source: NEMO/branches/2019/dev_r11265_ASINTER-01_Guillaume_ABL1D/src/OCE/IOM/iom_nf90.F90 @ 11586

Last change on this file since 11586 was 11586, checked in by gsamson, 19 months ago

dev_r11265_ABL : see #2131

  • merge HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization branch @ r11535 (last commit) with dev_r11265_ABL branch @ r11414 (except doc directory)
  • change ORCA2 results due to changes in HPC-13_IRRMANN_BDY_optimization branch
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 43.2 KB
Line 
1MODULE iom_nf90
2   !!======================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom_nf90 ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files with NF90 (only fliocom module)
5   !!======================================================================
6   !! History :  9.0  ! 05 12  (J. Belier) Original code
7   !!            9.0  ! 06 02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!             "   ! 07 07  (D. Storkey) Changes to iom_nf90_gettime
9   !!            3.6  ! 2015-15  (J. Harle) Added procedure to read REAL attributes
10   !!            4.0  ! 2017-11 (M. Andrejczuk) Extend IOM interface to write any 3D fields
11   !!----------------------------------------------------------------------
12
13   !!----------------------------------------------------------------------
14   !!   iom_open       : open a file read only
15   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
16   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
17   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
18   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
19   !!----------------------------------------------------------------------
20   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
21   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
22   USE iom_def         ! iom variables definitions
23   USE netcdf          ! NetCDF library
24   USE in_out_manager  ! I/O manager
25   USE lib_mpp         ! MPP library
26
27   IMPLICIT NONE
28   PRIVATE
29
30   PUBLIC iom_nf90_open  , iom_nf90_close, iom_nf90_varid, iom_nf90_get, iom_nf90_rstput
31   PUBLIC iom_nf90_chkatt, iom_nf90_getatt, iom_nf90_putatt
32
33   INTERFACE iom_nf90_get
34      MODULE PROCEDURE iom_nf90_g0d, iom_nf90_g123d
35   END INTERFACE
36   INTERFACE iom_nf90_rstput
37      MODULE PROCEDURE iom_nf90_rp0123d
38   END INTERFACE
39
40   !!----------------------------------------------------------------------
41   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
42   !! $Id$
43   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
44   !!----------------------------------------------------------------------
45CONTAINS
46
47   SUBROUTINE iom_nf90_open( cdname, kiomid, ldwrt, ldok, kdompar, kdlev )
48      !!---------------------------------------------------------------------
49      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
50      !!
51      !! ** Purpose : open an input file with NF90
52      !!---------------------------------------------------------------------
53      CHARACTER(len=*)       , INTENT(inout)           ::   cdname      ! File name
54      INTEGER                , INTENT(  out)           ::   kiomid      ! nf90 identifier of the opened file
55      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldwrt       ! read or write the file?
56      LOGICAL                , INTENT(in   )           ::   ldok        ! check the existence
57      INTEGER, DIMENSION(2,5), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdompar     ! domain parameters:
58      INTEGER                , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdlev       ! size of the third dimension
59
60      CHARACTER(LEN=256) ::   clinfo           ! info character
61      CHARACTER(LEN=256) ::   cltmp            ! temporary character
62      INTEGER            ::   iln              ! lengths of character
63      INTEGER            ::   istop            ! temporary storage of nstop
64      INTEGER            ::   if90id           ! nf90 identifier of the opened file
65      INTEGER            ::   idmy             ! dummy variable
66      INTEGER            ::   jl               ! loop variable
67      INTEGER            ::   ichunk           ! temporary storage of nn_chunksz
68      INTEGER            ::   imode            ! creation mode flag: NF90_CLOBBER or NF90_NOCLOBBER or NF90_HDF5
69      INTEGER            ::   ihdf5            ! local variable for retrieval of value for NF90_HDF5
70      LOGICAL            ::   llclobber        ! local definition of ln_clobber
71      INTEGER            ::   ilevels           ! vertical levels
72      !---------------------------------------------------------------------
73      !
74      clinfo = '                    iom_nf90_open ~~~  '
75      istop = nstop     ! store the actual value of nstop
76      !
77      !                 !number of vertical levels
78      IF( PRESENT(kdlev) ) THEN   ;   ilevels = kdlev    ! use input value (useful for sea-ice)
79      ELSE                        ;   ilevels = jpk      ! by default jpk
80      ENDIF
81      !
82      IF( nn_chunksz > 0 ) THEN   ;   ichunk = nn_chunksz
83      ELSE                        ;   ichunk = NF90_SIZEHINT_DEFAULT
84      ENDIF
85      !
86      llclobber = ldwrt .AND. ln_clobber
87      IF( ldok .AND. .NOT. llclobber ) THEN      !==  Open existing file ==!
88         !                                       !=========================!
