New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
bio_medusa_fin.F90 in branches/NERC/dev_r5518_GO6_Carb_Debug/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA – NEMO

source: branches/NERC/dev_r5518_GO6_Carb_Debug/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/MEDUSA/bio_medusa_fin.F90 @ 8649

Last change on this file since 8649 was 8649, checked in by jpalmier, 6 years ago

JPALM -- 20-10-17 -- ctl_warn text fix

File size: 35.2 KB
Line 
1MODULE bio_medusa_fin_mod
2   !!======================================================================
3   !!                         ***  MODULE bio_medusa_fin_mod  ***
4   !! Finalisation for TRC_BIO_MEDUSA
5   !!======================================================================
6   !! History :
7   !!   -   ! 2017-04 (M. Stringer)        Code taken from trcbio_medusa.F90
8   !!   -   ! 2017-08 (A. Yool)            Amend bethic reservoir updating
9   !!----------------------------------------------------------------------
10#if defined key_medusa
11   !!----------------------------------------------------------------------
12   !!                                                   MEDUSA bio-model
13   !!----------------------------------------------------------------------
14
15   IMPLICIT NONE
16   PRIVATE
17     
18   PUBLIC   bio_medusa_fin     ! Called in trcbio_medusa.F90
19
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   !! NEMO/TOP 2.0 , LOCEAN-IPSL (2007)
22   !! $Id$
23   !! Software governed by the CeCILL licence (modipsl/doc/NEMO_CeCILL.txt)
24   !!----------------------------------------------------------------------
25
26CONTAINS
27
28   SUBROUTINE bio_medusa_fin( kt )
29      !!---------------------------------------------------------------------
30      !!                     ***  ROUTINE bio_medusa_fin  ***
31      !! This called from TRC_BIO_MEDUSA and
32      !!  - ...
33      !!----------------------------------------------------------------------
34      USE bio_medusa_mod
35      USE dom_oce,           ONLY: atfp, atfp1, neuler, rdt,            &
36                                   e3t_0, e3t_n, tmask
37      USE in_out_manager,    ONLY: lwp, numout
38# if defined key_iomput
39      USE iom,               ONLY: iom_put, lk_iomput
40# endif
41      USE lbclnk,            ONLY: lbc_lnk
42      USE par_medusa,        ONLY: jp_medusa_2d, jp_medusa_3d,          &
43                                   jp_medusa_trd
44      USE par_oce,           ONLY: jpi, jpim1, jpj, jpjm1, jpk
45      USE phycst,            ONLY: rsmall
46      USE sms_medusa,        ONLY: jinorgben, jorgben,                  &
47                                   f3_co3, f3_h2co3, f3_hco3,           &
48                                   f3_omarg, f3_omcal, f3_pH,           &
49                                   za_sed_c, za_sed_ca, za_sed_fe,      &
50                                   za_sed_n, za_sed_si,                 &
51                                   zb_sed_c, zb_sed_ca, zb_sed_fe,      &
52                                   zb_sed_n, zb_sed_si,                 &
53                                   zn_sed_c, zn_sed_ca, zn_sed_fe,      &
54                                   zn_sed_n, zn_sed_si
55      USE trc,               ONLY: med_diag, nittrc000 
56      USE trcnam_trp,        ONLY: ln_trcadv_cen2, ln_trcadv_tvd
57 
58   !!* Substitution
59#  include "domzgr_substitute.h90"
60
61      !! time (integer timestep)
62      INTEGER, INTENT( in ) ::    kt
63
64      INTEGER :: ji, jj
65      INTEGER :: jn
66
67      REAL(wp) :: fq0,fq1,fq2,fq3,fq4
68
69# if defined key_roam                     
70      !!----------------------------------------------------------------------
71      !! AXY (09/08/17): fix benthic submodel
72      !!----------------------------------------------------------------------
73      !! Process benthic in/out fluxes
74      !! These can be handled outside of the 3D calculations since the
75      !! benthic pools (and fluxes) are 2D in nature; this code was
76      !! developed with help from George Nurser (NOC); it cannot be run
77      !! in a configuration with variable time-stepping with depth
78      !!----------------------------------------------------------------------
79      !!
80      !! time-step calculation
81      if (jorgben.eq.1) then
82         za_sed_n(:,:)  = zb_sed_n(:,:)  + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
83                          ( f_sbenin_n(:,:)  + f_fbenin_n(:,:)  - f_benout_n(:,:)  ))
84         za_sed_fe(:,:) = zb_sed_fe(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
85                          ( f_sbenin_fe(:,:) + f_fbenin_fe(:,:) - f_benout_fe(:,:) ))
86         za_sed_c(:,:)  = zb_sed_c(:,:)  + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
87                          ( f_sbenin_c(:,:)  + f_fbenin_c(:,:)  - f_benout_c(:,:)  ))
88      endif
89      if (jinorgben.eq.1) then
90         za_sed_si(:,:) = zb_sed_si(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
91                          ( f_fbenin_si(:,:) - f_benout_si(:,:) ))
92         za_sed_ca(:,:) = zb_sed_ca(:,:) + ((2. * (rdt / 86400.)) * &
93                          ( f_fbenin_ca(:,:) - f_benout_ca(:,:) ))
94      endif
95      !!
