source: NEMO/branches/UKMO/NEMO_4.0_GO8_coupled_iodef/src/OCE/step.F90 @ 11355

Last change on this file since 11355 was 11355, checked in by dancopsey, 2 years ago

Add lots of print statements printing out values of files throughout the ocean_ice timestep.. New output will be in files crash_stats_419.out and crash_stats_68.out.

File size: 25.3 KB
Line 
1MODULE step
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE step  ***
4   !! Time-stepping   : manager of the ocean, tracer and ice time stepping
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  !  1991-03  (G. Madec)  Original code
7   !!             -   !  1991-11  (G. Madec)
8   !!             -   !  1992-06  (M. Imbard)  add a first output record
9   !!             -   !  1996-04  (G. Madec)  introduction of dynspg
10   !!             -   !  1996-04  (M.A. Foujols)  introduction of passive tracer
11   !!            8.0  !  1997-06  (G. Madec)  new architecture of call
12   !!            8.2  !  1997-06  (G. Madec, M. Imbard, G. Roullet)  free surface
13   !!             -   !  1999-02  (G. Madec, N. Grima)  hpg implicit
14   !!             -   !  2000-07  (J-M Molines, M. Imbard)  Open Bondary Conditions
15   !!   NEMO     1.0  !  2002-06  (G. Madec)  free form, suppress macro-tasking
16   !!             -   !  2004-08  (C. Talandier) New trends organization
17   !!             -   !  2005-01  (C. Ethe) Add the KPP closure scheme
18   !!             -   !  2005-11  (G. Madec)  Reorganisation of tra and dyn calls
19   !!             -   !  2006-01  (L. Debreu, C. Mazauric)  Agrif implementation
20   !!             -   !  2006-07  (S. Masson)  restart using iom
21   !!            3.2  !  2009-02  (G. Madec, R. Benshila)  reintroduicing z*-coordinate
22   !!             -   !  2009-06  (S. Masson, G. Madec)  TKE restart compatible with key_cpl
23   !!            3.3  !  2010-05  (K. Mogensen, A. Weaver, M. Martin, D. Lea) Assimilation interface
24   !!             -   !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase + merge TRC-TRA
25   !!            3.4  !  2011-04  (G. Madec, C. Ethe) Merge of dtatem and dtasal
26   !!            3.6  !  2012-07  (J. Simeon, G. Madec. C. Ethe)  Online coarsening of outputs
27   !!            3.6  !  2014-04  (F. Roquet, G. Madec) New equations of state
28   !!            3.6  !  2014-10  (E. Clementi, P. Oddo) Add Qiao vertical mixing in case of waves
29   !!            3.7  !  2014-10  (G. Madec)  LDF simplication
30   !!             -   !  2014-12  (G. Madec) remove KPP scheme
31   !!             -   !  2015-11  (J. Chanut) free surface simplification (remove filtered free surface)
32   !!            4.0  !  2017-05  (G. Madec)  introduction of the vertical physics manager (zdfphy)
33   !!----------------------------------------------------------------------
34
35   !!----------------------------------------------------------------------
36   !!   stp             : OPA system time-stepping
37   !!----------------------------------------------------------------------
38   USE step_oce         ! time stepping definition modules
39   !
40   USE iom              ! xIOs server
41
42   IMPLICIT NONE
43   PRIVATE
44
45   PUBLIC   stp   ! called by nemogcm.F90
46
47   !!----------------------------------------------------------------------
48   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
49   !! $Id$
50   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
51   !!----------------------------------------------------------------------
52CONTAINS
53
54#if defined key_agrif
55   RECURSIVE SUBROUTINE stp( )
56      INTEGER             ::   kstp   ! ocean time-step index
57#else
58   SUBROUTINE stp( kstp )
59      INTEGER, INTENT(in) ::   kstp   ! ocean time-step index
60#endif
61      !!----------------------------------------------------------------------
62      !!                     ***  ROUTINE stp  ***
63      !!
