New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
bibliography.bib in NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main – NEMO

source: NEMO/trunk/doc/latex/NEMO/main/bibliography.bib @ 14113

Last change on this file since 14113 was 14113, checked in by nicolasmartin, 2 years ago

#2414 Reintegration to the trunk, LaTeX manuals are compiling ;-)

File size: 107.6 KB
Line 
1
2@article{         adcroft.campin_OM04,
3  title         = "Rescaled height coordinates for accurate representation of
4                  free-surface flows in ocean circulation models",
5  pages         = "269--284",
6  journal       = "Ocean Modelling",
7  volume        = "7",
8  number        = "3-4",
9  author        = "A. Adcroft and J.-M. Campin",
10  year          = "2004",
11  month         = "jan",
12  publisher     = "Elsevier BV",
13  issn          = "1463-5003",
14  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.09.003"
15}
16
17@article{         arakawa.hsu_MWR90,
18  title         = "Energy Conserving and Potential-Enstrophy Dissipating
19                  Schemes for the Shallow Water Equations",
20  pages         = "1960--1969",
21  journal       = "Monthly Weather Review",
22  volume        = "118",
23  number        = "10",
24  author        = "A. Arakawa and Y.-J. G. Hsu",
25  year          = "1990",
26  month         = "oct",
27  publisher     = "American Meteorological Society",
28  issn          = "1520-0493",
29  doi           = "10.1175/1520-0493(1990)118<1960:ecaped>2.0.co;2"
30}
31
32@article{         arakawa.lamb_MWR81,
33  title         = "A Potential Enstrophy and Energy Conserving Scheme for the
34                  Shallow Water Equations",
35  pages         = "18--36",
36  journal       = "Monthly Weather Review",
37  volume        = "109",
38  number        = "1",
39  author        = "A. Arakawa and V. R. Lamb",
40  year          = "1981",
41  month         = "jan",
42  publisher     = "American Meteorological Society",
43  issn          = "1520-0493",
44  doi           = "10.1175/1520-0493(1981)109<0018:apeaec>2.0.co;2"
45}
46
47@article{         arakawa_JCP66,
48  title         = "Computational design for long-term numerical integration
49                  of the equations of fluid motion: Two-dimensional
50                  incompressible flow. Part {I}",
51  pages         = "119--143",
52  journal       = "Journal of Computational Physics",
53  volume        = "1",
54  number        = "1",
55  author        = "A. Arakawa",
56  year          = "1966",
57  month         = "Aug",
58  publisher     = "Elsevier BV",
59  issn          = "0021-9991",
60  doi           = "10.1016/0021-9991(66)90015-5"
61}
62
63@article{         arbic.garner.ea_DSR04,
64  title         = "The accuracy of surface elevations in forward global
65                  barotropic and baroclinic tide models",
66  pages         = "3069--3101",
67  journal       = "Deep Sea Research",
68  volume        = "51",
69  number        = "25-26",
70  author        = "B. K. Arbic and S. T. Garner and R. W. Hallberg and H. L.
71                  Simmons",
72  year          = "2004",
73  month         = "dec",
74  publisher     = "Elsevier BV",
75  issn          = "0967-0645",
76  doi           = "10.1016/j.dsr2.2004.09.014"
77}
78
79@article{         artale.iudicone.ea_JGR02,
80  title         = "Role of surface fluxes in Ocean General Circulation Models
81                  using satellite sea surface temperature: Validation of and
82                  sensitivity to the forcing frequency of the Mediterranean
83                  thermohaline circulation",
84  pages         = "2901--2924",
85  journal       = "Journal of Geophysical Research",
86  volume        = "107",
87  number        = "C8",
88  author        = "V. Artale and D. Iudicone and R. Santoleri and V. Rupolo
89                  and S. Marullo and F. {D'O}rtenzio",
90  year          = "2002",
91  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
92  issn          = "0148-0227",
93  doi           = "10.1029/2000jc000452"
94}
95
96@article{         asselin_MWR72,
97  title         = "Frequency Filter for Time Integrations",
98  pages         = "487--490",
99  journal       = "Monthly Weather Review",
100  volume        = "100",
101  number        = "6",
102  author        = "R. Asselin",
103  year          = "1972",
104  month         = "jun",
105  publisher     = "American Meteorological Society",
106  issn          = "1520-0493",
107  doi           = "10.1175/1520-0493(1972)100<0487:fffti>2.3.co;2"
108}
109
110@article{         axell_JGR02,
111  title         = "Wind-driven internal waves and Langmuir circulations in a
112                  numerical ocean model of the southern Baltic Sea",
113  journal       = "Journal of Geophysical Research",
114  volume        = "107",
115  number        = "C11",
116  author        = "L. B. Axell",
117  year          = "2002",
118  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
119  issn          = "0148-0227",
120  doi           = "10.1029/2001jc000922"
121}
122
123@article{         barnier.madec.ea_OD06,
124  title         = "Impact of partial steps and momentum advection schemes in
125                  a global ocean circulation model at eddy-permitting
126                  resolution",
127  pages         = "543--567",
128  journal       = "Ocean Dynamics",
129  volume        = "56",
130  number        = "5-6",
131  author        = "B. Barnier and G. Madec and T. Penduff and J.-M. Molines
132                  and A.-M. Tr\'{e}guier and J. {Le Sommer} and A. Beckmann
133                  and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and J. Dengg and C.
134                  Derval and E. Durand and S. Gulev and E. Remy and C.
135                  Talandier and S. Theetten and M. Maltrud and J. McClean and
136                  B. {de Cuevas}",
137  year          = "2006",
138  month         = "jun",
139  publisher     = "Springer Nature",
140  issn          = "1616-7228",
141  doi           = "10.1007/s10236-006-0082-1"
142}
143
144@article{         beckmann.doscher_JPO97,
145  title         = "A method for improved representation of dense water
146                  spreading over topography in geopotential-coordinate
147                  models",
148  pages         = "581--591",
149  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
150  volume        = "27",
151  number        = "4",
152  author        = "A. Beckmann and R. D{\"{o}}scher",
153  year          = "1997",
154  month         = "apr",
155  publisher     = "American Meteorological Society",
156  issn          = "1520-0485",
157  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0581:amfiro>2.0.co;2"
158}
159
160@article{         beckmann.goosse_OM03,
161  title         = "A parameterization of ice shelf-ocean interaction for
162                  climate models",
163  pages         = "157--170",
164  journal       = "Ocean Modelling",
165  volume        = "5",
166  number        = "2",
167  author        = "A. Beckmann and H. Goosse",
168  year          = "2003",
169  month         = "jan",
170  publisher     = "Elsevier BV",
171  issn          = "1463-5003",
172  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00019-7"
173}
174
175@article{         beckmann.haidvogel_JPO93,
176  title         = "Numerical Simulation of Flow around a Tall Isolated
177                  Seamount. Part {I}: Problem Formulation and Model Accuracy",
178  pages         = "1736--1753",
179  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
180  volume        = "23",
181  number        = "8",
182  author        = "A. Beckmann and D. B. Haidvogel",
183  year          = "1993",
184  month         = "aug",
185  publisher     = "American Meteorological Society",
186  issn          = "1520-0485",
187  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1736:nsofaa>2.0.co;2"
188}
189
190@article{         beljaars_QJRMS95,
191  title         = "The parametrization of surface fluxes in large-scale
192                  models under free convection",
193  pages         = "255--270",
194  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
195  volume        = "121",
196  number        = "522",
197  author        = "Beljaars, Anton C. M.",
198  year          = "1995",
199  month         = "jan",
200  publisher     = "Wiley",
201  issn          = "00359009",
202  doi           = "10.1002/qj.49712152203"
203}
204
205@article{         bernie.guilyardi.ea_CD07,
206  title         = "Impact of resolving the diurnal cycle in an
207                  ocean-atmosphere {GCM}. Part 1: a diurnally forced {OGCM}",
208  pages         = "575--590",
209  journal       = "Climate Dynamics",
210  volume        = "29",
211  number        = "6",
212  author        = "D. J. Bernie and E. Guilyardi and G. Madec and J. M.
213                  Slingo and S. J. Woolnough",
214  year          = "2007",
215  month         = "may",
216  publisher     = "Springer Nature",
217  issn          = "1432-0894",
218  doi           = "10.1007/s00382-007-0249-6"
219}
220
221@article{         bernie.woolnough.ea_JC05,
222  title         = "Modeling diurnal and intraseasonal variability of the
223                  ocean mixed layer",
224  pages         = "1190--1202",
225  journal       = "Journal of Climate",
226  volume        = "18",
227  number        = "8",
228  author        = "D. J. Bernie and S. J. Woolnough and J. M. Slingo and E.
229                  Guilyardi",
230  year          = "2005",
231  month         = "apr",
232  publisher     = "American Meteorological Society",
233  issn          = "1520-0442",
234  doi           = "10.1175/jcli3319.1"
235}
236
237@article{         blanke.delecluse_JPO93,
238  title         = "Variability of the tropical Atlantic Ocean simulated by a
239                  General Circulation Model with two different mixed-layer
240                  physics",
241  pages         = "1363--1388",
242  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
243  volume        = "23",
244  number        = "7",
245  author        = "B. Blanke and P. Del\'{e}cluse",
246  year          = "1993",
247  month         = "jul",
248  publisher     = "American Meteorological Society",
249  issn          = "1520-0485",
250  doi           = "10.1175/1520-0485(1993)023<1363:vottao>2.0.co;2"
251}
252
253@article{         blanke.raynaud_JPO97,
254  title         = "Kinematics of the Pacific Equatorial Undercurrent: An
255                  Eulerian and Lagrangian Approach from {GCM} Results",
256  pages         = "1038--1053",
257  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
258  volume        = "27",
259  number        = "6",
260  author        = "B. Blanke and S. Raynaud",
261  year          = "1997",
262  month         = "jun",
263  publisher     = "American Meteorological Society",
264  issn          = "1520-0485",
265  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<1038:kotpeu>2.0.co;2"
266}
267
268@article{         bloom.takacs.ea_MWR96,
269  title         = "Data assimilation using incremental analysis updates",
270  pages         = "1256--1271",
271  journal       = "Monthly Weather Review",
272  volume        = "124",
273  number        = "6",
274  author        = "S. C. Bloom and L. L. Takacs and A. M. Da Silva and D.
275                  Ledvina",
276  year          = "1996",
277  month         = "jun",
278  publisher     = "American Meteorological Society",
279  issn          = "1520-0493",
280  doi           = "10.1175/1520-0493(1996)124<1256:dauiau>2.0.co;2"
281}
282
283@article{         bouffard.boegman_DAO13,
284  title         = "A diapycnal diffusivity model for stratified environmental
285                  flows",
286  pages         = "14--34",
287  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
288  volume        = "61-62",
289  author        = "D. Bouffard and L. Boegman",
290  year          = "2013",
291  month         = "jun",
292  publisher     = "Elsevier BV",
293  issn          = "0377-0265",
294  doi           = "10.1016/j.dynatmoce.2013.02.002"
295}
296
297@article{         bougeault.lacarrere_MWR89,
298  title         = "Parameterization of Orography-Induced Turbulence in a
299                  Mesobeta--Scale Model",
300  pages         = "1872--1890",
301  journal       = "Monthly Weather Review",
302  volume        = "117",
303  number        = "8",
304  author        = "P. Bougeault and P. Lacarrere",
305  year          = "1989",
306  month         = "aug",
307  publisher     = "American Meteorological Society",
308  issn          = "1520-0493",
309  doi           = "10.1175/1520-0493(1989)117<1872:pooiti>2.0.co;2"
310}
311
312@article{         bouillon.maqueda.ea_OM09,
313  title         = "An elastic-viscous-plastic sea ice model formulated on
314                  Arakawa {B} and {C} grids",
315  pages         = "174--184",
316  journal       = "Ocean Modelling",
317  volume        = "27",
318  number        = "3-4",
319  author        = "S. Bouillon and M. A. Morales Maqueda and V. Legat and T.
320                  Fichefet",
321  year          = "2009",
322  month         = "jan",
323  publisher     = "Elsevier BV",
324  issn          = "1463-5003",
325  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.01.004"
326}
327
328@article{         brankart.candille.ea_GMD15,
329  title         = "A generic approach to explicit simulation of uncertainty
330                  in the {NEMO} ocean model",
331  pages         = "1285--1297",
332  journal       = "Geoscientific Model Development",
333  volume        = "8",
334  number        = "5",
335  author        = "J.-M. Brankart and G. Candille and F. Garnier and C.
336                  Calone and A. Melet and P.-A. Bouttier and P. Brasseur and
337                  J. Verron",
338  year          = "2015",
339  month         = "may",
340  publisher     = "Copernicus GmbH",
341  issn          = "1991-9603",
342  doi           = "10.5194/gmd-8-1285-2015"
343}
344
345@article{         brankart_OM13,
346  title         = "Impact of uncertainties in the horizontal density gradient
347                  upon low resolution global ocean modelling",
348  pages         = "64--76",
349  journal       = "Ocean Modelling",
350  volume        = "66",
351  author        = "J.-M. Brankart",
352  year          = "2013",
353  month         = "jun",
354  publisher     = "Elsevier BV",
355  issn          = "1463-5003",
356  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.004"
357}
358
359@article{         breivik.bidlot.ea_OM16,
360  title         = "A Stokes drift approximation based on the Phillips
361                  spectrum",
362  pages         = "49--56",
363  journal       = "Ocean Modelling",
364  volume        = "100",
365  author        = "{\O}. Breivik and J.-R. Bidlot and P. A. E. M. Janssen",
366  year          = "2016",
367  month         = "apr",
368  publisher     = "Elsevier BV",
369  issn          = "1463-5003",
370  doi           = "10.1016/j.ocemod.2016.01.005"
371}
372
373@article{         breivik.janssen.ea_JPO14,
374  title         = "Approximate Stokes Drift Profiles in Deep Water",
375  pages         = "2433--2445",
376  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
377  volume        = "44",
378  number        = "9",
379  author        = "{\O}. Breivik and P. A. E. M. Janssen and J.-R. Bidlot",
380  year          = "2014",
381  month         = "sep",
382  publisher     = "American Meteorological Society",
383  issn          = "1520-0485",
384  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0020.1"
385}
386
387@article{         brodeau.barnier.ea_JPO16,
388  title         = "Climatologically Significant Effects of Some
389                  Approximations in the Bulk Parameterizations of Turbulent
390                  Air–Sea Fluxes",
391  pages         = "5--28",
392  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
393  volume        = "47",
394  number        = "1",
395  author        = "Brodeau, Laurent and Barnier, Bernard and Gulev, Sergey K.
