New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iom.F90 in trunk/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/IOM – NEMO

source: trunk/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/IOM/iom.F90 @ 4145

Last change on this file since 4145 was 4145, checked in by hadcv, 11 years ago

Ticket #1157 (C1D fixes): redo the fix for #1096 to work for XIOS detached mode and add xios_context_finalize.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 74.2 KB
Line 
1MODULE iom
2   !!=====================================================================
3   !!                    ***  MODULE  iom ***
4   !! Input/Output manager :  Library to read input files
5   !!====================================================================
6   !! History :  2.0  ! 2005-12  (J. Belier) Original code
7   !!            2.0  ! 2006-02  (S. Masson) Adaptation to NEMO
8   !!            3.0  ! 2007-07  (D. Storkey) Changes to iom_gettime
9   !!            3.4  ! 2012-12  (R. Bourdalle-Badie and G. Reffray)  add C1D case 
10   !!--------------------------------------------------------------------
11
12   !!--------------------------------------------------------------------
13   !!   iom_open       : open a file read only
14   !!   iom_close      : close a file or all files opened by iom
15   !!   iom_get        : read a field (interfaced to several routines)
16   !!   iom_gettime    : read the time axis cdvar in the file
17   !!   iom_varid      : get the id of a variable in a file
18   !!   iom_rstput     : write a field in a restart file (interfaced to several routines)
19   !!--------------------------------------------------------------------
20   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
21   USE c1d             ! 1D vertical configuration
22   USE flo_oce         ! floats module declarations
23   USE lbclnk          ! lateal boundary condition / mpp exchanges
24   USE iom_def         ! iom variables definitions
25   USE iom_ioipsl      ! NetCDF format with IOIPSL library
26   USE iom_nf90        ! NetCDF format with native NetCDF library
27   USE iom_rstdimg     ! restarts access direct format "dimg" style...
28   USE in_out_manager  ! I/O manager
29   USE lib_mpp           ! MPP library
30#if defined key_iomput
31   USE sbc_oce, ONLY :   nn_fsbc         ! ocean space and time domain
32   USE trc_oce, ONLY :   nn_dttrc        !  !: frequency of step on passive tracers
33   USE icb_oce, ONLY :   class_num       !  !: iceberg classes
34   USE domngb          ! ocean space and time domain
35   USE phycst          ! physical constants
36   USE dianam          ! build name of file
37   USE xios
38# endif
39   USE ioipsl, ONLY :  ju2ymds    ! for calendar
40
41   IMPLICIT NONE
42   PUBLIC   !   must be public to be able to access iom_def through iom
43   
44#if defined key_iomput
45   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .TRUE.        !: iom_put flag
46#else
47   LOGICAL, PUBLIC, PARAMETER ::   lk_iomput = .FALSE.       !: iom_put flag
48#endif
49   PUBLIC iom_init, iom_swap, iom_open, iom_close, iom_setkt, iom_varid, iom_get, iom_gettime, iom_rstput, iom_put
50   PUBLIC iom_getatt
51
52   PRIVATE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
53   PRIVATE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d, iom_get_123d
54   PRIVATE iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
55#if defined key_iomput
56   PRIVATE iom_set_domain_attr, iom_set_axis_attr, iom_set_field_attr, iom_set_file_attr, iom_get_file_attr, iom_set_grid_attr
57   PRIVATE set_grid, set_scalar, set_xmlatt, set_mooring, iom_update_file_name, iom_sdate
58# endif
59
60   INTERFACE iom_get
61      MODULE PROCEDURE iom_g0d, iom_g1d, iom_g2d, iom_g3d
62   END INTERFACE
63   INTERFACE iom_getatt
64      MODULE PROCEDURE iom_g0d_intatt
65   END INTERFACE
66   INTERFACE iom_rstput
67      MODULE PROCEDURE iom_rp0d, iom_rp1d, iom_rp2d, iom_rp3d
68   END INTERFACE
69  INTERFACE iom_put
70     MODULE PROCEDURE iom_p0d, iom_p1d, iom_p2d, iom_p3d
71  END INTERFACE
72#if defined key_iomput
73   INTERFACE iom_setkt
74      MODULE PROCEDURE xios_update_calendar
75   END INTERFACE
76# endif
77
78   !!----------------------------------------------------------------------
79   !! NEMO/OPA 3.3 , NEMO Consortium (2010)
80   !! $Id$
81   !! Software governed by the CeCILL licence (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
82   !!----------------------------------------------------------------------
83
84CONTAINS
85
86   SUBROUTINE iom_init
87      !!----------------------------------------------------------------------
88      !!                     ***  ROUTINE   ***
89      !!
90      !! ** Purpose :   
91      !!
92      !!----------------------------------------------------------------------
93#if defined key_iomput
94      TYPE(xios_time)   :: dtime    = xios_time(0, 0, 0, 0, 0, 0)
95      CHARACTER(len=19) :: cldate 
96      CHARACTER(len=10) :: clname
97      INTEGER           ::   ji
98      !!----------------------------------------------------------------------
99
100      clname = "nemo"
101      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) /= '0' )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname)
102      CALL xios_context_initialize(TRIM(clname), mpi_comm_opa)
103      CALL iom_swap
104
105      ! calendar parameters
106      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
107      CASE ( 1)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "Gregorian")
108      CASE ( 0)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "NoLeap")
109      CASE (30)   ;   CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), calendar_type= "D360")
110      END SELECT
111      WRITE(cldate,"(i4.4,'-',i2.2,'-',i2.2,' 00:00:00')") nyear,nmonth,nday 
112      CALL xios_set_context_attr(TRIM(clname), start_date=cldate )
113
114      ! horizontal grid definition
115      CALL set_scalar
116      CALL set_grid( "T", glamt, gphit ) 
117      CALL set_grid( "U", glamu, gphiu )
118      CALL set_grid( "V", glamv, gphiv )
119      CALL set_grid( "W", glamt, gphit )
120
121      ! vertical grid definition
122      CALL iom_set_axis_attr( "deptht", gdept_0 )
123      CALL iom_set_axis_attr( "depthu", gdept_0 )
124      CALL iom_set_axis_attr( "depthv", gdept_0 )
125      CALL iom_set_axis_attr( "depthw", gdepw_0 )
126# if defined key_floats
127      CALL iom_set_axis_attr( "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nfloat) /) )
128# endif
129      CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num )
130     
131      ! automatic definitions of some of the xml attributs
132      CALL set_xmlatt
133
134      ! end file definition
135      dtime%second = rdt
136      CALL xios_set_timestep(dtime)
137      CALL xios_close_context_definition()
138     
139      CALL xios_update_calendar(0)
140#endif
141     
142   END SUBROUTINE iom_init
143
144
145   SUBROUTINE iom_swap
146      !!---------------------------------------------------------------------
147      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_swap  ***
148      !!
