source: NEMO/releases/r4.0/r4.0-HEAD/src/OCE/DIA/diawri.F90 @ 13085

Last change on this file since 13085 was 13085, checked in by davestorkey, 4 months ago

r4.0-HEAD : fix for ticket #2425.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 49.2 KB
Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   !
46   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
47   USE in_out_manager ! I/O manager
48   USE dia25h         ! 25h Mean output
49   USE iom            !
50   USE ioipsl         !
51
52#if defined key_si3
53   USE ice 
54   USE icewri 
55#endif
56   USE lib_mpp         ! MPP library
57   USE timing          ! preformance summary
58   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
59   USE cool_skin       ! Cool skin
60
61   IMPLICIT NONE
62   PRIVATE
63
64   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
65   PUBLIC   dia_wri_state
66   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
67
68   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
69   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
70   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
71   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
72   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
73   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
74   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
75   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
77
78   !! * Substitutions
79#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
80   !!----------------------------------------------------------------------
81   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
82   !! $Id$
83   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
84   !!----------------------------------------------------------------------
85CONTAINS
86
87#if defined key_iomput
88   !!----------------------------------------------------------------------
89   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
90   !!----------------------------------------------------------------------
91   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
92      !
93      dia_wri_alloc = 0
94      !
95   END FUNCTION dia_wri_alloc
96
97   
98   SUBROUTINE dia_wri( kt )
99      !!---------------------------------------------------------------------
100      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
101      !!                   
102      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
103      !!      NETCDF format is used by default
104      !!
105      !! ** Method  :  use iom_put
106      !!----------------------------------------------------------------------
107      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
108      !!
109      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
110      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
111      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
112      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
113      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
115      !!----------------------------------------------------------------------
116      !
117      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
118      !
119      ! Output the initial state and forcings
120      IF( ninist == 1 ) THEN                       
121         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
122         ninist = 0
123      ENDIF
124
125      ! Output of initial vertical scale factor
126      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
127      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
128      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
129      !
130      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
131      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
132      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
133      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
134      IF( iom_use("e3tdef") )   &
135         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
136
137      IF( ll_wd ) THEN
138         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
139      ELSE
140         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
141      ENDIF
142
143      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
144         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
145     
146      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
147      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
148      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
149         DO jj = 1, jpj
150            DO ji = 1, jpi
151               ikbot = mbkt(ji,jj)
152               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
153            END DO
154         END DO
155         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
156      ENDIF
157     
158      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
159      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
160      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
161         DO jj = 1, jpj
162            DO ji = 1, jpi
163               ikbot = mbkt(ji,jj)
164               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
165            END DO
166         END DO
167         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
168      ENDIF
169
170      CALL iom_put( "rhop", rhop(:,:,:) )          ! 3D potential density (sigma0)
171
172      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
173         zztmp = rau0 * 0.25
174         z2d(:,:) = 0._wp
175         DO jj = 2, jpjm1
176            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
177               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
178                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
180                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
181               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
182               !
183            END DO
184         END DO
185         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
186         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
187      ENDIF
188         
189      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
190      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
191      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
192         DO jj = 1, jpj
193            DO ji = 1, jpi
194               ikbot = mbku(ji,jj)
195               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
196            END DO
197         END DO
198         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
199      ENDIF
200     
201      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
202      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
203      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
204         DO jj = 1, jpj
205            DO ji = 1, jpi
206               ikbot = mbkv(ji,jj)
207               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
208            END DO
209         END DO
210         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
211      ENDIF
212
213      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn + wi               ! Recombine explicit and implicit parts of vertical velocity for diagnostic output
214      !
215      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
216      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
217         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
218         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
219         DO jk = 1, jpk
220            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
221         END DO
222         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
223         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
224      ENDIF
225      !
