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iodef.xml in branches/2012/dev_NOC_2012_rev3555/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00 – NEMO

source: branches/2012/dev_NOC_2012_rev3555/NEMOGCM/CONFIG/AMM12_PISCES/EXP00/iodef.xml @ 3631

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Branch dev_NOC_2012_r3555. #1006. Step 8. Minor code changes and updated iodef.xml files to enable successful SETTE testing

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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3 
4  <context id="nemo">
5   
6    <!-- $id$ -->
7
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14   
15    <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" enabled=".TRUE."> <!-- time step automaticaly defined -->
16
17      <!-- T grid -->
18     
19      <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
20   <field id="toce"         description="temperature"                               unit="degC" axis_ref="deptht"   />
21         <field id="soce"         description="salinity"                                  unit="psu"  axis_ref="deptht"   />
22   <field id="sst"          description="sea surface temperature"                   unit="degC"                     />
23   <field id="sst2"         description="square of sea surface temperature"         unit="degC2"                    />
24   <field id="sstgrad"      description="module of sst gradient"                    unit="degC/m"                   />
25   <field id="sstgrad2"     description="square of module of sst gradient"          unit="degC2/m2"                 />
26   <field id="sss"          description="sea surface salinity"                      unit="psu"                      />
27   <field id="sss2"         description="square of sea surface salinity"            unit="psu2"                     />
28   <field id="ssh"          description="sea surface height"                        unit="m"                        />
29   <field id="ssh2"         description="square of sea surface height"              unit="m2"                       />
30   <field id="mldkz5"       description="mixing layer depth (Turbocline)"           unit="m"                        />
31   <field id="mldr10_1"     description="Mixed Layer Depth 0.01 ref.10m"            unit="m"                        />
32         <field id="rhop"         description="potential density (sigma0)"                unit="kg/m3" axis_ref="deptht"  />
33   <!-- next variables available with key_diahth -->
34   <field id="mlddzt"       description="Thermocline Depth (max dT/dz)"             unit="m"                        />
35   <field id="mldr10_3"     description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.10m)"       unit="m"                        />
36   <field id="mldr0_1"      description="Mixed Layer Depth dr=0.01 (ref.surf)"      unit="m"                        />
37   <field id="mldr0_3"      description="Mixed Layer Depth dr=0.03 (ref.surf)"      unit="m"                        />
38   <field id="mld_dt02"     description="Mixed Layer Depth |dt|=0.2 (ref.10m)"      unit="m"                        />
39   <field id="topthdep"     description="Top of the thermocline dt=-0.2 (ref.10m)"  unit="m"                        />
40   <field id="pycndep"      description="Pycnocline depth dr~dt=-0.2 (ref.10m)"     unit="m"                        />
41   <field id="BLT"          description="Barrier Layer Thickness"                   unit="m"                        />
42   <field id="tinv"         description="Max of vertical invertion of temperature"  unit="degC"                     />
43   <field id="depti"        description="Depth of max. vert. inv. of temperature"   unit="m"                        />
44        <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"                     unit="m"                        />
45   <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"                     unit="m"                        />
46   <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                        unit="W"                        />
47   <!-- variables available with key_diaar5 -->
48   <field id="botpres"      description="Pressure at sea floor"                     unit="dbar"                     />
49   <field id="cellthc"      description="Cell thickness"                            unit="m"     axis_ref="deptht"  />
50     </group>
51
52      <!-- SBC -->
53     
54      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc -->
55
56   <field id="empmr"        description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  />
57        <field id="saltflx"      description="Downward salt flux"                                          unit="PSU/m2/s"  />
58   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  />
59   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  />
60
61   <field id="qt"           description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     />
62   <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     />
63   <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     />
64   <field id="qsr3d"        description="Shortwave Radiation 3D distribution"        axis_ref="deptht" unit="W/m2"     />
65   <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     />
66   <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  />
67   <field id="taum"         description="wind stress module"                                           unit="N/m2"     />
68   <field id="wspd"         description="Wind speed module at 10 m"                                    unit="m/s"      />
69
70        <!-- * variable relative to atmospheric pressure forcing : available with ln_apr_dyn -->
71        <field id="ssh_ib"       description="Inverse barometer sea surface height"                         unit="m"        />
72   
73   <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core -->
74   <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     />
75   <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
76   <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
77   <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     />
78        <field id="qhc_oce"      description="Downward Heat Content of E-P over open ocean"                 unit="W/m2"     />
79   <field id="taum_oce"     description="wind stress module over open ocean"                           unit="N/m2"     />
80
81   <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="1"        />
82
