New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
step.F90 in branches/UKMO/dev_r8126_LIM3_couple/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC – NEMO

source: branches/UKMO/dev_r8126_LIM3_couple/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/step.F90 @ 8892

Last change on this file since 8892 was 8892, checked in by frrh, 7 years ago

Commit updates with debugging write statements.
File size: 23.8 KB
Line 
1MODULE step
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE step  ***
4   !! Time-stepping   : manager of the ocean, tracer and ice time stepping
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  !  1991-03  (G. Madec)  Original code
7   !!             -   !  1991-11  (G. Madec)
8   !!             -   !  1992-06  (M. Imbard)  add a first output record
9   !!             -   !  1996-04  (G. Madec)  introduction of dynspg
10   !!             -   !  1996-04  (M.A. Foujols)  introduction of passive tracer
11   !!            8.0  !  1997-06  (G. Madec)  new architecture of call
12   !!            8.2  !  1997-06  (G. Madec, M. Imbard, G. Roullet)  free surface
13   !!             -   !  1999-02  (G. Madec, N. Grima)  hpg implicit
14   !!             -   !  2000-07  (J-M Molines, M. Imbard)  Open Bondary Conditions
15   !!   NEMO     1.0  !  2002-06  (G. Madec)  free form, suppress macro-tasking
16   !!             -   !  2004-08  (C. Talandier) New trends organization
17   !!             -   !  2005-01  (C. Ethe) Add the KPP closure scheme
18   !!             -   !  2005-11  (G. Madec)  Reorganisation of tra and dyn calls
19   !!             -   !  2006-01  (L. Debreu, C. Mazauric)  Agrif implementation
20   !!             -   !  2006-07  (S. Masson)  restart using iom
21   !!            3.2  !  2009-02  (G. Madec, R. Benshila)  reintroduicing z*-coordinate
22   !!             -   !  2009-06  (S. Masson, G. Madec)  TKE restart compatible with key_cpl
23   !!            3.3  !  2010-05  (K. Mogensen, A. Weaver, M. Martin, D. Lea) Assimilation interface
24   !!             -   !  2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase + merge TRC-TRA
25   !!            3.4  !  2011-04  (G. Madec, C. Ethe) Merge of dtatem and dtasal
26   !!            3.6  !  2012-07  (J. Simeon, G. Madec. C. Ethe)  Online coarsening of outputs
27   !!            3.6  !  2014-04  (F. Roquet, G. Madec) New equations of state
28   !!            3.6  !  2014-10  (E. Clementi, P. Oddo) Add Qiao vertical mixing in case of waves
29   !!            3.7  !  2014-10  (G. Madec)  LDF simplication
30   !!             -   !  2014-12  (G. Madec) remove KPP scheme
31   !!             -   !  2015-11  (J. Chanut) free surface simplification
32   !!----------------------------------------------------------------------
33
34   !!----------------------------------------------------------------------
35   !!   stp             : OPA system time-stepping
36   !!----------------------------------------------------------------------
37   USE step_oce         ! time stepping definition modules
38   !
39   USE iom              ! xIOs server
40use in_out_manager
41use lib_fortran
42use oce
43
44
45   IMPLICIT NONE
46   PRIVATE
47
48   PUBLIC   stp   ! called by nemogcm.F90
49
50   !!----------------------------------------------------------------------
51   !! NEMO/OPA 3.7 , NEMO Consortium (2015)
52   !! $Id$
53   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
54   !!----------------------------------------------------------------------
55CONTAINS
56
57#if defined key_agrif
58   RECURSIVE SUBROUTINE stp( )
59      INTEGER             ::   kstp   ! ocean time-step index
60#else
61   SUBROUTINE stp( kstp )
62      INTEGER, INTENT(in) ::   kstp   ! ocean time-step index
63#endif
64      !!----------------------------------------------------------------------
65      !!                     ***  ROUTINE stp  ***
66      !!
67      !! ** Purpose : - Time stepping of OPA  (momentum and active tracer eqs.)
68      !!              - Time stepping of ESIM (dynamic and thermodynamic eqs.)
69      !!              - Time stepping of TRC  (passive tracer eqs.)
70      !!