396                  and Woods, Cian",
397  year          = "2016",
398  month         = "jan",
399  publisher     = "American Meteorological Society",
400  issn          = "0022-3670",
401  doi           = "10.1175/jpo-d-16-0169.1"
402}
403
404@article{         brodeau.barnier.ea_OM10,
405  title         = "An {ERA40}-based atmospheric forcing for global ocean
406                  circulation models",
407  pages         = "88--104",
408  journal       = "Ocean Modelling",
409  volume        = "31",
410  number        = "3-4",
411  author        = "L. Brodeau and B. Barnier and A.-M. Tr\'{e}guier and T.
412                  Penduff and S. Gulev",
413  year          = "2010",
414  month         = "jan",
415  publisher     = "Elsevier BV",
416  issn          = "1463-5003",
417  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.10.005"
418}
419
420@article{         brown.campana_MWR78,
421  title         = "An economical time-differencing system for numerical
422                  weather prediction",
423  pages         = "1125--1136",
424  journal       = "Monthly Weather Review",
425  volume        = "106",
426  number        = "8",
427  author        = "J. A. Brown and K. A. Campana",
428  year          = "1978",
429  month         = "aug",
430  publisher     = "American Meteorological Society",
431  issn          = "1520-0493",
432  doi           = "10.1175/1520-0493(1978)106<1125:aetsfn>2.0.co;2"
433}
434
435@article{         bryan_JCP97,
436  title         = "A numerical method for the study of the circulation of the
437                  world ocean",
438  pages         = "154--169",
439  journal       = "Journal of Computational Physics",
440  volume        = "135",
441  number        = "2",
442  author        = "K. Bryan",
443  year          = "1997",
444  month         = "Aug",
445  publisher     = "Elsevier BV",
446  issn          = "0021-9991",
447  doi           = "10.1006/jcph.1997.5699"
448}
449
450@article{         burchard_OM02,
451  title         = "Energy-conserving discretisation of turbulent shear and
452                  buoyancy production",
453  pages         = "347--361",
454  journal       = "Ocean Modelling",
455  volume        = "4",
456  number        = "3-4",
457  author        = "H. Burchard",
458  year          = "2002",
459  month         = "jun",
460  publisher     = "Elsevier BV",
461  issn          = "1463-5003",
462  doi           = "10.1016/s1463-5003(02)00009-4"
463}
464
465@article{         campin.adcroft.ea_OM04,
466  title         = "Conservation of properties in a free-surface model",
467  pages         = "221--244",
468  journal       = "Ocean Modelling",
469  volume        = "6",
470  number        = "3-4",
471  author        = "J.-M. Campin and A. Adcroft and C. Hill and J. Marshall",
472  year          = "2004",
473  month         = "jan",
474  publisher     = "Elsevier BV",
475  issn          = "1463-5003",
476  doi           = "10.1016/s1463-5003(03)00009-x"
477}
478
479@article{         campin.goosse_T99,
480  title         = "Parameterization of density-driven downsloping flow for a
481                  coarse-resolution ocean model in z-coordinate",
482  pages         = "412--430",
483  journal       = "Tellus A",
484  volume        = "51",
485  number        = "3",
486  author        = "J.-M. Campin and H. Goosse",
487  year          = "1999",
488  month         = "may",
489  publisher     = "Informa UK Limited",
490  issn          = "1600-0870",
491  doi           = "10.1034/j.1600-0870.1999.t01-3-00006.x"
492}
493
494@article{         campin.marshall.ea_OM08,
495  title         = "Sea ice-ocean coupling using a rescaled vertical
496                  coordinate \zstar",
497  pages         = "1--14",
498  journal       = "Ocean Modelling",
499  volume        = "24",
500  number        = "1-2",
501  author        = "J.-M. Campin and J. Marshall and D. Ferreira",
502  year          = "2008",
503  month         = "jan",
504  publisher     = "Elsevier BV",
505  issn          = "1463-5003",
506  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.05.005"
507}
508
509@article{         canuto.howard.ea_JPO01,
510  title         = "Ocean turbulence. Part {I}: One-point closure
511                  model-momentum and heat vertical diffusivities",
512  pages         = "1413--1426",
513  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
514  volume        = "31",
515  number        = "6",
516  author        = "V. M. Canuto and A. Howard and Y. Cheng and M. S.
517                  Dubovikov",
518  year          = "2001",
519  month         = "jun",
520  publisher     = "American Meteorological Society",
521  issn          = "1520-0485",
522  doi           = "10.1175/1520-0485(2001)031<1413:otpiop>2.0.co;2"
523}
524
525@techreport{      chanut_trpt05,
526  title         = "Nesting code for {NEMO}",
527  pages         = "25",
528  author        = "J. Chanut",
529  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
530                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
531  year          = "2005",
532  month         = "may",
533  doi           = "10.5281/zenodo.3243409"
534}
535
536@article{         chassignet.smith.ea_JPO03,
537  title         = "North Atlantic Simulations with the Hybrid Coordinate
538                  Ocean Model ({HYCOM}): Impact of the Vertical Coordinate
539                  Choice, Reference Pressure, and Thermobaricity",
540  pages         = "2504--2526",
541  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
542  volume        = "33",
543  number        = "12",
544  author        = "E. P. Chassignet and L. T. Smith and G. R. Halliwell and
545                  R. Bleck",
546  year          = "2003",
547  month         = "dec",
548  publisher     = "American Meteorological Society",
549  issn          = "1520-0485",
550  doi           = "10.1175/1520-0485(2003)033<2504:naswth>2.0.co;2"
551}
552
553@article{         cox_OM87,
554  title         = "Isopycnal diffusion in a z-coordinate ocean model",
555  pages         = "1--9",
556  journal       = "Ocean Modelling",
557  volume        = "74",
558  author        = "M. D. Cox",
559  year          = "1987",
560  month         = "jan",
561  url           = "https://www.researchgate.net/publication/243768762_Isopycnal_diffusion_in_a_z-coordinate_ocean_model"
562}
563
564@article{         craig.banner_JPO94,
565  title         = "Modeling wave-enhanced turbulence in the ocean surface
566                  layer",
567  pages         = "2546--2559",
568  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
569  volume        = "24",
570  number        = "12",
571  author        = "P. D. Craig and M. L. Banner",
572  year          = "1994",
573  month         = "dec",
574  publisher     = "American Meteorological Society",
575  issn          = "1520-0485",
576  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<2546:mwetit>2.0.co;2"
577}
578
579@article{         craik.leibovich_JFM76,
580  title         = "A rational model for Langmuir circulations",
581  pages         = "401--426",
582  journal       = "Journal of Fluid Mechanics",
583  volume        = "73",
584  number        = "3",
585  author        = "A. D. D. Craik and S. Leibovich",
586  year          = "1976",
587  month         = "feb",
588  publisher     = "Cambridge University Press (CUP)",
589  issn          = "1469-7645",
590  doi           = "10.1017/s0022112076001420"
591}
592
593@article{         dalessio.abdella.ea_JPO98,
594  title         = "A new second-order turbulence closure scheme for modeling
595                  the oceanic mixed layer",
596  pages         = "1624--1641",
597  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
598  volume        = "28",
599  number        = "8",
600  author        = "S. J. D. D'Alessio and K. Abdella and N. A. McFarlane",
601  year          = "1998",
602  month         = "aug",
603  publisher     = "American Meteorological Society",
604  issn          = "1520-0485",
605  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<1624:ansotc>2.0.co;2"
606}
607
608@book{            daley.barker_bk01,
609  pages         = "163",
610  booktitle     = "{NAVDAS} Source Book 2001: {NRL} Atmospheric Variational
611                  Data Assimilation System",
612  editor        = "Naval Research Laboratory, Marine Meteorology Division",
613  author        = "R. Daley and E. Barker",
614  year          = "2001",
615  month         = "jul",
616  publisher     = "Defense Technical Information Center",
617  doi           = "10.21236/ada396883"
618}
619
620@article{         danabasoglu.ferrari.ea_JC08,
621  title         = "Sensitivity of an Ocean General Circulation Model to a
622                  parameterization of near-surface eddy fluxes",
623  pages         = "1192--1208",
624  journal       = "Journal of Climate",
625  volume        = "21",
626  number        = "6",
627  author        = "G. Danabasoglu and R. Ferrari and J. C. McWilliams",
628  year          = "2008",
629  month         = "mar",
630  publisher     = "American Meteorological Society",
631  issn          = "1520-0442",
632  doi           = "10.1175/2007jcli1508.1"
633}
634
635@article{         davies_QJRMS76,
636  title         = "A lateral boundary formulation for multi-level prediction
637                  models",
638  pages         = "405--418",
639  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
640  volume        = "102",
641  number        = "432",
642  author        = "H. C. Davies",
643  year          = "1976",
644  month         = "apr",
645  publisher     = "Wiley",
646  issn          = "0035-9009",
647  doi           = "10.1002/qj.49710243210"
648}
649
650@article{         de-boyer-montegut.madec.ea_JGR04,
651  title         = "Mixed layer depth over the global ocean: An examination of
652                  profile data and a profile-based climatology",
653  pages         = "C12003",
654  journal       = "Journal of Geophysical Research",
655  volume        = "109",
656  number        = "C12",
657  author        = "C. {de Boyer Mont\'{e}gut} and G. Madec and A. S. Fischer
658                  and A. Lazar and D. Iudicone",
659  year          = "2004",
660  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
661  issn          = "0148-0227",
662  doi           = "10.1029/2004jc002378"
663}
664
665@article{         de-lavergne.madec.ea_JPO16,
666  title         = "The impact of a variable mixing efficiency on the abyssal
667                  overturning",
668  pages         = "663--681",
669  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
670  volume        = "46",
671  number        = "2",
672  author        = "C. {de Lavergne} and G. Madec and J. {Le Sommer} and A. J.
673                  G. Nurser and A. C. Naveira Garabato",
674  year          = "2016",
675  month         = "feb",
676  publisher     = "American Meteorological Society",
677  issn          = "1520-0485",
678  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0259.1"
679}
680
681@article{         debreu.vouland.ea_CG08,
682  title         = "{AGRIF}: Adaptive Grid Refinement In Fortran",
683  pages         = "8--13",
684  journal       = "Computers \& Geosciences",
685  volume        = "34",
686  number        = "1",
687  author        = "L. Debreu and C. Vouland and E. Blayo",
688  year          = "2008",
689  month         = "jan",
690  publisher     = "Elsevier BV",
691  issn          = "0098-3004",
692  doi           = "10.1016/j.cageo.2007.01.009"
693}
694
695@incollection{    delecluse.madec_icol99,
696  title         = "Ocean modelling and the role of the ocean in the climate
697                  system",
698  pages         = "237--313",
699  booktitle     = "Modeling the Earth's Climate and its Variability",
700  editor        = "W. R. Holland and S. Joussaume and F. David",
701  series        = "Les Houches",
702  volume        = "67",
703  author        = "P. Del\'{e}cluse and G. Madec",
704  year          = "1999",
705  publisher     = "North Holland",
706  isbn          = "978-0-444-50338-1"
707}
708
709@phdthesis{       demange_phd14,
710  title         = "Advection and gravity waves propagation numerical schemes
711                  for oceanic circulation models",
712  pages         = "138",
713  author        = "J. Demange",
714  school        = "Grenoble University, France",
715  year          = "2014",
716  url           = "https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01104703/file/DEMANGE_2014_archivage.pdf"
717}
718
719@article{         dobricic.pinardi.ea_OS07,
720  title         = "Daily oceanographic analyses by Mediterranean Forecasting
721                  System at the basin scale",
722  pages         = "149--157",
723  journal       = "Ocean Science",
724  volume        = "3",
725  number        = "1",
726  author        = "S. Dobricic and N. Pinardi and M. Adani and M. Tonani and
727                  C. Fratianni and A. Bonazzi and V. Fernandez",
728  year          = "2007",
729  month         = "mar",
730  publisher     = "Copernicus GmbH",
731  issn          = "1812-0792",
732  doi           = "10.5194/os-3-149-2007"
733}
734
735@article{         drijfhout_JPO94,
736  title         = "Heat transport by mesoscale eddies in an ocean circulation
737                  Model",
738  pages         = "353--369",
739  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
740  volume        = "24",
741  number        = "2",
742  author        = "S. S. Drijfhout",
743  year          = "1994",
744  month         = "feb",
745  publisher     = "American Meteorological Society",
746  issn          = "1520-0485",
747  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0353:htbmei>2.0.co;2"
748}
749
750@article{         dukowicz.smith_JGR94,
751  title         = "Implicit free-surface method for the Bryan-Cox-Semtner
752                  ocean model",
753  pages         = "7991--8014",
754  journal       = "Journal of Geophysical Research",
755  volume        = "99",
756  number        = "C4",
757  author        = "J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
758  year          = "1994",
759  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
760  issn          = "0148-0227",
761  doi           = "10.1029/93jc03455"
762}
763
764@article{         edson.jampana.ea_JPO13,
765  title         = "On the Exchange of Momentum over the Open Ocean",
766  pages         = "1589--1610",
767  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
768  volume        = "43",
769  number        = "8",
770  author        = "Edson, James B. and Jampana, Venkata and Weller, Robert A.
