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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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iodef_ar5.xml in trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00 – NEMO

source: trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM/EXP00/iodef_ar5.xml @ 5107

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update IO for VVL compatibility, see ticket #1474

  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3 
4  <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" >
5
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>   
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                                                                                          =
18=                                           output files definition                                        =
19=                                                                                                          =
20=                  http://www2-pcmdi.llnl.gov/svn/repository/cmor/trunk/Tables/CMIP5_Oclim                 =
21=                  http://www2-pcmdi.llnl.gov/svn/repository/cmor/trunk/Tables/CMIP5_Omon                  =
22=                  http://www2-pcmdi.llnl.gov/svn/repository/cmor/trunk/Tables/CMIP5_Oimon                 =             
23=          http://www.clivar.org/organization/wgomd/references/WGOMD_CMIP5_ocean_fields.June2009.pdf       =
24=                                                                                                          =
25============================================================================================================
26    -->
27   
28    <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" output_level="10" sync_freq="2mo" min_digits="4">
29      <!--
30+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++   daily   ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
31        -->
32      <file_group id="1d" output_freq="1d"  enabled=".TRUE.">                      <!-- 1d files -->
33   <file id="file1" name_suffix="_grid_T_table2.2" >         <!-- grid T  -->
34     <field field_ref="sst"          name='tos'      long_name="sea_surface_temperature"                              level="2"                      />
35     <field field_ref="sst2"         name='tossq'    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2"                      />
36     <field field_ref="mldkz5"       name='omldamax' long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" />
37   </file>   
38      </file_group>
39   <!--
40++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++   monthly   +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
41     -->
42      <file_group id="1m" output_freq="1mo"     enabled=".TRUE.">                      <!-- real monthly files -->
43   <!--
44..............................................    grid T   .................................................
45     -->   
46   <file id="file2" name_suffix="_grid_T_table2.2" >
47     <field field_ref="botpres"      name="pbo"      long_name="sea_water_pressure_at_sea_floor"                               />
48     <!-- pso : sea_water_pressure_at_sea_water_surface = 0 -->
49     <field field_ref="ssh"          name="zos"      long_name="sea_surface_height_above_geoid"                                 />
50     <field field_ref="ssh2"         name="zossq"    long_name="square_of_sea_surface_height_above_geoid"             level="2" />
51     <!-- masscello : sea_water_mass_per_unit_area = e3t*rau0                                          no time changes -->
52     <field field_ref="e3t"          name="thkcello" long_name="cell_thickness"                                                 /> <!-- no time changes -->
53     <field field_ref="toce"         name="thetao"   long_name="sea_water_potential_temperature"                                />
54     <field field_ref="sst"          name="tos"      long_name="sea_surface_temperature"                              level="1" />
55     <field field_ref="sst2"         name="tossq"    long_name="square_of_sea_surface_temperature"                    level="2" />
56     <field field_ref="soce"         name="so"       long_name="sea_water_salinity"                                             />
57     <field field_ref="sss"          name="sos"      long_name="sea_surface_salinity"                                 level="1" />
58     <field field_ref="rhop"         name="rhopoto"  long_name="sea_water_potential_density"                          level="2" />
59     <!-- no agessc : sea_water_age_since_surface_contact -->
60     <!-- no cfc11  : moles_per_unit_mass_of_cfc11_in_sea_water -->
61     <!-- msftbarot : ocean_barotropic_mass_streamfunction : offline -->
62     <!-- mlotst    :           ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline -->
63     <!-- mlotstsq  : square_of_ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_sigma_t : must be done offline -->
64     <field field_ref="mldkz5"       name='omlmax'   long_name="ocean_mixed_layer_thickness_defined_by_mixing_scheme" level="2" operation="maximum" />
65   </file>   
66   
67   <file id="file3" name_suffix="_grid_T_table2.5" >
68     <field field_ref="rain"         name="pr"       long_name="rainfall_flux"                                           level="1" />
69     <field field_ref="snow_ao_cea"  name="prsn"     long_name="snowfall_flux"                                           level="1" />
70     <field field_ref="evap_ao_cea"  name="evs"      long_name="water_evaporation_flux"                                  level="1" />
71     <field field_ref="runoffs"      name="friver"   long_name="water_flux_into_sea_water_from_rivers"                   level="1" />
72     <field field_ref="calving"      name="ficeberg" long_name="water_flux_into_sea_water_from_icebergs"                 level="1" />
