New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
NEMO_manual.bib in NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main – NEMO

source: NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main/NEMO_manual.bib @ 11121

Last change on this file since 11121 was 11121, checked in by nicolasmartin, 3 years ago

Fixes on BibTeX fields

  • Restoration of few missing entries from previous cleaning
  • Protection of some french names with "von" part
  • Use of the proper syntax for doubles quotes: `` ... ''
  • Addition of backslash for underscore character in URL
File size: 115.0 KB
Line 
1
2@article{         adcroft.campin_04,
3  author        = {A. Adcroft and J.-M. Campin},
4  title         = {Rescaled height coordinates for accurate representation of
5                  free-surface flows in ocean circulation models},
6  journal       = {Ocean Modelling},
7  publisher     = {Elsevier BV},
8  year          = {2004},
9  month         = {jan},
10  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
11  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.09.003},
12  pages         = {269--284},
13  volume        = {7},
14  number        = {3-4},
15  issn          = {1463-5003}
16}
17
18@article{         arakawa.hsu_90,
19  author        = {A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu},
20  title         = {Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
21                  Schemes for the Shallow Water Equations},
22  journal       = {Monthly Weather Review},
23  publisher     = {American Meteorological Society},
24  year          = {1990},
25  month         = {oct},
26  doi           = {10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
27  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2},
28  pages         = {1960--1969},
29  volume        = {118},
30  number        = {10},
31  issn          = {1520-0493}
32}
33
34@article{         arakawa.lamb_81,
35  author        = {A. Arakawa and V. R. Lamb},
36  title         = {A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
37                  Shallow Water Equations},
38  journal       = {Monthly Weather Review},
39  publisher     = {American Meteorological Society},
40  year          = {1981},
41  month         = {jan},
42  doi           = {10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
43  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2},
44  pages         = {18--36},
45  volume        = {109},
46  number        = {1},
47  issn          = {1520-0493}
48}
49
50@article{         arakawa_66,
51  author        = {A. Arakawa},
52  title         = {Computational design for long-term numerical integration
53                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
54                  incompressible flow. Part {I}},
55  journal       = {Journal of Computational Physics},
56  publisher     = {Elsevier BV},
57  year          = {1966},
58  month         = {Aug},
59  doi           = {10.1016/0021-9991(66)90015-5},
60  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(66)90015-5},
61  pages         = {119--143},
62  volume        = {1},
63  number        = {1},
64  issn          = {0021-9991}
65}
66
67@article{         arbic.garner.ea_04,
68  author        = {B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
69                  Simmons},
70  title         = {The accuracy of surface elevations in forward global
71                  barotropic and baroclinic tide models},
72  journal       = {Deep Sea Research},
73  publisher     = {Elsevier BV},
74  year          = {2004},
75  month         = {dec},
76  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
77  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.014},
78  pages         = {3069--3101},
79  volume        = {51},
80  number        = {25-26},
81  issn          = {0967-0645}
82}
83
84@article{         artale.iudicone.ea_02,
85  author        = {V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
86                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio},
87  title         = {Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
88                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
89                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
90                  thermohaline circulation},
91  journal       = {Journal of Geophysical Research},
92  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
93  year          = {2002},
94  doi           = {10.1029/2000jc000452},
95  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000JC000452},
96  pages         = {2901--2924},
97  volume        = {107},
98  number        = {C8},
99  issn          = {0148-0227}
100}
101
102@Article{         asselin_72,
103  author        = "R. Asselin",
104  title         = "Frequency Filter for Time Integrations",
105  journal       = "Monthly Weather Review",
106  issn          = "1520-0493",
107  year          = "1972",
108  volume        = "100",
109  number        = "6",
110  month         = "jun",
111  pages         = "487--490",
112  publisher     = "American Meteorological Society",
113  doi           = "10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2",
114  url           = "http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2",
115}
116
117@article{         axell_02,
118  author        = {L. B. Axell},
119  title         = {Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
120                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea},
121  journal       = {Journal of Geophysical Research},
122  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
123  year          = {2002},
124  doi           = {10.1029/2001jc000922},
125  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001JC000922},
126  volume        = {107},
127  number        = {C11},
128  issn          = {0148-0227}
129}
130
131@article{         barnier.madec.ea_06,
132  author        = {B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
133                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. {Le Sommer} and A. Beckmann and
134                  A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and J. Dengg and C. Derval
135                  and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C. Talandier and
136                  S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and B. {de Cuevas}},
137  title         = {Impact of partial steps and momentum advection schemes in
138                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
139                  resolution},
140  journal       = {Ocean Dynamics},
141  publisher     = {Springer Nature},
142  year          = {2006},
143  month         = {jun},
144  doi           = {10.1007/s10236-006-0082-1},
145  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-006-0082-1},
146  pages         = {543--567},
147  volume        = {56},
148  number        = {5-6},
149  issn          = {1616-7228}
150}
151
152@article{         beckmann.doscher_97,
153  author        = {A. Beckmann and R. D{\"{o}}scher},
154  title         = {A method for improved representation of dense water
155                  spreading over topography in geopotential-coordinate
156                  models},
157  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
158  publisher     = {American Meteorological Society},
159  year          = {1997},
160  month         = {apr},
161  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
162  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2},
163  pages         = {581--591},
164  volume        = {27},
165  number        = {4},
166  issn          = {1520-0485}
167}
168
169@article{         beckmann.goosse_03,
170  author        = {A. Beckmann and H. Goosse},
171  title         = {A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
172                  climate models},
173  journal       = {Ocean Modelling},
174  publisher     = {Elsevier BV},
175  year          = {2003},
176  month         = {jan},
177  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
178  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(02)00019-7},
179  pages         = {157--170},
180  volume        = {5},
181  number        = {2},
182  issn          = {1463-5003}
183}
184
185@article{         beckmann.haidvogel_93,
186  author        = {A. Beckmann and D. B. Haidvogel},
187  title         = {Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
188                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model
189                  Accuracy},
190  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
191  publisher     = {American Meteorological Society},
192  year          = {1993},
193  month         = {aug},
194  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
195  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2},
196  pages         = {1736--1753},
197  volume        = {23},
198  number        = {8},
199  issn          = {1520-0485}
200}
201
202@article{         bernie.guilyardi.ea_07,
203  author        = {D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
204                  Slingo and S. J. Woolnough},
205  title         = {Impact of resolving the diurnal cycle in an
206                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced
207                  {OGCM}},
208  journal       = {Climate Dynamics},
209  publisher     = {Springer Nature},
210  year          = {2007},
211  month         = {may},
212  doi           = {10.1007/s00382-007-0249-6},
213  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-007-0249-6},
214  pages         = {575--590},
215  volume        = {29},
216  number        = {6},
217  issn          = {1432-0894}
218}
219
220@article{         bernie.woolnough.ea_05,
221  author        = {D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
222                  Guilyardi},
223  title         = {Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
224                  ocean mixed layer},
225  journal       = {Journal of Climate},
226  publisher     = {American Meteorological Society},
227  year          = {2005},
228  month         = {apr},
229  doi           = {10.1175/jcli3319.1},
230  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/jcli3319.1},
231  pages         = {1190--1202},
232  volume        = {18},
233  number        = {8},
234  issn          = {1520-0442}
235}
236
237@article{         blanke.delecluse_93,
238  author        = {B. Blanke and P. Del\'{e}cluse},
239  title         = {Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
240                  General Circulation Model with two different mixed-layer
241                  physics},
242  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
243  publisher     = {American Meteorological Society},
244  year          = {1993},
245  month         = {jul},
246  doi           = {10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
247  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2},
248  pages         = {1363--1388},
249  volume        = {23},
250  number        = {7},
251  issn          = {1520-0485}
252}
253
254@article{         blanke.raynaud_97,
255  author        = {B. Blanke and S. Raynaud},
256  title         = {Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
257                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results},
258  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
259  publisher     = {American Meteorological Society},
260  year          = {1997},
261  month         = {jun},
262  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
263  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2},
264  pages         = {1038--1053},
265  volume        = {27},
266  number        = {6},
267  issn          = {1520-0485}
268}
269
270@article{         bloom.takacs.ea_96,
271  author        = {S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
272                  Ledvina},
273  title         = {Data assimilation using incremental analysis updates},
274  journal       = {Monthly Weather Review},
275  publisher     = {American Meteorological Society},
276  year          = {1996},
277  month         = {jun},
278  doi           = {10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
279  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2},
280  pages         = {1256--1271},
281  volume        = {124},
282  number        = {6},
283  issn          = {1520-0493}
284}
285
286@Article{         bouffard_boegman_13,
287  author        = "D. Bouffard and L. Boegman",
288  title         = "A diapycnal diffusivity model for stratified environmental
289                  flows",
290  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
291  issn          = "0377-0265",
292  year          = "2013",
293  volume        = "61-62",
294  month         = "jun",
295  pages         = "14--34",
296  publisher     = "Elsevier BV",
297  doi           = "10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002",
298  url           = "http://dx.doi.org/10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002",
299}
300
301@article{         bougeault.lacarrere_89,
302  author        = {P. Bougeault and P. Lacarrere},
303  title         = {Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
304                  Mesobeta--Scale Model},
305  journal       = {Monthly Weather Review},
306  publisher     = {American Meteorological Society},
307  year          = {1989},
308  month         = {aug},
309  doi           = {10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
310  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2},
311  pages         = {1872--1890},
312  volume        = {117},
313  number        = {8},
314  issn          = {1520-0493}
315}
316
317@article{         bouillon.maqueda.ea_09,
318  author        = {S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
319                  Fichefet},
320  title         = {An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
321                  Arakawa {B} and {C} grids},
322  journal       = {Ocean Modelling},
323  publisher     = {Elsevier BV},
324  year          = {2009},
325  month         = {jan},
326  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
327  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.01.004},
328  pages         = {174--184},
329  volume        = {27},
330  number        = {3-4},
331  issn          = {1463-5003}
332}
333
334@article{         boyer-montegut.madec.ea_04,
335  author        = {C. {de Boyer Mont\'{e}gut} and G. Madec and A. S. Fischer
336                  and A. Lazar and D. Iudicone},
337  title         = {Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
338                  profile data and a profile-based climatology},
339  journal       = {Journal of Geophysical Research},
340  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
341  year          = {2004},
342  doi           = {10.1029/2004jc002378},
343  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2004JC002378},
344  pages         = {C12003},
345  volume        = {109},
346  number        = {C12},
347  issn          = {0148-0227}
348}
349
350@article{         brankart.candille.ea_15,
351  author        = {J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
352                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
353                  J. Verron},
354  title         = {A generic approach to explicit simulation of uncertainty
355                  in the {NEMO} ocean model},
356  journal       = {Geoscientific Model Development},
357  publisher     = {Copernicus GmbH},
358  year          = {2015},
359  month         = {may},
