source: branches/2017/dev_merge_2017/NEMOGCM/TOOLS/DOMAINcfg/namelist_ref @ 9033

Last change on this file since 9033 was 9033, checked in by timgraham, 3 years ago

Commit final files from merge of NEMOGCM and some fixes for waves (taooc renamed tauwoc)

File size: 91.5 KB
Line 
1!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
2!!                            namelist_ref
3!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
4!! NEMO/OPA  :  1 - run manager      (namrun)
5!! namelists    2 - Domain           (namcfg, namzgr, namzgr_sco, namdom, namtsd, namcrs, namc1d, namc1d_uvd)
6!!              3 - Surface boundary (namsbc, namsbc_ana, namsbc_flx, namsbc_clio, namsbc_core, namsbc_sas
7!!                                    namsbc_cpl, namtra_qsr, namsbc_rnf,
8!!                                    namsbc_apr, namsbc_ssr, namsbc_alb, namsbc_wave)
9!!              4 - lateral boundary (namlbc, namagrif, nambdy, nambdy_tide)
10!!              5 - bottom  boundary (nambfr, nambbc, nambbl)
11!!              6 - Tracer           (nameos, namtra_adv, namtra_ldf, namtra_ldfeiv, namtra_dmp)
12!!              7 - dynamics         (namdyn_adv, namdyn_vor, namdyn_hpg, namdyn_spg, namdyn_ldf)
13!!              8 - Verical physics  (namzdf, namzdf_ric, namzdf_tke, namzdf_ddm, namzdf_tmx)
14!!              9 - diagnostics      (namnc4, namtrd, namspr, namflo, namhsb, namsto)
15!!             10 - miscellaneous    (nammpp, namctl)
16!!             11 - Obs & Assim      (namobs, nam_asminc)
17!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
18
19!!======================================================================
20!!                   ***  Run management namelists  ***
21!!======================================================================
22!!   namrun       parameters of the run
23!!======================================================================
24!
25!-----------------------------------------------------------------------
26&namrun        !   parameters of the run
27!-----------------------------------------------------------------------
28   nn_no       =       0   !  job number (no more used...)
29   cn_exp      =  "ORCA2"  !  experience name
30   nn_it000    =       1   !  first time step
31   nn_itend    =    5475   !  last  time step (std 5475)
32   nn_date0    =  010101   !  date at nit_0000 (format yyyymmdd) used if ln_rstart=F or (ln_rstart=T and nn_rstctl=0 or 1)
33   nn_time0    =       0   !  initial time of day in hhmm
34   nn_leapy    =       0   !  Leap year calendar (1) or not (0)
35   ln_rstart   = .false.   !  start from rest (F) or from a restart file (T)
36      nn_euler    =    1            !  = 0 : start with forward time step if ln_rstart=T
37      nn_rstctl   =    0            !  restart control ==> activated only if ln_rstart=T
38      !                             !    = 0 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : read in namelist
39      !                             !    = 1 nn_date0 read in namelist ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart
40      !                             !    = 2 nn_date0 read in restart  ; nn_it000 : check consistancy between namelist and restart
41      cn_ocerst_in    = "restart"   !  suffix of ocean restart name (input)
42      cn_ocerst_indir = "."         !  directory from which to read input ocean restarts
43      cn_ocerst_out   = "restart"   !  suffix of ocean restart name (output)
44      cn_ocerst_outdir= "."         !  directory in which to write output ocean restarts
45   ln_iscpl    = .false.   !  cavity evolution forcing or coupling to ice sheet model
46   nn_istate   =       0   !  output the initial state (1) or not (0)
47   ln_rst_list = .false.   !  output restarts at list of times using nn_stocklist (T) or at set frequency with nn_stock (F)
48   nn_stock    =    5475   !  frequency of creation of a restart file (modulo referenced to 1)
49   nn_stocklist = 0,0,0,0,0,0,0,0,0,0 ! List of timesteps when a restart file is to be written
50   nn_write    =    5475   !  frequency of write in the output file   (modulo referenced to nn_it000)
51   ln_mskland  = .false.   !  mask land points in NetCDF outputs (costly: + ~15%)
52   ln_cfmeta   = .false.   !  output additional data to netCDF files required for compliance with the CF metadata standard
53   ln_clobber  = .true.    !  clobber (overwrite) an existing file
54   nn_chunksz  =       0   !  chunksize (bytes) for NetCDF file (works only with iom_nf90 routines)
55/
56!
57!!======================================================================
58!!                      ***  Domain namelists  ***
59!!======================================================================
60!!   namcfg       parameters of the configuration
61!!   namzgr       vertical coordinate                                   (default: NO selection)
62!!   namzgr_sco   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate
63!!   namdom       space and time domain (bathymetry, mesh, timestep)
64!!   namwad       Wetting and drying                                    (default F)
65!!   namtsd       data: temperature & salinity
66!!   namcrs       coarsened grid (for outputs and/or TOP)               ("key_crs")
67!!   namc1d       1D configuration options                              ("key_c1d")
68!!   namc1d_dyndmp 1D newtonian damping applied on currents             ("key_c1d")
69!!   namc1d_uvd   1D data (currents)                                    ("key_c1d")
70!!======================================================================
71!
72!-----------------------------------------------------------------------
73&namcfg        !   parameters of the configuration
74!-----------------------------------------------------------------------
75   !
76   ln_e3_dep   = .true.    ! =T : e3=dk[depth] in discret sens.
77   !                       !      ===>>> will become the only possibility in v4.0
78   !                       ! =F : e3 analytical derivative of depth function
79   !                       !      only there for backward compatibility test with v3.6
80   !
81   cp_cfg      = "default" !  name of the configuration
82   cp_cfz      = "no zoom" !  name of the zoom of configuration
83   jp_cfg      =      0    !  resolution of the configuration
84   jpidta      =     10    !  1st lateral dimension ( >= jpi )
85   jpjdta      =     12    !  2nd    "         "    ( >= jpj )
86   jpkdta      =     31    !  number of levels      ( >= jpk )
87   jpiglo      =     10    !  1st dimension of global domain --> i =jpidta
88   jpjglo      =     12    !  2nd    -                  -    --> j =jpjdta
89   jpizoom     =      1    !  left bottom (i,j) indices of the zoom
90   jpjzoom     =      1    !  in data domain indices
91   jperio      =      0    !  lateral cond. type (between 0 and 6)
92                                 !  = 0 closed                 ;   = 1 cyclic East-West
93                                 !  = 2 equatorial symmetric   ;   = 3 North fold T-point pivot
94                                 !  = 4 cyclic East-West AND North fold T-point pivot
95                                 !  = 5 North fold F-point pivot
96                                 !  = 6 cyclic East-West AND North fold F-point pivot
97   ln_use_jattr = .false.  !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present
98                           !  in netcdf input files, as the start j-row for reading
99/
100!-----------------------------------------------------------------------
101&namzgr        !   vertical coordinate                                  (default: NO selection)
102!-----------------------------------------------------------------------
103   ln_zco      = .false.   !  z-coordinate - full    steps
104   ln_zps      = .false.   !  z-coordinate - partial steps
105   ln_sco      = .false.   !  s- or hybrid z-s-coordinate
106   ln_isfcav   = .false.   !  ice shelf cavity
107   ln_linssh   = .false.   !  linear free surface
108/
109!-----------------------------------------------------------------------
110&namzgr_sco    !   s-coordinate or hybrid z-s-coordinate                (default F)
111!-----------------------------------------------------------------------
112   ln_s_sh94   = .false.    !  Song & Haidvogel 1994 hybrid S-sigma   (T)|
113   ln_s_sf12   = .false.   !  Siddorn & Furner 2012 hybrid S-z-sigma (T)| if both are false the NEMO tanh stretching is applied
114   ln_sigcrit  = .false.   !  use sigma coordinates below critical depth (T) or Z coordinates (F) for Siddorn & Furner stretch
115                           !  stretching coefficients for all functions
116   rn_sbot_min =   10.0    !  minimum depth of s-bottom surface (>0) (m)
117   rn_sbot_max = 7000.0    !  maximum depth of s-bottom surface (= ocean depth) (>0) (m)
118   rn_hc       =  150.0    !  critical depth for transition to stretched coordinates
119                        !!!!!!!  Envelop bathymetry
120   rn_rmax     =    0.3    !  maximum cut-off r-value allowed (0<r_max<1)
121                        !!!!!!!  SH94 stretching coefficients  (ln_s_sh94 = .true.)
122   rn_theta    =    6.0    !  surface control parameter (0<=theta<=20)
123   rn_bb       =    0.8    !  stretching with SH94 s-sigma
124                        !!!!!!!  SF12 stretching coefficient  (ln_s_sf12 = .true.)
125   rn_alpha    =    4.4    !  stretching with SF12 s-sigma
126   rn_efold    =    0.0    !  efold length scale for transition to stretched coord
127   rn_zs       =    1.0    !  depth of surface grid box
128                           !  bottom cell depth (Zb) is a linear function of water depth Zb = H*a + b
129   rn_zb_a     =    0.024  !  bathymetry scaling factor for calculating Zb
130   rn_zb_b     =   -0.2    !  offset for calculating Zb
131                        !!!!!!!! Other stretching (not SH94 or SF12) [also uses rn_theta above]
132   rn_thetb    =    1.0    !  bottom control parameter  (0<=thetb<= 1)
133/
134!-----------------------------------------------------------------------
135&namdom        !   space and time domain (bathymetry, mesh, timestep)
136!-----------------------------------------------------------------------
137   nn_bathy    =    1      !  compute (=0) or read (=1) the bathymetry file
138   rn_bathy    =    0.     !  value of the bathymetry. if (=0) bottom flat at jpkm1
139   nn_closea   =    0      !  remove (=0) or keep (=1) closed seas and lakes (ORCA)
140   nn_msh      =    1      !  create (=1) a mesh file or not (=0)
141   rn_hmin     =   -3.     !  min depth of the ocean (>0) or min number of ocean level (<0)
142   rn_isfhmin  =    1.00   !  treshold (m) to discriminate grounding ice to floating ice
143   rn_e3zps_min=   20.     !  partial step thickness is set larger than the minimum of
144   rn_e3zps_rat=    0.1    !  rn_e3zps_min and rn_e3zps_rat*e3t, with 0<rn_e3zps_rat<1
145                           !