83   <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     />
84   <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
85   <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
86   <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     />
87   
88   <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
89   <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
90   
91   <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        />
92   <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        />
93   <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      />
94   
95   <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        />
96   <field id="ist_cea"      description="Ice surface temperature (cell average)"                       unit="degC"     />
97   <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="degC"     />     
98   <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
99   <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
100   
101   <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
102   <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
103   
104   <field id="u_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along i-axis"                          unit="kg/s"     />
105   <field id="v_imasstr"    description="Sea-ice mass transport along j-axis"                          unit="kg/s"     />
106
107        <!-- available if not defined key_vvl -->
108        <field id="emp_x_sst"      description="Concentration/Dilution term on SST"                         unit="kgC/m2/s" />
109        <field id="emp_x_sss"      description="Concentration/Dilution term on SSS"                       unit="kgPSU/m2/s" />
110   <!-- available key_coupled -->
111   <field id="snow_ao_cea"  description="Snow over ice-free ocean (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
112   <field id="snow_ai_cea"  description="Snow over sea-ice (cell average)"                             unit="kg/m2/s"  />
113   <field id="subl_ai_cea"  description="Sublimation over sea-ice (cell average)"                      unit="kg/m2/s"  />
114   <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="1"        />
115   <field id="calving"      description="Calving"                                                      unit="kg/m2/s"  />
116   <!-- available if key_coupled + conservative method -->
117   <field id="rain"         description="Liquid precipitation"                                         unit="Kg/m2/s"  />
118   <field id="evap_ao_cea"  description="Evaporation over ice-free ocean (cell average)"               unit="kg/m2/s"  />
119   <!-- variables available with key_diaar5 -->
120   <field id="isnwmlt_cea"   description="Snow over Ice melting (cell average)"                        unit="kg/m2/s"  />
121   <field id="fsal_virt_cea" description="Virtual salt flux due to ice formation (cell average)"       unit="kg/m2/s"  />
122   <field id="fsal_real_cea" description="Real salt flux due to ice formation (cell average)"          unit="kg/m2/s"  />
123   <field id="hflx_rain_cea" description="heat flux due to rainfall"                                   unit="W/m2"     />
124   <field id="hflx_evap_cea" description="heat flux due to evaporation"                                unit="W/m2"     />
125   <field id="hflx_snow_cea" description="heat flux due to snow falling over ice-free ocean"           unit="W/m2"     />
126   <field id="hflx_ice_cea"  description="heat flux due to ice thermodynamics"                         unit="W/m2"     />
127   <field id="hflx_rnf_cea"  description="heat flux due to runoffs"                                    unit="W/m2"     />
128   <field id="hflx_cal_cea"  description="heat flux due to calving"                                    unit="W/m2"     />
129   <field id="bicemel_cea"  description="Rate of Melt at Sea Ice Base (cell average)"                  unit="kg/m2/s"  />
130   <field id="licepro_cea"  description="Lateral Sea Ice Growth Rate (cell average)"                   unit="kg/m2/s"  />
131   <field id="snowmel_cea"  description="Snow Melt Rate (cell average)"                                unit="kg/m2/s"  />
132   <field id="sntoice_cea"  description="Snow-Ice Formation Rate (cell average)"                       unit="kg/m2/s"  />
133   <field id="ticemel_cea"  description="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice (cell average)"      unit="kg/m2/s"  />
134
135      </group>
136
137      <!-- U grid -->
138     
139      <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U">
140   <field id="utau"         description="Wind Stress along i-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
141   <field id="uoce"         description="ocean current along i-axis"                  unit="m/s"                  />
142   <field id="uocetr_eff"     description="Effective ocean transport along i-axis"    unit="m3/s"                 />
143   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
144   <field id="uoce_eiv"     description="EIV ocean current along i-axis"              unit="m/s"                  />
145   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl -->
146   <field id="uoce_bbl"     description="BBL ocean current along i-axis"              unit="m/s"  axis_ref="none" />
147   <field id="ahu_bbl"      description="BBL diffusive flux along i-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
148   <!-- variables available with key_diaar5 -->
149   <field id="u_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along i-axis"  unit="kg/s"                 />
150   <field id="u_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along i-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
151   <field id="ueiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along i-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
152   <field id="udiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along i-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
153     </group>
154     
155      <!-- V grid -->
156     
157      <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V">
158   <field id="vtau"         description="Wind Stress along j-axis"                    unit="N/m2" axis_ref="none" />
159   <field id="voce"         description="ocean current along j-axis"                  unit="m/s"                  />
160   <field id="vocetr_eff"     description="Effective ocean tra,sport along j-axis"    unit="m3/s"                 />
161   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