771                  and Bigorre, Sebastien P. and Plueddemann, Albert J. and
772                  Fairall, Christopher W. and Miller, Scott D. and Mahrt,
773                  Larry and Vickers, Dean and Hersbach, Hans",
774  year          = "2013",
775  month         = "aug",
776  publisher     = "American Meteorological Society",
777  issn          = "0022-3670",
778  doi           = "10.1175/JPO-D-12-0173.1"
779}
780
781@article{         eiseman.stone_SR80,
782  title         = "Conservation laws of fluid dynamics - {A} survey",
783  pages         = "12--27",
784  journal       = "SIAM Review",
785  volume        = "22",
786  number        = "1",
787  author        = "P. R. Eiseman and A. P. Stone",
788  year          = "1980",
789  month         = "jan",
790  publisher     = "Society for Industrial & Applied Mathematics (SIAM)",
791  issn          = "1095-7200",
792  doi           = "10.1137/1022002"
793}
794
795@article{         emile-geay.madec_OS09,
796  title         = "Geothermal heating, diapycnal mixing and the abyssal
797                  circulation",
798  pages         = "203--217",
799  journal       = "Ocean Science",
800  volume        = "5",
801  number        = "2",
802  author        = "J. Emile-Geay and G. Madec",
803  year          = "2009",
804  month         = "jun",
805  publisher     = "Copernicus GmbH",
806  issn          = "1812-0792",
807  doi           = "10.5194/os-5-203-2009"
808}
809
810@article{         engedahl_T95,
811  title         = "Use of the flow relaxation scheme in a three-dimensional
812                  baroclinic ocean model with realistic topography",
813  pages         = "365--382",
814  journal       = "Tellus A",
815  volume        = "47",
816  number        = "3",
817  author        = "H. Engedahl",
818  year          = "1995",
819  month         = "jan",
820  publisher     = "Informa UK Limited",
821  issn          = "1600-0870",
822  doi           = "10.3402/tellusa.v47i3.11523"
823}
824
825@article{         fairall.bradley.ea_JC03,
826  title         = "Bulk parameterization of air-sea fluxes: Updates and
827                  verification for the COARE algorithm",
828  pages         = "571--591",
829  journal       = "Journal of Climate",
830  volume        = "16",
831  number        = "4",
832  author        = "Fairall, C. W. and Bradley, E. F. and Hare, J. E. and
833                  Grachev, A. A. and Edson, J. B.",
834  year          = "2003",
835  publisher     = "American Meteorological Society",
836  issn          = "08948755",
837  doi           = "10.1175/1520-0442(2003)016<0571:BPOASF>2.0.CO;2"
838}
839
840@article{         fairall.bradley.ea_JGRO96,
841  title         = "Cool-skin and warm-layer effects on sea surface
842                  temperature",
843  pages         = "1295--1308",
844  journal       = "Journal of Geophysical Research: Oceans",
845  volume        = "101",
846  number        = "C1",
847  author        = "C. W. Fairall and E. F. Bradley and J. S. Godfrey and G.
848                  A. Wick and J. B. Edson and G. S. Young",
849  year          = "1996",
850  month         = "jan",
851  publisher     = "American Geophysical Union",
852  doi           = "10.1029/95jc03190"
853}
854
855@phdthesis{       farge-coulombier_phd87,
856  title         = "Dynamique non-lin\'{e}aire des ondes et des tourbillons
857                  dans les \'{e}quations de Saint-Venant",
858  pages         = "353",
859  author        = "M. {Farge Coulombier}",
860  school        = "Paris VI University, France",
861  year          = "1987",
862  url           = "http://www.theses.fr/1987PA066365"
863}
864
865@article{         farrow.stevens_JPO95,
866  title         = "A new tracer advection scheme for Bryan and Cox type Ocean
867                  General Circulation Models",
868  pages         = "1731--1741",
869  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
870  volume        = "25",
871  number        = "7",
872  author        = "D. E. Farrow and D. P. Stevens",
873  year          = "1995",
874  month         = "jul",
875  publisher     = "American Meteorological Society",
876  issn          = "1520-0485",
877  doi           = "10.1175/1520-0485(1995)025<1731:antasf>2.0.co;2"
878}
879
880@article{         flather_JPO94,
881  title         = "A storm surge prediction model for the northern Bay of
882                  Bengal with application to the cyclone disaster in April
883                  1991",
884  pages         = "172--190",
885  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
886  volume        = "24",
887  number        = "1",
888  author        = "R. A. Flather",
889  year          = "1994",
890  month         = "jan",
891  publisher     = "American Meteorological Society",
892  issn          = "1520-0485",
893  doi           = "10.1175/1520-0485(1994)024<0172:asspmf>2.0.co;2"
894}
895
896@book{            fofonoff.millard_bk83,
897  pages         = "53",
898  booktitle     = "Algorithms for computation of fundamental properties of
899                  seawater",
900  editor        = "UNESCO/ICES/SCOR/IAPSO",
901  series        = "Technical Paper in Marine Science",
902  volume        = "44",
903  author        = "N P. Fofonoff and R. C. Millard",
904  year          = "1983",
905  publisher     = "UNESCO",
906  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000059832.locale=en"
907}
908
909@article{         fox-kemper.ferrari.ea_JPO08,
910  title         = "Parameterization of Mixed Layer Eddies. Part I: Theory and
911                  Diagnosis",
912  pages         = "1145--1165",
913  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
914  volume        = "38",
915  number        = "6",
916  author        = "B. Fox-Kemper and R. Ferrari and B. Hallberg",
917  year          = "2008",
918  month         = "jun",
919  publisher     = "American Meteorological Society",
920  issn          = "1520-0485",
921  doi           = "10.1175/2007JPO3792.1"
922}
923
924@article{         galperin.kantha.ea_JAS88,
925  title         = "A quasi-equilibrium turbulent energy model for geophysical
926                  flows",
927  pages         = "55--62",
928  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
929  volume        = "45",
930  number        = "1",
931  author        = "B. Galperin and L. H. Kantha and S. Hassid and A. Rosati",
932  year          = "1988",
933  month         = "jan",
934  publisher     = "American Meteorological Society",
935  issn          = "1520-0469",
936  doi           = "10.1175/1520-0469(1988)045<0055:aqetem>2.0.co;2"
937}
938
939@article{         gargett_JMR84,
940  title         = "Vertical eddy diffusivity in the ocean interior",
941  pages         = "359--393",
942  journal       = "Journal of Marine Research",
943  volume        = "42",
944  number        = "2",
945  author        = "A. E. Gargett",
946  year          = "1984",
947  month         = "may",
948  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
949  issn          = "1543-9542",
950  doi           = "10.1357/002224084788502756"
951}
952
953@article{         gaspar.gregoris.ea_JGR90,
954  title         = "A simple eddy kinetic energy model for simulations of the
955                  oceanic vertical mixing: Tests at station Papa and
956                  long-term upper ocean study site",
957  pages         = "16179",
958  journal       = "Journal of Geophysical Research",
959  volume        = "95",
960  number        = "C9",
961  author        = "P. Gaspar and Y. Gr{\'e}goris and J.-M. Lefevre",
962  year          = "1990",
963  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
964  issn          = "0148-0227",
965  doi           = "10.1029/jc095ic09p16179"
966}
967
968@article{         gent.mcwilliams_JPO90,
969  title         = "Isopycnal Mixing in Ocean Circulation Models",
970  pages         = "150--155",
971  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
972  volume        = "20",
973  number        = "1",
974  author        = "P. R. Gent and J. C. McWilliams",
975  year          = "1990",
976  month         = "jan",
977  publisher     = "American Meteorological Society",
978  issn          = "1520-0485",
979  doi           = "10.1175/1520-0485(1990)020<0150:imiocm>2.0.co;2"
980}
981
982@article{         gentemann.minnett.ea_JGR09,
983  title         = "Profiles of Ocean Surface Heating ({POSH}): {A} new model
984                  of upper ocean diurnal warming",
985  pages         = "C07017",
986  journal       = "Journal of Geophysical Research",
987  volume        = "114",
988  number        = "C7",
989  author        = "C. L. Gentemann and P. J. Minnett and B. Ward",
990  year          = "2009",
991  month         = "jul",
992  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
993  issn          = "0148-0227",
994  doi           = "10.1029/2008jc004825"
995}
996
997@article{         gerdes.koberle.ea_CD91,
998  title         = "The influence of numerical advection schemes on the
999                  results of Ocean General Circulation Models",
1000  pages         = "211--226",
1001  journal       = "Climate Dynamics",
1002  volume        = "5",
1003  number        = "4",
1004  author        = "R. Gerdes and C. K{\"{o}}berle and J. Willebrand",
1005  year          = "1991",
1006  month         = "jun",
1007  publisher     = "Springer Nature",
1008  issn          = "1432-0894",
1009  doi           = "10.1007/bf00210006"
1010}
1011
1012@article{         gerdes_JGR93,
1013  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
1014                  general vertical coordinate transformation: 1. Description
1015                  and testing of the model",
1016  pages         = "14683--14701",
1017  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1018  volume        = "98",
1019  number        = "C8",
1020  author        = "R. Gerdes",
1021  year          = "1993",
1022  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1023  issn          = "0148-0227",
1024  doi           = "10.1029/93jc00760"
1025}
1026
1027@article{         gerdes_JGR93*a,
1028  title         = "A primitive equation ocean circulation model using a
1029                  general vertical coordinate transformation: 2. Application
1030                  to an overflow problem",
1031  pages         = "14703--14726",
1032  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1033  volume        = "98",
1034  number        = "C8",
1035  author        = "R. Gerdes",
1036  year          = "1993",
1037  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1038  issn          = "0148-0227",
1039  doi           = "10.1029/93jc00788"
1040}
1041
1042@techreport{      gibson_trpt86,
1043  title         = "Standards for software development and maintenance",
1044  pages         = "21",
1045  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
1046  number        = "120",
1047  author        = "J. K. Gibson",
1048  institution   = "ECMWF Operations Department; Reading, United Kingdom",
1049  year          = "1986",
1050  month         = "aug",
1051  doi           = "10.21957/gi113q4gn"
1052}
1053
1054@book{            gill_bk82,
1055  pages         = "662",
1056  booktitle     = "Atmosphere-Ocean Dynamics",
1057  series        = "International Geophysics",
1058  volume        = "30",
1059  author        = "A. E. Gill",
1060  year          = "1982",
1061  month         = "nov",
1062  publisher     = "Elsevier",
1063  issn          = "0074-6142",
1064  isbn          = "978-0-12-283522-3",
1065  doi           = "10.1016/s0074-6142(08)x6002-4"
1066}
1067
1068@article{         goff_JGR10,
1069  title         = "Global prediction of abyssal hill root-mean-square heights
1070                  from small-scale altimetric gravity variability",
1071  pages         = "B12104",
1072  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1073  volume        = "115",
1074  number        = "B12",
1075  author        = "J. A. Goff",
1076  year          = "2010",
1077  month         = "dec",
1078  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1079  issn          = "0148-0227",
1080  doi           = "10.1029/2010jb007867"
1081}
1082
1083@article{         graham.mcdougall_JPO13,
1084  title         = "Quantifying the nonconservative production of conservative
1085                  temperature, potential temperature, and entropy",
1086  pages         = "838--862",
1087  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1088  volume        = "43",
1089  number        = "5",
1090  author        = "F. S. Graham and T. J. McDougall",
1091  year          = "2013",
1092  month         = "may",
1093  publisher     = "American Meteorological Society",
1094  issn          = "1520-0485",
1095  doi           = "10.1175/jpo-d-11-0188.1"
1096}
1097
1098@article{         greatbatch_JGR94,
1099  title         = "A note on the representation of steric sea level in models
1100                  that conserve volume rather than mass",
1101  pages         = "12767--12771",
1102  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1103  volume        = "99",
1104  number        = "C6",
1105  author        = "R. J. Greatbatch",
1106  year          = "1994",
1107  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1108  issn          = "0148-0227",
1109  doi           = "10.1029/94jc00847"
1110}
1111
1112@article{         griffies.biastoch.ea_OM09,
1113  title         = "Coordinated Ocean-ice Reference Experiments ({CORE}s)",
1114  pages         = "1--46",
1115  journal       = "Ocean Modelling",
1116  volume        = "26",
1117  number        = "1-2",
1118  author        = "S. M. Griffies and A. Biastoch and C. B{\"{o}}ning and F.
1119                  Bryan and G. Danabasoglu and E. P. Chassignet and M. H.
1120                  England and R. Gerdes and H. Haak and R. W. Hallberg and W.
1121                  Hazeleger and J. Jungclaus and W. G. Large and G. Madec and
1122                  A. Pirani and B. L. Samuels and M. Scheinert and A. Sen
1123                  Gupta and C. A. Severijns and H. L. Simmons and A.-M.
1124                  Tr\'{e}guier and M. Winton and S. Yeager and J. Yin",
1125  year          = "2009",
1126  month         = "jan",
1127  publisher     = "Elsevier BV",
1128  issn          = "1463-5003",
1129  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.08.007"
1130}
1131
1132@article{         griffies.gnanadesikan.ea_JPO98,
1133  title         = "Isoneutral Diffusion in a z-coordinate Ocean Model",
1134  pages         = "805--830",
1135  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1136  volume        = "28",
1137  number        = "5",
1138  author        = "S. M. Griffies and A. Gnanadesikan and R. C. Pacanowski
1139                  and V. D. Larichev and J. K. Dukowicz and R. D. Smith",
1140  year          = "1998",
1141  month         = "may",
1142  publisher     = "American Meteorological Society",
1143  issn          = "1520-0485",
1144  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0805:idiazc>2.0.co;2"
1145}
1146
1147@article{         griffies.pacanowski.ea_MWR01,
1148  title         = "Tracer Conservation with an Explicit Free Surface Method
1149                  for z-coordinate Ocean Models",
1150  pages         = "1081--1098",
1151  journal       = "Monthly Weather Review",
1152  volume        = "129",
1153  number        = "5",
1154  author        = "S. M. Griffies and R. C. Pacanowski and M. Schmidt and V.
