bounds");
1984         StdString timeid(getTimeCounterName());
1985         StdString timeBoundId("axis_nbounds");
1986
1987         if (field->getOperationTimeType() == func::CFunctor::instant)
1988         {
1989            axisid = "time_instant";
1990            axisBoundId = "time_instant_bounds";
1991         }
1992
1993         try
1994         {
1995          // Adding time_instant or time_centered
1996           std::vector<StdString> dims;
1997           dims.push_back(timeid);
1998           if (!SuperClassWriter::varExist(axisid))
1999           {
2000              SuperClassWriter::addVariable(axisid, NC_DOUBLE, dims);
2001
2002              CDate timeOrigin=cal->getTimeOrigin() ;
2003              StdOStringStream oss2;
2004  //            oss2<<initDate.getYear()<<"-"<<initDate.getMonth()<<"-"<<initDate.getDay()<<" "
2005  //                <<initDate.getHour()<<"-"<<initDate.getMinute()<<"-"<<initDate.getSecond() ;
2006              StdString strInitdate=oss2.str() ;
2007              StdString strTimeOrigin=timeOrigin.toString() ;
2008              this->writeTimeAxisAttributes
2009                 (axisid, cal->getType(),
2010                  StdString("seconds since ").append(strTimeOrigin),
2011                  strTimeOrigin, axisBoundId);
2012           }
2013
2014           // Adding time_instant_bounds or time_centered_bounds variables
2015           if (!SuperClassWriter::varExist(axisBoundId))
2016           {
2017              dims.clear() ;
2018              dims.push_back(timeid);
2019              dims.push_back(timeBoundId);
2020              SuperClassWriter::addVariable(axisBoundId, NC_DOUBLE, dims);
2021           }
2022
2023           if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::none)
2024           {
2025             // Adding time_counter
2026             axisid = getTimeCounterName();
2027             axisBoundId = getTimeCounterName() + "_bounds";
2028             dims.clear();
2029             dims.push_back(timeid);
2030             if (!SuperClassWriter::varExist(axisid))
2031             {
2032                SuperClassWriter::addVariable(axisid, NC_DOUBLE, dims);
2033                SuperClassWriter::addAttribute("axis", string("T"), &axisid);
2034
2035                if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::record)
2036                {
2037                  CDate timeOrigin = cal->getTimeOrigin();
2038                  StdString strTimeOrigin = timeOrigin.toString();
2039
2040                  this->writeTimeAxisAttributes(axisid, cal->getType(),
2041                                                StdString("seconds since ").append(strTimeOrigin),
2042                                                strTimeOrigin, axisBoundId);
2043                }
2044             }
2045
2046             // Adding time_counter_bound dimension
2047             if (field->file->time_counter != CFile::time_counter_attr::record)
2048             {
2049                if (!SuperClassWriter::varExist(axisBoundId))
2050                {
2051                  dims.clear();
2052                  dims.push_back(timeid);
2053                  dims.push_back(timeBoundId);
2054                  SuperClassWriter::addVariable(axisBoundId, NC_DOUBLE, dims);
2055                }
2056             }
2057           }
2058         }
2059         catch (CNetCdfException& e)
2060         {
2061           StdString msg("On writing time axis data: ");
2062           msg.append("In the context : ");
2063           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2064           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2065           msg.append(e.what());
2066           ERROR("CNc4DataOutput::writeTimeAxis_ (CField*    field, \
2067                  const boost::shared_ptr<CCalendar> cal)", << msg);
2068         }
2069      }
2070
2071      //---------------------------------------------------------------
2072
2073      void CNc4DataOutput::writeTimeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
2074                                                   const StdString & calendar,
2075                                                   const StdString & units,
2076                                                   const StdString & time_origin,
2077                                                   const StdString & time_bounds,
2078                                                   const StdString & standard_name,
2079                                                   const StdString & long_name)
2080      {
2081         try
2082         {
2083           SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", standard_name, &axis_name);
2084           SuperClassWriter::addAttribute("long_name",     long_name    , &axis_name);
2085           SuperClassWriter::addAttribute("calendar",      calendar     , &axis_name);
2086           SuperClassWriter::addAttribute("units",         units        , &axis_name);
2087           SuperClassWriter::addAttribute("time_origin",   time_origin  , &axis_name);
2088           SuperClassWriter::addAttribute("bounds",        time_bounds  , &axis_name);
2089         }
2090         catch (CNetCdfException& e)
2091         {
2092           StdString msg("On writing time axis Attribute: ");
2093           msg.append("In the context : ");
2094           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2095           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2096           msg.append(e.what());
2097           ERROR("CNc4DataOutput::writeTimeAxisAttributes(const StdString & axis_name, \
2098                                                          const StdString & calendar,\
2099                                                          const StdString & units, \
2100                                                          const StdString & time_origin, \
2101                                                          const StdString & time_bounds, \
2102                                                          const StdString & standard_name, \
2103                                                          const StdString & long_name)", << msg);