71      !! ** Method  : -1- Update forcings and data
72      !!              -2- Update ocean physics
73      !!              -3- Compute the t and s trends
74      !!              -4- Update t and s
75      !!              -5- Compute the momentum trends
76      !!              -6- Update the horizontal velocity
77      !!              -7- Compute the diagnostics variables (rd,N2, hdiv,w)
78      !!              -8- Outputs and diagnostics
79      !!----------------------------------------------------------------------
80      INTEGER ::   ji,jj,jk ! dummy loop indice
81      INTEGER ::   indic    ! error indicator if < 0
82      INTEGER ::   kcall    ! optional integer argument (dom_vvl_sf_nxt)
83      !! ---------------------------------------------------------------------
84#if defined key_agrif
85      kstp = nit000 + Agrif_Nb_Step()
86      IF( lk_agrif_debug ) THEN
87         IF( Agrif_Root() .and. lwp)   WRITE(*,*) '---'
88         IF(lwp)   WRITE(*,*) 'Grid Number', Agrif_Fixed(),' time step ', kstp, 'int tstep', Agrif_NbStepint()
89      ENDIF
90      IF( kstp == nit000 + 1 )   lk_agrif_fstep = .FALSE.
91# if defined key_iomput
92      IF( Agrif_Nbstepint() == 0 )   CALL iom_swap( cxios_context )
93# endif
94#endif
95      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
96      ! update I/O and calendar
97      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
98                             indic = 0                ! reset to no error condition
99                             
100      IF( kstp == nit000 ) THEN                       ! initialize IOM context (must be done after nemo_init for AGRIF+XIOS+OASIS)
101                             CALL iom_init(      cxios_context          )  ! for model grid (including passible AGRIF zoom)
102         IF( ln_crs      )   CALL iom_init( TRIM(cxios_context)//"_crs" )  ! for coarse grid
103      ENDIF
104      IF( kstp /= nit000 )   CALL day( kstp )         ! Calendar (day was already called at nit000 in day_init)
105                             CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1,      cxios_context          )   ! tell IOM we are at time step kstp
106      IF( ln_crs         )   CALL iom_setkt( kstp - nit000 + 1, TRIM(cxios_context)//"_crs" )   ! tell IOM we are at time step kstp
107
108      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
109      ! Update external forcing (tides, open boundaries, and surface boundary condition (including sea-ice)
110      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
111      IF( ln_tide    )   CALL sbc_tide( kstp )                   ! update tide potential
112      IF( ln_apr_dyn )   CALL sbc_apr ( kstp )                   ! atmospheric pressure (NB: call before bdy_dta which needs ssh_ib)
113      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dta ( kstp, time_offset=+1 )   ! update dynamic & tracer data at open boundaries
114                         CALL sbc     ( kstp )                   ! Sea Boundary Condition (including sea-ice)
115
116      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
117      ! Update stochastic parameters and random T/S fluctuations
118      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
119      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_par( kstp )          ! Stochastic parameters
120      IF( ln_sto_eos ) CALL sto_pts( tsn  )          ! Random T/S fluctuations
121
122write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn AA", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
123
124      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
125      ! Ocean physics update                (ua, va, tsa used as workspace)
126      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
127      !  THERMODYNAMICS
128                         CALL eos_rab( tsb, rab_b )       ! before local thermal/haline expension ratio at T-points
129                         CALL eos_rab( tsn, rab_n )       ! now    local thermal/haline expension ratio at T-points
130                         CALL bn2    ( tsb, rab_b, rn2b ) ! before Brunt-Vaisala frequency
131                         CALL bn2    ( tsn, rab_n, rn2  ) ! now    Brunt-Vaisala frequency
132write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn BB", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
133
134      !
135      !  VERTICAL PHYSICS
136                         CALL zdf_bfr( kstp )         ! bottom friction (if quadratic)
137      !                                               ! Vertical eddy viscosity and diffusivity coefficients
138      IF( lk_zdfric  )   CALL zdf_ric ( kstp )             ! Richardson number dependent Kz
139      IF( lk_zdftke  )   CALL zdf_tke ( kstp )             ! TKE closure scheme for Kz
140      IF( lk_zdfgls  )   CALL zdf_gls ( kstp )             ! GLS closure scheme for Kz
141      IF( ln_zdfqiao )   CALL zdf_qiao( kstp )             ! Qiao vertical mixing
142      !