64      !! ** Purpose : - Time stepping of OPA  (momentum and active tracer eqs.)
65      !!              - Time stepping of SI3 (dynamic and thermodynamic eqs.)
66      !!              - Time stepping of TRC  (passive tracer eqs.)
67      !!
68      !! ** Method  : -1- Update forcings and data
69      !!              -2- Update ocean physics
70      !!              -3- Compute the t and s trends
71      !!              -4- Update t and s
72      !!              -5- Compute the momentum trends
73      !!              -6- Update the horizontal velocity
74      !!              -7- Compute the diagnostics variables (rd,N2, hdiv,w)
75      !!              -8- Outputs and diagnostics
76      !!----------------------------------------------------------------------
77      INTEGER ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indice
78      INTEGER ::   indic        ! error indicator if < 0
79!!gm kcall can be removed, I guess
80      INTEGER ::   kcall        ! optional integer argument (dom_vvl_sf_nxt)
81      !! ---------------------------------------------------------------------
82#if defined key_agrif
83      kstp = nit000 + Agrif_Nb_Step()
84      IF( lk_agrif_debug ) THEN
85         IF( Agrif_Root() .and. lwp)   WRITE(*,*) '---'
86         IF(lwp)   WRITE(*,*) 'Grid Number', Agrif_Fixed(),' time step ', kstp, 'int tstep', Agrif_NbStepint()
87      ENDIF
88      IF( kstp == nit000 + 1 )   lk_agrif_fstep = .FALSE.
89# if defined key_iomput
90      IF( Agrif_Nbstepint() == 0 )   CALL iom_swap( cxios_context )
91# endif
92#endif
93      !
94      IF( ln_timing )   CALL timing_start('stp')
95
96      IF(narea == 419) THEN
97         WRITE(9419,*) 'max sshn step before update IO = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
98         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
99         WRITE(9419,*) 'max emp_b = ',MAXVAL(  ABS( emp_b(:,:) )  )
100         WRITE(9419,*) 'max emp = ',MAXVAL(  ABS( emp(:,:) )  )
101      ENDIF
102
103      !
104      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
105      ! update I/O and calendar
106      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
107                             indic = 0                ! reset to no error condition
108                             
109      IF( kstp == nit000 ) THEN                       ! initialize IOM context (must be done after nemo_init for AGRIF+XIOS+OASIS)
110                             CALL iom_init(      cxios_context          )  ! for model grid (including passible AGRIF zoom)
111         IF( ln_crs      )   CALL iom_init( TRIM(cxios_context)//"_crs" )  ! for coarse grid
112      ENDIF
113      IF( kstp /= nit000 )   CALL day( kstp )         ! Calendar (day was already called at nit000 in day_init)
114                             CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1,      cxios_context          )   ! tell IOM we are at time step kstp
115      IF( ln_crs         )   CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1, TRIM(cxios_context)//"_crs" )   ! tell IOM we are at time step kstp
116
117      IF(narea == 419) THEN
118         WRITE(9419,*) 'max sshn step before external forcing = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
119         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
120         WRITE(9419,*) 'max emp_b = ',MAXVAL(  ABS( emp_b(:,:) )  )
121         WRITE(9419,*) 'max emp = ',MAXVAL(  ABS( emp(:,:) )  )
122      ENDIF
123
124      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
125      ! Update external forcing (tides, open boundaries, and surface boundary condition (including sea-ice)
126      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
127      IF( ln_tide    )   CALL sbc_tide( kstp )                   ! update tide potential
128      IF( ln_apr_dyn )   CALL sbc_apr ( kstp )                   ! atmospheric pressure (NB: call before bdy_dta which needs ssh_ib)
129      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dta ( kstp, time_offset=+1 )   ! update dynamic & tracer data at open boundaries
130                         CALL sbc     ( kstp )                   ! Sea Boundary Condition (including sea-ice)
131
132
133
134
135      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
136      ! Update stochastic parameters and random T/S fluctuations
137      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
138      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_par( kstp )          ! Stochastic parameters
139      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_pts( tsn  )          ! Random T/S fluctuations
140
141      IF(narea == 419) THEN
142         WRITE(9419,*) 'max sshn step before ocean physics = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
143         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
144         WRITE(9419,*) 'max emp_b = ',MAXVAL(  ABS( emp_b(:,:) )  )
145         WRITE(9419,*) 'max emp = ',MAXVAL(  ABS( emp(:,:) )  )
146      ENDIF
147
148      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
149      ! Ocean physics update
150      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
151      !  THERMODYNAMICS
152                         CALL eos_rab( tsb, rab_b )       ! before local thermal/haline expension ratio at T-points
153                         CALL eos_rab( tsn, rab_n )       ! now    local thermal/haline expension ratio at T-points
154                         CALL bn2    ( tsb, rab_b, rn2b ) ! before Brunt-Vaisala frequency
155                         CALL bn2    ( tsn, rab_n, rn2  ) ! now    Brunt-Vaisala frequency
156
157      !  VERTICAL PHYSICS
158                         CALL zdf_phy( kstp )         ! vertical physics update (top/bot drag, avt, avs, avm + MLD)
159
160      !  LATERAL  PHYSICS
161      !