96      !! time-level calculation
97      if (jorgben.eq.1) then
98         zb_sed_n(:,:)  = zn_sed_n(:,:)  + (atfp * &
99                          ( za_sed_n(:,:)  - (2. * zn_sed_n(:,:))  + zb_sed_n(:,:)  ))
100         zn_sed_n(:,:)  = za_sed_n(:,:)
101         zb_sed_fe(:,:) = zn_sed_fe(:,:) + (atfp * &
102                          ( za_sed_fe(:,:) - (2. * zn_sed_fe(:,:)) + zb_sed_fe(:,:) ))
103         zn_sed_fe(:,:) = za_sed_fe(:,:)
104         zb_sed_c(:,:)  = zn_sed_c(:,:)  + (atfp * &
105                          ( za_sed_c(:,:)  - (2. * zn_sed_c(:,:))  + zb_sed_c(:,:)  ))
106         zn_sed_c(:,:)  = za_sed_c(:,:)
107      endif
108      if (jinorgben.eq.1) then
109         zb_sed_si(:,:) = zn_sed_si(:,:) + (atfp * &
110                          ( za_sed_si(:,:) - (2. * zn_sed_si(:,:)) + zb_sed_si(:,:) ))
111         zn_sed_si(:,:) = za_sed_si(:,:)
112         zb_sed_ca(:,:) = zn_sed_ca(:,:) + (atfp * &
113                          ( za_sed_ca(:,:) - (2. * zn_sed_ca(:,:)) + zb_sed_ca(:,:) ))
114         zn_sed_ca(:,:) = za_sed_ca(:,:)
115      endif
116# endif     
117
118#  if defined key_debug_medusa
119         !! AXY (12/07/17)
120         !!-----------------------------------------------------------------
121         !! Check conservation of MEDUSA's sinks-minus-sources using fflx_X
122         !! diagnostics (i.e. biogeochemical processes only)
123         !!   - fflx_X diagnostics *should* include all transfers between
124         !!     modelled components
125         !!   - they should also include gains / losses due to air-sea
126         !!     fluxes of C and O2, aeolian and seafloor inputs of Fe, and
127         !!     inputs from seafloor "benthic buckets" (N, Si, Fe, C and
128         !!     alkalinity)
129         !!   - however, they do not include the transfer of material to
130         !!     "benthic buckets" by sedimenting slow- and fast-sinking
131         !!     detritus since these are separate 2D reservoirs
132         !!   - consequently, for a given water column, the integrated
133         !!     fluxes should sum to the "loss" of material to the "benthic
134         !!     buckets"
135         !!   - if they do not, this suggests that MEDUSA contains errors
136         !!     in its accounting (e.g. processes omitted from calculated
137         !!     fluxes)
138         !!   - here, the local integrated fluxes and benthic inputs (plus
139         !!     air-sea fluxes in the case of C) are reported together with
140         !!     the resulting error
141         !!   - only N, Si, C and alkalinity inventories considered; Fe and
142         !!     O2 overlooked because of wholesale loss (and addition, in
143         !!     the case of O2) of these tracers within the water column
144         !!-----------------------------------------------------------------
145         !!
146         !! nitrogen
147         DO jj = 2,jpjm1
148            DO ji = 2,jpim1
149               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
150                  fq0 = fflx_n(ji,jj)
151                  fq1 = f_sbenin_n(ji,jj) + f_fbenin_n(ji,jj)
152                  fq2 = fq0 + fq1
153                  fq3 = f_benout_n(ji,jj)
154                  if (lwp) write (numout,'(a,2i3,a,4f15.5)')                     &
155                     'AXY N   cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',      &
156                     fq0,fq1,fq2,fq3
157               ENDIF
158            ENDDO
159         ENDDO   
160         !! silicon
161         DO jj = 2,jpjm1
162            DO ji = 2,jpim1
163               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
164                  fq0 = fflx_si(ji,jj)
165                  fq1 = f_fbenin_si(ji,jj)
166                  fq2 = fq0 + fq1
167                  fq3 = f_benout_si(ji,jj)
168                  if (lwp) write (numout,'(a,2i3,a,4f15.5)')                    &
169                     'AXY Si  cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',     &
170                     fq0,fq1,fq2,fq3
171               ENDIF
172            ENDDO
173         ENDDO   
174         !! carbon
175         DO jj = 2,jpjm1
176            DO ji = 2,jpim1
177               if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
178                  fq0 = fflx_c(ji,jj)
179                  fq1 = f_sbenin_c(ji,jj) + f_fbenin_c(ji,jj) + f_fbenin_ca(ji,jj)
180                  fq2 = f_co2flux(ji,jj) * fse3t(ji,jj,1)
181                  fq3 = fq0 + fq1
182                  fq4 = f_benout_c(ji,jj) + f_benout_ca(ji,jj)
183                  if (lwp) write (numout,'(a,2i3,a,5f15.5)')                    &
184                     'AXY C   cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,asf,err,out)=', &
185                     fq0,fq1,fq2,fq3,fq4
186                ENDIF
187             ENDDO
188          ENDDO   
189          !! alkalinity
190          DO jj = 2,jpjm1
191             DO ji = 2,jpim1
192                if (tmask(ji,jj,1) == 1) then
193                   fq0 = fflx_a(ji,jj)
194                   fq1 = 2.0 * f_fbenin_ca(ji,jj)
195                   fq2 = fq0 + fq1
196                   fq3 = 2.0 * f_benout_ca(ji,jj)
197                   if (lwp) write (numout,'(a,2i3,a,4f15.5)')                    &
198                      'AXY alk cons: (i,j)=',ji,jj,', (flx,ben,err,out)=',     &
199                      fq0,fq1,fq2,fq3
200               ENDIF
201            ENDDO
202         ENDDO   
203#  endif
204
205         !!!---------------------------------------------------------------
206         !! Add very last diag calculations
207         !!!---------------------------------------------------------------
208         DO jj = 2,jpjm1
209            DO ji = 2,jpim1
210               !!         
