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iodef.xml in trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00 – NEMO

source: trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml @ 4996

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trunk : New diagnostics in PISCES model, see ticket #1424
  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22
23   <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
24   
25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
26      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
27      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
28      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
29      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
30      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->
31     
32      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files -->
33        <file id="file1" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" >
34           <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
35           <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
36           <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
37           <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field>
38           <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
39           <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
40           <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field>
41           <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field>
42           <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field>
43           <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field>
44        </file>
45      </file_group>
46
47      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
48      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->   
49
50      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files -->
51
52   <file id="file2" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
53          <field field_ref="DIC"      />
54          <field field_ref="Alkalini" />
55          <field field_ref="O2"       />
56          <field field_ref="PO4"      />
57          <field field_ref="Si"       />
58          <field field_ref="Fer"      />
59          <field field_ref="NCHL"     />
60          <field field_ref="DCHL"     />
61          <field field_ref="NO3"      />
62   </file>
63   
64   <file id="file3" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
65          <field field_ref="Cflx"     />
66          <field field_ref="Dpco2"    />
67   </file>
68
69      </file_group>
70      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
71      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
72      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
73      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
74
75      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files -->
76
77   <file id="file4" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
78          <field field_ref="DIC"      />
79          <field field_ref="Alkalini" />
80          <field field_ref="O2"       />
81          <field field_ref="CaCO3"    />
82          <field field_ref="PO4"      />
83          <field field_ref="POC"      />
84          <field field_ref="Si"       />
85          <field field_ref="PHY"      />
86          <field field_ref="ZOO"      />
87          <field field_ref="DOC"      />
88          <field field_ref="PHY2"     />
89          <field field_ref="ZOO2"     />
90          <field field_ref="DSi"      />
91          <field field_ref="Fer"      />
92          <field field_ref="BFe"      />
93          <field field_ref="GOC"      />
94          <field field_ref="SFe"      />
95          <field field_ref="DFe"      />
96          <field field_ref="GSi"      />
97          <field field_ref="NFe"      />
98          <field field_ref="NCHL"     />
99          <field field_ref="DCHL"     />
100          <field field_ref="NO3"      />
101          <field field_ref="NH4"      />
102   </file>
103
104   <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
105          <field field_ref="PH"       />
106          <field field_ref="CO3"      />
107          <field field_ref="CO3sat"   />
108          <field field_ref="PAR"      />
109          <field field_ref="PPPHY"    />
110          <field field_ref="PPPHY2"   />
111          <field field_ref="PPNEWN"   />
112          <field field_ref="PPNEWD"   />
113          <field field_ref="PBSi"     />
114          <field field_ref="PFeN"     />
115          <field field_ref="PFeD"     />
116          <field field_ref="xfracal"  />
117          <field field_ref="PCAL"     />
118          <field field_ref="DCAL"     />
119          <field field_ref="GRAZ1"    />
120          <field field_ref="GRAZ2"    />
121          <field field_ref="EPC100"   />
122          <field field_ref="EPFE100"  />
123          <field field_ref="EPSI100"  />
124          <field field_ref="EPCAL100" />
125          <field field_ref="Cflx"     />
126          <field field_ref="Oflx"     />
127          <field field_ref="Kg"       />
128          <field field_ref="Dpco2"    />
129          <field field_ref="Dpo2"     />
130          <field field_ref="Heup"     />
131          <field field_ref="Irondep"  />
132          <field field_ref="Ironsed"  />
133          <field field_ref="Ironice"  />
134          <field field_ref="Nfix"     />
135          <field field_ref="MuN"      />
136          <field field_ref="MuD"      />
137          <field field_ref="LNnut"    />
138          <field field_ref="LDnut"    />
139          <field field_ref="LNFe"     />
140          <field field_ref="LDFe"     />
141          <field field_ref="LNlight"  />
142          <field field_ref="LDlight"  />
143          <field field_ref="pdust"    />
144          <field field_ref="Fe2"      />
145          <field field_ref="Fe3"      />
146          <field field_ref="FeL1"     />
147          <field field_ref="FeL2"     />
148          <field field_ref="FeP"      />
149          <field field_ref="TL1"      />
150          <field field_ref="TL2"      />
151          <field field_ref="Sdenit"   />
152          <field field_ref="Totlig"   />
153   </file>
154
155      </file_group>
156      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
157      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
158      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
159
160   </file_definition>
161   
162    <!--
163============================================================================================================
164= grid definition = = DO NOT CHANGE =
165============================================================================================================
166    -->
167   
168   <axis_definition> 
169      <axis id="deptht" long_name="Vertical T levels" unit="m" positive="down" />
170      <axis id="depthu" long_name="Vertical U levels" unit="m" positive="down" />
171      <axis id="depthv" long_name="Vertical V levels" unit="m" positive="down" />
172      <axis id="depthw" long_name="Vertical W levels" unit="m" positive="down" />
173      <axis id="nfloat" long_name="Float number"      unit="-"  />
174      <axis id="icbcla" long_name="Iceberg class"     unit="-"  />
175   </axis_definition> 
176   
177   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
178   
179   <grid_definition>   
180     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
181     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
182     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
183     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
184     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
185     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
186     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
187     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
188    </grid_definition>   
189 
190  </context>
191 
192
193  <context id="xios">
194
195      <variable_definition>
196   
197     <!--
198        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
199-->
200     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable>
201     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
202     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
203     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
204     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
205     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
206   
207      </variable_definition>
208               
209  </context>
210 
211</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.