source: XIOS/trunk/src/transformation/generic_algorithm_transformation.cpp @ 977

Last change on this file since 977 was 977, checked in by mhnguyen, 6 years ago

Minor improvements: Removing some redundant codes

File size: 25.6 KB
Line 
1/*!
2   \file generic_algorithm_transformation.hpp
3   \author Ha NGUYEN
4   \since 14 May 2015
5   \date 21 Mars 2016
6
7   \brief Interface for all transformation algorithms.
8 */
9#include "generic_algorithm_transformation.hpp"
10#include "context.hpp"
11#include "context_client.hpp"
12#include "client_client_dht_template.hpp"
13
14namespace xios {
15
16CGenericAlgorithmTransformation::CGenericAlgorithmTransformation()
17 : transformationMapping_(), transformationWeight_(), transformationPosition_(),
18   idAuxInputs_(), type_(ELEMENT_NO_MODIFICATION_WITH_DATA)
19{
20}
21
22void CGenericAlgorithmTransformation::apply(const std::vector<std::pair<int,double> >& localIndex,
23                                            const double* dataInput,
24                                            CArray<double,1>& dataOut,
25                                            std::vector<bool>& flagInitial,
26                                            const double& defaultValue)
27{
28  int nbLocalIndex = localIndex.size();
29  bool hasMissingValue = (0.0 != defaultValue) ? true : false;
30  if (hasMissingValue)
31  {
32    for (int idx = 0; idx < nbLocalIndex; ++idx)
33    {
34      if (defaultValue == *(dataInput + idx))
35      {
36        flagInitial[localIndex[idx].first] = false;
37      }
38      else
39      {
40        dataOut(localIndex[idx].first) += *(dataInput + idx) * localIndex[idx].second;
41      }
42    }
43
44    for (int idx = 0; idx < nbLocalIndex; ++idx)
45    {
46      if (!flagInitial[localIndex[idx].first])
47        dataOut(localIndex[idx].first) = defaultValue;
48    }
49  }
50  else
51  {
52    for (int idx = 0; idx < nbLocalIndex; ++idx)
53    {
54      dataOut(localIndex[idx].first) += *(dataInput + idx) * localIndex[idx].second;
55    }
56  }
57}
58
59void CGenericAlgorithmTransformation::computePositionElements(CGrid* dst, CGrid* src)
60{
61  int idxScalar = 0, idxAxis = 0, idxDomain = 0;
62  CArray<int,1> axisDomainOrderDst = dst->axis_domain_order;
63  for (int i = 0; i < axisDomainOrderDst.numElements(); ++i)
64  {
65    int dimElement = axisDomainOrderDst(i);
66    if (2 == dimElement)
67    {
68      elementPositionInGridDst2DomainPosition_[i] = idxDomain;
69      ++idxDomain;
70    }
71    else if (1 == dimElement)
72    {
73      elementPositionInGridDst2AxisPosition_[i] = idxAxis;
74      ++idxAxis;
75    }
76    else
77    {
78      elementPositionInGridDst2ScalarPosition_[i] = idxScalar;
79      ++idxScalar;
80    }
81  }
82
83  idxScalar = idxAxis = idxDomain = 0;
84  CArray<int,1> axisDomainOrderSrc = src->axis_domain_order;
85  for (int i = 0; i < axisDomainOrderSrc.numElements(); ++i)
86  {
87    int dimElement = axisDomainOrderSrc(i);
88    if (2 == dimElement)
89    {
90      elementPositionInGridSrc2DomainPosition_[i] = idxDomain;
91      ++idxDomain;
92    }
93    else if (1 == dimElement)
94    {
95      elementPositionInGridSrc2AxisPosition_[i] = idxAxis;
96      ++idxAxis;
97    }
98    else
99    {
100      elementPositionInGridSrc2ScalarPosition_[i] = idxScalar;
101      ++idxScalar;
102    }
103  }
104}
105
106/*!
107  This function computes the global indexes of grid source, which the grid destination is in demand.
108  \param[in] elementPositionInGrid position of an element in a grid .E.g: if grid is composed of domain and axis (in order),
109                then position of axis in grid is 1 and domain is positioned at 0.
