source: NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main/NEMO_manual.bib @ 11116

Last change on this file since 11116 was 11116, checked in by nicolasmartin, 2 years ago

Removing of unnecessary entries

File size: 113.4 KB
Line 
1
2@Article{         adcroft.campin_04,
3  author        = {A. Adcroft and J.-M. Campin},
4  title         = {Rescaled height coordinates for accurate representation of
5                  free-surface flows in ocean circulation models},
6  journal       = {Ocean Modelling},
7  publisher     = {Elsevier BV},
8  year          = {2004},
9  month         = {jan},
10  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
11  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
12  pages         = {269--284},
13  volume        = {7},
14  number        = {3-4},
15  issn          = {1463-5003}
16}
17
18@Article{         arakawa.hsu_90,
19  author        = {A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu},
20  title         = {Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
21                  Schemes for the Shallow Water Equations},
22  journal       = {Monthly Weather Review},
23  publisher     = {American Meteorological Society},
24  year          = {1990},
25  month         = {oct},
26  doi           = {10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
27  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
28  pages         = {1960--1969},
29  volume        = {118},
30  number        = {10},
31  issn          = {1520-0493}
32}
33
34@Article{         arakawa.lamb_81,
35  author        = {A. Arakawa and V. R. Lamb},
36  title         = {A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
37                  Shallow Water Equations},
38  journal       = {Monthly Weather Review},
39  publisher     = {American Meteorological Society},
40  year          = {1981},
41  month         = {jan},
42  doi           = {10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
43  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
44  pages         = {18--36},
45  volume        = {109},
46  number        = {1},
47  issn          = {1520-0493}
48}
49
50@Article{         arakawa_66,
51  author        = {A. Arakawa},
52  title         = {Computational design for long-term numerical integration
53                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
54                  incompressible flow. Part {I}},
55  journal       = {Journal of Computational Physics},
56  publisher     = {Elsevier BV},
57  year          = {1966},
58  month         = {Aug},
59  doi           = {10.1016/0021-9991(66)90015-5},
60  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(66)90015-5},
61  pages         = {119--143},
62  volume        = {1},
63  number        = {1},
64  issn          = {0021-9991}
65}
66
67@Article{         arbic.garner.ea_04,
68  author        = {B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
69                  Simmons},
70  title         = {The accuracy of surface elevations in forward global
71                  barotropic and baroclinic tide models},
72  journal       = {Deep Sea Research},
73  publisher     = {Elsevier BV},
74  year          = {2004},
75  month         = {dec},
76  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
77  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
78  pages         = {3069--3101},
79  volume        = {51},
80  number        = {25-26},
81  issn          = {0967-0645}
82}
83
84@Article{         artale.iudicone.ea_02,
85  author        = {V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
86                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio},
87  title         = {Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
88                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
89                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
90                  thermohaline circulation},
91  journal       = {Journal of Geophysical Research},
92  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
93  year          = {2002},
94  doi           = {10.1029/2000jc000452},
95  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000JC000452},
96  pages         = {2901--2924},
97  volume        = {107},
98  number        = {C8},
99  issn          = {0148-0227}
100}
101
102@Article{         axell_02,
103  author        = {L. B. Axell},
104  title         = {Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
105                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea},
106  journal       = {Journal of Geophysical Research},
107  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
108  year          = {2002},
109  doi           = {10.1029/2001jc000922},
110  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001JC000922},
111  volume        = {107},
112  number        = {C11},
113  issn          = {0148-0227}
114}
115
116@Article{         barnier.madec.ea_06,
117  author        = {B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
118                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. Le Sommer and A. Beckmann and
119                  A. Biastoch and C. B\"{o}ning and J. Dengg and C. Derval
120                  and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C. Talandier and
121                  S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and B. De Cuevas},
122  title         = {Impact of partial steps and momentum advection schemes in
123                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
124                  resolution},
125  journal       = {Ocean Dynamics},
126  publisher     = {Springer Nature},
127  year          = {2006},
128  month         = {jun},
129  doi           = {10.1007/s10236-006-0082-1},
130  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-006-0082-1},
131  pages         = {543--567},
132  volume        = {56},
133  number        = {5-6},
134  issn          = {1616-7228}
135}
136
137@Article{         beckmann.doscher_97,
138  author        = {A. Beckmann and R. D\"{o}scher},
139  title         = {A method for improved representation of dense water
140                  spreading over topography in geopotential-coordinate
141                  models},
142  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
143  publisher     = {American Meteorological Society},
144  year          = {1997},
145  month         = {apr},
146  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
147  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
148  pages         = {581--591},
149  volume        = {27},
150  number        = {4},
151  issn          = {1520-0485}
152}
153
154@Article{         beckmann.goosse_03,
155  author        = {A. Beckmann and H. Goosse},
156  title         = {A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
157                  climate models},
158  journal       = {Ocean Modelling},
159  publisher     = {Elsevier BV},
160  year          = {2003},
161  month         = {jan},
162  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
163  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
164  pages         = {157--170},
165  volume        = {5},
166  number        = {2},
167  issn          = {1463-5003}
168}
169
170@Article{         beckmann.haidvogel_93,
171  author        = {A. Beckmann and D. B. Haidvogel},
172  title         = {Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
173                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model
174                  Accuracy},
175  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
176  publisher     = {American Meteorological Society},
177  year          = {1993},
178  month         = {aug},
179  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
180  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
181  pages         = {1736--1753},
182  volume        = {23},
183  number        = {8},
184  issn          = {1520-0485}
185}
186
187@Article{         bernie.guilyardi.ea_07,
188  author        = {D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
189                  Slingo and S. J. Woolnough},
190  title         = {Impact of resolving the diurnal cycle in an
191                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced
192                  {OGCM}},
193  journal       = {Climate Dynamics},
194  publisher     = {Springer Nature},
195  year          = {2007},
196  month         = {may},
197  doi           = {10.1007/s00382-007-0249-6},
198  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-007-0249-6},
199  pages         = {575--590},
200  volume        = {29},
201  number        = {6},
202  issn          = {1432-0894}
203}
204
205@Article{         bernie.woolnough.ea_05,
206  author        = {D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
207                  Guilyardi},
208  title         = {Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
209                  ocean mixed layer},
210  journal       = {Journal of Climate},
211  publisher     = {American Meteorological Society},
212  year          = {2005},
213  month         = {apr},
214  doi           = {10.1175/jcli3319.1},
215  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3319.1},
216  pages         = {1190--1202},
217  volume        = {18},
218  number        = {8},
219  issn          = {1520-0442}
220}
221
222@Article{         blanke.delecluse_93,
223  author        = {B. Blanke and P. Del\'{e}cluse},
224  title         = {Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
225                  General Circulation Model with two different mixed-layer
226                  physics},
227  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
228  publisher     = {American Meteorological Society},
229  year          = {1993},
230  month         = {jul},
231  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
232  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
233  pages         = {1363--1388},
234  volume        = {23},
235  number        = {7},
236  issn          = {1520-0485}
237}
238
239@Article{         blanke.raynaud_97,
240  author        = {B. Blanke and S. Raynaud},
241  title         = {Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
242                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results},
243  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
244  publisher     = {American Meteorological Society},
245  year          = {1997},
246  month         = {jun},
247  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
248  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
249  pages         = {1038--1053},
250  volume        = {27},
251  number        = {6},
252  issn          = {1520-0485}
253}
254
255@Article{         bloom.takacs.ea_96,
256  author        = {S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
257                  Ledvina},
258  title         = {Data assimilation using incremental analysis updates},
259  journal       = {Monthly Weather Review},
260  publisher     = {American Meteorological Society},
261  year          = {1996},
262  month         = {jun},
263  doi           = {10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
264  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
265  pages         = {1256--1271},
266  volume        = {124},
267  number        = {6},
268  issn          = {1520-0493}
269}
270
271@Article{         bougeault.lacarrere_89,
272  author        = {P. Bougeault and P. Lacarrere},
273  title         = {Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
274                  Mesobeta--Scale Model},
275  journal       = {Monthly Weather Review},
276  publisher     = {American Meteorological Society},
277  year          = {1989},
278  month         = {aug},
279  doi           = {10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
280  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
281  pages         = {1872--1890},
282  volume        = {117},
283  number        = {8},
284  issn          = {1520-0493}
285}
286
287@Article{         bouillon.maqueda.ea_09,
288  author        = {S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
289                  Fichefet},
290  title         = {An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
291                  Arakawa {B} and {C} grids},
292  journal       = {Ocean Modelling},
293  publisher     = {Elsevier BV},
294  year          = {2009},
295  month         = {jan},
296  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
297  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
298  pages         = {174--184},
299  volume        = {27},
300  number        = {3-4},
301  issn          = {1463-5003}
302}
303
304@Article{         boyer-montegut.madec.ea_04,
305  author        = {C. de Boyer Mont\'{e}gut and G. Madec and A. S. Fischer
306                  and A. Lazar and D. Iudicone},
307  title         = {Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
308                  profile data and a profile-based climatology},
309  journal       = {Journal of Geophysical Research},
310  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
311  year          = {2004},
312  doi           = {10.1029/2004jc002378},
313  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2004JC002378},
314  pages         = {C12003},
315  volume        = {109},
316  number        = {C12},
317  issn          = {0148-0227}
318}
319
320@Article{         brankart.candille.ea_15,
321  author        = {J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
322                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
323                  J. Verron},
324  title         = {A generic approach to explicit simulation of uncertainty
325                  in the {NEMO} ocean model},
326  journal       = {Geoscientific Model Development},
327  publisher     = {Copernicus GmbH},
328  year          = {2015},
329  month         = {may},
330  doi           = {10.5194/gmd-8-1285-2015},
331  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1285-2015},
332  pages         = {1285--1297},
333  volume        = {8},
334  number        = {5},
335  issn          = {1991-9603}
336}
337
338@Article{         brankart_13,
339  author        = {J.-M. Brankart},
340  title         = {Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
341                  upon low resolution global ocean modelling},
342  journal       = {Ocean Modelling},
343  publisher     = {Elsevier BV},
344  year          = {2013},
345  month         = {jun},
346  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
347  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
348  pages         = {64--76},
349  volume        = {66},
350  issn          = {1463-5003}
351}
352
353@Article{         breivik.bidlot.ea_16,
354  author        = {{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen},
355  title         = {A Stokes drift approximation based on the Phillips
356                  spectrum},
357  journal       = {Ocean Modelling},
358  publisher     = {Elsevier BV},
359  year          = {2016},
360  month         = {apr},
361  doi           = {10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
362  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
363  pages         = {49--56},
364  volume        = {100},
365  issn          = {1463-5003}
366}
367
368@Article{         breivik.janssen.ea_14,
369  author        = {{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot},
370  title         = {Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water},
371  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
372  publisher     = {American Meteorological Society},
373  year          = {2014},
374  month         = {sep},
375  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0020.1},
376  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0020.1},
377  pages         = {2433--2445},
378  volume        = {44},
379  number        = {9},
380  issn          = {1520-0485}
381}
382
383@Article{         brodeau.barnier.ea_10,
384  author        = {L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
385                  Penduff and S. Gulev},
386  title         = {An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
387                  circulation models},