2104         }
2105      }
2106
2107      //---------------------------------------------------------------
2108
2109      void CNc4DataOutput::writeAxisAttributes(const StdString & axis_name,
2110                                               const StdString & axis,
2111                                               const StdString & standard_name,
2112                                               const StdString & long_name,
2113                                               const StdString & units,
2114                                               const StdString & nav_model)
2115      {
2116         try
2117         {
2118          if (!axis.empty())
2119            SuperClassWriter::addAttribute("axis"       , axis         , &axis_name);
2120
2121          SuperClassWriter::addAttribute("standard_name", standard_name, &axis_name);
2122          SuperClassWriter::addAttribute("long_name"    , long_name    , &axis_name);
2123          SuperClassWriter::addAttribute("units"        , units        , &axis_name);
2124          SuperClassWriter::addAttribute("nav_model"    , nav_model    , &axis_name);
2125         }
2126         catch (CNetCdfException& e)
2127         {
2128           StdString msg("On writing Axis Attribute: ");
2129           msg.append("In the context : ");
2130           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2131           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2132           msg.append(e.what());
2133           ERROR("CNc4DataOutput::writeAxisAttributes(const StdString & axis_name, \
2134                                                      const StdString & axis, \
2135                                                      const StdString & standard_name, \
2136                                                      const StdString & long_name, \
2137                                                      const StdString & units, \
2138                                                      const StdString & nav_model)", << msg);
2139         }
2140      }
2141
2142      //---------------------------------------------------------------
2143
2144      void CNc4DataOutput::writeLocalAttributes
2145         (int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, StdString domid)
2146      {
2147        try
2148        {
2149         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("ibegin").append(domid), ibegin);
2150         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("ni"    ).append(domid), ni);
2151         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("jbegin").append(domid), jbegin);
2152         SuperClassWriter::addAttribute(StdString("nj"    ).append(domid), nj);
2153        }
2154        catch (CNetCdfException& e)
2155        {
2156           StdString msg("On writing Local Attributes: ");
2157           msg.append("In the context : ");
2158           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2159           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2160           msg.append(e.what());
2161           ERROR("CNc4DataOutput::writeLocalAttributes \
2162                  (int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, StdString domid)", << msg);
2163        }
2164
2165      }
2166
2167      void CNc4DataOutput::writeLocalAttributes_IOIPSL(const StdString& dimXid, const StdString& dimYid,
2168                                                       int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, int ni_glo, int nj_glo, int rank, int size)
2169      {
2170         CArray<int,1> array(2) ;
2171
2172         try
2173         {
2174           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_number_total",size ) ;
2175           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_number", rank) ;
2176           array = SuperClassWriter::getDimension(dimXid) + 1, SuperClassWriter::getDimension(dimYid) + 1;
2177           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_dimensions_ids",array) ;
2178           array=ni_glo,nj_glo ;
2179           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_size_global", array) ;
2180           array=ni,nj ;
2181           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_size_local", array) ;
2182           array=ibegin+1,jbegin+1 ;
2183           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_position_first", array) ;
2184           array=ibegin+ni-1+1,jbegin+nj-1+1 ;
2185           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_position_last",array) ;
2186           array=0,0 ;
2187           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_halo_size_start", array) ;
2188           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_halo_size_end", array);
2189           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_type",string("box")) ;
2190  /*
2191           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_DIM_N001",string("x")) ;
2192           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_DIM_N002",string("y")) ;
2193           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_DIM_N003",string("axis_A")) ;
2194           SuperClassWriter::addAttribute("DOMAIN_DIM_N004",string("time_counter")) ;
2195  */
2196         }
2197         catch (CNetCdfException& e)
2198         {
2199           StdString msg("On writing Local Attributes IOIPSL \n");
2200           msg.append("In the context : ");
2201           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2202           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2203           msg.append(e.what());
2204           ERROR("CNc4DataOutput::writeLocalAttributes_IOIPSL \
2205                  (int ibegin, int ni, int jbegin, int nj, int ni_glo, int nj_glo, int rank, int size)", << msg);
2206         }
2207      }
2208      //---------------------------------------------------------------
2209
2210      void CNc4DataOutput:: writeFileAttributes(const StdString & name,
2211                                                const StdString & description,