162      IF( l_ldfslp ) THEN                             ! slope of lateral mixing
163                         CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )               ! before in situ density
164
165         IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                               &
166            &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient
167            &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level
168
169         IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                               &
170            &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv, gtui, gtvi,  &  ! Partial steps for top cell (ISF)
171            &                                          rhd, gru , grv , grui, grvi   )  ! of t, s, rd at the first ocean level
172         IF( ln_traldf_triad ) THEN
173                         CALL ldf_slp_triad( kstp )                       ! before slope for triad operator
174         ELSE     
175                         CALL ldf_slp     ( kstp, rhd, rn2b )             ! before slope for standard operator
176         ENDIF
177      ENDIF
178      !                                                                   ! eddy diffusivity coeff.
179      IF( l_ldftra_time .OR. l_ldfeiv_time )   CALL ldf_tra( kstp )       !       and/or eiv coeff.
180      IF( l_ldfdyn_time                    )   CALL ldf_dyn( kstp )       ! eddy viscosity coeff.
181
182      IF(narea == 419) THEN
183         WRITE(9419,*) 'max sshn step before ocean dynamics = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
184         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
185         WRITE(9419,*) 'max emp_b = ',MAXVAL(  ABS( emp_b(:,:) )  )
186         WRITE(9419,*) 'max emp = ',MAXVAL(  ABS( emp(:,:) )  )
187      ENDIF
188
189      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
190      !  Ocean dynamics : hdiv, ssh, e3, u, v, w
191      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
192
193                            CALL ssh_nxt       ( kstp )  ! after ssh (includes call to div_hor)
194      IF(narea == 419) THEN
195         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dom_vvl_sf_nxt = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
196         CALL FLUSH(9419)
197      ENDIF
198
199      IF(narea == 68) THEN
200         WRITE(968,*) 'max ssha step before dom_vvl_sf_nxt = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
201         CALL FLUSH(968)
202      ENDIF
203
204
205      IF( .NOT.ln_linssh )  CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp )  ! after vertical scale factors
206
207      IF(narea == 419) THEN
208         WRITE(9419,*) 'max ssha step before wzv = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
209      ENDIF
210
211                            CALL wzv           ( kstp )  ! now cross-level velocity
212
213      IF(narea == 419) THEN
214         WRITE(9419,*) 'max ssha step before wAimp = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
215      ENDIF
216
217      IF( ln_zad_Aimp )     CALL wAimp         ( kstp )  ! Adaptive-implicit vertical advection partitioning
218                            CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, gdept_n(:,:,:) )  ! now in situ density for hpg computation
219
220      IF(narea == 419) THEN
221         WRITE(9419,*) 'max ssha step before simplification = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
222      ENDIF
223
224                           
225!!jc: fs simplification
226!!jc: lines below are useless if ln_linssh=F. Keep them here (which maintains a bug if ln_linssh=T and ln_zps=T, cf ticket #1636)
227!!                                         but ensures reproductible results
228!!                                         with previous versions using split-explicit free surface         
229            IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav )                               &
230               &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,   &  ! Partial steps: before horizontal gradient
231               &                                          rhd, gru , grv     )  ! of t, s, rd at the last ocean level
232            IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav )                                          &
233               &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv, gtui, gtvi,  &  ! Partial steps for top cell (ISF)
234               &                                          rhd, gru , grv , grui, grvi   )  ! of t, s, rd at the first ocean level
235!!jc: fs simplification
236                           
237                         ua(:,:,:) = 0._wp            ! set dynamics trends to zero
238                         va(:,:,:) = 0._wp
239
240      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. ln_dyninc )   &