146   rn_rdt      = 5760.     !  time step for the dynamics (and tracer if nn_acc=0)
147   rn_atfp     =    0.1    !  asselin time filter parameter
148   ln_crs      = .false.      !  Logical switch for coarsening module
149   jphgr_msh   =       0               !  type of horizontal mesh
150                                       !  = 0 curvilinear coordinate on the sphere read in coordinate.nc
151                                       !  = 1 geographical mesh on the sphere with regular grid-spacing
152                                       !  = 2 f-plane with regular grid-spacing
153                                       !  = 3 beta-plane with regular grid-spacing
154                                       !  = 4 Mercator grid with T/U point at the equator
155   ppglam0     =       0.0             !  longitude of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1)
156   ppgphi0     =     -35.0             ! latitude  of first raw and column T-point (jphgr_msh = 1)
157   ppe1_deg    =       1.0             !  zonal      grid-spacing (degrees)
158   ppe2_deg    =       0.5             !  meridional grid-spacing (degrees)
159   ppe1_m      =    5000.0             !  zonal      grid-spacing (degrees)
160   ppe2_m      =    5000.0             !  meridional grid-spacing (degrees)
161   ppsur       =    -4762.96143546300  !  ORCA r4, r2 and r05 coefficients
162   ppa0        =      255.58049070440  ! (default coefficients)
163   ppa1        =      245.58132232490  !
164   ppkth       =       21.43336197938  !
165   ppacr       =        3.0            !
166   ppdzmin     =       10.             !  Minimum vertical spacing
167   pphmax      =     5000.             !  Maximum depth
168   ldbletanh   =    .TRUE.             !  Use/do not use double tanf function for vertical coordinates
169   ppa2        =      100.760928500000 !  Double tanh function parameters
170   ppkth2      =       48.029893720000 !
171   ppacr2      =       13.000000000000 !
172   ln_wd       =             .false.   !  T/F activation of wetting and drying
173   rn_wd_ref_depth   =    0.0          !  Reference Depth for WAD cases (0 all other cases)
174/
175!-----------------------------------------------------------------------
176&namtsd        !   data : Temperature  & Salinity
177!-----------------------------------------------------------------------
178!              !  file name                 ! frequency (hours) ! variable ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
179!              !                            !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
180   sn_tem = 'data_1m_potential_temperature_nomask',     -1      ,'votemper',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
181   sn_sal = 'data_1m_salinity_nomask'             ,     -1      ,'vosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
182   !
183   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
184   ln_tsd_init = .true.    !  Initialisation of ocean T & S with T & S input data (T) or not (F)
185   ln_tsd_tradmp = .true.  !  damping of ocean T & S toward T & S input data (T) or not (F)
186/
187!-----------------------------------------------------------------------
188&namcrs        !   coarsened grid (for outputs and/or TOP)              ("key_crs")
189!-----------------------------------------------------------------------
190   nn_factx    = 3         !  Reduction factor of x-direction
191   nn_facty    = 3         !  Reduction factor of y-direction
192   nn_binref   = 0         !  Bin centering preference: NORTH or EQUAT
193                           !  0, coarse grid is binned with preferential treatment of the north fold
194                           !  1, coarse grid is binned with centering at the equator
195                           !    Symmetry with nn_facty being odd-numbered. Asymmetry with even-numbered nn_facty.
196   nn_msh_crs  = 1         !  create (=1) a mesh file or not (=0)
197   nn_crs_kz   = 0         ! 0, MEAN of volume boxes
198                           ! 1, MAX of boxes
199                           ! 2, MIN of boxes
200   ln_crs_wn   = .true.    ! wn coarsened (T) or computed using horizontal divergence ( F )
201/
202!-----------------------------------------------------------------------
203&namc1d        !   1D configuration options                             ("key_c1d")
204!-----------------------------------------------------------------------
205   rn_lat1d    =      50   !  Column latitude (default at PAPA station)
206   rn_lon1d    =    -145   !  Column longitude (default at PAPA station)
207   ln_c1d_locpt=  .true.   ! Localization of 1D config in a grid (T) or independant point (F)
208/
209!-----------------------------------------------------------------------
210&namc1d_dyndmp !   U & V newtonian damping                              ("key_c1d")
211!-----------------------------------------------------------------------
212   ln_dyndmp   =  .false.  !  add a damping term (T) or not (F)
213/
214!-----------------------------------------------------------------------
215&namc1d_uvd    !   data: U & V currents                                 ("key_c1d")
216!-----------------------------------------------------------------------
217!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
218!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
219   sn_ucur     = 'ucurrent'  ,         -1        ,'u_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Ume'   , ''
220   sn_vcur     = 'vcurrent'  ,         -1        ,'v_current',   .false.    , .true. , 'monthly' ,  ''      ,  'Vme'   , ''
221!
222   cn_dir        = './'    !  root directory for the location of the files
223   ln_uvd_init   = .false. !  Initialisation of ocean U & V with U & V input data (T) or not (F)
224   ln_uvd_dyndmp = .false. !  damping of ocean U & V toward U & V input data (T) or not (F)
225/
226
227!!======================================================================
228!!            ***  Surface Boundary Condition namelists  ***
229!!======================================================================
230!!   namsbc          surface boundary condition
231!!   namsbc_ana      analytical         formulation                     (ln_ana     =T)
232!!   namsbc_flx      flux               formulation                     (ln_flx     =T)
233!!   namsbc_clio     CLIO bulk formulae formulation                     (ln_blk_clio=T)
234!!   namsbc_core     CORE bulk formulae formulation                     (ln_blk_core=T)
235!!   namsbc_mfs      MFS  bulk formulae formulation                     (ln_blk_mfs =T)
236!!   namsbc_cpl      CouPLed            formulation                     ("key_oasis3" )
237!!   namsbc_sas      StAndalone Surface module
238!!   namtra_qsr      penetrative solar radiation                        (ln_traqsr  =T)
239!!   namsbc_rnf      river runoffs                                      (ln_rnf     =T)
240!!   namsbc_isf      ice shelf melting/freezing                         (nn_isf     >0)
241!!   namsbc_iscpl    coupling option between land ice model and ocean
242!!   namsbc_apr      Atmospheric Pressure                               (ln_apr_dyn =T)
243!!   namsbc_ssr      sea surface restoring term (for T and/or S)        (ln_ssr     =T)
244!!   namsbc_alb      albedo parameters
245!!   namsbc_wave     external fields from wave model                    (ln_wave    =T)
246!!   namberg         iceberg floats                                     (ln_icebergs=T)
247!!======================================================================
248!
249!-----------------------------------------------------------------------
250&namsbc        !   Surface Boundary Condition (surface module)
251!-----------------------------------------------------------------------
252   nn_fsbc     = 5         !  frequency of surface boundary condition computation
253                           !     (also = the frequency of sea-ice & iceberg model call)
254                     ! Type of air-sea fluxes
255   ln_ana      = .false.   !  analytical formulation                    (T => fill namsbc_ana )
256   ln_flx      = .false.   !  flux formulation                          (T => fill namsbc_flx )
257   ln_blk_clio = .false.   !  CLIO bulk formulation                     (T => fill namsbc_clio)
258   ln_blk_core = .true.    !  CORE bulk formulation                     (T => fill namsbc_core)
259   ln_blk_mfs  = .false.   !  MFS bulk formulation                      (T => fill namsbc_mfs )
260                     ! Type of coupling (Ocean/Ice/Atmosphere) :
261   ln_cpl      = .false.   !  atmosphere coupled   formulation          ( requires key_oasis3 )
262   ln_mixcpl   = .false.   !  forced-coupled mixed formulation          ( requires key_oasis3 )
263   nn_components = 0       !  configuration of the opa-sas OASIS coupling
264                           !  =0 no opa-sas OASIS coupling: default single executable configuration
265                           !  =1 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, OPA component
266                           !  =2 opa-sas OASIS coupling: multi executable configuration, SAS component
267                     ! Sea-ice :
268   nn_ice      = 2         !  =0 no ice boundary condition   ,
269                           !  =1 use observed ice-cover      ,
270                           !  =2-3 ice-model used                       ("key_lim3", "key_cice")
271   nn_ice_embd = 1         !  =0 levitating ice (no mass exchange, concentration/dilution effect)
272                           !  =1 levitating ice with mass and salt exchange but no presure effect
273                           !  =2 embedded sea-ice (full salt and mass exchanges and pressure)
274                     ! Misc. options of sbc :
275   ln_traqsr   = .true.    !  Light penetration in the ocean            (T => fill namtra_qsr )
276   ln_dm2dc    = .false.   !  daily mean to diurnal cycle on short wave
277   ln_rnf      = .true.    !  runoffs                                   (T => fill namsbc_rnf)
278   ln_ssr      = .true.    !  Sea Surface Restoring on T and/or S       (T => fill namsbc_ssr)
279   nn_fwb      = 2         !  FreshWater Budget: =0 unchecked
280                           !     =1 global mean of e-p-r set to zero at each time step
281                           !     =2 annual global mean of e-p-r set to zero
282   ln_apr_dyn  = .false.   !  Patm gradient added in ocean & ice Eqs.   (T => fill namsbc_apr )
283   ln_isf      = .false.   !  ice shelf                                 (T   => fill namsbc_isf)
284   ln_wave     = .false.   !  coupling with surface wave                (T => fill namsbc_wave)
285   nn_lsm      = 0         !  =0 land/sea mask for input fields is not applied (keep empty land/sea mask filename field) ,
286                           !  =1:n number of iterations of land/sea mask application for input fields (fill land/sea mask filename field)
287/
288!-----------------------------------------------------------------------
289&namsbc_ana    !   analytical surface boundary condition
290!-----------------------------------------------------------------------
291   nn_tau000   =   0       !  gently increase the stress over the first ntau_rst time-steps
292   rn_utau0    =   0.5     !  uniform value for the i-stress
293   rn_vtau0    =   0.e0    !  uniform value for the j-stress
294   rn_qns0     =   0.e0    !  uniform value for the total heat flux
295   rn_qsr0     =   0.e0    !  uniform value for the solar radiation
296   rn_emp0     =   0.e0    !  uniform value for the freswater budget (E-P)
297/
298!-----------------------------------------------------------------------
299&namsbc_flx    !   surface boundary condition : flux formulation
300!-----------------------------------------------------------------------
301!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
302!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
303   sn_utau     = 'utau'      ,        24         , 'utau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
304   sn_vtau     = 'vtau'      ,        24         , 'vtau'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
305   sn_qtot     = 'qtot'      ,        24         , 'qtot'    , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
306   sn_qsr      = 'qsr'       ,        24         , 'qsr'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
307   sn_emp      = 'emp'       ,        24         , 'emp'     , .false.      , .false., 'yearly'  , ''       , ''       , ''
308
309   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the flux files
310/
311!-----------------------------------------------------------------------
312&namsbc_clio   !   namsbc_clio  CLIO bulk formulae
313!-----------------------------------------------------------------------
314!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
315!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
316   sn_utau     = 'taux_1m'   ,       -1          , 'sozotaux',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
317   sn_vtau     = 'tauy_1m'   ,       -1          , 'sometauy',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
318   sn_wndm     = 'flx'       ,       -1          , 'socliowi',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
319   sn_tair     = 'flx'       ,       -1          , 'socliot2',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
320   sn_humi     = 'flx'       ,       -1          , 'socliohu',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
321   sn_ccov     = 'flx'       ,       -1          , 'socliocl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
322   sn_prec     = 'flx'       ,       -1          , 'socliopl',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
323
324   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are
325/
326!-----------------------------------------------------------------------
327&namsbc_core   !   namsbc_core  CORE bulk formulae
328!-----------------------------------------------------------------------
329!              !  file name                   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights                               ! rotation ! land/sea mask !