89         IF( ldwrt ) THEN  ! ... in write mode
90            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
91            IF( snc4set%luse ) THEN
92               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id ), clinfo)
93            ELSE
94               CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_WRITE  , if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
95            ENDIF
96            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL, idmy                          ), clinfo)
97         ELSE              ! ... in read mode
98            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' open existing file: '//TRIM(cdname)//' in READ mode'
99            CALL iom_nf90_check(NF90_OPEN( TRIM(cdname), NF90_NOWRITE, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
100         ENDIF
101      ELSE                                       !== the file doesn't exist ==!   (or we overwrite it)
102         !                                       !============================!
103         iln = INDEX( cdname, '.nc' )
104         IF( ldwrt ) THEN              !* the file should be open in write mode so we create it...
105            IF( jpnij > 1 ) THEN
106               WRITE(cltmp,'(a,a,i4.4,a)') cdname(1:iln-1), '_', narea-1, '.nc'
107               cdname = TRIM(cltmp)
108            ENDIF
109            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' create new file: '//TRIM(cdname)//' in WRITE mode'
110
111            IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_CLOBBER   )
112            ELSE                   ;   imode = IOR( NF90_64BIT_OFFSET, NF90_NOCLOBBER ) 
113            ENDIF
114            IF( snc4set%luse ) THEN
115               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' creating file: '//TRIM(cdname)//' in hdf5 (netcdf4) mode'
116               CALL GET_NF90_SYMBOL("NF90_HDF5", ihdf5)
117               IF( llclobber ) THEN   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_CLOBBER)
118               ELSE                   ;   imode = IOR(ihdf5, NF90_NOCLOBBER)
119               ENDIF
120               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id ), clinfo)
121            ELSE
122               CALL iom_nf90_check(NF90_CREATE( TRIM(cdname), imode, if90id, chunksize = ichunk ), clinfo)
123            ENDIF
124            CALL iom_nf90_check(NF90_SET_FILL( if90id, NF90_NOFILL,                   idmy ), clinfo)
125            ! define dimensions
126            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'x',   kdompar(1,1), idmy ), clinfo)
127            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,            'y',   kdompar(2,1), idmy ), clinfo)
128            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,      'nav_lev',            jpk, idmy ), clinfo)
129            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id, 'time_counter', NF90_UNLIMITED, idmy ), clinfo)
130            IF( PRESENT(kdlev) )   &
131               CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_DIM( if90id,    'numcat',          kdlev, idmy ), clinfo)
132            ! global attributes
133            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number_total'   , jpnij              ), clinfo)
134            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_number'         , narea-1            ), clinfo)
135            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_dimensions_ids' , (/1     , 2     /) ), clinfo)
136            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_global'    , (/jpiglo, jpjglo/) ), clinfo)
137            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_size_local'     , kdompar(:,1)       ), clinfo)
138            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_first' , kdompar(:,2)       ), clinfo)
139            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_position_last'  , kdompar(:,3)       ), clinfo)
140            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_start', kdompar(:,4)       ), clinfo)
141            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_halo_size_end'  , kdompar(:,5)       ), clinfo)
142            CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT( if90id, NF90_GLOBAL, 'DOMAIN_type'           , 'BOX'              ), clinfo)
143         ELSE                          !* the file should be open for read mode so it must exist...
144            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), ' should be impossible case...' )
145         ENDIF
146      ENDIF
147      !
148      ! start to fill file informations
149      ! =============
150      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
151!does not work with some compilers         kiomid = MINLOC(iom_file(:)%nfid, dim = 1)
152         kiomid = 0
153         DO jl = jpmax_files, 1, -1
154            IF( iom_file(jl)%nfid == 0 )   kiomid = jl
155         ENDDO
156         iom_file(kiomid)%name   = TRIM(cdname)
157         iom_file(kiomid)%nfid   = if90id
158         iom_file(kiomid)%nvars  = 0
159         iom_file(kiomid)%irec   = -1   ! useless for NetCDF files, used to know if the file is in define mode
160         iom_file(kiomid)%nlev   = ilevels
161         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire(if90id, unlimitedDimId = iom_file(kiomid)%iduld), clinfo)
162         IF( iom_file(kiomid)%iduld .GE. 0 ) THEN
163            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, iom_file(kiomid)%iduld,    & 
164               &                                       name = iom_file(kiomid)%uldname,   &
165               &                                       len  = iom_file(kiomid)%lenuld ), clinfo )
166         ENDIF
167         IF(lwp) WRITE(numout,*) '                   ---> '//TRIM(cdname)//' OK'
168      ELSE
169         kiomid = 0               ! return error flag
170      ENDIF
171      !