360  doi           = {10.5194/gmd-8-1285-2015},
361  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1285-2015},
362  pages         = {1285--1297},
363  volume        = {8},
364  number        = {5},
365  issn          = {1991-9603}
366}
367
368@article{         brankart_13,
369  author        = {J.-M. Brankart},
370  title         = {Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
371                  upon low resolution global ocean modelling},
372  journal       = {Ocean Modelling},
373  publisher     = {Elsevier BV},
374  year          = {2013},
375  month         = {jun},
376  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
377  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.004},
378  pages         = {64--76},
379  volume        = {66},
380  issn          = {1463-5003}
381}
382
383@article{         breivik.bidlot.ea_16,
384  author        = {{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen},
385  title         = {A Stokes drift approximation based on the Phillips
386                  spectrum},
387  journal       = {Ocean Modelling},
388  publisher     = {Elsevier BV},
389  year          = {2016},
390  month         = {apr},
391  doi           = {10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
392  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2016.01.005},
393  pages         = {49--56},
394  volume        = {100},
395  issn          = {1463-5003}
396}
397
398@article{         breivik.janssen.ea_14,
399  author        = {{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot},
400  title         = {Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water},
401  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
402  publisher     = {American Meteorological Society},
403  year          = {2014},
404  month         = {sep},
405  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0020.1},
406  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0020.1},
407  pages         = {2433--2445},
408  volume        = {44},
409  number        = {9},
410  issn          = {1520-0485}
411}
412
413@article{         brodeau.barnier.ea_10,
414  author        = {L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
415                  Penduff and S. Gulev},
416  title         = {An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
417                  circulation models},
418  journal       = {Ocean Modelling},
419  publisher     = {Elsevier BV},
420  year          = {2010},
421  month         = {jan},
422  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
423  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.10.005},
424  pages         = {88--104},
425  volume        = {31},
426  number        = {3-4},
427  issn          = {1463-5003}
428}
429
430@article{         brown.campana_78,
431  author        = {J. A. Brown and K. A. Campana},
432  title         = {An economical time-differencing system for numerical
433                  weather prediction},
434  journal       = {Monthly Weather Review},
435  publisher     = {American Meteorological Society},
436  year          = {1978},
437  month         = {aug},
438  doi           = {10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
439  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2},
440  pages         = {1125--1136},
441  volume        = {106},
442  number        = {8},
443  issn          = {1520-0493}
444}
445
446@article{         bryan_97,
447  author        = {K. Bryan},
448  title         = {A numerical method for the study of the circulation of the
449                  world ocean},
450  journal       = {Journal of Computational Physics},
451  publisher     = {Elsevier BV},
452  year          = {1997},
453  month         = {Aug},
454  doi           = {10.1006/jcph.1997.5699},
455  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1997.5699},
456  volume        = {135},
457  number        = {2},
458  pages         = {154--169},
459  issn          = {0021-9991}
460}
461
462@article{         burchard_02,
463  author        = {H. Burchard},
464  title         = {Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
465                  buoyancy production},
466  journal       = {Ocean Modelling},
467  publisher     = {Elsevier BV},
468  year          = {2002},
469  month         = {jun},
470  doi           = {10.1016/s1463-5003(02)00009-4},
471  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/S1463-5003(02)00009-4},
472  pages         = {347--361},
473  volume        = {4},
474  number        = {3-4},
475  issn          = {1463-5003}
476}
477
478@article{         campin.adcroft.ea_04,
479  author        = {J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall},
480  title         = {Conservation of properties in a free-surface model},
481  journal       = {Ocean Modelling},
482  publisher     = {Elsevier BV},
483  year          = {2004},
484  month         = {jan},
485  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
486  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00009-x},
487  pages         = {221--244},
488  volume        = {6},
489  number        = {3-4},
490  issn          = {1463-5003}
491}
492
493@article{         campin.goosse_99,
494  author        = {J.-M. Campin and H. Goosse},
495  title         = {Parameterization of density-driven downsloping flow for a
496                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate},
497  journal       = {Tellus A},
498  publisher     = {Informa UK Limited},
499  year          = {1999},
500  month         = {may},
501  doi           = {10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
502  url           = {http://dx.doi.org/10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x},
503  pages         = {412--430},
504  volume        = {51},
505  number        = {3},
506  issn          = {1600-0870}
507}
508
509@article{         campin.marshall.ea_08,
510  author        = {J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira},
511  title         = {Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
512                  coordinate \zstar},
513  journal       = {Ocean Modelling},
514  publisher     = {Elsevier BV},
515  year          = {2008},
516  month         = {jan},
517  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
518  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.05.005},
519  pages         = {1--14},
520  volume        = {24},
521  number        = {1-2},
522  issn          = {1463-5003}
523}
524
525@article{         canuto.howard.ea_01,
526  author        = {V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
527                  Dubovikov},
528  title         = {Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
529                  model-momentum and heat vertical diffusivities},
530  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
531  publisher     = {American Meteorological Society},
532  year          = {2001},
533  month         = {jun},
534  doi           = {10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
535  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2},
536  pages         = {1413--1426},
537  volume        = {31},
538  number        = {6},
539  issn          = {1520-0485}
540}
541
542@article{         carrere.lyard_03,
543  author        = {L. Carr\`{e}re and F. Lyard},
544  title         = {Modeling the barotropic response of the global ocean to
545                  atmospheric wind and pressure forcing - comparisons with
546                  observations},
547  journal       = {Geophysical Research Letters},
548  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
549  year          = {2003},
550  month         = {mar},
551  doi           = {10.1029/2002gl016473},
552  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL016473},
553  volume        = {30},
554  number        = {6},
555  issn          = {0094-8276}
556}
557
558@techreport{      chanut_mersea05,
559  author        = {J. Chanut},
560  title         = {Nesting code for {NEMO}},
561  year          = {2005},
562  month         = {may},
563  doi           = {10.5281/zenodo.3243409},
564  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3243409},
565  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
566                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
567  pages         = {25}
568}
569
570@article{         chassignet.smith.ea_03,
571  author        = {E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
572                  R. Bleck},
573  title         = {North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
574                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
575                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity},
576  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
577  publisher     = {American Meteorological Society},
578  year          = {2003},
579  month         = {dec},
580  doi           = {10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
581  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2},
582  pages         = {2504--2526},
583  volume        = {33},
584  number        = {12},
585  issn          = {1520-0485}
586}
587
588@article{         cox_87,
589  author        = {M. D. Cox},
590  title         = {Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model},
591  journal       = {Ocean Modelling},
592  year          = {1987},
593  month         = {jan},
594  url           = {https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model},
595  pages         = {1--9},
596  volume        = {74}
597}
598
599@article{         craig.banner_94,
600  author        = {P. D. Craig and M. L. Banner},
601  title         = {Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
602                  layer},
603  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
604  publisher     = {American Meteorological Society},
605  year          = {1994},
606  month         = {dec},
607  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
608  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2},
609  pages         = {2546--2559},
610  volume        = {24},
611  number        = {12},
612  issn          = {1520-0485}
613}
614
615@article{         craik.leibovich_76,
616  author        = {A. D. D. Craik and S. Leibovich},
617  title         = {A rational model for Langmuir circulations},
618  journal       = {Journal of Fluid Mechanics},
619  publisher     = {Cambridge University Press (CUP)},
620  year          = {1976},
621  month         = {feb},
622  doi           = {10.1017/s0022112076001420},
623  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/s0022112076001420},
624  pages         = {401--426},
625  volume        = {73},
626  number        = {3},
627  issn          = {1469-7645}
628}
629
630@article{         dalessio.abdella.ea_98,
631  author        = {S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane},
632  title         = {A new second-order turbulence closure scheme for modeling
633                  the oceanic mixed layer},
634  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
635  publisher     = {American Meteorological Society},
636  year          = {1998},
637  month         = {aug},
638  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
639  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2},
640  pages         = {1624--1641},
641  volume        = {28},
642  number        = {8},
643  issn          = {1520-0485}
644}
645
646@book{            daley.barker_01,
647  author        = {R. Daley and E. Barker},
648  booktitle     = {{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
649                  Data Assimilation System},
650  publisher     = {Defense Technical Information Center},
651  editor        = {Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division},
652  year          = {2001},
653  month         = {jul},
654  doi           = {10.21236/ada396883},
655  url           = {http://dx.doi.org/10.21236/ada396883},
656  pages         = {163}
657}
658
659@article{         danabasoglu.ferrari.ea_08,
660  author        = {G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams},
661  title         = {Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
662                  parameterization of near-surface eddy fluxes},
663  journal       = {Journal of Climate},
664  publisher     = {American Meteorological Society},
665  year          = {2008},
666  month         = {mar},
667  doi           = {10.1175/2007jcli1508.1},
668  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2007JCLI1508.1},
669  pages         = {1192--1208},
670  volume        = {21},
671  number        = {6},
672  issn          = {1520-0442}
673}
674
675@article{         davies_76,
676  author        = {H. C. Davies},
677  title         = {A lateral boundary formulation for multi-level prediction
678                  models},
679  journal       = {Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society},
680  publisher     = {Wiley},
681  year          = {1976},
682  month         = {apr},
683  doi           = {10.1002/qj.49710243210},
684  url           = {http://dx.doi.org/10.1002/qj.49710243210},
685  pages         = {405--418},
686  volume        = {102},
687  number        = {432},
688  issn          = {0035-9009}
689}
690
691@article{         debreu.vouland.ea_08,
692  author        = {L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo},
693  title         = {{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran},
694  journal       = {Computers \& Geosciences},
695  publisher     = {Elsevier BV},
696  year          = {2008},
697  month         = {jan},
698  doi           = {10.1016/j.cageo.2007.01.009},
699  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2007.01.009},
700  pages         = {8--13},
701  volume        = {34},
702  number        = {1},
703  issn          = {0098-3004}
704}
705
706@incollection{    delecluse.madec_99,
707  author        = {P. Del\'{e}cluse and G. Madec},
708  title         = {Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
709                  system},
710  booktitle     = {Modeling the Earth's Climate and its Variability},
711  publisher     = {North Holland},
712  editor        = {W. R. Holland and S. Joussaume and F. David},
713  year          = {1999},
714  isbn          = {978-0-444-50338-1},
715  series        = {Les Houches},
716  volume        = {67},
717  pages         = {237--313}
718}
719
720@phdthesis{       demange_14,
721  author        = {J. Demange},
722  title         = {Advection and gravity waves propagation numerical schemes
723                  for oceanic circulation models},
724  year          = {2014},
725  pages         = {138},
726  url           = {https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf},
727  school        = {Grenoble University, France}
728}
729
730@article{         dobricic.pinardi.ea_07,
731  author        = {S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
732                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez},
733  title         = {Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
734                  System at the basin scale},
735  journal       = {Ocean Science},
736  publisher     = {Copernicus GmbH},
737  year          = {2007},
738  month         = {mar},
739  doi           = {10.5194/os-3-149-2007},
740  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-149-2007},
741  pages         = {149--157},
742  volume        = {3},
743  number        = {1},
744  issn          = {1812-0792}
745}
746
747@article{         drijfhout_94,
