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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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usrdef_zgr.F90 in NEMO/trunk/tests/DOME/MY_SRC – NEMO

source: NEMO/trunk/tests/DOME/MY_SRC/usrdef_zgr.F90 @ 14261

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#2222, upper bound on bathymetry (relevant in case of s-coordinates only)

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Line 
1MODULE usrdef_zgr
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE usrdef_zgr  ***
4   !!
5   !!                       ===  DOME case  ===
6   !!
7   !! user defined :  vertical coordinate system of a user configuration
8   !!======================================================================
9   !! History :  4.0  ! 2020-12  (J. Chanut)  Original code
10   !!----------------------------------------------------------------------
11
12   !!----------------------------------------------------------------------
13   !!   usr_def_zgr   : user defined vertical coordinate system (required)
14   !!       zgr_z1d   : reference 1D z-coordinate
15   !!---------------------------------------------------------------------
16   USE oce            ! ocean variables
17   USE dom_oce ,  ONLY: mi0, mi1          ! ocean space and time domain
18   USE dom_oce ,  ONLY: glamt, gphit      ! ocean space and time domain
19   USE usrdef_nam     ! User defined : namelist variables
20   !
21   USE in_out_manager ! I/O manager
22   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
23   USE lib_mpp        ! distributed memory computing library
24   USE timing         ! Timing
25
26   IMPLICIT NONE
27   PRIVATE
28
29   PUBLIC   usr_def_zgr   ! called by domzgr.F90
30
31   !! * Substitutions
32#  include "do_loop_substitute.h90"
33   !!----------------------------------------------------------------------
34   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
35   !! $Id: usrdef_zgr.F90 14053 2020-12-03 13:48:38Z techene $
36   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
37   !!----------------------------------------------------------------------
38CONTAINS             
39
40   SUBROUTINE usr_def_zgr( ld_zco  , ld_zps  , ld_sco  , ld_isfcav,    &   ! type of vertical coordinate
41      &                    pdept_1d, pdepw_1d, pe3t_1d , pe3w_1d  ,    &   ! 1D reference vertical coordinate
42      &                    pdept , pdepw ,                             &   ! 3D t & w-points depth
43      &                    pe3t  , pe3u  , pe3v , pe3f ,               &   ! vertical scale factors
44      &                    pe3w  , pe3uw , pe3vw,                      &   !     -      -      -
45      &                    k_top  , k_bot    )                             ! top & bottom ocean level
46      !!---------------------------------------------------------------------
47      !!              ***  ROUTINE usr_def_zgr  ***
48      !!
49      !! ** Purpose :   User defined the vertical coordinates
50      !!
51      !!----------------------------------------------------------------------
52      LOGICAL                   , INTENT(in   ) ::   ld_zco, ld_zps, ld_sco      ! vertical coordinate flags ( read in namusr_def )
53      LOGICAL                   , INTENT(  out) ::   ld_isfcav                   ! under iceshelf cavity flag
54      REAL(wp), DIMENSION(:)    , INTENT(  out) ::   pdept_1d, pdepw_1d          ! 1D grid-point depth     [m]
55      REAL(wp), DIMENSION(:)    , INTENT(  out) ::   pe3t_1d , pe3w_1d           ! 1D grid-point depth     [m]
56      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), INTENT(  out) ::   pdept, pdepw                ! grid-point depth        [m]
57      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), INTENT(  out) ::   pe3t , pe3u , pe3v , pe3f   ! vertical scale factors  [m]
58      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), INTENT(  out) ::   pe3w , pe3uw, pe3vw         ! i-scale factors
59      INTEGER , DIMENSION(:,:)  , INTENT(  out) ::   k_top, k_bot                ! first & last ocean level
60      !
61      INTEGER  ::   ji, jj, jk        ! dummy indices
62      INTEGER  ::   ik                ! local integers
63      REAL(wp) ::   zfact, z1_jpkm1   ! local scalar
64      REAL(wp) ::   ze3min            ! local scalar
65      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   zht, zhu, zhv, zhf, z2d   ! 2D workspace
66      !!----------------------------------------------------------------------
67      !
68      IF(lwp) WRITE(numout,*)
69      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'usr_def_zgr : DOME configuration (z(ps)- or s-coordinate closed box ocean without cavities)'
70      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~'
71      !
72      !
73      ! type of vertical coordinate
74      ! ---------------------------
75      ! already set in usrdef_nam.F90 by reading the namusr_def namelist except for ISF
76      ld_isfcav = .FALSE.
77      !
78      !
79      ! Build the vertical coordinate system
80      ! ------------------------------------
81      !
82      !                       !==  UNmasked meter bathymetry  ==!
83      !
84      zht(:,:) = MIN(3600._wp, MAX( 600._wp,  600._wp - gphit(:,:)*1.e3*0.01 ))
85      !
