source: XIOS/trunk/xios_test_suite/TEST_SUITE/step1.py @ 1915

Last change on this file since 1915 was 1915, checked in by yushan, 4 years ago

trunk : correct an error in reference match

File size: 12.6 KB
Line 
1import glob
2import sys
3import subprocess
4import os
5import json
6import itertools
7import copy
8
9param_list = ["ATMdomain", "UsingServer2", "NumberClients", "NumberServers", "RatioServer2", "NumberPoolsServer2", "Duration", "InfoLevel"]
10param_short_list = ["ATMdom", "Srv2", "NbClnt", "NbSrv", "RatioSrv2", "NbPlSrv2", "Duration", "Info"]
11
12mode=os.getenv("mode")
13arch=os.getenv("arch")
14machine=os.getenv("xios_machine_name")
15
16nb_proc_irene=40 # this must be >= NumberClients+NumberServers for all configs for all test folders
17nb_proc_jz=40 # to run completly in parallel, this must be set to 40 for the moment
18              # otherwise, jobs should be regrouped by test folder. jobs in folder are parallel, folders are sequential
19              # in this case,nb_proc_jz >= sum(NumberClients+NumberServers) for each test folder
20
21def OSinfo(runthis):
22    red = lambda text: '\033[0;31m' + text + '\033[0m'
23    osstdout = subprocess.Popen(runthis, shell=True, stdin=subprocess.PIPE, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.STDOUT, close_fds=True)
24    theInfo = osstdout.communicate()[0].strip()
25    if osstdout.returncode!=0:
26        print(red(runthis+" FAILED"))
27        print(theInfo)
28        sys.exit()
29
30def product_dict(**kwargs):
31    keys = kwargs.keys()
32    vals = kwargs.values()
33    for instance in itertools.product(*vals):
34        yield dict(zip(keys, instance))
35
36def get_default_param():
37    f=open("default_param.json", 'r')
38    default_param = json.load(f)
39    f.close()
40    l = list(default_param[0].items())
41    l.sort()
42    def_param=dict(l)
43    return def_param
44
45def generate_job(fn, n):
46    if machine=="irene":
47        with open(fn, "w") as fh:
48            fh.write("#!/bin/bash\n")
49            fh.write("#====================================================\n")
50            fh.write("# Generated by step1.py\n")
51            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
52            fh.write("# For Irene\n")
53            fh.write("#====================================================\n")
54            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
55            fh.write("#MSUB -eo\n")
56            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
57            fh.write("#MSUB -e client_error.out\n")
58            fh.write("#MSUB -c 1\n")
59            fh.write("#MSUB -n "+str(n)+"\n")
60            fh.write("#MSUB -X\n")
61            fh.write("#MSUB -x\n")
62            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
63            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
64            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
65            fh.write("#MSUB -Q test\n")
66            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
67            fh.write("cp ../../build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe ./\n")
68            fh.write("source ../../build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
69            fh.write("ccc_mprun -n "+str(n)+" generic_testcase.exe\n")
70
71    if machine=="jeanzay":
72        with open(fn, "w") as fh:
73            fh.write("#!/bin/bash\n")
74            fh.write("#====================================================\n")
75            fh.write("# Generated by step1.py\n")
76            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
77            fh.write("# For Jean-Zay\n")
78            fh.write("#====================================================\n")
79            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(n)+"\n")
80            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
81            fh.write("#SBATCH -o output.out\n")
82            fh.write("#SBATCH -e error.out\n")
83            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
84            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
85            fh.write("ulimit -c 0\n")
86            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
87            fh.write("cp ../../build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe ./\n")
88            fh.write("source ../../build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
89            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
90            fh.write("srun generic_testcase.exe")
91
92
93def update_full_job(location, n):
94    global my_counter
95    if machine=="irene":
96        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
97            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; ccc_mprun -E \'--exclusive\' -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output_"+arch+"_"+mode+".out 2> error_"+arch+"_"+mode+".out &\n")
98            fh.write("PIDS+=($!)\n")
99            fh.write("CONFIGS+=("+location+")\n")
100    if machine=="jeanzay":
101        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
102            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; srun --exclusive -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output_"+arch+"_"+mode+".out 2> error_"+arch+"_"+mode+".out &\n")
103
104def main():
105
106    if machine=="irene":
107        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
108            fh.write("#!/bin/bash\n")
109            fh.write("#====================================================\n")
110            fh.write("# Generated by step1.py\n")
111            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
112            fh.write("#====================================================\n")
113            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
114            fh.write("#MSUB -eo\n")
115            fh.write("#MSUB -o output_"+arch+"_"+mode+".out\n")
116            fh.write("#MSUB -e error_"+arch+"_"+mode+".err\n")
117            fh.write("#MSUB -c 1\n")
118            fh.write("#MSUB -n "+str(nb_proc_irene)+"\n")
119            fh.write("#MSUB -X\n")
120            fh.write("#MSUB -x\n")
121            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
122            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
123            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
124            fh.write("#MSUB -Q test\n")
125            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
126            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
127            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
128            fh.write("source build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
129            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
130            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
131     
132    if machine=="jeanzay":
133        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
134            fh.write("#!/bin/bash\n")
135            fh.write("#====================================================\n")
136            fh.write("# Generated by step1.py\n")
137            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