388  journal       = {Ocean Modelling},
389  publisher     = {Elsevier BV},
390  year          = {2010},
391  month         = {jan},
392  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
393  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
394  pages         = {88--104},
395  volume        = {31},
396  number        = {3-4},
397  issn          = {1463-5003}
398}
399
400@Article{         brown.campana_78,
401  author        = {J. A. Brown and K. A. Campana},
402  title         = {An economical time-differencing system for numerical
403                  weather prediction},
404  journal       = {Monthly Weather Review},
405  publisher     = {American Meteorological Society},
406  year          = {1978},
407  month         = {aug},
408  doi           = {10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
409  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
410  pages         = {1125--1136},
411  volume        = {106},
412  number        = {8},
413  issn          = {1520-0493}
414}
415
416@Article{         bryan_97,
417  author        = {K. Bryan},
418  title         = {A numerical method for the study of the circulation of the
419                  world ocean},
420  journal       = {Journal of Computational Physics},
421  publisher     = {Elsevier BV},
422  year          = {1997},
423  month         = {Aug},
424  doi           = {10.1006/jcph.1997.5699},
425  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1997.5699},
426  volume        = {135},
427  number        = {2},
428  pages         = {154--169},
429  issn          = {0021-9991}
430}
431
432@Article{         burchard_02,
433  author        = {H. Burchard},
434  title         = {Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
435                  buoyancy production},
436  journal       = {Ocean Modelling},
437  publisher     = {Elsevier BV},
438  year          = {2002},
439  month         = {jun},
440  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00009-4},
441  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/S1463-5003(02)00009-4},
442  pages         = {347--361},
443  volume        = {4},
444  number        = {3-4},
445  issn          = {1463-5003}
446}
447
448@Article{         campin.adcroft.ea_04,
449  author        = {J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall},
450  title         = {Conservation of properties in a free-surface model},
451  journal       = {Ocean Modelling},
452  publisher     = {Elsevier BV},
453  year          = {2004},
454  month         = {jan},
455  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
456  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
457  pages         = {221--244},
458  volume        = {6},
459  number        = {3-4},
460  issn          = {1463-5003}
461}
462
463@Article{         campin.goosse_99,
464  author        = {J.-M. Campin and H. Goosse},
465  title         = {Parameterization of density-driven downsloping flow for a
466                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate},
467  journal       = {Tellus A},
468  publisher     = {Informa UK Limited},
469  year          = {1999},
470  month         = {may},
471  doi           = {10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
472  url           = {http://dx.doi.org/10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
473  pages         = {412--430},
474  volume        = {51},
475  number        = {3},
476  issn          = {1600-0870}
477}
478
479@Article{         campin.marshall.ea_08,
480  author        = {J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira},
481  title         = {Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
482                  coordinate z^{∗}},
483  journal       = {Ocean Modelling},
484  publisher     = {Elsevier BV},
485  year          = {2008},
486  month         = {jan},
487  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
488  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
489  pages         = {1--14},
490  volume        = {24},
491  number        = {1-2},
492  issn          = {1463-5003}
493}
494
495@Article{         canuto.howard.ea_01,
496  author        = {V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
497                  Dubovikov},
498  title         = {Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
499                  model-momentum and heat vertical diffusivities},
500  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
501  publisher     = {American Meteorological Society},
502  year          = {2001},
503  month         = {jun},
504  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
505  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
506  pages         = {1413--1426},
507  volume        = {31},
508  number        = {6},
509  issn          = {1520-0485}
510}
511
512@Article{         carrere.lyard_03,
513  author        = {L. Carr\`{e}re and F. Lyard},
514  title         = {Modeling the barotropic response of the global ocean to
515                  atmospheric wind and pressure forcing - comparisons with
516                  observations},
517  journal       = {Geophysical Research Letters},
518  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
519  year          = {2003},
520  month         = {mar},
521  doi           = {10.1029/2002gl016473},
522  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL016473},
523  volume        = {30},
524  number        = {6},
525  issn          = {0094-8276}
526}
527
528@TechReport{      chanut_mersea05,
529  author        = {J. Chanut},
530  title         = {Nesting code for {NEMO}},
531  year          = {2005},
532  month         = {may},
533  doi           = {10.5281/zenodo.3243409},
534  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3243409},
535  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
536                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
537  pages         = {25}
538}
539
540@Article{         chassignet.smith.ea_03,
541  author        = {E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
542                  R. Bleck},
543  title         = {North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
544                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
545                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity},
546  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
547  publisher     = {American Meteorological Society},
548  year          = {2003},
549  month         = {dec},
550  doi           = {10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
551  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
552  pages         = {2504--2526},
553  volume        = {33},
554  number        = {12},
555  issn          = {1520-0485}
556}
557
558@Article{         cox_87,
559  author        = {M. D. Cox},
560  title         = {Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model},
561  journal       = {Ocean Modelling},
562  year          = {1987},
563  month         = {jan},
564  url           = {https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model},
565  pages         = {1--9},
566  volume        = {74}
567}
568
569@Article{         craig.banner_94,
570  author        = {P. D. Craig and M. L. Banner},
571  title         = {Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
572                  layer},
573  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
574  publisher     = {American Meteorological Society},
575  year          = {1994},
576  month         = {dec},
577  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
578  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
579  pages         = {2546--2559},
580  volume        = {24},
581  number        = {12},
582  issn          = {1520-0485}
583}
584
585@Article{         craik.leibovich_76,
586  author        = {A. D. D. Craik and S. Leibovich},
587  title         = {A rational model for Langmuir circulations},
588  journal       = {Journal of Fluid Mechanics},
589  publisher     = {Cambridge University Press (CUP)},
590  year          = {1976},
591  month         = {feb},
592  doi           = {10.1017/s0022112076001420},
593  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/s0022112076001420},
594  pages         = {401--426},
595  volume        = {73},
596  number        = {3},
597  issn          = {1469-7645}
598}
599
600@Article{         dalessio.abdella.ea_98,
601  author        = {S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane},
602  title         = {A new second-order turbulence closure scheme for modeling
603                  the oceanic mixed layer},
604  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
605  publisher     = {American Meteorological Society},
606  year          = {1998},
607  month         = {aug},
608  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
609  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
610  pages         = {1624--1641},
611  volume        = {28},
612  number        = {8},
613  issn          = {1520-0485}
614}
615
616@Book{            daley.barker_01,
617  author        = {R. Daley and E. Barker},
618  booktitle     = {{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
619                  Data Assimilation System},
620  publisher     = {Defense Technical Information Center},
621  editor        = {Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division},
622  year          = {2001},
623  month         = {jul},
624  doi           = {10.21236/ada396883},
625  url           = {http://dx.doi.org/10.21236/ada396883},
626  pages         = {163}
627}
628
629@Article{         danabasoglu.ferrari.ea_08,
630  author        = {G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams},
631  title         = {Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
632                  parameterization of near-surface eddy fluxes},
633  journal       = {Journal of Climate},
634  publisher     = {American Meteorological Society},
635  year          = {2008},
636  month         = {mar},
637  doi           = {10.1175/2007jcli1508.1},
638  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2007JCLI1508.1},
639  pages         = {1192--1208},
640  volume        = {21},
641  number        = {6},
642  issn          = {1520-0442}
643}
644
645@Article{         davies_76,
646  author        = {H. C. Davies},
647  title         = {A lateral boundary formulation for multi-level prediction
648                  models},
649  journal       = {Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society},
650  publisher     = {Wiley},
651  year          = {1976},
652  month         = {apr},
653  doi           = {10.1002/qj.49710243210},
654  url           = {http://dx.doi.org/10.1002/qj.49710243210},
655  pages         = {405--418},
656  volume        = {102},
657  number        = {432},
658  issn          = {0035-9009}
659}
660
661@Article{         debreu.vouland.ea_08,
662  author        = {L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo},
663  title         = {{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran},
664  journal       = {Computers \& Geosciences},
665  publisher     = {Elsevier BV},
666  year          = {2008},
667  month         = {jan},
668  doi           = {10.1016/j.cageo.2007.01.009},
669  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2007.01.009},
670  pages         = {8--13},
671  volume        = {34},
672  number        = {1},
673  issn          = {0098-3004}
674}
675
676@InCollection{    delecluse.madec_99,
677  author        = {P. Del\'{e}cluse and G. Madec},
678  title         = {Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
679                  system},
680  booktitle     = {Modeling the Earth's Climate and its Variability},
681  publisher     = {North Holland},
682  editor        = {W. R. Holland and S. Joussaume and F. David},
683  year          = {1999},
684  isbn          = {978-0-444-50338-1},
685  series        = {Les Houches},
686  volume        = {67},
687  pages         = {237--313}
688}
689
690@PhDThesis{       demange_14,
691  author        = {J. Demange},
692  title         = {Advection and gravity waves propagation numerical schemes
693                  for oceanic circulation models},
694  year          = {2014},
695  pages         = {138},
696  url           = {https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf},
697  school        = {Grenoble University, France}
698}
699
700@Article{         dobricic.pinardi.ea_07,
701  author        = {S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
702                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez},
703  title         = {Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
704                  System at the basin scale},
705  journal       = {Ocean Science},
706  publisher     = {Copernicus GmbH},
707  year          = {2007},
708  month         = {mar},
709  doi           = {10.5194/os-3-149-2007},
710  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-149-2007},
711  pages         = {149--157},
712  volume        = {3},
713  number        = {1},
714  issn          = {1812-0792}
715}
716
717@Article{         drijfhout_94,
718  author        = {S. S. Drijfhout},
719  title         = {Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
720                  Model},
721  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
722  publisher     = {American Meteorological Society},
723  year          = {1994},
724  month         = {feb},
725  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
726  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
727  pages         = {353--369},
728  volume        = {24},
729  number        = {2},
730  issn          = {1520-0485}
731}
732
733@Article{         dukowicz.smith_94,
734  author        = {J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
735  title         = {Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
736                  ocean model},
737  journal       = {Journal of Geophysical Research},
738  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
739  year          = {1994},
740  doi           = {10.1029/93jc03455},
741  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc03455},
742  pages         = {7991--8014},
743  volume        = {99},
744  number        = {C4},
745  issn          = {0148-0227}
746}
747
748@Article{         egbert.ray_00,
749  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
750  title         = {Significant dissipation of tidal energy in the deep ocean
751                  inferred from satellite altimeter data},
752  journal       = {Nature},
753  publisher     = {Springer Nature},
754  year          = {2000},
755  month         = {jun},
756  doi           = {10.1038/35015531},
757  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/35015531},
758  pages         = {775--778},
759  volume        = {405},
760  number        = {6788},
761  issn          = {1476-4687}
762}
763
764@Article{         egbert.ray_01,
765  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
766  title         = {Estimates of {M2} tidal energy dissipation from
767                  {TOPEX}/Poseidon altimeter data},
768  journal       = {Journal of Geophysical Research},
769  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
770  year          = {2001},
771  month         = {oct},
772  doi           = {10.1029/2000jc000699},
773  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000699},
774  pages         = {22475--22502},
775  volume        = {106},
776  number        = {C10},
777  issn          = {0148-0227}
778}
779
780@Article{         eiseman.stone_80,
781  author        = {P. R. Eiseman and A. P. Stone},
782  title         = {Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey},
783  journal       = {SIAM Review},
784  publisher     = {Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)},
785  year          = {1980},
786  month         = {jan},
787  doi           = {10.1137/1022002},
788  url           = {http://dx.doi.org/10.1137/1022002},
789  pages         = {12--27},
790  volume        = {22},
791  number        = {1},
792  issn          = {1095-7200}
793}
794
795@Article{         emile-geay.madec_09,
