source: branches/UKMO/CO6_KD490_amm7_oper_fabm/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/DIA/dia25h.F90 @ 8049

Last change on this file since 8049 was 8049, checked in by dford, 5 years ago

Add FABM-related code changes.

File size: 20.8 KB
Line 
1MODULE dia25h 
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE  diaharm  ***
4   !! Harmonic analysis of tidal constituents
5   !!======================================================================
6   !! History :  3.6  !  2014  (E O'Dea)  Original code
7   !!----------------------------------------------------------------------
8   USE oce             ! ocean dynamics and tracers variables
9   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
10   USE diainsitutem, ONLY: rinsitu_t, theta2t
11   USE in_out_manager  ! I/O units
12   USE iom             ! I/0 library
13   USE wrk_nemo        ! working arrays
14#if defined key_zdftke 
15   USE zdftke, ONLY: en
16#endif
17   USE zdf_oce, ONLY: avt, avm
18#if defined key_zdfgls
19   USE zdfgls, ONLY: mxln
20   USE zdf_oce, ONLY: en
21#endif
22   USE diatmb
23#if defined key_fabm
24   USE trc, ONLY: trn
25   USE par_fabm
26   USE fabm, ONLY: fabm_get_bulk_diagnostic_data
27#endif
28
29   IMPLICIT NONE
30   PRIVATE
31
32   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_dia25h     !:  25h mean output
33   PUBLIC   dia_25h_init               ! routine called by nemogcm.F90
34   PUBLIC   dia_25h                    ! routine called by diawri.F90
35
36  !! * variables for calculating 25-hourly means
37   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:) ::   tn_25h  , sn_25h, rinsitu_t_25h 
38   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:)   ::   sshn_25h, insitu_bot_25h, temp_bot_25h 
39   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:) ::   un_25h  , vn_25h  , wn_25h
40   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:) ::   avt_25h , avm_25h
41#if defined key_zdfgls || key_zdftke
42   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:) ::   en_25h
43#endif
44#if defined key_zdfgls 
45   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:) ::   rmxln_25h
46#endif
47#if defined key_fabm
48   REAL(wp),SAVE, ALLOCATABLE,   DIMENSION(:,:,:,:) :: fabm3d_25h
49#endif
50   INTEGER, SAVE :: cnt_25h     ! Counter for 25 hour means
51
52
53
54   !!----------------------------------------------------------------------
55   !! NEMO/OPA 3.6 , NEMO Consortium (2014)
56   !! $Id$
57   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
58   !!----------------------------------------------------------------------
59CONTAINS
60
61   SUBROUTINE dia_25h_init 
62      !!---------------------------------------------------------------------------
63      !!                  ***  ROUTINE dia_25h_init  ***
64      !!     
65      !! ** Purpose: Initialization of 25h mean namelist
66      !!       
67      !! ** Method : Read namelist
68      !!   History
69      !!   3.6  !  08-14  (E. O'Dea) Routine to initialize dia_25h
70      !!---------------------------------------------------------------------------
71      !!
72      INTEGER ::   ios                 ! Local integer output status for namelist read
73      INTEGER ::   ierror              ! Local integer for memory allocation
74      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,3)   ::   zwtmb                                 ! temporary workspace
75      !
76      NAMELIST/nam_dia25h/ ln_dia25h
77      !!----------------------------------------------------------------------
78      !
79      REWIND ( numnam_ref )              ! Read Namelist nam_dia25h in reference namelist : 25hour mean diagnostics
80      READ   ( numnam_ref, nam_dia25h, IOSTAT=ios, ERR= 901 )
81901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nam_dia25h in reference namelist', lwp )
82
83      REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist nam_dia25h in configuration namelist  25hour diagnostics
84      READ  ( numnam_cfg, nam_dia25h, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
85902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nam_dia25h in configuration namelist', lwp )
86      IF(lwm) WRITE ( numond, nam_dia25h )
87
88      IF(lwp) THEN                   ! Control print
89         WRITE(numout,*)
90         WRITE(numout,*) 'dia_25h_init : Output 25 hour mean diagnostics'
91         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~'
92         WRITE(numout,*) 'Namelist nam_dia25h : set 25h outputs '
93         WRITE(numout,*) 'Switch for 25h diagnostics (T) or not (F)  ln_dia25h  = ', ln_dia25h
94      ENDIF
95      IF( .NOT. ln_dia25h )   RETURN
96      ! ------------------- !