110  \param[in] gridSrc Grid source
111  \param[in] gridDst Grid destination
112  \param[in\out] globaIndexWeightFromSrcToDst mapping of each global index source and weight to index destination
113*/
114void CGenericAlgorithmTransformation::computeGlobalSourceIndex(int elementPositionInGrid,
115                                                               CGrid* gridSrc,
116                                                               CGrid* gridDst,
117                                                               SourceDestinationIndexMap& globaIndexWeightFromSrcToDst)
118 {
119  CContext* context = CContext::getCurrent();
120  CContextClient* client = context->client;
121  int nbClient = client->clientSize;
122
123  typedef boost::unordered_map<int, std::vector<std::pair<int,double> > > SrcToDstMap;
124
125  size_t indexSrcSize = 0;
126  for (size_t idxTrans = 0; idxTrans < transformationMapping_.size(); ++idxTrans)
127  {
128    TransformationIndexMap::const_iterator itbTransMap = transformationMapping_[idxTrans].begin(), itTransMap,
129                                           iteTransMap = transformationMapping_[idxTrans].end();
130    TransformationWeightMap::const_iterator itbTransWeight = transformationWeight_[idxTrans].begin(), itTransWeight;
131
132    itTransWeight = itbTransWeight;
133    for (itTransMap = itbTransMap; itTransMap != iteTransMap; ++itTransMap, ++itTransWeight)
134    {
135       indexSrcSize += (itTransMap->second).size();
136    }
137  }
138
139  bool isTransPosEmpty = transformationPosition_.empty();
140  CArray<size_t,1> transPos;
141  if (!isTransPosEmpty) transPos.resize(transformationMapping_.size());
142  CArray<size_t,1> indexSrc(indexSrcSize);
143  indexSrcSize = 0;
144  for (size_t idxTrans = 0; idxTrans < transformationMapping_.size(); ++idxTrans)
145  {
146    TransformationIndexMap::const_iterator itbTransMap = transformationMapping_[idxTrans].begin(), itTransMap,
147                                           iteTransMap = transformationMapping_[idxTrans].end();
148    TransformationWeightMap::const_iterator itbTransWeight = transformationWeight_[idxTrans].begin(), itTransWeight;
149
150    // Build mapping between global source element index and global destination element index.
151    itTransWeight = itbTransWeight;
152    for (itTransMap = itbTransMap; itTransMap != iteTransMap; ++itTransMap, ++itTransWeight)
153    {
154      const std::vector<int>& srcIndex = itTransMap->second;
155      for (int idx = 0; idx < srcIndex.size(); ++idx)
156      {
157        indexSrc(indexSrcSize) = srcIndex[idx];
158        ++indexSrcSize;
159      }
160    }
161
162    if (!isTransPosEmpty)
163    {
164      TransformationPositionMap::const_iterator itPosMap = transformationPosition_[idxTrans].begin();
165      transPos(idxTrans) = itPosMap->second[0];
166    }
167  }
168
169  // compute position of elements on grids
170  computePositionElements(gridDst, gridSrc);
171  std::vector<CScalar*> scalarListDestP = gridDst->getScalars();
172  std::vector<CAxis*> axisListDestP = gridDst->getAxis();
173  std::vector<CDomain*> domainListDestP = gridDst->getDomains();
174  CArray<int,1> axisDomainDstOrder = gridDst->axis_domain_order;
175  std::vector<CScalar*> scalarListSrcP  = gridSrc->getScalars();
176  std::vector<CAxis*> axisListSrcP = gridSrc->getAxis();
177  std::vector<CDomain*> domainListSrcP = gridSrc->getDomains();
178  CArray<int,1> axisDomainSrcOrder = gridSrc->axis_domain_order;
179
180  // Find out global index source of transformed element on corresponding process.