241               &         CALL dyn_asm_inc   ( kstp )  ! apply dynamics assimilation increment
242
243      IF(narea == 419) THEN
244         WRITE(9419,*) 'max ssha step before bdy_dyn3d_dmp = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
245      ENDIF
246
247      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dyn3d_dmp ( kstp )  ! bdy damping trends
248#if defined key_agrif
249      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
250               &         CALL Agrif_Sponge_dyn        ! momentum sponge
251#endif
252
253      IF(narea == 419) THEN
254         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dom_adv = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
255      ENDIF
256
257                         CALL dyn_adv       ( kstp )  ! advection (vector or flux form)
258
259      IF(narea == 419) THEN
260         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_vor = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
261      ENDIF
262
263                         CALL dyn_vor       ( kstp )  ! vorticity term including Coriolis
264
265      IF(narea == 419) THEN
266         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_ldft = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
267      ENDIF
268
269                         CALL dyn_ldf       ( kstp )  ! lateral mixing
270
271      IF(narea == 419) THEN
272         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_osm = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
273      ENDIF
274
275      IF( ln_zdfosm  )   CALL dyn_osm       ( kstp )  ! OSMOSIS non-local velocity fluxes
276
277      IF(narea == 419) THEN
278         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_hpg = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
279      ENDIF
280
281                         CALL dyn_hpg       ( kstp )  ! horizontal gradient of Hydrostatic pressure
282
283      IF(narea == 419) THEN
284         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_spg = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
285      ENDIF
286
287                         CALL dyn_spg       ( kstp )  ! surface pressure gradient
288
289
290      IF(narea == 419) THEN
291         WRITE(9419,*) 'max ssha step before div_hor = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
292      ENDIF
293
294                                                      ! With split-explicit free surface, since now transports have been updated and ssha as well
295      IF( ln_dynspg_ts ) THEN                         ! vertical scale factors and vertical velocity need to be updated
296                            CALL div_hor    ( kstp )              ! Horizontal divergence  (2nd call in time-split case)
297         IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp, kcall=2 )  ! after vertical scale factors (update depth average component)
298                            CALL wzv        ( kstp )              ! now cross-level velocity
299         IF( ln_zad_Aimp )  CALL wAimp      ( kstp )  ! Adaptive-implicit vertical advection partitioning
300      ENDIF
301
302      IF(narea == 419) THEN
303         WRITE(9419,*) 'max ssha step before dyn_zdf = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
304      ENDIF
305
306     
307                         CALL dyn_zdf       ( kstp )  ! vertical diffusion
308
309      IF(narea == 419) THEN
310         WRITE(9419,*) 'max sshn step before cool skin = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
311         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
312      ENDIF
313
314      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
315      ! cool skin
316      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
317      IF ( ln_diurnal )  CALL stp_diurnal( kstp )
318
319      IF(narea == 419) THEN
320         WRITE(9419,*) 'max sshn step before diagnostics = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
321         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
322      ENDIF
323     
324      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
325      ! diagnostics and outputs
326      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
327      IF( lk_floats  )   CALL flo_stp ( kstp )        ! drifting Floats
328      IF( ln_diacfl  )   CALL dia_cfl ( kstp )        ! Courant number diagnostics
329      IF( lk_diahth  )   CALL dia_hth ( kstp )        ! Thermocline depth (20 degres isotherm depth)
330      IF( lk_diadct  )   CALL dia_dct ( kstp )        ! Transports
331                         CALL dia_ar5 ( kstp )        ! ar5 diag
332      IF( lk_diaharm )   CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis
333                         CALL dia_prod( kstp )        ! ocean model: product diagnostics
334                         CALL dia_wri ( kstp )        ! ocean model: outputs
335      !