143      IF( lk_zdfcst  ) THEN                                ! Constant Kz (reset avt, avm[uv] to the background value)
144         avt (:,:,:) = rn_avt0 * wmask (:,:,:)
145         avmu(:,:,:) = rn_avm0 * wumask(:,:,:)
146         avmv(:,:,:) = rn_avm0 * wvmask(:,:,:)
147      ENDIF
148write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn CC", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
149
150      IF( ln_rnf_mouth ) THEN                         ! increase diffusivity at rivers mouths
151         DO jk = 2, nkrnf   ;   avt(:,:,jk) = avt(:,:,jk) + 2._wp * rn_avt_rnf * rnfmsk(:,:) * tmask(:,:,jk)   ;   END DO
152      ENDIF
153      IF( ln_zdfevd  )   CALL zdf_evd( kstp )         ! enhanced vertical eddy diffusivity
154
155      IF( lk_zdftmx  )   CALL zdf_tmx( kstp )         ! tidal vertical mixing
156
157      IF( lk_zdfddm  )   CALL zdf_ddm( kstp )         ! double diffusive mixing
158
159                         CALL zdf_mxl( kstp )         ! mixed layer depth
160
161write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn DD", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
162                                                      ! write TKE or GLS information in the restart file
163      IF( lrst_oce .AND. lk_zdftke )   CALL tke_rst( kstp, 'WRITE' )
164      IF( lrst_oce .AND. lk_zdfgls )   CALL gls_rst( kstp, 'WRITE' )
165      !
166      !  LATERAL  PHYSICS
167      !
168      IF( l_ldfslp ) THEN                             ! slope of lateral mixing
169                         CALL eos( tsb, rhd, gdept_0(:,:,:) )               ! before in situ density
170
171         IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav)                               &
172            &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv,  &  ! Partial steps: before horizontal gradient
173            &                                          rhd, gru , grv    )  ! of t, s, rd at the last ocean level
174
175         IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav)                               &
176            &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsb, gtsu, gtsv, gtui, gtvi,  &  ! Partial steps for top cell (ISF)
177            &                                          rhd, gru , grv , grui, grvi   )  ! of t, s, rd at the first ocean level
178         IF( ln_traldf_triad ) THEN
179                         CALL ldf_slp_triad( kstp )                       ! before slope for triad operator
180         ELSE     
181                         CALL ldf_slp     ( kstp, rhd, rn2b )             ! before slope for standard operator
182         ENDIF
183      ENDIF
184write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn EE", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
185      !                                                                   ! eddy diffusivity coeff.
186      IF( l_ldftra_time .OR. l_ldfeiv_time )   CALL ldf_tra( kstp )       !       and/or eiv coeff.
187      IF( l_ldfdyn_time                    )   CALL ldf_dyn( kstp )       ! eddy viscosity coeff.
188
189      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
190      !  Ocean dynamics : hdiv, ssh, e3, u, v, w
191      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
192
193                            CALL ssh_nxt       ( kstp )  ! after ssh (includes call to div_hor)
194      IF(.NOT.ln_linssh )   CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp )  ! after vertical scale factors
195                            CALL wzv           ( kstp )  ! now cross-level velocity
196                            CALL eos    ( tsn, rhd, rhop, gdept_n(:,:,:) )  ! now in situ density for hpg computation
197                           
198!!jc: fs simplification
199!!jc: lines below are useless if ln_linssh=F. Keep them here (which maintains a bug if ln_linssh=T and ln_zps=T, cf ticket #1636)
200!!                                         but ensures reproductible results
201!!                                         with previous versions using split-explicit free surface         
202            IF( ln_zps .AND. .NOT. ln_isfcav )                               &
203               &            CALL zps_hde    ( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv,   &  ! Partial steps: before horizontal gradient
204               &                                          rhd, gru , grv     )  ! of t, s, rd at the last ocean level
205            IF( ln_zps .AND.       ln_isfcav )                                          &
206               &            CALL zps_hde_isf( kstp, jpts, tsn, gtsu, gtsv, gtui, gtvi,  &  ! Partial steps for top cell (ISF)
207               &                                          rhd, gru , grv , grui, grvi   )  ! of t, s, rd at the first ocean level
208!!jc: fs simplification
209write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn FF", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
210                           
211                         ua(:,:,:) = 0._wp            ! set dynamics trends to zero
212                         va(:,:,:) = 0._wp
213
214      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. ln_dyninc )   &
215               &         CALL dyn_asm_inc   ( kstp )  ! apply dynamics assimilation increment
216      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_dyn3d_dmp ( kstp )  ! bdy damping trends
217#if defined key_agrif
218      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
219               &         CALL Agrif_Sponge_dyn        ! momentum sponge