211               IF( med_diag%PN_JLIM%dgsave ) THEN
212                  fjln2d(ji,jj) = fjln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
213               ENDIF
214               IF( med_diag%PN_NLIM%dgsave ) THEN
215                  fnln2d(ji,jj) = fnln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
216               ENDIF
217               IF( med_diag%PN_FELIM%dgsave ) THEN
218                  ffln2d(ji,jj) = ffln2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pn(ji,jj), rsmall)
219               ENDIF
220               IF( med_diag%PD_JLIM%dgsave ) THEN
221                  fjld2d(ji,jj) = fjld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
222               ENDIF
223               IF( med_diag%PD_NLIM%dgsave ) THEN
224                  fnld2d(ji,jj) = fnld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
225               ENDIF
226               IF( med_diag%PD_FELIM%dgsave ) THEN
227                  ffld2d(ji,jj) = ffld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
228               ENDIF
229               IF( med_diag%PD_SILIM%dgsave ) THEN
230                  fsld2d2(ji,jj) = fsld2d2(ji,jj) / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
231               ENDIF
232               IF( med_diag%PDSILIM2%dgsave ) THEN
233                  fsld2d(ji,jj) = fsld2d(ji,jj)   / MAX(ftot_pd(ji,jj), rsmall)
234               ENDIF
235            ENDDO
236         ENDDO
237         !!----------------------------------------------------------------
238         !! Add in XML diagnostics stuff
239         !!----------------------------------------------------------------
240         !!
241         !! ** 2D diagnostics
242#   if defined key_debug_medusa
243         IF (lwp) write (numout,*) 'bio_medusa_fin: export all diag kt = ', kt
244         CALL flush(numout)
245#   endif
246         IF ( med_diag%INVTN%dgsave ) THEN
247            CALL iom_put( "INVTN"  , ftot_n )
248         ENDIF
249         IF ( med_diag%INVTSI%dgsave ) THEN
250            CALL iom_put( "INVTSI"  , ftot_si )
251         ENDIF
252         IF ( med_diag%INVTFE%dgsave ) THEN
253            CALL iom_put( "INVTFE"  , ftot_fe )
254         ENDIF                           
255         IF ( med_diag%ML_PRN%dgsave ) THEN
256            CALL iom_put( "ML_PRN"  , fprn_ml )
257         ENDIF
258         IF ( med_diag%ML_PRD%dgsave ) THEN
259            CALL iom_put( "ML_PRD"  , fprd_ml )
260         ENDIF
261         IF ( med_diag%OCAL_LVL%dgsave ) THEN
262            CALL iom_put( "OCAL_LVL"  , fccd )
263         ENDIF
264         IF ( med_diag%CHL_MLD%dgsave ) THEN
265            CALL iom_put( "CHL_MLD"  , fchl_ml )
266         ENDIF
267         IF ( med_diag%PN_JLIM%dgsave ) THEN
268            CALL iom_put( "PN_JLIM"  , fjln2d )
269            DEALLOCATE( fjln2d )
270         ENDIF
271         IF ( med_diag%PN_NLIM%dgsave ) THEN
272            CALL iom_put( "PN_NLIM"  , fnln2d )
273            DEALLOCATE( fnln2d )
274         ENDIF
275         IF ( med_diag%PN_FELIM%dgsave ) THEN
276            CALL iom_put( "PN_FELIM"  , ffln2d )
277            DEALLOCATE( ffln2d )
278         ENDIF
279         IF ( med_diag%PD_JLIM%dgsave ) THEN
280            CALL iom_put( "PD_JLIM"  , fjld2d )
281            DEALLOCATE( fjld2d )
282         ENDIF
283         IF ( med_diag%PD_NLIM%dgsave ) THEN
284            CALL iom_put( "PD_NLIM"  , fnld2d )
285            DEALLOCATE( fnld2d )
286         ENDIF
287         IF ( med_diag%PD_FELIM%dgsave ) THEN
288            CALL iom_put( "PD_FELIM"  , ffld2d )
289            DEALLOCATE( ffld2d )
290         ENDIF
291         IF ( med_diag%PD_SILIM%dgsave ) THEN
292            CALL iom_put( "PD_SILIM"  , fsld2d2 )
293            DEALLOCATE( fsld2d2 )
294         ENDIF
295         IF ( med_diag%PDSILIM2%dgsave ) THEN
296            CALL iom_put( "PDSILIM2"  , fsld2d )
297            DEALLOCATE( fsld2d )
298         ENDIF
299         IF ( med_diag%INTFLX_N%dgsave ) THEN
300            CALL iom_put( "INTFLX_N"  , fflx_n )
301         ENDIF
302         IF ( med_diag%INTFLX_SI%dgsave ) THEN
303            CALL iom_put( "INTFLX_SI"  , fflx_si )
304         ENDIF
305         IF ( med_diag%INTFLX_FE%dgsave ) THEN
306            CALL iom_put( "INTFLX_FE"  , fflx_fe )
307         ENDIF       
308         IF ( med_diag%INT_PN%dgsave ) THEN
309            CALL iom_put( "INT_PN"  , ftot_pn )
310         ENDIF
311         IF ( med_diag%INT_PD%dgsave ) THEN
312            CALL iom_put( "INT_PD"  , ftot_pd )
313         ENDIF         
314         IF ( med_diag%INT_ZMI%dgsave ) THEN
315            CALL iom_put( "INT_ZMI"  , ftot_zmi )
316         ENDIF
317         IF ( med_diag%INT_ZME%dgsave ) THEN
318            CALL iom_put( "INT_ZME"  , ftot_zme )
319         ENDIF
320         IF ( med_diag%INT_DET%dgsave ) THEN
321            CALL iom_put( "INT_DET"  , ftot_det )
322         ENDIF
323         IF ( med_diag%INT_DTC%dgsave ) THEN
324            CALL iom_put( "INT_DTC"  , ftot_dtc )
325         ENDIF
326         IF ( med_diag%BEN_N%dgsave ) THEN
327            CALL iom_put( "BEN_N"  , za_sed_n )
328         ENDIF
329         IF ( med_diag%BEN_FE%dgsave ) THEN