149      !! ** Purpose :  swap context between different agrif grid for xmlio_server
150      !!---------------------------------------------------------------------
151#if defined key_iomput
152      TYPE(xios_context) :: nemo_hdl
153
154     IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
155        CALL xios_get_handle("nemo",nemo_hdl)
156     ELSE
157        CALL xios_get_handle(TRIM(Agrif_CFixed())//"_nemo",nemo_hdl)
158     ENDIF
159     CALL xios_set_current_context(nemo_hdl)
160
161#endif
162   END SUBROUTINE iom_swap
163
164
165   SUBROUTINE iom_open( cdname, kiomid, ldwrt, kdom, kiolib, ldstop, ldiof )
166      !!---------------------------------------------------------------------
167      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_open  ***
168      !!
169      !! ** Purpose :  open an input file (return 0 if not found)
170      !!---------------------------------------------------------------------
171      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )           ::   cdname   ! File name
172      INTEGER         , INTENT(  out)           ::   kiomid   ! iom identifier of the opened file
173      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldwrt    ! open in write modeb          (default = .FALSE.)
174      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kdom     ! Type of domain to be written (default = jpdom_local_noovlap)
175      INTEGER         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kiolib   ! library used to open the file (default = jpnf90)
176      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if open to read a non-existing file (default = .TRUE.)
177      LOGICAL         , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldiof    ! Interp On the Fly, needed for AGRIF (default = .FALSE.)
178
179      CHARACTER(LEN=256)    ::   clname    ! the name of the file based on cdname [[+clcpu]+clcpu]
180      CHARACTER(LEN=256)    ::   cltmpn    ! tempory name to store clname (in writting mode)
181      CHARACTER(LEN=10)     ::   clsuffix  ! ".nc" or ".dimg"
182      CHARACTER(LEN=15)     ::   clcpu     ! the cpu number (max jpmax_digits digits)
183      CHARACTER(LEN=256)    ::   clinfo    ! info character
184      LOGICAL               ::   llok      ! check the existence
185      LOGICAL               ::   llwrt     ! local definition of ldwrt
186      LOGICAL               ::   llnoov    ! local definition to read overlap
187      LOGICAL               ::   llstop    ! local definition of ldstop
188      LOGICAL               ::   lliof     ! local definition of ldiof
189      INTEGER               ::   iolib     ! library do we use to open the file
190      INTEGER               ::   icnt      ! counter for digits in clcpu (max = jpmax_digits)
191      INTEGER               ::   iln, ils  ! lengths of character
192      INTEGER               ::   idom      ! type of domain
193      INTEGER               ::   istop     !
194      INTEGER, DIMENSION(2,5) ::   idompar ! domain parameters:
195      ! local number of points for x,y dimensions
196      ! position of first local point for x,y dimensions
197      ! position of last local point for x,y dimensions
198      ! start halo size for x,y dimensions
199      ! end halo size for x,y dimensions
200      !---------------------------------------------------------------------
201      ! Initializations and control
202      ! =============
203      kiomid = -1
204      clinfo = '                    iom_open ~~~  '
205      istop = nstop
206      ! if iom_open is called for the first time: initialize iom_file(:)%nfid to 0
207      ! (could be done when defining iom_file in f95 but not in f90)
208      IF( Agrif_Root() ) THEN
209         IF( iom_open_init == 0 ) THEN
210            iom_file(:)%nfid = 0
211            iom_open_init = 1
212         ENDIF
213      ENDIF
214      ! do we read or write the file?
215      IF( PRESENT(ldwrt) ) THEN   ;   llwrt = ldwrt
216      ELSE                        ;   llwrt = .FALSE.
217      ENDIF
218      ! do we call ctl_stop if we try to open a non-existing file in read mode?
219      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
220      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
221      ENDIF
222      ! what library do we use to open the file?
223      IF( PRESENT(kiolib) ) THEN   ;   iolib = kiolib
224      ELSE                         ;   iolib = jpnf90
225      ENDIF
226      ! are we using interpolation on the fly?
227      IF( PRESENT(ldiof) ) THEN   ;   lliof = ldiof
228      ELSE                        ;   lliof = .FALSE.
229      ENDIF
230      ! do we read the overlap
231      ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
232      llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
233      ! create the file name by added, if needed, TRIM(Agrif_CFixed()) and TRIM(clsuffix)
234      ! =============
235      clname   = trim(cdname)
236      IF ( .NOT. Agrif_Root() .AND. .NOT. lliof ) THEN
237         iln    = INDEX(clname,'/') 
238         cltmpn = clname(1:iln)
239         clname = clname(iln+1:LEN_TRIM(clname))
240         clname=TRIM(cltmpn)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(clname)
241      ENDIF
242      ! which suffix should we use?