330!              !                              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename                              ! pairing  ! filename      !
331   sn_wndi     = 'u_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'U_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Uwnd'   , ''
332   sn_wndj     = 'v_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'V_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bicubic_noc.nc'   , 'Vwnd'   , ''
333   sn_qsr      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'SWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
334   sn_qlw      = 'ncar_rad.15JUNE2009_fill'   ,        24         , 'LWDN_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
335   sn_tair     = 't_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'T_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
336   sn_humi     = 'q_10.15JUNE2009_fill'       ,         6         , 'Q_10_MOD',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
337   sn_prec     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'PRC_MOD1',   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
338   sn_snow     = 'ncar_precip.15JUNE2009_fill',        -1         , 'SNOW'    ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
339   sn_tdif     = 'taudif_core'                ,        24         , 'taudif'  ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , 'weights_core_orca2_bilinear_noc.nc'  , ''       , ''
340
341   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files
342   ln_taudif   = .false.   !  HF tau contribution: use "mean of stress module - module of the mean stress" data
343   rn_zqt      = 10.       !  Air temperature and humidity reference height (m)
344   rn_zu       = 10.       !  Wind vector reference height (m)
345   rn_pfac     = 1.        !  multiplicative factor for precipitation (total & snow)
346   rn_efac     = 1.        !  multiplicative factor for evaporation (0. or 1.)
347   rn_vfac     = 0.        !  multiplicative factor for ocean/ice velocity
348                           !  in the calculation of the wind stress (0.=absolute winds or 1.=relative winds)
349/
350!-----------------------------------------------------------------------
351&namsbc_mfs   !   namsbc_mfs  MFS bulk formulae
352!-----------------------------------------------------------------------
353!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights     ! rotation ! land/sea mask !
354!              !             !  (if <0  months)  !   name   !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename    ! pairing  ! filename      !
355   sn_wndi     =   'ecmwf'   ,        6          , 'u10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,   ''
356   sn_wndj     =   'ecmwf'   ,        6          , 'v10'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,   ''
357   sn_clc      =   'ecmwf'   ,        6          , 'clc'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,   ''
358   sn_msl      =   'ecmwf'   ,        6          , 'msl'    ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,   ''
359   sn_tair     =   'ecmwf'   ,        6          , 't2'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,   ''
360   sn_rhm      =   'ecmwf'   ,        6          , 'rh'     ,    .true.    , .false., 'daily'   ,'bilinear.nc',   ''     ,   ''
361   sn_prec     =   'ecmwf'   ,        6          , 'precip' ,    .true.    , .true. , 'daily'   ,'bicubic.nc' ,   ''     ,   ''
362
363   cn_dir      = './ECMWF/'      !  root directory for the location of the bulk files
364/
365!-----------------------------------------------------------------------
366&namsbc_cpl    !   coupled ocean/atmosphere model                       ("key_oasis3")
367!-----------------------------------------------------------------------
368!                    !     description      !  multiple  !    vector   !      vector          ! vector !
369!                    !                      ! categories !  reference  !    orientation       ! grids  !
370! send
371   sn_snd_temp   =   'weighted oce and ice' ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
372   sn_snd_alb    =   'weighted ice'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
373   sn_snd_thick  =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
374   sn_snd_crt    =   'none'                 ,    'no'    , 'spherical' , 'eastward-northward' ,  'T'
375   sn_snd_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''           ,   ''
376! receive
377   sn_rcv_w10m   =   'none'                 ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
378   sn_rcv_taumod =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
379   sn_rcv_tau    =   'oce only'             ,    'no'    , 'cartesian' , 'eastward-northward',  'U,V'
380   sn_rcv_dqnsdt =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
381   sn_rcv_qsr    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
382   sn_rcv_qns    =   'oce and ice'          ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
383   sn_rcv_emp    =   'conservative'         ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
384   sn_rcv_rnf    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
385   sn_rcv_cal    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
386   sn_rcv_co2    =   'coupled'              ,    'no'    ,     ''      ,         ''          ,   ''
387!
388   nn_cplmodel   =     1   !  Maximum number of models to/from which NEMO is potentialy sending/receiving data
389   ln_usecplmask = .false. !  use a coupling mask file to merge data received from several models
390   !                       !   -> file cplmask.nc with the float variable called cplmask (jpi,jpj,nn_cplmodel)
391/
392!-----------------------------------------------------------------------
393&namsbc_sas    !   analytical surface boundary condition
394!-----------------------------------------------------------------------
395!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
396!              !             !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
397   sn_usp      = 'sas_grid_U',     120           , 'vozocrtx',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
398   sn_vsp      = 'sas_grid_V',     120           , 'vomecrty',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
399   sn_tem      = 'sas_grid_T',     120           , 'sosstsst',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
400   sn_sal      = 'sas_grid_T',     120           , 'sosaline',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
401   sn_ssh      = 'sas_grid_T',     120           , 'sossheig',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
402   sn_e3t      = 'sas_grid_T',     120           , 'e3t_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
403   sn_frq      = 'sas_grid_T',     120           , 'frq_m'   ,   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,    ''
404
405   ln_3d_uve   = .true.    !  specify whether we are supplying a 3D u,v and e3 field
406   ln_read_frq = .false.   !  specify whether we must read frq or not
407   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files are
408/
409!-----------------------------------------------------------------------
410&namtra_qsr    !   penetrative solar radiation                          (ln_traqsr=T)
411!-----------------------------------------------------------------------
412!              !  file name  ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
413!              !             !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
414   sn_chl      ='chlorophyll',        -1         , 'CHLA'    ,   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
415
416   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
417   ln_qsr_rgb  = .true.    !  RGB (Red-Green-Blue) light penetration
418   ln_qsr_2bd  = .false.   !  2 bands              light penetration
419   ln_qsr_bio  = .false.   !  bio-model light penetration
420   nn_chldta   =      1    !  RGB : Chl data (=1) or cst value (=0)
421   rn_abs      =   0.58    !  RGB & 2 bands: fraction of light (rn_si1)
422   rn_si0      =   0.35    !  RGB & 2 bands: shortess depth of extinction
423   rn_si1      =   23.0    !  2 bands: longest depth of extinction
424   ln_qsr_ice  = .true.    !  light penetration for ice-model LIM3
425/
426!-----------------------------------------------------------------------
427&namsbc_rnf    !   runoffs namelist surface boundary condition          (ln_rnf=T)
428!-----------------------------------------------------------------------
429!              !  file name           ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
430!              !                      !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
431   sn_rnf      = 'runoff_core_monthly',        -1         , 'sorunoff',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
432   sn_cnf      = 'runoff_core_monthly',         0         , 'socoefr0',   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
433   sn_s_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rosaline',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
434   sn_t_rnf    = 'runoffs'            ,        24         , 'rotemper',   .true.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
435   sn_dep_rnf  = 'runoffs'            ,         0         , 'rodepth' ,   .false.    , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
436
437   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
438   ln_rnf_mouth= .true.    !  specific treatment at rivers mouths
439      rn_hrnf     =  15.e0    !  depth over which enhanced vertical mixing is used    (ln_rnf_mouth=T)
440      rn_avt_rnf  =   1.e-3   !  value of the additional vertical mixing coef. [m2/s] (ln_rnf_mouth=T)
441   rn_rfact    =   1.e0    !  multiplicative factor for runoff
442   ln_rnf_depth= .false.   !  read in depth information for runoff
443   ln_rnf_tem  = .false.   !  read in temperature information for runoff
444   ln_rnf_sal  = .false.   !  read in salinity information for runoff
445   ln_rnf_depth_ini = .false. ! compute depth at initialisation from runoff file
446      rn_rnf_max  = 5.735e-4  !  max value of the runoff climatologie over global domain ( ln_rnf_depth_ini = .true )
447      rn_dep_max  = 150.      !  depth over which runoffs is spread ( ln_rnf_depth_ini = .true )
448      nn_rnf_depth_file = 0   !  create (=1) a runoff depth file or not (=0)
449/
450!-----------------------------------------------------------------------
451&namsbc_isf    !  Top boundary layer (ISF)                              (nn_isf >0)
452!-----------------------------------------------------------------------
453!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
454!              !           !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
455! nn_isf == 4
456   sn_fwfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sowflisf',   .false.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    ''
457! nn_isf == 3
458   sn_rnfisf   = 'rnfisf'  ,         -12       ,'sofwfisf',   .false.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    ''
459! nn_isf == 2 and 3
460   sn_depmax_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmax',  .false.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    ''
461   sn_depmin_isf='rnfisf'  ,         -12       ,'sozisfmin',  .false.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    ''
462! nn_isf == 2
463   sn_Leff_isf = 'rnfisf'  ,         -12       ,'Leff'    ,   .false.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,   ''     ,    ''
464!