181  std::vector<boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> > > globalElementIndexOnProc(axisDomainDstOrder.numElements());
182  CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap globalIndexOfTransformedElementOnProc; 
183  for (int idx = 0; idx < axisDomainDstOrder.numElements(); ++idx)
184  {
185    if (idx == elementPositionInGrid)
186      computeExchangeGlobalIndex(indexSrc, axisDomainSrcOrder(idx), globalIndexOfTransformedElementOnProc); //globalElementIndexOnProc[idx]);
187    if (2 == axisDomainDstOrder(idx)) // It's domain
188    {
189      if (idx != elementPositionInGrid)
190        computeExchangeDomainIndex(domainListDestP[elementPositionInGridDst2DomainPosition_[idx]],
191                                   domainListSrcP[elementPositionInGridSrc2DomainPosition_[idx]],
192                                   transPos,
193                                   globalElementIndexOnProc[idx]);     
194
195    }
196    else if (1 == axisDomainDstOrder(idx))//it's an axis
197    {
198      if (idx != elementPositionInGrid)
199        computeExchangeAxisIndex(axisListDestP[elementPositionInGridDst2AxisPosition_[idx]],
200                                 axisListSrcP[elementPositionInGridSrc2AxisPosition_[idx]],
201                                 transPos,
202                                 globalElementIndexOnProc[idx]);
203    }
204    else //it's a scalar
205    {
206      if (idx != elementPositionInGrid)
207        computeExchangeScalarIndex(scalarListDestP[elementPositionInGridDst2ScalarPosition_[idx]],
208                                   scalarListSrcP[elementPositionInGridSrc2ScalarPosition_[idx]],
209                                   transPos,
210                                   globalElementIndexOnProc[idx]);
211
212    }
213  }
214
215  if (!isTransPosEmpty)
216  {
217    for (int idx = 0; idx < globalElementIndexOnProc.size(); ++idx)
218    {
219      if (idx != elementPositionInGrid)
220      {
221        boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >::iterator itb = globalElementIndexOnProc[idx].begin(), it,
222                                                                 ite = globalElementIndexOnProc[idx].end();
223        for (it = itb; it != ite; ++it) it->second.resize(1);
224      }
225    }
226  }
227
228  for (size_t idxTrans = 0; idxTrans < transformationMapping_.size(); ++idxTrans)
229  {
230    TransformationIndexMap::const_iterator itbTransMap = transformationMapping_[idxTrans].begin(), itTransMap,
231                                           iteTransMap = transformationMapping_[idxTrans].end();
232    TransformationWeightMap::const_iterator itbTransWeight = transformationWeight_[idxTrans].begin(), itTransWeight;
233    SrcToDstMap src2DstMap;
234    src2DstMap.rehash(std::ceil(transformationMapping_[idxTrans].size()/src2DstMap.max_load_factor()));
235
236    // Build mapping between global source element index and global destination element index.
237    boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >().swap(globalElementIndexOnProc[elementPositionInGrid]);
238    boost::unordered_map<int,int> tmpCounter;
239    itTransWeight = itbTransWeight;
240    for (itTransMap = itbTransMap; itTransMap != iteTransMap; ++itTransMap, ++itTransWeight)
241    {
242      const std::vector<int>& srcIndex = itTransMap->second;
243      const std::vector<double>& weight = itTransWeight->second;
244      for (int idx = 0; idx < srcIndex.size(); ++idx)
245      {
246        src2DstMap[srcIndex[idx]].push_back(make_pair(itTransMap->first, weight[idx]));
247        if (1 == globalIndexOfTransformedElementOnProc.count(srcIndex[idx]) && (0 == tmpCounter.count(srcIndex[idx])))
248        {
249          tmpCounter[srcIndex[idx]] = 1;
250          std::vector<int>& srcProc = globalIndexOfTransformedElementOnProc[srcIndex[idx]];
251          for (int j = 0; j < srcProc.size(); ++j)
252            globalElementIndexOnProc[elementPositionInGrid][srcProc[j]].push_back(srcIndex[idx]);
253        }
254      }
255    }
256
257    if (!isTransPosEmpty)
258    {
259      for (int idx = 0; idx < globalElementIndexOnProc.size(); ++idx)
260      {
261        if (idx != elementPositionInGrid)
262        {
263          boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >::iterator itb = globalElementIndexOnProc[idx].begin(), it,
264                                                                   ite = globalElementIndexOnProc[idx].end();
265          for (it = itb; it != ite; ++it) it->second[0] = transPos(idxTrans);
266        }
267      }
268    }
269
270    std::vector<std::vector<bool> > elementOnProc(axisDomainDstOrder.numElements(), std::vector<bool>(nbClient, false));
271    boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >::const_iterator it, itb, ite;
272    for (int idx = 0; idx < globalElementIndexOnProc.size(); ++idx)
273    {
274      itb = globalElementIndexOnProc[idx].begin();
275      ite = globalElementIndexOnProc[idx].end();
276      for (it = itb; it != ite; ++it) elementOnProc[idx][it->first] = true;
277    }
278
279    // Determine procs which contain global source index
280    std::vector<bool> intersectedProc(nbClient, true);
281    for (int idx = 0; idx < axisDomainDstOrder.numElements(); ++idx)
282    {
283      std::transform(elementOnProc[idx].begin(), elementOnProc[idx].end(),
284                     intersectedProc.begin(), intersectedProc.begin(),
285                     std::logical_and<bool>());
286    }
287
288    std::vector<int> srcRank;
289    for (int idx = 0; idx < nbClient; ++idx)
290    {
291      if (intersectedProc[idx]) srcRank.push_back(idx);
292    }
293
294    // Ok, now compute global index of grid source and ones of grid destination
295    computeGlobalGridIndexMapping(elementPositionInGrid,
296                                  srcRank,
297                                  src2DstMap,
298                                  gridSrc,
299                                  gridDst,
300                                  globalElementIndexOnProc,
301                                  globaIndexWeightFromSrcToDst);
302  }
303 }
304
305/*!
