source: NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0.1_FKOSM/src/OCE/DIA/diawri.F90 @ 12386

Last change on this file since 12386 was 12386, checked in by cguiavarch, 15 months ago

corrections to tramle & zdfosm to avoid division by 0 and restored OSMOSIS variables in output.abort

File size: 50.0 KB
Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   USE zdfosm         ! mixed layer
46   !
47   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
48   USE in_out_manager ! I/O manager
49   USE diatmb         ! Top,middle,bottom output
50   USE dia25h         ! 25h Mean output
51   USE iom            !
52   USE ioipsl         !
53
54#if defined key_si3
55   USE ice 
56   USE icewri 
57#endif
58   USE lib_mpp         ! MPP library
59   USE timing          ! preformance summary
60   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
61   USE cool_skin       ! Cool skin
62
63   IMPLICIT NONE
64   PRIVATE
65
66   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
67   PUBLIC   dia_wri_state
68   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
69
70   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
71   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
72   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
73   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
74   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
75   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
77   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
78   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
79
80   !! * Substitutions
81#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
82   !!----------------------------------------------------------------------
83   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
84   !! $Id$
85   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
86   !!----------------------------------------------------------------------
87CONTAINS
88
89#if defined key_iomput
90   !!----------------------------------------------------------------------
91   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
92   !!----------------------------------------------------------------------
93   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
94      !
95      dia_wri_alloc = 0
96      !
97   END FUNCTION dia_wri_alloc
98
99   
100   SUBROUTINE dia_wri( kt )
101      !!---------------------------------------------------------------------
102      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
103      !!                   
104      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
105      !!      NETCDF format is used by default
106      !!
107      !! ** Method  :  use iom_put
108      !!----------------------------------------------------------------------
109      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
110      !!
111      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
112      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
113      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
114      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
116      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
117      !!----------------------------------------------------------------------
118      !
119      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
120      !
121      ! Output the initial state and forcings
122      IF( ninist == 1 ) THEN                       
123         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
124         ninist = 0
125      ENDIF
126
127      ! Output of initial vertical scale factor
128      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
129      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
130      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
131      !
132      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
133      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
134      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
135      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
136      IF( iom_use("e3tdef") )   &
137         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
138
139      IF( ll_wd ) THEN
140         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
141      ELSE
142         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
143      ENDIF
144
145      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
146         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
147     
148      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
149      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
150      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
151         DO jj = 1, jpj
152            DO ji = 1, jpi
153               ikbot = mbkt(ji,jj)
154               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
155            END DO
156         END DO
157         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
158      ENDIF
159     
160      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
161      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
162      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
163         DO jj = 1, jpj
164            DO ji = 1, jpi
165               ikbot = mbkt(ji,jj)
166               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
167            END DO
168         END DO
169         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
170      ENDIF
171
172      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
173         zztmp = rau0 * 0.25
174         z2d(:,:) = 0._wp
175         DO jj = 2, jpjm1
176            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
177               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
178                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
180                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
181               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
182               !
183            END DO
184         END DO
185         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
186         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
187      ENDIF
188         
189      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
190      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
191      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
192         DO jj = 1, jpj
193            DO ji = 1, jpi
194               ikbot = mbku(ji,jj)
195               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
196            END DO
197         END DO
198         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
199      ENDIF
200     
201      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
202      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
203      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
204         DO jj = 1, jpj
205            DO ji = 1, jpi
206               ikbot = mbkv(ji,jj)
207               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
208            END DO
209         END DO
210         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
211      ENDIF
212
213      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn + wi               ! Recombine explicit and implicit parts of vertical velocity for diagnostic output
214      !
215      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
216      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
217         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
218         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
219         DO jk = 1, jpk
220            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
221         END DO
222         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
223         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
224      ENDIF
225      !