97      ! 1 - Allocate memory !
98      ! ------------------- !
99      ALLOCATE( tn_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
100      IF( ierror > 0 ) THEN
101         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate tn_25h' )   ;   RETURN
102      ENDIF
103      ALLOCATE( sn_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
104      IF( ierror > 0 ) THEN
105         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate sn_25h' )   ;   RETURN
106      ENDIF
107      ALLOCATE( rinsitu_t_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
108      IF( ierror > 0 ) THEN
109         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate rinsitu_t_25h' )   ;   RETURN
110      ENDIF
111      ALLOCATE( insitu_bot_25h(jpi,jpj), STAT=ierror )
112      IF( ierror > 0 ) THEN
113         CALL ctl_stop( 'dia_tide: unable to allocate insitu_bot_25h' )   ;   RETURN
114      ENDIF     
115      ALLOCATE( temp_bot_25h(jpi,jpj), STAT=ierror )
116      IF( ierror > 0 ) THEN
117         CALL ctl_stop( 'dia_tide: unable to allocate temp_bot_25h' )   ;   RETURN
118      ENDIF
119      ALLOCATE( un_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
120      IF( ierror > 0 ) THEN
121         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate un_25h' )   ;   RETURN
122      ENDIF
123      ALLOCATE( vn_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
124      IF( ierror > 0 ) THEN
125         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate vn_25h' )   ;   RETURN
126      ENDIF
127      ALLOCATE( wn_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
128      IF( ierror > 0 ) THEN
129         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate wn_25h' )   ;   RETURN
130      ENDIF
131      ALLOCATE( avt_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
132      IF( ierror > 0 ) THEN
133         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate avt_25h' )   ;   RETURN
134      ENDIF
135      ALLOCATE( avm_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
136      IF( ierror > 0 ) THEN
137         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate avm_25h' )   ;   RETURN
138      ENDIF
139# if defined key_zdfgls || defined key_zdftke
140      ALLOCATE( en_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
141      IF( ierror > 0 ) THEN
142         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate en_25h' )   ;   RETURN
143      ENDIF
144#endif
145# if defined key_zdfgls 
146      ALLOCATE( rmxln_25h(jpi,jpj,jpk), STAT=ierror )
147      IF( ierror > 0 ) THEN
148         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate rmxln_25h' )   ;   RETURN
149      ENDIF
150#endif
151      ALLOCATE( sshn_25h(jpi,jpj), STAT=ierror )
152      IF( ierror > 0 ) THEN
153         CALL ctl_stop( 'dia_25h: unable to allocate sshn_25h' )   ;   RETURN
154      ENDIF
155#if defined key_fabm
156      ALLOCATE( fabm3d_25h(jpi,jpj,jpk,jp_fabmdia_3dout), STAT=ierror )
157      IF( ierror > 0 ) THEN
158         CALL ctl_stop( 'dia_tide: unable to allocate fabm3d_25h' )   ;   RETURN
159      ENDIF
160#endif 
161      ! ------------------------- !
162      ! 2 - Assign Initial Values !
163      ! ------------------------- !