336      IF( ln_crs     )   CALL crs_fld       ( kstp )  ! ocean model: online field coarsening & output
337     
338#if defined key_top
339      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
340      ! Passive Tracer Model
341      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
342                         CALL trc_stp       ( kstp )  ! time-stepping
343#endif
344
345      IF(narea == 419) THEN
346         WRITE(9419,*) 'max sshn step before active tracers = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
347         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
348      ENDIF
349
350      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
351      ! Active tracers                             
352      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
353                         tsa(:,:,:,:) = 0._wp         ! set tracer trends to zero
354
355      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. &
356         & ln_trainc )   CALL tra_asm_inc   ( kstp )  ! apply tracer assimilation increment
357
358      IF(narea == 419) THEN
359         WRITE(9419,*) 'max sshn step before tra_sbc = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
360         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
361      ENDIF
362
363                         CALL tra_sbc       ( kstp )  ! surface boundary condition
364
365      IF(narea == 419) THEN
366         WRITE(9419,*) 'max sshn step after tra_sbc = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
367         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
368      ENDIF
369
370      IF( ln_traqsr  )   CALL tra_qsr       ( kstp )  ! penetrative solar radiation qsr
371      IF( ln_trabbc  )   CALL tra_bbc       ( kstp )  ! bottom heat flux
372      IF( ln_trabbl  )   CALL tra_bbl       ( kstp )  ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme
373      IF( ln_tradmp  )   CALL tra_dmp       ( kstp )  ! internal damping trends
374      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_tra_dmp   ( kstp )  ! bdy damping trends
375#if defined key_agrif
376      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
377               &         CALL Agrif_Sponge_tra        ! tracers sponge
378#endif
379                         CALL tra_adv       ( kstp )  ! horizontal & vertical advection
380      IF( ln_zdfosm  )   CALL tra_osm       ( kstp )  ! OSMOSIS non-local tracer fluxes
381      IF( lrst_oce .AND. ln_zdfosm ) &
382           &             CALL osm_rst( kstp, 'WRITE' )! write OSMOSIS outputs + wn (so must do here) to restarts
383                         CALL tra_ldf       ( kstp )  ! lateral mixing
384
385!!gm : why CALL to dia_ptr has been moved here??? (use trends info?)
386      IF( ln_diaptr  )   CALL dia_ptr                 ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics
387!!gm
388                         CALL tra_zdf       ( kstp )  ! vertical mixing and after tracer fields
389      IF( ln_zdfnpc  )   CALL tra_npc       ( kstp )  ! update after fields by non-penetrative convection
390
391      IF(narea == 419) THEN
392         WRITE(9419,*) 'max sshn step before boundary conditions = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
393         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
394      ENDIF
395
396      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
397      ! Set boundary conditions and Swap
398      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
399!!jc1: For agrif, it would be much better to finalize tracers/momentum here (e.g. bdy conditions) and move the swap
400!!    (and time filtering) after Agrif update. Then restart would be done after and would contain updated fields.
401!!    If so:
402!!    (i) no need to call agrif update at initialization time
403!!    (ii) no need to update "before" fields
404!!
405!!    Apart from creating new tra_swp/dyn_swp routines, this however:
406!!    (i) makes boundary conditions at initialization time computed from updated fields which is not the case between
407!!    two restarts => restartability issue. One can circumvent this, maybe, by assuming "interface separation",
408!!    e.g. a shift of the feedback interface inside child domain.