748  author        = {S. S. Drijfhout},
749  title         = {Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
750                  Model},
751  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
752  publisher     = {American Meteorological Society},
753  year          = {1994},
754  month         = {feb},
755  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
756  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2},
757  pages         = {353--369},
758  volume        = {24},
759  number        = {2},
760  issn          = {1520-0485}
761}
762
763@article{         dukowicz.smith_94,
764  author        = {J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
765  title         = {Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
766                  ocean model},
767  journal       = {Journal of Geophysical Research},
768  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
769  year          = {1994},
770  doi           = {10.1029/93jc03455},
771  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc03455},
772  pages         = {7991--8014},
773  volume        = {99},
774  number        = {C4},
775  issn          = {0148-0227}
776}
777
778@article{         egbert.ray_00,
779  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
780  title         = {Significant dissipation of tidal energy in the deep ocean
781                  inferred from satellite altimeter data},
782  journal       = {Nature},
783  publisher     = {Springer Nature},
784  year          = {2000},
785  month         = {jun},
786  doi           = {10.1038/35015531},
787  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/35015531},
788  pages         = {775--778},
789  volume        = {405},
790  number        = {6788},
791  issn          = {1476-4687}
792}
793
794@article{         egbert.ray_01,
795  author        = {G. D. Egbert and R. D. Ray},
796  title         = {Estimates of {M2} tidal energy dissipation from
797                  {TOPEX}/Poseidon altimeter data},
798  journal       = {Journal of Geophysical Research},
799  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
800  year          = {2001},
801  month         = {oct},
802  doi           = {10.1029/2000jc000699},
803  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000699},
804  pages         = {22475--22502},
805  volume        = {106},
806  number        = {C10},
807  issn          = {0148-0227}
808}
809
810@article{         eiseman.stone_80,
811  author        = {P. R. Eiseman and A. P. Stone},
812  title         = {Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey},
813  journal       = {SIAM Review},
814  publisher     = {Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)},
815  year          = {1980},
816  month         = {jan},
817  doi           = {10.1137/1022002},
818  url           = {http://dx.doi.org/10.1137/1022002},
819  pages         = {12--27},
820  volume        = {22},
821  number        = {1},
822  issn          = {1095-7200}
823}
824
825@article{         emile-geay.madec_09,
826  author        = {J. Emile-Geay and G. Madec},
827  title         = {Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
828                  circulation},
829  journal       = {Ocean Science},
830  publisher     = {Copernicus GmbH},
831  year          = {2009},
832  month         = {jun},
833  doi           = {10.5194/os-5-203-2009},
834  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-5-203-2009},
835  pages         = {203--217},
836  volume        = {5},
837  number        = {2},
838  issn          = {1812-0792}
839}
840
841@article{         engedahl_95,
842  author        = {H. Engedahl},
843  title         = {Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
844                  baroclinic ocean model with realistic topography},
845  journal       = {Tellus A},
846  publisher     = {Informa UK Limited},
847  year          = {1995},
848  month         = {jan},
849  doi           = {10.3402/tellusa.v47i3.11523},
850  url           = {http://dx.doi.org/10.3402/tellusa.v47i3.11523},
851  pages         = {365--382},
852  volume        = {47},
853  number        = {3},
854  issn          = {1600-0870}
855}
856
857@phdthesis{       farge-coulombier_87,
858  author        = {M. {Farge Coulombier}},
859  title         = {Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
860                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant},
861  year          = {1987},
862  pages         = {353},
863  url           = {http://www.theses.fr/1987PA066365},
864  school        = {Paris VI University, France}
865}
866
867@article{         farrow.stevens_95,
868  author        = {D. E. Farrow and D. P. Stevens},
869  title         = {A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
870                  General Circulation Models},
871  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
872  publisher     = {American Meteorological Society},
873  year          = {1995},
874  month         = {jul},
875  doi           = {10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
876  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2},
877  pages         = {1731--1741},
878  volume        = {25},
879  number        = {7},
880  issn          = {1520-0485}
881}
882
883@article{         flather_94,
884  author        = {R. A. Flather},
885  title         = {A storm surge prediction model for the northern Bay of
886                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
887                  1991},
888  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
889  publisher     = {American Meteorological Society},
890  year          = {1994},
891  month         = {jan},
892  doi           = {10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
893  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2},
894  pages         = {172--190},
895  volume        = {24},
896  number        = {1},
897  issn          = {1520-0485}
898}
899
900@book{            fofonoff.millard_83,
901  author        = {N P. Fofonoff and R. C. Millard},
902  booktitle     = {Algorithms for computation of fundamental properties of
903                  seawater},
904  publisher     = {UNESCO},
905  editor        = {UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO},
906  year          = {1983},
907  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en},
908  series        = {Technical Paper in Marine Science},
909  pages         = {53},
910  volume        = {44}
911}
912
913@article{         galperin.kantha.ea_88,
914  author        = {B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati},
915  title         = {A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
916                  flows},
917  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
918  publisher     = {American Meteorological Society},
919  year          = {1988},
920  month         = {jan},
921  doi           = {10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
922  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2},
923  pages         = {55--62},
924  volume        = {45},
925  number        = {1},
926  issn          = {1520-0469}
927}
928
929@article{         gargett_84,
930  author        = {A. E. Gargett},
931  title         = {Vertical eddy diffusivity in the ocean interior},
932  journal       = {Journal of Marine Research},
933  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
934  year          = {1984},
935  month         = {may},
936  doi           = {10.1357/002224084788502756},
937  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502756},
938  pages         = {359--393},
939  volume        = {42},
940  number        = {2},
941  issn          = {1543-9542}
942}
943
944@article{         gaspar.gregoris.ea_90,
945  author        = {P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre},
946  title         = {A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
947                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
948                  long-term upper ocean study site},
949  journal       = {Journal of Geophysical Research},
950  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
951  year          = {1990},
952  doi           = {10.1029/jc095ic09p16179},
953  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc095ic09p16179},
954  pages         = {16179},
955  volume        = {95},
956  number        = {C9},
957  issn          = {0148-0227}
958}
959
960@article{         gent.mcwilliams_90,
961  author        = {P. R. Gent and J. C. McWilliams},
962  title         = {Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models},
963  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
964  publisher     = {American Meteorological Society},
965  year          = {1990},
966  month         = {jan},
967  doi           = {10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
968  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2},
969  pages         = {150--155},
970  volume        = {20},
971  number        = {1},
972  issn          = {1520-0485}
973}
974
975@article{         gentemann.minnett.ea_09,
976  author        = {C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward},
977  title         = {Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
978                  of upper ocean diurnal warming},
979  journal       = {Journal of Geophysical Research},
980  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
981  year          = {2009},
982  month         = {jul},
983  doi           = {10.1029/2008jc004825},
984  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2008JC004825},
985  pages         = {C07017},
986  volume        = {114},
987  number        = {C7},
988  issn          = {0148-0227}
989}
990
991@article{         gerdes.koberle_91,
992  author        = {R. Gerdes and C. K{\"{o}}berle and J. Willebrand},
993  title         = {The influence of numerical advection schemes on the
994                  results of Ocean General Circulation Models},
995  journal       = {Climate Dynamics},
996  publisher     = {Springer Nature},
997  year          = {1991},
998  month         = {jun},
999  doi           = {10.1007/bf00210006},
1000  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/BF00210006},
1001  pages         = {211--226},
1002  volume        = {5},
1003  number        = {4},
1004  issn          = {1432-0894}
1005}
1006
1007@article{         gerdes_93,
1008  author        = {R. Gerdes},
1009  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
1010                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
1011                  and testing of the model},
1012  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1013  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1014  year          = {1993},
1015  doi           = {10.1029/93jc00760},
1016  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00760},
1017  pages         = {14683--14701},
1018  volume        = {98},
1019  number        = {C8},
1020  issn          = {0148-0227}
1021}
1022
1023@article{         gerdes_93*1,
1024  author        = {R. Gerdes},
1025  title         = {A primitive equation ocean circulation model using a
1026                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
1027                  to an overflow problem},
1028  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1029  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1030  year          = {1993},
1031  doi           = {10.1029/93jc00788},
1032  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/93jc00788},
1033  pages         = {14703--14726},
1034  volume        = {98},
1035  number        = {C8},
1036  issn          = {0148-0227}
1037}
1038
1039@techreport{      gibson_86,
1040  author        = {J. K. Gibson},
1041  title         = {Standards for software development and maintenance},
1042  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
1043  year          = {1986},
1044  month         = {aug},
1045  doi           = {10.21957/gi113q4gn},
1046  url           = {https://www.ecmwf.int/node/9565},
1047  institution   = {ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom},
1048  pages         = {21},
1049  number        = {120}
1050}
1051
1052@book{            gill_82,
1053  author        = {A. E. Gill},
1054  booktitle     = {Atmosphere-Ocean Dynamics},
1055  publisher     = {Elsevier},
1056  issn          = {0074-6142},
1057  year          = {1982},
1058  month         = {nov},
1059  doi           = {10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1060  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0074-6142(08)x6002-4},
1061  isbn          = {978-0-12-283522-3},
1062  series        = {International Geophysics},
1063  pages         = {662},
1064  volume        = {30}
1065}
1066
1067@Article{         goff_10,
1068  author        = "J. A. Goff",
1069  title         = "Global prediction of abyssal hill root-mean-square heights
1070                  from small-scale altimetric gravity variability",
1071  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1072  issn          = "0148-0227",
1073  year          = "2010",
1074  volume        = "115",
1075  number        = "B12",
1076  month         = "dec",
1077  pages         = "B12104",
1078  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1079  doi           = "10.1029/2010jb007867",
1080  url           = "http://dx.doi.org/10.1029/2010JB007867",
1081}
1082
1083@article{         goosse.deleersnijder.ea_99,
1084  author        = {H. Goosse and E. Deleersnijder and T. Fichefet and M. H.
1085                  England},
1086  title         = {Sensitivity of a global coupled ocean-sea ice model to the
1087                  parameterization of vertical mixing},
1088  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1089  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1090  year          = {1999},
1091  month         = {jun},
1092  doi           = {10.1029/1999jc900099},
1093  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1999jc900099},
1094  pages         = {13681--13695},
1095  volume        = {104},
1096  number        = {C6},
1097  issn          = {0148-0227}
1098}
1099
1100@article{         graham.mcdougall_13,
1101  author        = {F. S. Graham and T. J. McDougall},
1102  title         = {Quantifying the nonconservative production of conservative
1103                  temperature, potential temperature, and entropy},
1104  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1105  publisher     = {American Meteorological Society},
1106  year          = {2013},
1107  month         = {may},
1108  doi           = {10.1175/jpo-d-11-0188.1},
1109  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-11-0188.1},
1110  pages         = {838--862},
1111  volume        = {43},
1112  number        = {5},
1113  issn          = {1520-0485}
1114}
1115
1116@article{         greatbatch_94,
1117  author        = {R. J. Greatbatch},
1118  title         = {A note on the representation of steric sea level in models
1119                  that conserve volume rather than mass},
1120  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1121  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1122  year          = {1994},
1123  doi           = {10.1029/94jc00847},
1124  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc00847},
1125  pages         = {12767--12771},
1126  volume        = {99},
1127  number        = {C6},
1128  issn          = {0148-0227}
1129}
1130
1131@article{         griffies.biastoch.ea_09,
1132  author        = {S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and F.