465! for all case
466   nn_isf      = 1         !  ice shelf melting/freezing
467                           !  1 = presence of ISF    2 = bg03 parametrisation
468                           !  3 = rnf file for isf   4 = ISF fwf specified
469                           !  option 1 and 4 need ln_isfcav = .true. (domzgr)
470! only for nn_isf = 1 or 2
471   rn_gammat0  = 1.e-4     ! gammat coefficient used in blk formula
472   rn_gammas0  = 1.e-4     ! gammas coefficient used in blk formula
473! only for nn_isf = 1 or 4
474   rn_hisf_tbl =  30.      ! thickness of the top boundary layer    (Losh et al. 2008)
475   !                       ! 0 => thickness of the tbl = thickness of the first wet cell
476! only for nn_isf = 1
477   nn_isfblk   = 1         ! 1 ISOMIP  like: 2 equations formulation (Hunter et al., 2006)
478   !                       ! 2 ISOMIP+ like: 3 equations formulation (Asay-Davis et al., 2015)
479   nn_gammablk = 1         ! 0 = cst Gammat (= gammat/s)
480   !                       ! 1 = velocity dependend Gamma (u* * gammat/s)  (Jenkins et al. 2010)
481   !                       ! 2 = velocity and stability dependent Gamma    (Holland et al. 1999)
482/
483!-----------------------------------------------------------------------
484&namsbc_iscpl  !   land ice / ocean coupling option                     
485!-----------------------------------------------------------------------
486   nn_drown    = 10        ! number of iteration of the extrapolation loop (fill the new wet cells)
487   ln_hsb      = .false.   ! activate conservation module (conservation exact after a time of rn_fiscpl)
488   nn_fiscpl   = 43800     ! (number of time step) conservation period (maybe should be fix to the coupling frequencey of restart frequency)
489/
490!-----------------------------------------------------------------------
491&namsbc_apr    !   Atmospheric pressure used as ocean forcing or in bulk
492!-----------------------------------------------------------------------
493!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
494!              !           !  (if <0  months)  !   name   !  (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
495   sn_apr      = 'patm'    ,         -1        ,'somslpre',   .true.    , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,      ''
496
497   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the bulk files
498   rn_pref     = 101000.   !  reference atmospheric pressure   [N/m2]/
499   ln_ref_apr  = .false.   !  ref. pressure: global mean Patm (T) or a constant (F)
500   ln_apr_obc  = .false.   !  inverse barometer added to OBC ssh data
501/
502!-----------------------------------------------------------------------
503&namsbc_ssr    !   surface boundary condition : sea surface restoring   (ln_ssr=T)
504!-----------------------------------------------------------------------
505!              ! file name ! frequency (hours) ! variable ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
506!              !           !  (if <0  months)  !   name   !   (logical) !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
507   sn_sst      = 'sst_data',        24         ,  'sst'   ,    .false.  , .false., 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,     ''
508   sn_sss      = 'sss_data',        -1         ,  'sss'   ,    .true.   , .true. , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,     ''
509
510   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
511   nn_sstr     =     0     !  add a retroaction term in the surface heat       flux (=1) or not (=0)
512   nn_sssr     =     2     !  add a damping     term in the surface freshwater flux (=2)
513                           !  or to SSS only (=1) or no damping term (=0)
514   rn_dqdt     =   -40.    !  magnitude of the retroaction on temperature   [W/m2/K]
515   rn_deds     =  -166.67  !  magnitude of the damping on salinity   [mm/day]
516   ln_sssr_bnd =  .true.   !  flag to bound erp term (associated with nn_sssr=2)
517   rn_sssr_bnd =   4.e0    !  ABS(Max/Min) value of the damping erp term [mm/day]
518/
519!-----------------------------------------------------------------------
520&namsbc_alb    !   albedo parameters
521!-----------------------------------------------------------------------
522   nn_ice_alb  =    0      !  parameterization of ice/snow albedo
523                           !     0: Shine & Henderson-Sellers (JGR 1985)
524                           !     1: "home made" based on Brandt et al. (J. Climate 2005)
525                           !                         and Grenfell & Perovich (JGR 2004)
526   rn_albice   =  0.53     !  albedo of bare puddled ice (values from 0.49 to 0.58)
527                           !     0.53 (default) => if nn_ice_alb=0
528                           !     0.50 (default) => if nn_ice_alb=1
529/
530!-----------------------------------------------------------------------
531&namsbc_wave   ! External fields from wave model                        (ln_wave=T)
532!-----------------------------------------------------------------------
533!              ! file name ! frequency (hours) ! variable    ! time interp.!  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
534!              !           !  (if <0  months)  !   name      !  (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
535   sn_cdg      = 'cdg_wave',        1          , 'drag_coeff',   .true.    , .false., 'daily'   ,    ''      , ''       , ''
536   sn_usd      = 'sdw_wave',        1          , 'u_sd2d'    ,   .true.    , .false., 'daily'   ,    ''      , ''       , ''
537   sn_vsd      = 'sdw_wave',        1          , 'v_sd2d'    ,   .true.    , .false., 'daily'   ,    ''      , ''       , ''
538   sn_wn       = 'sdw_wave',        1          , 'wave_num'  ,   .true.    , .false., 'daily'   ,    ''      , ''       , ''
539!
540   cn_dir_cdg  = './'      !  root directory for the location of drag coefficient files
541   ln_cdgw     = .false.   !  Neutral drag coefficient read from wave model
542   ln_sdw      = .false.   !  Computation of 3D stokes drift               
543/
544!-----------------------------------------------------------------------
545&namberg       !   iceberg parameters                                   (default: No iceberg)
546!-----------------------------------------------------------------------
547      ln_icebergs              = .false.              ! iceberg floats or not
548      ln_bergdia               = .true.               ! Calculate budgets
549      nn_verbose_level         = 1                    ! Turn on more verbose output if level > 0
550      nn_verbose_write         = 15                   ! Timesteps between verbose messages
551      nn_sample_rate           = 1                    ! Timesteps between sampling for trajectory storage
552                                                      ! Initial mass required for an iceberg of each class
553      rn_initial_mass          = 8.8e7, 4.1e8, 3.3e9, 1.8e10, 3.8e10, 7.5e10, 1.2e11, 2.2e11, 3.9e11, 7.4e11
554                                                      ! Proportion of calving mass to apportion to each class
555      rn_distribution          = 0.24, 0.12, 0.15, 0.18, 0.12, 0.07, 0.03, 0.03, 0.03, 0.02
556                                                      ! Ratio between effective and real iceberg mass (non-dim)
557                                                      ! i.e. number of icebergs represented at a point
558      rn_mass_scaling          = 2000, 200, 50, 20, 10, 5, 2, 1, 1, 1
559                                                      ! thickness of newly calved bergs (m)
560      rn_initial_thickness     = 40., 67., 133., 175., 250., 250., 250., 250., 250., 250.
561      rn_rho_bergs             = 850.                 ! Density of icebergs
562      rn_LoW_ratio             = 1.5                  ! Initial ratio L/W for newly calved icebergs
563      ln_operator_splitting    = .true.               ! Use first order operator splitting for thermodynamics
564      rn_bits_erosion_fraction = 0.                   ! Fraction of erosion melt flux to divert to bergy bits
565      rn_sicn_shift            = 0.                   ! Shift of sea-ice concn in erosion flux (0<sicn_shift<1)
566      ln_passive_mode          = .false.              ! iceberg - ocean decoupling
567      nn_test_icebergs         =  10                  ! Create test icebergs of this class (-1 = no)
568                                                      ! Put a test iceberg at each gridpoint in box (lon1,lon2,lat1,lat2)
569      rn_test_box              = 108.0,  116.0, -66.0, -58.0
570      rn_speed_limit           = 0.                   ! CFL speed limit for a berg
571
572!            ! file name ! frequency (hours) !   variable   ! time interp.!  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
573!            !           !  (if <0  months)  !     name     !  (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
574      sn_icb =  'calving',       -1          , 'calvingmask',   .true.    , .true.  , 'yearly'  ,    ''    ,    ''    ,     ''
575
576      cn_dir = './'
577/
578
579!!======================================================================
580!!               ***  Lateral boundary condition  ***
581!!======================================================================
582!!   namlbc        lateral momentum boundary condition
583!!   namagrif      agrif nested grid ( read by child model only )       ("key_agrif")
584!!   nam_tide      Tidal forcing
585!!   nambdy        Unstructured open boundaries                         ("key_bdy")
586!!   nambdy_dta    Unstructured open boundaries - external data         ("key_bdy")
587!!   nambdy_tide   tidal forcing at open boundaries                     ("key_bdy_tides")
588!!======================================================================
589!
590!-----------------------------------------------------------------------
591&namlbc        !   lateral momentum boundary condition
592!-----------------------------------------------------------------------
593   !                       !  free slip  !   partial slip  !   no slip   ! strong slip
594   rn_shlat    =    2.     !  shlat = 0  !  0 < shlat < 2  !  shlat = 2  !  2 < shlat
595   ln_vorlat   = .false.   !  consistency of vorticity boundary condition with analytical Eqs.
596/
597!-----------------------------------------------------------------------
598&namagrif      !  AGRIF zoom                                            ("key_agrif")
599!-----------------------------------------------------------------------
600   nn_cln_update =    3    !  baroclinic update frequency
601   ln_spc_dyn    = .true.  !  use 0 as special value for dynamics
602   rn_sponge_tra = 2880.   !  coefficient for tracer   sponge layer [m2/s]
603   rn_sponge_dyn = 2880.   !  coefficient for dynamics sponge layer [m2/s]
604   ln_chk_bathy  = .FALSE. !
605/
606!-----------------------------------------------------------------------
607&nam_tide      !   tide parameters                                      ("key_tide")
608!-----------------------------------------------------------------------
609   ln_tide_pot = .true.    !  use tidal potential forcing
610   ln_tide_ramp= .false.   !
611   rdttideramp =    0.     !
612   clname(1)   = 'DUMMY'   !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg
613/
614!-----------------------------------------------------------------------
615&nambdy        !  unstructured open boundaries                          ("key_bdy")
616!-----------------------------------------------------------------------
617    nb_bdy         = 0                    !  number of open boundary sets
618    ln_coords_file = .true.               !  =T : read bdy coordinates from file
619    cn_coords_file = 'coordinates.bdy.nc' !  bdy coordinates files
620    ln_mask_file   = .false.              !  =T : read mask from file
621    cn_mask_file   = ''                   !  name of mask file (if ln_mask_file=.TRUE.)
622    cn_dyn2d       = 'none'               !
623    nn_dyn2d_dta   =  0                   !  = 0, bdy data are equal to the initial state
624                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
625                                          !  = 2, use tidal harmonic forcing data from files
626                                          !  = 3, use external data AND tidal harmonic forcing
627    cn_dyn3d      =  'none'               !
628    nn_dyn3d_dta  =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state
629                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
630    cn_tra        =  'none'               !
631    nn_tra_dta    =  0                    !  = 0, bdy data are equal to the initial state
632                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
633    cn_ice_lim      =  'none'             !