86      ! at u/v/f-point: averaging zht
87      zhu(:,:) = 600_wp ; zhv(:,:) = 600_wp ; zhf(:,:) = 600_wp
88      DO ji = 1, jpim1
89         zhu(ji,:) = 0.5_wp * ( zht(ji,:) + zht(ji+1,:) )
90      END DO
91      DO jj = 1, jpjm1
92         zhv(:,jj) = 0.5_wp * ( zht(:,jj) + zht(:,jj+1) )
93      END DO
94      DO jj = 1, jpjm1
95         DO ji = 1, jpim1
96            zhf(ji,jj) = 0.25_wp * (  zht(ji,jj  ) + zht(ji+1,jj  ) &
97                       &            + zht(ji,jj+1) + zht(ji+1,jj+1) ) 
98         END DO
99      END DO
100      CALL lbc_lnk_multi( 'usrdef_zgr', zhu, 'U', 1.0_wp, zhv, 'V', 1.0_wp, zhf, 'F', 1.0_wp)     
101      !     
102      CALL zgr_z1d( pdept_1d, pdepw_1d, pe3t_1d , pe3w_1d )   ! Reference z-coordinate system
103      !
104      !
105      !                       !==  top masked level bathymetry  ==!  (all coordinates)
106      !
107      ! no ocean cavities : top ocean level is ONE, except over land
108      ! the ocean basin surrounded by land (1 grid-point) set through lbc_lnk call as jperio=0
109      z2d(:,:) = 1._wp                    ! surface ocean is the 1st level
110      WHERE (gphit(:,:)>0._wp) z2d(:,:) = 0._wp
111      ! Dig inlet:
112      WHERE ((gphit(:,:)>0._wp).AND.(glamt(:,:)>-50._wp).AND.(glamt(:,:)<50._wp)) z2d(:,:) = 1._wp
113      CALL lbc_lnk( 'usrdef_zgr', z2d, 'T', 1. )        ! closed basin since jperio = 0 (see userdef_nam.F90)
114      k_top(:,:) = NINT( z2d(:,:) )
115      !
116      !                             
117      !
118      IF ( ld_sco ) THEN      !==  s-coordinate  ==!   (terrain-following coordinate)
119         !
120         k_bot(:,:) = jpkm1 * k_top(:,:)  !* bottom ocean = jpk-1 (here use k_top as a land mask)
121         !
122         !                                !* terrain-following coordinate with e3.(k)=cst)
123         z1_jpkm1 = 1._wp / REAL( jpkm1 , wp)
124         DO jk = 1, jpk
125            pdept(:,:,jk) = zht(:,:) * z1_jpkm1 * ( REAL( jk   , wp ) - 0.5_wp )
126            pdepw(:,:,jk) = zht(:,:) * z1_jpkm1 * ( REAL( jk-1 , wp )          )
127            pe3t (:,:,jk) = zht(:,:) * z1_jpkm1
128            pe3u (:,:,jk) = zhu(:,:) * z1_jpkm1
129            pe3v (:,:,jk) = zhv(:,:) * z1_jpkm1
130            pe3f (:,:,jk) = zhf(:,:) * z1_jpkm1
131            pe3w (:,:,jk) = zht(:,:) * z1_jpkm1
132            pe3uw(:,:,jk) = zhu(:,:) * z1_jpkm1
133            pe3vw(:,:,jk) = zhv(:,:) * z1_jpkm1
134         END DO     
135      ENDIF
136      !
137      !
138      IF ( ld_zco ) THEN      !==  z-coordinate  ==!   (step-like topography)
139         !
140         !                                !* bottom ocean compute from the depth of grid-points
141         k_bot(:,:) = jpkm1 * k_top(:,:)     ! here use k_top as a land mask
142         DO jk = 1, jpkm1
143            WHERE( pdept_1d(jk) < zht(:,:) .AND. zht(:,:) <= pdept_1d(jk+1) )   k_bot(:,:) = jk * k_top(:,:)
144         END DO
145         !                                !* horizontally uniform coordinate (reference z-co everywhere)
146         DO jk = 1, jpk
147            pdept(:,:,jk) = pdept_1d(jk)
148            pdepw(:,:,jk) = pdepw_1d(jk)
149            pe3t (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
150            pe3u (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
151            pe3v (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
152            pe3f (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
153            pe3w (:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
154            pe3uw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
155            pe3vw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
156         END DO
157      ENDIF
158      !
159      !
160      IF ( ld_zps ) THEN      !==  zps-coordinate  ==!   (partial bottom-steps)
161         !
162         ze3min = 0.1_wp * rn_dz
163         IF(lwp) WRITE(numout,*) '   minimum thickness of the partial cells = 10 % of e3 = ', ze3min
164         !
165         !
166         !                                !* bottom ocean compute from the depth of grid-points
167         k_bot(:,:) = jpkm1
168         DO jk = jpkm1, 1, -1
169            WHERE( zht(:,:) < pdepw_1d(jk) + ze3min )   k_bot(:,:) = jk-1
170         END DO
171         !