1133                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1134                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1135                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1136                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1137                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1138                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin},
1139  title         = {Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)},
1140  journal       = {Ocean Modelling},
1141  publisher     = {Elsevier BV},
1142  year          = {2009},
1143  month         = {jan},
1144  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1145  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.08.007},
1146  pages         = {1--46},
1147  volume        = {26},
1148  number        = {1-2},
1149  issn          = {1463-5003}
1150}
1151
1152@article{         griffies.gnanadesikan.ea_98,
1153  author        = {S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1154                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith},
1155  title         = {Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model},
1156  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1157  publisher     = {American Meteorological Society},
1158  year          = {1998},
1159  month         = {may},
1160  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1161  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2},
1162  pages         = {805--830},
1163  volume        = {28},
1164  number        = {5},
1165  issn          = {1520-0485}
1166}
1167
1168@article{         griffies.pacanowski.ea_01,
1169  author        = {S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1170                  Balaji},
1171  title         = {Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1172                  for z-coordinate Ocean Models},
1173  journal       = {Monthly Weather Review},
1174  publisher     = {American Meteorological Society},
1175  year          = {2001},
1176  month         = {may},
1177  doi           = {10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1178  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2},
1179  pages         = {1081--1098},
1180  volume        = {129},
1181  number        = {5},
1182  issn          = {1520-0493}
1183}
1184
1185@book{            griffies_04,
1186  author        = {S. M. Griffies},
1187  booktitle     = {Fundamentals of ocean climate models},
1188  publisher     = {Princeton University Press},
1189  year          = {2004},
1190  month         = {dec},
1191  doi           = {10.2307/j.ctv301gzg},
1192  url           = {http://dx.doi.org/10.2307/j.ctv301gzg},
1193  pages         = {434},
1194  isbn          = {978-0-691-18712-9}
1195}
1196
1197@article{         griffies_98,
1198  author        = {S. M. Griffies},
1199  title         = {The Gent-McWilliams skew-flux},
1200  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1201  publisher     = {American Meteorological Society},
1202  year          = {1998},
1203  month         = {may},
1204  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1205  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2},
1206  pages         = {831--841},
1207  volume        = {28},
1208  number        = {5},
1209  issn          = {1520-0485}
1210}
1211
1212@article{         guilyardi.madec.ea_01,
1213  author        = {E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray},
1214  title         = {The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1215                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}},
1216  journal       = {Climate Dynamics},
1217  publisher     = {Springer Science and Business Media LLC},
1218  year          = {2001},
1219  month         = {may},
1220  doi           = {10.1007/pl00007930},
1221  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/pl00007930},
1222  pages         = {589--599},
1223  volume        = {17},
1224  number        = {8},
1225  issn          = {0930-7575}
1226}
1227
1228@article{         haney_91,
1229  author        = {R. L. Haney},
1230  title         = {On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
1231                  Sigma Coordinate Ocean Models},
1232  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1233  publisher     = {American Meteorological Society},
1234  year          = {1991},
1235  month         = {apr},
1236  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
1237  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2},
1238  pages         = {610--619},
1239  volume        = {21},
1240  number        = {4},
1241  issn          = {1520-0485}
1242}
1243
1244@article{         hazeleger.drijfhout_00,
1245  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1246  title         = {A model study on internally generated variability in
1247                  subtropical mode water formation},
1248  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1249  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1250  year          = {2000},
1251  month         = {jun},
1252  doi           = {10.1029/2000jc900041},
1253  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900041},
1254  pages         = {13965--13979},
1255  volume        = {105},
1256  number        = {C6},
1257  issn          = {0148-0227}
1258}
1259
1260@article{         hazeleger.drijfhout_00*1,
1261  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1262  title         = {Eddy subduction in a model of the subtropical gyre},
1263  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1264  publisher     = {American Meteorological Society},
1265  year          = {2000},
1266  month         = {apr},
1267  doi           = {10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
1268  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2},
1269  pages         = {677--695},
1270  volume        = {30},
1271  number        = {4},
1272  issn          = {1520-0485}
1273}
1274
1275@article{         hazeleger.drijfhout_98,
1276  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1277  title         = {Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
1278                  response to anomalous forcing},
1279  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1280  publisher     = {American Meteorological Society},
1281  year          = {1998},
1282  month         = {feb},
1283  doi           = {10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
1284  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2},
1285  pages         = {266--288},
1286  volume        = {28},
1287  number        = {2},
1288  issn          = {1520-0485}
1289}
1290
1291@article{         hazeleger.drijfhout_99,
1292  author        = {W. Hazeleger and S. S. Drijfhout},
1293  title         = {Stochastically forced mode water variability},
1294  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1295  publisher     = {American Meteorological Society},
1296  year          = {1999},
1297  month         = {aug},
1298  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
1299  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2},
1300  pages         = {1772--1786},
1301  volume        = {29},
1302  number        = {8},
1303  issn          = {1520-0485}
1304}
1305
1306@article{         he.ding_01,
1307  author        = {Y. He and C. H. Q. Ding},
1308  title         = {Using accurate arithmetics to improve numerical
1309                  reproducibility and stability in parallel applications},
1310  journal       = {The Journal of Supercomputing},
1311  publisher     = {Springer Nature},
1312  year          = {2001},
1313  doi           = {10.1023/a:1008153532043},
1314  url           = {http://dx.doi.org/10.1023/A:1008153532043},
1315  pages         = {259--277},
1316  volume        = {18},
1317  number        = {3},
1318  issn          = {0920-8542}
1319}
1320
1321@article{         hirt.amsden.ea_74,
1322  author        = {C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook},
1323  title         = {An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
1324                  flow speeds},
1325  journal       = {Journal of Computational Physics},
1326  publisher     = {Elsevier BV},
1327  year          = {1974},
1328  month         = {mar},
1329  doi           = {10.1016/0021-9991(74)90051-5},
1330  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(74)90051-5},
1331  pages         = {227--253},
1332  volume        = {14},
1333  number        = {3},
1334  issn          = {0021-9991}
1335}
1336
1337@article{         hofmeister.burchard.ea_10,
1338  author        = {R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers},
1339  title         = {Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
1340                  ocean models},
1341  journal       = {Ocean Modelling},
1342  publisher     = {Elsevier BV},
1343  year          = {2010},
1344  month         = {jan},
1345  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
1346  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.12.003},
1347  pages         = {70--86},
1348  volume        = {33},
1349  number        = {1-2},
1350  issn          = {1463-5003}
1351}
1352
1353@article{         holland.jenkins_99,
1354  author        = {D. M. Holland and A. Jenkins},
1355  title         = {Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the
1356                  base of an ice shelf},
1357  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1358  publisher     = {American Meteorological Society},
1359  year          = {1999},
1360  month         = {aug},
1361  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
1362  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2},
1363  pages         = {1787--1800},
1364  volume        = {29},
1365  number        = {8},
1366  issn          = {1520-0485}
1367}
1368
1369@techreport{      hunter_06,
1370  author        = {J. R. Hunter},
1371  title         = {Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities},
1372  year          = {2006},
1373  month         = {jun},
1374  url           = {http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf},
1375  institution   = {Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
1376                  Centre},
1377  pages         = {17},
1378  number        = {7}
1379}
1380
1381@article{         jackson.rehmann_14,
1382  author        = {P. R. Jackson and C. R. Rehmann},
1383  title         = {Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
1384                  a sheared, stratified flow},
1385  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1386  publisher     = {American Meteorological Society},
1387  year          = {2014},
1388  month         = {oct},
1389  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0027.1},
1390  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0027.1},
1391  pages         = {2661--2680},
1392  volume        = {44},
1393  number        = {10},
1394  issn          = {1520-0485}
1395}
1396
1397@techreport{      janssen.breivik.ea_13,
1398  author        = {P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
1399                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
1400                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni},
1401  title         = {Air-sea interaction and surface waves},
1402  year          = {2013},
1403  month         = {nov},
1404  doi           = {10.21957/0kg73joh},
1405  url           = {https://www.ecmwf.int/node/10238},
1406  pages         = {36},
1407  volume        = {712},
1408  series        = {ECMWF Technical Memoranda},
1409  institution   = {ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom}
1410}
1411
1412@article{         jenkins.nicholls.ea_10,
1413  author        = {A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr},
1414  title         = {Observation and parameterization of ablation at the base
1415                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica},
1416  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1417  publisher     = {American Meteorological Society},
1418  year          = {2010},
1419  month         = {oct},
1420  doi           = {10.1175/2010jpo4317.1},
1421  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2010jpo4317.1},
1422  pages         = {2298--2312},
1423  volume        = {40},
1424  number        = {10},
1425  issn          = {1520-0485}
1426}
1427
1428@article{         jenkins_91,
1429  author        = {A. Jenkins},
1430  title         = {A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction},
1431  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1432  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1433  year          = {1991},
1434  doi           = {10.1029/91jc01842},
1435  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc01842},
1436  pages         = {20671--20677},
1437  volume        = {96},
1438  number        = {C11},
1439  issn          = {0148-0227}
1440}
1441
1442@article{         kantha.carniel_03,
1443  author        = {L. Kantha and S. Carniel},
1444  title         = {Comments on ``{A} generic length-scale equation for
1445                  geophysical turbulence models'' by {L}. Umlauf and {H}.
1446                  Burchard},
1447  journal       = {Journal of Marine Research},
1448  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
1449  year          = {2003},
1450  month         = {sep},
1451  doi           = {10.1357/002224003771816007},
1452  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003771816007},
1453  pages         = {693--702},
1454  volume        = {61},
1455  number        = {5},
1456  issn          = {1543-9542}
1457}
1458
1459@article{         kantha.clayson_94,
1460  author        = {L. H. Kantha and C. A. Clayson},
1461  title         = {An improved mixed layer model for geophysical
1462                  applications},
1463  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1464  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1465  year          = {1994},
1466  doi           = {10.1029/94jc02257},
1467  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/94jc02257},
1468  pages         = {25235--25266},
1469  volume        = {99},
1470  number        = {C12},
1471  issn          = {0148-0227}
1472}
1473
1474@article{         kasahara_74,
1475  author        = {A. Kasahara},
1476  title         = {Various vertical coordinate systems used for numerical
1477                  weather prediction},
1478  journal       = {Monthly Weather Review},
1479  publisher     = {American Meteorological Society},
1480  year          = {1974},
1481  month         = {jul},
1482  doi           = {10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
1483  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2},
1484  pages         = {509--522},
1485  volume        = {102},
1486  number        = {7},
1487  issn          = {1520-0493}
1488}
1489
1490@article{         killworth.stainforth.ea_91,
1491  author        = {P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
1492                  Paterson},
1493  title         = {The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner
1494                  ocean model},
1495  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1496  publisher     = {American Meteorological Society},
1497  year          = {1991},
1498  month         = {sep},
1499  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
1500  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2},
1501  pages         = {1333--1348},
1502  volume        = {21},
1503  number        = {9},
1504  issn          = {1520-0485}
1505}
1506
1507@inproceedings{   killworth_89,
1508  author        = {P. D. Killworth},
1509  title         = {On the parameterization of deep convection in ocean
1510                  models},
1511  booktitle     = {Parameterization of small-scale processes},
1512  publisher     = {Hawaii Institute of Geophysics},
1513  editor        = {P. Muller and D. Henderson},
1514  year          = {1989},
1515  month         = {jan},
1516  url           = {http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf},
1517  pages         = {59--74}
1518}
1519
1520@article{         killworth_92,
1521  author        = {P. D. Killworth},
1522  title         = {An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
1523                  Antarctic model},
1524  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1525  publisher     = {American Meteorological Society},
1526  year          = {1992},
1527  month         = {nov},
1528  doi           = {10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
1529  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2},
1530  pages         = {1379--1387},
1531  volume        = {22},
1532  number        = {11},
1533  issn          = {1520-0485}
1534}
1535
1536@article{         koch-larrouy.lengaigne.ea_10,
1537  author        = {A. Koch-Larrouy and M. Lengaigne and P. Terray and G.
1538                  Madec and S. Masson},
1539  title         = {Tidal mixing in the Indonesian Seas and its effect on the
1540                  tropical climate system},
1541  journal       = {Climate Dynamics},
1542  publisher     = {Springer Nature},
1543  year          = {2010},
1544  month         = {aug},
1545  doi           = {10.1007/s00382-009-0642-4},
1546  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-009-0642-4},
1547  pages         = {891--904},
1548  volume        = {34},
1549  number        = {6},
1550  issn          = {1432-0894}
1551}
1552
1553@article{         koch-larrouy.madec.ea_07,
1554  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
1555                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard},
1556  title         = {On the transformation of Pacific water into Indonesian
1557                  ThroughFlow water by internal tidal mixing},
1558  journal       = {Geophysical Research Letters},
1559  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1560  year          = {2007},
1561  month         = {feb},
1562  doi           = {10.1029/2006gl028405},
1563  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2006GL028405},
1564  pages         = {L04604},
1565  volume        = {34},
1566  number        = {4},
1567  issn          = {0094-8276}
1568}
1569
1570@article{         koch-larrouy.madec.ea_08,
1571  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and B. Blanke and R.
1572                  Molcard},
1573  title         = {Water mass transformation along the Indonesian ThroughFlow
1574                  in an {OGCM}},
1575  journal       = {Ocean Dynamics},
1576  publisher     = {Springer Nature},
1577  year          = {2008},
1578  month         = {oct},
1579  doi           = {10.1007/s10236-008-0155-4},
1580  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0155-4},
1581  pages         = {289--309},
1582  volume        = {58},
1583  number        = {3-4},
1584  issn          = {1616-7228}
1585}
1586
1587@article{         koch-larrouy.madec.ea_08*1,
1588  author        = {A. Koch-Larrouy and G. Madec and D. Iudicone and A.
1589                  Atmadipoera and R. Molcard},
1590  title         = {Physical processes contributing to the water mass
1591                  transformation of the Indonesian ThroughFlow},
1592  journal       = {Ocean Dynamics},
1593  publisher     = {Springer Nature},
1594  year          = {2008},
1595  month         = {oct},
1596  doi           = {10.1007/s10236-008-0154-5},
1597  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s10236-008-0154-5},
1598  pages         = {275--288},
1599  volume        = {58},
1600  number        = {3-4},
1601  issn          = {1616-7228}
1602}
1603
1604@article{         kolmogorov_42,
1605  author        = {A. N. Kolmogorov},
1606  title         = {Equations of turbulent motion in an incompressible fluid},
1607  journal       = {Izvestiya Akademiya Nauk SSSR},
1608  year          = {1942},
1609  series        = {Fizika},
1610  pages         = {56--58},
1611  volume        = {6}
1612}
1613
1614@techreport{      large.yeager_04,
1615  author        = {W. G. Large and S. G. Yeager},
1616  title         = {Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
1617                  models: the data sets and flux climatologies},
1618  year          = {2004},
1619  month         = {may},
1620  doi           = {10.5065/d6kk98q6},
1621  url           = {http://dx.doi.org/10.5065/D6KK98Q6},
1622  institution   = {{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO, United States}
1623}
1624
1625@article{         lavergne.madec.ea_16*1,
1626  author        = {C. {de Lavergne} and G. Madec and J. {Le Sommer} and A. J. G.