634    nn_ice_lim_dta  =  0                  !  = 0, bdy data are equal to the initial state
635                                          !  = 1, bdy data are read in 'bdydata   .nc' files
636    rn_ice_tem      = 270.                !  lim3 only: arbitrary temperature of incoming sea ice
637    rn_ice_sal      = 10.                 !  lim3 only:      --   salinity           --
638    rn_ice_age      = 30.                 !  lim3 only:      --   age                --
639
640    ln_tra_dmp    =.false.                !  open boudaries conditions for tracers
641    ln_dyn3d_dmp  =.false.                !  open boundary condition for baroclinic velocities
642    rn_time_dmp   =  1.                   ! Damping time scale in days
643    rn_time_dmp_out =  1.                 ! Outflow damping time scale
644    nn_rimwidth   = 10                    !  width of the relaxation zone
645    ln_vol        = .false.               !  total volume correction (see nn_volctl parameter)
646    nn_volctl     = 1                     !  = 0, the total water flux across open boundaries is zero
647/
648!-----------------------------------------------------------------------
649&nambdy_dta    !  open boundaries - external data                       ("key_bdy")
650!-----------------------------------------------------------------------
651!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
652!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
653   bn_ssh      = 'amm12_bdyT_u2d',         24        , 'sossheig',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
654   bn_u2d      = 'amm12_bdyU_u2d',         24        , 'vobtcrtx',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
655   bn_v2d      = 'amm12_bdyV_u2d',         24        , 'vobtcrty',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
656   bn_u3d      = 'amm12_bdyU_u3d',         24        , 'vozocrtx',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
657   bn_v3d      = 'amm12_bdyV_u3d',         24        , 'vomecrty',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
658   bn_tem      = 'amm12_bdyT_tra',         24        , 'votemper',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
659   bn_sal      = 'amm12_bdyT_tra',         24        , 'vosaline',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
660! for lim3
661!   bn_a_i     = 'amm12_bdyT_ice',         24        , 'ileadfra',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
662!   bn_ht_i    = 'amm12_bdyT_ice',         24        , 'iicethic',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
663!   bn_ht_s    = 'amm12_bdyT_ice',         24        , 'isnowthi',    .true.   , .false. ,  'daily'  ,    ''    ,   ''     ,     ''
664
665   cn_dir      = 'bdydta/' !  root directory for the location of the bulk files
666   ln_full_vel = .false.   
667/
668!-----------------------------------------------------------------------
669&nambdy_tide   !  tidal forcing at open boundaries
670!-----------------------------------------------------------------------
671   filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'   !  file name root of tidal forcing files
672   ln_bdytide_2ddta = .false.                   !
673   ln_bdytide_conj  = .false.                   !
674/
675
676!!======================================================================
677!!                 ***  Bottom boundary condition  ***
678!!======================================================================
679!!   nambfr        bottom friction
680!!   nambbc        bottom temperature boundary condition
681!!   nambbl        bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl")
682!!======================================================================
683!
684!-----------------------------------------------------------------------
685&nambfr        !   bottom friction                                      (default: linear)
686!-----------------------------------------------------------------------
687   nn_bfr      =    1      !  type of bottom friction :   = 0 : free slip,  = 1 : linear friction
688                           !                              = 2 : nonlinear friction
689   rn_bfri1    =    4.e-4  !  bottom drag coefficient (linear case)
690   rn_bfri2    =    1.e-3  !  bottom drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T
691   rn_bfri2_max=    1.e-1  !  max. bottom drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T)
692   rn_bfeb2    =    2.5e-3 !  bottom turbulent kinetic energy background  (m2/s2)
693   rn_bfrz0    =    3.e-3  !  bottom roughness [m] if ln_loglayer=T
694   ln_bfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the bottom friction coef (read a 2D mask file )
695   rn_bfrien   =    50.    !  local multiplying factor of bfr (ln_bfr2d=T)
696   rn_tfri1    =    4.e-4  !  top drag coefficient (linear case)
697   rn_tfri2    =    2.5e-3 !  top drag coefficient (non linear case). Minimum coeft if ln_loglayer=T
698   rn_tfri2_max=    1.e-1  !  max. top drag coefficient (non linear case and ln_loglayer=T)
699   rn_tfeb2    =    0.0    !  top turbulent kinetic energy background  (m2/s2)
700   rn_tfrz0    =    3.e-3  !  top roughness [m] if ln_loglayer=T
701   ln_tfr2d    = .false.   !  horizontal variation of the top friction coef (read a 2D mask file )
702   rn_tfrien   =   50.     !  local multiplying factor of tfr (ln_tfr2d=T)
703
704   ln_bfrimp   = .true.    !  implicit bottom friction (requires ln_zdfexp = .false. if true)
705   ln_loglayer = .false.   !  logarithmic formulation (non linear case)
706/
707!-----------------------------------------------------------------------
708&nambbc        !   bottom temperature boundary condition                (default: NO)
709!-----------------------------------------------------------------------
710!              !  file name      ! frequency (hours) ! variable  ! time interp.!  clim   ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
711!              !                 !  (if <0  months)  !   name    !  (logical)  !  (T/F ) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
712   sn_qgh      ='geothermal_heating.nc',  -12.       , 'heatflow',   .false.   , .true.  , 'yearly'  ,   ''     ,   ''     ,   ''
713   !
714   ln_trabbc   = .false.   !  Apply a geothermal heating at the ocean bottom
715   nn_geoflx   =    2      !  geothermal heat flux: = 0 no flux
716                           !     = 1 constant flux
717                           !     = 2 variable flux (read in geothermal_heating.nc in mW/m2)
718   rn_geoflx_cst = 86.4e-3 !  Constant value of geothermal heat flux [W/m2]
719   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the runoff files
720/
721!-----------------------------------------------------------------------
722&nambbl        !   bottom boundary layer scheme                         ("key_trabbl")
723!-----------------------------------------------------------------------
724   nn_bbl_ldf  =  1        !  diffusive bbl (=1)   or not (=0)
725   nn_bbl_adv  =  0        !  advective bbl (=1/2) or not (=0)
726   rn_ahtbbl   =  1000.    !  lateral mixing coefficient in the bbl  [m2/s]
727   rn_gambbl   =  10.      !  advective bbl coefficient                 [s]
728/
729
730!!======================================================================
731!!                        Tracer (T & S ) namelists
732!!======================================================================
733!!   nameos           equation of state
734!!   namtra_adv       advection scheme
735!!   namtra_adv_mle   mixed layer eddy param. (Fox-Kemper param.)
736!!   namtra_ldf       lateral diffusion scheme
737!!   namtra_ldfeiv    eddy induced velocity param.
738!!   namtra_dmp       T & S newtonian damping
739!!======================================================================
740!
741!-----------------------------------------------------------------------
742&nameos        !   ocean physical parameters
743!-----------------------------------------------------------------------
744   ln_teos10   = .false.         !  = Use TEOS-10 equation of state
745   ln_eos80    = .false.         !  = Use EOS80 equation of state
746   ln_seos     = .false.         !  = Use simplified equation of state (S-EOS)
747                                 !
748   !                     ! S-EOS coefficients (ln_seos=T):
749   !                             !  rd(T,S,Z)*rau0 = -a0*(1+.5*lambda*dT+mu*Z+nu*dS)*dT+b0*dS
750   rn_a0       =  1.6550e-1      !  thermal expension coefficient (nn_eos= 1)
751   rn_b0       =  7.6554e-1      !  saline  expension coefficient (nn_eos= 1)
752   rn_lambda1  =  5.9520e-2      !  cabbeling coeff in T^2  (=0 for linear eos)
753   rn_lambda2  =  7.4914e-4      !  cabbeling coeff in S^2  (=0 for linear eos)
754   rn_mu1      =  1.4970e-4      !  thermobaric coeff. in T (=0 for linear eos)
755   rn_mu2      =  1.1090e-5      !  thermobaric coeff. in S (=0 for linear eos)
756   rn_nu       =  2.4341e-3      !  cabbeling coeff in T*S  (=0 for linear eos)
757/
758!-----------------------------------------------------------------------
759&namtra_adv    !   advection scheme for tracer                          (default: NO advection)
760!-----------------------------------------------------------------------
761   ln_traadv_cen = .false. !  2nd order centered scheme
762      nn_cen_h   =  4            !  =2/4, horizontal 2nd order CEN / 4th order CEN
763      nn_cen_v   =  4            !  =2/4, vertical   2nd order CEN / 4th order COMPACT
764   ln_traadv_fct = .false. !  FCT scheme
765      nn_fct_h   =  2            !  =2/4, horizontal 2nd / 4th order
766      nn_fct_v   =  2            !  =2/4, vertical   2nd / COMPACT 4th order
767      nn_fct_zts =  0            !  >=1,  2nd order FCT scheme with vertical sub-timestepping
768      !                          !        (number of sub-timestep = nn_fct_zts)
769   ln_traadv_mus = .false. !  MUSCL scheme
770      ln_mus_ups = .false.       !  use upstream scheme near river mouths
771   ln_traadv_ubs = .false. !  UBS scheme
772      nn_ubs_v   =  2            !  =2  , vertical 2nd order FCT / COMPACT 4th order
773   ln_traadv_qck = .false. !  QUICKEST scheme
774/
775!-----------------------------------------------------------------------
776&namtra_adv_mle !   mixed layer eddy parametrisation (Fox-Kemper param) (default: NO)
777!-----------------------------------------------------------------------
778   ln_mle      = .false.   ! (T) use the Mixed Layer Eddy (MLE) parameterisation
779   rn_ce       = 0.06      ! magnitude of the MLE (typical value: 0.06 to 0.08)
780   nn_mle      = 1         ! MLE type: =0 standard Fox-Kemper ; =1 new formulation
781   rn_lf       = 5.e+3     ! typical scale of mixed layer front (meters)                      (case rn_mle=0)
782   rn_time     = 172800.   ! time scale for mixing momentum across the mixed layer (seconds)  (case rn_mle=0)
783   rn_lat      = 20.       ! reference latitude (degrees) of MLE coef.                        (case rn_mle=1)
784   nn_mld_uv   = 0         ! space interpolation of MLD at u- & v-pts (0=min,1=averaged,2=max)
785   nn_conv     = 0         ! =1 no MLE in case of convection ; =0 always MLE
786   rn_rho_c_mle= 0.01      ! delta rho criterion used to calculate MLD for FK
787/
788!-----------------------------------------------------------------------
789&namtra_ldf    !   lateral diffusion scheme for tracers                 (default: NO diffusion)
790!-----------------------------------------------------------------------
791   !                       !  Operator type:
792   !                           !  no diffusion: set ln_traldf_lap=..._blp=F
793   ln_traldf_lap   =  .false.  !    laplacian operator
794   ln_traldf_blp   =  .false.  !  bilaplacian operator
795   !