1155                  Balaji",
1156  year          = "2001",
1157  month         = "may",
1158  publisher     = "American Meteorological Society",
1159  issn          = "1520-0493",
1160  doi           = "10.1175/1520-0493(2001)129<1081:tcwaef>2.0.co;2"
1161}
1162
1163@article{         griffies_JPO98,
1164  title         = "The Gent-McWilliams skew-flux",
1165  pages         = "831--841",
1166  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1167  volume        = "28",
1168  number        = "5",
1169  author        = "S. M. Griffies",
1170  year          = "1998",
1171  month         = "may",
1172  publisher     = "American Meteorological Society",
1173  issn          = "1520-0485",
1174  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0831:tgmsf>2.0.co;2"
1175}
1176
1177@book{            griffies_bk04,
1178  pages         = "434",
1179  booktitle     = "Fundamentals of ocean climate models",
1180  author        = "S. M. Griffies",
1181  year          = "2004",
1182  month         = "dec",
1183  publisher     = "Princeton University Press",
1184  isbn          = "978-0-691-18712-9",
1185  doi           = "10.2307/j.ctv301gzg"
1186}
1187
1188@article{         guilyardi.madec.ea_CD01,
1189  title         = "The role of lateral ocean physics in the upper ocean
1190                  thermal balance of a coupled ocean-atmosphere {GCM}",
1191  pages         = "589--599",
1192  journal       = "Climate Dynamics",
1193  volume        = "17",
1194  number        = "8",
1195  author        = "E. Guilyardi and G. Madec and L. Terray",
1196  year          = "2001",
1197  month         = "may",
1198  publisher     = "Springer Science and Business Media LLC",
1199  issn          = "0930-7575",
1200  doi           = "10.1007/pl00007930"
1201}
1202
1203@article{         haney_JPO91,
1204  title         = "On the Pressure Gradient Force over Steep Topography in
1205                  Sigma Coordinate Ocean Models",
1206  pages         = "610--619",
1207  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1208  volume        = "21",
1209  number        = "4",
1210  author        = "R. L. Haney",
1211  year          = "1991",
1212  month         = "apr",
1213  publisher     = "American Meteorological Society",
1214  issn          = "1520-0485",
1215  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<0610:otpgfo>2.0.co;2"
1216}
1217
1218@article{         hazeleger.drijfhout_JGR00,
1219  title         = "A model study on internally generated variability in
1220                  subtropical mode water formation",
1221  pages         = "13965--13979",
1222  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1223  volume        = "105",
1224  number        = "C6",
1225  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1226  year          = "2000",
1227  month         = "jun",
1228  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1229  issn          = "0148-0227",
1230  doi           = "10.1029/2000jc900041"
1231}
1232
1233@article{         hazeleger.drijfhout_JPO00,
1234  title         = "Eddy subduction in a model of the subtropical gyre",
1235  pages         = "677--695",
1236  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1237  volume        = "30",
1238  number        = "4",
1239  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1240  year          = "2000",
1241  month         = "apr",
1242  publisher     = "American Meteorological Society",
1243  issn          = "1520-0485",
1244  doi           = "10.1175/1520-0485(2000)030<0677:esiamo>2.0.co;2"
1245}
1246
1247@article{         hazeleger.drijfhout_JPO98,
1248  title         = "Mode water variability in a model of the subtropical gyre:
1249                  response to anomalous forcing",
1250  pages         = "266--288",
1251  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1252  volume        = "28",
1253  number        = "2",
1254  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1255  year          = "1998",
1256  month         = "feb",
1257  publisher     = "American Meteorological Society",
1258  issn          = "1520-0485",
1259  doi           = "10.1175/1520-0485(1998)028<0266:mwviam>2.0.co;2"
1260}
1261
1262@article{         hazeleger.drijfhout_JPO99,
1263  title         = "Stochastically forced mode water variability",
1264  pages         = "1772--1786",
1265  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1266  volume        = "29",
1267  number        = "8",
1268  author        = "W. Hazeleger and S. S. Drijfhout",
1269  year          = "1999",
1270  month         = "aug",
1271  publisher     = "American Meteorological Society",
1272  issn          = "1520-0485",
1273  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1772:sfmwv>2.0.co;2"
1274}
1275
1276@article{         he.ding_JS01,
1277  title         = "Using accurate arithmetics to improve numerical
1278                  reproducibility and stability in parallel applications",
1279  pages         = "259--277",
1280  journal       = "The Journal of Supercomputing",
1281  volume        = "18",
1282  number        = "3",
1283  author        = "Y. He and C. H. Q. Ding",
1284  year          = "2001",
1285  publisher     = "Springer Nature",
1286  issn          = "0920-8542",
1287  doi           = "10.1023/a:1008153532043"
1288}
1289
1290@article{         hirt.amsden.ea_JCP74,
1291  title         = "An arbitrary Lagrangian-Eulerian computing method for all
1292                  flow speeds",
1293  pages         = "227--253",
1294  journal       = "Journal of Computational Physics",
1295  volume        = "14",
1296  number        = "3",
1297  author        = "C. W. Hirt and A. A. Amsden and J. L. Cook",
1298  year          = "1974",
1299  month         = "mar",
1300  publisher     = "Elsevier BV",
1301  issn          = "0021-9991",
1302  doi           = "10.1016/0021-9991(74)90051-5"
1303}
1304
1305@article{         hofmeister.burchard.ea_OM10,
1306  title         = "Non-uniform adaptive vertical grids for 3{D} numerical
1307                  ocean models",
1308  pages         = "70--86",
1309  journal       = "Ocean Modelling",
1310  volume        = "33",
1311  number        = "1-2",
1312  author        = "R. Hofmeister and H. Burchard and J.-M. Beckers",
1313  year          = "2010",
1314  month         = "jan",
1315  publisher     = "Elsevier BV",
1316  issn          = "1463-5003",
1317  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.12.003"
1318}
1319
1320@article{         holland.jenkins_JPO99,
1321  title         = "Modeling thermodynamic ice-ocean interactions at the base
1322                  of an ice shelf",
1323  pages         = "1787--1800",
1324  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1325  volume        = "29",
1326  number        = "8",
1327  author        = "D. M. Holland and A. Jenkins",
1328  year          = "1999",
1329  month         = "aug",
1330  publisher     = "American Meteorological Society",
1331  issn          = "1520-0485",
1332  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1787:mtioia>2.0.co;2"
1333}
1334
1335@techreport{      hunter_trpt06,
1336  title         = "Specification for Test Models of Ice Shelf Cavities",
1337  pages         = "17",
1338  number        = "7",
1339  author        = "J. R. Hunter",
1340  institution   = "Antarctic Climate \& Ecosystems Cooperative Research
1341                  Centre",
1342  year          = "2006",
1343  month         = "jun",
1344  url           = "http://staff.acecrc.org.au/~bkgalton/ISOMIP/test_cavities.pdf"
1345}
1346
1347@book{            ioc.iapso_bk10,
1348  title         = "The international thermodynamic equation of seawater -
1349                  2010: Calculation and use of thermodynamic properties",
1350  pages         = "196",
1351  editor        = "Intergovernmental Oceanographic Commission",
1352  series        = "Manuals and Guides",
1353  volume        = "56",
1354  author        = "IOC, SCOR and IAPSO",
1355  year          = "2010",
1356  month         = "mar",
1357  publisher     = "UNESCO",
1358  url           = "https://unesdoc.unesco.org/ark:/48223/pf0000188170.locale=en"
1359}
1360
1361@article{         jackson.rehmann_JPO14,
1362  title         = "Experiments on differential scalar mixing in turbulence in
1363                  a sheared, stratified flow",
1364  pages         = "2661--2680",
1365  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1366  volume        = "44",
1367  number        = "10",
1368  author        = "P. R. Jackson and C. R. Rehmann",
1369  year          = "2014",
1370  month         = "oct",
1371  publisher     = "American Meteorological Society",
1372  issn          = "1520-0485",
1373  doi           = "10.1175/jpo-d-14-0027.1"
1374}
1375
1376@techreport{      janssen.breivik.ea_trpt13,
1377  title         = "Air-sea interaction and surface waves",
1378  pages         = "36",
1379  series        = "ECMWF Technical Memoranda",
1380  volume        = "712",
1381  author        = "P. A. E. M. Janssen and {\O}. Breivik and K. Mogensen and
1382                  F. Vitart and M. Alonso-Balmaseda and J.-R. Bidlot and S.
1383                  Keeley and M. Leutbecher and L. Magnusson and F. Molteni",
1384  institution   = "ECMWF Research Departement; Reading, United Kingdom",
1385  year          = "2013",
1386  month         = "nov",
1387  doi           = "10.21957/0kg73joh"
1388}
1389
1390@article{         jenkins.nicholls.ea_JPO10,
1391  title         = "Observation and parameterization of ablation at the base
1392                  of Ronne Ice Shelf, Antarctica",
1393  pages         = "2298--2312",
1394  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1395  volume        = "40",
1396  number        = "10",
1397  author        = "A. Jenkins and K. W. Nicholls and H. F. J. Corr",
1398  year          = "2010",
1399  month         = "oct",
1400  publisher     = "American Meteorological Society",
1401  issn          = "1520-0485",
1402  doi           = "10.1175/2010jpo4317.1"
1403}
1404
1405@article{         jenkins_JGR91,
1406  title         = "A one-dimensional model of ice shelf-ocean interaction",
1407  pages         = "20671--20677",
1408  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1409  volume        = "96",
1410  number        = "C11",
1411  author        = "A. Jenkins",
1412  year          = "1991",
1413  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1414  issn          = "0148-0227",
1415  doi           = "10.1029/91jc01842"
1416}
1417
1418@article{         josey.gulev.ea_OCC13,
1419  title         = "Exchanges Through the Ocean Surface",
1420  pages         = "115--140",
1421  journal       = "Ocean Circulation and Climate",
1422  author        = "Josey, Simon A. and Gulev, Serge and Yu, Lisan",
1423  year          = "2013",
1424  publisher     = "Elsevier",
1425  issn          = "0074-6142",
1426  isbn          = "9780123918512",
1427  doi           = "10.1016/b978-0-12-391851-2.00005-2"
1428}
1429
1430@article{         kantha.carniel_JMR03,
1431  title         = "Comments on ``{A} generic length-scale equation for
1432                  geophysical turbulence models'' by {L}. Umlauf and {H}.
1433                  Burchard",
1434  pages         = "693--702",
1435  journal       = "Journal of Marine Research",
1436  volume        = "61",
1437  number        = "5",
1438  author        = "L. Kantha and S. Carniel",
1439  year          = "2003",
1440  month         = "sep",
1441  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1442  issn          = "1543-9542",
1443  doi           = "10.1357/002224003771816007"
1444}
1445
1446@article{         kantha.clayson_JGR94,
1447  title         = "An improved mixed layer model for geophysical
1448                  applications",
1449  pages         = "25235--25266",
1450  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1451  volume        = "99",
1452  number        = "C12",
1453  author        = "L. H. Kantha and C. A. Clayson",
1454  year          = "1994",
1455  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1456  issn          = "0148-0227",
1457  doi           = "10.1029/94jc02257"
1458}
1459
1460@article{         kasahara_MWR74,
1461  title         = "Various vertical coordinate systems used for numerical
1462                  weather prediction",
1463  pages         = "509--522",
1464  journal       = "Monthly Weather Review",
1465  volume        = "102",
1466  number        = "7",
1467  author        = "A. Kasahara",
1468  year          = "1974",
1469  month         = "jul",
1470  publisher     = "American Meteorological Society",
1471  issn          = "1520-0493",
1472  doi           = "10.1175/1520-0493(1974)102<0509:vvcsuf>2.0.co;2"
1473}
1474
1475@article{         killworth.webb.ea_JPO91,
1476  title         = "The development of a free-surface Bryan-Cox-Semtner ocean
1477                  model",
1478  pages         = "1333--1348",
1479  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1480  volume        = "21",
1481  number        = "9",
1482  author        = "P. D. Killworth and D. J. Webb and D. Stainforth and S. M.
1483                  Paterson",
1484  year          = "1991",
1485  month         = "sep",
1486  publisher     = "American Meteorological Society",
1487  issn          = "1520-0485",
1488  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1333:tdoafs>2.0.co;2"
1489}
1490
1491@article{         killworth_JPO92,
1492  title         = "An equivalent-barotropic mode in the fine resolution
1493                  Antarctic model",
1494  pages         = "1379--1387",
1495  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1496  volume        = "22",
1497  number        = "11",
1498  author        = "P. D. Killworth",
1499  year          = "1992",
1500  month         = "nov",
1501  publisher     = "American Meteorological Society",
1502  issn          = "1520-0485",
1503  doi           = "10.1175/1520-0485(1992)022<1379:aebmit>2.0.co;2"
1504}
1505
1506@inproceedings{   killworth_iprc89,
1507  title         = "On the parameterization of deep convection in ocean
1508                  models",
1509  pages         = "59--74",
1510  booktitle     = "Parameterization of small-scale processes",
1511  editor        = "P. Muller and D. Henderson",
1512  author        = "P. D. Killworth",
1513  year          = "1989",
1514  month         = "jan",
1515  publisher     = "Hawaii Institute of Geophysics",
1516  url           = "http://www.soest.hawaii.edu/PubServices/1989pdfs/Killworth.pdf"
1517}
1518
1519@article{         koch-larrouy.madec.ea_GRL07,
1520  title         = "On the transformation of Pacific water into Indonesian
1521                  ThroughFlow water by internal tidal mixing",
1522  pages         = "L04604",
1523  journal       = "Geophysical Research Letters",
1524  volume        = "34",
1525  number        = "4",
1526  author        = "A. Koch-Larrouy and G. Madec and P. Bouruet-Aubertot and
1527                  T. Gerkema and L. Bessi\`{e}res and R. Molcard",
1528  year          = "2007",
1529  month         = "feb",
1530  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1531  issn          = "0094-8276",
1532  doi           = "10.1029/2006gl028405"
1533}
1534
1535@article{         kolmogorov_IANS42,
1536  title         = "Equations of turbulent motion in an incompressible fluid",
1537  pages         = "56--58",
1538  journal       = "Izvestiya Akademiya Nauk SSSR",
1539  series        = "Fizika",
1540  volume        = "6",
1541  author        = "A. N. Kolmogorov",
1542  year          = "1942"
1543}
1544
1545@article{         kraus.businger_QJRMS96,
1546  title         = "Atmosphere-ocean interaction.",
1547  pages         = "324--325",
1548  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
1549  volume        = "122",
1550  number        = "529",
1551  author        = "E. B. Kraus and J. A. Businger",
1552  year          = "1996",
1553  publisher     = "John Wiley & Sons, Ltd",
1554  issn          = "1477-870X",
1555  doi           = "10.1002/qj.49712252914"
1556}
1557
1558@article{         kraus.turner_T67,
1559  title         = "A one-dimensional model of the seasonal thermocline II.
