source: XIOS/trunk/src/test/test_remap.f90 @ 1064

Last change on this file since 1064 was 1064, checked in by mhnguyen, 5 years ago

Auto-distribution of unstructured grid read from a file.

+ Unstructured grid read from a file is now distributed automatically among clients if there is
no distribution information provided.
+ Attributes of grid can be setup: From model (highest priority), from file (reading), or auto-generation (lowest priority).
If an attribute can be setup by several ways, it will be setup by one with the higher priority.

Test
+ On Curie
+ Tests pass

  • Property svn:executable set to *
File size: 8.7 KB
Line 
1PROGRAM test_remap
2
3  USE xios
4  USE mod_wait
5  USE netcdf
6
7  IMPLICIT NONE
8  INCLUDE "mpif.h"
9  INTEGER :: rank
10  INTEGER :: size
11  INTEGER :: ierr
12
13  CHARACTER(len=*),PARAMETER :: id="client"
14  INTEGER :: comm
15  TYPE(xios_duration) :: dtime
16  TYPE(xios_context) :: ctx_hdl
17
18  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lon(:), dst_lon(:), src_lon_tmp(:)
19  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_lat(:), dst_lat(:), src_lat_tmp(:)
20  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslon(:,:), dst_boundslon(:,:)
21  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_boundslat(:,:), dst_boundslat(:,:)
22  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_2D(:), src_field_2D_clone(:)
23  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: tmp_field_0(:), tmp_field_1(:), tmp_field_2(:)
24  DOUBLE PRECISION,ALLOCATABLE :: src_field_3D(:,:), src_field_4D(:,:,:), lval(:), lval1(:), lval2(:), src_field_pression(:,:)
25  LOGICAL,ALLOCATABLE :: src_mask_2D(:)
26  INTEGER :: src_ni_glo, dst_ni_glo;
27  INTEGER :: src_nvertex, dst_nvertex;
28  INTEGER :: src_ibegin, dst_ibegin;
29  INTEGER :: src_ni, dst_ni;
30  INTEGER :: src_tmp_ni, src_tmp_nj, src_tmp_n;
31  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: src_file="h14.nc"
32  CHARACTER(LEN=*),PARAMETER :: dst_file="r180x90.nc"
33  INTEGER :: ncid
34  INTEGER :: dimids(2)
35  INTEGER :: div,remain
36  INTEGER :: varid
37  INTEGER :: ts
38  INTEGER :: i,j
39  INTEGER,PARAMETER :: llm=5, interpolatedLlm = 4, llm2 = 6
40  DOUBLE PRECISION, PARAMETER :: missing_value = 100000
41
42  CALL MPI_INIT(ierr)
43  CALL init_wait
44
45!!! XIOS Initialization (get the local communicator)
46
47  CALL xios_initialize(id,return_comm=comm)
48  CALL MPI_COMM_RANK(comm,rank,ierr)
49  CALL MPI_COMM_SIZE(comm,size,ierr)
50
51  ierr=NF90_OPEN(src_file, NF90_NOWRITE, ncid)
52  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
53  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
54  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=src_nvertex)
55  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=src_ni_glo)
56
57  div    = src_ni_glo/size
58  remain = MOD( src_ni_glo, size )
59  IF (rank < remain) THEN
60    src_ni=div+1 ;
61    src_ibegin=rank*(div+1) ;
62  ELSE
63    src_ni=div ;
64    src_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
65  ENDIF
66
67  ALLOCATE(src_lon(src_ni), src_lon_tmp(src_ni))
68  ALLOCATE(src_lat(src_ni), src_lat_tmp(src_ni))
69  ALLOCATE(src_boundslon(src_nvertex,src_ni))
70  ALLOCATE(src_boundslat(src_nvertex,src_ni))
71  ALLOCATE(src_field_2D(src_ni), src_field_2D_clone(src_ni))
72  ALLOCATE(src_field_3D(src_ni,llm))
73  ALLOCATE(src_field_4D(src_ni,llm,llm2))
74  ALLOCATE(src_mask_2D(src_ni))
75  ALLOCATE(src_field_pression(src_ni,llm))
76  ALLOCATE(lval(llm))
77  ALLOCATE(lval1(interpolatedLlm))
78  ALLOCATE(lval2(llm2))
79
