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2!! PISCES  :    1  - air-sea exchange                         (nampisext)
3!! namelists    2  - biological parameters                    (nampisbio)
4!!              3  - parameters for nutrient limitations      (nampislim)   
5!!              4  - parameters for phytoplankton             (nampisprod,nampismort)
6!!              5  - parameters for zooplankton               (nampismes,nampiszoo)
7!!              6  - parameters for remineralization          (nampisrem)
8!!              7  - parameters for calcite chemistry         (nampiscal)
9!!              8  - parameters for inputs deposition         (nampissed)
10!!              9  - parameters for Kriest parameterization   (nampiskrp, nampiskrs)
11!!              10 - additional 2D/3D  diagnostics            (nampisdia)
12!!              11 - Damping                                  (nampisdmp)
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14!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
15&nampisext     !   air-sea exchange
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17   atcco2     = 287.    ! atmospheric pCO2
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19!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
20&nampisbio     !   biological parameters
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22   part       =  0.85    ! part of calcite not dissolved in guts
23   nrdttrc    =  4       ! time step frequency for biology
24   wsbio      =  2.      ! POC sinking speed
25   xkmort     =  1.E-7   ! half saturation constant for mortality
26   ferat3     =  3.E-6   ! Fe/C in zooplankton
27   wsbio2     =  30.     ! Big particles sinking speed
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29!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
30&nampislim     !   parameters for nutrient limitations
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32   conc0      =  2.e-6    ! Phosphate half saturation
33   conc1      =  10E-6    ! Phosphate half saturation for diatoms
34   conc2      =  0.01E-9  ! Iron half saturation for phyto
35   conc2m     =  0.08E-9  ! Max iron half saturation for phyto
36   conc3      =  0.1E-9   ! Iron half saturation for diatoms
37   conc3m     =  0.4E-9   ! Maxi iron half saturation for diatoms
38   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto
39   concdnh4   =  5.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms
40   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake
41   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C
42   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization
43   caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio
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45!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
46&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth
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48   pislope    =  3.       ! P-I slope 
49   pislope2   =  3.       ! P-I slope  for diatoms
50   excret     =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton
51   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms
52   chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton
53   chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms
54   fecnm      =  10E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton
55   fecdm      =  15E-6    ! Minimum Fe/C in diatoms
56   grosip     =  0.151    ! mean Si/C ratio
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58!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
59&nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks
60!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
61   wchl       =  0.001    ! quadratic mortality of phytoplankton
62   wchld      =  0.02     ! maximum quadratic mortality of diatoms
63   mprat      =  0.01     ! phytoplankton mortality rate
64   mprat2     =  0.01     ! Diatoms mortality rate
65   mpratm     =  0.01     ! Phytoplankton minimum mortality rate
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67!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
68&nampismes     !   parameters for mesozooplankton
69!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
70   grazrat2   =  0.7      ! maximal mesozoo grazing rate
71   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton
72   mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate
73   xprefc     =  1.       ! zoo preference for phyto
74   xprefp     =  0.2      ! zoo preference for POC
75   xprefz     =  1.       ! zoo preference for zoo
76   xprefpoc   =  0.2      ! zoo preference for poc
77   xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing
78   epsher2    =  0.33     ! Efficicency of Mesozoo growth
79   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM
80   unass2     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo
81   grazflux   =  5.e3     ! flux-feeding rate
82/
83!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
84&nampiszoo     !   parameters for microzooplankton
85!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
86   grazrat    =  4.0      ! maximal zoo grazing rate   
87   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton
88   mzrat      =  0.0      ! zooplankton mortality rate
89   xpref2c    =  0.1      ! Microzoo preference for POM
90   xpref2p    =  0.45     ! Microzoo preference for Nanophyto
91   xpref2d    =  0.45     ! Microzoo preference for Diatoms
92   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing
93   epsher     =  0.33     ! Efficiency of microzoo growth