306  Compute mapping of global index of grid source and grid destination
307  \param [in] elementPositionInGrid position of element in grid. E.x: grid composed of domain and axis, domain has position 0 and axis 1.
308  \param [in] srcRank rank of client from which we demand global index of element source
309  \param [in] src2DstMap mapping of global index of element source and global index of element destination
310  \param[in] gridSrc Grid source
311  \param[in] gridDst Grid destination
312  \param[in] globalElementIndexOnProc Global index of element source on different client rank
313  \param[out] globaIndexWeightFromSrcToDst Mapping of global index of grid source and grid destination
314*/
315void CGenericAlgorithmTransformation::computeGlobalGridIndexMapping(int elementPositionInGrid,
316                                                                   const std::vector<int>& srcRank,
317                                                                   boost::unordered_map<int, std::vector<std::pair<int,double> > >& src2DstMap,
318                                                                   CGrid* gridSrc,
319                                                                   CGrid* gridDst,
320                                                                   std::vector<boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> > >& globalElementIndexOnProc,
321                                                                   SourceDestinationIndexMap& globaIndexWeightFromSrcToDst)
322{
323  std::vector<CDomain*> domainListSrcP = gridSrc->getDomains();
324  std::vector<CAxis*> axisListSrcP = gridSrc->getAxis();
325  std::vector<CScalar*> scalarListSrcP = gridSrc->getScalars();
326  CArray<int,1> axisDomainSrcOrder = gridSrc->axis_domain_order;
327
328  size_t nbElement = axisDomainSrcOrder.numElements();
329  std::vector<size_t> nGlobSrc(nbElement);
330  size_t globalSrcSize = 1;
331  int domainIndex = 0, axisIndex = 0, scalarIndex = 0;
332  for (int idx = 0; idx < nbElement; ++idx)
333  {
334    nGlobSrc[idx] = globalSrcSize;
335    int elementDimension = axisDomainSrcOrder(idx);
336
337    // If this is a domain
338    if (2 == elementDimension)
339    {
340      globalSrcSize *= domainListSrcP[domainIndex]->nj_glo.getValue() * domainListSrcP[domainIndex]->ni_glo.getValue();
341      ++domainIndex;
342    }
343    else if (1 == elementDimension) // So it's an axis
344    {
345      globalSrcSize *= axisListSrcP[axisIndex]->n_glo.getValue();
346      ++axisIndex;
347    }
348    else
349    {
350      globalSrcSize *= 1;
351      ++scalarIndex;
352    }
353  }
354
355  std::vector<CDomain*> domainListDestP = gridDst->getDomains();
356  std::vector<CAxis*> axisListDestP = gridDst->getAxis();
357  std::vector<CScalar*> scalarListDestP = gridDst->getScalars();
358  CArray<int,1> axisDomainDstOrder = gridDst->axis_domain_order;
359
360  std::vector<size_t> nGlobDst(nbElement);
361  size_t globalDstSize = 1;
362  domainIndex = axisIndex = scalarIndex = 0;
363  for (int idx = 0; idx < nbElement; ++idx)
364  {
365    nGlobDst[idx] = globalDstSize;
366    int elementDimension = axisDomainDstOrder(idx);
367
368    // If this is a domain
369    if (2 == elementDimension)
370    {
371      globalDstSize *= domainListDestP[domainIndex]->nj_glo.getValue() * domainListDestP[domainIndex]->ni_glo.getValue();
372      ++domainIndex;
373    }
374    else if (1 == elementDimension) // So it's an axis
375    {
376      globalDstSize *= axisListDestP[axisIndex]->n_glo.getValue();
377      ++axisIndex;
378    }
379    else
380    {
381      globalDstSize *= 1;
382      ++scalarIndex;
383    }
384  }
385
386  for (int i = 0; i < srcRank.size(); ++i)
387  {