330            CALL iom_put( "BEN_FE"  , za_sed_fe )
331         ENDIF
332         IF ( med_diag%BEN_C%dgsave ) THEN
333            CALL iom_put( "BEN_C"  , za_sed_c )
334         ENDIF
335         IF ( med_diag%BEN_SI%dgsave ) THEN
336            CALL iom_put( "BEN_SI"  , za_sed_si )
337         ENDIF
338         IF ( med_diag%BEN_CA%dgsave ) THEN
339            CALL iom_put( "BEN_CA"  , za_sed_ca )
340         ENDIF
341         IF ( med_diag%RUNOFF%dgsave ) THEN
342            CALL iom_put( "RUNOFF"  , f_runoff )
343         ENDIF 
344# if defined key_roam       
345         IF ( med_diag%N_PROD%dgsave ) THEN
346            CALL iom_put( "N_PROD"  , fnit_prod )
347         ENDIF
348         IF ( med_diag%N_CONS%dgsave ) THEN
349            CALL iom_put( "N_CONS"  , fnit_cons )
350         ENDIF
351         IF ( med_diag%C_PROD%dgsave ) THEN
352            CALL iom_put( "C_PROD"  , fcar_prod )
353         ENDIF
354         IF ( med_diag%C_CONS%dgsave ) THEN
355            CALL iom_put( "C_CONS"  , fcar_cons )
356         ENDIF
357         IF ( med_diag%O2_PROD%dgsave ) THEN
358            CALL iom_put( "O2_PROD"  , foxy_prod )
359         ENDIF
360         IF ( med_diag%O2_CONS%dgsave ) THEN
361            CALL iom_put( "O2_CONS"  , foxy_cons )
362         ENDIF
363         IF ( med_diag%O2_ANOX%dgsave ) THEN
364            CALL iom_put( "O2_ANOX"  , foxy_anox )
365         ENDIF
366         IF ( med_diag%INVTC%dgsave ) THEN
367            CALL iom_put( "INVTC"  , ftot_c )
368         ENDIF
369         IF ( med_diag%INVTALK%dgsave ) THEN
370            CALL iom_put( "INVTALK"  , ftot_a )
371         ENDIF
372         IF ( med_diag%INVTO2%dgsave ) THEN
373            CALL iom_put( "INVTO2"  , ftot_o2 )
374         ENDIF
375         IF ( med_diag%COM_RESP%dgsave ) THEN
376            CALL iom_put( "COM_RESP"  , fcomm_resp )
377         ENDIF         
378# endif     
379         !!
380         !! diagnostic filled in the i-j-k main loop
381         !!--------------------------------------------
382         IF ( med_diag%PRN%dgsave ) THEN
383            CALL iom_put( "PRN"  , fprn2d )
384            DEALLOCATE( fprn2d )
385         ENDIF
386         IF ( med_diag%MPN%dgsave ) THEN
387            CALL iom_put( "MPN"  ,fdpn2d )
388            DEALLOCATE( fdpn2d )
389         ENDIF
390         IF ( med_diag%PRD%dgsave ) THEN
391            CALL iom_put( "PRD"  ,fprd2d )
392            DEALLOCATE( fprd2d )
393         ENDIF
394         IF( med_diag%MPD%dgsave ) THEN
395            CALL iom_put( "MPD"  , fdpd2d )
396            DEALLOCATE( fdpd2d )
397         ENDIF
398         !  IF( med_diag%DSED%dgsave ) THEN
399         !      CALL iom_put( "DSED"  , ftot_n )
400         !  ENDIF
401         IF( med_diag%OPAL%dgsave ) THEN
402            CALL iom_put( "OPAL"  , fprds2d )
403            DEALLOCATE( fprds2d )
404         ENDIF
405         IF( med_diag%OPALDISS%dgsave ) THEN
406            CALL iom_put( "OPALDISS"  , fsdiss2d )
407            DEALLOCATE( fsdiss2d )
408         ENDIF
409         IF( med_diag%GMIPn%dgsave ) THEN
410            CALL iom_put( "GMIPn"  , fgmipn2d )
411            DEALLOCATE( fgmipn2d )
412         ENDIF
413         IF( med_diag%GMID%dgsave ) THEN
414            CALL iom_put( "GMID"  , fgmid2d )
415            DEALLOCATE( fgmid2d )
416         ENDIF
417         IF( med_diag%MZMI%dgsave ) THEN
418            CALL iom_put( "MZMI"  , fdzmi2d )
419            DEALLOCATE( fdzmi2d )
420         ENDIF
421         IF( med_diag%GMEPN%dgsave ) THEN
422            CALL iom_put( "GMEPN"  , fgmepn2d )
423            DEALLOCATE( fgmepn2d )
424         ENDIF
425         IF( med_diag%GMEPD%dgsave ) THEN
426            CALL iom_put( "GMEPD"  , fgmepd2d )
427            DEALLOCATE( fgmepd2d )
428         ENDIF
429         IF( med_diag%GMEZMI%dgsave ) THEN
430            CALL iom_put( "GMEZMI"  , fgmezmi2d )
431            DEALLOCATE( fgmezmi2d )
432         ENDIF
433         IF( med_diag%GMED%dgsave ) THEN
434            CALL iom_put( "GMED"  , fgmed2d )
435            DEALLOCATE( fgmed2d )
436         ENDIF
437         IF( med_diag%MZME%dgsave ) THEN
438            CALL iom_put( "MZME"  , fdzme2d )
439            DEALLOCATE( fdzme2d )
440         ENDIF
441         !  IF( med_diag%DEXP%dgsave ) THEN
442         !      CALL iom_put( "DEXP"  , ftot_n )
443         !  ENDIF
444         IF( med_diag%DETN%dgsave ) THEN
445            CALL iom_put( "DETN"  , fslown2d )
446            DEALLOCATE( fslown2d )
447         ENDIF
448         IF( med_diag%MDET%dgsave ) THEN
449            CALL iom_put( "MDET"  , fdd2d )
450            DEALLOCATE( fdd2d )
451         ENDIF
452         IF( med_diag%AEOLIAN%dgsave ) THEN
453            CALL iom_put( "AEOLIAN"  , ffetop2d )
454            DEALLOCATE( ffetop2d )
455         ENDIF
456         IF( med_diag%BENTHIC%dgsave ) THEN
457            CALL iom_put( "BENTHIC"  , ffebot2d )
458            DEALLOCATE( ffebot2d )
459         ENDIF
460         IF( med_diag%SCAVENGE%dgsave ) THEN
461            CALL iom_put( "SCAVENGE"  , ffescav2d )
462            DEALLOCATE( ffescav2d )
463         ENDIF
464         !!