220#endif
221                         CALL dyn_adv       ( kstp )  ! advection (vector or flux form)
222                         CALL dyn_vor       ( kstp )  ! vorticity term including Coriolis
223                         CALL dyn_ldf       ( kstp )  ! lateral mixing
224                         CALL dyn_hpg       ( kstp )  ! horizontal gradient of Hydrostatic pressure
225                         CALL dyn_spg       ( kstp )  ! surface pressure gradient
226
227                                                      ! With split-explicit free surface, since now transports have been updated and ssha as well
228      IF( ln_dynspg_ts ) THEN                         ! vertical scale factors and vertical velocity need to be updated
229                            CALL div_hor    ( kstp )              ! Horizontal divergence  (2nd call in time-split case)
230         IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_nxt( kstp, kcall=2 )  ! after vertical scale factors (update depth average component)
231                            CALL wzv        ( kstp )              ! now cross-level velocity
232      ENDIF
233write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn GG", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
234
235                         CALL dyn_bfr       ( kstp )  ! bottom friction
236                         CALL dyn_zdf       ( kstp )  ! vertical diffusion
237
238      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
239      ! cool skin
240      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
241      IF ( ln_diurnal )  CALL stp_diurnal( kstp )
242     
243      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
244      ! diagnostics and outputs             (ua, va, tsa used as workspace)
245      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
246      IF( lk_floats  )   CALL flo_stp( kstp )         ! drifting Floats
247      IF( nn_diacfl == 1 )   CALL dia_cfl( kstp )         ! Courant number diagnostics
248      IF( lk_diahth  )   CALL dia_hth( kstp )         ! Thermocline depth (20 degres isotherm depth)
249      IF( lk_diadct  )   CALL dia_dct( kstp )         ! Transports
250                         CALL dia_ar5( kstp )         ! ar5 diag
251write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
252      IF( lk_diaharm )   CALL dia_harm( kstp )        ! Tidal harmonic analysis
253write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.1", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
254                         CALL dia_wri( kstp )         ! ocean model: outputs
255write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.2", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
256      !
257      IF( ln_crs     )   CALL crs_fld       ( kstp )  ! ocean model: online field coarsening & output
258     
259write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.3", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
260#if defined key_top
261      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
262      ! Passive Tracer Model
263      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
264                         CALL trc_stp       ( kstp )  ! time-stepping
265write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.4", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
266#endif
267
268      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
269      ! Active tracers                             
270      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
271                         tsa(:,:,:,:) = 0._wp         ! set tracer trends to zero
272
273      IF(  lk_asminc .AND. ln_asmiau .AND. &
274         & ln_trainc )   CALL tra_asm_inc   ( kstp )  ! apply tracer assimilation increment
275                         CALL tra_sbc       ( kstp )  ! surface boundary condition
276write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.5", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
277      IF( ln_traqsr  )   CALL tra_qsr       ( kstp )  ! penetrative solar radiation qsr
278write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.6", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
279      IF( ln_trabbc  )   CALL tra_bbc       ( kstp )  ! bottom heat flux
280write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.7", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
281      IF( lk_trabbl  )   CALL tra_bbl       ( kstp )  ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme
282write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.8", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
283      IF( ln_tradmp  )   CALL tra_dmp       ( kstp )  ! internal damping trends
284write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.9", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
285      IF( ln_bdy     )   CALL bdy_tra_dmp   ( kstp )  ! bdy damping trends
286write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn HH.10", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
287#if defined key_agrif
288      IF(.NOT. Agrif_Root())  & 
289               &         CALL Agrif_Sponge_tra        ! tracers sponge
290#endif
291 write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn II", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
292                        CALL tra_adv       ( kstp )  ! horizontal & vertical advection
293                         CALL tra_ldf       ( kstp )  ! lateral mixing
294
295!!gm : why CALL to dia_ptr has been moved here??? (use trends info?)