226      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn - wi               ! Remove implicit part of vertical velocity that was added for diagnostic output
227
228      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
229      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
230      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
231
232      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
233      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
234
235      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
236         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
237            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
238               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
239               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
240               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
241               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
242                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
243            END DO
244         END DO
245         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
246         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
247         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
248         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
249      ENDIF
250         
251      ! heat and salt contents
252      IF( iom_use("heatc") ) THEN
253         z2d(:,:)  = 0._wp 
254         DO jk = 1, jpkm1
255            DO jj = 1, jpj
256               DO ji = 1, jpi
257                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
258               END DO
259            END DO
260         END DO
261         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
262      ENDIF
263
264      IF( iom_use("saltc") ) THEN
265         z2d(:,:)  = 0._wp 
266         DO jk = 1, jpkm1
267            DO jj = 1, jpj
268               DO ji = 1, jpi
269                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
270               END DO
271            END DO
272         END DO
273         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
274      ENDIF
275      !
276      IF ( iom_use("eken") ) THEN
277         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
278         DO jk = 1, jpkm1
279            DO jj = 2, jpjm1
280               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
281                  zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk)
282                  z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  un(ji-1,jj,jk)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)   &
283                     &                     + un(ji  ,jj,jk)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)   &
284                     &                     + vn(ji,jj-1,jk)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)   &
285                     &                     + vn(ji,jj  ,jk)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)   )
286               END DO
287            END DO
288         END DO
289         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
290         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
291      ENDIF
292      !
293      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
294      !
295      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
296         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
297         z2d(:,:) = 0.e0
298         DO jk = 1, jpkm1
299            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
300            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
301         END DO
302         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
303         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
304      ENDIF
305     
306      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
307         z2d(:,:) = 0._wp 
308         DO jk = 1, jpkm1
309            DO jj = 2, jpjm1
310               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
311                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
312               END DO
313            END DO
314         END DO
315         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
316         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
317      ENDIF
318
319      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
320         z2d(:,:) = 0.e0 
321         DO jk = 1, jpkm1
322            DO jj = 2, jpjm1
323               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
324                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
325               END DO
326            END DO
327         END DO
328         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
329         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
330      ENDIF
331
332     
333      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
334         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
335         DO jk = 1, jpkm1
336            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
337         END DO
338         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
339      ENDIF
340     
341      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
342         z2d(:,:) = 0.e0 
343         DO jk = 1, jpkm1
344            DO jj = 2, jpjm1
345               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
346                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
347               END DO
348            END DO
349         END DO
350         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
351         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
352      ENDIF
353
354      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
355         z2d(:,:) = 0._wp 
356         DO jk = 1, jpkm1
357            DO jj = 2, jpjm1
358               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
359                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
360               END DO
361            END DO
362         END DO
363         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
364         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
365      ENDIF
366
367      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
368         z2d(:,:) = 0._wp
369         DO jk = 1, jpkm1
370            DO jj = 2, jpjm1
371               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
372                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
373               END DO
374            END DO
375         END DO
376         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
377         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
378      ENDIF
379      IF( iom_use("somint") ) THEN
380         z2d(:,:)=0._wp
381         DO jk = 1, jpkm1
382            DO jj = 2, jpjm1
383               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
384                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
385               END DO
386            END DO
387         END DO
388         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
389         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
390      ENDIF
391
392      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
393      !
394         
395      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
396
397      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
398      !
399   END SUBROUTINE dia_wri
400
401#else
402   !!----------------------------------------------------------------------
403   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
404   !!----------------------------------------------------------------------
405
406   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
407      !!----------------------------------------------------------------------
408      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
409      !!----------------------------------------------------------------------
410      IF( nn_write == -1 ) THEN
411         dia_wri_alloc = 0
412      ELSE   
413         ierr = 0
414         ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
415            &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
416            &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
417         !
418         dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
419         CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
420         !
421      ENDIF
422      !
423   END FUNCTION dia_wri_alloc
424
425   
426   SUBROUTINE dia_wri( kt )
427      !!---------------------------------------------------------------------
428      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
429      !!                   