80  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
81  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lon, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
82  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
83  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_lat, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
84  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
85  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,src_boundslon, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
86  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
87  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_boundslat, start=(/1,src_ibegin+1/),count=(/src_nvertex,src_ni/))
88  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"val",varid)
89  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, src_field_2D, start=(/src_ibegin+1/),count=(/src_ni/))
90  DO i=1,src_ni
91    src_field_3D(i,:) = src_field_2D(i)
92    IF ((23.5 < src_lat(i)) .AND. (src_lat(i) < 65.5) .AND. (0 < src_lon(i)) .AND. (src_lon(i) < 30)) THEN
93      src_mask_2D(i)=.FALSE.
94      src_field_2D(i) = missing_value
95    ELSE
96      src_mask_2D(i)=.TRUE.     
97    ENDIF
98    src_lon_tmp(i) = src_lon(i) + 1000
99    src_lat_tmp(i) = src_lat(i) + 10000
100  ENDDO
101  src_field_2D_clone = src_field_2D
102
103  DO i=1,llm
104    lval(i) = i*100
105    src_field_pression(:,i) = i * 100
106    IF (MOD(i,3)==0) THEN
107      ! src_field_pression(:,i) = missing_value
108      src_field_3D(:,i) = missing_value
109    ELSE
110      ! src_field_pression(:,i) = i * 100
111      src_field_3D(:,i) = src_field_3D(:,i) + i * 10 
112    ENDIF
113    ! src_field_3D(:,i) = src_field_3D(:,i) + i * 10   
114  ENDDO
115
116  DO i=1,llm2
117    src_field_4D(:,:,i) = src_field_3D(:,:) + i * 100
118  ENDDO
119
120  DO i=1,interpolatedLlm
121    lval2(i) = i*10
122    lval1(i) = i*10 + 2
123  ENDDO
124
125  ierr=NF90_OPEN(dst_file, NF90_NOWRITE, ncid)
126  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
127  ierr=NF90_INQUIRE_VARIABLE(ncid, varid,dimids=dimids)
128  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(1), len=dst_nvertex)
129  ierr=NF90_INQUIRE_DIMENSION(ncid, dimids(2), len=dst_ni_glo)
130
131  div    = dst_ni_glo/size
132  remain = MOD( dst_ni_glo, size )
133  IF (rank < remain) THEN
134    dst_ni=div+1 ;
135    dst_ibegin=rank*(div+1) ;
136  ELSE
137    dst_ni=div ;
138    dst_ibegin= remain * (div+1) + (rank-remain) * div ;
139  ENDIF
140
141  ALLOCATE(dst_lon(dst_ni))
142  ALLOCATE(dst_lat(dst_ni))
143  ALLOCATE(dst_boundslon(dst_nvertex,dst_ni))
144  ALLOCATE(dst_boundslat(dst_nvertex,dst_ni))
145
146  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lon",varid)
147  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lon, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
148  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"lat",varid)
149  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_lat, start=(/dst_ibegin+1/),count=(/dst_ni/))
150  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lon",varid)
151  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid,dst_boundslon, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
152  ierr=NF90_INQ_VARID(ncid,"bounds_lat",varid)
153  ierr=NF90_GET_VAR(ncid,varid, dst_boundslat, start=(/1,dst_ibegin+1/),count=(/dst_nvertex,dst_ni/))
154
155
156  CALL xios_context_initialize("test",comm)
157  CALL xios_get_handle("test",ctx_hdl)
158  CALL xios_set_current_context(ctx_hdl)
159
160  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
