source: XIOS/trunk/src/test/test_remap.f90 @ 1018

Last change on this file since 1018 was 1018, checked in by mhnguyen, 4 years ago

Improving missing-value processing
If detect_missing_value is activated, then all missing value will be converted to
NaN (Not-a-number) in input of data flow then they will be reconverted to missing value on output

+) Update SourceFilter?, TemporalFilter? and SpatialTransformFilter? with new processing
+) Update all transformations with new processing

Test
+) On Curie
+) Work

  • Property svn:executable set to *
File size: 7.8 KB
Line 
1PROGRAM test_remap
2
3  USE xios
4  USE mod_wait
5  USE netcdf
6
7  IMPLICIT NONE
8  INCLUDE "mpif.h"
9  INTEGER :: rank
10  INTEGER :: size
11  INTEGER :: ierr
12
13  CHARACTER(len=*),PARAMETER :: id="client"
14  INTEGER :: comm
15  TYPE(xios_duration) :: dtime
16  TYPE(xios_context) :: ctx_hdl
17
18  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lon(:), dst_lon(:)
19  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lat(:), dst_lat(:)
20  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslon(:,:), dst_boundslon(:,:)
21  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslat(:,:), dst_boundslat(:,:)
22  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_2D(:)
23  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: tmp_field_0(:), tmp_field_1(:), tmp_field_2(:)
24  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_3D(:,:), src_field_4D(:,:,:), lval(:), lval1(:), lval2(:), src_field_pression(:,:)
25  LOGICAL,ALLOCATABLE :: src_mask_2D(:)
26  INTEGER :: src_ni_glo, dst_ni_glo;
27  INTEGER :: src_nvertex, dst_nvertex;
28  INTEGER :: src_ibegin, dst_ibegin;
29  INTEGER :: src_ni, dst_ni;
30  INTEGER :: src_tmp_ni, src_tmp_nj, src_tmp_n;
31  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: src_file="h14.nc"
32  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: dst_file="r180x90.nc"
33  INTEGER :: ncid
34  INTEGER :: dimids(2)
35  INTEGER :: div,remain
36  INTEGER :: varid
37  INTEGER :: ts
38  INTEGER :: i
39  INTEGER,PARAMETER :: llm=5, interpolatedLlm = 4, llm2 = 6
40
41  CALL MPI_INIT(ierr)
42  CALL init_wait
43
44!!! XIOS Initialization (get the local communicator)
45
46  CALL xios_initialize(id,return_comm=comm)
47  CALL MPI_COMM_RANK(comm,rank,ierr)
48  CALL MPI_COMM_SIZE(comm,size,ierr)
49
50  ierr=NF90_OPEN(src_file, NF90_NOWRITE, ncid)
51  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
52  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
53  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=src_nvertex)
54  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=src_ni_glo)
55
56  div    = src_ni_glo/size
57  remain = MOD( src_ni_glo, size )
58  IF (rank < remain) THEN
59    src_ni=div+1 ;
60    src_ibegin=rank*(div+1) ;
61  ELSE
62    src_ni=div ;
63    src_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
64  ENDIF
65
66  ALLOCATE(src_lon(src_ni))
67  ALLOCATE(src_lat(src_ni))
68  ALLOCATE(src_boundslon(src_nvertex,src_ni))
69  ALLOCATE(src_boundslat(src_nvertex,src_ni))
70  ALLOCATE(src_field_2D(src_ni))
71  ALLOCATE(src_field_3D(src_ni,llm))
72  ALLOCATE(src_field_4D(src_ni,llm,llm2))
73  ALLOCATE(src_mask_2D(src_ni))
74  ALLOCATE(src_field_pression(src_ni,llm))
75  ALLOCATE(lval(llm))
76  ALLOCATE(lval1(interpolatedLlm))
77  ALLOCATE(lval2(llm2))
78
79  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
80  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lon, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
81  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
82  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lat, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
83  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
84  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,src_boundslon, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
85  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
86  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_boundslat, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
87  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"val",varid)
88  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_field_2D, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
89  DO i=1,src_ni
90    src_field_3D(i,:) = src_field_2D(i)
91    IF (MOD(i,10)==0) THEN
92      src_mask_2D(i)=.FALSE.
93      src_field_2D(i) = 100000
94    ELSE
95      src_mask_2D(i)=.TRUE.     
96    ENDIF
97  ENDDO
98
99  DO i=1,llm
100    lval(i) = i*100
101    src_field_pression(:,i) = i * 100
102    IF (MOD(i,3)==0) THEN
103      ! src_field_pression(:,i) = 100000
104      src_field_3D(:,i) = 100000
105    ELSE
106      ! src_field_pression(:,i) = i * 100
107      src_field_3D(:,i) = src_field_3D(:,i) + i * 10 
108    ENDIF