172   END SUBROUTINE iom_nf90_open
173
174
175   SUBROUTINE iom_nf90_close( kiomid )
176      !!--------------------------------------------------------------------
177      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_close  ***
178      !!
179      !! ** Purpose : close an input file with NF90
180      !!--------------------------------------------------------------------
181      INTEGER, INTENT(in) ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
182      CHARACTER(LEN=100)  ::   clinfo   ! info character
183      !---------------------------------------------------------------------
184      clinfo = '      iom_nf90_close    , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)
185      CALL iom_nf90_check(NF90_CLOSE(iom_file(kiomid)%nfid), clinfo)
186   END SUBROUTINE iom_nf90_close
187
188
189   FUNCTION iom_nf90_varid ( kiomid, cdvar, kiv, kdimsz, kndims, lduld ) 
190      !!-----------------------------------------------------------------------
191      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
192      !!
193      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file with NF90
194      !!-----------------------------------------------------------------------
195      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
196      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
197      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiv   !
198      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of each dimension
199      INTEGER              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   kndims   ! number of dimensions
200      LOGICAL              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   lduld    ! true if the last dimension is unlimited (time)
201      !
202      INTEGER                        ::   iom_nf90_varid   ! iom variable Id
203      INTEGER                        ::   if90id           ! nf90 file identifier
204      INTEGER                        ::   ji               ! dummy loop index
205      INTEGER                        ::   ivarid           ! NetCDF  variable Id
206      INTEGER                        ::   i_nvd            ! number of dimension of the variable
207      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimid           ! dimension ids of the variable
208      LOGICAL                        ::   llok             ! ok  test
209      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo           ! info character
210      !!-----------------------------------------------------------------------
211      clinfo = '          iom_nf90_varid, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
212      iom_nf90_varid = 0                    ! default definition
213      IF( PRESENT(kdimsz) ) kdimsz(:) = 0   ! default definition
214      if90id = iom_file(kiomid)%nfid        ! get back NetCDF file id
215      !
216      llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! does the variable exist in the file
217      IF( llok ) THEN
218         iom_nf90_varid = kiv
219         iom_file(kiomid)%nvars       = kiv
220         iom_file(kiomid)%nvid(kiv)   = ivarid
221         iom_file(kiomid)%cn_var(kiv) = TRIM(cdvar)
222         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, ndims = i_nvd), clinfo)   ! number of dimensions
223         iom_file(kiomid)%ndims(kiv)  = i_nvd
224         CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Variable(if90id, ivarid, dimids = idimid(1:i_nvd)), clinfo)   ! dimensions ids
225         iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .FALSE.   ! default value
226         iom_file(kiomid)%dimsz(:,kiv) = 0      ! reset dimsz in case previously used
227         DO ji = 1, i_nvd                       ! dimensions size
228            CALL iom_nf90_check(NF90_Inquire_Dimension(if90id, idimid(ji), len = iom_file(kiomid)%dimsz(ji,kiv)), clinfo)   
229            IF( idimid(ji) == iom_file(kiomid)%iduld ) iom_file(kiomid)%luld(kiv) = .TRUE.   ! unlimited dimension?
230         END DO
231         !---------- Deal with scale_factor and add_offset
232         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'scale_factor') == nf90_noerr
233         IF( llok) THEN
234            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'scale_factor', iom_file(kiomid)%scf(kiv)), clinfo)
235         ELSE
236            iom_file(kiomid)%scf(kiv) = 1.
237         END IF
238         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, 'add_offset') == nf90_noerr
239         IF( llok ) THEN
240            CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, 'add_offset', iom_file(kiomid)%ofs(kiv)), clinfo)
241         ELSE
242            iom_file(kiomid)%ofs(kiv) = 0.
243         END IF
244         ! return the simension size
245         IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
246            IF( i_nvd <= SIZE(kdimsz) ) THEN
247               kdimsz(1:i_nvd) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,kiv)
248            ELSE
249               WRITE(ctmp1,*) i_nvd, SIZE(kdimsz)
250               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'error in kdimsz size'//TRIM(ctmp1) )
251            ENDIF
252         ENDIF
253         IF( PRESENT(kndims) )  kndims = iom_file(kiomid)%ndims(kiv)
254         IF( PRESENT( lduld) )  lduld  = iom_file(kiomid)%luld(kiv)
255      ELSE 
256         iom_nf90_varid = -1   !   variable not found, return error code: -1
257      ENDIF
258      !
259   END FUNCTION iom_nf90_varid
260
261   !!----------------------------------------------------------------------
262   !!                   INTERFACE iom_nf90_get
263   !!----------------------------------------------------------------------
264
265   SUBROUTINE iom_nf90_g0d( kiomid, kvid, pvar, kstart )
266      !!-----------------------------------------------------------------------
267      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g0d  ***
268      !!