465         IF( med_diag%TOTREG_N%dgsave ) THEN
466            CALL iom_put( "TOTREG_N"  , fregen2d )
467            DEALLOCATE( fregen2d )
468         ENDIF
469         IF( med_diag%TOTRG_SI%dgsave ) THEN
470            CALL iom_put( "TOTRG_SI"  , fregensi2d )
471            DEALLOCATE( fregensi2d )
472         ENDIF
473         !!
474         IF( med_diag%FASTN%dgsave ) THEN
475            CALL iom_put( "FASTN"  , ftempn2d )
476            DEALLOCATE( ftempn2d )
477         ENDIF
478         IF( med_diag%FASTSI%dgsave ) THEN
479            CALL iom_put( "FASTSI"  , ftempsi2d )
480            DEALLOCATE( ftempsi2d )
481         ENDIF
482         IF( med_diag%FASTFE%dgsave ) THEN
483            CALL iom_put( "FASTFE"  , ftempfe2d )
484            DEALLOCATE( ftempfe2d )
485         ENDIF
486         IF( med_diag%FASTC%dgsave ) THEN
487            CALL iom_put( "FASTC"  , ftempc2d )
488            DEALLOCATE( ftempc2d )
489         ENDIF
490         IF( med_diag%FASTCA%dgsave ) THEN
491            CALL iom_put( "FASTCA"  , ftempca2d )
492            DEALLOCATE( ftempca2d )
493         ENDIF
494         !!
495         IF( med_diag%REMINN%dgsave ) THEN
496            CALL iom_put( "REMINN"  , freminn2d )
497            DEALLOCATE( freminn2d )
498         ENDIF
499         IF( med_diag%REMINSI%dgsave ) THEN
500            CALL iom_put( "REMINSI"  , freminsi2d )
501            DEALLOCATE( freminsi2d )
502         ENDIF
503         IF( med_diag%REMINFE%dgsave ) THEN
504            CALL iom_put( "REMINFE"  , freminfe2d )
505            DEALLOCATE( freminfe2d )
506         ENDIF
507         IF( med_diag%REMINC%dgsave ) THEN
508            CALL iom_put( "REMINC"  , freminc2d )
509            DEALLOCATE( freminc2d )
510         ENDIF
511         IF( med_diag%REMINCA%dgsave ) THEN
512            CALL iom_put( "REMINCA"  , freminca2d )
513            DEALLOCATE( freminca2d )
514         ENDIF
515         IF( med_diag%SEAFLRN%dgsave ) THEN
516            CALL iom_put( "SEAFLRN"  , fsedn )
517         ENDIF
518         IF( med_diag%SEAFLRSI%dgsave ) THEN
519            CALL iom_put( "SEAFLRSI"  , fsedsi )
520         ENDIF
521         IF( med_diag%SEAFLRFE%dgsave ) THEN
522            CALL iom_put( "SEAFLRFE"  , fsedfe )
523         ENDIF
524         IF( med_diag%SEAFLRC%dgsave ) THEN
525            CALL iom_put( "SEAFLRC"  , fsedc )
526         ENDIF
527         IF( med_diag%SEAFLRCA%dgsave ) THEN
528            CALL iom_put( "SEAFLRCA"  , fsedca )
529         ENDIF
530         !!
531# if defined key_roam           
532         !!
533         IF( med_diag%RIV_N%dgsave ) THEN
534            CALL iom_put( "RIV_N"  , rivn2d )
535            DEALLOCATE( rivn2d )
536         ENDIF
537         IF( med_diag%RIV_SI%dgsave ) THEN
538            CALL iom_put( "RIV_SI"  , rivsi2d )
539            DEALLOCATE( rivsi2d )
540         ENDIF
541         IF( med_diag%RIV_C%dgsave ) THEN
542            CALL iom_put( "RIV_C"  , rivc2d )
543            DEALLOCATE( rivc2d )
544         ENDIF
545         IF( med_diag%RIV_ALK%dgsave ) THEN
546            CALL iom_put( "RIV_ALK"  , rivalk2d )
547            DEALLOCATE( rivalk2d )
548         ENDIF
549         IF( med_diag%DETC%dgsave ) THEN
550            CALL iom_put( "DETC"  , fslowc2d )
551            DEALLOCATE( fslowc2d )
552         ENDIF
553         !!