796   !                       !  Direction of action:
797   ln_traldf_lev   =  .false.  !  iso-level
798   ln_traldf_hor   =  .false.  !  horizontal (geopotential)
799   ln_traldf_iso   =  .false.  !  iso-neutral (standard operator)
800   ln_traldf_triad =  .false.  !  iso-neutral (triad    operator)
801   !
802   !                       !  iso-neutral options:       
803   ln_traldf_msc   =  .false.  !  Method of Stabilizing Correction (both operators)
804   rn_slpmax       =   0.01    !  slope limit                      (both operators)
805   ln_triad_iso    =  .false.  !  pure horizontal mixing in ML              (triad only)
806   rn_sw_triad     =  1        !  =1 switching triad ; =0 all 4 triads used (triad only)
807   ln_botmix_triad =  .false.  !  lateral mixing on bottom                  (triad only)
808   !
809   !                       !  Coefficients:
810   nn_aht_ijk_t    = 0         !  space/time variation of eddy coef
811   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_diffusivity_2D.nc (..._3D.nc) file
812   !                                !   =  0           constant
813   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d
814   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d
815   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation
816   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d * ldf_c1d
817   !                                !   = 31 F(i,j,k,t)=F(local velocity and grid-spacing)
818   rn_aht_0        = 2000.     !  lateral eddy diffusivity   (lap. operator) [m2/s]
819   rn_bht_0        = 1.e+12    !  lateral eddy diffusivity (bilap. operator) [m4/s]
820/
821!-----------------------------------------------------------------------
822&namtra_ldfeiv !   eddy induced velocity param.                         (default: NO)
823!-----------------------------------------------------------------------
824   ln_ldfeiv     =.false.  ! use eddy induced velocity parameterization
825   ln_ldfeiv_dia =.false.  ! diagnose eiv stream function and velocities
826   rn_aeiv_0     = 2000.   ! eddy induced velocity coefficient   [m2/s]
827   nn_aei_ijk_t  = 21      ! space/time variation of the eiv coeficient
828   !                                !   =-20 (=-30)    read in eddy_induced_velocity_2D.nc (..._3D.nc) file
829   !                                !   =  0           constant
830   !                                !   = 10 F(k)      =ldf_c1d
831   !                                !   = 20 F(i,j)    =ldf_c2d
832   !                                !   = 21 F(i,j,t)  =Treguier et al. JPO 1997 formulation
833   !                                !   = 30 F(i,j,k)  =ldf_c2d + ldf_c1d
834/
835!-----------------------------------------------------------------------
836&namtra_dmp    !   tracer: T & S newtonian damping                      (default: NO)
837!-----------------------------------------------------------------------
838   ln_tradmp   =  .true.   !  add a damping termn (T) or not (F)
839   nn_zdmp     =    0      !  vertical   shape =0    damping throughout the water column
840                           !                   =1 no damping in the mixing layer (kz  criteria)
841                           !                   =2 no damping in the mixed  layer (rho crieria)
842   cn_resto    ='resto.nc' !  Name of file containing restoration coeff. field (use dmp_tools to create this)
843/
844
845!!======================================================================
846!!                      ***  Dynamics namelists  ***
847!!======================================================================
848!!   namdyn_adv    formulation of the momentum advection
849!!   namdyn_vor    advection scheme
850!!   namdyn_hpg    hydrostatic pressure gradient
851!!   namdyn_spg    surface pressure gradient
852!!   namdyn_ldf    lateral diffusion scheme
853!!======================================================================
854!
855!-----------------------------------------------------------------------
856&namdyn_adv    !   formulation of the momentum advection                (default: vector form)
857!-----------------------------------------------------------------------
858   ln_dynadv_vec = .true.  !  vector form (T) or flux form (F)
859   nn_dynkeg     = 0       ! scheme for grad(KE): =0   C2  ;  =1   Hollingsworth correction
860   ln_dynadv_cen2= .false. !  flux form - 2nd order centered scheme
861   ln_dynadv_ubs = .false. !  flux form - 3rd order UBS      scheme
862   ln_dynzad_zts = .false. !  Use (T) sub timestepping for vertical momentum advection
863/
864!-----------------------------------------------------------------------
865&nam_vvl    !   vertical coordinate options                             (default: zstar)
866!-----------------------------------------------------------------------
867   ln_vvl_zstar  = .true.           !  zstar vertical coordinate
868   ln_vvl_ztilde = .false.          !  ztilde vertical coordinate: only high frequency variations
869   ln_vvl_layer  = .false.          !  full layer vertical coordinate
870   ln_vvl_ztilde_as_zstar = .false. !  ztilde vertical coordinate emulating zstar
871   ln_vvl_zstar_at_eqtor  = .false. !  ztilde near the equator
872   rn_ahe3       = 0.0e0            !  thickness diffusion coefficient
873   rn_rst_e3t    = 30.e0            !  ztilde to zstar restoration timescale [days]
874   rn_lf_cutoff  = 5.0e0            !  cutoff frequency for low-pass filter  [days]
875   rn_zdef_max   = 0.9e0            !  maximum fractional e3t deformation
876   ln_vvl_dbg    = .true.           !  debug prints    (T/F)
877/
878!-----------------------------------------------------------------------
879&namdyn_vor    !   Vorticity / Coriolis scheme                          (default: NO)
880!-----------------------------------------------------------------------
881   ln_dynvor_ene = .false. !  enstrophy conserving scheme
882   ln_dynvor_ens = .false. !  energy conserving scheme
883   ln_dynvor_mix = .false. !  mixed scheme
884   ln_dynvor_een = .false. !  energy & enstrophy scheme
885      nn_een_e3f = 1          ! e3f = masked averaging of e3t divided by 4 (=0) or by the sum of mask (=1)
886   ln_dynvor_msk = .false. !  vorticity multiplied by fmask (=T) or not (=F) (all vorticity schemes)  ! PLEASE DO NOT ACTIVATE
887/
888!-----------------------------------------------------------------------
889&namdyn_hpg    !   Hydrostatic pressure gradient option                 (default: zps)
890!-----------------------------------------------------------------------
891   ln_hpg_zco  = .false.   !  z-coordinate - full steps
892   ln_hpg_zps  = .true.    !  z-coordinate - partial steps (interpolation)
893   ln_hpg_sco  = .false.   !  s-coordinate (standard jacobian formulation)
894   ln_hpg_isf  = .false.   !  s-coordinate (sco ) adapted to isf
895   ln_hpg_djc  = .false.   !  s-coordinate (Density Jacobian with Cubic polynomial)
896   ln_hpg_prj  = .false.   !  s-coordinate (Pressure Jacobian scheme)
897/
898!-----------------------------------------------------------------------
899&namdyn_spg    !   surface pressure gradient                            (default: NO)
900!-----------------------------------------------------------------------
901   ln_dynspg_exp  = .false.   ! explicit free surface
902   ln_dynspg_ts   = .false.   ! split-explicit free surface
903      ln_bt_fw      = .true.     ! Forward integration of barotropic Eqs.
904      ln_bt_av      = .true.     ! Time filtering of barotropic variables
905         nn_bt_flt     = 1          ! Time filter choice  = 0 None
906         !                          !                     = 1 Boxcar over   nn_baro sub-steps
907         !                          !                     = 2 Boxcar over 2*nn_baro  "    "
908      ln_bt_auto    = .true.     ! Number of sub-step defined from:
909         rn_bt_cmax   =  0.8        ! =T : the Maximum Courant Number allowed
910         nn_baro      = 30          ! =F : the number of sub-step in rn_rdt seconds
911/
912!-----------------------------------------------------------------------
913&namdyn_ldf    !   lateral diffusion on momentum                        (default: NO)
914!-----------------------------------------------------------------------
915   !                       !  Type of the operator :
916   !                           !  no diffusion: set ln_dynldf_lap=..._blp=F
917   ln_dynldf_lap =  .false.    !    laplacian operator
918   ln_dynldf_blp =  .false.    !  bilaplacian operator
919   !                       !  Direction of action  :
920   ln_dynldf_lev =  .false.    !  iso-level
921   ln_dynldf_hor =  .false.    !  horizontal (geopotential)
922   ln_dynldf_iso =  .false.    !  iso-neutral
923   !                       !  Coefficient
924   nn_ahm_ijk_t  = 0           !  space/time variation of eddy coef
925   !                                !  =-30  read in eddy_viscosity_3D.nc file
926   !                                !  =-20  read in eddy_viscosity_2D.nc file
927   !                                !  =  0  constant
928   !                                !  = 10  F(k)=c1d
929   !                                !  = 20  F(i,j)=F(grid spacing)=c2d
930   !                                !  = 30  F(i,j,k)=c2d*c1d
931   !                                !  = 31  F(i,j,k)=F(grid spacing and local velocity)
932   rn_ahm_0      =  40000.     !  horizontal laplacian eddy viscosity   [m2/s]
933   rn_ahm_b      =      0.     !  background eddy viscosity for ldf_iso [m2/s]
934   rn_bhm_0      = 1.e+12      !  horizontal bilaplacian eddy viscosity [m4/s]
935   !
936   ! Caution in 20 and 30 cases the coefficient have to be given for a 1 degree grid (~111km)
937/
938
939!!======================================================================
940!!             Tracers & Dynamics vertical physics namelists
941!!======================================================================
942!!    namzdf        vertical physics
943!!    namzdf_ric    richardson number dependent vertical mixing         ("key_zdfric")
944!!    namzdf_tke    TKE dependent vertical mixing                       ("key_zdftke")
945!!    namzdf_gls    GLS vertical mixing                                 ("key_zdfgls")
946!!    namzdf_ddm    double diffusive mixing parameterization            ("key_zdfddm")
947!!    namzdf_tmx    tidal mixing parameterization                       ("key_zdftmx")
948!!======================================================================
949!