1560                  The general theory and its consequences",
1561  pages         = "98--106",
1562  journal       = "Tellus",
1563  volume        = "19",
1564  number        = "1",
1565  author        = "Kraus, E. B. and Turner, J. S.",
1566  year          = "1967",
1567  month         = "Jan",
1568  publisher     = "Informa UK Limited",
1569  issn          = "2153-3490",
1570  doi           = "10.3402/tellusa.v19i1.9753"
1571}
1572
1573@article{         large.mcwilliams.ea_RG94,
1574  title         = "Oceanic vertical mixing: {A} review and a model with a
1575                  nonlocal boundary layer parameterization",
1576  pages         = "363--403",
1577  journal       = "Reviews of Geophysics",
1578  number        = "4",
1579  author        = "Large, W. G. and McWilliams, J. C. and Doney, S. C.",
1580  year          = "1994",
1581  publisher     = "AGU",
1582  doi           = "10.1029/94RG01872"
1583}
1584
1585@article{         large.yeager_CD09,
1586  title         = "The Global Climatology of an Interannually Varying Air-Sea
1587                  Flux Data Set",
1588  pages         = "341--364",
1589  journal       = "Climate Dynamics",
1590  volume        = "33",
1591  number        = "2-3",
1592  author        = "Large, W. G. and Yeager, S. G.",
1593  year          = "2009",
1594  month         = "aug",
1595  publisher     = "Springer Science and Business Media LLC",
1596  doi           = "10.1007/s00382-008-0441-3"
1597}
1598
1599@techreport{      large.yeager_trpt04,
1600  title         = "Diurnal to decadal global forcing for ocean and sea-ice
1601                  models: the data sets and flux climatologies",
1602  author        = "W. G. Large and S. G. Yeager",
1603  institution   = "{NCAR} Climate and global dynamics division; Boulder, CO,
1604                  United States",
1605  year          = "2004",
1606  month         = "may",
1607  doi           = "10.5065/d6kk98q6"
1608}
1609
1610@article{         lazar.madec.ea_JPO99,
1611  title         = "The Deep Interior Downwelling, the Veronis Effect, and
1612                  Mesoscale Tracer Transport Parameterizations in an {OGCM}",
1613  pages         = "2945--2961",
1614  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1615  volume        = "29",
1616  number        = "11",
1617  author        = "A. Lazar and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
1618  year          = "1999",
1619  month         = "nov",
1620  publisher     = "American Meteorological Society",
1621  issn          = "1520-0485",
1622  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<2945:tdidtv>2.0.co;2"
1623}
1624
1625@phdthesis{       lazar_phd97,
1626  title         = "La branche froide de la circulation thermohaline -
1627                  sensibilit\'{e} \`{a} la diffusion turbulente dans un
1628                  mod\`{e}le de circulation g\'{e}n\'{e}rale
1629                  id\'{e}alis\'{e}e",
1630  pages         = "269",
1631  author        = "A. Lazar",
1632  school        = "Universit\'{e} Pierre et Marie Curie, Paris, France",
1633  year          = "1997",
1634  url           = "http://www.theses.fr/1997PA066680"
1635}
1636
1637@article{         le-sommer.penduff.ea_OM09,
1638  title         = "How momentum advection schemes influence
1639                  current-topography interactions at eddy permitting
1640                  resolution",
1641  pages         = "1--14",
1642  journal       = "Ocean Modelling",
1643  volume        = "29",
1644  number        = "1",
1645  author        = "J. {Le Sommer} and T. Penduff and S. Theetten and G. Madec
1646                  and B. Barnier",
1647  year          = "2009",
1648  month         = "jan",
1649  publisher     = "Elsevier BV",
1650  issn          = "1463-5003",
1651  doi           = "10.1016/j.ocemod.2008.11.007"
1652}
1653
1654@article{         leclair.madec_OM09,
1655  title         = "A conservative leapfrog time stepping method",
1656  pages         = "88--94",
1657  journal       = "Ocean Modelling",
1658  volume        = "30",
1659  number        = "2-3",
1660  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1661  year          = "2009",
1662  month         = "jan",
1663  publisher     = "Elsevier BV",
1664  issn          = "1463-5003",
1665  doi           = "10.1016/j.ocemod.2009.06.006"
1666}
1667
1668@article{         leclair.madec_OM11,
1669  title         = "$\tilde{z}$-coordinate, an arbitrary Lagrangian-Eulerian
1670                  coordinate separating high and low frequency motions",
1671  pages         = "139--152",
1672  journal       = "Ocean Modelling",
1673  volume        = "37",
1674  number        = "3-4",
1675  author        = "M. Leclair and G. Madec",
1676  year          = "2011",
1677  publisher     = "Elsevier BV",
1678  issn          = "1463-5003",
1679  doi           = "10.1016/j.ocemod.2011.02.001"
1680}
1681
1682@phdthesis{       leclair_phd10,
1683  title         = "Introduction d'une coordonn\'{e}e verticale arbitrairement
1684                  Lagrangienne Eul\'{e}rienne dans le code d'oc\'{e}an
1685                  {NEMO}",
1686  pages         = "163",
1687  author        = "M. Leclair",
1688  school        = "Universit\'{e} Pierre and Marie Curie, Paris, France",
1689  year          = "2010",
1690  url           = "http://www.theses.fr/2010PA066728"
1691}
1692
1693@article{         lele_JCP92,
1694  title         = "Compact finite difference schemes with spectral-like
1695                  resolution",
1696  pages         = "16--42",
1697  journal       = "Journal of Computational Physics",
1698  volume        = "103",
1699  number        = "1",
1700  author        = "S. K. Lele",
1701  year          = "1992",
1702  month         = "nov",
1703  publisher     = "Elsevier BV",
1704  issn          = "0021-9991",
1705  doi           = "10.1016/0021-9991(92)90324-r"
1706}
1707
1708@article{         lemarie.debreu.ea_OM12,
1709  title         = "On the stability and accuracy of the harmonic and
1710                  biharmonic isoneutral mixing operators in ocean models",
1711  pages         = "9--35",
1712  journal       = "Ocean Modelling",
1713  volume        = "52-53",
1714  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and A. F. Shchepetkin and J.
1715                  C. McWilliams",
1716  year          = "2012",
1717  month         = "aug",
1718  publisher     = "Elsevier BV",
1719  issn          = "1463-5003",
1720  doi           = "10.1016/j.ocemod.2012.04.007"
1721}
1722
1723@article{         lemarie.debreu.ea_OM15,
1724  title         = "Stability constraints for oceanic numerical models:
1725                  implications for the formulation of time and space
1726                  discretizations",
1727  pages         = "124--148",
1728  journal       = "Ocean Modelling",
1729  volume        = "92",
1730  author        = "F. Lemari\'{e} and L. Debreu and G. Madec and J. Demange
1731                  and J. M. Molines and M. Honnorat",
1732  year          = "2015",
1733  month         = "aug",
1734  publisher     = "Elsevier BV",
1735  issn          = "1463-5003",
1736  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.06.006"
1737}
1738
1739@article{         lengaigne.madec.ea_JGR03,
1740  title         = "Impact of isopycnal mixing on the tropical ocean
1741                  circulation",
1742  pages         = "3345",
1743  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1744  volume        = "108",
1745  number        = "C11",
1746  author        = "M. Lengaigne and G. Madec and G. Alory and C. Menkes",
1747  year          = "2003",
1748  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1749  issn          = "0148-0227",
1750  doi           = "10.1029/2002jc001704"
1751}
1752
1753@article{         lengaigne.menkes.ea_CD07,
1754  title         = "Influence of the oceanic biology on the tropical Pacific
1755                  climate in a Coupled General Circulation Model",
1756  pages         = "503--516",
1757  journal       = "Climate Dynamics",
1758  volume        = "28",
1759  number        = "5",
1760  author        = "M. Lengaigne and C. Menkes and O. Aumont and T. Gorgues
1761                  and L. Bopp and J.-M. Andr\'{e} and G. Madec",
1762  year          = "2007",
1763  month         = "nov",
1764  publisher     = "Springer Nature",
1765  issn          = "1432-0894",
1766  doi           = "10.1007/s00382-006-0200-2"
1767}
1768
1769@article{         leonard_CMAME79,
1770  title         = "A stable and accurate convective modelling procedure based
1771                  on quadratic upstream interpolation",
1772  pages         = "59--98",
1773  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1774  volume        = "19",
1775  number        = "1",
1776  author        = "B. P. Leonard",
1777  year          = "1979",
1778  month         = "jun",
1779  publisher     = "Elsevier BV",
1780  issn          = "0045-7825",
1781  doi           = "10.1016/0045-7825(79)90034-3"
1782}
1783
1784@article{         leonard_CMAME91,
1785  title         = "The {ULTIMATE} conservative difference scheme applied to
1786                  unsteady one-dimensional advection",
1787  pages         = "17--74",
1788  journal       = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
1789  volume        = "88",
1790  number        = "1",
1791  author        = "B. P. Leonard",
1792  year          = "1991",
1793  month         = "jun",
1794  publisher     = "Elsevier BV",
1795  issn          = "0045-7825",
1796  doi           = "10.1016/0045-7825(91)90232-u"
1797}
1798
1799@article{         lermusiaux_JMS01,
1800  title         = "Evolving the subspace of the three-dimensional multiscale
1801                  ocean variability: Massachusetts Bay",
1802  pages         = "385--422",
1803  journal       = "Journal of Marine Systems",
1804  volume        = "29",
1805  number        = "1-4",
1806  author        = "P. F. J. Lermusiaux",
1807  year          = "2001",
1808  month         = "may",
1809  publisher     = "Elsevier BV",
1810  issn          = "0924-7963",
1811  doi           = "10.1016/s0924-7963(01)00025-2"
1812}
1813
1814@techreport{      levier.treguier.ea_trpt07,
1815  title         = "Free surface and variable volume in the {NEMO} code",
1816  pages         = "47",
1817  author        = "B. Levier and A.-M. Tr\'{e}guier and G. Madec and V.
1818                  Garnier",
1819  institution   = "European Union: Marine Environment and Security for the
1820                  European Area (MERSEA) Integrated Project",
1821  year          = "2007",
1822  month         = "may",
1823  doi           = "10.5281/zenodo.3244182"
1824}
1825
1826@article{         levy.estublier.ea_GRL01,
1827  title         = "Choice of an advection scheme for biogeochemical models",
1828  pages         = "3725--3728",
1829  journal       = "Geophysical Research Letters",
1830  volume        = "28",
1831  number        = "19",
1832  author        = "M. L\'{e}vy and A. Estublier and G Madec",
1833  year          = "2001",
1834  month         = "oct",
1835  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1836  issn          = "0094-8276",
1837  doi           = "10.1029/2001gl012947"
1838}
1839
1840@article{         levy.klein.ea_OM10,
1841  title         = "Modifications of gyre circulation by sub-mesoscale
1842                  physics",
1843  pages         = "1--15",
1844  journal       = "Ocean Modelling",
1845  volume        = "34",
1846  number        = "1-2",
1847  author        = "M. L\'{e}vy and P. Klein and A.-M. Tr\'{e}guier and D.
1848                  Iovino and G. Madec and S. Masson and K. Takahashi",
1849  year          = "2010",
1850  month         = "jan",
1851  publisher     = "Elsevier BV",
1852  issn          = "1463-5003",
1853  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.04.001"
1854}
1855
1856@article{         li.garrett_JMR93,
1857  title         = "Cell merging and the jet/downwelling ratio in Langmuir
1858                  circulation",
1859  pages         = "737--769",
1860  journal       = "Journal of Marine Research",
1861  volume        = "51",
1862  number        = "4",
1863  author        = "M. Li and C. Garrett",
1864  year          = "1993",
1865  month         = "nov",
1866  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
1867  issn          = "1543-9542",
1868  doi           = "10.1357/0022240933223945"
1869}
1870
1871@article{         losch_JGR08,
1872  title         = "Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean
1873                  General Circulation Model",
1874  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1875  volume        = "113",
1876  number        = "C8",
1877  author        = "M. Losch",
1878  year          = "2008",
1879  month         = "aug",
1880  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
1881  issn          = "0148-0227",
1882  doi           = "10.1029/2007jc004368"
1883}
1884
1885@article{         lott.madec.ea_OM90,
1886  title         = "Topographic experiments in an Ocean General Circulation
1887                  Model",
1888  pages         = "1--4",
1889  journal       = "Ocean Modelling",
1890  volume        = "88",
1891  author        = "F. Lott and G. Madec and J. Verron",
1892  year          = "1990"
1893}
1894
1895@article{         lupkes.gryanik.ea_JGRA12,
1896  title         = "A parametrization, based on sea ice morphology, of the
1897                  neutral atmospheric drag coefficients for weather
1898                  prediction and climate models",
1899  pages         = "1--18",
1900  journal       = "Journal of Geophysical Research Atmospheres",
1901  volume        = "117",
1902  number        = "13",
1903  author        = "L{\"{u}}pkes, Christof and Gryanik, Vladimir M. and
1904                  Hartmann, J{\"{o}}rg and Andreas, Edgar L.",
1905  year          = "2012",
1906  issn          = "01480227",
1907  doi           = "10.1029/2012JD017630"
1908}
1909
1910@article{         lupkes.gryanik_JGR15,
1911  title         = "A stability-dependent parametrization of transfer
1912                  coefficients formomentum and heat over polar sea ice to be
1913                  used in climate models",
1914  pages         = "552--581",
1915  journal       = "Journal of Geophysical Research",
1916  volume        = "120",
1917  number        = "2",
1918  author        = "L{\"{u}}pkes, Christof and Gryanik, Vladimir M.",
1919  year          = "2015",
1920  issn          = "21562202",
1921  doi           = "10.1002/2014JD022418"
1922}
1923
1924@article{         madec.chartier.ea_DAO91,
1925  title         = "The effect of thermohaline forcing variability on deep
1926                  water formation in the western Mediterranean Sea: a
1927                  high-resolution three-dimensional numerical study",
1928  pages         = "301--332",
1929  journal       = "Dynamics of Atmospheres and Oceans",
1930  volume        = "15",
1931  number        = "3-5",
1932  author        = "G. Madec and M. Chartier and M. Cr\'{e}pon",
1933  year          = "1991",
1934  month         = "apr",
1935  publisher     = "Elsevier BV",
1936  issn          = "0377-0265",
1937  doi           = "10.1016/0377-0265(91)90024-a"
1938}
1939
1940@inproceedings{   madec.crepon_iprc91,
1941  title         = "Thermohaline-driven deep water formation in the
1942                  northwestern Mediterranean Sea",
1943  chapter       = "15",
1944  pages         = "241--265",
1945  booktitle     = "Deep convection and deep water formation in the oceans,
1946                  Proceedings of the international Monterey colloquium on
1947                  deep convection and deep water formation in the oceans",
1948  editor        = "P.C. Chu and J.C. Gascard",
1949  series        = "Elsevier Oceanography",
1950  volume        = "57",
1951  author        = "G. Madec and M. Cr\'{e}pon",
1952  year          = "1991",
1953  publisher     = "Elsevier",
1954  issn          = "0422-9894",
1955  isbn          = "978-0-444-88764-1",
1956  doi           = "10.1016/s0422-9894(08)70071-0"
1957}
1958
1959@article{         madec.delecluse.ea_JPO91,
1960  title         = "A three-dimensional numerical study of deep-water
1961                  formation in the northwestern Mediterranean Sea",
1962  pages         = "1349--1371",
1963  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1964  volume        = "21",
1965  number        = "9",
1966  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and M.