1627                  Nurser and A. C. Naveira Garabato},
1628  title         = {The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
1629                  overturning},
1630  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1631  publisher     = {American Meteorological Society},
1632  year          = {2016},
1633  month         = {feb},
1634  doi           = {10.1175/jpo-d-14-0259.1},
1635  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-14-0259.1},
1636  pages         = {663--681},
1637  volume        = {46},
1638  number        = {2},
1639  issn          = {1520-0485}
1640}
1641
1642@article{         lazar.madec.ea_99,
1643  author        = {A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
1644  title         = {The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
1645                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}},
1646  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1647  publisher     = {American Meteorological Society},
1648  year          = {1999},
1649  month         = {nov},
1650  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
1651  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2},
1652  pages         = {2945--2961},
1653  volume        = {29},
1654  number        = {11},
1655  issn          = {1520-0485}
1656}
1657
1658@phdthesis{       lazar_97,
1659  author        = {A. Lazar},
1660  title         = {La branche froide de la circulation thermohaline -
1661                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
1662                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale id\'{e}alis\'{e}e},
1663  year          = {1997},
1664  url           = {http://www.theses.fr/1997PA066680},
1665  pages         = {269},
1666  school        = {Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France}
1667}
1668
1669@article{         le-sommer.penduff.ea_09,
1670  author        = {J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
1671                  and B. Barnier},
1672  title         = {How momentum advection schemes influence
1673                  current-topography interactions at eddy permitting
1674                  resolution},
1675  journal       = {Ocean Modelling},
1676  publisher     = {Elsevier BV},
1677  year          = {2009},
1678  month         = {jan},
1679  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
1680  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.007},
1681  pages         = {1--14},
1682  volume        = {29},
1683  number        = {1},
1684  issn          = {1463-5003}
1685}
1686
1687@article{         leclair.madec_09,
1688  author        = {M. Leclair and G. Madec},
1689  title         = {A conservative leapfrog time stepping method},
1690  journal       = {Ocean Modelling},
1691  publisher     = {Elsevier BV},
1692  year          = {2009},
1693  month         = {jan},
1694  doi           = {10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
1695  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2009.06.006},
1696  pages         = {88--94},
1697  volume        = {30},
1698  number        = {2-3},
1699  issn          = {1463-5003}
1700}
1701
1702@article{         leclair.madec_11,
1703  author        = {M. Leclair and G. Madec},
1704  title         = {$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
1705                  coordinate separating high and low frequency motions},
1706  journal       = {Ocean Modelling},
1707  publisher     = {Elsevier BV},
1708  year          = {2011},
1709  doi           = {10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
1710  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2011.02.001},
1711  pages         = {139--152},
1712  volume        = {37},
1713  number        = {3-4},
1714  issn          = {1463-5003}
1715}
1716
1717@phdthesis{       leclair_10,
1718  author        = {M. Leclair},
1719  title         = {Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
1720                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an {NEMO}},
1721  year          = {2010},
1722  url           = {http://www.theses.fr/2010PA066728},
1723  pages         = {163},
1724  school        = {Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France}
1725}
1726
1727@article{         lele_92,
1728  author        = {S. K. Lele},
1729  title         = {Compact finite difference schemes with spectral-like
1730                  resolution},
1731  journal       = {Journal of Computational Physics},
1732  publisher     = {Elsevier BV},
1733  year          = {1992},
1734  month         = {nov},
1735  doi           = {10.1016/0021-9991(92)90324-r},
1736  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(92)90324-r},
1737  pages         = {16--42},
1738  volume        = {103},
1739  number        = {1},
1740  issn          = {0021-9991}
1741}
1742
1743@article{         lemarie.debreu.ea_12,
1744  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
1745                  C. McWilliams},
1746  title         = {On the stability and accuracy of the harmonic and
1747                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models},
1748  journal       = {Ocean Modelling},
1749  publisher     = {Elsevier BV},
1750  year          = {2012},
1751  month         = {aug},
1752  doi           = {10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
1753  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2012.04.007},
1754  pages         = {9--35},
1755  volume        = {52-53},
1756  issn          = {1463-5003}
1757}
1758
1759@article{         lemarie.debreu.ea_15,
1760  author        = {F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
1761                  and J. M. Molines and M. Honnorat},
1762  title         = {Stability constraints for oceanic numerical models:
1763                  implications for the formulation of time and space
1764                  discretizations},
1765  journal       = {Ocean Modelling},
1766  publisher     = {Elsevier BV},
1767  year          = {2015},
1768  month         = {aug},
1769  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
1770  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.06.006},
1771  pages         = {124--148},
1772  volume        = {92},
1773  issn          = {1463-5003}
1774}
1775
1776@article{         lengaigne.madec.ea_03,
1777  author        = {M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes},
1778  title         = {Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
1779                  circulation},
1780  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1781  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1782  year          = {2003},
1783  doi           = {10.1029/2002jc001704},
1784  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002JC001704},
1785  pages         = {3345},
1786  volume        = {108},
1787  number        = {C11},
1788  issn          = {0148-0227}
1789}
1790
1791@article{         lengaigne.menkes.ea_07,
1792  author        = {M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
1793                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec},
1794  title         = {Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
1795                  climate in a Coupled General Circulation Model},
1796  journal       = {Climate Dynamics},
1797  publisher     = {Springer Nature},
1798  year          = {2007},
1799  month         = {nov},
1800  doi           = {10.1007/s00382-006-0200-2},
1801  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/s00382-006-0200-2},
1802  pages         = {503--516},
1803  volume        = {28},
1804  number        = {5},
1805  issn          = {1432-0894}
1806}
1807
1808@article{         leonard_79,
1809  author        = {B. P. Leonard},
1810  title         = {A stable and accurate convective modelling procedure based
1811                  on quadratic upstream interpolation},
1812  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
1813  publisher     = {Elsevier BV},
1814  year          = {1979},
1815  month         = {jun},
1816  doi           = {10.1016/0045-7825(79)90034-3},
1817  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(79)90034-3},
1818  pages         = {59--98},
1819  volume        = {19},
1820  number        = {1},
1821  issn          = {0045-7825}
1822}
1823
1824@article{         leonard_91,
1825  author        = {B. P. Leonard},
1826  title         = {The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
1827                  unsteady one-dimensional advection},
1828  journal       = {Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering},
1829  publisher     = {Elsevier BV},
1830  year          = {1991},
1831  month         = {jun},
1832  doi           = {10.1016/0045-7825(91)90232-u},
1833  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0045-7825(91)90232-u},
1834  pages         = {17--74},
1835  volume        = {88},
1836  number        = {1},
1837  issn          = {0045-7825}
1838}
1839
1840@article{         lermusiaux_01,
1841  author        = {P. F. J. Lermusiaux},
1842  title         = {Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
1843                  ocean variability: Massachusetts Bay},
1844  journal       = {Journal of Marine Systems},
1845  publisher     = {Elsevier BV},
1846  year          = {2001},
1847  month         = {may},
1848  doi           = {10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
1849  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0924-7963(01)00025-2},
1850  pages         = {385--422},
1851  volume        = {29},
1852  number        = {1-4},
1853  issn          = {0924-7963}
1854}
1855
1856@techreport{      levier.treguier.ea_mersea07,
1857  author        = {B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
1858                  Garnier},
1859  title         = {Free surface and variable volume in the {NEMO} code},
1860  year          = {2007},
1861  month         = {may},
1862  doi           = {10.5281/zenodo.3244182},
1863  url           = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3244182},
1864  institution   = {European Union: Marine Environment and Security for the
1865                  European Area (MERSEA) Integrated Project},
1866  pages         = {47}
1867}
1868
1869@article{         levy.estublier.ea_01,
1870  author        = {M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec},
1871  title         = {Choice of an advection scheme for biogeochemical models},
1872  journal       = {Geophysical Research Letters},
1873  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1874  year          = {2001},
1875  month         = {oct},
1876  doi           = {10.1029/2001gl012947},
1877  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2001gl012947},
1878  pages         = {3725--3728},
1879  volume        = {28},
1880  number        = {19},
1881  issn          = {0094-8276}
1882}
1883
1884@article{         levy.klein.ea_10,
1885  author        = {M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
1886                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi},
1887  title         = {Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
1888                  physics},
1889  journal       = {Ocean Modelling},
1890  publisher     = {Elsevier BV},
1891  year          = {2010},
1892  month         = {jan},
1893  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
1894  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.04.001},
1895  pages         = {1--15},
1896  volume        = {34},
1897  number        = {1-2},
1898  issn          = {1463-5003}
1899}
1900
1901@article{         li.garrett_93,
1902  author        = {M. Li and C. Garrett},
1903  title         = {Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
1904                  circulation},
1905  journal       = {Journal of Marine Research},
1906  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
1907  year          = {1993},
1908  month         = {nov},
1909  doi           = {10.1357/0022240933223945},
1910  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/0022240933223945},
1911  pages         = {737--769},
1912  volume        = {51},
1913  number        = {4},
1914  issn          = {1543-9542}
1915}
1916
1917@article{         losch_08,
1918  author        = {M. Losch},
1919  title         = {Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
1920                  General Circulation Model},
1921  journal       = {Journal of Geophysical Research},
1922  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
1923  year          = {2008},
1924  month         = {aug},
1925  doi           = {10.1029/2007jc004368},
1926  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2007jc004368},
1927  volume        = {113},
1928  number        = {C8},
1929  issn          = {0148-0227}
1930}
1931
1932@article{         lott.madec.ea_90,
1933  author        = {F. Lott and G. Madec and J. Verron},
1934  title         = {Topographic experiments in an Ocean General Circulation
1935                  Model},
1936  journal       = {Ocean Modelling},
1937  year          = {1990},
1938  pages         = {1--4},
1939  volume        = {88}
1940}
1941
1942@article{         madec.chartier.ea_91,
1943  author        = {G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon},
1944  title         = {The effect of thermohaline forcing variability on deep
1945                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
1946                  high-resolution three-dimensional numerical study},
1947  journal       = {Dynamics of Atmospheres and Oceans},
1948  publisher     = {Elsevier BV},
1949  year          = {1991},
1950  month         = {apr},
1951  doi           = {10.1016/0377-0265(91)90024-a},
1952  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0377-0265(91)90024-a},
1953  pages         = {301--332},
1954  volume        = {15},
1955  number        = {3-5},
1956  issn          = {0377-0265}
1957}
1958
1959@inproceedings{   madec.crepon_91,
1960  author        = {G. Madec and M. Cr\'{e}pon},
1961  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
1962                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
1963                  deep convection and deep water formation in the oceans",
1964  publisher     = {Elsevier},
1965  editor        = {P.C. Chu and J.C. Gascard},
1966  year          = {1991},
1967  doi           = {10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
1968  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0422-9894(08)70071-0},
1969  title         = {Thermohaline-driven deep water formation in the
1970                  northwestern Mediterranean Sea},
1971  chapter       = {15},
1972  series        = {Elsevier Oceanography},
1973  volume        = {57},
1974  pages         = {241--265},
1975  issn          = {0422-9894},
1976  isbn          = {978-0-444-88764-1}
1977}
1978
1979@article{         madec.delecluse.ea_91,
1980  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
1981                  Chartier},
1982  title         = {A three-dimensional numerical study of deep-water
1983                  formation in the northwestern Mediterranean Sea},
1984  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
1985  publisher     = {American Meteorological Society},
1986  year          = {1991},
1987  month         = {sep},
1988  doi           = {10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
1989  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2},
1990  pages         = {1349--1371},
1991  volume        = {21},
1992  number        = {9},
1993  issn          = {1520-0485}
1994}
1995
1996@article{         madec.delecluse.ea_96,
1997  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
1998                  Lott},
1999  title         = {Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
2000                  northwestern Mediterranean Sea},
2001  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2002  publisher     = {American Meteorological Society},
2003  year          = {1996},
2004  month         = {aug},
2005  doi           = {10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
2006  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2},
2007  pages         = {1393--1408},
2008  volume        = {26},
2009  number        = {8},
2010  issn          = {1520-0485}
2011}
2012
2013@book{            madec.delecluse.ea_98,
2014  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
2015                  L\'{e}vy},
2016  title         = {{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
2017                  manual},
2018  journal       = {Note du Pole de Mod\'{e}lisation},
2019  publisher     = {Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})},
2020  year          = {1998},
2021  url           = {http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf},
2022  pages         = {91},
2023  issn          = {1288-1619},
2024  volume        = {11}
2025}
2026
2027@article{         madec.delecluse_97,
2028  author        = {G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
2029  title         = {The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
2030                  Coupled Model},
2031  journal       = {International WOCE Newsletter},
2032  publisher     = {University of Southampton},
2033  year          = {1997},
2034  month         = {apr},
2035  url           = {https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf},
2036  pages         = {12--15},
2037  volume        = {26}
2038}
2039
2040@article{         madec.imbard_96,
2041  author        = {G. Madec and M. Imbard},
2042  title         = {A global ocean mesh to overcome the North Pole
2043                  singularity},
2044  journal       = {Climate Dynamics},
2045  publisher     = {Springer Nature},
2046  year          = {1996},
2047  month         = {may},
2048  doi           = {10.1007/bf00211684},
2049  url           = {http://dx.doi.org/10.1007/bf00211684},
2050  pages         = {381--388},
2051  volume        = {12},
2052  number        = {6},
2053  issn          = {1432-0894}
2054}
2055
2056@article{         maltrud.smith.ea_98,
2057  author        = {M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
2058                  Malone},
2059  title         = {Global eddy-resolving ocean simulations driven by
2060                  1985-1995 atmospheric winds},
2061  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2062  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2063  year          = {1998},
2064  month         = {dec},
2065  doi           = {10.1029/1998jc900013},
2066  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/1998jc900013},
2067  pages         = {30825--30853},
2068  volume        = {103},
2069  number        = {C13},
2070  issn          = {0148-0227}
2071}
2072
2073@article{         marchesiello.williams.ea_01,
2074  author        = {P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin},
2075  title         = {Open boundary conditions for long-term integration of
2076                  regional oceanic models},
2077  journal       = {Ocean Modelling},
2078  publisher     = {Elsevier BV},
2079  year          = {2001},
2080  month         = {jan},
2081  doi           = {10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
2082  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(00)00013-5},
2083  pages         = {1--20},
2084  volume        = {3},
2085  number        = {1-2},
2086  issn          = {1463-5003}
2087}
2088
2089@article{         marsaleix.auclair.ea_08,
2090  author        = {P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
2091                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses},
2092  title         = {Energy conservation issues in sigma-coordinate
2093                  free-surface ocean models},
2094  journal       = {Ocean Modelling},
2095  publisher     = {Elsevier BV},
2096  year          = {2008},
2097  month         = {jan},
2098  doi           = {10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
2099  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2007.07.005},
2100  pages         = {61--89},
2101  volume        = {20},
2102  number        = {1},
2103  issn          = {1463-5003}
2104}
2105
2106@article{         marsh.ivchenko.ea_15,
2107  author        = {R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
2108                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
2109                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. {Le Sommer} and N.