243      SELECT CASE (iolib)
244      CASE (jpioipsl ) ;   clsuffix = '.nc'
245      CASE (jpnf90   ) ;   clsuffix = '.nc'
246      CASE (jprstdimg) ;   clsuffix = '.dimg'
247      CASE DEFAULT     ;   clsuffix = ''
248         CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
249      END SELECT
250      ! Add the suffix if needed
251      iln = LEN_TRIM(clname)
252      ils = LEN_TRIM(clsuffix)
253      IF( iln <= ils .OR. INDEX( TRIM(clname), TRIM(clsuffix), back = .TRUE. ) /= iln - ils + 1 )   &
254         &   clname = TRIM(clname)//TRIM(clsuffix)
255      cltmpn = clname   ! store this name
256      ! try to find if the file to be opened already exist
257      ! =============
258      INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
259      IF( .NOT.llok ) THEN
260         ! we try to add the cpu number to the name
261         IF( iolib == jprstdimg ) THEN   ;   WRITE(clcpu,*) narea
262         ELSE                            ;   WRITE(clcpu,*) narea-1
263         ENDIF
264         clcpu  = TRIM(ADJUSTL(clcpu))
265         iln = INDEX(clname,TRIM(clsuffix), back = .TRUE.)
266         clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
267         icnt = 0
268         INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok ) 
269         ! we try different formats for the cpu number by adding 0
270         DO WHILE( .NOT.llok .AND. icnt < jpmax_digits )
271            clcpu  = "0"//trim(clcpu)
272            clname = clname(1:iln-1)//'_'//TRIM(clcpu)//TRIM(clsuffix)
273            INQUIRE( FILE = clname, EXIST = llok )
274            icnt = icnt + 1
275         END DO
276      ENDIF
277      IF( llwrt ) THEN
278         ! check the domain definition
279! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
280!         idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
281         IF( llnoov ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap   ! default definition
282         ELSE                ;   idom = jpdom_local_full      ! default definition
283         ENDIF
284         IF( PRESENT(kdom) )   idom = kdom
285         ! create the domain informations
286         ! =============
287         SELECT CASE (idom)
288         CASE (jpdom_local_full)
289            idompar(:,1) = (/ jpi             , jpj              /)
290            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
291            idompar(:,3) = (/ nimpp + jpi - 1 , njmpp + jpj - 1  /)
292            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
293            idompar(:,5) = (/ jpi - nlei      , jpj - nlej       /)
294         CASE (jpdom_local_noextra)
295            idompar(:,1) = (/ nlci            , nlcj             /)
296            idompar(:,2) = (/ nimpp           , njmpp            /)
297            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlci - 1, njmpp + nlcj - 1 /)
298            idompar(:,4) = (/ nldi - 1        , nldj - 1         /)
299            idompar(:,5) = (/ nlci - nlei     , nlcj - nlej      /)
300         CASE (jpdom_local_noovlap)
301            idompar(:,1) = (/ nlei  - nldi + 1, nlej  - nldj + 1 /)
302            idompar(:,2) = (/ nimpp + nldi - 1, njmpp + nldj - 1 /)
303            idompar(:,3) = (/ nimpp + nlei - 1, njmpp + nlej - 1 /)
304            idompar(:,4) = (/ 0               , 0                /)
305            idompar(:,5) = (/ 0               , 0                /)
306         CASE DEFAULT
307            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'wrong value of kdom, only jpdom_local* cases are accepted' )
308         END SELECT
309      ENDIF
310      ! Open the NetCDF or RSTDIMG file
311      ! =============
312      ! do we have some free file identifier?
313      IF( MINVAL(iom_file(:)%nfid) /= 0 )   &
314         &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'No more free file identifier', 'increase jpmax_files in iom_def' )
315      ! if no file was found...
316      IF( .NOT. llok ) THEN
317         IF( .NOT. llwrt ) THEN   ! we are in read mode
318            IF( llstop ) THEN   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'File '//TRIM(cltmpn)//'* not found' )
319            ELSE                ;   istop = nstop + 1   ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
320            ENDIF
321         ELSE                     ! we are in write mode so we
322            clname = cltmpn       ! get back the file name without the cpu number
323         ENDIF
324      ELSE
325         IF( llwrt .AND. .NOT. ln_clobber ) THEN   ! we stop as we want to write in a new file
326            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'We want to write in a new file but '//TRIM(clname)//' already exists...' )
327            istop = nstop + 1                      ! make sure that istop /= nstop so we don't open the file
328         ENDIF
329      ENDIF
330      IF( istop == nstop ) THEN   ! no error within this routine
331         SELECT CASE (iolib)
332         CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_open(  clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
333         CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_open(    clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
334         CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_open( clname, kiomid, llwrt, llok, idompar )
335         CASE DEFAULT
336            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
337         END SELECT
338      ENDIF
339      !
340   END SUBROUTINE iom_open
341
342
343   SUBROUTINE iom_close( kiomid )
344      !!--------------------------------------------------------------------
345      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_close  ***
346      !!
347      !! ** Purpose : close an input file, or all files opened by iom
348      !!--------------------------------------------------------------------
349      INTEGER, INTENT(inout), OPTIONAL ::   kiomid   ! iom identifier of the file to be closed
350      !                                              ! return 0 when file is properly closed
351      !                                              ! No argument: all files opened by iom are closed
352
353      INTEGER ::   jf         ! dummy loop indices
354      INTEGER ::   i_s, i_e   ! temporary integer
355      CHARACTER(LEN=100)    ::   clinfo    ! info character
356      !---------------------------------------------------------------------
357      !
358      clinfo = '                    iom_close ~~~  '
359      IF( PRESENT(kiomid) ) THEN
360         i_s = kiomid
361         i_e = kiomid
362      ELSE
363         i_s = 1
364         i_e = jpmax_files
365      ENDIF
366
367      IF( i_s > 0 ) THEN
368         DO jf = i_s, i_e
369            IF( iom_file(jf)%nfid > 0 ) THEN
370               SELECT CASE (iom_file(jf)%iolib)
371               CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_close(  jf )
372               CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_close(    jf )
373               CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_close( jf )
374               CASE DEFAULT
375                  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
376               END SELECT
377               iom_file(jf)%nfid       = 0          ! free the id
378               IF( PRESENT(kiomid) )   kiomid = 0   ! return 0 as id to specify that the file was closed
379               IF(lwp) WRITE(numout,*) TRIM(clinfo)//' close file: '//TRIM(iom_file(jf)%name)//' ok'
380            ELSEIF( PRESENT(kiomid) ) THEN
381               WRITE(ctmp1,*) '--->',  kiomid
382               CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' Invalid file identifier', ctmp1 )
383            ENDIF
384         END DO
385      ENDIF
386      !   