73     <field field_ref="isnwmlt_cea"  name="fsitherm" long_name="water_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" />
74     <field field_ref="empmr"        name="wfo"      long_name="water_flux_into_sea_water"                               level="1" />
75     <!-- wfonocorr : water_flux_into_sea_water_without_flux_correction : emp - erp --> 
76     <field field_ref="erp"          name="wfcorr"   long_name="water_flux_correction"                                   level="1" /> <!-- usually = 0 -->
77   </file>   
78   
79   <file id="file4" name_suffix="_grid_T_table2.6" >
80     <!-- vsfpr    : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_rainfall    = 0 --> 
81     <!-- vsfevap  : virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_evaporation = 0 --> 
82     <!-- vsfriver : virtual_salt_flux_into_sea_water_from_rivers        = 0 -->     
83     <field field_ref="fsal_virt_cea" name="vsfsit" long_name="virtual_salt_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics" level="1" />
84     <!-- vsf      : virtual_salt_flux_into_sea_water = fsal_virtual + fsal_real -->
85     <!-- wfcorr   : virtual_salt_flux_correction                        = 0 --> 
86     <field field_ref="fsal_virt_cea" name="sfdsi"  long_name="downward_sea_ice_basal_salt_flux"                               level="1" />
87     <!-- sfriver  : salt_flux_into_sea_water_from_rivers                = 0 --> 
88   </file>   
89   
90   <file id="file5" name_suffix="_grid_T_table2.7" >
91     <!-- hfgeou : upward_geothermal_heat_flux_at_sea_floor : cte, see nambbc and trabbc.F90 -->
92     <field field_ref="hflx_rain_cea" name="hfrainds"    long_name="temperature_flux_due_to_rainfall_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"      level="1" />
93     <field field_ref="hflx_evap_cea" name="hfevapds"    long_name="temperature_flux_due_to_evaporation_expressed_as_heat_flux_out_of_sea_water" level="1" />
94     <field field_ref="hflx_rnf_cea"  name="hfrunoffds"  long_name="temperature_flux_due_to_runoff_expressed_as_heat_flux_into_sea_water"        level="1" />
95     <field field_ref="hflx_snow_cea" name="hfsnthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_snow_thermodynamics"                         level="1" />
96     <field field_ref="hflx_ice_cea"  name="hfsithermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_sea_ice_thermodynamics"                      level="1" />
97     <field field_ref="hflx_cal_cea"  name="hfibthermds" long_name="heat_flux_into_sea_water_due_to_iceberg_thermodynamics"                      level="1" />
98     <!-- rlds   : surface_net_downward_longwave_flux : not available -->
99     <!-- hfls   : surface_downward_latent_heat_flux  : not available -->
100     <!-- hfss   : surface_downward_sensible_heat_flux: not available -->
101     <field field_ref="qns"           name="nshfls"      long_name="surface_net_downward_non_solar_flux"                                         level="1" />
102     <field field_ref="qsr"           name="rsntds"      long_name="surface_net_downward_shortwave_flux"                                         level="1" />
103     <field field_ref="qsr3d"         name="rsds"        long_name="downwelling_shortwave_flux_in_sea_water"                                     level="1" />
104     <field field_ref="qrp"           name="hfcorr"      long_name="heat_flux_correction"                                                        level="1" />
105   </file>   
106   <!--
107..............................................    grid U   .................................................
108   -->
109   <file id="file6" name_suffix="_grid_U_table2.3" >
110     <field field_ref="uoce"         name="uo"      long_name="sea_water_x_velocity"                                       />
111     <field field_ref="u_masstr"     name="umo"     long_name="ocean_mass_x_transport"                           level="1" />
112     <field field_ref="u_heattr"     name="hfx"     long_name="ocean_heat_x_transport"                           level="1" />
113     <field field_ref="ueiv_heattr"  name="hfxba"   long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" />
114     <field field_ref="udiff_heattr" name="hfxdiff" long_name="ocean_heat_x_transport_due_to_diffusion"          level="2" />
115   </file>   
116   
117   <file id="file7" name_suffix="_grid_U_table2.8" >
118     <field field_ref="utau"         name="tauuo" long_name="surface_downward_x_stress"                          level="1" />
119     <!-- tauucorr : surface_downward_x_stress_correction = 0 -->
120   </file>   
121   <!--
122..............................................    grid V   .................................................
123   -->
124   <file id="file8" name_suffix="_grid_V_table2.3" >
125     <field field_ref="voce"         name="vo"      long_name="sea_water_y_velocity"                                       />
126     <field field_ref="v_masstr"     name="vmo"     long_name="ocean_mass_y_transport"                           level="1" />
127     <field field_ref="v_heattr"     name="hfy"     long_name="ocean_heat_y_transport"                           level="1" />
128     <field field_ref="veiv_heattr"  name="hfyba"   long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_bolus_advection"    level="2" />
129     <field field_ref="vdiff_heattr" name="hfydiff" long_name="ocean_heat_y_transport_due_to_diffusion"          level="2" />
130   </file>   
131   
132   <file id="file9" name_suffix="_grid_V_table2.8" >
133     <field field_ref="vtau"         name="tauvo" long_name="surface_downward_y_stress"                          level="1" />
134     <!-- tauvcorr : surface_downward_y_stress_correction = 0 -->
135   </file>   
136   <!--
137..............................................    grid W   .................................................