162   <field id="voce_eiv"     description="EIV ocean current along j-axis"              unit="m/s"                  />
163   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl -->
164   <field id="voce_bbl"     description="BBL ocean current along j-axis"              unit="m/s" axis_ref="none"  />
165   <field id="ahv_bbl"      description="BBL diffusive flux along j-axis"             unit="m3/s" axis_ref="none" />
166   <!-- variables available with key_diaar5 -->
167   <field id="v_masstr"     description="ocean eulerian mass transport along j-axis"  unit="kg/s"                 />
168   <field id="v_heattr"     description="ocean eulerian heat transport along j-axis"  unit="W"    axis_ref="none" />
169   <field id="veiv_heattr"  description="ocean bolus heat transport along j-axis"     unit="W"    axis_ref="none" />
170   <field id="vdiff_heattr" description="ocean diffusion heat transport along j-axis" unit="W"    axis_ref="none" />
171      </group>
172     
173      <!-- W grid -->
174     
175      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
176   <field id="woce"         description="ocean vertical velocity"                     unit="m/s"                  />
177   <field id="wocetr_eff"     description="effective ocean vertical transport"          unit="m3/s"                 />
178   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
179   <field id="woce_eiv"     description="EIV ocean vertical velocity"                 unit="m/s"                  />
180   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
181   <field id="avt"          description="vertical eddy diffusivity"                   unit="m2/s"                 />
182   <field id="avm"          description="vertical eddy viscosity"                     unit="m2/s"                 />
183   <!-- avs: available with key_zdfddm -->
184   <field id="avs"          description="salt vertical eddy diffusivity"              unit="m2/s"                 />
185   <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd -->
186   <field id="avt_evd"      description="enhanced vertical diffusivity"               unit="m2/s"                 />
187   <field id="avm_evd"      description="enhanced vertical viscosity"                 unit="m2/s"                 />
188   <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d -->
189   <field id="aht2d"        description="lateral eddy diffusivity"                    unit="m2/s" axis_ref="none" />
190   <field id="aht2d_eiv"    description="EIV lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" />
191   <!-- avt_tide: available with key_zdftmx -->
192   <field id="av_tide"      description="tidal vertical diffusivity"                  unit="m2/s"                 />
193   <!-- variables available with key_diaar5 -->   
194   <field id="w_masstr"     description="vertical mass trasport"                      unit="kg/s"                 />
195   <field id="w_masstr2"    description="square of vertical mass trasport"            unit="kg2/s2"               />
196      </group>
197         
198      <!-- scalar -->
199     
200      <!-- variables available with key_diaar5 -->
201      <group id="scalar" axis_ref="none" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point" >
202   <field id="voltot"     description="global mean volume"                         unit="m3"   />
203   <field id="sshtot"     description="global mean ssh"                            unit="m"    />
204   <field id="sshsteric"  description="global mean ssh steric"                     unit="m"    />
205   <field id="sshthster"  description="global mean ssh thermosteric"               unit="m"    />
206   <field id="masstot"    description="global mean mass"                           unit="kg"   />
207   <field id="temptot"    description="global mean temperature"                    unit="degC" />
208   <field id="saltot"     description="global mean salinity"                       unit="psu"  />
209   <field id="fram_trans" description="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait" unit="kg/s" />
210      </group>
211
212      <!-- variables available with key_float -->
213      <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point">
214        <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" />
215        <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   />
216        <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     />
217        <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  />
218        <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   />
219        <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" />
220        <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  />
221      </group>
222     
223      <!-- ptrc on T grid -->
224
225     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">
226       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mmol/m3" />
227       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="mmol/m3"    />
228       <field id="O2"       description="Oxygen Concentration"                     unit="mmol/m3" />
229       <field id="CaCO3"    description="Calcite Concentration"                    unit="mmol/m3" />
230       <field id="PO4"      description="Phosphate Concentration"                  unit="mmol/m3" />
231       <field id="POC"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mmol/m3" />
232       <field id="Si"       description="Silicate Concentration"                   unit="mmol/m3" />
233       <field id="PHY"      description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mmol/m3" />
234       <field id="ZOO"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mmol/m3" />
235       <field id="DOC"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mmol/m3" />
236       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mmol/m3" />
237       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mmol/m3" />
238       <field id="DSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mmol/m3" />
239       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mmol/m3" />
240       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mmol/m3" />
241       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mmol/m3" />
242       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mmol/m3" />
243       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mmol/m3" />
244       <field id="GSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mmol/m3" />
245       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mmol/m3" />