387   END SUBROUTINE iom_close
388
389
390   FUNCTION iom_varid ( kiomid, cdvar, kdimsz, ldstop ) 
391      !!-----------------------------------------------------------------------
392      !!                  ***  FUNCTION  iom_varid  ***
393      !!
394      !! ** Purpose : get the id of a variable in a file (return 0 if not found)
395      !!-----------------------------------------------------------------------
396      INTEGER              , INTENT(in   )           ::   kiomid   ! file Identifier
397      CHARACTER(len=*)     , INTENT(in   )           ::   cdvar    ! name of the variable
398      INTEGER, DIMENSION(:), INTENT(  out), OPTIONAL ::   kdimsz   ! size of the dimensions
399      LOGICAL              , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldstop   ! stop if looking for non-existing variable (default = .TRUE.)
400      !
401      INTEGER                        ::   iom_varid, iiv, i_nvd
402      LOGICAL                        ::   ll_fnd
403      CHARACTER(LEN=100)             ::   clinfo                   ! info character
404      LOGICAL                        ::   llstop                   ! local definition of ldstop
405      !!-----------------------------------------------------------------------
406      iom_varid = 0                         ! default definition
407      ! do we call ctl_stop if we look for non-existing variable?
408      IF( PRESENT(ldstop) ) THEN   ;   llstop = ldstop
409      ELSE                         ;   llstop = .TRUE.
410      ENDIF
411      !
412      IF( kiomid > 0 ) THEN
413         clinfo = 'iom_varid, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(cdvar)
414         IF( iom_file(kiomid)%nfid == 0 ) THEN
415            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the file is not open' )
416         ELSE
417            ll_fnd  = .FALSE.
418            iiv = 0
419            !
420            DO WHILE ( .NOT.ll_fnd .AND. iiv < iom_file(kiomid)%nvars )
421               iiv = iiv + 1
422               ll_fnd  = ( TRIM(cdvar) == TRIM(iom_file(kiomid)%cn_var(iiv)) )
423            END DO
424            !
425            IF( .NOT.ll_fnd ) THEN
426               iiv = iiv + 1
427               IF( iiv <= jpmax_vars ) THEN
428                  SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
429                  CASE (jpioipsl )   ;   iom_varid = iom_ioipsl_varid( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz )
430                  CASE (jpnf90   )   ;   iom_varid = iom_nf90_varid  ( kiomid, cdvar, iiv, kdimsz )
431                  CASE (jprstdimg)   ;   iom_varid = -1   ! all variables are listed in iom_file
432                  CASE DEFAULT   
433                     CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
434                  END SELECT
435               ELSE
436                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'Too many variables in the file '//iom_file(kiomid)%name,   &
437                        &                         'increase the parameter jpmax_vars')
438               ENDIF
439               IF( llstop .AND. iom_varid == -1 )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' not found' ) 
440            ELSE
441               iom_varid = iiv
442               IF( PRESENT(kdimsz) ) THEN
443                  i_nvd = iom_file(kiomid)%ndims(iiv)
444                  IF( i_nvd == size(kdimsz) ) THEN
445                     kdimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(1:i_nvd,iiv)
446                  ELSE
447                     WRITE(ctmp1,*) i_nvd, size(kdimsz)
448                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'error in kdimsz size'//trim(ctmp1) )
449                  ENDIF
450               ENDIF
451            ENDIF
452         ENDIF
453      ENDIF
454      !
455   END FUNCTION iom_varid
456
457
458   !!----------------------------------------------------------------------
459   !!                   INTERFACE iom_get
460   !!----------------------------------------------------------------------
461   SUBROUTINE iom_g0d( kiomid, cdvar, pvar )
462      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
463      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable
464      REAL(wp)        , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
465      !
466      INTEGER               :: idvar   ! variable id
467      !
468      IF( kiomid > 0 ) THEN
469         idvar = iom_varid( kiomid, cdvar )
470         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 .AND. idvar > 0 ) THEN
471            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
472            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_get(  kiomid, idvar, pvar )
473            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_get(    kiomid, idvar, pvar )
474            CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_get( kiomid, idvar, pvar )
475            CASE DEFAULT   
476               CALL ctl_stop( 'iom_g0d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
477            END SELECT
478         ENDIF
479      ENDIF
480   END SUBROUTINE iom_g0d
481
482   SUBROUTINE iom_g1d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount )
483      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file
484      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read
485      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                         ::   cdvar     ! Name of the variable
486      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:)           ::   pvar      ! read field
487      INTEGER         , INTENT(in   )              , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
488      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
489      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
490      !
491      IF( kiomid > 0 ) THEN
492         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=pvar,   &
493              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount )
494      ENDIF
495   END SUBROUTINE iom_g1d
496
497   SUBROUTINE iom_g2d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount )
498      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kiomid    ! Identifier of the file
499      INTEGER         , INTENT(in   )                           ::   kdom      ! Type of domain to be read
500      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                           ::   cdvar     ! Name of the variable
501      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:)           ::   pvar      ! read field
502      INTEGER         , INTENT(in   )                , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
503      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
504      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2)  , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
505      !
506      IF( kiomid > 0 ) THEN
507         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r2d=pvar,   &
508              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount )
509      ENDIF
510   END SUBROUTINE iom_g2d
511
512   SUBROUTINE iom_g3d( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount )
513      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kiomid    ! Identifier of the file
514      INTEGER         , INTENT(in   )                             ::   kdom      ! Type of domain to be read
515      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                             ::   cdvar     ! Name of the variable
516      REAL(wp)        , INTENT(  out), DIMENSION(:,:,:)           ::   pvar      ! read field
517      INTEGER         , INTENT(in   )                  , OPTIONAL ::   ktime     ! record number
518      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading
519      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3)    , OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis
520      !