796  author        = {J. Emile-Geay and G. Madec},
797  title         = {Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
798                  circulation},
799  journal       = {Ocean Science},
800  publisher     = {Copernicus GmbH},
801  year          = {2009},
802  month         = {jun},
803  doi           = {10.5194/os-5-203-2009},
804  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-5-203-2009},
805  pages         = {203--217},
806  volume        = {5},
807  number        = {2},
808  issn          = {1812-0792}
809}
810
811@Article{         engedahl_95,
812  author        = {H. Engedahl},
813  title         = {Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
814                  baroclinic ocean model with realistic topography},
815  journal       = {Tellus A},
816  publisher     = {Informa UK Limited},
817  year          = {1995},
818  month         = {jan},
819  doi           = {10.3402/tellusa.v47i3.11523},
820  url           = {http://dx.doi.org/10.3402/tellusa.v47i3.11523},
821  pages         = {365--382},
822  volume        = {47},
823  number        = {3},
824  issn          = {1600-0870}
825}
826
827@PhDThesis{       farge-coulombier_87,
828  author        = {M. Farge Coulombier},
829  title         = {Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
830                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant},
831  year          = {1987},
832  pages         = {353},
833  url           = {http://www.theses.fr/1987PA066365},
834  school        = {Paris VI University, France}
835}
836
837@Article{         farrow.stevens_95,
838  author        = {D. E. Farrow and D. P. Stevens},
839  title         = {A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
840                  General Circulation Models},
841  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
842  publisher     = {American Meteorological Society},
843  year          = {1995},
844  month         = {jul},
845  doi           = {10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
846  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
847  pages         = {1731--1741},
848  volume        = {25},
849  number        = {7},
850  issn          = {1520-0485}
851}
852
853@Article{         flather_94,
854  author        = {R. A. Flather},
855  title         = {A storm surge prediction model for the northern Bay of
856                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
857                  1991},
858  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
859  publisher     = {American Meteorological Society},
860  year          = {1994},
861  month         = {jan},
862  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
863  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
864  pages         = {172--190},
865  volume        = {24},
866  number        = {1},
867  issn          = {1520-0485}
868}
869
870@Book{            fofonoff.millard_83,
871  author        = {N P. Fofonoff and R. C. Millard},
872  booktitle     = {Algorithms for computation of fundamental properties of
873                  seawater},
874  publisher     = {UNESCO},
875  editor        = {UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO},
876  year          = {1983},
877  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en},
878  series        = {Technical Paper in Marine Science},
879  pages         = {53},
880  volume        = {44}
881}
882
883@Article{         galperin.kantha.ea_88,
884  author        = {B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati},
885  title         = {A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
886                  flows},
887  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
888  publisher     = {American Meteorological Society},
889  year          = {1988},
890  month         = {jan},
891  doi           = {10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
892  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
893  pages         = {55--62},
894  volume        = {45},
895  number        = {1},
896  issn          = {1520-0469}
897}
898
899@Article{         gargett_84,
900  author        = {A. E. Gargett},
901  title         = {Vertical eddy diffusivity in the ocean interior},
902  journal       = {Journal of Marine Research},
903  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
904  year          = {1984},
905  month         = {may},
906  doi           = {10.1357/002224084788502756},
907  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502756},
908  pages         = {359--393},
909  volume        = {42},
910  number        = {2},
911  issn          = {1543-9542}
912}
913
914@Article{         gaspar.gregoris.ea_90,
915  author        = {P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre},
916  title         = {A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
917                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
918                  long-term upper ocean study site},
919  journal       = {Journal of Geophysical Research},
920  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
921  year          = {1990},
922  doi           = {10.1029/jc095ic09p16179},
923  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc095ic09p16179},
924  pages         = {16179},
925  volume        = {95},
926  number        = {C9},
927  issn          = {0148-0227}
928}
929
930@Article{         gent.mcwilliams_90,
931  author        = {P. R. Gent and J. C. McWilliams},
932  title         = {Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models},
933  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
934  publisher     = {American Meteorological Society},
935  year          = {1990},
936  month         = {jan},
937  doi           = {10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
938  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
939  pages         = {150--155},
940  volume        = {20},
941  number        = {1},
942  issn          = {1520-0485}
943}
944
945@Article{         gentemann.minnett.ea_09,
946  author        = {C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward},
947  title         = {Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
948                  of upper ocean diurnal warming},
949  journal       = {Journal of Geophysical Research},
950  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
951  year          = {2009},
952  month         = {jul},
953  doi           = {10.1029/2008jc004825},
954  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2008JC004825},
955  pages         = {C07017},
956  volume        = {114},
957  number        = {C7},
958  issn          = {0148-0227}
959}
960
961@Article{         gerdes.koberle_91,
962  author        = {R. Gerdes and C. K\"{o}berle and J. Willebrand},
963  title         = {The influence of numerical advection schemes on the
964                  results of Ocean General Circulation Models},
965  journal       = {Climate Dynamics},
966  publisher     = {Springer Nature},
967  year          = {1991},
968  month         = {jun},
969  doi           = {10.1007/bf00210006},
970  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/BF00210006},
971  pages         = {211--226},
972  volume        = {5},
973  number        = {4},
974  issn          = {1432-0894}
975}
976
977@Article{         gerdes_93,
978  author        = {R. Gerdes},
979  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
980                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
981                  and testing of the model},
982  journal       = {Journal of Geophysical Research},
983  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
984  year          = {1993},
985  doi           = {10.1029/93jc00760},
986  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00760},
987  pages         = {14683},
988  volume        = {98},
989  number        = {C8},
990  issn          = {0148-0227}
991}
992
993@Article{         gerdes_93*1,
994  author        = {R. Gerdes},
995  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
996                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
997                  to an overflow problem},
998  journal       = {Journal of Geophysical Research},
999  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1000  year          = {1993},
1001  doi           = {10.1029/93jc00788},
1002  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00788},
1003  pages         = {14703--14726},
1004  volume        = {98},
1005  number        = {C8},
1006  issn          = {0148-0227}
1007}
1008
1009@TechReport{      gibson_86,
1010  author        = {J. K. Gibson},
1011  title         = {Standards for software development and maintenance},
1012  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
1013  year          = {1986},
1014  month         = {aug},
1015  doi           = {10.21957/gi113q4gn},
1016  url           = {https://www.ecmwf.int/node/9565},
1017  institution   = {ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom},
1018  pages         = {21},
1019  number        = {120}
1020}
1021
1022@Book{            gill_82,
1023  author        = {A. E. Gill},
1024  booktitle     = {Atmosphere-Ocean Dynamics},
1025  publisher     = {Elsevier},
1026  issn          = {0074-6142},
1027  year          = {1982},
1028  month         = {nov},
1029  doi           = {10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1030  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1031  isbn          = {978-0-12-283522-3},
1032  series        = {International Geophysics},
1033  pages         = {662},
1034  volume        = {30}
1035}
1036
1037@Article{         goosse.deleersnijder.ea_99,
1038  author        = {H. Goosse and E. Deleersnijder and T. Fichefet and M. H.
1039                  England},
1040  title         = {Sensitivity of a global coupled ocean-sea ice model to the
1041                  parameterization of vertical mixing},
1042  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1043  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1044  year          = {1999},
1045  month         = {jun},
1046  doi           = {10.1029/1999jc900099},
1047  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999jc900099},
1048  pages         = {13681--13695},
1049  volume        = {104},
1050  number        = {C6},
1051  issn          = {0148-0227}
1052}
1053
1054@Article{         graham.mcdougall_13,
1055  author        = {F. S. Graham and T. J. McDougall},
1056  title         = {Quantifying the nonconservative production of conservative
1057                  temperature, potential temperature, and entropy},
1058  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1059  publisher     = {American Meteorological Society},
1060  year          = {2013},
1061  month         = {may},
1062  doi           = {10.1175/jpo-d-11-0188.1},
1063  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-11-0188.1},
1064  pages         = {838--862},
1065  volume        = {43},
1066  number        = {5},
1067  issn          = {1520-0485}
1068}
1069
1070@Article{         greatbatch_94,
1071  author        = {R. J. Greatbatch},
1072  title         = {A note on the representation of steric sea level in models
1073                  that conserve volume rather than mass},
1074  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1075  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1076  year          = {1994},
1077  doi           = {10.1029/94jc00847},
1078  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc00847},
1079  pages         = {12767--12771},
1080  volume        = {99},
1081  number        = {C6},
1082  issn          = {0148-0227}
1083}
1084
1085@Article{         griffies.biastoch.ea_09,
1086  author        = {S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B\"{o}ning and F.
1087                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1088                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1089                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1090                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1091                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1092                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin},
1093  title         = {Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)},
1094  journal       = {Ocean Modelling},
1095  publisher     = {Elsevier BV},
1096  year          = {2009},
1097  month         = {jan},
1098  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1099  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1100  pages         = {1--46},
1101  volume        = {26},
1102  number        = {1-2},
1103  issn          = {1463-5003}
1104}
1105
1106@Article{         griffies.gnanadesikan.ea_98,
1107  author        = {S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1108                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
1109  title         = {Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model},
1110  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1111  publisher     = {American Meteorological Society},
1112  year          = {1998},
1113  month         = {may},
1114  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1115  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1116  pages         = {805--830},
1117  volume        = {28},
1118  number        = {5},
1119  issn          = {1520-0485}
1120}
1121
1122@Article{         griffies.pacanowski.ea_01,
1123  author        = {S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1124                  Balaji},
1125  title         = {Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1126                  for z-coordinate Ocean Models},
1127  journal       = {Monthly Weather Review},
1128  publisher     = {American Meteorological Society},
1129  year          = {2001},
1130  month         = {may},
1131  doi           = {10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1132  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1133  pages         = {1081--1098},
1134  volume        = {129},
1135  number        = {5},
1136  issn          = {1520-0493}
1137}
1138
1139@Book{            griffies_04,
1140  author        = {S. M. Griffies},
1141  booktitle     = {Fundamentals of ocean climate models},
1142  publisher     = {Princeton University Press},
1143  year          = {2004},
1144  month         = {dec},
1145  doi           = {10.2307/j.ctv301gzg},
1146  url           = {http://dx.doi.org/10.2307/j.ctv301gzg},
1147  pages         = {434},
1148  isbn          = {978-0-691-18712-9}
1149}
1150
1151@Article{         griffies_98,
1152  author        = {S. M. Griffies},
1153  title         = {The Gent-McWilliams skew-flux},
1154  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1155  publisher     = {American Meteorological Society},
1156  year          = {1998},
1157  month         = {may},
1158  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1159  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1160  pages         = {831--841},
1161  volume        = {28},
1162  number        = {5},
1163  issn          = {1520-0485}
1164}
1165
1166@Article{         guilyardi.madec.ea_01,
1167  author        = {E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray},
1168  title         = {The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1169                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}},
1170  journal       = {Climate Dynamics},
1171  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
1172  year          = {2001},
1173  month         = {may},
1174  doi           = {10.1007/pl00007930},
1175  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/pl00007930},
1176  pages         = {589--599},
1177  volume        = {17},
1178  number        = {8},
1179  issn          = {0930-7575}
1180}
1181
1182@Article{         haney_91,
1183  author        = {R. L. Haney},
1184  title         = {On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
1185                  Sigma Coordinate Ocean Models},
1186  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1187  publisher     = {American Meteorological Society},
1188  year          = {1991},
1189  month         = {apr},