269      !! ** Purpose : read a scalar with NF90
270      !!-----------------------------------------------------------------------
271      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kiomid   ! Identifier of the file
272      INTEGER ,               INTENT(in   )            ::   kvid     ! variable id
273      REAL(wp),               INTENT(  out)            ::   pvar     ! read field
274      INTEGER , DIMENSION(1), INTENT(in   ), OPTIONAL  ::   kstart   ! start position of the reading in each axis
275      !
276      CHARACTER(LEN=100)      ::   clinfo   ! info character
277      !---------------------------------------------------------------------
278      clinfo = 'iom_nf90_g0d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
279      CALL iom_nf90_check(NF90_GET_VAR(iom_file(kiomid)%nfid, iom_file(kiomid)%nvid(kvid), pvar, start = kstart), clinfo )
280   END SUBROUTINE iom_nf90_g0d
281
282
283   SUBROUTINE iom_nf90_g123d( kiomid, kvid, knbdim, kstart, kcount, kx1, kx2, ky1, ky2,   &
284         &                    pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
285      !!-----------------------------------------------------------------------
286      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_g123d  ***
287      !!
288      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable with NF90
289      !!
290      !! ** Method : read ONE record at each CALL
291      !!-----------------------------------------------------------------------
292      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid    ! iom identifier of the file
293      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kvid      ! Name of the variable
294      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   knbdim    ! number of dimensions of the variable
295      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kstart    ! start position of the reading in each axis
296      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   )           ::   kcount    ! number of points to be read in each axis
297      INTEGER ,                    INTENT(in   )           ::   kx1, kx2, ky1, ky2   ! subdomain indexes
298      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d    ! read field (1D case)
299      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d    ! read field (2D case)
300      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d    ! read field (3D case)
301      !
302      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo               ! info character
303      INTEGER            ::   if90id               ! nf90 identifier of the opened file
304      INTEGER            ::   ivid                 ! nf90 variable id
305      !---------------------------------------------------------------------
306      clinfo = 'iom_nf90_g123d , file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(kvid))
307      if90id = iom_file(kiomid)%nfid         ! get back NetCDF file id
308      ivid   = iom_file(kiomid)%nvid(kvid)   ! get back NetCDF var id
309      !
310      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
311         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r1d(:                ), start = kstart(1:knbdim),   &
312            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
313      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
314         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r2d(kx1:kx2,ky1:ky2  ), start = kstart(1:knbdim),   &
315            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
316      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
317         CALL iom_nf90_check( NF90_GET_VAR(if90id, ivid, pv_r3d(kx1:kx2,ky1:ky2,:), start = kstart(1:knbdim),   &
318            &                                                                       count = kcount(1:knbdim)), clinfo )
319      ENDIF
320      !
321   END SUBROUTINE iom_nf90_g123d
322
323
324   SUBROUTINE iom_nf90_chkatt( kiomid, cdatt, llok, ksize, cdvar )
325      !!-----------------------------------------------------------------------
326      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_chkatt  ***
327      !!
328      !! ** Purpose : check existence of attribute with NF90
329      !!              (either a global attribute (default) or a variable
330      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
331      !!-----------------------------------------------------------------------
332      INTEGER         , INTENT(in   ) ::   kiomid   ! Identifier of the file
333      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) ::   cdatt    ! attribute name
334      LOGICAL         , INTENT(  out) ::   llok     ! error code
335      INTEGER         , INTENT(  out), OPTIONAL     &
336                      &               ::   ksize    ! attribute size
337      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ), OPTIONAL     &
338                      &               ::   cdvar    ! name of the variable
339      !
340      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
341      INTEGER                         ::   isize    ! temporary integer
342      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
343      !---------------------------------------------------------------------
344      !
345      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
346      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
347         ! check the variable exists in the file
348         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
349         IF( llok ) &
350            ! check the variable has the attribute required
351            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
352      ELSE
353         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt, len=isize ) == nf90_noerr
354      ENDIF
355      !
356      IF( PRESENT(ksize) ) ksize = isize
357      !
358      IF( .not. llok) &
359         CALL ctl_warn('iom_nf90_chkatt: no attribute '//cdatt//' found')
360      !
361   END SUBROUTINE iom_nf90_chkatt
362
363
364   !!----------------------------------------------------------------------
365   !!                   INTERFACE iom_nf90_getatt
366   !!----------------------------------------------------------------------
367
368   SUBROUTINE iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
369      !!-----------------------------------------------------------------------
370      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_getatt  ***
371      !!
372      !! ** Purpose : read an attribute with NF90
373      !!              (either a global attribute (default) or a variable
374      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
375      !!-----------------------------------------------------------------------
376      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
377      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
378      INTEGER               , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
379      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
380      REAL(wp)              , INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
381      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
382      CHARACTER(len=*)      , INTENT(  out), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
383      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
384      !