521      IF( kiomid > 0 ) THEN
522         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r3d=pvar,   &
523              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount )
524      ENDIF
525   END SUBROUTINE iom_g3d
526   !!----------------------------------------------------------------------
527
528   SUBROUTINE iom_get_123d( kiomid, kdom  , cdvar ,   &
529         &                  pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d,   &
530         &                  ktime , kstart, kcount  )
531      !!-----------------------------------------------------------------------
532      !!                  ***  ROUTINE  iom_get_123d  ***
533      !!
534      !! ** Purpose : read a 1D/2D/3D variable
535      !!
536      !! ** Method : read ONE record at each CALL
537      !!-----------------------------------------------------------------------
538      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kiomid     ! Identifier of the file
539      INTEGER                    , INTENT(in   )           ::   kdom       ! Type of domain to be read
540      CHARACTER(len=*)           , INTENT(in   )           ::   cdvar      ! Name of the variable
541      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r1d     ! read field (1D case)
542      REAL(wp), DIMENSION(:,:)   , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r2d     ! read field (2D case)
543      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:) , INTENT(  out), OPTIONAL ::   pv_r3d     ! read field (3D case)
544      INTEGER                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ktime      ! record number
545      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kstart     ! start position of the reading in each axis
546      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kcount     ! number of points to be read in each axis
547      !
548      LOGICAL                        ::   llnoov      ! local definition to read overlap
549      INTEGER                        ::   jl          ! loop on number of dimension
550      INTEGER                        ::   idom        ! type of domain
551      INTEGER                        ::   idvar       ! id of the variable
552      INTEGER                        ::   inbdim      ! number of dimensions of the variable
553      INTEGER                        ::   idmspc      ! number of spatial dimensions
554      INTEGER                        ::   itime       ! record number
555      INTEGER                        ::   istop       ! temporary value of nstop
556      INTEGER                        ::   ix1, ix2, iy1, iy2   ! subdomain indexes
557      INTEGER                        ::   ji, jj      ! loop counters
558      INTEGER                        ::   irankpv       !
559      INTEGER                        ::   ind1, ind2  ! substring index
560      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   istart      ! starting point to read for each axis
561      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   icnt        ! number of value to read along each axis
562      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   idimsz      ! size of the dimensions of the variable
563      INTEGER, DIMENSION(jpmax_dims) ::   ishape      ! size of the dimensions of the variable
564      REAL(wp)                       ::   zscf, zofs  ! sacle_factor and add_offset
565      INTEGER                        ::   itmp        ! temporary integer
566      CHARACTER(LEN=256)             ::   clinfo      ! info character
567      CHARACTER(LEN=256)             ::   clname      ! file name
568      CHARACTER(LEN=1)               ::   clrankpv, cldmspc      !
569      !---------------------------------------------------------------------
570      !
571      clname = iom_file(kiomid)%name   !   esier to read
572      clinfo = '          iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar)
573      ! local definition of the domain ?
574      idom = kdom
575      ! do we read the overlap
576      ! ugly patch SM+JMM+RB to overwrite global definition in some cases
577      llnoov = (jpni * jpnj ) == jpnij .AND. .NOT. lk_agrif 
578      ! check kcount and kstart optionals parameters...
579      IF( PRESENT(kcount) .AND. (.NOT. PRESENT(kstart)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kcount present needs kstart present')
580      IF( PRESENT(kstart) .AND. (.NOT. PRESENT(kcount)) ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kcount present')
581      IF( PRESENT(kstart) .AND. idom /= jpdom_unknown   ) CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'kstart present needs kdom = jpdom_unknown')
582
583      ! Search for the variable in the data base (eventually actualize data)
584      istop = nstop
585      idvar = iom_varid( kiomid, cdvar )
586      !
587      IF( idvar > 0 ) THEN
588         ! to write iom_file(kiomid)%dimsz in a shorter way !
589         idimsz(:) = iom_file(kiomid)%dimsz(:, idvar) 
590         inbdim = iom_file(kiomid)%ndims(idvar)            ! number of dimensions in the file
591         idmspc = inbdim                                   ! number of spatial dimensions in the file
592         IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) )   idmspc = inbdim - 1
593         IF( idmspc > 3 )   CALL ctl_stop(trim(clinfo), 'the file has more than 3 spatial dimensions this case is not coded...') 
594         !
595         ! update idom definition...
596         ! Identify the domain in case of jpdom_auto(glo/dta) definition
597         IF( idom == jpdom_autoglo .OR. idom == jpdom_autodta ) THEN           
598            IF( idom == jpdom_autoglo ) THEN   ;   idom = jpdom_global 
599            ELSE                               ;   idom = jpdom_data
600            ENDIF
601            ind1 = INDEX( clname, '_', back = .TRUE. ) + 1
602            ind2 = INDEX( clname, '.', back = .TRUE. ) - 1
603            IF( ind2 > ind1 ) THEN   ;   IF( VERIFY( clname(ind1:ind2), '0123456789' ) == 0 )   idom = jpdom_local   ;   ENDIF
604         ENDIF
605         ! Identify the domain in case of jpdom_local definition
606         IF( idom == jpdom_local ) THEN
607            IF(     idimsz(1) == jpi               .AND. idimsz(2) == jpj               ) THEN   ;   idom = jpdom_local_full
608            ELSEIF( idimsz(1) == nlci              .AND. idimsz(2) == nlcj              ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noextra
609            ELSEIF( idimsz(1) == (nlei - nldi + 1) .AND. idimsz(2) == (nlej - nldj + 1) ) THEN   ;   idom = jpdom_local_noovlap
610            ELSE   ;   CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'impossible to identify the local domain' )
611            ENDIF
612         ENDIF
613         !
614         ! check the consistency between input array and data rank in the file
615         !