388    size_t ssize = 1;
389    int rankSrc = srcRank[i];
390    for (int idx = 0; idx < nbElement; ++idx)
391    {
392      ssize *= (globalElementIndexOnProc[idx][rankSrc]).size();
393    }
394
395    std::vector<int> idxLoop(nbElement,0);
396    std::vector<int> currentIndexSrc(nbElement, 0);
397    std::vector<int> currentIndexDst(nbElement, 0);
398    int innnerLoopSize = (globalElementIndexOnProc[0])[rankSrc].size();
399    size_t idx = 0;
400    while (idx < ssize)
401    {
402      for (int ind = 0; ind < nbElement; ++ind)
403      {
404        if (idxLoop[ind] == (globalElementIndexOnProc[ind])[rankSrc].size())
405        {
406          idxLoop[ind] = 0;
407          ++idxLoop[ind+1];
408        }
409
410        currentIndexDst[ind] = currentIndexSrc[ind] = (globalElementIndexOnProc[ind])[rankSrc][idxLoop[ind]];
411      }
412
413      for (int ind = 0; ind < innnerLoopSize; ++ind)
414      {
415        currentIndexDst[0] = currentIndexSrc[0] = (globalElementIndexOnProc[0])[rankSrc][ind];
416        int globalElementDstIndexSize = 0;
417        if (1 == src2DstMap.count(currentIndexSrc[elementPositionInGrid]))
418        {
419          globalElementDstIndexSize = src2DstMap[currentIndexSrc[elementPositionInGrid]].size();
420        }
421
422        std::vector<size_t> globalDstVecIndex(globalElementDstIndexSize,0);
423        size_t globalSrcIndex = 0;
424        for (int idxElement = 0; idxElement < nbElement; ++idxElement)
425        {
426          if (idxElement == elementPositionInGrid)
427          {
428            for (int k = 0; k < globalElementDstIndexSize; ++k)
429            {
430              globalDstVecIndex[k] += src2DstMap[currentIndexSrc[elementPositionInGrid]][k].first * nGlobDst[idxElement];
431            }
432          }
433          else
434          {
435            for (int k = 0; k < globalElementDstIndexSize; ++k)
436            {
437              globalDstVecIndex[k] += currentIndexDst[idxElement] * nGlobDst[idxElement];
438            }
439          }
440          globalSrcIndex += currentIndexSrc[idxElement] * nGlobSrc[idxElement];
441        }
442
443        for (int k = 0; k < globalElementDstIndexSize; ++k)
444        {
445          globaIndexWeightFromSrcToDst[rankSrc][globalSrcIndex].push_back(make_pair(globalDstVecIndex[k],src2DstMap[currentIndexSrc[elementPositionInGrid]][k].second ));
446        }
447        ++idxLoop[0];
448      }
449      idx += innnerLoopSize;
450    }
451  }
452}
453
454/*!
455  Find out proc and global index of axis source which axis destination is on demande
456  \param[in] scalar Scalar destination
457  \param[in] scalar Scalar source
458  \param[in] destGlobalIndexPositionInGrid Relative position of axis corresponds to other element of grid.
459  \param[out] globalScalarIndexOnProc Global index of axis source on different procs
460*/
461void CGenericAlgorithmTransformation::computeExchangeScalarIndex(CScalar* scalarDst,
462                                                                 CScalar* scalarSrc,
463                                                                 CArray<size_t,1>& destGlobalIndexPositionInGrid,
464                                                                 boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >& globalScalarIndexOnProc)
465{
466  CContext* context = CContext::getCurrent();
467  CContextClient* client=context->client;
468  int clientRank = client->clientRank;
469  int clientSize = client->clientSize;
470
471  globalScalarIndexOnProc.rehash(std::ceil(clientSize/globalScalarIndexOnProc.max_load_factor()));
472  for (int idx = 0; idx < clientSize; ++idx)
473  {
474    globalScalarIndexOnProc[idx].push_back(0);
475  }
476}
477
478/*!