385      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
386      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
387      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
388      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
389      !---------------------------------------------------------------------
390      !
391      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
392      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
393         ! check the variable exists in the file
394         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr
395         IF( llok ) THEN
396            ! check the variable has the attribute required
397            llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt) == nf90_noerr
398         ELSE
399            CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found')
400         ENDIF
401      ELSE
402         llok = NF90_Inquire_attribute(if90id, NF90_GLOBAL, cdatt) == nf90_noerr
403         ivarid = NF90_GLOBAL
404      ENDIF
405      !
406      IF( llok) THEN
407         clinfo = 'iom_nf90_getatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
408         IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt0d), clinfo)
409         IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  katt1d), clinfo)
410         IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt0d), clinfo)
411         IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =  patt1d), clinfo)
412         IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_GET_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = cdatt0d), clinfo)
413      ELSE
414         CALL ctl_warn('iom_nf90_getatt: no attribute '//TRIM(cdatt)//' found')
415         IF(PRESENT( katt0d))    katt0d    = -999
416         IF(PRESENT( katt1d))    katt1d(:) = -999
417         IF(PRESENT( patt0d))    patt0d    = -999._wp
418         IF(PRESENT( patt1d))    patt1d(:) = -999._wp
419         IF(PRESENT(cdatt0d))   cdatt0d    = '!'
420      ENDIF
421      !
422   END SUBROUTINE iom_nf90_getatt
423
424
425   SUBROUTINE iom_nf90_putatt( kiomid, cdatt, katt0d, katt1d, patt0d, patt1d, cdatt0d, cdvar)
426      !!-----------------------------------------------------------------------
427      !!                  ***  ROUTINE  iom_nf90_putatt  ***
428      !!
429      !! ** Purpose : write an attribute with NF90
430      !!              (either a global attribute (default) or a variable
431      !!               attribute if optional variable name is supplied (cdvar))
432      !!-----------------------------------------------------------------------
433      INTEGER               , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! Identifier of the file
434      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   )           ::   cdatt    ! attribute name
435      INTEGER               , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt0d   ! read scalar integer
436      INTEGER, DIMENSION(:) , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   katt1d   ! read 1d array integer
437      REAL(wp)              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt0d   ! read scalar  real
438      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in   ), OPTIONAL ::   patt1d   ! read 1d array real
439      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdatt0d  ! read character
440      CHARACTER(len=*)      , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   cdvar    ! name of the variable
441      !
442      INTEGER                         ::   if90id   ! temporary integer
443      INTEGER                         ::   ivarid   ! NetCDF variable Id
444      INTEGER                         ::   isize    ! Attribute size
445      INTEGER                         ::   itype    ! Attribute type
446      LOGICAL                         ::   llok     ! temporary logical
447      LOGICAL                         ::   llatt     ! temporary logical
448      LOGICAL                         ::   lldata   ! temporary logical
449      CHARACTER(LEN=100)              ::   clinfo   ! info character
450      !---------------------------------------------------------------------
451      !
452      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
453      IF( PRESENT(cdvar) ) THEN
454         llok = NF90_INQ_VARID( if90id, TRIM(cdvar), ivarid ) == nf90_noerr   ! is the variable in the file?
455         IF( .NOT. llok ) THEN
456            CALL ctl_warn('iom_nf90_putatt: no variable '//TRIM(cdvar)//' found'   &
457               &        , '                 no attribute '//cdatt//' written' )
458            RETURN
459         ENDIF
460      ELSE
461         ivarid = NF90_GLOBAL
462      ENDIF
463      llatt = NF90_Inquire_attribute(if90id, ivarid, cdatt, len = isize, xtype = itype ) == nf90_noerr
464      !
465      ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
466      lldata = iom_file(kiomid)%irec /= -1   ! default: go back in define mode if in data mode
467      IF( lldata .AND. llatt ) THEN          ! attribute already there. Do we really need to go back in define mode?
468         ! do we have the appropriate type?
469         IF(PRESENT( katt0d) .OR. PRESENT( katt1d))   llok = itype == NF90_INT
470         IF(PRESENT( patt0d) .OR. PRESENT( patt1d))   llok = itype == NF90_DOUBLE
471         IF(PRESENT(cdatt0d)                      )   llok = itype == NF90_CHAR
472         ! and do we have the appropriate size?
473         IF(PRESENT( katt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
474         IF(PRESENT( katt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(katt1d)
475         IF(PRESENT( patt0d))   llok = llok .AND. isize == 1
476         IF(PRESENT( patt1d))   llok = llok .AND. isize == SIZE(patt1d)
477         IF(PRESENT(cdatt0d))   llok = llok .AND. isize == LEN_TRIM(cdatt0d)
478         !