2110                  Merino and V. B. Zalesny},
2111  title         = {{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
2112                  ocean model globally configured at eddy-permitting
2113                  resolution},
2114  journal       = {Geoscientific Model Development},
2115  publisher     = {Copernicus GmbH},
2116  year          = {2015},
2117  month         = {may},
2118  doi           = {10.5194/gmd-8-1547-2015},
2119  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-8-1547-2015},
2120  pages         = {1547--1562},
2121  volume        = {8},
2122  number        = {5},
2123  issn          = {1991-9603}
2124}
2125
2126@article{         marti.madec.ea_92,
2127  author        = {O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse},
2128  title         = {Comment on ``{N}et diffusivity in ocean general circulation
2129                  models with nonuniform grids'' by {F}. {L}. Yin and {I}.
2130                  {Y}. Fung},
2131  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2132  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2133  year          = {1992},
2134  doi           = {10.1029/92jc00306},
2135  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00306},
2136  pages         = {12763--12766},
2137  volume        = {97},
2138  number        = {C8},
2139  issn          = {0148-0227}
2140}
2141
2142@article{         martin.adcroft_10,
2143  author        = {T. Martin and A. Adcroft},
2144  title         = {Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
2145                  with interactive icebergs in a coupled climate model},
2146  journal       = {Ocean Modelling},
2147  publisher     = {Elsevier BV},
2148  year          = {2010},
2149  month         = {jan},
2150  doi           = {10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
2151  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2010.05.001},
2152  pages         = {111--124},
2153  volume        = {34},
2154  number        = {3-4},
2155  issn          = {1463-5003}
2156}
2157
2158@article{         mathiot.jenkins.ea_17,
2159  author        = {P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec},
2160  title         = {Explicit representation and parametrised impacts of under
2161                  ice shelf seas in the \zstar coordinate ocean model {NEMO}
2162                  3.6},
2163  journal       = {Geoscientific Model Development},
2164  publisher     = {Copernicus GmbH},
2165  year          = {2017},
2166  month         = {jul},
2167  doi           = {10.5194/gmd-10-2849-2017},
2168  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/gmd-10-2849-2017},
2169  pages         = {2849--2874},
2170  volume        = {10},
2171  number        = {7},
2172  issn          = {1991-9603}
2173}
2174
2175@article{         mcdougall.taylor_84,
2176  author        = {T. J. McDougall and J. R. Taylor},
2177  title         = {Flux measurements across a finger interface at low values
2178                  of the stability ratio},
2179  journal       = {Journal of Marine Research},
2180  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2181  year          = {1984},
2182  month         = {feb},
2183  doi           = {10.1357/002224084788506095},
2184  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788506095},
2185  pages         = {1--14},
2186  volume        = {42},
2187  number        = {1},
2188  issn          = {1543-9542}
2189}
2190
2191@article{         mcdougall_87,
2192  author        = {T. J. McDougall},
2193  title         = {Neutral Surfaces},
2194  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2195  publisher     = {American Meteorological Society},
2196  year          = {1987},
2197  month         = {nov},
2198  doi           = {10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2},
2199  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1987)017<1950:NS>2.0.CO;2},
2200  pages         = {1950--1964},
2201  volume        = {17},
2202  number        = {11},
2203  issn          = {1520-0485}
2204}
2205
2206@article{         mellor.blumberg_04,
2207  author        = {G. Mellor and A. Blumberg},
2208  title         = {Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response},
2209  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2210  publisher     = {American Meteorological Society},
2211  year          = {2004},
2212  month         = {mar},
2213  doi           = {10.1175/2517.1},
2214  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/2517.1},
2215  pages         = {693--698},
2216  volume        = {34},
2217  number        = {3},
2218  issn          = {1520-0485}
2219}
2220
2221@article{         mellor.yamada_82,
2222  author        = {G. L. Mellor and T. Yamada},
2223  title         = {Development of a turbulence closure model for geophysical
2224                  fluid problems},
2225  journal       = {Reviews of Geophysics},
2226  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2227  year          = {1982},
2228  doi           = {10.1029/rg020i004p00851},
2229  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/rg020i004p00851},
2230  pages         = {851--875},
2231  volume        = {20},
2232  number        = {4},
2233  issn          = {8755-1209}
2234}
2235
2236@article{         merryfield.holloway.ea_99,
2237  author        = {W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett},
2238  title         = {A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing},
2239  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2240  publisher     = {American Meteorological Society},
2241  year          = {1999},
2242  month         = {jun},
2243  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
2244  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2},
2245  pages         = {1124--1142},
2246  volume        = {29},
2247  number        = {6},
2248  issn          = {1520-0485}
2249}
2250
2251@book{            mesinger.arakawa_76,
2252  author        = {F. Mesinger and A. Arakawa},
2253  booktitle     = {Numerical methods used in atmospheric models},
2254  year          = {1976},
2255  month         = {aug},
2256  url           = {https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models},
2257  series        = {GARP Publication},
2258  volume        = {1},
2259  number        = {17}
2260}
2261
2262@article{         morel.berthon_89,
2263  author        = {A. Morel and J.-F. Berthon},
2264  title         = {Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
2265                  production of the euphotic layer: Relationships
2266                  reinvestigated in view of remote-sensing applications},
2267  journal       = {Limnology and Oceanography},
2268  publisher     = {Wiley},
2269  year          = {1989},
2270  month         = {dec},
2271  doi           = {10.4319/lo.1989.34.8.1545},
2272  url           = {http://dx.doi.org/10.4319/lo.1989.34.8.1545},
2273  pages         = {1545--1562},
2274  volume        = {34},
2275  number        = {8},
2276  issn          = {0024-3590}
2277}
2278
2279@article{         morel.maritorena_01,
2280  author        = {A. Morel and S. Maritorena},
2281  title         = {Bio-optical properties of oceanic waters: {A}
2282                  reappraisal},
2283  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2284  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2285  year          = {2001},
2286  month         = {apr},
2287  doi           = {10.1029/2000jc000319},
2288  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc000319},
2289  pages         = {7163--7180},
2290  volume        = {106},
2291  number        = {C4},
2292  issn          = {0148-0227}
2293}
2294
2295@article{         morel_88,
2296  author        = {A. Morel},
2297  title         = {Optical modeling of the upper ocean in relation to its
2298                  biogenous matter content (case {I} waters)},
2299  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2300  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2301  year          = {1988},
2302  doi           = {10.1029/jc093ic09p10749},
2303  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc093ic09p10749},
2304  pages         = {10749--10768},
2305  volume        = {93},
2306  number        = {C9},
2307  issn          = {0148-0227}
2308}
2309
2310@article{         murray_96,
2311  author        = {R. J. Murray},
2312  title         = {Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models},
2313  journal       = {Journal of Computational Physics},
2314  publisher     = {Elsevier BV},
2315  year          = {1996},
2316  month         = {jul},
2317  doi           = {10.1006/jcph.1996.0136},
2318  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1996.0136},
2319  pages         = {251--273},
2320  volume        = {126},
2321  number        = {2},
2322  issn          = {0021-9991}
2323}
2324
2325@article{         oey_06,
2326  author        = {L.-Y. Oey},
2327  title         = {An {OGCM} with movable land-sea boundaries},
2328  journal       = {Ocean Modelling},
2329  publisher     = {Elsevier BV},
2330  year          = {2006},
2331  month         = {jan},
2332  doi           = {10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
2333  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2006.01.001},
2334  pages         = {176--195},
2335  volume        = {13},
2336  number        = {2},
2337  issn          = {1463-5003}
2338}
2339
2340@article{         osborn_80,
2341  author        = {T. R. Osborn},
2342  title         = {Estimates of the local rate of vertical diffusion from
2343                  dissipation measurements},
2344  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2345  publisher     = {American Meteorological Society},
2346  year          = {1980},
2347  month         = {jan},
2348  doi           = {10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
2349  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2},
2350  pages         = {83--89},
2351  volume        = {10},
2352  number        = {1},
2353  issn          = {1520-0485}
2354}
2355
2356@article{         pacanowski.gnanadesikan_98,
2357  author        = {R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan},
2358  title         = {Transient response in a z-level ocean model that resolves
2359                  topography with partial-cells},
2360  journal       = {Monthly Weather Review},
2361  publisher     = {American Meteorological Society},
2362  year          = {1998},
2363  month         = {dec},
2364  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
2365  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2},
2366  pages         = {3248--3270},
2367  volume        = {126},
2368  number        = {12},
2369  issn          = {1520-0493}
2370}
2371
2372@article{         pacanowski.philander_81,
2373  author        = {R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander},
2374  title         = {Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
2375                  Tropical Oceans},
2376  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2377  publisher     = {American Meteorological Society},
2378  year          = {1981},
2379  month         = {nov},
2380  doi           = {10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
2381  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2},
2382  pages         = {1443--1451},
2383  volume        = {11},
2384  number        = {11},
2385  issn          = {1520-0485}
2386}
2387
2388@article{         paulson.simpson_77,
2389  author        = {C. A. Paulson and J. J. Simpson},
2390  title         = {Irradiance Measurements in the Upper Ocean},
2391  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2392  publisher     = {American Meteorological Society},
2393  year          = {1977},
2394  month         = {nov},
2395  doi           = {10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
2396  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2},
2397  pages         = {952--956},
2398  volume        = {7},
2399  number        = {6},
2400  issn          = {1520-0485}
2401}
2402
2403@article{         penduff.sommer.ea_07,
2404  author        = {T. Penduff and J. {Le Sommer} and B. Barnier and A.-M.