479  Find out proc and global index of axis source which axis destination is on demande
480  \param[in] axisDst Axis destination
481  \param[in] axisSrc Axis source
482  \param[in] destGlobalIndexPositionInGrid Relative position of axis corresponds to other element of grid.
483  \param[out] globalAxisIndexOnProc Global index of axis source on different procs
484*/
485void CGenericAlgorithmTransformation::computeExchangeAxisIndex(CAxis* axisDst,
486                                                               CAxis* axisSrc,
487                                                               CArray<size_t,1>& destGlobalIndexPositionInGrid,
488                                                               boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >& globalAxisIndexOnProc)
489{
490  CContext* context = CContext::getCurrent();
491  CContextClient* client=context->client;
492  int clientRank = client->clientRank;
493  int clientSize = client->clientSize;
494
495  size_t globalIndex;
496  int nIndexSize = axisSrc->index.numElements();
497  CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap globalIndex2ProcRank;
498  globalIndex2ProcRank.rehash(std::ceil(nIndexSize/globalIndex2ProcRank.max_load_factor()));
499  for (int idx = 0; idx < nIndexSize; ++idx)
500  {
501    globalIndex = axisSrc->index(idx);
502    globalIndex2ProcRank[globalIndex].push_back(clientRank);
503  }
504
505  CClientClientDHTInt dhtIndexProcRank(globalIndex2ProcRank, client->intraComm);
506  CArray<size_t,1> globalAxisIndex(axisDst->index.numElements());
507  for (int idx = 0; idx < globalAxisIndex.numElements(); ++idx)
508  {
509    globalAxisIndex(idx) = axisDst->index(idx);
510  }
511  dhtIndexProcRank.computeIndexInfoMapping(globalAxisIndex);
512
513  std::vector<int> countIndex(clientSize,0);
514  const CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap& computedGlobalIndexOnProc = dhtIndexProcRank.getInfoIndexMap();
515  CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap::const_iterator itb = computedGlobalIndexOnProc.begin(), it,
516                                                               ite = computedGlobalIndexOnProc.end();
517  for (it = itb; it != ite; ++it)
518  {
519    const std::vector<int>& procList = it->second;
520    for (int idx = 0; idx < procList.size(); ++idx) ++countIndex[procList[idx]];
521  }
522
523  globalAxisIndexOnProc.rehash(std::ceil(clientSize/globalAxisIndexOnProc.max_load_factor()));
524  for (int idx = 0; idx < clientSize; ++idx)
525  {
526    if (0 != countIndex[idx])
527    {
528      globalAxisIndexOnProc[idx].resize(countIndex[idx]);
529      countIndex[idx] = 0;
530    }
531  }
532
533  for (it = itb; it != ite; ++it)
534  {
535    const std::vector<int>& procList = it->second;
536    for (int idx = 0; idx < procList.size(); ++idx)
537    {
538      globalAxisIndexOnProc[procList[idx]][countIndex[procList[idx]]] = it->first;
539      ++countIndex[procList[idx]];
540    }
541  }
542}
543
544/*!
545  Find out proc and global index of domain source which domain destination is on demande
546  \param[in] domainDst Domain destination
547  \param[in] domainSrc Domain source
548  \param[in] destGlobalIndexPositionInGrid Relative position of domain corresponds to other element of grid.