226      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn - wi               ! Remove implicit part of vertical velocity that was added for diagnostic output
227
228      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
229      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
230      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
231
232      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
233      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
234
235      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
236         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
237            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
238               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
239               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
240               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
241               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
242                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
243            END DO
244         END DO
245         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
246         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
247         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
248         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
249      ENDIF
250         
251      ! heat and salt contents
252      IF( iom_use("heatc") ) THEN
253         z2d(:,:)  = 0._wp 
254         DO jk = 1, jpkm1
255            DO jj = 1, jpj
256               DO ji = 1, jpi
257                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
258               END DO
259            END DO
260         END DO
261         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
262      ENDIF
263
264      IF( iom_use("saltc") ) THEN
265         z2d(:,:)  = 0._wp 
266         DO jk = 1, jpkm1
267            DO jj = 1, jpj
268               DO ji = 1, jpi
269                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
270               END DO
271            END DO
272         END DO
273         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
274      ENDIF
275      !
276      IF ( iom_use("eken") ) THEN
277         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
278         DO jk = 1, jpkm1
279            DO jj = 2, jpjm1
280               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
281                  zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk)
282                  z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  un(ji-1,jj,jk)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)   &
283                     &                     + un(ji  ,jj,jk)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)   &
284                     &                     + vn(ji,jj-1,jk)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)   &
285                     &                     + vn(ji,jj  ,jk)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)   )
286               END DO
287            END DO
288         END DO
289         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
290         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
291      ENDIF
292      !
293      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
294      !
295      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
296         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
297         z2d(:,:) = 0.e0
298         DO jk = 1, jpkm1
299            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
300            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
301         END DO
302         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
303         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
304      ENDIF
305     
306      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
307         z2d(:,:) = 0._wp 
308         DO jk = 1, jpkm1
309            DO jj = 2, jpjm1
310               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
311                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
312               END DO
313            END DO
314         END DO
315         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
316         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
317      ENDIF
318
319      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
320         z2d(:,:) = 0.e0 
321         DO jk = 1, jpkm1
322            DO jj = 2, jpjm1
323               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
324                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
325               END DO
326            END DO
327         END DO
328         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
329         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
330      ENDIF
331
332     
333      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
334         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
335         DO jk = 1, jpkm1
336            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
337         END DO
338         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
339      ENDIF
340     
341      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
342         z2d(:,:) = 0.e0 
343         DO jk = 1, jpkm1
344            DO jj = 2, jpjm1
345               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
346                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
347               END DO
348            END DO
349         END DO
350         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
351         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
352      ENDIF
353
354      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
355         z2d(:,:) = 0._wp 
356         DO jk = 1, jpkm1
357            DO jj = 2, jpjm1
358               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
359                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
360               END DO
361            END DO
362         END DO
363         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
364         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
365      ENDIF
366
367      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
368         z2d(:,:) = 0._wp
369         DO jk = 1, jpkm1
370            DO jj = 2, jpjm1
371               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
372                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
373               END DO
374            END DO
375         END DO
376         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
377         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
378      ENDIF
379      IF( iom_use("somint") ) THEN
380         z2d(:,:)=0._wp
381         DO jk = 1, jpkm1
382            DO jj = 2, jpjm1
383               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
384                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
385               END DO
386            END DO
387         END DO
388         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
389         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
390      ENDIF
391
392      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
393      !
394
395      IF (ln_diatmb)   CALL dia_tmb                   ! tmb values
396         
397      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
398
399      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
400      !
401   END SUBROUTINE dia_wri
402
403#else
404   !!----------------------------------------------------------------------
405   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
406   !!----------------------------------------------------------------------
407
408   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
409      !!----------------------------------------------------------------------
410      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
411      !!----------------------------------------------------------------------
412      ierr = 0
413      ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
414         &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
415         &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
416         !
417      dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
418      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
419      !
420   END FUNCTION dia_wri_alloc
421
422   
423   SUBROUTINE dia_wri( kt )
424      !!---------------------------------------------------------------------
425      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
426      !!                   
427      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
428      !!      NETCDF format is used by default
429      !!
430      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
431      !!      define all the NETCDF files and fields
432      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
433      !!      Each nn_write time step, output the instantaneous or mean fields
434      !!----------------------------------------------------------------------
435      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
436      !
437      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
438      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
439      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
440      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
441      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
442      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
443      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
444      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
445      !