1190  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
1191  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
1192  pages         = {610--619},
1193  volume        = {21},
1194  number        = {4},
1195  issn          = {1520-0485}
1196}
1197
1198@Article{         hazeleger.drijfhout_00,
1199  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1200  title         = {A model study on internally generated variability in
1201                  subtropical mode water formation},
1202  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1203  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1204  year          = {2000},
1205  month         = {jun},
1206  doi           = {10.1029/2000jc900041},
1207  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900041},
1208  pages         = {13965--13979},
1209  volume        = {105},
1210  number        = {C6},
1211  issn          = {0148-0227}
1212}
1213
1214@Article{         hazeleger.drijfhout_00*1,
1215  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1216  title         = {Eddy subduction in a model of the subtropical gyre},
1217  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1218  publisher     = {American Meteorological Society},
1219  year          = {2000},
1220  month         = {apr},
1221  doi           = {10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
1222  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
1223  pages         = {677--695},
1224  volume        = {30},
1225  number        = {4},
1226  issn          = {1520-0485}
1227}
1228
1229@Article{         hazeleger.drijfhout_98,
1230  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1231  title         = {Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
1232                  response to anomalous forcing},
1233  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1234  publisher     = {American Meteorological Society},
1235  year          = {1998},
1236  month         = {feb},
1237  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
1238  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
1239  pages         = {266--288},
1240  volume        = {28},
1241  number        = {2},
1242  issn          = {1520-0485}
1243}
1244
1245@Article{         hazeleger.drijfhout_99,
1246  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1247  title         = {Stochastically forced mode water variability},
1248  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1249  publisher     = {American Meteorological Society},
1250  year          = {1999},
1251  month         = {aug},
1252  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
1253  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
1254  pages         = {1772--1786},
1255  volume        = {29},
1256  number        = {8},
1257  issn          = {1520-0485}
1258}
1259
1260@Article{         he.ding_01,
1261  author        = {Y. He and C. H. Q. Ding},
1262  title         = {Using accurate arithmetics to improve numerical
1263                  reproducibility and stability in parallel applications},
1264  journal       = {The Journal of Supercomputing},
1265  publisher     = {Springer Nature},
1266  year          = {2001},
1267  doi           = {10.1023/a:1008153532043},
1268  url           = {http://dx.doi.org/10.1023/A:1008153532043},
1269  pages         = {259--277},
1270  volume        = {18},
1271  number        = {3},
1272  issn          = {0920-8542}
1273}
1274
1275@Article{         hirt.amsden.ea_74,
1276  author        = {C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook},
1277  title         = {An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
1278                  flow speeds},
1279  journal       = {Journal of Computational Physics},
1280  publisher     = {Elsevier BV},
1281  year          = {1974},
1282  month         = {mar},
1283  doi           = {10.1016/0021-9991(74)90051-5},
1284  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(74)90051-5},
1285  pages         = {227--253},
1286  volume        = {14},
1287  number        = {3},
1288  issn          = {0021-9991}
1289}
1290
1291@Article{         hofmeister.burchard.ea_10,
1292  author        = {R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers},
1293  title         = {Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
1294                  ocean models},
1295  journal       = {Ocean Modelling},
1296  publisher     = {Elsevier BV},
1297  year          = {2010},
1298  month         = {jan},
1299  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
1300  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
1301  pages         = {70--86},
1302  volume        = {33},
1303  number        = {1-2},
1304  issn          = {1463-5003}
1305}
1306
1307@Article{         holland.jenkins_99,
1308  author        = {D. M. Holland and A. Jenkins},
1309  title         = {Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the
1310                  base of an ice shelf},
1311  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1312  publisher     = {American Meteorological Society},
1313  year          = {1999},
1314  month         = {aug},
1315  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
1316  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
1317  pages         = {1787--1800},
1318  volume        = {29},
1319  number        = {8},
1320  issn          = {1520-0485}
1321}
1322
1323@TechReport{      hunter_06,
1324  author        = {J. R. Hunter},
1325  title         = {Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities},
1326  year          = {2006},
1327  month         = {jun},
1328  url           = {http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf},
1329  institution   = {Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
1330                  Centre},
1331  pages         = {17},
1332  number        = {7}
1333}
1334
1335@Article{         jackson.rehmann_14,
1336  author        = {P. R. Jackson and C. R. Rehmann},
1337  title         = {Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
1338                  a sheared, stratified flow},
1339  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1340  publisher     = {American Meteorological Society},
1341  year          = {2014},
1342  month         = {oct},
1343  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0027.1},
1344  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0027.1},
1345  pages         = {2661--2680},
1346  volume        = {44},
1347  number        = {10},
1348  issn          = {1520-0485}
1349}
1350
1351@TechReport{      janssen.breivik.ea_13,
1352  author        = {P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
1353                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
1354                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni},
1355  title         = {Air-sea interaction and surface waves},
1356  year          = {2013},
1357  month         = {nov},
1358  doi           = {10.21957/0kg73joh},
1359  url           = {https://www.ecmwf.int/node/10238},
1360  pages         = {36},
1361  volume        = {712},
1362  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
1363  institution   = {ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom}
1364}
1365
1366@Article{         jenkins.nicholls.ea_10,
1367  author        = {A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr},
1368  title         = {Observation and parameterization of ablation at the base
1369                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica},
1370  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1371  publisher     = {American Meteorological Society},
1372  year          = {2010},
1373  month         = {oct},
1374  doi           = {10.1175/2010jpo4317.1},
1375  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2010jpo4317.1},
1376  pages         = {2298--2312},
1377  volume        = {40},
1378  number        = {10},
1379  issn          = {1520-0485}
1380}
1381
1382@Article{         jenkins_91,
1383  author        = {A. Jenkins},
1384  title         = {A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction},
1385  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1386  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1387  year          = {1991},
1388  doi           = {10.1029/91jc01842},
1389  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc01842},
1390  pages         = {20671--20677},
1391  volume        = {96},
1392  number        = {C11},
1393  issn          = {0148-0227}
1394}
1395
1396@Article{         kantha.carniel_03,
1397  author        = {L. Kantha and S. Carniel},
1398  title         = {Comments on {\"}{A} generic length-scale equation for
1399                  geophysical turbulence models{\"} by {L}. Umlauf and {H}.
1400                  Burchard},
1401  journal       = {Journal of Marine Research},
1402  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
1403  year          = {2003},
1404  month         = {sep},
1405  doi           = {10.1357/002224003771816007},
1406  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003771816007},
1407  pages         = {693--702},
1408  volume        = {61},
1409  number        = {5},
1410  issn          = {1543-9542}
1411}
1412
1413@Article{         kantha.clayson_94,
1414  author        = {L. H. Kantha and C. A. Clayson},
1415  title         = {An improved mixed layer model for geophysical
1416                  applications},
1417  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1418  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1419  year          = {1994},
1420  doi           = {10.1029/94jc02257},
1421  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc02257},
1422  pages         = {25235--25266},
1423  volume        = {99},
1424  number        = {C12},
1425  issn          = {0148-0227}
1426}
1427
1428@Article{         kasahara_74,
1429  author        = {A. Kasahara},
1430  title         = {Various vertical coordinate systems used for numerical
1431                  weather prediction},
1432  journal       = {Monthly Weather Review},
1433  publisher     = {American Meteorological Society},
1434  year          = {1974},
1435  month         = {jul},
1436  doi           = {10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
1437  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
1438  pages         = {509--522},
1439  volume        = {102},
1440  number        = {7},
1441  issn          = {1520-0493}
1442}
1443
1444@Article{         killworth.stainforth.ea_91,
1445  author        = {P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
1446                  Paterson},
1447  title         = {The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner
1448                  ocean model},
1449  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1450  publisher     = {American Meteorological Society},
1451  year          = {1991},
1452  month         = {sep},
1453  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
1454  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
1455  pages         = {1333--1348},
1456  volume        = {21},
1457  number        = {9},
1458  issn          = {1520-0485}
1459}
1460
1461@InProceedings{   killworth_89,
1462  author        = {P. D. Killworth},
1463  title         = {On the parameterization of deep convection in ocean
1464                  models},
1465  booktitle     = {Parameterization of small-scale processes},
1466  publisher     = {Hawaii Institute of Geophysics},
1467  editor        = {P. Muller and D. Henderson},
1468  year          = {1989},
1469  month         = {jan},
1470  url           = {http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf},
1471  pages         = {59--74}
1472}
1473
1474@Article{         killworth_92,
1475  author        = {P. D. Killworth},
1476  title         = {An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
1477                  Antarctic model},
1478  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1479  publisher     = {American Meteorological Society},
1480  year          = {1992},
1481  month         = {nov},
1482  doi           = {10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
1483  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
1484  pages         = {1379--1387},
1485  volume        = {22},
1486  number        = {11},
1487  issn          = {1520-0485}
1488}
1489
1490@Article{         koch-larrouy.lengaigne.ea_10,
1491  author        = {A. Koch-Larrouy and M. Lengaigne and P. Terray and G.
1492                  Madec and S. Masson},
1493  title         = {Tidal mixing in the Indonesian Seas and its effect on the
1494                  tropical climate system},
1495  journal       = {Climate Dynamics},
1496  publisher     = {Springer Nature},
1497  year          = {2010},
1498  month         = {aug},
1499  doi           = {10.1007/s00382-009-0642-4},
1500  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-009-0642-4},
1501  pages         = {891--904},
1502  volume        = {34},
1503  number        = {6},
1504  issn          = {1432-0894}
1505}
1506
1507@Article{         koch-larrouy.madec.ea_07,
1508  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
1509                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard},
1510  title         = {On the transformation of Pacific water into Indonesian
1511                  ThroughFlow water by internal tidal mixing},
1512  journal       = {Geophysical Research Letters},
1513  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1514  year          = {2007},
1515  month         = {feb},
1516  doi           = {10.1029/2006gl028405},
1517  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2006GL028405},
1518  pages         = {L04604},
1519  volume        = {34},
1520  number        = {4},
1521  issn          = {0094-8276}
1522}
1523
1524@Article{         koch-larrouy.madec.ea_08,
1525  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and B. Blanke and R.
1526                  Molcard},
1527  title         = {Water mass transformation along the Indonesian ThroughFlow
1528                  in an {OGCM}},
1529  journal       = {Ocean Dynamics},
1530  publisher     = {Springer Nature},
1531  year          = {2008},
1532  month         = {oct},
1533  doi           = {10.1007/s10236-008-0155-4},
1534  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0155-4},
1535  pages         = {289--309},
1536  volume        = {58},
1537  number        = {3-4},
1538  issn          = {1616-7228}
1539}
1540
1541@Article{         koch-larrouy.madec.ea_08*1,
1542  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and D. Iudicone and A.
1543                  Atmadipoera and R. Molcard},
1544  title         = {Physical processes contributing to the water mass
1545                  transformation of the Indonesian ThroughFlow},
1546  journal       = {Ocean Dynamics},
1547  publisher     = {Springer Nature},
1548  year          = {2008},
1549  month         = {oct},
1550  doi           = {10.1007/s10236-008-0154-5},
1551  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0154-5},
1552  pages         = {275--288},
1553  volume        = {58},
1554  number        = {3-4},
1555  issn          = {1616-7228}
1556}
1557
1558@Article{         kolmogorov_42,
1559  author        = {A. N. Kolmogorov},
1560  title         = {Equations of turbulent motion in an incompressible fluid},
1561  journal       = {Izvestiya Akademiya Nauk SSSR},
1562  year          = {1942},
1563  series        = {Fizika},
1564  pages         = {56--58},
1565  volume        = {6}
1566}
1567
1568@TechReport{      large.yeager_04,
1569  author        = {W. G. Large and S. G. Yeager},
1570  title         = {Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
1571                  models: the data sets and flux climatologies},
1572  year          = {2004},
1573  month         = {may},
1574  doi           = {10.5065/d6kk98q6},
1575  url           = {http://dx.doi.org/10.5065/D6KK98Q6},
1576  institution   = {{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO, United States}
1577}
1578
1579@Article{         lavergne.madec.ea_16*1,
1580  author        = {C. de Lavergne and G. Madec and J. Le Sommer and A. J. G.