616         ! initializations
617         itime = 1
618         IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime
619
620         irankpv = 1 * COUNT( (/PRESENT(pv_r1d)/) ) + 2 * COUNT( (/PRESENT(pv_r2d)/) ) + 3 * COUNT( (/PRESENT(pv_r3d)/) )
621         WRITE(clrankpv, fmt='(i1)') irankpv
622         WRITE(cldmspc , fmt='(i1)') idmspc
623         !
624         IF(     idmspc <  irankpv ) THEN
625            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'The file has only '//cldmspc//' spatial dimension',   &
626               &                         'it is impossible to read a '//clrankpv//'D array from this file...' )
627         ELSEIF( idmspc == irankpv ) THEN
628            IF( PRESENT(pv_r1d) .AND. idom /= jpdom_unknown )   &
629               &   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'case not coded...You must use jpdom_unknown' )
630         ELSEIF( idmspc >  irankpv ) THEN
631               IF( PRESENT(pv_r2d) .AND. itime == 1 .AND. idimsz(3) == 1 .AND. idmspc == 3 ) THEN
632                  CALL ctl_warn( trim(clinfo), '2D array but 3 spatial dimensions for the data...'              ,   &
633                        &         'As the size of the z dimension is 1 and as we try to read the first record, ',   &
634                        &         'we accept this case, even if there is a possible mix-up between z and time dimension' )   
635                  idmspc = idmspc - 1
636               ELSE
637                  CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'To keep iom lisibility, when reading a '//clrankpv//'D array,'         ,   &
638                     &                         'we do not accept data with more than '//cldmspc//' spatial dimension',   &
639                     &                         'Use ncwa -a to suppress the unnecessary dimensions' )
640               ENDIF
641         ENDIF
642
643         !
644         ! definition of istart and icnt
645         !
646         icnt  (:) = 1
647         istart(:) = 1
648         istart(idmspc+1) = itime
649
650         IF(              PRESENT(kstart)       ) THEN ; istart(1:idmspc) = kstart(1:idmspc) ; icnt(1:idmspc) = kcount(1:idmspc)
651         ELSE
652            IF(           idom == jpdom_unknown ) THEN                                       ; icnt(1:idmspc) = idimsz(1:idmspc)
653            ELSE
654               IF( .NOT. PRESENT(pv_r1d) ) THEN   !   not a 1D array
655                  IF(     idom == jpdom_data    ) THEN ; istart(1:2) = (/ mig(1), mjg(1) /)  ! icnt(1:2) done bellow
656                  ELSEIF( idom == jpdom_global  ) THEN ; istart(1:2) = (/ nimpp , njmpp  /)  ! icnt(1:2) done bellow
657                  ENDIF
658                  ! we do not read the overlap                     -> we start to read at nldi, nldj
659! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
660!                  IF( idom /= jpdom_local_noovlap )   istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
661                  IF( llnoov .AND. idom /= jpdom_local_noovlap ) istart(1:2) = istart(1:2) + (/ nldi - 1, nldj - 1 /)
662                  ! we do not read the overlap and the extra-halos -> from nldi to nlei and from nldj to nlej
663! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
664!                  icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
665                  IF( llnoov ) THEN   ;   icnt(1:2) = (/ nlei - nldi + 1, nlej - nldj + 1 /)
666                  ELSE                ;   icnt(1:2) = (/ nlci           , nlcj            /)
667                  ENDIF
668                  IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
669                     IF( idom == jpdom_data ) THEN   ; icnt(3) = jpkdta
670                     ELSE                            ; icnt(3) = jpk
671                     ENDIF
672                  ENDIF
673               ENDIF
674            ENDIF
675         ENDIF
676
677         ! check that istart and icnt can be used with this file
678         !-
679         DO jl = 1, jpmax_dims
680            itmp = istart(jl)+icnt(jl)-1
681            IF( itmp > idimsz(jl) .AND. idimsz(jl) /= 0 ) THEN
682               WRITE( ctmp1, FMT="('(istart(', i1, ') + icnt(', i1, ') - 1) = ', i5)" ) jl, jl, itmp
683               WRITE( ctmp2, FMT="(' is larger than idimsz(', i1,') = ', i5)"         ) jl, idimsz(jl)
684               CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'start and count too big regarding to the size of the data, ', ctmp1, ctmp2 )     
685            ENDIF
686         END DO
687
688         ! check that icnt matches the input array
689         !-     
690         IF( idom == jpdom_unknown ) THEN
691            IF( irankpv == 1 )        ishape(1:1) = SHAPE(pv_r1d)
692            IF( irankpv == 2 )        ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d)
693            IF( irankpv == 3 )        ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d)
694            ctmp1 = 'd'
695         ELSE
696            IF( irankpv == 2 ) THEN
697! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
698!               ishape(1:2) = SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  ))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej)'
699               IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(nldi:nlei,nldj:nlej  )) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej)'
700               ELSE              ; ishape(1:2)=SHAPE(pv_r2d(1   :nlci,1   :nlcj  )) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj)'
701               ENDIF
702            ENDIF
703            IF( irankpv == 3 ) THEN 
704! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
705!               ishape(1:3) = SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:))   ;   ctmp1 = 'd(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
706               IF( llnoov ) THEN ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)) ; ctmp1='d(nldi:nlei,nldj:nlej,:)'
707               ELSE              ; ishape(1:3)=SHAPE(pv_r3d(1   :nlci,1   :nlcj,:)) ; ctmp1='d(1:nlci,1:nlcj,:)'
708               ENDIF
709            ENDIF
710         ENDIF
711         
712         DO jl = 1, irankpv
713            WRITE( ctmp2, FMT="(', ', i1,'): ', i5,' /= icnt(', i1,'):', i5)" ) jl, ishape(jl), jl, icnt(jl)
714            IF( ishape(jl) /= icnt(jl) )   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo), 'size(pv_r'//clrankpv//TRIM(ctmp1)//TRIM(ctmp2) )
715         END DO
716
717      ENDIF
718
719      ! read the data
720      !-     
721      IF( idvar > 0 .AND. istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
722         !