430      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
431      !!      NETCDF format is used by default
432      !!
433      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
434      !!      define all the NETCDF files and fields
435      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
436      !!      Each nn_write time step, output the instantaneous or mean fields
437      !!----------------------------------------------------------------------
438      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
439      !
440      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
441      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
442      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
443      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
444      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
445      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
446      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
447      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
448      !
449      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
450      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
451      !!----------------------------------------------------------------------
452      !
453      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
454         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
455         ninist = 0
456      ENDIF
457      !
458      IF( nn_write == -1 )   RETURN   ! we will never do any output
459      !
460      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
461      !
462      ! 0. Initialisation
463      ! -----------------
464
465      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
466      ll_print = ll_print .AND. lwp
467
468      ! Define frequency of output and means
469      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
470#if defined key_diainstant
471      zsto = nn_write * rdt
472      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
473#else
474      zsto=rdt
475      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
476#endif
477      zout = nn_write * rdt
478      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
479
480      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
481      iimi = 1      ;      iima = jpi
482      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
483      ipk = jpk
484
485      ! define time axis
486      it = kt
487      itmod = kt - nit000 + 1
488
489
490      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
491      ! -----------------------------------------------------------------
492
493      IF( kt == nit000 ) THEN
494
495         ! Define the NETCDF files (one per grid)
496
497         ! Compute julian date from starting date of the run
498         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
499         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
500         IF(lwp)WRITE(numout,*)
501         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
502            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
503         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
504                                 ' limit storage in depth = ', ipk
505
506         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
507         IF(lwp) THEN
508            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write,' ' )
509            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
510            WRITE(inum,*) clhstnam
511            CLOSE(inum)
512         ENDIF
513
514         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
515
516         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_T' )
517         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
518         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
519            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
520            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
521         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
522            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
523         !                                                            ! Index of ocean points
524         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
525         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
526         !
527         IF( ln_icebergs ) THEN
528            !
529            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
530            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
531            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
532            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
533            IF( ierror /= 0 ) THEN
534               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
535               RETURN
536            ENDIF
537            !
538            !! iceberg vertical coordinate is class number
539            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
540               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
541            !
542            !! each class just needs the surface index pattern
543            ndim_bT = 3
544            DO jn = 1,nclasses
545               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
546            ENDDO
547            !
548         ENDIF
549
550         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
551
552         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_U' )
553         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
554         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
555            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
556            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
557         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
558            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
559         !                                                            ! Index of ocean points
560         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
561         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
562
563         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
564
565         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_V' )                   ! filename
566         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
567         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
568            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
569            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
570         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
571            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
572         !                                                            ! Index of ocean points
573         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
574         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
575
576         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
577
578         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_W' )                   ! filename
579         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
580         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
581            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
582            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
583         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
584            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
585
586
587         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
588
589         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
590         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
591            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
592         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
593            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
594         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
595            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
596            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
597            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
598            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
599            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
600            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
601         ENDIF
602         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
603         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
604            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
605         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
606            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
607         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
608            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
609         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
610            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
611         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
612            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
613         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
614            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
615         IF(  ln_linssh  ) THEN
616            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
617            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
618            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
619            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
620            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
621            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
622         ENDIF
623         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
624            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
625         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
626            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
627         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
628            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
629         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
630            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
631         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
632            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
633         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
634            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
635!