109    ! src_field_3D(:,i) = src_field_3D(:,i) + i * 10   
110  ENDDO
111
112  DO i=1,llm2
113    src_field_4D(:,:,i) = src_field_3D(:,:) + i * 100
114  ENDDO
115
116  DO i=1,interpolatedLlm
117    lval2(i) = i*10
118    lval1(i) = i*10 + 2
119  ENDDO
120
121  ierr=NF90_OPEN(dst_file, NF90_NOWRITE, ncid)
122  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
123  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
124  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=dst_nvertex)
125  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=dst_ni_glo)
126
127  div    = dst_ni_glo/size
128  remain = MOD( dst_ni_glo, size )
129  IF (rank < remain) THEN
130    dst_ni=div+1 ;
131    dst_ibegin=rank*(div+1) ;
132  ELSE
133    dst_ni=div ;
134    dst_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
135  ENDIF
136
137  ALLOCATE(dst_lon(dst_ni))
138  ALLOCATE(dst_lat(dst_ni))
139  ALLOCATE(dst_boundslon(dst_nvertex,dst_ni))
140  ALLOCATE(dst_boundslat(dst_nvertex,dst_ni))
141
142  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
143  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lon, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
144  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
145  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lat, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
146  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
147  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,dst_boundslon, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
148  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
149  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_boundslat, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
150
151
152  CALL xios_context_initialize("test",comm)
153  CALL xios_get_handle("test",ctx_hdl)
154  CALL xios_set_current_context(ctx_hdl)
155
156  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
157  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
158                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex)
159
160  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
161  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
162                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex, &
163                            mask_1d=src_mask_2D)
164
165  CALL xios_set_axis_attr("src_axis", n_glo=llm, value=lval)
166  CALL xios_set_axis_attr("nq", n_glo=llm2, value=lval2)
167
168  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", ni_glo=dst_ni_glo, ibegin=dst_ibegin, ni=dst_ni, type="unstructured")
169  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", lonvalue_1D=dst_lon, latvalue_1D=dst_lat, &
170                            bounds_lon_1D=dst_boundslon, bounds_lat_1D=dst_boundslat, nvertex=dst_nvertex)
171
172  dtime%second = 3600
173  CALL xios_set_timestep(dtime)
174
175  CALL xios_close_context_definition()
176  ! CALL xios_get_domain_attr("src_domain_regular_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
177  ! ALLOCATE(tmp_field_0(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
178
179  ! CALL xios_get_axis_attr("src_axis_curvilinear_read", n=src_tmp_n)
180  ! CALL xios_get_domain_attr("src_domain_curvilinear_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
181  ! ALLOCATE(tmp_field_1(src_tmp_ni*src_tmp_nj*src_tmp_n))
182
183  ! CALL xios_get_domain_attr("src_domain_unstructured_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
184  ! ALLOCATE(tmp_field_2(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
185
186  DO ts=1,5
187    ! CALL xios_recv_field("src_field_regular", tmp_field_0)
188    ! CALL xios_recv_field("src_field_curvilinear", tmp_field_1)
189    ! CALL xios_recv_field("src_field_unstructured", tmp_field_2)
190    CALL xios_update_calendar(ts)
191    CALL xios_send_field("src_field_2D",src_field_2D)
192    CALL xios_send_field("src_field_2D_clone",src_field_2D)
193    CALL xios_send_field("src_field_3D",src_field_3D)
194    CALL xios_send_field("src_field_3D_clone",src_field_3D)
195    CALL xios_send_field("src_field_4D",src_field_4D)
196    CALL xios_send_field("src_field_3D_pression",src_field_pression)
197    ! CALL xios_send_field("tmp_field_0",tmp_field_0)
198    ! CALL xios_send_field("tmp_field_1",tmp_field_1)
199    ! CALL xios_send_field("tmp_field_2",tmp_field_2)
200    CALL wait_us(5000) ;
201   ENDDO
202
203  CALL xios_context_finalize()
204
205  DEALLOCATE(src_lon, src_lat, src_boundslon,src_boundslat, src_field_2D)
206  DEALLOCATE(dst_lon, dst_lat, dst_boundslon,dst_boundslat)
207  ! DEALLOCATE(tmp_field_0, tmp_field_1, tmp_field_2)
208
209  CALL MPI_COMM_FREE(comm, ierr)
210
211  CALL xios_finalize()
212
213  CALL MPI_FINALIZE(ierr)
214
215END PROGRAM test_remap
216
217
218
219
220
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.