1581                  Nurser and A. C. Naveira Garabato},
1582  title         = {The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
1583                  overturning},
1584  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1585  publisher     = {American Meteorological Society},
1586  year          = {2016},
1587  month         = {feb},
1588  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0259.1},
1589  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0259.1},
1590  pages         = {663--681},
1591  volume        = {46},
1592  number        = {2},
1593  issn          = {1520-0485}
1594}
1595
1596@Article{         lazar.madec.ea_99,
1597  author        = {A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
1598  title         = {The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
1599                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}},
1600  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1601  publisher     = {American Meteorological Society},
1602  year          = {1999},
1603  month         = {nov},
1604  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
1605  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
1606  pages         = {2945--2961},
1607  volume        = {29},
1608  number        = {11},
1609  issn          = {1520-0485}
1610}
1611
1612@PhDThesis{       lazar_97,
1613  author        = {A. Lazar},
1614  title         = {La branche froide de la circulation thermohaline -
1615                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
1616                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale id\'{e}alis\'{e}e},
1617  year          = {1997},
1618  url           = {http://www.theses.fr/1997PA066680},
1619  pages         = {269},
1620  school        = {Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France}
1621}
1622
1623@Article{         le-sommer.penduff.ea_09,
1624  author        = {J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
1625                  and B. Barnier},
1626  title         = {How momentum advection schemes influence
1627                  current-topography interactions at eddy permitting
1628                  resolution},
1629  journal       = {Ocean Modelling},
1630  publisher     = {Elsevier BV},
1631  year          = {2009},
1632  month         = {jan},
1633  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
1634  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
1635  pages         = {1--14},
1636  volume        = {29},
1637  number        = {1},
1638  issn          = {1463-5003}
1639}
1640
1641@Article{         leclair.madec_09,
1642  author        = {M. Leclair and G. Madec},
1643  title         = {A conservative leapfrog time stepping method},
1644  journal       = {Ocean Modelling},
1645  publisher     = {Elsevier BV},
1646  year          = {2009},
1647  month         = {jan},
1648  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
1649  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
1650  pages         = {88--94},
1651  volume        = {30},
1652  number        = {2-3},
1653  issn          = {1463-5003}
1654}
1655
1656@Article{         leclair.madec_11,
1657  author        = {M. Leclair and G. Madec},
1658  title         = {$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
1659                  coordinate separating high and low frequency motions},
1660  journal       = {Ocean Modelling},
1661  publisher     = {Elsevier BV},
1662  year          = {2011},
1663  doi           = {10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
1664  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
1665  pages         = {139--152},
1666  volume        = {37},
1667  number        = {3-4},
1668  issn          = {1463-5003}
1669}
1670
1671@PhDThesis{       leclair_10,
1672  author        = {M. Leclair},
1673  title         = {Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
1674                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an {NEMO}},
1675  year          = {2010},
1676  url           = {http://www.theses.fr/2010PA066728},
1677  pages         = {163},
1678  school        = {Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France}
1679}
1680
1681@Article{         lele_92,
1682  author        = {S. K. Lele},
1683  title         = {Compact finite difference schemes with spectral-like
1684                  resolution},
1685  journal       = {Journal of Computational Physics},
1686  publisher     = {Elsevier BV},
1687  year          = {1992},
1688  month         = {nov},
1689  doi           = {10.1016/0021-9991(92)90324-r},
1690  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(92)90324-r},
1691  pages         = {16--42},
1692  volume        = {103},
1693  number        = {1},
1694  issn          = {0021-9991}
1695}
1696
1697@Article{         lemarie.debreu.ea_12,
1698  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
1699                  C. McWilliams},
1700  title         = {On the stability and accuracy of the harmonic and
1701                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models},
1702  journal       = {Ocean Modelling},
1703  publisher     = {Elsevier BV},
1704  year          = {2012},
1705  month         = {aug},
1706  doi           = {10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
1707  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
1708  pages         = {9--35},
1709  volume        = {52-53},
1710  issn          = {1463-5003}
1711}
1712
1713@Article{         lemarie.debreu.ea_15,
1714  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
1715                  and J. M. Molines and M. Honnorat},
1716  title         = {Stability constraints for oceanic numerical models:
1717                  implications for the formulation of time and space
1718                  discretizations},
1719  journal       = {Ocean Modelling},
1720  publisher     = {Elsevier BV},
1721  year          = {2015},
1722  month         = {aug},
1723  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
1724  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
1725  pages         = {124--148},
1726  volume        = {92},
1727  issn          = {1463-5003}
1728}
1729
1730@Article{         lengaigne.madec.ea_03,
1731  author        = {M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes},
1732  title         = {Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
1733                  circulation},
1734  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1735  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1736  year          = {2003},
1737  doi           = {10.1029/2002jc001704},
1738  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002JC001704},
1739  pages         = {3345},
1740  volume        = {108},
1741  number        = {C11},
1742  issn          = {0148-0227}
1743}
1744
1745@Article{         lengaigne.menkes.ea_07,
1746  author        = {M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
1747                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec},
1748  title         = {Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
1749                  climate in a Coupled General Circulation Model},
1750  journal       = {Climate Dynamics},
1751  publisher     = {Springer Nature},
1752  year          = {2007},
1753  month         = {nov},
1754  doi           = {10.1007/s00382-006-0200-2},
1755  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-006-0200-2},
1756  pages         = {503--516},
1757  volume        = {28},
1758  number        = {5},
1759  issn          = {1432-0894}
1760}
1761
1762@Article{         leonard_79,
1763  author        = {B. P. Leonard},
1764  title         = {A stable and accurate convective modelling procedure based
1765                  on quadratic upstream interpolation},
1766  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
1767  publisher     = {Elsevier BV},
1768  year          = {1979},
1769  month         = {jun},
1770  doi           = {10.1016/0045-7825(79)90034-3},
1771  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(79)90034-3},
1772  pages         = {59--98},
1773  volume        = {19},
1774  number        = {1},
1775  issn          = {0045-7825}
1776}
1777
1778@Article{         leonard_91,
1779  author        = {B. P. Leonard},
1780  title         = {The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
1781                  unsteady one-dimensional advection},
1782  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
1783  publisher     = {Elsevier BV},
1784  year          = {1991},
1785  month         = {jun},
1786  doi           = {10.1016/0045-7825(91)90232-u},
1787  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(91)90232-u},
1788  pages         = {17--74},
1789  volume        = {88},
1790  number        = {1},
1791  issn          = {0045-7825}
1792}
1793
1794@Article{         lermusiaux_01,
1795  author        = {P. F. J. Lermusiaux},
1796  title         = {Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
1797                  ocean variability: Massachusetts Bay},
1798  journal       = {Journal of Marine Systems},
1799  publisher     = {Elsevier BV},
1800  year          = {2001},
1801  month         = {may},
1802  doi           = {10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
1803  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
1804  pages         = {385--422},
1805  volume        = {29},
1806  number        = {1-4},
1807  issn          = {0924-7963}
1808}
1809
1810@TechReport{      levier.treguier.ea_mersea07,
1811  author        = {B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
1812                  Garnier},
1813  title         = {Free surface and variable volume in the {NEMO} code},
1814  year          = {2007},
1815  month         = {may},
1816  doi           = {10.5281/zenodo.3244182},
1817  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3244182},
1818  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
1819                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
1820  pages         = {47}
1821}
1822
1823@Article{         levy.estublier.ea_01,
1824  author        = {M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec},
1825  title         = {Choice of an advection scheme for biogeochemical models},
1826  journal       = {Geophysical Research Letters},
1827  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1828  year          = {2001},
1829  month         = {oct},
1830  doi           = {10.1029/2001gl012947},
1831  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001gl012947},
1832  pages         = {3725--3728},
1833  volume        = {28},
1834  number        = {19},
1835  issn          = {0094-8276}
1836}
1837
1838@Article{         levy.klein.ea_10,
1839  author        = {M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
1840                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi},
1841  title         = {Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
1842                  physics},
1843  journal       = {Ocean Modelling},
1844  publisher     = {Elsevier BV},
1845  year          = {2010},
1846  month         = {jan},
1847  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
1848  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
1849  pages         = {1--15},
1850  volume        = {34},
1851  number        = {1-2},
1852  issn          = {1463-5003}
1853}
1854
1855@Article{         li.garrett_93,
1856  author        = {M. Li and C. Garrett},
1857  title         = {Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
1858                  circulation},
1859  journal       = {Journal of Marine Research},
1860  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
1861  year          = {1993},
1862  month         = {nov},
1863  doi           = {10.1357/0022240933223945},
1864  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/0022240933223945},
1865  pages         = {737--769},
1866  volume        = {51},
1867  number        = {4},
1868  issn          = {1543-9542}
1869}
1870
1871@Article{         losch_08,
1872  author        = {M. Losch},
1873  title         = {Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
1874                  General Circulation Model},
1875  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1876  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1877  year          = {2008},
1878  month         = {aug},
1879  doi           = {10.1029/2007jc004368},
1880  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2007jc004368},
1881  volume        = {113},
1882  number        = {C8},
1883  issn          = {0148-0227}
1884}
1885
1886@Article{         lott.madec.ea_90,
1887  author        = {F. Lott and G. Madec and J. Verron},
1888  title         = {Topographic experiments in an Ocean General Circulation
1889                  Model},
1890  journal       = {Ocean Modelling},
1891  year          = {1990},
1892  pages         = {1--4},
1893  volume        = {88}
1894}
1895
1896@Article{         madec.chartier.ea_91,
1897  author        = {G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon},
1898  title         = {The effect of thermohaline forcing variability on deep
1899                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
1900                  high-resolution three-dimensional numerical study},
1901  journal       = {Dynamics of Atmospheres and Oceans},
1902  publisher     = {Elsevier BV},
1903  year          = {1991},
1904  month         = {apr},
1905  doi           = {10.1016/0377-0265(91)90024-a},
1906  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0377-0265(91)90024-a},
1907  pages         = {301--332},
1908  volume        = {15},
1909  number        = {3-5},
1910  issn          = {0377-0265}
1911}
1912
1913@InProceedings{   madec.crepon_91,
1914  author        = {G. Madec and M. Cr\'{e}pon},
1915  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
1916                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
1917                  deep convection and deep water formation in the oceans",
1918  publisher     = {Elsevier},
1919  editor        = {P.C. Chu and J.C. Gascard},
1920  year          = {1991},
1921  doi           = {10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
1922  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
1923  title         = {Thermohaline-driven deep water formation in the
1924                  northwestern Mediterranean Sea},
1925  chapter       = {15},
1926  series        = {Elsevier Oceanography},
1927  volume        = {57},
1928  pages         = {241--265},
1929  issn          = {0422-9894},
1930  isbn          = {978-0-444-88764-1}
1931}
1932
1933@Article{         madec.delecluse.ea_91,
1934  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
1935                  Chartier},
1936  title         = {A three-dimensional numerical study of deep-water
1937                  formation in the northwestern Mediterranean Sea},
1938  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1939  publisher     = {American Meteorological Society},
1940  year          = {1991},
1941  month         = {sep},
1942  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
1943  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
1944  pages         = {1349--1371},
1945  volume        = {21},
1946  number        = {9},
1947  issn          = {1520-0485}
1948}
1949
1950@Article{         madec.delecluse.ea_96,
1951  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
1952                  Lott},
1953  title         = {Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
1954                  northwestern Mediterranean Sea},
1955  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1956  publisher     = {American Meteorological Society},
1957  year          = {1996},
1958  month         = {aug},
1959  doi           = {10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
1960  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
1961  pages         = {1393--1408},
1962  volume        = {26},
1963  number        = {8},
1964  issn          = {1520-0485}
1965}
1966
1967@Manual{          madec.delecluse.ea_98,
1968  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
1969                  L\'{e}vy},
1970  title         = {{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
1971                  manual},
1972  journal       = {Note du Pole de Mod\'{e}lisation},
1973  publisher     = {Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})},
1974  year          = {1998},
1975  url           = {http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf},
1976  pages         = {91},
1977  issn          = {1288-1619},
1978  volume        = {11}
1979}
1980
1981@Article{         madec.delecluse_97,
1982  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
1983  title         = {The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
1984                  Coupled Model},
1985  journal       = {International WOCE Newsletter},
1986  publisher     = {University of Southampton},
1987  year          = {1997},
1988  month         = {apr},
1989  url           = {https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf},
1990  pages         = {12--15},
1991  volume        = {26}
1992}
1993
1994@Article{         madec.imbard_96,
1995  author        = {G. Madec and M. Imbard},
1996  title         = {A global ocean mesh to overcome the North Pole
1997                  singularity},
1998  journal       = {Climate Dynamics},
1999  publisher     = {Springer Nature},
2000  year          = {1996},
2001  month         = {may},
2002  doi           = {10.1007/bf00211684},
2003  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/bf00211684},
2004  pages         = {381--388},
2005  volume        = {12},
2006  number        = {6},
2007  issn          = {1432-0894}
2008}
2009
2010@Article{         maltrud.smith.ea_98,
2011  author        = {M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
2012                  Malone},
2013  title         = {Global eddy-resolving ocean simulations driven by
2014                  1985-1995 atmospheric winds},
2015  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2016  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2017  year          = {1998},
2018  month         = {dec},
2019  doi           = {10.1029/1998jc900013},
2020  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1998jc900013},
2021  pages         = {30825--30853},
2022  volume        = {103},
2023  number        = {C13},
2024  issn          = {0148-0227}
2025}
2026
2027@Article{         marchesiello.williams.ea_01,
2028  author        = {P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin},
2029  title         = {Open boundary conditions for long-term integration of
2030                  regional oceanic models},
2031  journal       = {Ocean Modelling},
2032  publisher     = {Elsevier BV},
2033  year          = {2001},
2034  month         = {jan},
2035  doi           = {10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
2036  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
2037  pages         = {1--20},
2038  volume        = {3},
2039  number        = {1-2},
2040  issn          = {1463-5003}
2041}
2042
2043@Article{         marsaleix.auclair.ea_08,
2044  author        = {P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
2045                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses},
2046  title         = {Energy conservation issues in sigma-coordinate
2047                  free-surface ocean models},
2048  journal       = {Ocean Modelling},
2049  publisher     = {Elsevier BV},
2050  year          = {2008},
2051  month         = {jan},
2052  doi           = {10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
2053  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
2054  pages         = {61--89},
2055  volume        = {20},
2056  number        = {1},
2057  issn          = {1463-5003}
2058}
2059
2060@Article{         marsh.ivchenko.ea_15,
2061  author        = {R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
2062                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
2063                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. Le Sommer and N.