2405                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec},
2406  title         = {Influence of numerical schemes on current-topography
2407                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations},
2408  journal       = {Ocean Science},
2409  publisher     = {Copernicus GmbH},
2410  year          = {2007},
2411  month         = {dec},
2412  doi           = {10.5194/os-3-509-2007},
2413  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/os-3-509-2007},
2414  pages         = {509--524},
2415  volume        = {3},
2416  number        = {4},
2417  issn          = {1812-0792}
2418}
2419
2420@article{         phillips_59,
2421  author        = {R. S. Phillips},
2422  title         = {Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
2423                  differential equations},
2424  journal       = {Transactions of the American Mathematical Society},
2425  publisher     = {American Mathematical Society (AMS)},
2426  year          = {1959},
2427  month         = {feb},
2428  doi           = {10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1},
2429  url           = {http://dx.doi.org/10.1090/S0002-9947-1959-0104919-1},
2430  pages         = {193--254},
2431  volume        = {90},
2432  number        = {2},
2433  issn          = {0002-9947}
2434}
2435
2436@article{         redi_82,
2437  author        = {M. H. Redi},
2438  title         = {Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation},
2439  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2440  publisher     = {American Meteorological Society},
2441  year          = {1982},
2442  month         = {oct},
2443  doi           = {10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
2444  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2},
2445  pages         = {1154--1158},
2446  volume        = {12},
2447  number        = {10},
2448  issn          = {1520-0485}
2449}
2450
2451@book{            richtmyer.morton_67,
2452  author        = {R. D. Richtmyer and K. W. Morton},
2453  booktitle     = {Difference methods for initial-value problems},
2454  publisher     = {Interscience},
2455  year          = {1967},
2456  url           = {https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ},
2457  pages         = {405},
2458  edition       = {2},
2459  isbn          = {9780470720400},
2460  issn          = {0074-994X},
2461  series        = {Interscience tracts in pure and applied mathematics}
2462}
2463
2464@article{         robert_66,
2465  author        = {A. J. Robert},
2466  title         = {The integration of a low order spectral form of the
2467                  primitive meteorological equations},
2468  journal       = {Journal of the Meteorological Society of Japan},
2469  publisher     = {Meteorological Society of Japan},
2470  year          = {1966},
2471  doi           = {10.2151/jmsj1965.44.5\_237},
2472  url           = {http://dx.doi.org/10.2151/jmsj1965.44.5_237},
2473  pages         = {237--245},
2474  volume        = {44},
2475  number        = {5},
2476  issn          = {2186-9057}
2477}
2478
2479@article{         rodgers.aumont.ea_14,
2480  author        = {K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
2481                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. {de Boyer Mont\'{e}gut}
2482                  and D. Iudicone and R. F. Keeling and G. Madec and R.
2483                  Wanninkhof},
2484  title         = {Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
2485                  nutrient cycling to wind stirring},
2486  journal       = {Biogeosciences},
2487  publisher     = {Copernicus GmbH},
2488  year          = {2014},
2489  month         = {aug},
2490  doi           = {10.5194/bg-11-4077-2014},
2491  url           = {http://dx.doi.org/10.5194/bg-11-4077-2014},
2492  pages         = {4077--4098},
2493  volume        = {11},
2494  number        = {15},
2495  issn          = {1726-4189}
2496}
2497
2498@article{         rodi_87,
2499  author        = {W. Rodi},
2500  title         = {Examples of calculation methods for flow and mixing in
2501                  stratified fluids},
2502  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2503  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2504  year          = {1987},
2505  doi           = {10.1029/jc092ic05p05305},
2506  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc092ic05p05305},
2507  pages         = {5305--5328},
2508  volume        = {92},
2509  number        = {C5},
2510  issn          = {0148-0227}
2511}
2512
2513@article{         roquet.madec.ea_15,
2514  author        = {F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
2515                  Barker},
2516  title         = {Accurate polynomial expressions for the density and
2517                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard},
2518  journal       = {Ocean Modelling},
2519  publisher     = {Elsevier BV},
2520  year          = {2015},
2521  month         = {jun},
2522  doi           = {10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
2523  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2015.04.002},
2524  pages         = {29--43},
2525  volume        = {90},
2526  issn          = {1463-5003}
2527}
2528
2529@article{         roquet.madec.ea_15*1,
2530  author        = {F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander},
2531  title         = {Defining a simplified yet ``realistic'' equation of
2532                  state for seawater},
2533  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2534  publisher     = {American Meteorological Society},
2535  year          = {2015},
2536  month         = {oct},
2537  doi           = {10.1175/jpo-d-15-0080.1},
2538  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/JPO-D-15-0080.1},
2539  pages         = {2564--2579},
2540  volume        = {45},
2541  number        = {10},
2542  issn          = {1520-0485}
2543}
2544
2545@article{         roullet.madec_00,
2546  author        = {G. Roullet and G. Madec},
2547  title         = {Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
2548                  new formulation for Ocean General Circulation Models},
2549  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2550  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2551  year          = {2000},
2552  month         = {oct},
2553  doi           = {10.1029/2000jc900089},
2554  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2000jc900089},
2555  pages         = {23927--23942},
2556  volume        = {105},
2557  number        = {C10},
2558  issn          = {0148-0227}
2559}
2560
2561@article{         sarmiento.bryan_82,
2562  author        = {J. L. Sarmiento and K. Bryan},
2563  title         = {An ocean transport model for the North Atlantic},
2564  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2565  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2566  year          = {1982},
2567  doi           = {10.1029/jc087ic01p00394},
2568  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/jc087ic01p00394},
2569  pages         = {394--409},
2570  volume        = {87},
2571  number        = {C1},
2572  issn          = {0148-0227}
2573}
2574
2575@article{         saunders_67,
2576  author        = {P. M. Saunders},
2577  title         = {The temperature at the ocean-air interface},
2578  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
2579  publisher     = {American Meteorological Society},
2580  year          = {1967},
2581  month         = {may},
2582  doi           = {10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2},
2583  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1967)024<0269:TTATOA>2.0.CO;2},
2584  pages         = {269--273},
2585  volume        = {24},
2586  number        = {3},
2587  issn          = {1520-0469}
2588}
2589
2590@article{         shchepetkin.mcwilliams_05,
2591  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
2592  title         = {The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
2593                  split-explicit, free-surface,
2594                  topography-following-coordinate oceanic model},
2595  journal       = {Ocean Modelling},
2596  publisher     = {Elsevier BV},
2597  year          = {2005},
2598  month         = {jan},
2599  doi           = {10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
2600  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2004.08.002},
2601  pages         = {347--404},
2602  volume        = {9},
2603  number        = {4},
2604  issn          = {1463-5003}
2605}
2606
2607@inbook{          shchepetkin.mcwilliams_09,
2608  author        = {A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams},
2609  booktitle     = {Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans},
2610  publisher     = {Elsevier},
2611  editor        = {R. M. Temam and J. J. Tribbia},
2612  year          = {2009},
2613  doi           = {10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
2614  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1570-8659(08)01202-0},
2615  title         = {Computational kernel algorithms for fine-scale,
2616                  multiprocess, longtime oceanic simulations},
2617  chapter       = {2},
2618  series        = {Handbook of Numerical Analysis},
2619  pages         = {121--183},
2620  volume        = {14},
2621  issn          = {1570-8659},
2622  isbn          = {9780444518934}
2623}
2624
2625@article{         siddorn.furner_13,
2626  author        = {J. R. Siddorn and R. Furner},
2627  title         = {An analytical stretching function that combines the best
2628                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
2629                  coordinates},
2630  journal       = {Ocean Modelling},
2631  publisher     = {Elsevier BV},
2632  year          = {2013},
2633  month         = {jun},
2634  doi           = {10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
2635  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2013.02.001},
2636  pages         = {1--13},
2637  volume        = {66},
2638  issn          = {1463-5003}
2639}
2640
2641@article{         simmons.jayne.ea_04,
2642  author        = {H. L. Simmons and S. R. Jayne and L. C. {St Laurent} and
2643                  A. J. Weaver},
2644  title         = {Tidally driven mixing in a numerical model of the ocean
2645                  general circulation},
2646  journal       = {Ocean Modelling},
2647  publisher     = {Elsevier BV},
2648  year          = {2004},
2649  month         = {jan},
2650  doi           = {10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
2651  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s1463-5003(03)00011-8},
2652  pages         = {245--263},
2653  volume        = {6},
2654  number        = {3-4},
2655  issn          = {1463-5003}
2656}
2657
2658@article{         song.haidvogel_94,
2659  author        = {Y. Song and D. Haidvogel},
2660  title         = {A semi-implicit ocean circulation model using a
2661                  generalized topography-following coordinate system},
2662  journal       = {Journal of Computational Physics},
2663  publisher     = {Elsevier BV},
2664  year          = {1994},
2665  month         = {nov},
2666  doi           = {10.1006/jcph.1994.1189},
2667  url           = {http://dx.doi.org/10.1006/jcph.1994.1189},
2668  pages         = {228--244},
2669  volume        = {115},
2670  number        = {1},
2671  issn          = {0021-9991}
2672}
2673
2674@article{         song_98,
2675  author        = {Y. T. Song},
2676  title         = {A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
2677                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis},
2678  journal       = {Monthly Weather Review},
2679  publisher     = {American Meteorological Society},
2680  year          = {1998},
2681  month         = {dec},
2682  doi           = {10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
2683  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2},
2684  pages         = {3213--3230},
2685  volume        = {126},
2686  number        = {12},
2687  issn          = {1520-0493}
2688}
2689
2690@article{         st-laurent.nash_04,
2691  author        = {L. C. {St Laurent} and J. D. Nash},
2692  title         = {An examination of the radiative and dissipative properties
2693                  of deep ocean internal tides},
2694  journal       = {Deep Sea Research},
2695  publisher     = {Elsevier BV},
2696  year          = {2004},
2697  month         = {dec},
2698  doi           = {10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
2699  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.dsr2.2004.09.008},
2700  pages         = {3029--3042},
2701  volume        = {51},
2702  number        = {25-26},
2703  issn          = {0967-0645}
2704}
2705
2706@article{         st-laurent.simmons.ea_02,
2707  author        = {L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne},
2708  title         = {Estimating tidally driven mixing in the deep ocean},
2709  journal       = {Geophysical Research Letters},
2710  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2711  year          = {2002},
2712  month         = {dec},
2713  doi           = {10.1029/2002gl015633},
2714  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2002GL015633},
2715  pages         = {2101--2104},
2716  volume        = {29},
2717  number        = {23},
2718  issn          = {0094-8276}
2719}
2720
2721@article{         stacey_99,
2722  author        = {M. W. Stacey},
2723  title         = {Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
2724                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness
2725                  length},
2726  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2727  publisher     = {American Meteorological Society},
2728  year          = {1999},
2729  month         = {jun},
2730  doi           = {10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
2731  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2},
2732  pages         = {1363--1367},
2733  volume        = {29},
2734  number        = {6},
2735  issn          = {1520-0485}
2736}
2737
2738@article{         steele.morley.ea_01,
2739  author        = {M. Steele and R. Morley and W. Ermold},
2740  title         = {{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
2741                  Arctic Ocean},
2742  journal       = {Journal of Climate},
2743  publisher     = {American Meteorological Society},
2744  year          = {2001},
2745  month         = {may},
2746  doi           = {10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
2747  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2},
2748  pages         = {2079--2087},
2749  volume        = {14},
2750  number        = {9},
2751  issn          = {1520-0442}
2752}
2753
2754@article{         stein.stein_92,
2755  author        = {C. A. Stein and S. Stein},
2756  title         = {A model for the global variation in oceanic depth and heat
2757                  flow with lithospheric age},
2758  journal       = {Nature},
2759  publisher     = {Springer Nature},
2760  year          = {1992},
2761  month         = {sep},
2762  doi           = {10.1038/359123a0},
2763  url           = {http://dx.doi.org/10.1038/359123a0},