950!-----------------------------------------------------------------------
951&namzdf        !   vertical physics
952!-----------------------------------------------------------------------
953   rn_avm0     =   1.2e-4  !  vertical eddy viscosity   [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst")
954   rn_avt0     =   1.2e-5  !  vertical eddy diffusivity [m2/s]          (background Kz if not "key_zdfcst")
955   nn_avb      =    0      !  profile for background avt & avm (=1) or not (=0)
956   nn_havtb    =    0      !  horizontal shape for avtb (=1) or not (=0)
957   ln_zdfevd   = .true.    !  enhanced vertical diffusion (evd) (T) or not (F)
958      nn_evdm     =    0        ! evd apply on tracer (=0) or on tracer and momentum (=1)
959      rn_avevd    =  100.       !  evd mixing coefficient [m2/s]
960   ln_zdfnpc   = .false.   !  Non-Penetrative Convective algorithm (T) or not (F)
961      nn_npc      =    1        ! frequency of application of npc
962      nn_npcp     =  365        ! npc control print frequency
963   ln_zdfexp   = .false.   !  time-stepping: split-explicit (T) or implicit (F) time stepping
964      nn_zdfexp   =    3        ! number of sub-timestep for ln_zdfexp=T
965/
966!-----------------------------------------------------------------------
967&namzdf_ric    !   richardson number dependent vertical diffusion       ("key_zdfric" )
968!-----------------------------------------------------------------------
969   rn_avmri    =  100.e-4  !  maximum value of the vertical viscosity
970   rn_alp      =    5.     !  coefficient of the parameterization
971   nn_ric      =    2      !  coefficient of the parameterization
972   rn_ekmfc    =    0.7    !  Factor in the Ekman depth Equation
973   rn_mldmin   =    1.0    !  minimum allowable mixed-layer depth estimate (m)
974   rn_mldmax   = 1000.0    !  maximum allowable mixed-layer depth estimate (m)
975   rn_wtmix    =   10.0    !  vertical eddy viscosity coeff [m2/s] in the mixed-layer
976   rn_wvmix    =   10.0    !  vertical eddy diffusion coeff [m2/s] in the mixed-layer
977   ln_mldw     =  .true.   !  Flag to use or not the mixed layer depth param.
978/
979!-----------------------------------------------------------------------
980&namzdf_tke    !   turbulent eddy kinetic dependent vertical diffusion  ("key_zdftke")
981!-----------------------------------------------------------------------
982   rn_ediff    =   0.1     !  coef. for vertical eddy coef. (avt=rn_ediff*mxl*sqrt(e) )
983   rn_ediss    =   0.7     !  coef. of the Kolmogoroff dissipation
984   rn_ebb      =  67.83    !  coef. of the surface input of tke (=67.83 suggested when ln_mxl0=T)
985   rn_emin     =   1.e-6   !  minimum value of tke [m2/s2]
986   rn_emin0    =   1.e-4   !  surface minimum value of tke [m2/s2]
987   rn_bshear   =   1.e-20  ! background shear (>0) currently a numerical threshold (do not change it)
988   nn_mxl      =   2       !  mixing length: = 0 bounded by the distance to surface and bottom
989                           !                 = 1 bounded by the local vertical scale factor
990                           !                 = 2 first vertical derivative of mixing length bounded by 1
991                           !                 = 3 as =2 with distinct disspipative an mixing length scale
992   nn_pdl      =   1       !  Prandtl number function of richarson number (=1, avt=pdl(Ri)*avm) or not (=0, avt=avm)
993   ln_mxl0     = .true.    !  surface mixing length scale = F(wind stress) (T) or not (F)
994   rn_mxl0     =   0.04    !  surface  buoyancy lenght scale minimum value
995   ln_lc       = .true.    !  Langmuir cell parameterisation (Axell 2002)
996   rn_lc       =   0.15    !  coef. associated to Langmuir cells
997   nn_etau     =   1       !  penetration of tke below the mixed layer (ML) due to near intertial waves
998                           !        = 0 no penetration
999                           !        = 1 add a tke source below the ML
1000                           !        = 2 add a tke source just at the base of the ML
1001                           !        = 3 as = 1 applied on HF part of the stress           (ln_cpl=T)
1002   rn_efr      =   0.05    !  fraction of surface tke value which penetrates below the ML (nn_etau=1 or 2)
1003   nn_htau     =   1       !  type of exponential decrease of tke penetration below the ML
1004                           !        = 0  constant 10 m length scale
1005                           !        = 1  0.5m at the equator to 30m poleward of 40 degrees
1006/
1007!-----------------------------------------------------------------------
1008&namzdf_gls    !   GLS vertical diffusion                               ("key_zdfgls")
1009!-----------------------------------------------------------------------
1010   rn_emin       = 1.e-7   !  minimum value of e   [m2/s2]
1011   rn_epsmin     = 1.e-12  !  minimum value of eps [m2/s3]
1012   ln_length_lim = .true.  !  limit on the dissipation rate under stable stratification (Galperin et al., 1988)
1013   rn_clim_galp  = 0.267   !  galperin limit
1014   ln_sigpsi     = .true.  !  Activate or not Burchard 2001 mods on psi schmidt number in the wb case
1015   rn_crban      = 100.    !  Craig and Banner 1994 constant for wb tke flux
1016   rn_charn      = 70000.  !  Charnock constant for wb induced roughness length
1017   rn_hsro       =  0.02   !  Minimum surface roughness
1018   rn_frac_hs    =   1.3   !  Fraction of wave height as roughness (if nn_z0_met=2)
1019   nn_z0_met     =     2   !  Method for surface roughness computation (0/1/2)
1020   nn_bc_surf    =     1   !  surface condition (0/1=Dir/Neum)
1021   nn_bc_bot     =     1   !  bottom condition (0/1=Dir/Neum)
1022   nn_stab_func  =     2   !  stability function (0=Galp, 1= KC94, 2=CanutoA, 3=CanutoB)
1023   nn_clos       =     1   !  predefined closure type (0=MY82, 1=k-eps, 2=k-w, 3=Gen)
1024/
1025!-----------------------------------------------------------------------
1026&namzdf_ddm    !   double diffusive mixing parameterization             ("key_zdfddm")
1027!-----------------------------------------------------------------------
1028   rn_avts     = 1.e-4     !  maximum avs (vertical mixing on salinity)
1029   rn_hsbfr    = 1.6       !  heat/salt buoyancy flux ratio
1030/
1031!-----------------------------------------------------------------------
1032&namzdf_tmx    !   tidal mixing parameterization                        ("key_zdftmx")
1033!-----------------------------------------------------------------------
1034   rn_htmx     = 500.      !  vertical decay scale for turbulence (meters)
1035   rn_n2min    = 1.e-8     !  threshold of the Brunt-Vaisala frequency (s-1)
1036   rn_tfe      = 0.333     !  tidal dissipation efficiency
1037   rn_me       = 0.2       !  mixing efficiency
1038   ln_tmx_itf  = .true.    !  ITF specific parameterisation
1039   rn_tfe_itf  = 1.        !  ITF tidal dissipation efficiency
1040/
1041!-----------------------------------------------------------------------
1042&namzdf_tmx_new !   internal wave-driven mixing parameterization        ("key_zdftmx_new" & "key_zdfddm")
1043!-----------------------------------------------------------------------
1044   nn_zpyc     = 1         !  pycnocline-intensified dissipation scales as N (=1) or N^2 (=2)
1045   ln_mevar    = .true.    !  variable (T) or constant (F) mixing efficiency
1046   ln_tsdiff   = .true.    !  account for differential T/S mixing (T) or not (F)
1047/
1048
1049
1050!!======================================================================
1051!!                  ***  Miscellaneous namelists  ***
1052!!======================================================================
1053!!   nammpp            Massively Parallel Processing                    ("key_mpp_mpi)
1054!!   namctl            Control prints & Benchmark
1055!!   namsto            Stochastic parametrization of EOS
1056!!======================================================================
1057!
1058!-----------------------------------------------------------------------
1059&nammpp        !   Massively Parallel Processing                        ("key_mpp_mpi)
1060!-----------------------------------------------------------------------
1061   cn_mpi_send =  'I'      !  mpi send/recieve type   ='S', 'B', or 'I' for standard send,
1062                           !  buffer blocking send or immediate non-blocking sends, resp.
1063   nn_buffer   =   0       !  size in bytes of exported buffer ('B' case), 0 no exportation
1064   ln_nnogather=  .false.  !  activate code to avoid mpi_allgather use at the northfold
1065   jpni        =   0       !  jpni   number of processors following i (set automatically if < 1)
1066   jpnj        =   0       !  jpnj   number of processors following j (set automatically if < 1)
1067   jpnij       =   0       !  jpnij  number of local domains (set automatically if < 1)
1068/
1069!-----------------------------------------------------------------------
1070&namctl        !   Control prints & Benchmark
1071!-----------------------------------------------------------------------
1072   ln_ctl      = .false.   !  trends control print (expensive!)
1073   nn_print    =    0      !  level of print (0 no extra print)
1074   nn_ictls    =    0      !  start i indice of control sum (use to compare mono versus
1075   nn_ictle    =    0      !  end   i indice of control sum        multi processor runs
1076   nn_jctls    =    0      !  start j indice of control               over a subdomain)
1077   nn_jctle    =    0      !  end   j indice of control
1078   nn_isplt    =    1      !  number of processors in i-direction
1079   nn_jsplt    =    1      !  number of processors in j-direction
1080   nn_bench    =    0      !  Bench mode (1/0): CAUTION use zero except for bench
1081                           !     (no physical validity of the results)
1082   nn_timing   =    0      !  timing by routine activated (=1) creates timing.output file, or not (=0)
1083   nn_diacfl   =    0      !  Write out CFL diagnostics (=1) in cfl_diagnostics.ascii, or not (=0)
1084/
1085!-----------------------------------------------------------------------
1086&namsto        ! Stochastic parametrization of EOS                      (default: NO)
1087!-----------------------------------------------------------------------
1088   ln_sto_eos  = .false.   ! stochastic equation of state
1089   nn_sto_eos  = 1         ! number of independent random walks
1090   rn_eos_stdxy= 1.4       ! random walk horz. standard deviation (in grid points)
1091   rn_eos_stdz = 0.7       ! random walk vert. standard deviation (in grid points)
1092   rn_eos_tcor = 1440.     ! random walk time correlation (in timesteps)
1093   nn_eos_ord  = 1         ! order of autoregressive processes
1094   nn_eos_flt  = 0         ! passes of Laplacian filter
1095   rn_eos_lim  = 2.0       ! limitation factor (default = 3.0)
1096   ln_rststo   = .false.   ! start from mean parameter (F) or from restart file (T)
1097   ln_rstseed  = .true.    ! read seed of RNG from restart file
1098   cn_storst_in  = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (input)
1099   cn_storst_out = "restart_sto" !  suffix of stochastic parameter restart file (output)
1100/
1101
1102!!======================================================================
1103!!                  ***  Diagnostics namelists  ***
1104!!======================================================================
1105!!   namtrd       dynamics and/or tracer trends                         (default F)
1106!!   namptr       Poleward Transport Diagnostics                        (default F)
1107!!   namhsb       Heat and salt budgets                                 (default F)
1108!!   namdiu       Cool skin and warm layer models                       (default F)
1109!!   namflo       float parameters                                      ("key_float")
1110!!   nam_diaharm  Harmonic analysis of tidal constituents               ("key_diaharm")
1111!!   namdct       transports through some sections                      ("key_diadct")
1112!!   nam_diatmb   Top Middle Bottom Output                              (default F)
1113!!   nam_dia25h   25h Mean Output                                       (default F)
1114!!   namnc4       netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4")
1115!!======================================================================
1116!