409!!    (ii) requires that all restart outputs of updated variables by agrif (e.g. passive tracers/tke/barotropic arrays) are done at the same
410!!    place.
411!!
412!!jc2: dynnxt must be the latest call. e3t_b are indeed updated in that routine
413                         CALL tra_nxt       ( kstp )  ! finalize (bcs) tracer fields at next time step and swap
414
415      IF(narea == 419) THEN
416         WRITE(9419,*) 'max sshn step before dyn_nxt = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
417         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
418      ENDIF
419
420                         CALL dyn_nxt       ( kstp )  ! finalize (bcs) velocities at next time step and swap (always called after tra_nxt)
421
422      IF(narea == 419) THEN
423         WRITE(9419,*) 'max sshn step before ssh_swp = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
424         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
425      ENDIF
426
427                         CALL ssh_swp       ( kstp )  ! swap of sea surface height
428
429      IF(narea == 419) THEN
430         WRITE(9419,*) 'max sshn step before dom_vvl_sf_swp = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
431         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
432      ENDIF
433
434      IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_swp( kstp )  ! swap of vertical scale factors
435      !
436
437      IF(narea == 419) THEN
438         WRITE(9419,*) 'max sshn step before dia_hsb = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
439         WRITE(9419,*) 'max ssha = ',MAXVAL(  ABS( ssha(:,:) )  )
440      ENDIF
441
442      IF( ln_diahsb  )   CALL dia_hsb       ( kstp )  ! - ML - global conservation diagnostics
443
444!!gm : This does not only concern the dynamics ==>>> add a new title
445!!gm2: why ouput restart before AGRIF update?
446!!
447!!jc: That would be better, but see comment above
448!!
449      IF( lrst_oce   )   CALL rst_write    ( kstp )   ! write output ocean restart file
450      IF( ln_sto_eos )   CALL sto_rst_write( kstp )   ! write restart file for stochastic parameters
451
452      IF(narea == 419) THEN
453         WRITE(9419,*) 'max sshn step before agrif = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
454      ENDIF
455
456#if defined key_agrif
457      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
458      ! AGRIF
459      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
460                         CALL Agrif_Integrate_ChildGrids( stp )  ! allows to finish all the Child Grids before updating
461
462                         IF( Agrif_NbStepint() == 0 ) CALL Agrif_update_all( ) ! Update all components
463#endif
464      IF( ln_diaobs  )   CALL dia_obs      ( kstp )      ! obs-minus-model (assimilation) diagnostics (call after dynamics update)
465
466      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
467      ! Control
468      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
469
470      IF(narea == 419) THEN
471         WRITE(9419,*) 'max sshn step before stp_ctl = ',MAXVAL(  ABS( sshn(:,:) )  )
472      ENDIF
473
474                         CALL stp_ctl      ( kstp, indic )
475                         
476      IF( kstp == nit000 ) THEN                          ! 1st time step only
477                                        CALL iom_close( numror )   ! close input  ocean restart file
478         IF(lwm)                        CALL FLUSH    ( numond )   ! flush output namelist oce
479         IF(lwm .AND. numoni /= -1 )    CALL FLUSH    ( numoni )   ! flush output namelist ice (if exist)
480      ENDIF
481
482      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
483      ! Coupled mode
484      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
485!!gm why lk_oasis and not lk_cpl ????
486      IF( lk_oasis   )   CALL sbc_cpl_snd( kstp )     ! coupled mode : field exchanges
487      !
488#if defined key_iomput
489      IF( kstp == nitend .OR. indic < 0 ) THEN
490                      CALL iom_context_finalize(      cxios_context          ) ! needed for XIOS+AGRIF
491                      IF(lrxios) CALL iom_context_finalize(      crxios_context          )
492         IF( ln_crs ) CALL iom_context_finalize( trim(cxios_context)//"_crs" ) !
493      ENDIF
494#endif
495      !
496      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('stp')
497      !
498   END SUBROUTINE stp
499   
500   !!======================================================================
501END MODULE step
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.