138   -->
139   <file id="file10" name_suffix="_grid_W_table2.3" >
140     <field field_ref="w_masstr"   name="wmo"   long_name="upward_ocean_mass_transport"                                    />
141     <field field_ref="w_masstr2"  name="wmosq" long_name="square_pf_upward_ocean_mass_transport"                          />
142   </file>   
143   
144   <file id="file11" name_suffix="_grid_W_table2.9" >
145     <field field_ref="avt"     name="difvho"   long_name="ocean_vertical_heat_diffusivity"                  level="2" />
146     <field field_ref="avs"     name="difvso"   long_name="ocean_vertical_salt_diffusivity"                  level="2" />
147     <!-- difvtrbo : ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb and  nn_havtb -->
148     <field field_ref="av_tide" name="difvtrto" long_name="ocean_vertical_tracer_diffusivity_due_to_tides"   level="2" />
149     <!-- tnpeo     : tendency_of_ocean_potential_energy_content                   : not available -->
150     <!-- tnpeot    : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_tides      : not available -->
151     <!-- tnpeotb   : tendency_of_ocean_potential_energy_content_due_to_background : not available -->
152     <field field_ref="avm"     name="difvmo"   long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity"              level="2" />
153     <!-- difvmbo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_background : cte with time, see namelist parameters nn_avb -->
154     <field field_ref="av_tide" name="difvmto"  long_name="ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_tides" level="2" /> <!-- same as tracer -->
155     <!-- difvmfdo : ocean_vertical_momentum_diffusivity_due_to_form_drag : ??? -->
156     <!-- dispkevfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_vertical_friction : not available -->
157   </file>
158   
159   <file id="file12" name_suffix="_grid_W_table2.10" >
160     <!-- if ln_traldf_lap    =  .true. -->
161     <field field_ref="aht2d_eiv" name="diftrblo" long_name="ocean_tracer_bolus_laplacian_diffusivity"                     level="2" />
162     <!-- diftrelo : ocean_tracer_epineutral_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso -->
163     <!-- diftrxylo : ocean_tracer_xy_laplacian_diffusivity : cte with time -->
164     <!-- if ln_traldf_bilap  =  .true. -->
165     <!-- field field_ref="diftrbbo" name="aht2d_eiv" long_name="ocean_tracer_bolus_biharmonic_diffusivity"                    level="2" /-->
166     <!-- diftrebo : ocean_tracer_epineutral_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_traldf_iso -->
167     <!-- diftrxybo : ocean_tracer_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time -->
168     <!-- tnkebto : tendency_of_ocean_eddy_kinetic_energy_content_due_to_bolus_transport : not available -->
169     <!-- difmxylo : ocean_momentum_xy_laplacian_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_lap -->
170     <!-- difmxybo : ocean_momentum_xy_biharmonic_diffusivity : cte with time, see ln_dynldf_bilap -->
171     <!-- dispkexyfo : ocean_kinetic_energy_dissipation_per_unit_area_due_to_xy_friction : not available -->
172   </file>   
173   <!--
174..............................................    scalar   .................................................
175   -->
176   <file id="file13" name_suffix="_scalar_table2.2" >         <!-- scalar -->
177     <field field_ref="masstot"    name="masso"    long_name="sea_water_mass"                                />
178     <field field_ref="voltot"     name="volo"     long_name="sea_water_volume"                              />
179     <field field_ref="sshtot"     name="zosga"    long_name="global_average_sea_level_change"               />
180     <field field_ref="sshsteric"  name="zossga"   long_name="global_average_steric_sea_level_change"        />
181     <field field_ref="sshthster"  name="zostoga"  long_name="global_average_thermosteric_sea_level_change"  />
182     <field field_ref="temptot"    name="thetaoga" long_name="sea_water_potential_temperature"               />
183     <field field_ref="saltot"     name="soga"     long_name="sea_water_salinity"                            />
184   </file>   
185   <!--
186..............................................    icemod   .................................................