296      IF( ln_diaptr  )   CALL dia_ptr                 ! Poleward adv/ldf TRansports diagnostics
297!!gm
298                         CALL tra_zdf       ( kstp )  ! vertical mixing and after tracer fields
299      IF( ln_zdfnpc  )   CALL tra_npc       ( kstp )  ! update after fields by non-penetrative convection
300
301      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
302      ! Set boundary conditions and Swap
303      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
304!!jc1: For agrif, it would be much better to finalize tracers/momentum here (e.g. bdy conditions) and move the swap
305!!    (and time filtering) after Agrif update. Then restart would be done after and would contain updated fields.
306!!    If so:
307!!    (i) no need to call agrif update at initialization time
308!!    (ii) no need to update "before" fields
309!!
310!!    Apart from creating new tra_swp/dyn_swp routines, this however:
311!!    (i) makes boundary conditions at initialization time computed from updated fields which is not the case between
312!!    two restarts => restartability issue. One can circumvent this, maybe, by assuming "interface separation",
313!!    e.g. a shift of the feedback interface inside child domain.
314!!    (ii) requires that all restart outputs of updated variables by agrif (e.g. passive tracers/tke/barotropic arrays) are done at the same
315!!    place.
316!!
317!!jc2: dynnxt must be the latest call. e3t_b are indeed updated in that routine
318                         CALL tra_nxt       ( kstp )  ! finalize (bcs) tracer fields at next time step and swap
319                         CALL dyn_nxt       ( kstp )  ! finalize (bcs) velocities at next time step and swap
320                         CALL ssh_swp       ( kstp )  ! swap of sea surface height
321      IF(.NOT.ln_linssh) CALL dom_vvl_sf_swp( kstp )  ! swap of vertical scale factors
322      !
323      IF( ln_diahsb        )   CALL dia_hsb( kstp )         ! - ML - global conservation diagnostics
324 write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn JJ", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
325
326!!gm : This does not only concern the dynamics ==>>> add a new title
327!!gm2: why ouput restart before AGRIF update?
328!!
329!!jc: That would be better, but see comment above
330!!
331      IF( lrst_oce         )   CALL rst_write    ( kstp )   ! write output ocean restart file
332      IF( ln_sto_eos       )   CALL sto_rst_write( kstp )   ! write restart file for stochastic parameters
333
334#if defined key_agrif
335      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
336      ! AGRIF
337      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<     
338                         CALL Agrif_Integrate_ChildGrids( stp ) 
339
340      IF( Agrif_NbStepint() == 0 ) THEN               ! AGRIF Update
341!!jc in fact update is useless at last time step, but do it for global diagnostics
342                         CALL Agrif_Update_Tra()      ! Update active tracers
343                         CALL Agrif_Update_Dyn()      ! Update momentum
344      ENDIF
345#endif
346      IF( ln_diaobs  )   CALL dia_obs( kstp )         ! obs-minus-model (assimilation) diagnostics (call after dynamics update)
347
348      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
349      ! Control
350      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
351                         CALL stp_ctl       ( kstp, indic )
352      IF( indic < 0  ) THEN
353                         CALL ctl_stop( 'step: indic < 0' )
354                         CALL dia_wri_state( 'output.abort', kstp )
355      ENDIF
356      IF( kstp == nit000 ) THEN
357                 CALL iom_close( numror )     ! close input  ocean restart file
358         IF(lwm) CALL FLUSH    ( numond )     ! flush output namelist oce
359         IF(lwm.AND.numoni /= -1 )   &
360            &    CALL FLUSH    ( numoni )     ! flush output namelist ice (if exist)
361      ENDIF
362 write(numout,*) "RSRH step tsb, tsa, tsn KK", kstp, glob_sum(tsb(:,:,:,1)), glob_sum(tsa(:,:,:,1)),glob_sum(tsn(:,:,:,1)); flush(numout)
363
364      !>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
365      ! Coupled mode
366      !<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
367!!gm why lk_oasis and not lk_cpl ????
368      !IF( lk_oasis   )   CALL sbc_cpl_snd( kstp )     ! coupled mode : field exchanges
369      !
370#if defined key_iomput
371      IF( kstp == nitend .OR. indic < 0 ) THEN
372                      CALL iom_context_finalize(      cxios_context          ) ! needed for XIOS+AGRIF
373         IF( ln_crs ) CALL iom_context_finalize( trim(cxios_context)//"_crs" ) !
374      ENDIF
375#endif
376      !
377      IF( nn_timing == 1 .AND.  kstp == nit000  )   CALL timing_reset
378      !
379   END SUBROUTINE stp
380   
381END MODULE step
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.