164      cnt_25h = 1  ! sets the first value of sum at timestep 1 (note - should strictly be at timestep zero so before values used where possible)
165      tn_25h(:,:,:) = tsb(:,:,:,jp_tem)
166      sn_25h(:,:,:) = tsb(:,:,:,jp_sal)
167      CALL theta2t
168      rinsitu_t_25h(:,:,:) = rinsitu_t(:,:,:)
169      CALL dia_calctmb( rinsitu_t(:,:,:),zwtmb )
170      insitu_bot_25h(:,:) = zwtmb(:,:,3)
171      CALL dia_calctmb( tn_25h(:,:,:),zwtmb )
172      temp_bot_25h(:,:) = zwtmb(:,:,3)
173      sshn_25h(:,:) = sshb(:,:)
174      un_25h(:,:,:) = ub(:,:,:)
175      vn_25h(:,:,:) = vb(:,:,:)
176      wn_25h(:,:,:) = wn(:,:,:)
177      avt_25h(:,:,:) = avt(:,:,:)
178      avm_25h(:,:,:) = avm(:,:,:)
179# if defined key_zdfgls || defined key_zdftke
180         en_25h(:,:,:) = en(:,:,:)
181#endif
182# if defined key_zdfgls
183         rmxln_25h(:,:,:) = mxln(:,:,:)
184#endif
185#if defined key_fabm
186      fabm3d_25h(:,:,:,1) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n1p)
187      fabm3d_25h(:,:,:,2) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n3n)
188      fabm3d_25h(:,:,:,3) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n4n)
189      fabm3d_25h(:,:,:,4) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n5s)
190      fabm3d_25h(:,:,:,5) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_o2o)
191      fabm3d_25h(:,:,:,6)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3ph) 
192      fabm3d_25h(:,:,:,7)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3pc)
193      fabm3d_25h(:,:,:,8)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_chltot) 
194      fabm3d_25h(:,:,:,9)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_netpp) 
195      fabm3d_25h(:,:,:,10)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_xeps) 
196      fabm3d_25h(:,:,:,11)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_phytot) 
197#endif
198#if defined key_lim3 || defined key_lim2
199         CALL ctl_stop('STOP', 'dia_25h not setup yet to do tidemean ice')
200#endif 
201
202      ! -------------------------- !
203      ! 3 - Return to dia_wri      !
204      ! -------------------------- !
205
206
207   END SUBROUTINE dia_25h_init
208
209
210   SUBROUTINE dia_25h( kt ) 
211      !!----------------------------------------------------------------------
212      !!                 ***  ROUTINE dia_25h  ***
213      !!         
214      !!
215      !!--------------------------------------------------------------------
216      !!                   
217      !! ** Purpose :   Write diagnostics with M2/S2 tide removed
218      !!
219      !! ** Method  :   
220      !!      25hr mean outputs for shelf seas
221      !!
222      !! History :
223      !!   ?.0  !  07-04  (A. Hines) New routine, developed from dia_wri_foam
224      !!   3.4  !  02-13  (J. Siddorn) Routine taken from old dia_wri_foam
225      !!   3.6  !  08-14  (E. O'Dea) adapted for VN3.6
226      !!----------------------------------------------------------------------
227      !! * Modules used
228
229      IMPLICIT NONE
230
231      !! * Arguments
232      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
233
234
235      !! * Local declarations
236      INTEGER ::   ji, jj, jk
237
238      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.    ! =T print and flush numout
239      REAL(wp)                         ::   zsto, zout, zmax, zjulian, zdt, zmdi  ! temporary reals
240      INTEGER                          ::   i_steps                               ! no of timesteps per hour
241      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj    ) ::   zw2d, un_dm, vn_dm                    ! temporary workspace
242      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zw3d                                  ! temporary workspace
243      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,3)   ::   zwtmb                                 ! temporary workspace
244      INTEGER                          ::   iyear0, nimonth0,iday0                ! start year,imonth,day
245
246      !!----------------------------------------------------------------------
247
248      ! 0. Initialisation