1967                  Chartier",
1968  year          = "1991",
1969  month         = "sep",
1970  publisher     = "American Meteorological Society",
1971  issn          = "1520-0485",
1972  doi           = "10.1175/1520-0485(1991)021<1349:atdnso>2.0.co;2"
1973}
1974
1975@article{         madec.delecluse.ea_JPO96,
1976  title         = "Large-Scale Preconditioning of Deep-Water Formation in the
1977                  northwestern Mediterranean Sea",
1978  pages         = "1393--1408",
1979  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
1980  volume        = "26",
1981  number        = "8",
1982  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Cr\'{e}pon and F.
1983                  Lott",
1984  year          = "1996",
1985  month         = "aug",
1986  publisher     = "American Meteorological Society",
1987  issn          = "1520-0485",
1988  doi           = "10.1175/1520-0485(1996)026<1393:lspodw>2.0.co;2"
1989}
1990
1991@book{            madec.delecluse.ea_NPM98,
1992  title         = "{OPA} 8.1 Ocean General Circulation Model reference
1993                  manual",
1994  pages         = "91",
1995  journal       = "Note du Pole de Mod\'{e}lisation",
1996  volume        = "11",
1997  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse and M. Imbard and C.
1998                  L\'{e}vy",
1999  year          = "1998",
2000  publisher     = "Institut Pierre Simon Laplace ({IPSL})",
2001  issn          = "1288-1619",
2002  url           = "http://cmc.ipsl.fr/images/publications/scientific_notes/note11.pdf"
2003}
2004
2005@article{         madec.delecluse_IWN97,
2006  title         = "The {OPA}/{ARPEGE} and {OPA}/{LMD} Global Ocean-Atmosphere
2007                  Coupled Model",
2008  pages         = "12--15",
2009  journal       = "International WOCE Newsletter",
2010  volume        = "26",
2011  author        = "G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
2012  year          = "1997",
2013  month         = "apr",
2014  publisher     = "University of Southampton",
2015  url           = "https://www.nodc.noaa.gov/woce/wdiu/wocedocs/newsltr/news26/news26.pdf"
2016}
2017
2018@article{         madec.imbard_CD96,
2019  title         = "A global ocean mesh to overcome the North Pole
2020                  singularity",
2021  pages         = "381--388",
2022  journal       = "Climate Dynamics",
2023  volume        = "12",
2024  number        = "6",
2025  author        = "G. Madec and M. Imbard",
2026  year          = "1996",
2027  month         = "may",
2028  publisher     = "Springer Nature",
2029  issn          = "1432-0894",
2030  doi           = "10.1007/bf00211684"
2031}
2032
2033@article{         maltrud.smith.ea_JGR98,
2034  title         = "Global eddy-resolving ocean simulations driven by
2035                  1985-1995 atmospheric winds",
2036  pages         = "30825--30853",
2037  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2038  volume        = "103",
2039  number        = "C13",
2040  author        = "M. E. Maltrud and R. D. Smith and A. J. Semtner and R. C.
2041                  Malone",
2042  year          = "1998",
2043  month         = "dec",
2044  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2045  issn          = "0148-0227",
2046  doi           = "10.1029/1998jc900013"
2047}
2048
2049@article{         marchesiello.mcwilliams.ea_OM01,
2050  title         = "Open boundary conditions for long-term integration of
2051                  regional oceanic models",
2052  pages         = "1--20",
2053  journal       = "Ocean Modelling",
2054  volume        = "3",
2055  number        = "1-2",
2056  author        = "P. Marchesiello and J. C. McWilliams and A. Shchepetkin",
2057  year          = "2001",
2058  month         = "jan",
2059  publisher     = "Elsevier BV",
2060  issn          = "1463-5003",
2061  doi           = "10.1016/s1463-5003(00)00013-5"
2062}
2063
2064@article{         marsaleix.auclair.ea_OM08,
2065  title         = "Energy conservation issues in sigma-coordinate
2066                  free-surface ocean models",
2067  pages         = "61--89",
2068  journal       = "Ocean Modelling",
2069  volume        = "20",
2070  number        = "1",
2071  author        = "P. Marsaleix and F. Auclair and J. W. Floor and M. J.
2072                  Herrmann and C. Estournel and I. Pairaud and C. Ulses",
2073  year          = "2008",
2074  month         = "jan",
2075  publisher     = "Elsevier BV",
2076  issn          = "1463-5003",
2077  doi           = "10.1016/j.ocemod.2007.07.005"
2078}
2079
2080@article{         marsh.ivchenko.ea_GMD15,
2081  title         = "{NEMO}-{ICB} (v1.0): interactive icebergs in the {NEMO}
2082                  ocean model globally configured at eddy-permitting
2083                  resolution",
2084  pages         = "1547--1562",
2085  journal       = "Geoscientific Model Development",
2086  volume        = "8",
2087  number        = "5",
2088  author        = "R. Marsh and V. O. Ivchenko and N. Skliris and S. Alderson
2089                  and G. R. Bigg and G. Madec and A. T. Blaker and Y. Aksenov
2090                  and B. Sinha and A. C. Coward and J. {Le Sommer} and N.
2091                  Merino and V. B. Zalesny",
2092  year          = "2015",
2093  month         = "may",
2094  publisher     = "Copernicus GmbH",
2095  issn          = "1991-9603",
2096  doi           = "10.5194/gmd-8-1547-2015"
2097}
2098
2099@article{         marti.madec.ea_JGR92,
2100  title         = "Comment on ``{N}et diffusivity in ocean general
2101                  circulation models with nonuniform grids'' by {F}. {L}. Yin
2102                  and {I}. {Y}. Fung",
2103  pages         = "12763--12766",
2104  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2105  volume        = "97",
2106  number        = "C8",
2107  author        = "O. Marti and G. Madec and P. Del\'{e}cluse",
2108  year          = "1992",
2109  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2110  issn          = "0148-0227",
2111  doi           = "10.1029/92jc00306"
2112}
2113
2114@article{         martin.adcroft_OM10,
2115  title         = "Parameterizing the fresh-water flux from land ice to ocean
2116                  with interactive icebergs in a coupled climate model",
2117  pages         = "111--124",
2118  journal       = "Ocean Modelling",
2119  volume        = "34",
2120  number        = "3-4",
2121  author        = "T. Martin and A. Adcroft",
2122  year          = "2010",
2123  month         = "jan",
2124  publisher     = "Elsevier BV",
2125  issn          = "1463-5003",
2126  doi           = "10.1016/j.ocemod.2010.05.001"
2127}
2128
2129@article{         mathiot.jenkins.ea_GMD17,
2130  title         = "Explicit representation and parametrised impacts of under
2131                  ice shelf seas in the \zstar coordinate ocean model {NEMO}
2132                  3.6",
2133  pages         = "2849--2874",
2134  journal       = "Geoscientific Model Development",
2135  volume        = "10",
2136  number        = "7",
2137  author        = "P. Mathiot and A. Jenkins and C. Harris and G. Madec",
2138  year          = "2017",
2139  month         = "jul",
2140  publisher     = "Copernicus GmbH",
2141  issn          = "1991-9603",
2142  doi           = "10.5194/gmd-10-2849-2017"
2143}
2144
2145@article{         mcdougall.taylor_JMR84,
2146  title         = "Flux measurements across a finger interface at low values
2147                  of the stability ratio",
2148  pages         = "1--14",
2149  journal       = "Journal of Marine Research",
2150  volume        = "42",
2151  number        = "1",
2152  author        = "T. J. McDougall and J. R. Taylor",
2153  year          = "1984",
2154  month         = "feb",
2155  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2156  issn          = "1543-9542",
2157  doi           = "10.1357/002224084788506095"
2158}
2159
2160@article{         mcdougall_JPO87,
2161  title         = "Neutral Surfaces",
2162  pages         = "1950--1964",
2163  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2164  volume        = "17",
2165  number        = "11",
2166  author        = "T. J. McDougall",
2167  year          = "1987",
2168  month         = "nov",
2169  publisher     = "American Meteorological Society",
2170  issn          = "1520-0485",
2171  doi           = "10.1175/1520-0485(1987)017<1950:ns>2.0.co;2"
2172}
2173
2174@article{         mcwilliams.sullivan.ea_JFM97,
2175  title         = "Langmuir turbulence in the ocean",
2176  pages         = "1--30",
2177  journal       = "Journal of Fluid Mechanics",
2178  volume        = "334",
2179  author        = "McWilliams, James C. and Sullivan, Peter P. and Moeng,
2180                  Chin-Hoh",
2181  year          = "1997",
2182  doi           = "10.1017/S0022112096004375"
2183}
2184
2185@article{         mellor.blumberg_JPO04,
2186  title         = "Wave Breaking and Ocean Surface Layer Thermal Response",
2187  pages         = "693--698",
2188  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2189  volume        = "34",
2190  number        = "3",
2191  author        = "G. Mellor and A. Blumberg",
2192  year          = "2004",
2193  month         = "mar",
2194  publisher     = "American Meteorological Society",
2195  issn          = "1520-0485",
2196  doi           = "10.1175/2517.1"
2197}
2198
2199@article{         mellor.yamada_RG82,
2200  title         = "Development of a turbulence closure model for geophysical
2201                  fluid problems",
2202  pages         = "851--875",
2203  journal       = "Reviews of Geophysics",
2204  volume        = "20",
2205  number        = "4",
2206  author        = "G. L. Mellor and T. Yamada",
2207  year          = "1982",
2208  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2209  issn          = "8755-1209",
2210  doi           = "10.1029/rg020i004p00851"
2211}
2212
2213@article{         merryfield.holloway.ea_JPO99,
2214  title         = "A Global Ocean Model with Double-Diffusive Mixing",
2215  pages         = "1124--1142",
2216  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2217  volume        = "29",
2218  number        = "6",
2219  author        = "W. J. Merryfield and G. Holloway and A. E. Gargett",
2220  year          = "1999",
2221  month         = "jun",
2222  publisher     = "American Meteorological Society",
2223  issn          = "1520-0485",
2224  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1124:agomwd>2.0.co;2"
2225}
2226
2227@book{            mesinger.arakawa_bk76,
2228  booktitle     = "Numerical methods used in atmospheric models",
2229  series        = "GARP Publication",
2230  volume        = "1",
2231  number        = "17",
2232  author        = "F. Mesinger and A. Arakawa",
2233  year          = "1976",
2234  month         = "aug",
2235  url           = "https://www.researchgate.net/publication/234333726_Numerical_Methods_Used_In_Atmospheric_Models"
2236}
2237
2238@article{         morel.berthon_LO89,
2239  title         = "Surface pigments, algal biomass profiles, and potential
2240                  production of the euphotic layer: Relationships
2241                  reinvestigated in view of remote-sensing applications",
2242  pages         = "1545--1562",
2243  journal       = "Limnology and Oceanography",
2244  volume        = "34",
2245  number        = "8",
2246  author        = "A. Morel and J.-F. Berthon",
2247  year          = "1989",
2248  month         = "dec",
2249  publisher     = "Wiley",
2250  issn          = "0024-3590",
2251  doi           = "10.4319/lo.1989.34.8.1545"
2252}
2253
2254@article{         morel.maritorena_JGR01,
2255  title         = "Bio-optical properties of oceanic waters: {A} reappraisal",
2256  pages         = "7163--7180",
2257  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2258  volume        = "106",
2259  number        = "C4",
2260  author        = "A. Morel and S. Maritorena",
2261  year          = "2001",
2262  month         = "apr",
2263  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2264  issn          = "0148-0227",
2265  doi           = "10.1029/2000jc000319"
2266}
2267
2268@article{         morel_JGR88,
2269  title         = "Optical modeling of the upper ocean in relation to its
2270                  biogenous matter content (case {I} waters)",
2271  pages         = "10749--10768",
2272  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2273  volume        = "93",
2274  number        = "C9",
2275  author        = "A. Morel",
2276  year          = "1988",
2277  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2278  issn          = "0148-0227",
2279  doi           = "10.1029/jc093ic09p10749"
2280}
2281
2282@article{         murray_JCP96,
2283  title         = "Explicit Generation of Orthogonal Grids for Ocean Models",
2284  pages         = "251--273",
2285  journal       = "Journal of Computational Physics",
2286  volume        = "126",
2287  number        = "2",
2288  author        = "R. J. Murray",
2289  year          = "1996",
2290  month         = "jul",
2291  publisher     = "Elsevier BV",
2292  issn          = "0021-9991",
2293  doi           = "10.1006/jcph.1996.0136"
2294}
2295
2296@article{         oey_OM06,
2297  title         = "An {OGCM} with movable land-sea boundaries",
2298  pages         = "176--195",
2299  journal       = "Ocean Modelling",
2300  volume        = "13",
2301  number        = "2",
2302  author        = "L.-Y. Oey",
2303  year          = "2006",
2304  month         = "jan",
2305  publisher     = "Elsevier BV",
2306  issn          = "1463-5003",
2307  doi           = "10.1016/j.ocemod.2006.01.001"
2308}
2309
2310@article{         osborn_JPO80,
2311  title         = "Estimates of the local rate of vertical diffusion from
2312                  dissipation measurements",
2313  pages         = "83--89",
2314  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2315  volume        = "10",
2316  number        = "1",
2317  author        = "T. R. Osborn",
2318  year          = "1980",
2319  month         = "jan",
2320  publisher     = "American Meteorological Society",
2321  issn          = "1520-0485",
2322  doi           = "10.1175/1520-0485(1980)010<0083:eotlro>2.0.co;2"
2323}
2324
2325@article{         pacanowski.gnanadesikan_MWR98,
2326  title         = "Transient response in a z-level ocean model that resolves
2327                  topography with partial-cells",
2328  pages         = "3248--3270",
2329  journal       = "Monthly Weather Review",
2330  volume        = "126",
2331  number        = "12",
2332  author        = "R. C. Pacanowski and A. Gnanadesikan",
2333  year          = "1998",
2334  month         = "dec",
2335  publisher     = "American Meteorological Society",
2336  issn          = "1520-0493",
2337  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3248:triazl>2.0.co;2"
2338}
2339
2340@article{         pacanowski.philander_JPO81,
2341  title         = "Parameterization of Vertical Mixing in Numerical Models of
2342                  Tropical Oceans",
2343  pages         = "1443--1451",
2344  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2345  volume        = "11",
2346  number        = "11",
2347  author        = "R. C. Pacanowski and S. G. H. Philander",
2348  year          = "1981",
2349  month         = "nov",
2350  publisher     = "American Meteorological Society",
2351  issn          = "1520-0485",
2352  doi           = "10.1175/1520-0485(1981)011<1443:povmin>2.0.co;2"
2353}
2354
2355@article{         paulson.simpson_JPO77,
2356  title         = "Irradiance Measurements in the Upper Ocean",
2357  pages         = "952--956",
2358  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2359  volume        = "7",
2360  number        = "6",
2361  author        = "C. A. Paulson and J. J. Simpson",
2362  year          = "1977",
2363  month         = "nov",
2364  publisher     = "American Meteorological Society",
2365  issn          = "1520-0485",
2366  doi           = "10.1175/1520-0485(1977)007<0952:imituo>2.0.co;2"
2367}
2368
2369@article{         penduff.le-sommer.ea_OS07,
2370  title         = "Influence of numerical schemes on current-topography
2371                  interactions in 1/4\deg global ocean simulations",
2372  pages         = "509--524",
2373  journal       = "Ocean Science",
2374  volume        = "3",
2375  number        = "4",
2376  author        = "T. Penduff and J. {Le Sommer} and B. Barnier and A.-M.