94   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM
95   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo
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97!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
98&nampisrem     !   parameters for remineralization
99!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
100   xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC
101   xremip    =  0.025     ! remineralisation rate of POC
102   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate
103   xsirem    =  0.015     ! remineralization rate of Si
104   xlam1     =  0.005     ! scavenging rate of Iron
105   oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia
106/
107!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
108&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry
109!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
110   kdca       =  0.327e3  ! calcite dissolution rate constant (1/time)
111   nca        =  1.       ! order of dissolution reaction (dimensionless)
112/
113!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
114&nampissed     !   parameters for inputs deposition
115!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
116   ln_dustfer  =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere
117   ln_river    =  .false.   ! boolean for river input of nutrients
118   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N
119   ln_sedinput =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments
120   sedfeinput  =  1E-9     ! Coastal release of Iron
121   dustsolub   =  0.014    ! Solubility of the dust
122/
123!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
124&nampiskrp     !   Kriest parameterization : parameters     "key_kriest"
125!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
126   xkr_eta      = 1.17    ! Sinking  exponent
127   xkr_zeta     = 2.28    ! N content exponent
128   xkr_mass_min = 0.0002  ! Minimum mass for Aggregates
129   xkr_mass_max = 1.      ! Maximum mass for Aggregates
130/
131!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
132&nampiskrs     !   Kriest parameterization : size classes  "key_kriest"
133!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
134   xkr_sfact    = 942.    ! Sinking factor
135   xkr_stick    = 0.5     ! Stickiness
136   xkr_nnano    = 2.337   ! Nbr of cell in nano size class
137   xkr_ndiat    = 3.718   ! Nbr of cell in diatoms size class
138   xkr_nmeso    = 7.147   ! Nbr of cell in mesozoo size class
139   xkr_naggr    = 9.877   ! Nbr of cell in aggregates  size class
140/
141!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
142&nampisdia     !   additional 2D/3D tracers diagnostics ("key_trc_diaadd")
143!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
144   nwritedia   =  1460     !  time step frequency for tracers diagnostics
145!
146!              !    name   !           title of the field          !     units      !
147!              !           !                                       !                ! 
148   pisdia2d(1)  = 'Cflx     ' , 'DIC flux                          ',  'molC/m2/s    '
149   pisdia2d(2)  = 'Oflx     ' , 'Oxygen flux                       ',  'molC/m2/s    '
150   pisdia2d(3)  = 'Kg       ' , 'Gas transfer                      ',  'mol/m2/s/uatm'
151   pisdia2d(4)  = 'Delc     ' , 'Delta CO2                         ',  'uatm         '
152   pisdia2d(5)  = 'PMO      ' , 'POC export                        ',  'molC/m2/s    '
153   pisdia2d(6)  = 'PMO2     ' , 'GOC export                        ',  'molC/m2/s    '
154   pisdia2d(7)  = 'ExpFe1   ' , 'Nano iron export                  ',  'molFe/m2/s   '
155   pisdia2d(8)  = 'ExpFe2   ' , 'Diatoms iron export               ',  'molFe/m2/s   '
156   pisdia2d(9)  = 'ExpSi    ' , 'Silicate export                   ',  'molSi/m2/s   '
157   pisdia2d(10) = 'ExpCaCO3 ' , 'Calcite export                    ',  'molC/m2/s    '
158   pisdia2d(11) = 'heup     ' , 'euphotic layer depth              ',  'm            '
159   pisdia2d(12) = 'Fedep    ' , 'Iron dep                          ',  'molFe/m2/s   '
160   pisdia2d(13) = 'Nfix     ' , 'Nitrogen Fixation                 ',  'molN/m2/s    '
161   pisdia3d(1)  = 'PH       ' , 'PH                                ',  '-            '
162   pisdia3d(2)  = 'CO3      ' , 'Bicarbonates                      ',  'mol/l        '
163   pisdia3d(3)  = 'CO3sat   ' , 'CO3 saturation                    ',  'mol/l        '
164   pisdia3d(4)  = 'PAR      ' , 'light penetration                 ',  'W/m2         '
165   pisdia3d(5)  = 'PPPHY    ' , 'Primary production of nanophyto   ',  'molC/m3/s    '
166   pisdia3d(6)  = 'PPPHY2   ' , 'Primary production of diatoms     ',  'molC/m3/s    '
167   pisdia3d(7)  = 'PPNEWN   ' , 'New Primary production of nano    ',  'molC/m3/s    '
168   pisdia3d(8)  = 'PPNEWD   ' , 'New Primary production of diat    ',  'molC/m3/s    '
169   pisdia3d(9)  = 'PBSi     ' , 'Primary production of Si diatoms  ',  'molSi/m3/s   '
170   pisdia3d(10) = 'PFeN     ' , 'Primary production of nano iron   ',  'molFe/m3/s   '
171   pisdia3d(11) = 'PFeD     ' , 'Primary production of diatoms iron',  'molFe/m3/s   '
172/
173!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
174&nampisdmp     !  Damping
175!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
176   ln_pisdmp    =  .true.     !  Relaxation fo some tracers to a mean value
177   ln_pisclo    =  .false.    !  Restoring of tracer to initial value on closed sea ("key_dtatrc")
178/
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.