554         IF( med_diag%PN_LLOSS%dgsave ) THEN
555            CALL iom_put( "PN_LLOSS"  , fdpn22d )
556            DEALLOCATE( fdpn22d )
557         ENDIF
558         IF( med_diag%PD_LLOSS%dgsave ) THEN
559            CALL iom_put( "PD_LLOSS"  , fdpd22d )
560            DEALLOCATE( fdpd22d )
561         ENDIF
562         IF( med_diag%ZI_LLOSS%dgsave ) THEN
563            CALL iom_put( "ZI_LLOSS"  , fdzmi22d )
564             DEALLOCATE( fdzmi22d )
565          ENDIF
566          IF( med_diag%ZE_LLOSS%dgsave ) THEN
567             CALL iom_put( "ZE_LLOSS"  , fdzme22d )
568             DEALLOCATE( fdzme22d )
569          ENDIF
570          IF( med_diag%ZI_MES_N%dgsave ) THEN
571             CALL iom_put( "ZI_MES_N"  , zimesn2d )
572             DEALLOCATE( zimesn2d )
573          ENDIF
574          IF( med_diag%ZI_MES_D%dgsave ) THEN
575             CALL iom_put( "ZI_MES_D"  , zimesd2d )
576             DEALLOCATE( zimesd2d )
577          ENDIF
578          IF( med_diag%ZI_MES_C%dgsave ) THEN
579             CALL iom_put( "ZI_MES_C"  , zimesc2d )
580             DEALLOCATE( zimesc2d )
581          ENDIF
582          IF( med_diag%ZI_MESDC%dgsave ) THEN
583             CALL iom_put( "ZI_MESDC"  ,zimesdc2d )
584             DEALLOCATE( zimesdc2d )
585          ENDIF
586          IF( med_diag%ZI_EXCR%dgsave ) THEN
587             CALL iom_put( "ZI_EXCR"  , ziexcr2d )
588             DEALLOCATE( ziexcr2d )
589          ENDIF
590          IF( med_diag%ZI_RESP%dgsave ) THEN
591             CALL iom_put( "ZI_RESP"  , ziresp2d )
592             DEALLOCATE( ziresp2d )
593          ENDIF
594          IF( med_diag%ZI_GROW%dgsave ) THEN
595             CALL iom_put( "ZI_GROW"  , zigrow2d )
596             DEALLOCATE( zigrow2d )
597          ENDIF
598          IF( med_diag%ZE_MES_N%dgsave ) THEN
599             CALL iom_put( "ZE_MES_N"  , zemesn2d )
600             DEALLOCATE( zemesn2d )
601          ENDIF
602          IF( med_diag%ZE_MES_D%dgsave ) THEN
603             CALL iom_put( "ZE_MES_D"  , zemesd2d )
604             DEALLOCATE( zemesd2d )
605          ENDIF
606          IF( med_diag%ZE_MES_C%dgsave ) THEN
607             CALL iom_put( "ZE_MES_C"  , zemesc2d )
608             DEALLOCATE( zemesc2d )
609          ENDIF
610          IF( med_diag%ZE_MESDC%dgsave ) THEN
611             CALL iom_put( "ZE_MESDC"  , zemesdc2d )
612             DEALLOCATE( zemesdc2d )
613          ENDIF
614          IF( med_diag%ZE_EXCR%dgsave ) THEN
615             CALL iom_put( "ZE_EXCR"  , zeexcr2d )
616             DEALLOCATE( zeexcr2d )
617          ENDIF
618          IF( med_diag%ZE_RESP%dgsave ) THEN
619             CALL iom_put( "ZE_RESP"  , zeresp2d )
620             DEALLOCATE( zeresp2d )
621          ENDIF
622          IF( med_diag%ZE_GROW%dgsave ) THEN
623             CALL iom_put( "ZE_GROW"  , zegrow2d )
624             DEALLOCATE( zegrow2d )
625          ENDIF
626          IF( med_diag%MDETC%dgsave ) THEN
627             CALL iom_put( "MDETC"  , mdetc2d )
628             DEALLOCATE( mdetc2d )
629          ENDIF
630          IF( med_diag%GMIDC%dgsave ) THEN
631             CALL iom_put( "GMIDC"  , gmidc2d )
632             DEALLOCATE( gmidc2d )
633          ENDIF
634          IF( med_diag%GMEDC%dgsave ) THEN
635             CALL iom_put( "GMEDC"  , gmedc2d )
636             DEALLOCATE( gmedc2d )
637          ENDIF
638          IF( med_diag%IBEN_N%dgsave ) THEN
639             CALL iom_put( "IBEN_N"  , iben_n2d )
640             DEALLOCATE( iben_n2d )
641          ENDIF
642          IF( med_diag%IBEN_FE%dgsave ) THEN
643             CALL iom_put( "IBEN_FE"  , iben_fe2d )
644             DEALLOCATE( iben_fe2d )
645          ENDIF
646          IF( med_diag%IBEN_C%dgsave ) THEN
647             CALL iom_put( "IBEN_C"  , iben_c2d )
648             DEALLOCATE( iben_c2d )
649          ENDIF
650          IF( med_diag%IBEN_SI%dgsave ) THEN
651             CALL iom_put( "IBEN_SI"  , iben_si2d )
652             DEALLOCATE( iben_si2d )
653          ENDIF
654          IF( med_diag%IBEN_CA%dgsave ) THEN
655             CALL iom_put( "IBEN_CA"  , iben_ca2d )
656             DEALLOCATE( iben_ca2d )
657          ENDIF
658          IF( med_diag%OBEN_N%dgsave ) THEN
659             CALL iom_put( "OBEN_N"  , oben_n2d )
660             DEALLOCATE( oben_n2d )
661          ENDIF
662          IF( med_diag%OBEN_FE%dgsave ) THEN
663             CALL iom_put( "OBEN_FE"  , oben_fe2d )
664             DEALLOCATE( oben_fe2d )
665          ENDIF
666          IF( med_diag%OBEN_C%dgsave ) THEN
667             CALL iom_put( "OBEN_C"  , oben_c2d )
668             DEALLOCATE( oben_c2d )
669          ENDIF
670          IF( med_diag%OBEN_SI%dgsave ) THEN
671             CALL iom_put( "OBEN_SI"  , oben_si2d )
672             DEALLOCATE( oben_si2d )
673          ENDIF
674          IF( med_diag%OBEN_CA%dgsave ) THEN
675             CALL iom_put( "OBEN_CA"  , oben_ca2d )
676             DEALLOCATE( oben_ca2d )
677          ENDIF
678          IF( med_diag%SFR_OCAL%dgsave ) THEN
679             CALL iom_put( "SFR_OCAL"  , sfr_ocal2d )
680             DEALLOCATE( sfr_ocal2d )
681          ENDIF
682          IF( med_diag%SFR_OARG%dgsave ) THEN
683             CALL iom_put( "SFR_OARG"  , sfr_oarg2d )
684             DEALLOCATE( sfr_oarg2d )
685          ENDIF
686          IF( med_diag%LYSO_CA%dgsave ) THEN
687             CALL iom_put( "LYSO_CA"  , lyso_ca2d )
688             DEALLOCATE( lyso_ca2d )
689          ENDIF
690# endif                   
691          !!