249      ! -----------------
250      ! Define frequency of summing to create 25 h mean
251      zdt = rdt
252      IF( nacc == 1 ) zdt = rdtmin
253
254      IF( MOD( 3600,INT(zdt) ) == 0 ) THEN
255         i_steps = 3600/INT(zdt)
256      ELSE
257         CALL ctl_stop('STOP', 'dia_wri_tide: timestep must give MOD(3600,rdt) = 0 otherwise no hourly values are possible')
258      ENDIF
259
260#if defined key_lim3 || defined key_lim2
261      CALL ctl_stop('STOP', 'dia_wri_tide not setup yet to do tidemean ice')
262#endif
263
264      ! local variable for debugging
265      ll_print = ll_print .AND. lwp
266
267      ! Sum of 25 hourly instantaneous values to give a 25h mean from 24hours
268      ! every day
269      IF( MOD( kt, i_steps ) == 0  .and. kt .ne. nn_it000 ) THEN
270
271         IF (lwp) THEN
272              WRITE(numout,*) 'dia_wri_tide : Summing instantaneous hourly diagnostics at timestep ',kt
273              WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~ '
274         ENDIF
275
276         tn_25h(:,:,:)        = tn_25h(:,:,:) + tsn(:,:,:,jp_tem)
277         sn_25h(:,:,:)        = sn_25h(:,:,:) + tsn(:,:,:,jp_sal)
278         CALL theta2t
279         rinsitu_t_25h(:,:,:)  = rinsitu_t_25h(:,:,:) + rinsitu_t(:,:,:)
280         CALL dia_calctmb( rinsitu_t(:,:,:),zwtmb )
281         insitu_bot_25h(:,:)  = insitu_bot_25h(:,:) + zwtmb(:,:,3)
282         zw3d(:,:,:)          = tsn(:,:,:,jp_tem)
283         CALL dia_calctmb( zw3d,zwtmb )
284         temp_bot_25h(:,:)    = temp_bot_25h(:,:) + zwtmb(:,:,3)
285         sshn_25h(:,:)        = sshn_25h(:,:) + sshn (:,:)
286         un_25h(:,:,:)        = un_25h(:,:,:) + un(:,:,:)
287         vn_25h(:,:,:)        = vn_25h(:,:,:) + vn(:,:,:)
288         wn_25h(:,:,:)        = wn_25h(:,:,:) + wn(:,:,:)
289         avt_25h(:,:,:)       = avt_25h(:,:,:) + avt(:,:,:)
290         avm_25h(:,:,:)       = avm_25h(:,:,:) + avm(:,:,:)
291# if defined key_zdfgls || defined key_zdftke
292         en_25h(:,:,:)        = en_25h(:,:,:) + en(:,:,:)
293#endif
294# if defined key_zdfgls
295         rmxln_25h(:,:,:)      = rmxln_25h(:,:,:) + mxln(:,:,:)
296#endif
297#if defined key_fabm
298         fabm3d_25h(:,:,:,1) = fabm3d_25h(:,:,:,1) + trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n1p)   ! phosphate
299         fabm3d_25h(:,:,:,2) = fabm3d_25h(:,:,:,2) + trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n3n)   ! nitrate
300         fabm3d_25h(:,:,:,3) = fabm3d_25h(:,:,:,3) + trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n4n)   ! ammonium
301         fabm3d_25h(:,:,:,4) = fabm3d_25h(:,:,:,4) + trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n5s)   ! silicate
302         fabm3d_25h(:,:,:,5) = fabm3d_25h(:,:,:,5) + trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_o2o)   ! oxygen
303         fabm3d_25h(:,:,:,6)= fabm3d_25h(:,:,:,6) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3ph) ! pH
304         fabm3d_25h(:,:,:,7)= fabm3d_25h(:,:,:,7) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3pc) ! pCO2
305         fabm3d_25h(:,:,:,8)= fabm3d_25h(:,:,:,8) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_chltot) ! total Chl
306         fabm3d_25h(:,:,:,9)= fabm3d_25h(:,:,:,9) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_netpp) ! netPP
307         fabm3d_25h(:,:,:,10)= fabm3d_25h(:,:,:,10) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_xeps) ! light attenuation
308         fabm3d_25h(:,:,:,11)= fabm3d_25h(:,:,:,11) + fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_phytot) ! total phytoplankton
309#endif
310         cnt_25h = cnt_25h + 1
311
312         IF (lwp) THEN
313            WRITE(numout,*) 'dia_tide : Summed the following number of hourly values so far',cnt_25h
314         ENDIF
315
316      ENDIF ! MOD( kt, i_steps ) == 0
317
318         ! Write data for 25 hour mean output streams
319      IF( cnt_25h .EQ. 25 .AND.  MOD( kt, i_steps*24) == 0 .AND. kt .NE. nn_it000 ) THEN
320
321            IF(lwp) THEN
322               WRITE(numout,*) 'dia_wri_tide : Writing 25 hour mean tide diagnostics at timestep', kt
323               WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~ '