2377                  Tr\'{e}guier and J.-M. Molines and G. Madec",
2378  year          = "2007",
2379  month         = "dec",
2380  publisher     = "Copernicus GmbH",
2381  issn          = "1812-0792",
2382  doi           = "10.5194/os-3-509-2007"
2383}
2384
2385@article{         phillips_TAMS59,
2386  title         = "Dissipative operators and hyperbolic systems of partial
2387                  differential equations",
2388  pages         = "193--254",
2389  journal       = "Transactions of the American Mathematical Society",
2390  volume        = "90",
2391  number        = "2",
2392  author        = "R. S. Phillips",
2393  year          = "1959",
2394  month         = "feb",
2395  publisher     = "American Mathematical Society (AMS)",
2396  issn          = "0002-9947",
2397  doi           = "10.1090/s0002-9947-1959-0104919-1"
2398}
2399
2400@article{         qiao.yuan.ea_OD10,
2401  title         = "A three-dimensional surface wave–ocean circulation
2402                  coupled model and its initial testing",
2403  pages         = "1339--1335",
2404  journal       = "Ocean Dynamics",
2405  volume        = "60",
2406  number        = "5",
2407  author        = "F. Qiao and Y. Yuan and T. Ezer and C. Xia and Y. Yang and
2408                  X. Lu and Z. Song ",
2409  year          = "2010",
2410  month         = "oct",
2411  publisher     = "Springer-Verlag",
2412  issn          = "1616-7341",
2413  doi           = "10.1007/s10236-010-0326-y"
2414}
2415
2416@article{         redi_JPO82,
2417  title         = "Oceanic isopycnal mixing by coordinate rotation",
2418  pages         = "1154--1158",
2419  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2420  volume        = "12",
2421  number        = "10",
2422  author        = "M. H. Redi",
2423  year          = "1982",
2424  month         = "oct",
2425  publisher     = "American Meteorological Society",
2426  issn          = "1520-0485",
2427  doi           = "10.1175/1520-0485(1982)012<1154:oimbcr>2.0.co;2"
2428}
2429
2430@article{         reffray.bourdalle-badie.ea_GMD15,
2431  title         = "Modelling turbulent vertical mixing sensitivity using a
2432                  1-D version of NEMO",
2433  pages         = "69--86",
2434  journal       = "Geoscientific Model Development",
2435  volume        = "8",
2436  number        = "1",
2437  author        = "G. Reffray. and R. Bourdalle-Badie and C. Calone",
2438  year          = "2015",
2439  month         = "jan",
2440  publisher     = "Copernicus GmbH",
2441  issn          = "1991-9603",
2442  doi           = "10.5194/gmd-8-69-2015"
2443}
2444
2445@book{            richtmyer.morton_bk67,
2446  pages         = "405",
2447  booktitle     = "Difference methods for initial-value problems",
2448  edition       = "2",
2449  series        = "Interscience tracts in pure and applied mathematics",
2450  author        = "R. D. Richtmyer and K. W. Morton",
2451  year          = "1967",
2452  publisher     = "Interscience",
2453  issn          = "0074-994X",
2454  isbn          = "9780470720400",
2455  url           = "https://books.google.fr/books?id=nd1QAAAAMAAJ"
2456}
2457
2458@article{         robert_JMSJ66,
2459  title         = "The integration of a low order spectral form of the
2460                  primitive meteorological equations",
2461  pages         = "237--245",
2462  journal       = "Journal of the Meteorological Society of Japan",
2463  volume        = "44",
2464  number        = "5",
2465  author        = "A. J. Robert",
2466  year          = "1966",
2467  publisher     = "Meteorological Society of Japan",
2468  issn          = "2186-9057",
2469  doi           = "10.2151/jmsj1965.44.5\_237"
2470}
2471
2472@article{         rodgers.aumont.ea_B14,
2473  title         = "Strong sensitivity of Southern Ocean carbon uptake and
2474                  nutrient cycling to wind stirring",
2475  pages         = "4077--4098",
2476  journal       = "Biogeosciences",
2477  volume        = "11",
2478  number        = "15",
2479  author        = "K. B. Rodgers and O. Aumont and S. E. Mikaloff Fletcher
2480                  and Y. Plancherel and L. Bopp and C. {de Boyer
2481                  Mont\'{e}gut} and D. Iudicone and R. F. Keeling and G.
2482                  Madec and R. Wanninkhof",
2483  year          = "2014",
2484  month         = "aug",
2485  publisher     = "Copernicus GmbH",
2486  issn          = "1726-4189",
2487  doi           = "10.5194/bg-11-4077-2014"
2488}
2489
2490@article{         rodi_JGR87,
2491  title         = "Examples of calculation methods for flow and mixing in
2492                  stratified fluids",
2493  pages         = "5305--5328",
2494  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2495  volume        = "92",
2496  number        = "C5",
2497  author        = "W. Rodi",
2498  year          = "1987",
2499  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2500  issn          = "0148-0227",
2501  doi           = "10.1029/jc092ic05p05305"
2502}
2503
2504@article{         roquet.madec.ea_JPO15,
2505  title         = "Defining a simplified yet ``realistic'' equation of state
2506                  for seawater",
2507  pages         = "2564--2579",
2508  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2509  volume        = "45",
2510  number        = "10",
2511  author        = "F. Roquet and G. Madec and L. Brodeau and J. Nycander",
2512  year          = "2015",
2513  month         = "oct",
2514  publisher     = "American Meteorological Society",
2515  issn          = "1520-0485",
2516  doi           = "10.1175/jpo-d-15-0080.1"
2517}
2518
2519@article{         roquet.madec.ea_OM15,
2520  title         = "Accurate polynomial expressions for the density and
2521                  specific volume of seawater using the {TEOS}-10 standard",
2522  pages         = "29--43",
2523  journal       = "Ocean Modelling",
2524  volume        = "90",
2525  author        = "F. Roquet and G. Madec and T. J. McDougall and P. M.
2526                  Barker",
2527  year          = "2015",
2528  month         = "jun",
2529  publisher     = "Elsevier BV",
2530  issn          = "1463-5003",
2531  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.04.002"
2532}
2533
2534@article{         roullet.madec_JGR00,
2535  title         = "Salt conservation, free surface, and varying levels: {A}
2536                  new formulation for Ocean General Circulation Models",
2537  pages         = "23927--23942",
2538  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2539  volume        = "105",
2540  number        = "C10",
2541  author        = "G. Roullet and G. Madec",
2542  year          = "2000",
2543  month         = "oct",
2544  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2545  issn          = "0148-0227",
2546  doi           = "10.1029/2000jc900089"
2547}
2548
2549@article{         sarmiento.bryan_JGR82,
2550  title         = "An ocean transport model for the North Atlantic",
2551  pages         = "394--409",
2552  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2553  volume        = "87",
2554  number        = "C1",
2555  author        = "J. L. Sarmiento and K. Bryan",
2556  year          = "1982",
2557  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2558  issn          = "0148-0227",
2559  doi           = "10.1029/jc087ic01p00394"
2560}
2561
2562@article{         saunders_JAS67,
2563  title         = "The temperature at the ocean-air interface",
2564  pages         = "269--273",
2565  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2566  volume        = "24",
2567  number        = "3",
2568  author        = "P. M. Saunders",
2569  year          = "1967",
2570  month         = "may",
2571  publisher     = "American Meteorological Society",
2572  issn          = "1520-0469",
2573  doi           = "10.1175/1520-0469(1967)024<0269:ttatoa>2.0.co;2"
2574}
2575
2576@article{         shchepetkin.mcwilliams_OM05,
2577  title         = "The regional oceanic modeling system ({ROMS}): a
2578                  split-explicit, free-surface,
2579                  topography-following-coordinate oceanic model",
2580  pages         = "347--404",
2581  journal       = "Ocean Modelling",
2582  volume        = "9",
2583  number        = "4",
2584  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2585  year          = "2005",
2586  month         = "jan",
2587  publisher     = "Elsevier BV",
2588  issn          = "1463-5003",
2589  doi           = "10.1016/j.ocemod.2004.08.002"
2590}
2591
2592@inbook{          shchepetkin.mcwilliams_ibk09,
2593  title         = "Computational kernel algorithms for fine-scale,
2594                  multiprocess, longtime oceanic simulations",
2595  chapter       = "2",
2596  pages         = "121--183",
2597  booktitle     = "Computational Methods for the Atmosphere and the Oceans",
2598  editor        = "R. M. Temam and J. J. Tribbia",
2599  series        = "Handbook of Numerical Analysis",
2600  volume        = "14",
2601  author        = "A. F. Shchepetkin and J. C. McWilliams",
2602  year          = "2009",
2603  publisher     = "Elsevier",
2604  issn          = "1570-8659",
2605  isbn          = "9780444518934",
2606  doi           = "10.1016/s1570-8659(08)01202-0"
2607}
2608
2609@article{         shchepetkin_OM15,
2610  title         = "An Adaptive, Courant-number-dependent implicit scheme for
2611                  vertical advection in oceanic modeling",
2612  pages         = "38--69",
2613  journal       = "Ocean Modelling",
2614  volume        = "91",
2615  author        = "A. F. Shchepetkin",
2616  year          = "2015",
2617  month         = "july",
2618  publisher     = "Elsevier BV",
2619  issn          = "1463-5003",
2620  doi           = "10.1016/j.ocemod.2015.03.006"
2621}
2622
2623@article{         siddorn.furner_OM13,
2624  title         = "An analytical stretching function that combines the best
2625                  attributes of geopotential and terrain-following vertical
2626                  coordinates",
2627  pages         = "1--13",
2628  journal       = "Ocean Modelling",
2629  volume        = "66",
2630  author        = "J. R. Siddorn and R. Furner",
2631  year          = "2013",
2632  month         = "jun",
2633  publisher     = "Elsevier BV",
2634  issn          = "1463-5003",
2635  doi           = "10.1016/j.ocemod.2013.02.001"
2636}
2637
2638@article{         smagorinsky_MWR63,
2639  title         = "General circulation experiments with the primitive
2640                  equations: I. The basic experiment ",
2641  pages         = "99--164",
2642  journal       = "Monthly Weather Review",
2643  volume        = "91",
2644  number        = "3",
2645  author        = "J. Smagorinsky",
2646  year          = "1963",
2647  month         = "mar",
2648  publisher     = "American Meteorological Society",
2649  issn          = "1520-0493",
2650  doi           = "10.1175/1520-0493(1963)091<0099:GCEWTP>2.3.CO;2"
2651}
2652
2653@article{         song.haidvogel_JCP94,
2654  title         = "A semi-implicit ocean circulation model using a
2655                  generalized topography-following coordinate system",
2656  pages         = "228--244",
2657  journal       = "Journal of Computational Physics",
2658  volume        = "115",
2659  number        = "1",
2660  author        = "Y. Song and D. Haidvogel",
2661  year          = "1994",
2662  month         = "nov",
2663  publisher     = "Elsevier BV",
2664  issn          = "0021-9991",
2665  doi           = "10.1006/jcph.1994.1189"
2666}
2667
2668@article{         song_MWR98,
2669  title         = "A General Pressure Gradient Formulation for Ocean Models.