172         !                                !* vertical coordinate system
173         DO jk = 1, jpk                      ! initialization to the reference z-coordinate
174            pdept(:,:,jk) = pdept_1d(jk)
175            pdepw(:,:,jk) = pdepw_1d(jk)
176            pe3t (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
177            pe3u (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
178            pe3v (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
179            pe3f (:,:,jk) = pe3t_1d (jk)
180            pe3w (:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
181            pe3uw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
182            pe3vw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk)
183         END DO
184         DO_2D( 1, 1, 1, 1 )
185            ik = k_bot(ji,jj)
186            pdepw(ji,jj,ik+1) = MIN( zht(ji,jj) , pdepw_1d(ik+1) )
187            pe3t (ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik+1) - pdepw(ji,jj,ik)
188            pe3t (ji,jj,ik+1) = pe3t (ji,jj,ik  ) 
189            !
190            pdept(ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik  ) + pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp
191            pdept(ji,jj,ik+1) = pdepw(ji,jj,ik+1) + pe3t (ji,jj,ik+1) * 0.5_wp
192            pe3w (ji,jj,ik+1) = pdept(ji,jj,ik+1) - pdept(ji,jj,ik)              ! = pe3t (ji,jj,ik  )
193            pe3w (ji,jj,ik  ) = pdept(ji,jj,ik  ) - pdept(ji,jj,ik-1)            ! st caution ik > 1
194         END_2D         
195         !                                   ! bottom scale factors and depth at  U-, V-, UW and VW-points
196         !                                   ! usually Computed as the minimum of neighbooring scale factors
197         pe3u (:,:,:) = pe3t(:,:,:)          ! HERE DOME configuration :
198         pe3v (:,:,:) = pe3t(:,:,:)          !    e3 increases with i-index and identical with j-index
199         pe3f (:,:,:) = pe3t(:,:,:)          !    so e3 minimum of (i,i+1) points is (i) point
200         pe3uw(:,:,:) = pe3w(:,:,:)          !    in j-direction e3v=e3t and e3f=e3v
201         pe3vw(:,:,:) = pe3w(:,:,:)          !    ==>>  no need of lbc_lnk calls
202         !     
203      ENDIF
204      !
205   END SUBROUTINE usr_def_zgr
206
207
208   SUBROUTINE zgr_z1d( pdept_1d, pdepw_1d, pe3t_1d , pe3w_1d )   ! 1D reference vertical coordinate
209      !!----------------------------------------------------------------------
210      !!                   ***  ROUTINE zgr_z1d  ***
211      !!
212      !! ** Purpose :   set the depth of model levels and the resulting
213      !!      vertical scale factors.
214      !!
215      !! ** Method  :   1D z-coordinate system (use in all type of coordinate)
216      !!       The depth of model levels is set from dep(k), an analytical function:
217      !!                   w-level: depw_1d  = dep(k)
218      !!                   t-level: dept_1d  = dep(k+0.5)
219      !!       The scale factors are the discrete derivative of the depth:
220      !!                   e3w_1d(jk) = dk[ dept_1d ]
221      !!                   e3t_1d(jk) = dk[ depw_1d ]
222      !!
223      !!            ===    Here constant vertical resolution   ===
224      !!
225      !! ** Action  : - pdept_1d, pdepw_1d : depth of T- and W-point (m)
226      !!              - pe3t_1d , pe3w_1d  : scale factors at T- and W-levels (m)
227      !!----------------------------------------------------------------------
228      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(out) ::   pdept_1d, pdepw_1d   ! 1D grid-point depth        [m]
229      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(out) ::   pe3t_1d , pe3w_1d    ! 1D vertical scale factors  [m]
230      !
231      INTEGER  ::   jk       ! dummy loop indices
232      REAL(wp) ::   zt, zw   ! local scalar
233      !!----------------------------------------------------------------------
234      !
235      IF(lwp) THEN                         ! Parameter print
236         WRITE(numout,*)
237         WRITE(numout,*) '    zgr_z1d : Reference vertical z-coordinates: uniform dz = ', rn_dz
238         WRITE(numout,*) '    ~~~~~~~'
239      ENDIF
240      !
241      ! Reference z-coordinate (depth - scale factor at T- and W-points)   ! Madec & Imbard 1996 function
242      ! ----------------------
243      DO jk = 1, jpk
244         zw = REAL( jk , wp )
245         zt = REAL( jk , wp ) + 0.5_wp
246         pdepw_1d(jk) =    rn_dz *   REAL( jk-1 , wp )
247         pdept_1d(jk) =    rn_dz * ( REAL( jk-1 , wp ) + 0.5_wp )
248         pe3w_1d (jk) =    rn_dz
249         pe3t_1d (jk) =    rn_dz
250      END DO
251      !
252      IF(lwp) THEN                        ! control print
253         WRITE(numout,*)
254         WRITE(numout,*) '              Reference 1D z-coordinate depth and scale factors:'
255         WRITE(numout, "(9x,' level  gdept_1d  gdepw_1d  e3t_1d   e3w_1d  ')" )
256         WRITE(numout, "(10x, i4, 4f9.2)" ) ( jk, pdept_1d(jk), pdepw_1d(jk), pe3t_1d(jk), pe3w_1d(jk), jk = 1, jpk )
257      ENDIF
258      !
259   END SUBROUTINE zgr_z1d
260   
261   !!======================================================================
262END MODULE usrdef_zgr
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.