246       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mg/m3" />
247       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mg/m3" />
248       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mmol/m3" />
249       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mmol/m3" />
250     </group>
251
252      <!-- diad on T grid : variables available with key_diatrc -->
253
254     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
255       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"          axis_ref="deptht" />
256       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" />
257       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/m3"     axis_ref="deptht" />
258       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"       axis_ref="deptht" />
259       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
260       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
261       <field id="PPNEWN"      description="New Primary production of nanophyto"      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
262       <field id="PPNEWD"      description="New Primary production of diatoms"        unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
263       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
264       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
265       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
266       <field id="PCAL"        description="Calcite production"                       unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
267       <field id="DCAL"        description="Calcite dissolution"                      unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
268       <field id="GRAZ"        description="Grazing by zooplankton"                   unit="mol/m3/s"   axis_ref="deptht" />
269       <field id="Mumax"       description="Maximum growth rate"                      unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
270       <field id="MuN"         description="Realized growth rate for nanophyto"       unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
271       <field id="MuD"         description="Realized growth rate for diatomes"        unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
272       <field id="MuNlight"    description="Light limited growth rate for nanophyto"  unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
273       <field id="MuDlight"    description="Light limited growth rate for diatomes"   unit="s-1"        axis_ref="deptht" />
274       <field id="LNnut"       description="Nutrient limitation term in Nanophyto"    unit="-"          axis_ref="deptht" />
275       <field id="LDnut"       description="Nutrient limitation term in Diatoms"      unit="-"          axis_ref="deptht" />
276       <field id="LNFe"        description="Iron limitation term in Nanophyto"        unit="-"          axis_ref="deptht" />
277       <field id="LDFe"        description="Iron limitation term in Diatoms"          unit="-"          axis_ref="deptht" />
278       <field id="LNlight"     description="Light limitation term in Nanophyto"       unit="-"          axis_ref="deptht" />
279       <field id="LDlight"     description="Light limitation term in Diatoms"         unit="-"          axis_ref="deptht" />
280       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation at surface"             unit="mol/m2/s"                     />
281       <field id="EPC100"      description="Export of carbon particles at 100 m"      unit="mol/m2/s"                     />
282       <field id="EPFE100"     description="Export of biogenic iron at 100 m"         unit="mol/m2/s"                     />
283       <field id="EPSI100"     description="Export of Silicate at 100 m"              unit="mol/m2/s"                     />
284       <field id="EPCAL100"    description="Export of Calcite at 100 m"               unit="mol/m2/s"                     />
285       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol/m2/s"                     />
286       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol/m2/s"                     />
287       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol/m2/s/uatm"                />
288       <field id="Dpco2"       description="Delta CO2"                                unit="uatm"                         />
289       <field id="Dpo2"        description="Delta O2"                                 unit="uatm"                         />
290       <field id="Heup"        description="Euphotic layer depth"                     unit="m"                            />
291       <field id="Irondep"     description="Iron deposition"                          unit="mol/m2/s"                     />
292     </group>
293       
294    </field_definition>
295   
296    <!--
297============================================================================================================
298=                                           output files definition                                        =
299=                                            Define your own files                                         =
300=                                         put the variables you want...                                    =
301============================================================================================================
302    -->
303   
304    <file_definition >
305
306      <group id="1h" output_freq="3600"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1h files -->
307      </group>
308     
309      <group id="2h" output_freq="7200"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 2h files -->
310      </group>
311     
312      <group id="3h" output_freq="10800"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3h files -->
313      </group>
314     
315      <group id="4h" output_freq="14400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 4h files -->
316      </group>
317     
318      <group id="6h" output_freq="21600"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 6h files -->
319      </group>
320     
321      <group id="1d" output_freq="86400"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files -->
322
323    <!--
324............................................................................................................
325           example of 3 types of 1d files
326............................................................................................................