723         ! find the right index of the array to be read
724! JMM + SM: ugly patch before getting the new version of lib_mpp)
725!         IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
726!         ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
727!         ENDIF
728         IF( llnoov ) THEN
729            IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = nldi   ;   ix2 = nlei      ;   iy1 = nldj   ;   iy2 = nlej
730            ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
731            ENDIF
732         ELSE
733            IF( idom /= jpdom_unknown ) THEN   ;   ix1 = 1      ;   ix2 = nlci      ;   iy1 = 1      ;   iy2 = nlcj
734            ELSE                               ;   ix1 = 1      ;   ix2 = icnt(1)   ;   iy1 = 1      ;   iy2 = icnt(2)
735            ENDIF
736         ENDIF
737     
738         SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
739         CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_get(  kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
740            &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
741         CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_get(    kiomid, idvar, inbdim, istart, icnt, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
742            &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
743         CASE (jprstdimg)   ;   CALL iom_rstdimg_get( kiomid, idom, idvar, ix1, ix2, iy1, iy2,   &
744            &                                         pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d )
745         CASE DEFAULT   
746            CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
747         END SELECT
748
749         IF( istop == nstop ) THEN   ! no additional errors until this point...
750            IF(lwp) WRITE(numout,"(10x,' read ',a,' (rec: ',i4,') in ',a,' ok')") TRIM(cdvar), itime, TRIM(iom_file(kiomid)%name)
751         
752            !--- overlap areas and extra hallows (mpp)
753            IF(     PRESENT(pv_r2d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
754               CALL lbc_lnk( pv_r2d,'Z',-999.,'no0' )
755            ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) .AND. idom /= jpdom_unknown ) THEN
756               ! this if could be simplified with the new lbc_lnk that works with any size of the 3rd dimension
757               IF( icnt(3) == jpk ) THEN
758                  CALL lbc_lnk( pv_r3d,'Z',-999.,'no0' )
759               ELSE   ! put some arbitrary value (a call to lbc_lnk will be done later...)
760                  DO jj = nlcj+1, jpj   ;   pv_r3d(1:nlci, jj, :) = pv_r3d(1:nlci, nlej, :)   ;   END DO
761                  DO ji = nlci+1, jpi   ;   pv_r3d(ji    , : , :) = pv_r3d(nlei  , :   , :)   ;   END DO
762               ENDIF
763            ENDIF
764           
765            ! C1D case : always call lbc_lnk to replicate the central value over the whole 3X3 domain
766            IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r2d) )   CALL lbc_lnk( pv_r2d,'Z',1. )
767            IF( lk_c1d .AND. PRESENT(pv_r3d) )   CALL lbc_lnk( pv_r3d,'Z',1. )
768   
769            !--- Apply scale_factor and offset
770            zscf = iom_file(kiomid)%scf(idvar)      ! scale factor
771            zofs = iom_file(kiomid)%ofs(idvar)      ! offset
772            IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN
773               IF( zscf /= 1. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf 
774               IF( zofs /= 0. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs
775            ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN
776!CDIR COLLAPSE
777               IF( zscf /= 1.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf
778!CDIR COLLAPSE
779               IF( zofs /= 0.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs
780            ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN
781!CDIR COLLAPSE
782               IF( zscf /= 1.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf
783!CDIR COLLAPSE
784               IF( zofs /= 0.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs
785            ENDIF
786            !
787         ENDIF
788         !
789      ENDIF
790      !
791   END SUBROUTINE iom_get_123d
792
793
794   SUBROUTINE iom_gettime( kiomid, ptime, cdvar, kntime, cdunits, cdcalendar )
795      !!--------------------------------------------------------------------
796      !!                   ***  SUBROUTINE iom_gettime  ***
797      !!
798      !! ** Purpose : read the time axis cdvar in the file
799      !!--------------------------------------------------------------------
800      INTEGER                    , INTENT(in   ) ::   kiomid     ! file Identifier
801      REAL(wp), DIMENSION(:)     , INTENT(  out) ::   ptime      ! the time axis
802      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(in   ) ::   cdvar      ! time axis name
803      INTEGER         , OPTIONAL , INTENT(  out) ::   kntime     ! number of times in file
804      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(  out) ::   cdunits    ! units attribute of time coordinate
805      CHARACTER(len=*), OPTIONAL , INTENT(  out) ::   cdcalendar ! calendar attribute of
806      !
807      INTEGER, DIMENSION(1) :: kdimsz
808      INTEGER            ::   idvar    ! id of the variable
809      CHARACTER(LEN=32)  ::   tname    ! local name of time coordinate
810      CHARACTER(LEN=100) ::   clinfo   ! info character
811      !---------------------------------------------------------------------
812      !
813      IF ( PRESENT(cdvar) ) THEN
814         tname = cdvar
815      ELSE
816         tname = iom_file(kiomid)%uldname
817      ENDIF
818      IF( kiomid > 0 ) THEN
819         clinfo = 'iom_gettime, file: '//trim(iom_file(kiomid)%name)//', var: '//trim(tname)
820         IF ( PRESENT(kntime) ) THEN
821            idvar  = iom_varid( kiomid, tname, kdimsz = kdimsz )
822            kntime = kdimsz(1)
823         ELSE
824            idvar = iom_varid( kiomid, tname )
825         ENDIF
826         !