2064                  Merino and V. B. Zalesny},
2065  title         = {{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
2066                  ocean model globally configured at eddy-permitting
2067                  resolution},
2068  journal       = {Geoscientific Model Development},
2069  publisher     = {Copernicus GmbH},
2070  year          = {2015},
2071  month         = {may},
2072  doi           = {10.5194/gmd-8-1547-2015},
2073  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1547-2015},
2074  pages         = {1547--1562},
2075  volume        = {8},
2076  number        = {5},
2077  issn          = {1991-9603}
2078}
2079
2080@Article{         marti.madec.ea_92,
2081  author        = {O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
2082  title         = {Comment on {\"}Net diffusivity in ocean general circulation
2083                  models with nonuniform grids{\"} by {F}. {L}. Yin and {I}.
2084                  {Y}. Fung},
2085  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2086  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2087  year          = {1992},
2088  doi           = {10.1029/92jc00306},
2089  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00306},
2090  pages         = {12763--12766},
2091  volume        = {97},
2092  number        = {C8},
2093  issn          = {0148-0227}
2094}
2095
2096@Article{         martin.adcroft_10,
2097  author        = {T. Martin and A. Adcroft},
2098  title         = {Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
2099                  with interactive icebergs in a coupled climate model},
2100  journal       = {Ocean Modelling},
2101  publisher     = {Elsevier BV},
2102  year          = {2010},
2103  month         = {jan},
2104  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
2105  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
2106  pages         = {111--124},
2107  volume        = {34},
2108  number        = {3-4},
2109  issn          = {1463-5003}
2110}
2111
2112@Article{         mathiot.jenkins.ea_17,
2113  author        = {P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec},
2114  title         = {Explicit representation and parametrised impacts of under
2115                  ice shelf seas in the z^\star coordinate ocean model {NEMO}
2116                  3.6},
2117  journal       = {Geoscientific Model Development},
2118  publisher     = {Copernicus GmbH},
2119  year          = {2017},
2120  month         = {jul},
2121  doi           = {10.5194/gmd-10-2849-2017},
2122  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-10-2849-2017},
2123  pages         = {2849--2874},
2124  volume        = {10},
2125  number        = {7},
2126  issn          = {1991-9603}
2127}
2128
2129@Article{         mcdougall.taylor_84,
2130  author        = {T. J. McDougall and J. R. Taylor},
2131  title         = {Flux measurements across a finger interface at low values
2132                  of the stability ratio},
2133  journal       = {Journal of Marine Research},
2134  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2135  year          = {1984},
2136  month         = {feb},
2137  doi           = {10.1357/002224084788506095},
2138  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788506095},
2139  pages         = {1--14},
2140  volume        = {42},
2141  number        = {1},
2142  issn          = {1543-9542}
2143}
2144
2145@Article{         mcdougall_87,
2146  author        = {T. J. McDougall},
2147  title         = {Neutral Surfaces},
2148  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2149  publisher     = {American Meteorological Society},
2150  year          = {1987},
2151  month         = {nov},
2152  doi           = {10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2},
2153  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1987)017<1950:NS>2.0.CO;2},
2154  pages         = {1950--1964},
2155  volume        = {17},
2156  number        = {11},
2157  issn          = {1520-0485}
2158}
2159
2160@Article{         mellor.blumberg_04,
2161  author        = {G. Mellor and A. Blumberg},
2162  title         = {Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response},
2163  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2164  publisher     = {American Meteorological Society},
2165  year          = {2004},
2166  month         = {mar},
2167  doi           = {10.1175/2517.1},
2168  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2517.1},
2169  pages         = {693--698},
2170  volume        = {34},
2171  number        = {3},
2172  issn          = {1520-0485}
2173}
2174
2175@Article{         mellor.yamada_82,
2176  author        = {G. L. Mellor and T. Yamada},
2177  title         = {Development of a turbulence closure model for geophysical
2178                  fluid problems},
2179  journal       = {Reviews of Geophysics},
2180  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2181  year          = {1982},
2182  doi           = {10.1029/rg020i004p00851},
2183  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/rg020i004p00851},
2184  pages         = {851--875},
2185  volume        = {20},
2186  number        = {4},
2187  issn          = {8755-1209}
2188}
2189
2190@Article{         merryfield.holloway.ea_99,
2191  author        = {W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett},
2192  title         = {A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing},
2193  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2194  publisher     = {American Meteorological Society},
2195  year          = {1999},
2196  month         = {jun},
2197  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
2198  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
2199  pages         = {1124--1142},
2200  volume        = {29},
2201  number        = {6},
2202  issn          = {1520-0485}
2203}
2204
2205@Book{            mesinger.arakawa_76,
2206  author        = {F. Mesinger and A. Arakawa},
2207  booktitle     = {Numerical methods used in atmospheric models},
2208  year          = {1976},
2209  month         = {aug},
2210  url           = {https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models},
2211  series        = {GARP Publication},
2212  volume        = {1},
2213  number        = {17}
2214}
2215
2216@Article{         morel.berthon_89,
2217  author        = {A. Morel and J.-F. Berthon},
2218  title         = {Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
2219                  production of the euphotic layer: Relationships
2220                  reinvestigated in view of remote-sensing applications},
2221  journal       = {Limnology and Oceanography},
2222  publisher     = {Wiley},
2223  year          = {1989},
2224  month         = {dec},
2225  doi           = {10.4319/lo.1989.34.8.1545},
2226  url           = {http://dx.doi.org/10.4319/lo.1989.34.8.1545},
2227  pages         = {1545--1562},
2228  volume        = {34},
2229  number        = {8},
2230  issn          = {0024-3590}
2231}
2232
2233@Article{         morel.maritorena_01,
2234  author        = {A. Morel and S. Maritorena},
2235  title         = {Bio-optical properties of oceanic waters: {A}
2236                  reappraisal},
2237  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2238  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2239  year          = {2001},
2240  month         = {apr},
2241  doi           = {10.1029/2000jc000319},
2242  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000319},
2243  pages         = {7163--7180},
2244  volume        = {106},
2245  number        = {C4},
2246  issn          = {0148-0227}
2247}
2248
2249@Article{         morel_88,
2250  author        = {A. Morel},
2251  title         = {Optical modeling of the upper ocean in relation to its
2252                  biogenous matter content (case {I} waters)},
2253  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2254  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2255  year          = {1988},
2256  doi           = {10.1029/jc093ic09p10749},
2257  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc093ic09p10749},
2258  pages         = {10749--10768},
2259  volume        = {93},
2260  number        = {C9},
2261  issn          = {0148-0227}
2262}
2263
2264@Article{         murray_96,
2265  author        = {R. J. Murray},
2266  title         = {Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models},
2267  journal       = {Journal of Computational Physics},
2268  publisher     = {Elsevier BV},
2269  year          = {1996},
2270  month         = {jul},
2271  doi           = {10.1006/jcph.1996.0136},
2272  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1996.0136},
2273  pages         = {251--273},
2274  volume        = {126},
2275  number        = {2},
2276  issn          = {0021-9991}
2277}
2278
2279@Article{         oey_06,
2280  author        = {L.-Y. Oey},
2281  title         = {An {OGCM} with movable land-sea boundaries},
2282  journal       = {Ocean Modelling},
2283  publisher     = {Elsevier BV},
2284  year          = {2006},
2285  month         = {jan},
2286  doi           = {10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
2287  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
2288  pages         = {176--195},
2289  volume        = {13},
2290  number        = {2},
2291  issn          = {1463-5003}
2292}
2293
2294@Article{         osborn_80,
2295  author        = {T. R. Osborn},
2296  title         = {Estimates of the local rate of vertical diffusion from
2297                  dissipation measurements},
2298  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2299  publisher     = {American Meteorological Society},
2300  year          = {1980},
2301  month         = {jan},
2302  doi           = {10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
2303  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
2304  pages         = {83--89},
2305  volume        = {10},
2306  number        = {1},
2307  issn          = {1520-0485}
2308}
2309
2310@Article{         pacanowski.gnanadesikan_98,
2311  author        = {R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan},
2312  title         = {Transient response in a z-level ocean model that resolves
2313                  topography with partial-cells},
2314  journal       = {Monthly Weather Review},
2315  publisher     = {American Meteorological Society},
2316  year          = {1998},
2317  month         = {dec},
2318  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
2319  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
2320  pages         = {3248--3270},
2321  volume        = {126},
2322  number        = {12},
2323  issn          = {1520-0493}
2324}
2325
2326@Article{         pacanowski.philander_81,
2327  author        = {R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander},
2328  title         = {Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
2329                  Tropical Oceans},
2330  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2331  publisher     = {American Meteorological Society},
2332  year          = {1981},
2333  month         = {nov},
2334  doi           = {10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
2335  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
2336  pages         = {1443--1451},
2337  volume        = {11},
2338  number        = {11},
2339  issn          = {1520-0485}
2340}
2341
2342@Article{         paulson.simpson_77,
2343  author        = {C. A. Paulson and J. J. Simpson},
2344  title         = {Irradiance Measurements in the Upper Ocean},
2345  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2346  publisher     = {American Meteorological Society},
2347  year          = {1977},
2348  month         = {nov},
2349  doi           = {10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
2350  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
2351  pages         = {952--956},
2352  volume        = {7},
2353  number        = {6},
2354  issn          = {1520-0485}
2355}
2356
2357@Article{         penduff.sommer.ea_07,
2358  author        = {T. Penduff and J. Le Sommer and B. Barnier and A.-M.