692          !! ** 3D diagnostics
693          IF( med_diag%TPP3%dgsave ) THEN
694             CALL iom_put( "TPP3"  , tpp3d )
695             DEALLOCATE( tpp3d )
696          ENDIF
697          IF( med_diag%DETFLUX3%dgsave ) THEN
698             CALL iom_put( "DETFLUX3"  , detflux3d )
699             DEALLOCATE( detflux3d )
700          ENDIF
701          IF( med_diag%REMIN3N%dgsave ) THEN
702             CALL iom_put( "REMIN3N"  , remin3dn )
703             DEALLOCATE( remin3dn )
704          ENDIF
705# if defined key_roam         
706          IF( med_diag%PH3%dgsave ) THEN
707             CALL iom_put( "PH3"  , f3_pH )
708          ENDIF
709          IF( med_diag%OM_CAL3%dgsave ) THEN
710             CALL iom_put( "OM_CAL3"  , f3_omcal )
711          ENDIF
712          !!
713          !! AXY (09/11/16): 2D CMIP6 diagnostics
714          IF( med_diag%INTDISSIC%dgsave ) THEN
715             CALL iom_put( "INTDISSIC"  , intdissic )
716             DEALLOCATE( intdissic )
717          ENDIF         
718          IF( med_diag%INTDISSIN%dgsave ) THEN
719             CALL iom_put( "INTDISSIN"  , intdissin )
720             DEALLOCATE( intdissin )
721          ENDIF         
722          IF( med_diag%INTDISSISI%dgsave ) THEN
723             CALL iom_put( "INTDISSISI"  , intdissisi )
724             DEALLOCATE( intdissisi )
725          ENDIF         
726          IF( med_diag%INTTALK%dgsave ) THEN
727             CALL iom_put( "INTTALK"  , inttalk )
728             DEALLOCATE( inttalk )
729          ENDIF         
730          IF( med_diag%O2min%dgsave ) THEN
731             CALL iom_put( "O2min"  , o2min )
732             DEALLOCATE( o2min )
733          ENDIF         
734          IF( med_diag%ZO2min%dgsave ) THEN
735             CALL iom_put( "ZO2min"  , zo2min )
736             DEALLOCATE( zo2min )
737          ENDIF         
738          IF( med_diag%FBDDTALK%dgsave ) THEN
739             CALL iom_put( "FBDDTALK"  , fbddtalk )
740             DEALLOCATE( fbddtalk )
741          ENDIF         
742          IF( med_diag%FBDDTDIC%dgsave ) THEN
743             CALL iom_put( "FBDDTDIC"  , fbddtdic )
744             DEALLOCATE( fbddtdic )
745          ENDIF         
746          IF( med_diag%FBDDTDIFE%dgsave ) THEN
747             CALL iom_put( "FBDDTDIFE" , fbddtdife )
748             DEALLOCATE( fbddtdife )
749          ENDIF         
750          IF( med_diag%FBDDTDIN%dgsave ) THEN
751             CALL iom_put( "FBDDTDIN"  , fbddtdin )
752             DEALLOCATE( fbddtdin )
753          ENDIF         
754          IF( med_diag%FBDDTDISI%dgsave ) THEN
755             CALL iom_put( "FBDDTDISI" , fbddtdisi )
756             DEALLOCATE( fbddtdisi )
757          ENDIF   
758          !!
759          !! AXY (09/11/16): 3D CMIP6 diagnostics
760          IF( med_diag%TPPD3%dgsave ) THEN
761             CALL iom_put( "TPPD3"     , tppd3 )
762             DEALLOCATE( tppd3 )
763          ENDIF         
764          IF( med_diag%BDDTALK3%dgsave ) THEN
765             CALL iom_put( "BDDTALK3"  , bddtalk3 )
766             DEALLOCATE( bddtalk3 )
767          ENDIF         
768          IF( med_diag%BDDTDIC3%dgsave ) THEN
769             CALL iom_put( "BDDTDIC3"  , bddtdic3 )
770             DEALLOCATE( bddtdic3 )
771          ENDIF         
772          IF( med_diag%BDDTDIFE3%dgsave ) THEN
773             CALL iom_put( "BDDTDIFE3" , bddtdife3 )
774             DEALLOCATE( bddtdife3 )
775          ENDIF         
776          IF( med_diag%BDDTDIN3%dgsave ) THEN
777             CALL iom_put( "BDDTDIN3"  , bddtdin3 )
778             DEALLOCATE( bddtdin3 )
779          ENDIF         
780          IF( med_diag%BDDTDISI3%dgsave ) THEN
781             CALL iom_put( "BDDTDISI3" , bddtdisi3 )
782             DEALLOCATE( bddtdisi3 )
783          ENDIF   
784          IF( med_diag%FD_NIT3%dgsave ) THEN
785             CALL iom_put( "FD_NIT3"  , fd_nit3 )
786             DEALLOCATE( fd_nit3 )
787          ENDIF
788          IF( med_diag%FD_SIL3%dgsave ) THEN
789             CALL iom_put( "FD_SIL3"  , fd_sil3 )
790             DEALLOCATE( fd_sil3 )
791          ENDIF
792          IF( med_diag%FD_CAL3%dgsave ) THEN
793             CALL iom_put( "FD_CAL3"  , fd_cal3 )
794             DEALLOCATE( fd_cal3 )
795          ENDIF
796          IF( med_diag%FD_CAR3%dgsave ) THEN
797             CALL iom_put( "FD_CAR3"  , fd_car3 )
798             DEALLOCATE( fd_car3 )
799          ENDIF
800          IF( med_diag%CO33%dgsave ) THEN
801             CALL iom_put( "CO33"  , f3_co3 )
802          ENDIF                   
803          IF( med_diag%CO3SATARAG3%dgsave ) THEN
804             CALL iom_put( "CO3SATARAG3"  , f3_omarg )