549  \param[out] globalDomainIndexOnProc Global index of domain source on different procs
550*/
551void CGenericAlgorithmTransformation::computeExchangeDomainIndex(CDomain* domainDst,
552                                                                 CDomain* domainSrc,
553                                                                 CArray<size_t,1>& destGlobalIndexPositionInGrid,
554                                                                 boost::unordered_map<int,std::vector<size_t> >& globalDomainIndexOnProc)
555{
556  CContext* context = CContext::getCurrent();
557  CContextClient* client=context->client;
558  int clientRank = client->clientRank;
559  int clientSize = client->clientSize;
560
561  int niGlobSrc = domainSrc->ni_glo.getValue();
562  size_t globalIndex;
563  int i_ind, j_ind;
564  int nIndexSize = (destGlobalIndexPositionInGrid.isEmpty()) ? domainSrc->i_index.numElements()
565                                                             : destGlobalIndexPositionInGrid.numElements();
566  CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap globalIndex2ProcRank;
567  globalIndex2ProcRank.rehash(std::ceil(nIndexSize/globalIndex2ProcRank.max_load_factor()));
568  if (destGlobalIndexPositionInGrid.isEmpty())
569  {
570    for (int idx = 0; idx < nIndexSize; ++idx)
571    {
572      i_ind=domainSrc->i_index(idx) ;
573      j_ind=domainSrc->j_index(idx) ;
574
575      globalIndex = i_ind + j_ind * niGlobSrc;
576      globalIndex2ProcRank[globalIndex].resize(1);
577      globalIndex2ProcRank[globalIndex][0] = clientRank;
578    }
579  }
580  else
581  {
582    for (int idx = 0; idx < nIndexSize; ++idx)
583    {
584      globalIndex2ProcRank[destGlobalIndexPositionInGrid(idx)].push_back(clientRank);
585    }
586  }
587
588  CArray<size_t,1> globalDomainIndex;
589  if (destGlobalIndexPositionInGrid.isEmpty())
590  {
591    int niGlobDst = domainDst->ni_glo.getValue();
592    globalDomainIndex.resize(domainDst->i_index.numElements());
593    nIndexSize = domainDst->i_index.numElements();
594
595    for (int idx = 0; idx < nIndexSize; ++idx)
596    {
597      i_ind=domainDst->i_index(idx) ;
598      j_ind=domainDst->j_index(idx) ;
599
600      globalDomainIndex(idx) = i_ind + j_ind * niGlobDst;
601    }
602  }
603  else
604  {
605    globalDomainIndex.reference(destGlobalIndexPositionInGrid);
606  }
607
608  CClientClientDHTInt dhtIndexProcRank(globalIndex2ProcRank, client->intraComm);
609  dhtIndexProcRank.computeIndexInfoMapping(globalDomainIndex);
610
611  std::vector<int> countIndex(clientSize,0);
612  const CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap& computedGlobalIndexOnProc = dhtIndexProcRank.getInfoIndexMap();
613  CClientClientDHTInt::Index2VectorInfoTypeMap::const_iterator itb = computedGlobalIndexOnProc.begin(), it,
614                                                               ite = computedGlobalIndexOnProc.end();
615  for (it = itb; it != ite; ++it)
616  {
617    const std::vector<int>& procList = it->second;
618    for (int idx = 0; idx < procList.size(); ++idx) ++countIndex[procList[idx]];
619  }
620
621  globalDomainIndexOnProc.rehash(std::ceil(clientSize/globalDomainIndexOnProc.max_load_factor()));
622  for (int idx = 0; idx < clientSize; ++idx)
623  {
624    if (0 != countIndex[idx])
625    {
626      globalDomainIndexOnProc[idx].resize(countIndex[idx]);
627      countIndex[idx] = 0;
628    }
629  }
630
631  for (it = itb; it != ite; ++it)
632  {
633    const std::vector<int>& procList = it->second;
634    for (int idx = 0; idx < procList.size(); ++idx)
635    {
636      globalDomainIndexOnProc[procList[idx]][countIndex[procList[idx]]] = it->first;
637      ++countIndex[procList[idx]];
638    }
639  }
640}
641
642/*!
643  Compute index mapping between element source and element destination with an auxiliary inputs which determine
644position of each mapped index in global index of grid destination.
645  \param [in] dataAuxInputs auxiliary inputs
646*/
647void CGenericAlgorithmTransformation::computeIndexSourceMapping(const std::vector<CArray<double,1>* >& dataAuxInputs)
648{
649  computeIndexSourceMapping_(dataAuxInputs);
650}
651
652std::vector<StdString> CGenericAlgorithmTransformation::getIdAuxInputs()
653{
654  return idAuxInputs_;
655}
656
657CGenericAlgorithmTransformation::AlgoTransType CGenericAlgorithmTransformation::type()
658{
659  return type_;
660}
661
662}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.