2764  pages         = {123--129},
2765  volume        = {359},
2766  number        = {6391},
2767  issn          = {1476-4687}
2768}
2769
2770@inbook{          stokes_09,
2771  author        = {G. G. Stokes},
2772  booktitle     = {Mathematical and Physical Papers},
2773  publisher     = {Cambridge University Press},
2774  year          = {2009},
2775  doi           = {10.1017/cbo9780511702242.013},
2776  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511702242.013},
2777  title         = {On the theory of oscillatory waves},
2778  chapter       = {12},
2779  series        = {Cambridge Library Collection - Mathematics},
2780  volume        = {1},
2781  pages         = {197--229},
2782  isbn          = {9780511702242}
2783}
2784
2785@article{         takaya.bidlot.ea_10,
2786  author        = {Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
2787                  E. M. Janssen},
2788  title         = {Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
2789                  temperature},
2790  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2791  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2792  year          = {2010},
2793  month         = {jun},
2794  doi           = {10.1029/2009jc005985},
2795  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2009JC005985},
2796  pages         = {C06009},
2797  volume        = {115},
2798  number        = {C6},
2799  issn          = {0148-0227}
2800}
2801
2802@article{         talagrand_72,
2803  author        = {O. Talagrand},
2804  title         = {On the damping of high-frequency motions in
2805                  four-dimensional assimilation of meteorological data},
2806  journal       = {Journal of the Atmospheric Sciences},
2807  publisher     = {American Meteorological Society},
2808  year          = {1972},
2809  month         = {nov},
2810  doi           = {10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
2811  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2},
2812  pages         = {1571--1574},
2813  volume        = {29},
2814  number        = {8},
2815  issn          = {1520-0469}
2816}
2817
2818@book{            teos_10,
2819  author        = {IOC, SCOR and IAPSO},
2820  title         = {The international thermodynamic equation of seawater -
2821                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties},
2822  publisher     = {UNESCO},
2823  editor        = {Intergovernmental Oceanographic Commission},
2824  year          = {2010},
2825  month         = {mar},
2826  url           = {https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en},
2827  pages         = {196},
2828  volume        = {56},
2829  series        = {Manuals and Guides}
2830}
2831
2832@article{         treguier.dukowicz.ea_96,
2833  author        = {A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan},
2834  title         = {Properties of nonuniform grids used in ocean general
2835                  circulation models},
2836  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2837  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2838  year          = {1996},
2839  month         = {sep},
2840  doi           = {10.1029/96jc01753},
2841  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/96jc01753},
2842  pages         = {20877--20881},
2843  volume        = {101},
2844  number        = {C9},
2845  issn          = {0148-0227}
2846}
2847
2848@article{         treguier.held.ea_97,
2849  author        = {A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev},
2850  title         = {Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
2851                  Equation Ocean Models},
2852  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
2853  publisher     = {American Meteorological Society},
2854  year          = {1997},
2855  month         = {apr},
2856  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
2857  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2},
2858  pages         = {567--580},
2859  volume        = {27},
2860  number        = {4},
2861  issn          = {1520-0485}
2862}
2863
2864@article{         treguier_92,
2865  author        = {A. M. Tr\'{e}guier},
2866  title         = {Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
2867                  equation model of the North Atlantic},
2868  journal       = {Journal of Geophysical Research},
2869  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2870  year          = {1992},
2871  doi           = {10.1029/91jc02350},
2872  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/91jc02350},
2873  pages         = {687--701},
2874  volume        = {97},
2875  number        = {C1},
2876  issn          = {0148-0227}
2877}
2878
2879@article{         tu.tsuang_05,
2880  author        = {C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang},
2881  title         = {Cool-skin simulation by a one-column ocean model},
2882  journal       = {Geophysical Research Letters},
2883  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
2884  year          = {2005},
2885  month         = {nov},
2886  doi           = {10.1029/2005gl024252},
2887  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/2005GL024252},
2888  pages         = {L22602},
2889  volume        = {32},
2890  number        = {22},
2891  issn          = {0094-8276}
2892}
2893
2894@article{         umlauf.burchard_03,
2895  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
2896  title         = {A generic length-scale equation for geophysical turbulence
2897                  models},
2898  journal       = {Journal of Marine Research},
2899  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
2900  year          = {2003},
2901  month         = {mar},
2902  doi           = {10.1357/002224003322005087},
2903  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224003322005087},
2904  pages         = {235--265},
2905  volume        = {61},
2906  number        = {2},
2907  issn          = {0022-2402}
2908}
2909
2910@article{         umlauf.burchard_05,
2911  author        = {L. Umlauf and H. Burchard},
2912  title         = {Second-order turbulence closure models for geophysical
2913                  boundary layers. {A} review of recent work},
2914  journal       = {Continental Shelf Research},
2915  publisher     = {Elsevier BV},
2916  year          = {2005},
2917  month         = {may},
2918  doi           = {10.1016/j.csr.2004.08.004},
2919  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.csr.2004.08.004},
2920  pages         = {795--827},
2921  volume        = {25},
2922  number        = {7-8},
2923  issn          = {0278-4343}
2924}
2925
2926@book{            vallis_06,
2927  author        = {G. K. Vallis},
2928  booktitle     = {Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics},
2929  publisher     = {Cambridge University Press},
2930  year          = {2006},
2931  doi           = {10.1017/cbo9780511790447},
2932  url           = {http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511790447},
2933  isbn          = {9780511790447}
2934}
2935
2936@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09,
2937  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse and S.
2938                  Bouillon and G. Madec and M. A. Morales Maqueda},
2939  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2940                  Antarctic sea ice. 1. Model description and validation},
2941  journal       = {Ocean Modelling},
2942  publisher     = {Elsevier BV},
2943  year          = {2009},
2944  month         = {jan},
2945  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
2946  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.10.005},
2947  pages         = {33--53},
2948  volume        = {27},
2949  number        = {1-2},
2950  issn          = {1463-5003}
2951}
2952
2953@article{         vancoppenolle.fichefet.ea_09*1,
2954  author        = {M. Vancoppenolle and T. Fichefet and H. Goosse},
2955  title         = {Simulating the mass balance and salinity of Arctic and
2956                  Antarctic sea ice. 2. Importance of sea ice salinity
2957                  variations},
2958  journal       = {Ocean Modelling},
2959  publisher     = {Elsevier BV},
2960  year          = {2009},
2961  month         = {jan},
2962  doi           = {10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
2963  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2008.11.003},
2964  pages         = {54--69},
2965  volume        = {27},
2966  number        = {1-2},
2967  issn          = {1463-5003}
2968}
2969
2970@article{         warner.defne.ea_13,
2971  author        = {J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango},
2972  title         = {A wetting and drying scheme for {ROMS}},
2973  journal       = {Computers \& Geosciences},
2974  publisher     = {Elsevier BV},
2975  year          = {2013},
2976  month         = {aug},
2977  doi           = {10.1016/j.cageo.2013.05.004},
2978  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2013.05.004},
2979  pages         = {54--61},
2980  volume        = {58},
2981  issn          = {0098-3004}
2982}
2983
2984@article{         warner.sherwood.ea_05,
2985  author        = {J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
2986                  Signell},
2987  title         = {Performance of four turbulence closure models implemented
2988                  using a generic length scale method},
2989  journal       = {Ocean Modelling},
2990  publisher     = {Elsevier BV},
2991  year          = {2005},
2992  month         = {jan},
2993  doi           = {10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
2994  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.ocemod.2003.12.003},
2995  pages         = {81--113},
2996  volume        = {8},
2997  number        = {1-2},
2998  issn          = {1463-5003}
2999}
3000
3001@article{         weatherly_84,
3002  author        = {G. L. Weatherly},
3003  title         = {An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
3004                  Stream fluctuations},
3005  journal       = {Journal of Marine Research},
3006  publisher     = {Journal of Marine Research/Yale},
3007  year          = {1984},
3008  month         = {may},
3009  doi           = {10.1357/002224084788502729},
3010  url           = {http://dx.doi.org/10.1357/002224084788502729},
3011  pages         = {289--301},
3012  volume        = {42},
3013  number        = {2},
3014  issn          = {1543-9542}
3015}
3016
3017@article{         weaver.eby_97,
3018  author        = {A. J. Weaver and M. Eby},
3019  title         = {On the numerical implementation of advection schemes for
3020                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
3021                  the {GFDL} ocean model},
3022  journal       = {Journal of Physical Oceanography},
3023  publisher     = {American Meteorological Society},
3024  year          = {1997},
3025  month         = {feb},
3026  doi           = {10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
3027  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2},
3028  pages         = {369--377},
3029  volume        = {27},
3030  number        = {2},
3031  issn          = {1520-0485}
3032}
3033
3034@article{         webb.cuevas.ea_98,
3035  author        = {D. J. Webb and B. A. {de Cuevas} and C. S. Richmond},
3036  title         = {Improved Advection Schemes for Ocean Models},
3037  journal       = {Journal of Atmospheric and Oceanic Technology},
3038  publisher     = {American Meteorological Society},
3039  year          = {1998},
3040  month         = {oct},
3041  doi           = {10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
3042  url           = {http://dx.doi.org/10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2},
3043  pages         = {1171--1187},
3044  volume        = {15},
3045  number        = {5},
3046  issn          = {1520-0426}
3047}
3048
3049@article{         white.adcroft.ea_09,
3050  author        = {L. White and A. Adcroft and R. Hallberg},
3051  title         = {High-order regridding-remapping schemes for continuous
3052                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models},
3053  journal       = {Journal of Computational Physics},
3054  publisher     = {Elsevier BV},
3055  year          = {2009},
3056  month         = {dec},
3057  doi           = {10.1016/j.jcp.2009.08.016},
3058  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/j.jcp.2009.08.016},
3059  pages         = {8665--8692},
3060  volume        = {228},
3061  number        = {23},
3062  issn          = {0021-9991}
3063}
3064
3065@article{         wilcox_88,
3066  author        = {D. C. Wilcox},
3067  title         = {Reassessment of the scale-determining equation for
3068                  advanced turbulence models},
3069  journal       = {AIAA Journal},
3070  publisher     = {American Institute of Aeronautics and Astronautics
3071                  (AIAA)},
3072  year          = {1988},
3073  month         = {nov},
3074  doi           = {10.2514/3.10041},
3075  url           = {http://dx.doi.org/10.2514/3.10041},
3076  pages         = {1299--1310},
3077  volume        = {26},
3078  number        = {11},
3079  issn          = {1533-385X}
3080}
3081
3082@article{         willebrand.barnier.ea_01,
3083  author        = {J. Willebrand and B. Barnier and C. B{\"{o}}ning and C.
3084                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
3085                  and J.-M. Molines and A. L. New},
3086  title         = {Circulation characteristics in three eddy-permitting
3087                  models of the North Atlantic},
3088  journal       = {Progress in Oceanography},
3089  publisher     = {Elsevier BV},
3090  year          = {2001},
3091  month         = {jan},
3092  doi           = {10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
3093  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/s0079-6611(01)00003-9},
3094  pages         = {123--161},
3095  volume        = {48},
3096  number        = {2-3},
3097  issn          = {0079-6611}
3098}
3099
3100@article{         zalesak_79,
3101  author        = {S. T. Zalesak},
3102  title         = {Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
3103                  for fluids},
3104  journal       = {Journal of Computational Physics},
3105  publisher     = {Elsevier BV},
3106  year          = {1979},
3107  month         = {jun},
3108  doi           = {10.1016/0021-9991(79)90051-2},
3109  url           = {http://dx.doi.org/10.1016/0021-9991(79)90051-2},
3110  pages         = {335--362},
3111  volume        = {31},
3112  number        = {3},
3113  issn          = {0021-9991}
3114}
3115
3116@article{         zhang.endoh_92,
3117  author        = {R.-H. Zhang and M. Endoh},
3118  title         = {A free surface General Circulation Model for the tropical
3119                  Pacific Ocean},
3120  journal       = {Journal of Geophysical Research},
3121  publisher     = {American Geophysical Union (AGU)},
3122  year          = {1992},
3123  doi           = {10.1029/92jc00911},
3124  url           = {http://dx.doi.org/10.1029/92jc00911},
3125  pages         = {11237--11255},
3126  volume        = {97},
3127  number        = {C7},
3128  issn          = {0148-0227}
3129}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.