479         lldata = .NOT. llok
480      ENDIF
481      !
482      clinfo = 'iom_nf90_putatt, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', att: '//TRIM(cdatt)
483      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ! leave data mode to define mode
484      !
485      IF(PRESENT( katt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt0d) , clinfo)
486      IF(PRESENT( katt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       katt1d) , clinfo)
487      IF(PRESENT( patt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt0d) , clinfo)
488      IF(PRESENT( patt1d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values =       patt1d) , clinfo)
489      IF(PRESENT(cdatt0d))   CALL iom_nf90_check(NF90_PUT_ATT(if90id, ivarid, cdatt, values = trim(cdatt0d)), clinfo)
490      !
491      IF(lldata)   CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ! leave define mode to data mode
492      !
493   END SUBROUTINE iom_nf90_putatt
494
495
496   SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d( kt, kwrite, kiomid, cdvar , kvid  , ktype,   &
497         &                                  pv_r0d, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
498      !!--------------------------------------------------------------------
499      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_nf90_rstput  ***
500      !!
501      !! ** Purpose : read the time axis cdvar in the file
502      !!--------------------------------------------------------------------
503      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kt       ! ocean time-step
504      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kwrite   ! writing time-step
505      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kiomid   ! Identifier of the file
506      CHARACTER(len=*)            , INTENT(in)           ::   cdvar    ! variable name
507      INTEGER                     , INTENT(in)           ::   kvid     ! variable id
508      INTEGER                     , INTENT(in), OPTIONAL ::   ktype    ! variable type (default R8)
509      REAL(wp)                    , INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r0d   ! written Od field
510      REAL(wp), DIMENSION(      :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r1d   ! written 1d field
511      REAL(wp), DIMENSION(:, :   ), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r2d   ! written 2d field
512      REAL(wp), DIMENSION(:, :, :), INTENT(in), OPTIONAL ::   pv_r3d   ! written 3d field
513      !
514      INTEGER               :: idims                ! number of dimension
515      INTEGER               :: idvar                ! variable id
516      INTEGER               :: jd                   ! dimension loop counter   
517      INTEGER               :: ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes   
518      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimsz               ! dimensions size 
519      INTEGER, DIMENSION(4) :: idimid               ! dimensions id
520      CHARACTER(LEN=256)    :: clinfo               ! info character
521      CHARACTER(LEN= 12), DIMENSION(5) :: cltmp     ! temporary character
522      INTEGER               :: if90id               ! nf90 file identifier
523      INTEGER               :: idmy                 ! dummy variable
524      INTEGER               :: itype                ! variable type
525      INTEGER, DIMENSION(4) :: ichunksz             ! NetCDF4 chunk sizes. Will be computed using
526      !                                             ! nn_nchunks_[i,j,k,t] namelist parameters
527      INTEGER               :: ichunkalg, ishuffle, ideflate, ideflate_level
528      !                                             ! NetCDF4 internally fixed parameters
529      LOGICAL               :: lchunk               ! logical switch to activate chunking and compression
530      !                                             ! when appropriate (currently chunking is applied to 4d fields only)
531      INTEGER               :: idlv                 ! local variable
532      INTEGER               :: idim3                ! id of the third dimension
533      !---------------------------------------------------------------------
534      !
535      clinfo = '          iom_nf90_rp0123d, file: '//TRIM(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//TRIM(cdvar)
536      if90id = iom_file(kiomid)%nfid
537      !
538      ! define dimension variables if it is not already done
539      ! ==========================
540      IF( iom_file(kiomid)%nvars == 0 ) THEN
541         ! are we in define mode?
542         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
543            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
544         ENDIF
545         ! define the dimension variables if it is not already done
546         ! Warning: we must use the same character length in an array constructor (at least for gcc compiler)
547         cltmp = (/ 'nav_lon     ', 'nav_lat     ', 'nav_lev     ', 'time_counter', 'numcat      ' /)   
548         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(1)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(1) ), clinfo)
549         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(2)), NF90_FLOAT , (/ 1, 2 /), iom_file(kiomid)%nvid(2) ), clinfo)
550         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(3)), NF90_FLOAT , (/ 3    /), iom_file(kiomid)%nvid(3) ), clinfo)
551         CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(4)), NF90_DOUBLE, (/ 4    /), iom_file(kiomid)%nvid(4) ), clinfo)
552         ! update informations structure related the dimension variable we just added...