446      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
447      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
448      !!----------------------------------------------------------------------
449      !
450      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
451         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
452         ninist = 0
453      ENDIF
454      !
455      IF( nn_write == -1 )   RETURN   ! we will never do any output
456      !
457      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
458      !
459      ! 0. Initialisation
460      ! -----------------
461
462      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
463      ll_print = ll_print .AND. lwp
464
465      ! Define frequency of output and means
466      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
467#if defined key_diainstant
468      zsto = nn_write * rdt
469      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
470#else
471      zsto=rdt
472      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
473#endif
474      zout = nn_write * rdt
475      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
476
477      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
478      iimi = 1      ;      iima = jpi
479      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
480      ipk = jpk
481
482      ! define time axis
483      it = kt
484      itmod = kt - nit000 + 1
485
486
487      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
488      ! -----------------------------------------------------------------
489
490      IF( kt == nit000 ) THEN
491
492         ! Define the NETCDF files (one per grid)
493
494         ! Compute julian date from starting date of the run
495         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
496         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
497         IF(lwp)WRITE(numout,*)
498         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
499            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
500         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
501                                 ' limit storage in depth = ', ipk
502
503         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
504         IF(lwp) THEN
505            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write,' ' )
506            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
507            WRITE(inum,*) clhstnam
508            CLOSE(inum)
509         ENDIF
510
511         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
512
513         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_T' )
514         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
515         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
516            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
517            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
518         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
519            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
520         !                                                            ! Index of ocean points
521         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
522         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
523         !
524         IF( ln_icebergs ) THEN
525            !
526            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
527            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
528            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
529            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
530            IF( ierror /= 0 ) THEN
531               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
532               RETURN
533            ENDIF
534            !
535            !! iceberg vertical coordinate is class number
536            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
537               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
538            !
539            !! each class just needs the surface index pattern
540            ndim_bT = 3
541            DO jn = 1,nclasses
542               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
543            ENDDO
544            !
545         ENDIF
546
547         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
548
549         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_U' )
550         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
551         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
552            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
553            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
554         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
555            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
556         !                                                            ! Index of ocean points
557         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
558         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
559
560         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
561
562         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_V' )                   ! filename
563         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
564         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
565            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
566            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
567         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
568            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
569         !                                                            ! Index of ocean points
570         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
571         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
572
573         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
574
575         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_W' )                   ! filename
576         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
577         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
578            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
579            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
580         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
581            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
582
583
584         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
585
586         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
587         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
588            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
589         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
590            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
591         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
592            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
593            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
594            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
595            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
596            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
597            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
598         ENDIF
599         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
600         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
601            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
602         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
603            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
604         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
605            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
606         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
607            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
608         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
609            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
610         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
611            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
612         IF(  ln_linssh  ) THEN
613            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
614            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
615            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
616            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
617            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
618            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
619         ENDIF
620         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
621            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
622         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
623            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
624         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
625            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
626         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
627            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
628         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
629            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
630         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
631            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
632!
633         IF( ln_icebergs ) THEN
634            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
635               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
636            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
637               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
638            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
639               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
640            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
641               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
642            IF( ln_bergdia ) THEN
643               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
644                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
645               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
646                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
647               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
648                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
649               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
650                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
651               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
652                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
653               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
654                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
655               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
656                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
657               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
658                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
659               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
660                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
661               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
662                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
663            ENDIF
664         ENDIF
665
666         IF( ln_ssr ) THEN
667            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
668               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
669            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
670               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
671            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
672               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
673         ENDIF
674       
675         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
676!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
677!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
678#if defined key_diahth
679         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
680            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
681         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
682            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
683         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
684            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
685         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
686            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
687#endif
688
689         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
690
691         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
692         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
693            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
694         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
695            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
696               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
697         ENDIF
698         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
699         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
700            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
701
702         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
703
704         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
705         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
706            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
707         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
708            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
709               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
710         ENDIF
711         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
712         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
713            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
714
715         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
716
717         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
718         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
719            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
720         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
721            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
722         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
723            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
724
725         IF( ln_zdfddm ) THEN
726            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
727               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
728         ENDIF
729         
730         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
731            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
732               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
733         ENDIF
734         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
735         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
736
737         IF(lwp) WRITE(numout,*)
738         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
739         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
740
741      ENDIF
742
743      ! 2. Start writing data
744      ! ---------------------
745
746      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
747      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
748      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
749
750      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nn_write ) == 0 ) THEN
751         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
752         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
753      ENDIF
754
755      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
756         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
757         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
758         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
759         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
760      ELSE
761         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
762         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
763         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
764         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
765      ENDIF
766      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
767         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
768         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
769         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
770         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
771      ENDIF
772      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
773      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
774      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
775      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
776                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
777                                                                                  ! in linear free surface case)
778      IF( ln_linssh ) THEN
779         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
780         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
781         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
782         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
783      ENDIF
784      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
785      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
786      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
787      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
788      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
789      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
790!