2212                                                const StdString & conventions,
2213                                                const StdString & production,
2214                                                const StdString & timeStamp)
2215      {
2216         try
2217         {
2218           SuperClassWriter::addAttribute("name"       , name);
2219           SuperClassWriter::addAttribute("description", description);
2220           SuperClassWriter::addAttribute("title"      , description);
2221           SuperClassWriter::addAttribute("Conventions", conventions);
2222           SuperClassWriter::addAttribute("production" , production);
2223           SuperClassWriter::addAttribute("timeStamp"  , timeStamp);
2224         }
2225         catch (CNetCdfException& e)
2226         {
2227           StdString msg("On writing File Attributes \n ");
2228           msg.append("In the context : ");
2229           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2230           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2231           msg.append(e.what());
2232           ERROR("CNc4DataOutput:: writeFileAttributes(const StdString & name, \
2233                                                const StdString & description, \
2234                                                const StdString & conventions, \
2235                                                const StdString & production, \
2236                                                const StdString & timeStamp)", << msg);
2237         }
2238      }
2239
2240      //---------------------------------------------------------------
2241
2242      void CNc4DataOutput::writeMaskAttributes(const StdString & mask_name,
2243                                               int data_dim,
2244                                               int data_ni,
2245                                               int data_nj,
2246                                               int data_ibegin,
2247                                               int data_jbegin)
2248      {
2249         try
2250         {
2251           SuperClassWriter::addAttribute("data_dim"   , data_dim   , &mask_name);
2252           SuperClassWriter::addAttribute("data_ni"    , data_ni    , &mask_name);
2253           SuperClassWriter::addAttribute("data_nj"    , data_nj    , &mask_name);
2254           SuperClassWriter::addAttribute("data_ibegin", data_ibegin, &mask_name);
2255           SuperClassWriter::addAttribute("data_jbegin", data_jbegin, &mask_name);
2256         }
2257         catch (CNetCdfException& e)
2258         {
2259           StdString msg("On writing Mask Attributes \n ");
2260           msg.append("In the context : ");
2261           CContext* context = CContext::getCurrent() ;
2262           msg.append(context->getId()); msg.append("\n");
2263           msg.append(e.what());
2264           ERROR("CNc4DataOutput::writeMaskAttributes(const StdString & mask_name, \
2265                                               int data_dim, \
2266                                               int data_ni, \
2267                                               int data_nj, \
2268                                               int data_ibegin, \
2269                                               int data_jbegin)", << msg);
2270         }
2271      }
2272
2273      ///--------------------------------------------------------------
2274
2275      StdSize CNc4DataOutput::getRecordFromTime(Time time)
2276      {
2277        std::map<Time, StdSize>::const_iterator it = timeToRecordCache.find(time);
2278        if (it == timeToRecordCache.end())
2279        {
2280          StdString timeAxisBoundsId(getTimeCounterName() + "_bounds");
2281          if (!SuperClassWriter::varExist(timeAxisBoundsId))
2282            timeAxisBoundsId = "time_instant_bounds";
2283
2284          CArray<double,2> timeAxisBounds;
2285          SuperClassWriter::getTimeAxisBounds(timeAxisBounds, timeAxisBoundsId, isCollective);
2286
2287          StdSize record = 0;
2288          double dtime(time);
2289          for (int n = timeAxisBounds.extent(1) - 1; n >= 0; n--)
2290          {
2291            if (timeAxisBounds(1, n) < dtime)
2292            {
2293              record = n + 1;
2294              break;
2295            }
2296          }
2297          it = timeToRecordCache.insert(std::make_pair(time, record)).first;
2298        }
2299        return it->second;
2300      }
2301
2302      ///--------------------------------------------------------------
2303
2304      bool CNc4DataOutput::isWrittenDomain(const std::string& domainName) const
2305      {
2306        return (this->writtenDomains.find(domainName) != this->writtenDomains.end());
2307      }
2308
2309      bool CNc4DataOutput::isWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName) const
2310      {
2311        return (this->writtenCompressedDomains.find(domainName) != this->writtenCompressedDomains.end());
2312      }
2313
2314      bool CNc4DataOutput::isWrittenAxis(const std::string& axisName) const
2315      {
2316        return (this->writtenAxis.find(axisName) != this->writtenAxis.end());
2317      }
2318
2319      bool CNc4DataOutput::isWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName) const
2320      {
2321        return (this->writtenCompressedAxis.find(axisName) != this->writtenCompressedAxis.end());
2322      }
2323
2324      void CNc4DataOutput::setWrittenDomain(const std::string& domainName)
2325      {
2326        this->writtenDomains.insert(domainName);
2327      }
2328
2329      void CNc4DataOutput::setWrittenCompressedDomain(const std::string& domainName)
2330      {
2331        this->writtenCompressedDomains.insert(domainName);
2332      }
2333
2334      void CNc4DataOutput::setWrittenAxis(const std::string& axisName)
2335      {
2336        this->writtenAxis.insert(axisName);
2337      }
2338
2339      void CNc4DataOutput::setWrittenCompressedAxis(const std::string& axisName)
2340      {
2341        this->writtenCompressedAxis.insert(axisName);
2342      }
2343} // namespace xios
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.