553         iom_file(kiomid)%nvars       = 4
554         iom_file(kiomid)%luld(1:4)   = (/ .FALSE., .FALSE., .FALSE., .TRUE. /)
555         iom_file(kiomid)%cn_var(1:4) = cltmp(1:4)
556         iom_file(kiomid)%ndims(1:4)  = (/ 2, 2, 1, 1 /)
557         IF( NF90_INQ_DIMID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN   ! add a 5th variable corresponding to the 5th dimension
558            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cltmp(5)), NF90_FLOAT , (/ 5 /), iom_file(kiomid)%nvid(5) ), clinfo)
559            iom_file(kiomid)%nvars     = 5
560            iom_file(kiomid)%luld(5)   = .FALSE.
561            iom_file(kiomid)%cn_var(5) = cltmp(5)
562            iom_file(kiomid)%ndims(5)  = 1
563         ENDIF
564         ! trick: defined to 0 to say that dimension variables are defined but not yet written
565         iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1)  = 0   
566         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' define dimension variables done'
567      ENDIF
568      ! define the data if it is not already done
569      ! ===============
570      IF( kvid <= 0 ) THEN
571         !
572         ! NetCDF4 chunking and compression fixed settings
573         ichunkalg = 0
574         ishuffle = 1
575         ideflate = 1
576         ideflate_level = 1
577         !
578         idvar = iom_file(kiomid)%nvars + 1
579         ! are we in define mode?
580         IF( iom_file(kiomid)%irec /= -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
581            CALL iom_nf90_check(NF90_REDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = -1
582         ENDIF
583         ! variable definition
584         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   idims = 0
585         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
586            IF( SIZE(pv_r1d,1) == jpk ) THEN   ;   idim3 = 3
587            ELSE                               ;   idim3 = 5
588            ENDIF
589                                              idims = 2   ;   idimid(1:idims) = (/idim3,4/)
590         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN   ;   idims = 3   ;   idimid(1:idims) = (/1,2  ,4/)
591         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
592            IF( SIZE(pv_r3d,3) == jpk ) THEN   ;   idim3 = 3
593            ELSE                               ;   idim3 = 5
594            ENDIF
595                                              idims = 4   ;   idimid(1:idims) = (/1,2,idim3,4/)
596         ENDIF
597         IF( PRESENT(ktype) ) THEN   ! variable external type
598            SELECT CASE (ktype)
599            CASE (jp_r8)   ;   itype = NF90_DOUBLE
600            CASE (jp_r4)   ;   itype = NF90_FLOAT
601            CASE (jp_i4)   ;   itype = NF90_INT
602            CASE (jp_i2)   ;   itype = NF90_SHORT
603            CASE (jp_i1)   ;   itype = NF90_BYTE
604            CASE DEFAULT   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' unknown variable type' )
605            END SELECT
606         ELSE
607            itype = NF90_DOUBLE
608         ENDIF
609         IF( PRESENT(pv_r0d) ) THEN
610            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype,                    &
611               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
612         ELSE
613            CALL iom_nf90_check(NF90_DEF_VAR( if90id, TRIM(cdvar), itype, idimid(1:idims),   &
614               &                              iom_file(kiomid)%nvid(idvar) ), clinfo )
615         ENDIF
616         lchunk = .false.
617         IF( snc4set%luse .AND. idims == 4 )   lchunk = .true.
618         ! update informations structure related the new variable we want to add...
619         iom_file(kiomid)%nvars         = idvar
620         iom_file(kiomid)%cn_var(idvar) = TRIM(cdvar)
621         iom_file(kiomid)%scf(idvar)    = 1.
622         iom_file(kiomid)%ofs(idvar)    = 0.
623         iom_file(kiomid)%ndims(idvar)  = idims
624         IF( .NOT. PRESENT(pv_r0d) ) THEN   ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .TRUE.
625         ELSE                               ;   iom_file(kiomid)%luld(idvar) = .FALSE.
626         ENDIF
627         DO jd = 1, idims
628            CALL iom_nf90_check(NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, idimid(jd), len = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar) ), clinfo)
629            IF ( lchunk ) ichunksz(jd) = iom_file(kiomid)%dimsz(jd,idvar)
630         END DO
631         IF ( lchunk ) THEN
632            ! Calculate chunk sizes by partitioning each dimension as requested in namnc4 namelist
633            ! Disallow very small chunk sizes and prevent chunk sizes larger than each individual dimension
634            ichunksz(1) = MIN( ichunksz(1),MAX( (ichunksz(1)-1)/snc4set%ni + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%ni=4
635            ichunksz(2) = MIN( ichunksz(2),MAX( (ichunksz(2)-1)/snc4set%nj + 1 ,16 ) ) ! Suggested default nc4set%nj=2
636            ichunksz(3) = MIN( ichunksz(3),MAX( (ichunksz(3)-1)/snc4set%nk + 1 , 1 ) ) ! Suggested default nc4set%nk=6
637            ichunksz(4) = 1                                                            ! Do not allow chunks to span the
638            !                                                                          ! unlimited dimension
639            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_CHUNKING(if90id, idvar, ichunkalg, ichunksz), clinfo)
640            CALL iom_nf90_check(SET_NF90_DEF_VAR_DEFLATE(if90id, idvar, ishuffle, ideflate, ideflate_level), clinfo)
641            IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' chunked ok. Chunks sizes: ', ichunksz
642         ENDIF
643         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' defined ok'
644      ELSE
645         idvar = kvid
646      ENDIF
647      !