791      IF( ln_icebergs ) THEN
792         !
793         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
794         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
795         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
796         !
797         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
798         !
799         IF( ln_bergdia ) THEN
800            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
801            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
802            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
803            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
804            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
805            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
806            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
807            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
808            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
809            !
810            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
811         ENDIF
812      ENDIF
813
814      IF( ln_ssr ) THEN
815         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
816         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
817         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
818         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
819      ENDIF
820!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
821!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
822
823#if defined key_diahth
824      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
825      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
826      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
827      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
828#endif
829
830      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
831      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
832
833      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
834      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
835
836      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
837         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn + wi     , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
838      ELSE
839         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn          , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
840      ENDIF
841      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
842      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
843      IF( ln_zdfddm ) THEN
844         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
845      ENDIF
846
847      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
848         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
849         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
850         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
851      ENDIF
852
853      ! 3. Close all files
854      ! ---------------------------------------
855      IF( kt == nitend ) THEN
856         CALL histclo( nid_T )
857         CALL histclo( nid_U )
858         CALL histclo( nid_V )
859         CALL histclo( nid_W )
860      ENDIF
861      !
862      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
863      !
864   END SUBROUTINE dia_wri
865#endif
866
867   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
868      !!---------------------------------------------------------------------
869      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
870      !!       
871      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
872      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
873      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
874      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
875      !!
876      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
877      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
878      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
879      !!----------------------------------------------------------------------
880      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
881      !!
882      INTEGER :: inum
883      !!----------------------------------------------------------------------
884      !
885      IF(lwp) WRITE(numout,*)
886      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
887      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
888      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
889
890#if defined key_si3
891     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
892#else
893     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
894#endif
895
896      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
897      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
898      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
899      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
900      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
901      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
902         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn + wi        )    ! now k-velocity
903      ELSE
904         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn             )    ! now k-velocity
905      ENDIF
906      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
907         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
908         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
909      ENDIF
910      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
911         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
912         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
913      ENDIF
914      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
915      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
916      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
917      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
918      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
919      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
920      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
921         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
922         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
923      END IF
924      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
925         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
926         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
927         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
928      ENDIF
929
930      IF( ln_zdfosm ) THEN
931         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'hbl', hbl*tmask(:,:,1)   )    ! now boundary-layer depth
932         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'hml', hml*tmask(:,:,1)    )    ! now mixed-layer depth
933         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'avt_k', avt_k*wmask       )    ! w-level diffusion
934         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'avm_k', avm_k*wmask       )    ! now w-level viscosity
935         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ghamt', ghamt*wmask       )    ! non-local t forcing
936         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ghams', ghams*wmask       )    ! non-local s forcing
937         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ghamu', ghamu*wmask       )    ! non-local u forcing
938         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ghamv', ghamu*wmask       )    ! non-local v forcing
939         IF( ln_osm_mle ) THEN
940            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'hmle', hmle*tmask(:,:,1)   )    ! now transition-layer depth
941         END IF
942      ENDIF
943 
944#if defined key_si3
945      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
946         CALL ice_wri_state( inum )
947      ENDIF
948#endif
949      !
950      CALL iom_close( inum )
951      !
952   END SUBROUTINE dia_wri_state
953
954   !!======================================================================
955END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.