161  CALL xios_set_domain_attr("src_domain", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
162                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex)
163
164  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
165  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_clone", lonvalue_1D=src_lon, latvalue_1D=src_lat, &
166                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex, &
167                            mask_1d=src_mask_2D)
168
169  CALL xios_set_axis_attr("src_axis", n_glo=llm, value=lval)
170  CALL xios_set_axis_attr("nq", n_glo=llm2, value=lval2)
171
172  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", ni_glo=dst_ni_glo, ibegin=dst_ibegin, ni=dst_ni, type="unstructured")
173  CALL xios_set_domain_attr("dst_domain", lonvalue_1D=dst_lon, latvalue_1D=dst_lat, &
174                            bounds_lon_1D=dst_boundslon, bounds_lat_1D=dst_boundslat, nvertex=dst_nvertex)
175
176  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_unstructured_read", ni_glo=src_ni_glo, ibegin=src_ibegin, ni=src_ni, type="unstructured")
177  CALL xios_set_domain_attr("src_domain_unstructured_read", lonvalue_1D=src_lon_tmp, latvalue_1D=src_lat_tmp, &
178                            bounds_lon_1D=src_boundslon, bounds_lat_1D=src_boundslat, nvertex=src_nvertex)
179
180
181  dtime%second = 3600
182  CALL xios_set_timestep(dtime)
183
184  CALL xios_close_context_definition()
185  CALL xios_get_domain_attr("src_domain_regular_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
186  ALLOCATE(tmp_field_0(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
187
188  CALL xios_get_axis_attr("src_axis_curvilinear_read", n=src_tmp_n)
189  CALL xios_get_domain_attr("src_domain_curvilinear_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
190  ALLOCATE(tmp_field_1(src_tmp_ni*src_tmp_nj*src_tmp_n))
191
192  CALL xios_get_domain_attr("src_domain_unstructured_read", ni=src_tmp_ni, nj=src_tmp_nj)
193  ALLOCATE(tmp_field_2(src_tmp_ni*src_tmp_nj))
194
195  DO ts=1,1
196    CALL xios_recv_field("src_field_regular", tmp_field_0)
197    CALL xios_recv_field("src_field_curvilinear", tmp_field_1)
198    CALL xios_recv_field("src_field_unstructured", tmp_field_2)
199    CALL xios_update_calendar(ts)
200    CALL xios_send_field("src_field_2D",src_field_2D)
201   
202    DO i=1,src_ni
203      src_field_2D_clone(i) = src_field_2D(i)
204      IF ((23.5 * ts < src_lat(i)) .AND. (src_lat(i) < 65.5 *ts) .AND. (0 < src_lon(i)) .AND. (src_lon(i) < 30*ts)) THEN     
205        src_field_2D_clone(i) = missing_value   
206      ENDIF
207    ENDDO
208
209    CALL xios_send_field("src_field_2D_clone",src_field_2D_clone)
210    CALL xios_send_field("src_field_3D",src_field_3D)
211    CALL xios_send_field("src_field_3D_clone",src_field_3D)
212    CALL xios_send_field("src_field_4D",src_field_4D)
213    CALL xios_send_field("src_field_3D_pression",src_field_pression)
214    CALL xios_send_field("tmp_field_0",tmp_field_0)
215    CALL xios_send_field("tmp_field_1",tmp_field_1)
216    CALL xios_send_field("tmp_field_2",tmp_field_2)
217    CALL wait_us(5000) ;
218   ENDDO
219
220  CALL xios_context_finalize()
221
222  DEALLOCATE(src_lon, src_lat, src_boundslon,src_boundslat, src_field_2D)
223  DEALLOCATE(dst_lon, dst_lat, dst_boundslon,dst_boundslat)
224  DEALLOCATE(tmp_field_0, tmp_field_1, tmp_field_2)
225
226  CALL MPI_COMM_FREE(comm, ierr)
227
228  CALL xios_finalize()
229
230  CALL MPI_FINALIZE(ierr)
231
232END PROGRAM test_remap
233
234
235
236
237
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.