327    -->
328        <!-- automatic definition of the name based on id="1d_grid_T"
329             => this name is used as the radical for all file names of this group
330             => add a suffix to be sure that all files names of this group are different   -->
331        <group id="1d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
332          <!-- mooring: automatic definition of the file name suffix based on id="0n180wT"  -->
333          <file id="0n180wT" name_suffix="auto" >
334            <group id="0n180wT" zoom_ref="0n180wT" >    <!-- group of variables sharing the same zoom -->
335              <field ref="toce" name="votemper"  />
336              <field ref="uoce" name="vozocrtx"  />     <!-- include a U-grid variable in the list => switch to T-grid -->
337            </group>
338          </file>
339          <!-- Equatorial section: automatic definition of the file name suffix based on id="EqT" -->
340          <file id="EqT" name_suffix="auto" >
341            <group id="EqT" zoom_ref="EqT" >
342              <field ref="toce" name="votemper"  />
343            </group>
344          </file>
345          <!-- global file with different operations on data   -->
346          <file id="global" >
347            <field ref="sst"    name="sst_1d_ave"                       />     <!-- mean -->
348            <field ref="sst"    name="sst_1d_max"  operation="t_max(X)" />     <!-- max -->
349          </file>
350        </group>
351
352      </group>
353     
354      <group id="3d" output_freq="259200" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 3d files -->
355      </group>
356     
357      <group id="5d" output_freq="432000" output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- 5d files -->
358
359   <file id="5d_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
360     <field ref="toce"         name="votemper"  />
361     <field ref="soce"         name="vosaline"  />
362     <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
363     <field ref="sss"          name="sosaline"  />
364     <field ref="ssh"          name="sossheig"  />
365     <field ref="empmr"        name="sowaflup"  />
366     <field ref="qsr"          name="soshfldo"  />
367          <field ref="saltflx"      name="sosfldow"  />
368     <field ref="qt"           name="sohefldo"  />
369     <field ref="mldr10_1"     name="somxl010"  />
370     <field ref="mldkz5"       name="somixhgt"  />
371     <field ref="ice_cover"    name="soicecov"  />
372     <field ref="wspd"         name="sowindsp"  />
373     <field ref="qrp"          name="sohefldp"  />
374     <field ref="erp"          name="sowafldp"  />
375     <field ref="mlddzt"       name="sothedep"  />
376     <field ref="20d"          name="so20chgt"  />
377     <field ref="28d"          name="so28chgt"  />
378     <field ref="hc300"        name="sohtc300"  />
379     <field ref="ist_ipa"      name="soicetem"  />
380     <field ref="icealb_cea"   name="soicealb"  />   
381   </file>
382   
383   <file id="5d_grid_U" name="auto" description="ocean U grid variables" >
384     <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  />
385     <field ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  />
386     <field ref="utau"         name="sozotaux"  />
387   </file>
388   
389   <file id="5d_grid_V" name="auto" description="ocean V grid variables" >
390     <field ref="voce"         name="vomecrty"  />
391     <field ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  />
392     <field ref="vtau"         name="sometauy"  />
393   </file>
394   
395   <file id="5d_grid_W" name="auto" description="ocean W grid variables" >
396     <field ref="woce"         name="vovecrtz" />
397     <field ref="woce_eiv"     name="voveeivw" />
398     <field ref="avt"          name="votkeavt" />
399     <field ref="avt_evd"      name="votkeevd" />
400     <field ref="avm"          name="votkeavm" />
401     <field ref="avm_evd"      name="votkeevm" />
402     <field ref="avs"          name="voddmavs" />
403     <field ref="aht2d"        name="soleahtw" />
404     <field ref="aht2d_eiv"    name="soleaeiw" />
405   </file>
406
407
408   <file id="5d_icemod" name="auto" description="ice variables" >
409     <field ref="ice_pres"                     />
410     <field ref="snowthic_cea" name="isnowthi" />
411     <field ref="icethic_cea"  name="iicethic" />
412     <field ref="iceprod_cea"  name="iiceprod" />
413     <field ref="ist_ipa"      name="iicetemp" />
414     <field ref="ioceflxb"     name="ioceflxb" />
415     <field ref="uice_ipa"     name="iicevelu" />
416     <field ref="vice_ipa"     name="iicevelv" />
417     <field ref="utau_ice"     name="iicestru" />
418     <field ref="vtau_ice"     name="iicestrv" />
419     <field ref="qsr_io_cea"   name="iicesflx" />
420     <field ref="qns_io_cea"   name="iicenflx" />
421     <field ref="snowpre"      name="isnowpre" />
422   </file>
423
424        <!-- variables available with key_float, instantaneous fields -->
425        <file id="floats"  description="floats variables">
426            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="432000" />
427            <field ref="traj_lat"   name="floats_latitude"    freq_op="432000" />
428            <field ref="traj_dep"   name="floats_depth"       freq_op="432000" />
429            <field ref="traj_temp"  name="floats_temperature" freq_op="432000" />
430            <field ref="traj_salt"  name="floats_salinity"    freq_op="432000" />
431            <field ref="traj_dens"  name="floats_density"     freq_op="432000" />
432            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="432000" />
433        </file>
434
435       <file id="5d_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" >
436          <field ref="Cflx"     />
437          <field ref="Oflx"     />