324            ENDIF
325
326            tn_25h(:,:,:)        = tn_25h(:,:,:) / 25.0_wp
327            sn_25h(:,:,:)        = sn_25h(:,:,:) / 25.0_wp
328            rinsitu_t_25h(:,:,:)  = rinsitu_t_25h(:,:,:) / 25.0_wp
329            insitu_bot_25h(:,:)  = insitu_bot_25h(:,:) / 25.0_wp 
330            temp_bot_25h(:,:)    = temp_bot_25h(:,:) /25.0_wp
331            sshn_25h(:,:)        = sshn_25h(:,:) / 25.0_wp
332            un_25h(:,:,:)        = un_25h(:,:,:) / 25.0_wp
333            vn_25h(:,:,:)        = vn_25h(:,:,:) / 25.0_wp
334            wn_25h(:,:,:)        = wn_25h(:,:,:) / 25.0_wp
335            avt_25h(:,:,:)       = avt_25h(:,:,:) / 25.0_wp
336            avm_25h(:,:,:)       = avm_25h(:,:,:) / 25.0_wp
337# if defined key_zdfgls || defined key_zdftke
338            en_25h(:,:,:)        = en_25h(:,:,:) / 25.0_wp
339#endif
340# if defined key_zdfgls
341            rmxln_25h(:,:,:)       = rmxln_25h(:,:,:) / 25.0_wp
342#endif
343#if defined key_fabm
344            fabm3d_25h(:,:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,:) / 25.0_wp
345#endif
346
347            IF (lwp)  WRITE(numout,*) 'dia_wri_tide : Mean calculated by dividing 25 hour sums and writing output'
348            zmdi=1.e+20 !missing data indicator for masking
349            ! write tracers (instantaneous)
350            zw3d(:,:,:) = tn_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
351            CALL iom_put("temper25h", zw3d)   ! potential temperature
352            CALL theta2t                                                                    ! calculate insitu temp
353            zw3d(:,:,:) = rinsitu_t_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
354            CALL iom_put("tempis25h", zw3d)   ! in-situ temperature
355            zw2d(:,:) = insitu_bot_25h(:,:)*tmask(:,:,1) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,1))
356            CALL iom_put("tempisbot25h", zw2d) ! bottom in-situ temperature
357            zw2d(:,:) = temp_bot_25h(:,:)*tmask(:,:,1) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,1))
358            CALL iom_put("temperbot25h",zw2d) ! bottom potential temperature
359            zw3d(:,:,:) = sn_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
360            CALL iom_put( "salin25h", zw3d  )   ! salinity
361            zw2d(:,:) = sshn_25h(:,:)*tmask(:,:,1) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,1))
362            CALL iom_put( "ssh25h", zw2d )   ! sea surface
363
364#if defined key_fabm
365            ! Write ERSEM variables
366            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,1)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
367            CALL iom_put( "N1p25h", zw3d  )   ! phosphate
368            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,2)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
369            CALL iom_put( "N3n25h", zw3d  )   ! nitrate
370            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,3)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
371            CALL iom_put( "N4n25h", zw3d  )   ! ammonium
372            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,4)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
373            CALL iom_put( "N5s25h", zw3d  )   ! silicate
374            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,5)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
375            CALL iom_put( "O2o25h", zw3d  )   ! oxygen
376            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,6)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
377            CALL iom_put( "pH25h", zw3d  )   ! pH
378            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,7)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
379            CALL iom_put( "pCO2_25h", zw3d  )   ! pCO2
380            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,8)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
381            CALL iom_put( "CHL25h", zw3d  )   ! total Chl
382            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,9)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