2359                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec},
2360  title         = {Influence of numerical schemes on current-topography
2361                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations},
2362  journal       = {Ocean Science},
2363  publisher     = {Copernicus GmbH},
2364  year          = {2007},
2365  month         = {dec},
2366  doi           = {10.5194/os-3-509-2007},
2367  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-509-2007},
2368  pages         = {509--524},
2369  volume        = {3},
2370  number        = {4},
2371  issn          = {1812-0792}
2372}
2373
2374@Article{         phillips_59,
2375  author        = {R. S. Phillips},
2376  title         = {Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
2377                  differential equations},
2378  journal       = {Transactions of the American Mathematical Society},
2379  publisher     = {American Mathematical Society (AMS)},
2380  year          = {1959},
2381  month         = {feb},
2382  doi           = {10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1},
2383  url           = {http://dx.doi.org/10.1090/S0002-9947-1959-0104919-1},
2384  pages         = {193--254},
2385  volume        = {90},
2386  number        = {2},
2387  issn          = {0002-9947}
2388}
2389
2390@Article{         redi_82,
2391  author        = {M. H. Redi},
2392  title         = {Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation},
2393  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2394  publisher     = {American Meteorological Society},
2395  year          = {1982},
2396  month         = {oct},
2397  doi           = {10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
2398  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
2399  pages         = {1154--1158},
2400  volume        = {12},
2401  number        = {10},
2402  issn          = {1520-0485}
2403}
2404
2405@Book{            richtmyer.morton_67,
2406  author        = {R. D. Richtmyer and K. W. Morton},
2407  booktitle     = {Difference methods for initial-value problems},
2408  publisher     = {Interscience},
2409  year          = {1967},
2410  url           = {https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ},
2411  pages         = {405},
2412  edition       = {2},
2413  isbn          = {9780470720400},
2414  issn          = {0074-994X},
2415  series        = {Interscience tracts in pure and applied mathematics}
2416}
2417
2418@Article{         robert_66,
2419  author        = {A. J. Robert},
2420  title         = {The integration of a low order spectral form of the
2421                  primitive meteorological equations},
2422  journal       = {Journal of the Meteorological Society of Japan},
2423  publisher     = {Meteorological Society of Japan},
2424  year          = {1966},
2425  doi           = {10.2151/jmsj1965.44.5_237},
2426  url           = {http://dx.doi.org/10.2151/jmsj1965.44.5_237},
2427  pages         = {237--245},
2428  volume        = {44},
2429  number        = {5},
2430  issn          = {2186-9057}
2431}
2432
2433@Article{         rodgers.aumont.ea_14,
2434  author        = {K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
2435                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. de Boyer Mont\'{e}gut
2436                  and D. Iudicone and R. F. Keeling and G. Madec and R.
2437                  Wanninkhof},
2438  title         = {Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
2439                  nutrient cycling to wind stirring},
2440  journal       = {Biogeosciences},
2441  publisher     = {Copernicus GmbH},
2442  year          = {2014},
2443  month         = {aug},
2444  doi           = {10.5194/bg-11-4077-2014},
2445  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/bg-11-4077-2014},
2446  pages         = {4077--4098},
2447  volume        = {11},
2448  number        = {15},
2449  issn          = {1726-4189}
2450}
2451
2452@Article{         rodi_87,
2453  author        = {W. Rodi},
2454  title         = {Examples of calculation methods for flow and mixing in
2455                  stratified fluids},
2456  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2457  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2458  year          = {1987},
2459  doi           = {10.1029/jc092ic05p05305},
2460  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc092ic05p05305},
2461  pages         = {5305--5328},
2462  volume        = {92},
2463  number        = {C5},
2464  issn          = {0148-0227}
2465}
2466
2467@Article{         roquet.madec.ea_15,
2468  author        = {F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
2469                  Barker},
2470  title         = {Accurate polynomial expressions for the density and
2471                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard},
2472  journal       = {Ocean Modelling},
2473  publisher     = {Elsevier BV},
2474  year          = {2015},
2475  month         = {jun},
2476  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
2477  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
2478  pages         = {29--43},
2479  volume        = {90},
2480  issn          = {1463-5003}
2481}
2482
2483@Article{         roquet.madec.ea_15*1,
2484  author        = {F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander},
2485  title         = {Defining a simplified yet {\"}realistic{\"} equation of
2486                  state for seawater},
2487  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2488  publisher     = {American Meteorological Society},
2489  year          = {2015},
2490  month         = {oct},
2491  doi           = {10.1175/jpo-d-15-0080.1},
2492  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-15-0080.1},
2493  pages         = {2564--2579},
2494  volume        = {45},
2495  number        = {10},
2496  issn          = {1520-0485}
2497}
2498
2499@Article{         roullet.madec_00,
2500  author        = {G. Roullet and G. Madec},
2501  title         = {Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
2502                  new formulation for Ocean General Circulation Models},
2503  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2504  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2505  year          = {2000},
2506  month         = {oct},
2507  doi           = {10.1029/2000jc900089},
2508  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900089},
2509  pages         = {23927--23942},
2510  volume        = {105},
2511  number        = {C10},
2512  issn          = {0148-0227}
2513}
2514
2515@Article{         sarmiento.bryan_82,
2516  author        = {J. L. Sarmiento and K. Bryan},
2517  title         = {An ocean transport model for the North Atlantic},
2518  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2519  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2520  year          = {1982},
2521  doi           = {10.1029/jc087ic01p00394},
2522  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc087ic01p00394},
2523  pages         = {394--409},
2524  volume        = {87},
2525  number        = {C1},
2526  issn          = {0148-0227}
2527}
2528
2529@Article{         saunders_67,
2530  author        = {P. M. Saunders},
2531  title         = {The temperature at the ocean-air interface},
2532  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
2533  publisher     = {American Meteorological Society},
2534  year          = {1967},
2535  month         = {may},
2536  doi           = {10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2},
2537  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1967)024<0269:TTATOA>2.0.CO;2},
2538  pages         = {269--273},
2539  volume        = {24},
2540  number        = {3},
2541  issn          = {1520-0469}
2542}
2543
2544@Article{         shchepetkin.mcwilliams_05,
2545  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
2546  title         = {The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
2547                  split-explicit, free-surface,
2548                  topography-following-coordinate oceanic model},
2549  journal       = {Ocean Modelling},
2550  publisher     = {Elsevier BV},
2551  year          = {2005},
2552  month         = {jan},
2553  doi           = {10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
2554  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
2555  pages         = {347--404},
2556  volume        = {9},
2557  number        = {4},
2558  issn          = {1463-5003}
2559}
2560
2561@InBook{          shchepetkin.mcwilliams_09,
2562  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
2563  booktitle     = {Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans},
2564  publisher     = {Elsevier},
2565  editor        = {R. M. Temam and J. J. Tribbia},
2566  year          = {2009},
2567  doi           = {10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
2568  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
2569  title         = {Computational kernel algorithms for fine-scale,
2570                  multiprocess, longtime oceanic simulations},
2571  chapter       = {2},
2572  series        = {Handbook of Numerical Analysis},
2573  pages         = {121--183},
2574  volume        = {14},
2575  issn          = {1570-8659},
2576  isbn          = {9780444518934}
2577}
2578
2579@Article{         siddorn.furner_13,
2580  author        = {J. R. Siddorn and R. Furner},
2581  title         = {An analytical stretching function that combines the best
2582                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
2583                  coordinates},
2584  journal       = {Ocean Modelling},
2585  publisher     = {Elsevier BV},
2586  year          = {2013},
2587  month         = {jun},
2588  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
2589  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
2590  pages         = {1--13},
2591  volume        = {66},
2592  issn          = {1463-5003}
2593}
2594
2595@Article{         simmons.jayne.ea_04,
2596  author        = {H. L. Simmons and S. R. Jayne and L. C. {St Laurent} and
2597                  A. J. Weaver},
2598  title         = {Tidally driven mixing in a numerical model of the ocean
2599                  general circulation},
2600  journal       = {Ocean Modelling},
2601  publisher     = {Elsevier BV},
2602  year          = {2004},
2603  month         = {jan},
2604  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
2605  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
2606  pages         = {245--263},
2607  volume        = {6},
2608  number        = {3-4},
2609  issn          = {1463-5003}
2610}
2611
2612@Article{         song.haidvogel_94,
2613  author        = {Y. Song and D. Haidvogel},
2614  title         = {A semi-implicit ocean circulation model using a
2615                  generalized topography-following coordinate system},
2616  journal       = {Journal of Computational Physics},
2617  publisher     = {Elsevier BV},
2618  year          = {1994},
2619  month         = {nov},
2620  doi           = {10.1006/jcph.1994.1189},
2621  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1994.1189},
2622  pages         = {228--244},
2623  volume        = {115},
2624  number        = {1},
2625  issn          = {0021-9991}
2626}
2627
2628@Article{         song_98,
2629  author        = {Y. T. Song},
2630  title         = {A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
2631                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis},
2632  journal       = {Monthly Weather Review},
2633  publisher     = {American Meteorological Society},
2634  year          = {1998},
2635  month         = {dec},
2636  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
2637  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
2638  pages         = {3213--3230},
2639  volume        = {126},
2640  number        = {12},
2641  issn          = {1520-0493}
2642}
2643
2644@Article{         st-laurent.nash_04,
2645  author        = {L. C. {St Laurent} and J. D. Nash},
2646  title         = {An examination of the radiative and dissipative properties
2647                  of deep ocean internal tides},
2648  journal       = {Deep Sea Research},
2649  publisher     = {Elsevier BV},
2650  year          = {2004},
2651  month         = {dec},
2652  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
2653  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
2654  pages         = {3029--3042},
2655  volume        = {51},
2656  number        = {25-26},
2657  issn          = {0967-0645}
2658}
2659
2660@Article{         st-laurent.simmons.ea_02,
2661  author        = {L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne},
2662  title         = {Estimating tidally driven mixing in the deep ocean},
2663  journal       = {Geophysical Research Letters},
2664  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2665  year          = {2002},
2666  month         = {dec},
2667  doi           = {10.1029/2002gl015633},
2668  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL015633},
2669  pages         = {2101--2104},
2670  volume        = {29},
2671  number        = {23},
2672  issn          = {0094-8276}
2673}
2674
2675@Article{         stacey_99,
2676  author        = {M. W. Stacey},
2677  title         = {Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
2678                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness
2679                  length},
2680  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2681  publisher     = {American Meteorological Society},
2682  year          = {1999},
2683  month         = {jun},
2684  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
2685  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
2686  pages         = {1363--1367},
2687  volume        = {29},
2688  number        = {6},
2689  issn          = {1520-0485}
2690}
2691
2692@Article{         steele.morley.ea_01,
2693  author        = {M. Steele and R. Morley and W. Ermold},
2694  title         = {{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
2695                  Arctic Ocean},
2696  journal       = {Journal of Climate},
2697  publisher     = {American Meteorological Society},
2698  year          = {2001},
2699  month         = {may},
2700  doi           = {10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
2701  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
2702  pages         = {2079--2087},
2703  volume        = {14},
2704  number        = {9},
2705  issn          = {1520-0442}
2706}
2707
2708@Article{         stein.stein_92,
2709  author        = {C. A. Stein and S. Stein},
2710  title         = {A model for the global variation in oceanic depth and heat
2711                  flow with lithospheric age},
2712  journal       = {Nature},
2713  publisher     = {Springer Nature},
2714  year          = {1992},
2715  month         = {sep},
2716  doi           = {10.1038/359123a0},
2717  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/359123a0},