2670                  Part {I}: Scheme Design and Diagnostic Analysis",
2671  pages         = "3213--3230",
2672  journal       = "Monthly Weather Review",
2673  volume        = "126",
2674  number        = "12",
2675  author        = "Y. T. Song",
2676  year          = "1998",
2677  month         = "dec",
2678  publisher     = "American Meteorological Society",
2679  issn          = "1520-0493",
2680  doi           = "10.1175/1520-0493(1998)126<3213:agpgff>2.0.co;2"
2681}
2682
2683@article{         st-laurent.simmons.ea_GRL02,
2684  title         = "Estimating tidally driven mixing in the deep ocean",
2685  pages         = "2101--2104",
2686  journal       = "Geophysical Research Letters",
2687  volume        = "29",
2688  number        = "23",
2689  author        = "L. C. {St Laurent} and H. L. Simmons and S. R. Jayne",
2690  year          = "2002",
2691  month         = "dec",
2692  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2693  issn          = "0094-8276",
2694  doi           = "10.1029/2002gl015633"
2695}
2696
2697@article{         stacey_JPO99,
2698  title         = "Simulations of the wind-forced near-surface circulation in
2699                  Knight Inlet: {A} parameterization of the roughness length",
2700  pages         = "1363--1367",
2701  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2702  volume        = "29",
2703  number        = "6",
2704  author        = "M. W. Stacey",
2705  year          = "1999",
2706  month         = "jun",
2707  publisher     = "American Meteorological Society",
2708  issn          = "1520-0485",
2709  doi           = "10.1175/1520-0485(1999)029<1363:sotwfn>2.0.co;2"
2710}
2711
2712@article{         steele.morley.ea_JC01,
2713  title         = "{PHC}: {A} global ocean hydrography with a high-quality
2714                  Arctic Ocean",
2715  pages         = "2079--2087",
2716  journal       = "Journal of Climate",
2717  volume        = "14",
2718  number        = "9",
2719  author        = "M. Steele and R. Morley and W. Ermold",
2720  year          = "2001",
2721  month         = "may",
2722  publisher     = "American Meteorological Society",
2723  issn          = "1520-0442",
2724  doi           = "10.1175/1520-0442(2001)014<2079:pagohw>2.0.co;2"
2725}
2726
2727@article{         stein.stein_N92,
2728  title         = "A model for the global variation in oceanic depth and heat
2729                  flow with lithospheric age",
2730  pages         = "123--129",
2731  journal       = "Nature",
2732  volume        = "359",
2733  number        = "6391",
2734  author        = "C. A. Stein and S. Stein",
2735  year          = "1992",
2736  month         = "sep",
2737  publisher     = "Springer Nature",
2738  issn          = "1476-4687",
2739  doi           = "10.1038/359123a0"
2740}
2741
2742@inbook{          stokes_ibk09,
2743  title         = "On the theory of oscillatory waves",
2744  chapter       = "12",
2745  pages         = "197--229",
2746  booktitle     = "Mathematical and Physical Papers",
2747  series        = "Cambridge Library Collection - Mathematics",
2748  volume        = "1",
2749  author        = "G. G. Stokes",
2750  year          = "2009",
2751  publisher     = "Cambridge University Press",
2752  isbn          = "9780511702242",
2753  doi           = "10.1017/cbo9780511702242.013"
2754}
2755
2756@book{            sverdrup.johnson.ea_bk42,
2757  title         = "The Oceans, Their Physics, Chemistry, and General Biology",
2758  pages         = "1087",
2759  author        = "H. U. Sverdrup and Martin W. Johnson and Richard H.
2760                  Fleming",
2761  year          = "1942",
2762  publisher     = "Prentice-Hall",
2763  address       = "New York"
2764}
2765
2766@article{         takaya.bidlot.ea_JGR10,
2767  title         = "Refinements to a prognostic scheme of skin sea surface
2768                  temperature",
2769  pages         = "C06009",
2770  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2771  volume        = "115",
2772  number        = "C6",
2773  author        = "Y. Takaya and J-R. Bidlot and A. C. M. Beljaars and P. A.
2774                  E. M. Janssen",
2775  year          = "2010",
2776  month         = "jun",
2777  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2778  issn          = "0148-0227",
2779  doi           = "10.1029/2009jc005985"
2780}
2781
2782@article{         talagrand_JAS72,
2783  title         = "On the damping of high-frequency motions in
2784                  four-dimensional assimilation of meteorological data",
2785  pages         = "1571--1574",
2786  journal       = "Journal of the Atmospheric Sciences",
2787  volume        = "29",
2788  number        = "8",
2789  author        = "O. Talagrand",
2790  year          = "1972",
2791  month         = "nov",
2792  publisher     = "American Meteorological Society",
2793  issn          = "1520-0469",
2794  doi           = "10.1175/1520-0469(1972)029<1571:otdohf>2.0.co;2"
2795}
2796
2797@article{         treguier.dukowicz.ea_JGR96,
2798  title         = "Properties of nonuniform grids used in ocean general
2799                  circulation models",
2800  pages         = "20877--20881",
2801  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2802  volume        = "101",
2803  number        = "C9",
2804  author        = "A.-M. Tr\'{e}guier and J. K. Dukowicz and K. Bryan",
2805  year          = "1996",
2806  month         = "sep",
2807  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2808  issn          = "0148-0227",
2809  doi           = "10.1029/96jc01753"
2810}
2811
2812@article{         treguier.held.ea_JPO97,
2813  title         = "Parameterization of Quasigeostrophic Eddies in Primitive
2814                  Equation Ocean Models",
2815  pages         = "567--580",
2816  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2817  volume        = "27",
2818  number        = "4",
2819  author        = "A. M. Tr\'{e}guier and I. M. Held and V. D. Larichev",
2820  year          = "1997",
2821  month         = "apr",
2822  publisher     = "American Meteorological Society",
2823  issn          = "1520-0485",
2824  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0567:poqeip>2.0.co;2"
2825}
2826
2827@article{         treguier_JGR92,
2828  title         = "Kinetic energy analysis of an eddy resolving, primitive
2829                  equation model of the North Atlantic",
2830  pages         = "687--701",
2831  journal       = "Journal of Geophysical Research",
2832  volume        = "97",
2833  number        = "C1",
2834  author        = "A. M. Tr\'{e}guier",
2835  year          = "1992",
2836  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2837  issn          = "0148-0227",
2838  doi           = "10.1029/91jc02350"
2839}
2840
2841@article{         tu.tsuang_GRL05,
2842  title         = "Cool-skin simulation by a one-column ocean model",
2843  pages         = "L22602",
2844  journal       = "Geophysical Research Letters",
2845  volume        = "32",
2846  number        = "22",
2847  author        = "C.-Y. Tu and B.-J. Tsuang",
2848  year          = "2005",
2849  month         = "nov",
2850  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
2851  issn          = "0094-8276",
2852  doi           = "10.1029/2005gl024252"
2853}
2854
2855@article{         umlauf.burchard_CSR05,
2856  title         = "Second-order turbulence closure models for geophysical
2857                  boundary layers. {A} review of recent work",
2858  pages         = "795--827",
2859  journal       = "Continental Shelf Research",
2860  volume        = "25",
2861  number        = "7-8",
2862  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2863  year          = "2005",
2864  month         = "may",
2865  publisher     = "Elsevier BV",
2866  issn          = "0278-4343",
2867  doi           = "10.1016/j.csr.2004.08.004"
2868}
2869
2870@article{         umlauf.burchard_JMR03,
2871  title         = "A generic length-scale equation for geophysical turbulence
2872                  models",
2873  pages         = "235--265",
2874  journal       = "Journal of Marine Research",
2875  volume        = "61",
2876  number        = "2",
2877  author        = "L. Umlauf and H. Burchard",
2878  year          = "2003",
2879  month         = "mar",
2880  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2881  issn          = "0022-2402",
2882  doi           = "10.1357/002224003322005087"
2883}
2884
2885@book{            vallis_bk06,
2886  booktitle     = "Atmospheric and Oceanic Fluid Dynamics",
2887  author        = "G. K. Vallis",
2888  year          = "2006",
2889  publisher     = "Cambridge University Press",
2890  isbn          = "9780511790447",
2891  doi           = "10.1017/cbo9780511790447"
2892}
2893
2894@article{         warner.defne.ea_CG13,
2895  title         = "A wetting and drying scheme for {ROMS}",
2896  pages         = "54--61",
2897  journal       = "Computers \& Geosciences",
2898  volume        = "58",
2899  author        = "J. C. Warner and Z. Defne and K. Haas and H. G. Arango",
2900  year          = "2013",
2901  month         = "aug",
2902  publisher     = "Elsevier BV",
2903  issn          = "0098-3004",
2904  doi           = "10.1016/j.cageo.2013.05.004"
2905}
2906
2907@article{         warner.sherwood.ea_OM05,
2908  title         = "Performance of four turbulence closure models implemented
2909                  using a generic length scale method",
2910  pages         = "81--113",
2911  journal       = "Ocean Modelling",
2912  volume        = "8",
2913  number        = "1-2",
2914  author        = "J. C. Warner and C. R. Sherwood and H. G. Arango and R. P.
2915                  Signell",
2916  year          = "2005",
2917  month         = "jan",
2918  publisher     = "Elsevier BV",
2919  issn          = "1463-5003",
2920  doi           = "10.1016/j.ocemod.2003.12.003"
2921}
2922
2923@article{         weatherly_JMR84,
2924  title         = "An estimate of bottom frictional dissipation by Gulf
2925                  Stream fluctuations",
2926  pages         = "289--301",
2927  journal       = "Journal of Marine Research",
2928  volume        = "42",
2929  number        = "2",
2930  author        = "G. L. Weatherly",
2931  year          = "1984",
2932  month         = "may",
2933  publisher     = "Journal of Marine Research/Yale",
2934  issn          = "1543-9542",
2935  doi           = "10.1357/002224084788502729"
2936}
2937
2938@article{         weaver.eby_JPO97,
2939  title         = "On the numerical implementation of advection schemes for
2940                  use in conjuction with various mixing parameterizations in
2941                  the {GFDL} ocean model",
2942  pages         = "369--377",
2943  journal       = "Journal of Physical Oceanography",
2944  volume        = "27",
2945  number        = "2",
2946  author        = "A. J. Weaver and M. Eby",
2947  year          = "1997",
2948  month         = "feb",
2949  publisher     = "American Meteorological Society",
2950  issn          = "1520-0485",
2951  doi           = "10.1175/1520-0485(1997)027<0369:otnioa>2.0.co;2"
2952}
2953
2954@article{         webb.de-cuevas.ea_JAOT98,
2955  title         = "Improved Advection Schemes for Ocean Models",
2956  pages         = "1171--1187",
2957  journal       = "Journal of Atmospheric and Oceanic Technology",
2958  volume        = "15",
2959  number        = "5",
2960  author        = "D. J. Webb and B. A. {de Cuevas} and C. S. Richmond",
2961  year          = "1998",
2962  month         = "oct",
2963  publisher     = "American Meteorological Society",
2964  issn          = "1520-0426",
2965  doi           = "10.1175/1520-0426(1998)015<1171:iasfom>2.0.co;2"
2966}
2967
2968@article{         white.adcroft.ea_JCP09,
2969  title         = "High-order regridding-remapping schemes for continuous
2970                  isopycnal and generalized coordinates in ocean models",
2971  pages         = "8665--8692",
2972  journal       = "Journal of Computational Physics",
2973  volume        = "228",
2974  number        = "23",
2975  author        = "L. White and A. Adcroft and R. Hallberg",
2976  year          = "2009",
2977  month         = "dec",
2978  publisher     = "Elsevier BV",
2979  issn          = "0021-9991",
2980  doi           = "10.1016/j.jcp.2009.08.016"
2981}
2982
2983@article{         white.hoskins.ea_QJRMS05,
2984  title         = "Consistent approximate models of the global atmosphere:
2985                  shallow, deep, hydrostatic, quasi-hydrostatic and
2986                  non-hydrostatic",
2987  pages         = "2081--2107",
2988  journal       = "Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society",
2989  volume        = "131",
2990  author        = "A. A. White and B. J. Hoskins and I. Roulstone and A.
2991                  Staniforth",
2992  year          = "2005",
2993  doi           = "10.1256/qj.04.49"
2994}
2995
2996@article{         wilcox_AJ88,
2997  title         = "Reassessment of the scale-determining equation for
2998                  advanced turbulence models",
2999  pages         = "1299--1310",
3000  journal       = "AIAA Journal",
3001  volume        = "26",
3002  number        = "11",
3003  author        = "D. C. Wilcox",
3004  year          = "1988",
3005  month         = "nov",
3006  publisher     = "American Institute of Aeronautics and Astronautics (AIAA)",
3007  issn          = "1533-385X",
3008  doi           = "10.2514/3.10041"
3009}
3010
3011@article{         willebrand.barnier.ea_PO01,
3012  title         = "Circulation characteristics in three eddy-permitting
3013                  models of the North Atlantic",
3014  pages         = "123--161",
3015  journal       = "Progress in Oceanography",
3016  volume        = "48",
3017  number        = "2-3",
3018  author        = "J. Willebrand and B. Barnier and C. B{\"{o}}ning and C.
3019                  Dieterich and P. D. Killworth and C. Le Provost and Y. Jia
3020                  and J.-M. Molines and A. L. New",
3021  year          = "2001",
3022  month         = "jan",
3023  publisher     = "Elsevier BV",
3024  issn          = "0079-6611",
3025  doi           = "10.1016/s0079-6611(01)00003-9"
3026}
3027
3028@article{         zalesak_JCP79,
3029  title         = "Fully multidimensional flux-corrected transport algorithms
3030                  for fluids",
3031  pages         = "335--362",
3032  journal       = "Journal of Computational Physics",
3033  volume        = "31",
3034  number        = "3",
3035  author        = "S. T. Zalesak",
3036  year          = "1979",
3037  month         = "jun",
3038  publisher     = "Elsevier BV",
3039  issn          = "0021-9991",
3040  doi           = "10.1016/0021-9991(79)90051-2"
3041}
3042
3043@article{         zeng.beljaars_GRL05,
3044  title         = "A prognostic scheme of sea surface skin temperature for
3045                  modeling and data assimilation",
3046  journal       = "Geophysical Research Letters",
3047  volume        = "32",
3048  number        = "14",
3049  author        = "Xubin Zeng and Anton Beljaars",
3050  year          = "2005",
3051  month         = "jul",
3052  publisher     = "American Geophysical Union",
3053  doi           = "10.1029/2005gl023030"
3054}
3055
3056@article{         zhang.endoh_JGR92,
3057  title         = "A free surface General Circulation Model for the tropical
3058                  Pacific Ocean",
3059  pages         = "11237--11255",
3060  journal       = "Journal of Geophysical Research",
3061  volume        = "97",
3062  number        = "C7",
3063  author        = "R.-H. Zhang and M. Endoh",
3064  year          = "1992",
3065  publisher     = "American Geophysical Union (AGU)",
3066  issn          = "0148-0227",
3067  doi           = "10.1029/92jc00911"
3068}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.