805          ENDIF                   
806          IF( med_diag%CO3SATCALC3%dgsave ) THEN
807             CALL iom_put( "CO3SATCALC3"  , f3_omcal )
808          ENDIF                   
809          IF( med_diag%EXPC3%dgsave ) THEN
810             CALL iom_put( "EXPC3"  , expc3 )
811             DEALLOCATE( expc3 )
812          ENDIF                   
813          IF( med_diag%EXPN3%dgsave ) THEN
814             CALL iom_put( "EXPN3"  , expn3 )
815             DEALLOCATE( expn3 )
816          ENDIF                   
817          IF( med_diag%DCALC3%dgsave ) THEN
818             CALL iom_put( "DCALC3"  , dcalc3 )
819             DEALLOCATE( dcalc3 )
820          ENDIF                   
821          IF( med_diag%FEDISS3%dgsave ) THEN
822             CALL iom_put( "FEDISS3"  , fediss3 )
823             DEALLOCATE( fediss3 )
824          ENDIF                   
825          IF( med_diag%FESCAV3%dgsave ) THEN
826             CALL iom_put( "FESCAV3"  , fescav3 )
827             DEALLOCATE( fescav3 )
828          ENDIF                   
829          IF( med_diag%MIGRAZP3%dgsave ) THEN
830             CALL iom_put( "MIGRAZP3"  , migrazp3 )
831             DEALLOCATE( migrazp3 )
832          ENDIF                   
833          IF( med_diag%MIGRAZD3%dgsave ) THEN
834             CALL iom_put( "MIGRAZD3"  , migrazd3 )
835             DEALLOCATE( migrazd3 )
836          ENDIF                   
837          IF( med_diag%MEGRAZP3%dgsave ) THEN
838             CALL iom_put( "MEGRAZP3"  , megrazp3 )
839             DEALLOCATE( megrazp3 )
840          ENDIF                   
841          IF( med_diag%MEGRAZD3%dgsave ) THEN
842             CALL iom_put( "MEGRAZD3"  , megrazd3 )
843             DEALLOCATE( megrazd3 )
844          ENDIF                   
845          IF( med_diag%MEGRAZZ3%dgsave ) THEN
846             CALL iom_put( "MEGRAZZ3"  , megrazz3 )
847             DEALLOCATE( megrazz3 )
848          ENDIF                   
849          IF( med_diag%O2SAT3%dgsave ) THEN
850             CALL iom_put( "O2SAT3"  , o2sat3 )
851             DEALLOCATE( o2sat3 )
852          ENDIF                   
853          IF( med_diag%PBSI3%dgsave ) THEN
854             CALL iom_put( "PBSI3"  , pbsi3 )
855             DEALLOCATE( pbsi3 )
856          ENDIF                   
857          IF( med_diag%PCAL3%dgsave ) THEN
858             CALL iom_put( "PCAL3"  , pcal3 )
859             DEALLOCATE( pcal3 )
860          ENDIF                   
861          IF( med_diag%REMOC3%dgsave ) THEN
862             CALL iom_put( "REMOC3"  , remoc3 )
863             DEALLOCATE( remoc3 )
864          ENDIF                   
865          IF( med_diag%PNLIMJ3%dgsave ) THEN
866             CALL iom_put( "PNLIMJ3" , pnlimj3 )
867             DEALLOCATE( pnlimj3 )
868          ENDIF                   
869          IF( med_diag%PNLIMN3%dgsave ) THEN
870             CALL iom_put( "PNLIMN3" , pnlimn3 )
871             DEALLOCATE( pnlimn3 )
872          ENDIF                   
873          IF( med_diag%PNLIMFE3%dgsave ) THEN
874             CALL iom_put( "PNLIMFE3" , pnlimfe3 )
875             DEALLOCATE( pnlimfe3 )
876          ENDIF                   
877          IF( med_diag%PDLIMJ3%dgsave ) THEN
878             CALL iom_put( "PDLIMJ3" , pdlimj3 )
879             DEALLOCATE( pdlimj3 )
880          ENDIF                   
881          IF( med_diag%PDLIMN3%dgsave ) THEN
882             CALL iom_put( "PDLIMN3" , pdlimn3 )
883             DEALLOCATE( pdlimn3 )
884          ENDIF                   
885          IF( med_diag%PDLIMFE3%dgsave ) THEN
886             CALL iom_put( "PDLIMFE3" , pdlimfe3 )
887             DEALLOCATE( pdlimfe3 )
888          ENDIF                   
889          IF( med_diag%PDLIMSI3%dgsave ) THEN
890             CALL iom_put( "PDLIMSI3" , pdlimsi3 )
891             DEALLOCATE( pdlimsi3 )
892          ENDIF                   
893         
894# endif         
895
896          DEALLOCATE( zw2d )
897
898   END SUBROUTINE bio_medusa_fin
899
900#else
901   !!======================================================================
902   !!  Dummy module :                                   No MEDUSA bio-model
903   !!======================================================================
904CONTAINS
905   SUBROUTINE bio_medusa_fin( )                    ! Empty routine
906      WRITE(*,*) 'bio_medusa_fin: You should not have seen this print! error?'
907   END SUBROUTINE bio_medusa_fin
908#endif 
909
910   !!======================================================================
911END MODULE bio_medusa_fin_mod
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.