2718  pages         = {123--129},
2719  volume        = {359},
2720  number        = {6391},
2721  issn          = {1476-4687}
2722}
2723
2724@InBook{          stokes_09,
2725  author        = {G. G. Stokes},
2726  booktitle     = {Mathematical and Physical Papers},
2727  publisher     = {Cambridge University Press},
2728  year          = {2009},
2729  doi           = {10.1017/cbo9780511702242.013},
2730  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511702242.013},
2731  title         = {On the theory of oscillatory waves},
2732  chapter       = {12},
2733  series        = {Cambridge Library Collection - Mathematics},
2734  volume        = {1},
2735  pages         = {197--229},
2736  isbn          = {9780511702242}
2737}
2738
2739@Article{         takaya.bidlot.ea_10,
2740  author        = {Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
2741                  E. M. Janssen},
2742  title         = {Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
2743                  temperature},
2744  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2745  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2746  year          = {2010},
2747  month         = {jun},
2748  doi           = {10.1029/2009jc005985},
2749  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2009JC005985},
2750  pages         = {C06009},
2751  volume        = {115},
2752  number        = {C6},
2753  issn          = {0148-0227}
2754}
2755
2756@Article{         talagrand_72,
2757  author        = {O. Talagrand},
2758  title         = {On the damping of high-frequency motions in
2759                  four-dimensional assimilation of meteorological data},
2760  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
2761  publisher     = {American Meteorological Society},
2762  year          = {1972},
2763  month         = {nov},
2764  doi           = {10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
2765  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
2766  pages         = {1571--1574},
2767  volume        = {29},
2768  number        = {8},
2769  issn          = {1520-0469}
2770}
2771
2772@Manual{          teos_10,
2773  author        = {IOC, SCOR and IAPSO},
2774  title         = {The international thermodynamic equation of seawater -
2775                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties},
2776  publisher     = {UNESCO},
2777  editor        = {Intergovernmental Oceanographic Commission},
2778  year          = {2010},
2779  month         = {mar},
2780  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en},
2781  pages         = {196},
2782  volume        = {56},
2783  series        = {Manuals and Guides}
2784}
2785
2786@Article{         treguier.dukowicz.ea_96,
2787  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan},
2788  title         = {Properties of nonuniform grids used in ocean general
2789                  circulation models},
2790  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2791  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2792  year          = {1996},
2793  month         = {sep},
2794  doi           = {10.1029/96jc01753},
2795  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/96jc01753},
2796  pages         = {20877--20881},
2797  volume        = {101},
2798  number        = {C9},
2799  issn          = {0148-0227}
2800}
2801
2802@Article{         treguier.held.ea_97,
2803  author        = {A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev},
2804  title         = {Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
2805                  Equation Ocean Models},
2806  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2807  publisher     = {American Meteorological Society},
2808  year          = {1997},
2809  month         = {apr},
2810  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
2811  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
2812  pages         = {567--580},
2813  volume        = {27},
2814  number        = {4},
2815  issn          = {1520-0485}
2816}
2817
2818@Article{         treguier_92,
2819  author        = {A. M. Tr\'{e}guier},
2820  title         = {Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
2821                  equation model of the North Atlantic},
2822  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2823  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2824  year          = {1992},
2825  doi           = {10.1029/91jc02350},
2826  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc02350},
2827  pages         = {687--701},
2828  volume        = {97},
2829  number        = {C1},
2830  issn          = {0148-0227}
2831}
2832
2833@Article{         tu.tsuang_05,
2834  author        = {C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang},
2835  title         = {Cool-skin simulation by a one-column ocean model},
2836  journal       = {Geophysical Research Letters},
2837  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2838  year          = {2005},
2839  month         = {nov},
2840  doi           = {10.1029/2005gl024252},
2841  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2005GL024252},
2842  pages         = {L22602},
2843  volume        = {32},
2844  number        = {22},
2845  issn          = {0094-8276}
2846}
2847
2848@Article{         umlauf.burchard_03,
2849  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
2850  title         = {A generic length-scale equation for geophysical turbulence
2851                  models},
2852  journal       = {Journal of Marine Research},
2853  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2854  year          = {2003},
2855  month         = {mar},
2856  doi           = {10.1357/002224003322005087},
2857  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003322005087},
2858  pages         = {235--265},
2859  volume        = {61},
2860  number        = {2},
2861  issn          = {0022-2402}
2862}
2863
2864@Article{         umlauf.burchard_05,
2865  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
2866  title         = {Second-order turbulence closure models for geophysical
2867                  boundary layers. {A} review of recent work},
2868  journal       = {Continental Shelf Research},
2869  publisher     = {Elsevier BV},
2870  year          = {2005},
2871  month         = {may},
2872  doi           = {10.1016/j.csr.2004.08.004},
2873  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.csr.2004.08.004},
2874  pages         = {795--827},
2875  volume        = {25},
2876  number        = {7-8},
2877  issn          = {0278-4343}
2878}
2879
2880@Book{            vallis_06,
2881  author        = {G. K. Vallis},
2882  booktitle     = {Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics},
2883  publisher     = {Cambridge University Press},
2884  year          = {2006},
2885  doi           = {10.1017/cbo9780511790447},
2886  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511790447},
2887  isbn          = {9780511790447}
2888}
2889
2890@Article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09,
2891  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse and S.
2892                  Bouillon and G. Madec and M. A. Morales Maqueda},
2893  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2894                  Antarctic sea ice. 1. Model description and validation},
2895  journal       = {Ocean Modelling},
2896  publisher     = {Elsevier BV},
2897  year          = {2009},
2898  month         = {jan},
2899  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
2900  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
2901  pages         = {33--53},
2902  volume        = {27},
2903  number        = {1-2},
2904  issn          = {1463-5003}
2905}
2906
2907@Article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09*1,
2908  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse},
2909  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2910                  Antarctic sea ice. 2. Importance of sea ice salinity
2911                  variations},
2912  journal       = {Ocean Modelling},
2913  publisher     = {Elsevier BV},
2914  year          = {2009},
2915  month         = {jan},
2916  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
2917  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
2918  pages         = {54--69},
2919  volume        = {27},
2920  number        = {1-2},
2921  issn          = {1463-5003}
2922}
2923
2924@Article{         warner.defne.ea_13,
2925  author        = {J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango},
2926  title         = {A wetting and drying scheme for {ROMS}},
2927  journal       = {Computers \& Geosciences},
2928  publisher     = {Elsevier BV},
2929  year          = {2013},
2930  month         = {aug},
2931  doi           = {10.1016/j.cageo.2013.05.004},
2932  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2013.05.004},
2933  pages         = {54--61},
2934  volume        = {58},
2935  issn          = {0098-3004}
2936}
2937
2938@Article{         warner.sherwood.ea_05,
2939  author        = {J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
2940                  Signell},
2941  title         = {Performance of four turbulence closure models implemented
2942                  using a generic length scale method},
2943  journal       = {Ocean Modelling},
2944  publisher     = {Elsevier BV},
2945  year          = {2005},
2946  month         = {jan},
2947  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
2948  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
2949  pages         = {81--113},
2950  volume        = {8},
2951  number        = {1-2},
2952  issn          = {1463-5003}
2953}
2954
2955@Article{         weatherly_84,
2956  author        = {G. L. Weatherly},
2957  title         = {An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
2958                  Stream fluctuations},
2959  journal       = {Journal of Marine Research},
2960  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2961  year          = {1984},
2962  month         = {may},
2963  doi           = {10.1357/002224084788502729},
2964  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502729},
2965  pages         = {289--301},
2966  volume        = {42},
2967  number        = {2},
2968  issn          = {1543-9542}
2969}
2970
2971@Article{         weaver.eby_97,
2972  author        = {A. J. Weaver and M. Eby},
2973  title         = {On the numerical implementation of advection schemes for
2974                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
2975                  the {GFDL} ocean model},
2976  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2977  publisher     = {American Meteorological Society},
2978  year          = {1997},
2979  month         = {feb},
2980  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
2981  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
2982  pages         = {369--377},
2983  volume        = {27},
2984  number        = {2},
2985  issn          = {1520-0485}
2986}
2987
2988@Article{         webb.cuevas.ea_98,
2989  author        = {D. J. Webb and B. A. de Cuevas and C. S. Richmond},
2990  title         = {Improved Advection Schemes for Ocean Models},
2991  journal       = {Journal of Atmospheric and Oceanic Technology},
2992  publisher     = {American Meteorological Society},
2993  year          = {1998},
2994  month         = {oct},
2995  doi           = {10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
2996  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
2997  pages         = {1171--1187},
2998  volume        = {15},
2999  number        = {5},
3000  issn          = {1520-0426}
3001}
3002
3003@Article{         white.adcroft.ea_09,
3004  author        = {L. White and A. Adcroft and R. Hallberg},
3005  title         = {High-order regridding-remapping schemes for continuous
3006                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models},
3007  journal       = {Journal of Computational Physics},
3008  publisher     = {Elsevier BV},
3009  year          = {2009},
3010  month         = {dec},
3011  doi           = {10.1016/j.jcp.2009.08.016},
3012  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jcp.2009.08.016},
3013  pages         = {8665--8692},
3014  volume        = {228},
3015  number        = {23},
3016  issn          = {0021-9991}
3017}
3018
3019@Article{         wilcox_88,
3020  author        = {D. C. Wilcox},
3021  title         = {Reassessment of the scale-determining equation for
3022                  advanced turbulence models},
3023  journal       = {AIAA Journal},
3024  publisher     = {American Institute of Aeronautics and Astronautics
3025                  (AIAA)},
3026  year          = {1988},
3027  month         = {nov},
3028  doi           = {10.2514/3.10041},
3029  url           = {http://dx.doi.org/10.2514/3.10041},
3030  pages         = {1299--1310},
3031  volume        = {26},
3032  number        = {11},
3033  issn          = {1533-385X}
3034}
3035
3036@Article{         willebrand.barnier.ea_01,
3037  author        = {J. Willebrand and B. Barnier and C. B\"{o}ning and C.
3038                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
3039                  and J.-M. Molines and A. L. New},
3040  title         = {Circulation characteristics in three eddy-permitting
3041                  models of the North Atlantic},
3042  journal       = {Progress in Oceanography},
3043  publisher     = {Elsevier BV},
3044  year          = {2001},
3045  month         = {jan},
3046  doi           = {10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
3047  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
3048  pages         = {123--161},
3049  volume        = {48},
3050  number        = {2-3},
3051  issn          = {0079-6611}
3052}
3053
3054@Article{         zalesak_79,
3055  author        = {S. T. Zalesak},
3056  title         = {Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
3057                  for fluids},
3058  journal       = {Journal of Computational Physics},
3059  publisher     = {Elsevier BV},
3060  year          = {1979},
3061  month         = {jun},
3062  doi           = {10.1016/0021-9991(79)90051-2},
3063  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(79)90051-2},
3064  pages         = {335--362},
3065  volume        = {31},
3066  number        = {3},
3067  issn          = {0021-9991}
3068}
3069
3070@Article{         zhang.endoh_92,
3071  author        = {R.-H. Zhang and M. Endoh},
3072  title         = {A free surface General Circulation Model for the tropical
3073                  Pacific Ocean},
3074  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3075  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3076  year          = {1992},
3077  doi           = {10.1029/92jc00911},
3078  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00911},
3079  pages         = {11237--11255},
3080  volume        = {97},
3081  number        = {C7},
3082  issn          = {0148-0227}
3083}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.