187   -->
188   <file id="file14" name_suffix="_icemod_table2.2" >         <!-- scalar -->
189     <field field_ref="ice_pres"                     />
190     <field field_ref="ice_cover"    name="sic"        long_name="sea_ice_area_fraction"                            />
191     <field field_ref="icethic_cea"  name="sit"        long_name="sea_ice_thickness"                                />
192     <field field_ref="subl_ai_cea"  name="evap"       long_name="water_evaporation_flux"                           />
193     <field field_ref="snowthic_cea" name="snd"        long_name="surface_snow_thickness"                           />
194     <!-- snc : surface_snow_area_fraction : same as sic -->
195     <field field_ref="icealb_cea"   name="ialb"       long_name="Bare Sea Ice Albedo"                              />
196     <!-- ssi : Sea Ice Salinity : cte = sice = 6, expect in baltic sea = 2 -->
197     <field field_ref="ist_cea"      name="tsice"      long_name="Surface Temperature of Sea Ice"                   />
198     <!-- tsnint : Temperature at Interface Between Sea Ice and Snow : not available -->
199     <!-- pr : Surface Rainfall Rate into the Sea Ice Portion of the Grid Cell = 0 -->
200     <field field_ref="snow_ai_cea"  name="prsn"       long_name="Surface Snowfall Rate into the Sea Ice Portion of the Grid Cell" />
201     <!-- ageice   : Age of Sea Ice : not available ??? -->
202     <!-- grFrazil : Frazil Sea Ice Growth (Leads) Rate ??? -->
203     <!-- grCongel : Congelation Sea Ice Growth Rate ??? -->
204     <field field_ref="licepro_cea"  name="grLateral"  long_name="Lateral Sea Ice Growth Rate"                      />
205     <field field_ref="sntoice_cea"  name="snoToIce"   long_name="Snow-Ice Formation Rate"                          />
206     <field field_ref="snowmel_cea"  name="snomelt"    long_name="Snow Melt Rate"                                   />
207     <field field_ref="ticemel_cea"  name="tmelt"      long_name="Rate of Melt at Upper Surface of Sea Ice"         />
208     <field field_ref="bicemel_cea"  name="bmelt"      long_name="Rate of Melt at Sea Ice Base"                     />
209     <!-- hcice  : Sea Ice Total Heat Content ??? -->
210     <field field_ref="qsr_ai_cea"   name="rsdssi"     long_name="surface_downwelling_shortwave_flux_in_air"        />
211     <!-- rsussi : surface_upwelling_shortwave_flux_in_air ??? -->
212     <!-- rldssi : surface_downwelling_longwave_flux_in_air ??? -->
213     <!-- rlussi : surface_upwelling_longwave_flux_in_air ??? -->
214     <!-- hfssi  : surface_upward_sensible_heat_flux ??? -->
215     <!-- hflssi : surface_upward_latent_heat_flux ??? -->
216     <field field_ref="subl_ai_cea"  name="sblsi"      long_name="surface_snow_and_ice_sublimation_flux"             />
217     <field field_ref="u_imasstr"    name="transix"    long_name="Eastward Sea Ice Transport"                        />
218     <field field_ref="v_imasstr"    name="transiy"    long_name="Northward Sea Ice Transport"                       />
219     <field field_ref="fram_trans"   name="transifs"   long_name="Sea Ice Mass Transport Through Fram Strait"        />
220     <field field_ref="utau_ice"     name="strairx"    long_name="Eastward Atmospheric Stress On Sea Ice"            />
221     <field field_ref="vtau_ice"     name="strairy"    long_name="Northward Atmospheric Stress On Sea Ice"           />
222     <!-- strocnx : Eastward Ocean Stress On Sea Ice ??? -->
223     <!-- strocny : Northward Ocean Stress On Sea Ice ??? -->
224     <!-- streng  : Compressive Sea Ice Strength ??? -->
225     <!-- divice  : Strain Rate Divergence of Sea Ice ??? -->
226     <!-- shrice  : Strain Rate Shear of Sea Ice ??? -->
227     <!-- ridgice : Sea Ice Ridging Rate ??? -->
228   </file>   
229      </file_group>
230
231      <!--
232+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
233        -->
234    </file_definition>
235   
236    <!--
237============================================================================================================
238=                                           grid definition                                                =
239=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
240============================================================================================================
241    -->
242   
243
244   <axis_definition> 
245      <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" />
246      <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" />
247      <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" />
248      <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" />
249      <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  />
250      <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  />
251   </axis_definition> 
252   
253   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
254   
255   <grid_definition>   
256     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
257     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
258     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
259     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
260     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
261     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
262     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
263     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
264    </grid_definition>   
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266  </context>
267 
268
269  <context id="xios">
270
271      <variable_definition>
272   
273     <!--
274        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8*3 (with jpi and jpj the subdomain size)
275-->
276     <variable id="buffer_size"               type="integer">25000000</variable>
277     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
278     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
279     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
280     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
281     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
282   
283      </variable_definition>
284               
285  </context>
286 
287</simulation>
288 
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.