648      ! time step kwrite : write the variable
649      IF( kt == kwrite ) THEN
650         ! are we in write mode?
651         IF( iom_file(kiomid)%irec == -1 ) THEN   ! trick: irec used to know if the file is in define mode or not
652            CALL iom_nf90_check(NF90_ENDDEF( if90id ), clinfo)   ;   iom_file(kiomid)%irec = 0
653         ENDIF
654         ! on what kind of domain must the data be written?
655         IF( PRESENT(pv_r2d) .OR. PRESENT(pv_r3d) ) THEN
656            idimsz(1:2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2,idvar)
657            IF(     idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN
658               ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei   ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
659            ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN
660               ix1 = 1      ;   ix2 = nlci   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
661            ELSEIF( idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN
662               ix1 = 1      ;   ix2 = jpi    ;   iy1 = 1      ;   iy2 = jpj
663            ELSE
664               CALL ctl_stop( 'iom_nf90_rp0123d: should have been an impossible case...' )
665            ENDIF
666
667            ! write dimension variables if it is not already done
668            ! =============
669            ! trick: is defined to 0 => dimension variable are defined but not yet written
670            IF( iom_file(kiomid)%dimsz(1, 1) == 0 ) THEN
671               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lon'     , idmy )         , clinfo )
672               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, glamt(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
673               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lat'     , idmy )         , clinfo )
674               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gphit(ix1:ix2, iy1:iy2) ), clinfo )
675               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'nav_lev'     , idmy ), clinfo )
676               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, gdept_1d       ), clinfo )
677               IF( NF90_INQ_VARID( if90id, 'numcat', idmy ) == nf90_noerr ) THEN
678                  CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR  ( if90id, idmy, (/ (idlv, idlv = 1,iom_file(kiomid)%nlev) /)), clinfo )
679               ENDIF
680               ! +++ WRONG VALUE: to be improved but not really useful...
681               CALL iom_nf90_check( NF90_INQ_VARID( if90id, 'time_counter', idmy ), clinfo )
682               CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idmy, kt                      ), clinfo )   
683               ! update the values of the variables dimensions size
684               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 1, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,1) ), clinfo )
685               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 2, len = iom_file(kiomid)%dimsz(2,1) ), clinfo )
686               iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 2) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:2, 1)
687               CALL iom_nf90_check( NF90_INQUIRE_DIMENSION( if90id, 3, len = iom_file(kiomid)%dimsz(1,3) ), clinfo )
688               iom_file(kiomid)%dimsz(1  , 4) = 1   ! unlimited dimension
689               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' write dimension variables done'
690            ENDIF
691         ENDIF
692
693         ! write the data
694         ! =============
695         IF(     PRESENT(pv_r0d) ) THEN
696            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r0d                    ), clinfo )
697         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN
698            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r1d(:)                 ), clinfo )
699         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
700            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r2d(ix1:ix2,iy1:iy2)   ), clinfo )
701         ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
702            CALL iom_nf90_check( NF90_PUT_VAR( if90id, idvar, pv_r3d(ix1:ix2,iy1:iy2,:) ), clinfo )
703         ENDIF
704         ! add 1 to the size of the temporal dimension (not really useful...)
705         IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar)    &
706               &                            = iom_file(kiomid)%dimsz(iom_file(kiomid)%ndims(idvar), idvar) + 1
707         IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' written ok'
708      ENDIF
709      !     
710   END SUBROUTINE iom_nf90_rp0123d
711
712
713   SUBROUTINE iom_nf90_check( kstatus, cdinfo )
714      !!--------------------------------------------------------------------
715      !!                   ***  SUBROUTINE iom_nf90_check  ***
716      !!
717      !! ** Purpose :   check nf90 errors
718      !!--------------------------------------------------------------------
719      INTEGER,          INTENT(in) :: kstatus
720      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdinfo
721      !---------------------------------------------------------------------
722      IF(kstatus /= nf90_noerr)   CALL ctl_stop( 'iom_nf90_check : '//TRIM(nf90_strerror(kstatus)), TRIM(cdinfo) )
723   END SUBROUTINE iom_nf90_check
724
725   !!======================================================================
726END MODULE iom_nf90
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.