383            CALL iom_put( "netPP25h", zw3d  ) ! netPP
384            zw3d(:,:,:) = (1.7/fabm3d_25h(:,:,:,10))*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
385            CALL iom_put( "visib25h", zw3d  ) ! light attenuation convert to visibility
386            zw3d(:,:,:) = fabm3d_25h(:,:,:,11)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
387            CALL iom_put( "PhytoC25h", zw3d  )   ! total phytoplankton
388#endif
389
390            ! Write velocities (instantaneous)
391            zw3d(:,:,:) = un_25h(:,:,:)*umask(:,:,:) + zmdi*(1.0-umask(:,:,:))
392            CALL iom_put("vozocrtx25h", zw3d)    ! i-current
393            zw3d(:,:,:) = vn_25h(:,:,:)*vmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-vmask(:,:,:))
394            CALL iom_put("vomecrty25h", zw3d  )   ! j-current
395
396            zw3d(:,:,:) = wn_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
397            CALL iom_put("vomecrtz25h", zw3d )   ! k-current
398            zw3d(:,:,:) = avt_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
399            CALL iom_put("avt25h", zw3d )   ! diffusivity
400            zw3d(:,:,:) = avm_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
401            CALL iom_put("avm25h", zw3d)   ! viscosity
402#if defined key_zdftke || defined key_zdfgls 
403!           zw3d(:,:,:) = en_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
404!           CALL iom_put("tke25h", zw3d)   ! tke
405#endif
406#if defined key_zdfgls 
407!           zw3d(:,:,:) = rmxln_25h(:,:,:)*tmask(:,:,:) + zmdi*(1.0-tmask(:,:,:))
408!           CALL iom_put( "mxln25h",zw3d)
409#endif
410
411            ! After the write reset the values to cnt=1 and sum values equal current value
412            tn_25h(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_tem)
413            sn_25h(:,:,:) = tsn(:,:,:,jp_sal)
414            CALL theta2t
415            rinsitu_t_25h(:,:,:) = rinsitu_t(:,:,:)
416            CALL dia_calctmb( rinsitu_t(:,:,:),zwtmb )
417            insitu_bot_25h(:,:) = zwtmb(:,:,3)
418            CALL dia_calctmb( tn_25h(:,:,:),zwtmb)
419            temp_bot_25h(:,:) = zwtmb(:,:,3)
420            sshn_25h(:,:) = sshn (:,:)
421            un_25h(:,:,:) = un(:,:,:)
422            vn_25h(:,:,:) = vn(:,:,:)
423            wn_25h(:,:,:) = wn(:,:,:)
424            avt_25h(:,:,:) = avt(:,:,:)
425            avm_25h(:,:,:) = avm(:,:,:)
426# if defined key_zdfgls || defined key_zdftke
427            en_25h(:,:,:) = en(:,:,:)
428#endif
429# if defined key_zdfgls
430            rmxln_25h(:,:,:) = mxln(:,:,:)
431#endif
432#if defined key_fabm
433            fabm3d_25h(:,:,:,1) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n1p)
434            fabm3d_25h(:,:,:,2) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n3n)
435            fabm3d_25h(:,:,:,3) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n4n)
436            fabm3d_25h(:,:,:,4) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_n5s)
437            fabm3d_25h(:,:,:,5) = trn(:,:,:,jp_fabm_m1+jp_fabm_o2o)
438            fabm3d_25h(:,:,:,6)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3ph)
439            fabm3d_25h(:,:,:,7)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_o3pc) 
440            fabm3d_25h(:,:,:,8)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_chltot)
441            fabm3d_25h(:,:,:,9)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_netpp)
442            fabm3d_25h(:,:,:,10)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabm_xeps)
443            fabm3d_25h(:,:,:,11)= fabm_get_bulk_diagnostic_data(model, jp_fabmdia_phytot)
444#endif
445            cnt_25h = 1
446            IF (lwp)  WRITE(numout,*) 'dia_wri_tide : After 25hr mean write, reset sum to current value and cnt_25h to one for overlapping average',cnt_25h
447
448      ENDIF !  cnt_25h .EQ. 25 .AND.  MOD( kt, i_steps * 24) == 0 .AND. kt .NE. nn_it000
449
450
451   END SUBROUTINE dia_25h 
452
453   !!======================================================================
454END MODULE dia25h
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.