1117!-----------------------------------------------------------------------
1118&namtrd        !   trend diagnostics                                    (default F)
1119!-----------------------------------------------------------------------
1120   ln_glo_trd  = .false.   ! (T) global domain averaged diag for T, T^2, KE, and PE
1121   ln_dyn_trd  = .false.   ! (T) 3D momentum trend output
1122   ln_dyn_mxl  = .false.   ! (T) 2D momentum trends averaged over the mixed layer (not coded yet)
1123   ln_vor_trd  = .false.   ! (T) 2D barotropic vorticity trends (not coded yet)
1124   ln_KE_trd   = .false.   ! (T) 3D Kinetic   Energy     trends
1125   ln_PE_trd   = .false.   ! (T) 3D Potential Energy     trends
1126   ln_tra_trd  = .false.   ! (T) 3D tracer trend output
1127   ln_tra_mxl  = .false.   ! (T) 2D tracer trends averaged over the mixed layer (not coded yet)
1128   nn_trd      = 365       !  print frequency (ln_glo_trd=T) (unit=time step)
1129/
1130!!gm   nn_ctls     =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk)
1131!!gm   rn_ucf      =   1.      !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day)
1132!!gm   cn_trdrst_in      = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (input)
1133!!gm   cn_trdrst_out     = "restart_mld"   ! suffix of ocean restart name (output)
1134!!gm   ln_trdmld_restart = .false.         !  restart for ML diagnostics
1135!!gm   ln_trdmld_instant = .false.         !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S
1136!!gm
1137!-----------------------------------------------------------------------
1138&namptr        !   Poleward Transport Diagnostic                         (default F)
1139!-----------------------------------------------------------------------
1140   ln_diaptr   = .false.   !  Poleward heat and salt transport (T) or not (F)
1141   ln_subbas   = .false.   !  Atlantic/Pacific/Indian basins computation (T) or not
1142/
1143!-----------------------------------------------------------------------
1144&namhsb        !  Heat and salt budgets                                  (default F)
1145!-----------------------------------------------------------------------
1146   ln_diahsb   = .false.   !  check the heat and salt budgets (T) or not (F)
1147/
1148!-----------------------------------------------------------------------
1149&namdiu        !   Cool skin and warm layer models                       (default F)
1150!-----------------------------------------------------------------------
1151   ln_diurnal      = .false.   !
1152   ln_diurnal_only = .false.   !
1153/
1154!-----------------------------------------------------------------------
1155&namflo        !   float parameters                                      ("key_float")
1156!-----------------------------------------------------------------------
1157   jpnfl       = 1         !  total number of floats during the run
1158   jpnnewflo   = 0         !  number of floats for the restart
1159   ln_rstflo   = .false.   !  float restart (T) or not (F)
1160   nn_writefl  =      75   !  frequency of writing in float output file
1161   nn_stockfl  =    5475   !  frequency of creation of the float restart file
1162   ln_argo     = .false.   !  Argo type floats (stay at the surface each 10 days)
1163   ln_flork4   = .false.   !  trajectories computed with a 4th order Runge-Kutta (T)
1164   !                       !  or computed with Blanke' scheme (F)
1165   ln_ariane   = .true.    !  Input with Ariane tool convention(T)
1166   ln_flo_ascii= .true.    !  Output with Ariane tool netcdf convention(F) or ascii file (T)
1167/
1168!-----------------------------------------------------------------------
1169&nam_diaharm   !   Harmonic analysis of tidal constituents               ("key_diaharm")
1170!-----------------------------------------------------------------------
1171    nit000_han = 1         ! First time step used for harmonic analysis
1172    nitend_han = 75        ! Last time step used for harmonic analysis
1173    nstep_han  = 15        ! Time step frequency for harmonic analysis
1174    tname(1)   = 'M2'      ! Name of tidal constituents
1175    tname(2)   = 'K1'
1176/
1177!-----------------------------------------------------------------------
1178&namdct        ! transports through some sections                        ("key_diadct")
1179!-----------------------------------------------------------------------
1180    nn_dct     = 15        !  time step frequency for transports computing
1181    nn_dctwri  = 15        !  time step frequency for transports writing
1182    nn_secdebug= 112       !      0 : no section to debug
1183    !                      !     -1 : debug all section
1184    !                      !  0 < n : debug section number n
1185/
1186!-----------------------------------------------------------------------
1187&nam_diatmb    !  Top Middle Bottom Output                               (default F)
1188!-----------------------------------------------------------------------
1189   ln_diatmb   = .false.   !  Choose Top Middle and Bottom output or not
1190/
1191!-----------------------------------------------------------------------
1192&nam_dia25h    !  25h Mean Output                                        (default F)
1193!-----------------------------------------------------------------------
1194   ln_dia25h   = .false.   ! Choose 25h mean output or not
1195/
1196!-----------------------------------------------------------------------
1197&namnc4        !   netcdf4 chunking and compression settings             ("key_netcdf4")
1198!-----------------------------------------------------------------------
1199   nn_nchunks_i=   4       !  number of chunks in i-dimension
1200   nn_nchunks_j=   4       !  number of chunks in j-dimension
1201   nn_nchunks_k=   31      !  number of chunks in k-dimension
1202   !                       !  setting nn_nchunks_k = jpk will give a chunk size of 1 in the vertical which
1203   !                       !  is optimal for postprocessing which works exclusively with horizontal slabs
1204   ln_nc4zip   = .true.    !  (T) use netcdf4 chunking and compression
1205   !                       !  (F) ignore chunking information and produce netcdf3-compatible files
1206/
1207
1208!!======================================================================
1209!!               ***  Observation & Assimilation  ***
1210!!======================================================================
1211!!   namobs       observation and model comparison
1212!!   nam_asminc   assimilation increments                               ('key_asminc')
1213!!======================================================================
1214!
1215!-----------------------------------------------------------------------
1216&namobs        !  observation usage switch
1217!-----------------------------------------------------------------------
1218   ln_diaobs   = .false.             ! Logical switch for the observation operator
1219   ln_t3d      = .false.             ! Logical switch for T profile observations
1220   ln_s3d      = .false.             ! Logical switch for S profile observations
1221   ln_sla      = .false.             ! Logical switch for SLA observations
1222   ln_sst      = .false.             ! Logical switch for SST observations
1223   ln_sic      = .false.             ! Logical switch for Sea Ice observations
1224   ln_vel3d    = .false.             ! Logical switch for velocity observations
1225   ln_altbias  = .false.             ! Logical switch for altimeter bias correction
1226   ln_nea      = .false.             ! Logical switch for rejection of observations near land
1227   ln_grid_global = .true.           ! Logical switch for global distribution of observations
1228   ln_grid_search_lookup = .false.   ! Logical switch for obs grid search w/lookup table
1229   ln_ignmis   = .true.              ! Logical switch for ignoring missing files
1230   ln_s_at_t   = .false.             ! Logical switch for computing model S at T obs if not there
1231   ln_sstnight = .false.             ! Logical switch for calculating night-time average for SST obs
1232! All of the *files* variables below are arrays. Use namelist_cfg to add more files
1233   cn_profbfiles = 'profiles_01.nc'  ! Profile feedback input observation file names
1234   cn_slafbfiles = 'sla_01.nc'       ! SLA feedback input observation file names
1235   cn_sstfbfiles = 'sst_01.nc'       ! SST feedback input observation file names
1236   cn_sicfbfiles = 'sic_01.nc'       ! SIC feedback input observation file names
1237   cn_velfbfiles = 'vel_01.nc'       ! Velocity feedback input observation file names
1238   cn_altbiasfile = 'altbias.nc'     ! Altimeter bias input file name
1239   cn_gridsearchfile='gridsearch.nc' ! Grid search file name
1240   rn_gridsearchres = 0.5            ! Grid search resolution
1241   rn_dobsini  = 00010101.000000     ! Initial date in window YYYYMMDD.HHMMSS
1242   rn_dobsend  = 00010102.000000     ! Final date in window YYYYMMDD.HHMMSS
1243   nn_1dint    = 0                   ! Type of vertical interpolation method
1244   nn_2dint    = 0                   ! Type of horizontal interpolation method
1245   nn_msshc    = 0                   ! MSSH correction scheme
1246   rn_mdtcorr  = 1.61                ! MDT  correction
1247   rn_mdtcutoff = 65.0               ! MDT cutoff for computed correction
1248   nn_profdavtypes = -1              ! Profile daily average types - array
1249   ln_sstbias  = .false.             !
1250   cn_sstbias_files = 'sstbias.nc'   !
1251/
1252!-----------------------------------------------------------------------
1253&nam_asminc    !   assimilation increments                              ('key_asminc')
1254!-----------------------------------------------------------------------
1255    ln_bkgwri  = .false.   !  Logical switch for writing out background state
1256    ln_trainc  = .false.   !  Logical switch for applying tracer increments
1257    ln_dyninc  = .false.   !  Logical switch for applying velocity increments
1258    ln_sshinc  = .false.   !  Logical switch for applying SSH increments
1259    ln_asmdin  = .false.   !  Logical switch for Direct Initialization (DI)
1260    ln_asmiau  = .false.   !  Logical switch for Incremental Analysis Updating (IAU)
1261    nitbkg     = 0         !  Timestep of background in [0,nitend-nit000-1]
1262    nitdin     = 0         !  Timestep of background for DI in [0,nitend-nit000-1]
1263    nitiaustr  = 1         !  Timestep of start of IAU interval in [0,nitend-nit000-1]
1264    nitiaufin  = 15        !  Timestep of end of IAU interval in [0,nitend-nit000-1]
1265    niaufn     = 0         !  Type of IAU weighting function
1266    ln_salfix  = .false.   !  Logical switch for ensuring that the sa > salfixmin
1267    salfixmin  = -9999     !  Minimum salinity after applying the increments
1268    nn_divdmp  = 0         !  Number of iterations of divergence damping operator
1269/
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.