636         IF( ln_icebergs ) THEN
637            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
638               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
639            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
640               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
641            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
642               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
643            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
644               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
645            IF( ln_bergdia ) THEN
646               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
647                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
648               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
649                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
650               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
651                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
652               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
653                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
654               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
655                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
656               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
657                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
658               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
659                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
660               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
661                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
662               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
663                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
664               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
665                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
666            ENDIF
667         ENDIF
668
669         IF( ln_ssr ) THEN
670            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
671               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
672            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
673               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
674            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
675               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
676         ENDIF
677       
678         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
679!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
680!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
681#if defined key_diahth
682         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
683            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
684         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
685            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
686         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
687            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
688         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
689            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
690#endif
691
692         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
693
694         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
695         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
696            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
697         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
698            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
699               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
700         ENDIF
701         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
702         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
703            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
704
705         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
706
707         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
708         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
709            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
710         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
711            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
712               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
713         ENDIF
714         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
715         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
716            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
717
718         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
719
720         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
721         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
722            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
723         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
724            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
725         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
726            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
727
728         IF( ln_zdfddm ) THEN
729            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
730               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
731         ENDIF
732         
733         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
734            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
735               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
736         ENDIF
737         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
738         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
739
740         IF(lwp) WRITE(numout,*)
741         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
742         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
743
744      ENDIF
745
746      ! 2. Start writing data
747      ! ---------------------
748
749      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
750      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
751      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
752
753      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nn_write ) == 0 ) THEN
754         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
755         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
756      ENDIF
757
758      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
759         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
760         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
761         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
762         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
763      ELSE
764         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
765         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
766         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
767         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
768      ENDIF
769      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
770         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
771         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
772         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
773         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
774      ENDIF
775      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
776      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
777      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
778      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
779                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
780                                                                                  ! in linear free surface case)
781      IF( ln_linssh ) THEN
782         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
783         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
784         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
785         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
786      ENDIF
787      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
788      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
789      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
790      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
791      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
792      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
793!
794      IF( ln_icebergs ) THEN
795         !
796         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
797         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
798         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
799         !
800         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
801         !
802         IF( ln_bergdia ) THEN
803            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
804            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
805            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
806            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
807            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
808            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
809            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
810            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
811            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
812            !
813            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
814         ENDIF
815      ENDIF
816
817      IF( ln_ssr ) THEN
818         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
819         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
820         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
821         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
822      ENDIF
823!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
824!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
825
826#if defined key_diahth
827      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
828      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
829      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
830      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
831#endif
832
833      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
834      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
835
836      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
837      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
838
839      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
840         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn + wi     , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
841      ELSE
842         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn          , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
843      ENDIF
844      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
845      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
846      IF( ln_zdfddm ) THEN
847         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
848      ENDIF
849
850      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
851         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
852         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
853         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
854      ENDIF
855
856      ! 3. Close all files
857      ! ---------------------------------------
858      IF( kt == nitend ) THEN
859         CALL histclo( nid_T )
860         CALL histclo( nid_U )
861         CALL histclo( nid_V )
862         CALL histclo( nid_W )
863      ENDIF
864      !
865      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
866      !
867   END SUBROUTINE dia_wri
868#endif
869
870   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
871      !!---------------------------------------------------------------------
872      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
873      !!       
874      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
875      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
876      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
877      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
878      !!
879      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
880      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
881      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
882      !!----------------------------------------------------------------------
883      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
884      !!
885      INTEGER :: inum
886      !!----------------------------------------------------------------------
887      !
888      IF(lwp) WRITE(numout,*)
889      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
890      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
891      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
892
893#if defined key_si3
894     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
895#else
896     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
897#endif
898
899      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
900      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
901      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
902      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
903      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
904      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
905         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn + wi        )    ! now k-velocity
906      ELSE
907         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn             )    ! now k-velocity
908      ENDIF
909      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
910         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
911         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
912      ENDIF
913      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
914         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
915         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
916      ENDIF
917      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
918      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
919      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
920      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
921      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
922      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
923      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
924         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
925         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
926      END IF
927      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
928         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
929         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
930         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
931      ENDIF
932 
933#if defined key_si3
934      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
935         CALL ice_wri_state( inum )
936      ENDIF
937#endif
938      !
939      CALL iom_close( inum )
940      !
941   END SUBROUTINE dia_wri_state
942
943   !!======================================================================
944END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.