138            fh.write("#====================================================\n")
139            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(nb_proc_jz)+"\n")
140            fh.write("#SBATCH -o output_"+arch+"_"+mode+".out\n")
141            fh.write("#SBATCH -e error_"+arch+"_"+mode+".out\n")
142            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
143            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
144            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
145            fh.write("ulimit -c 0\n")
146            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
147            fh.write("source build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
148            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
149            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
150            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
151            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
152            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
153
154
155
156    test_folder_list = glob.glob('test_*')
157    #all_config=dict()
158
159    default_param = get_default_param()
160    #print(default_param)
161
162    for test_folder in test_folder_list:
163        config_list=[]
164        config_name=[]
165        with open(test_folder+"/user_param.json", "r") as f:
166            config_dict = json.load(f)
167
168        for i in range(len(config_dict)):
169            config_list.extend(list(product_dict(**config_dict[i])))
170            #print(config_list)
171        for i in range(len(config_list)):
172            # print(config_list[i])
173            keylist = list(config_list[i].keys())
174            # print(keylist)
175            full_config = copy.deepcopy(default_param)
176            for j in range(len(keylist)):
177                full_config[ keylist[j] ] = config_list[i][keylist[j]]
178
179            #print(full_config)
180            mystr = str(full_config)
181            mystr = mystr.replace("{", "")
182            mystr = mystr.replace("}", "")
183            mystr = mystr.replace("[", "")
184            mystr = mystr.replace("]", "")
185            mystr = mystr.replace(",", "")
186            mystr = mystr.replace(":", "")
187            mystr = mystr.replace("u'", "")
188            mystr = mystr.replace("b'", "")
189            mystr = mystr.replace("'", "")
190            mystr = mystr.replace(" ", "_")
191            for j in range(len(param_list)):
192                mystr = mystr.replace(param_list[j], param_short_list[j])
193            if not mystr in config_name:
194                config_name.append(mystr)
195            #print(mystr)
196            OSinfo("mkdir -p "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
197            OSinfo("cp build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
198            OSinfo("cp iodef.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
199            OSinfo("cp "+test_folder+"/context_atm.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp")
200
201            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp", "r") as f:
202                lines = f.readlines()
203                for i in range(len(lines)):
204                    if "XIOS::" in lines[i]:
205                        config_keys = list(full_config.keys())
206                        for idx in range(len(config_keys)):
207                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
208                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml", "w") as g:
209                    for line in lines:
210                        g.write(line)
211
212            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp", "r") as f:
213                lines = f.readlines()
214                for i in range(len(lines)):
215                    if "XIOS::" in lines[i]:
216                        config_keys = list(full_config.keys())
217                        for idx in range(len(config_keys)):
218                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
219                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml", "w") as g:
220                    for line in lines:
221                        g.write(line)
222
223
224            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
225            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/context_atm.xml.tmp")
226            OSinfo("cp context_grid_dynamico.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
227            OSinfo("cp dynamico_grid.nc "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
228            OSinfo("cp "+test_folder+"/checkfile.def "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
229            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/param.def", "w") as fh:
230                fh.write("&params_run\n")
231                fh.write("duration=\'"+full_config["Duration"]+"\'\n")
232                fh.write("nb_proc_atm="+str(full_config["NumberClients"])+"\n")
233                fh.write("/\n")
234            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/all_param.def", "w") as fh:
235                fh.write("&params_run\n")
236                for param in param_list:
237                    fh.write(param+"="+str(full_config[param])+"\n")
238                fh.write("/\n")
239
240            generate_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/job_"+arch+"_"+mode+".sh", full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
241            update_full_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr, full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
242
243        #if machine=="jeanzay":
244        #    with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
245        #        fh.write("wait\nwait\n")
246        #        fh.write("echo \"tests in "+test_folder+" finished\"\n")
247        #all_config[test_folder] = config_name
248 
249
250    if machine=="irene":
251        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
252            #fh.write("\nfor pid in ${PIDS[@]}; do\n")
253            #fh.write("wait ${pid}\n")
254            #fh.write("STATUS+=($?)\ndone\n")
255            #fh.write("\ni=0\n")
256            #fh.write("#for st in ${STATUS[@]}; do\n")
257            #fh.write("#if [[ ${st} -ne 0 ]]; then\n")
258            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} -1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
259            #fh.write("#else\n")
260            #fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} 1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
261            #fh.write("#fi\n")
262            #fh.write("#((i+=1))\n")
263            #fh.write("#done\n\n")
264            fh.write("wait\nwait\n")
265            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
266    if machine=="jeanzay":
267        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
268            fh.write("wait\nwait\n")
269            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
270
271
272if __name__== "__main__":
273  main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.