438          <field ref="Dpco2"    />
439          <field ref="Dpo2"     />
440          <field ref="Heup"     />
441       </file>
442
443      </group>
444     
445      <group id="1m" output_freq="-1"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files -->
446
447   <file id="1m_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
448     <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
449   </file>   
450
451        <file id="1m_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" >
452          <field ref="DIC"      />
453          <field ref="Alkalini" />
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455          <field ref="NCHL"     />
456          <field ref="DCHL"     />
457          <field ref="DOC"      />
458          <field ref="Fer"      />
459          <field ref="NO3"      />
460       </file>
461   
462      </group>
463
464      <group id="2m" output_freq="-2"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2m files -->
465      </group>
466
467      <group id="3m" output_freq="-3"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 3m files -->
468      </group>
469
470      <group id="4m" output_freq="-4"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 4m files -->
471      </group>
472
473      <group id="6m" output_freq="-6"     output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 6m files -->
474      </group>
475
476      <group id="1y" output_freq="-12"    output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real yearly files -->
477
478        <file id="1y_grid_T" name="auto" description="ocean T grid variables" >
479          <field ref="mldr10_1"     name="sobowlin"  operation="t_max(X)" />
480        </file>
481
482        <file id="1y_ptrc_T" name="auto" description="pisces sms variables" >
483          <field ref="DIC"      />
484          <field ref="Alkalini" />
485          <field ref="O2"       />
486          <field ref="CaCO3"    />
487          <field ref="PO4"      />
488          <field ref="POC"      />
489          <field ref="Si"       />
490          <field ref="PHY"      />
491          <field ref="ZOO"      />
492          <field ref="DOC"      />
493          <field ref="PHY2"     />
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495          <field ref="DSi"      />
496          <field ref="Fer"      />
497          <field ref="BFe"      />
498          <field ref="GOC"      />
499          <field ref="SFe"      />
500          <field ref="DFe"      />
501          <field ref="GSi"      />
502          <field ref="NFe"      />
503          <field ref="NCHL"     />
504          <field ref="DCHL"     />
505          <field ref="NO3"      />
506          <field ref="NH4"      />
507       </file>
508
509       <file id="1y_diad_T" name="auto" description="additional pisces diagnostics" >
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511          <field ref="CO3"      />
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513          <field ref="PAR"      />
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529          <field ref="LNnut"    />
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534          <field ref="LDlight"  />
535          <field ref="EPC100"   />
536          <field ref="EPFE100"  />
537          <field ref="EPSI100"  />
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539          <field ref="Cflx"     />
540          <field ref="Oflx"     />
541          <field ref="Kg"       />
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544          <field ref="Heup"     />
545          <field ref="Irondep"  />
546          <field ref="Nfix"     />
547       </file>
548
549      </group>
550
551      <group id="2y"  output_freq="-24"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 2y files -->
552      </group>
553
554      <group id="5y"  output_freq="-60"   output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 5y files -->
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556
557      <group id="10y" output_freq="-120"  output_level="10" enabled=".TRUE.">                      <!-- real 10y files -->
558      </group>
559
560    </file_definition>
561   
562    <!--
563============================================================================================================
564=                                           grid definition                                                =
565=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
566============================================================================================================
567    -->
568   
569    <axis_definition> 
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571      <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" positive=".false." />
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574      <axis id="nfloat" description="Number of float"   unit="no unit" positive=".false." />
575      <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" />
576    </axis_definition> 
577   
578    <grid_definition>
579      <grid id="grid_T" description="grid T" >
580    <!--   Eq section   -->
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582    <!--   TAO   -->
583      <!--   137e   -->
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587      <!--   147e   -->
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589        <zoom id="2n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" />
590        <zoom id="5n147eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" />
591      <!--   156e   -->
592        <zoom id="5s156eT" ibegin="0000" jbegin="0000" ni="1" nj="1" />
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662    <!--   RAMA   -->
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Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.