827         ptime(:) = 0. ! default definition
828         IF( idvar > 0 ) THEN
829            IF( iom_file(kiomid)%ndims(idvar) == 1 ) THEN
830               IF( iom_file(kiomid)%luld(idvar) ) THEN
831                  IF( iom_file(kiomid)%dimsz(1,idvar) <= size(ptime) ) THEN
832                     SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
833                     CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_gettime( kiomid, idvar, ptime, cdunits, cdcalendar )
834                     CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_gettime(   kiomid, idvar, ptime, cdunits, cdcalendar )
835                     CASE (jprstdimg)   ;   CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' case IO library == jprstdimg not coded...' )
836                     CASE DEFAULT   
837                        CALL ctl_stop( TRIM(clinfo)//' accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
838                     END SELECT
839                  ELSE
840                     WRITE(ctmp1,*) 'error with the size of ptime ',size(ptime),iom_file(kiomid)%dimsz(1,idvar)
841                     CALL ctl_stop( trim(clinfo), trim(ctmp1) )
842                  ENDIF
843               ELSE
844                  CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'variable dimension is not unlimited... use iom_get' )
845               ENDIF
846            ELSE
847               CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'the variable has more than 1 dimension' )
848            ENDIF
849         ELSE
850            CALL ctl_stop( trim(clinfo), 'variable not found in '//iom_file(kiomid)%name )
851         ENDIF
852      ENDIF
853      !
854   END SUBROUTINE iom_gettime
855
856
857   !!----------------------------------------------------------------------
858   !!                   INTERFACE iom_getatt
859   !!----------------------------------------------------------------------
860   SUBROUTINE iom_g0d_intatt( kiomid, cdatt, pvar )
861      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file
862      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdatt     ! Name of the attribute
863      INTEGER         , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field
864      !
865      IF( kiomid > 0 ) THEN
866         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
867            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
868            CASE (jpioipsl )   ;   CALL ctl_stop('iom_getatt: only nf90 available')
869            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_getatt( kiomid, cdatt, pvar )
870            CASE (jprstdimg)   ;   CALL ctl_stop('iom_getatt: only nf90 available')
871            CASE DEFAULT   
872               CALL ctl_stop( 'iom_g0d_att: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
873            END SELECT
874         ENDIF
875      ENDIF
876   END SUBROUTINE iom_g0d_intatt
877
878
879   !!----------------------------------------------------------------------
880   !!                   INTERFACE iom_rstput
881   !!----------------------------------------------------------------------
882   SUBROUTINE iom_rp0d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
883      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
884      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
885      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
886      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
887      REAL(wp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field
888      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
889      INTEGER :: ivid   ! variable id
890      IF( kiomid > 0 ) THEN
891         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
892            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
893            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
894            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
895            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r0d = pvar )
896            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )    CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pvar )
897            CASE DEFAULT     
898               CALL ctl_stop( 'iom_rp0d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
899            END SELECT
900         ENDIF
901      ENDIF
902   END SUBROUTINE iom_rp0d
903
904   SUBROUTINE iom_rp1d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
905      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
906      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
907      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
908      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
909      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(          :) ::   pvar     ! written field
910      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
911      INTEGER :: ivid   ! variable id
912      IF( kiomid > 0 ) THEN
913         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
914            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
915            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
916            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
917            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r1d = pvar )
918            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )    CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r1d = pvar )
919            CASE DEFAULT     
920               CALL ctl_stop( 'iom_rp1d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
921            END SELECT
922         ENDIF
923      ENDIF
924   END SUBROUTINE iom_rp1d
925
926   SUBROUTINE iom_rp2d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
927      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
928      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
929      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
930      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
931      REAL(wp)        , INTENT(in), DIMENSION(:,    :    ) ::   pvar     ! written field
932      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
933      INTEGER :: ivid   ! variable id
934      IF( kiomid > 0 ) THEN
935         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
936            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
937            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
938            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
939            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r2d = pvar )
940            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )   CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r2d = pvar ) 
941            CASE DEFAULT     
942               CALL ctl_stop( 'iom_rp2d: accepted IO library are only jpioipsl, jpnf90 and jprstdimg' )
943            END SELECT
944         ENDIF
945      ENDIF
946   END SUBROUTINE iom_rp2d
947
948   SUBROUTINE iom_rp3d( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype )
949      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step
950      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step
951      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kiomid   ! Identifier of the file
952      CHARACTER(len=*), INTENT(in)                         ::   cdvar    ! time axis name
953      REAL(wp)        , INTENT(in),       DIMENSION(:,:,:) ::   pvar     ! written field
954      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type
955      INTEGER :: ivid   ! variable id
956      IF( kiomid > 0 ) THEN
957         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) THEN
958            ivid = iom_varid( kiomid, cdvar, ldstop = .FALSE. )
959            SELECT CASE (iom_file(kiomid)%iolib)
960            CASE (jpioipsl )   ;   CALL iom_ioipsl_rstput( kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
961            CASE (jpnf90   )   ;   CALL iom_nf90_rstput(   kt, kwrite, kiomid, cdvar, ivid, ktype, pv_r3d = pvar )
962            CASE (jprstdimg)   ;   IF( kt == kwrite )   CALL iom_rstdimg_rstput( kiomid, cdvar, ivid, pv_r3d = pvar )
963            CASE DEFAULT     
964               CALL ctl_stop( 'iom_rp3d: accepted IO library are only jpioipsl and jprstdimg' )
965            END SELECT
966         ENDIF
967      ENDIF
968   END SUBROUTINE iom_rp3d
969
970
971   !!----------------------------------------------------------------------
972   !!                   INTERFACE iom_put
973   !!----------------------------------------------------------------------
974   SUBROUTINE iom_p0d( cdname, pfield0d )
975      CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) ::   cdname
976      REAL(wp)        , INTENT(in) ::   pfield0d
977#if defined key_iomput
978      CALL xios_send_field(cdname, (/pfield0d/))
979#else
980      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield0d   ! useless test to avoid compilation warnings
981#endif
982   END SUBROUTINE iom_p0d
983
984   SUBROUTINE iom_p1d( cdname, pfield1d )
985      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdname
986      REAL(wp),     DIMENSION(:), INTENT(in) ::   pfield1d
987#if defined key_iomput
988      CALL xios_send_field( cdname, RESHAPE( (/pfield1d/), (/1,1,SIZE(pfield1d)/) ) )
989#else
990      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield1d   ! useless test to avoid compilation warnings
991#endif
992   END SUBROUTINE iom_p1d
993
994   SUBROUTINE iom_p2d( cdname, pfield2d )
995      CHARACTER(LEN=*)            , INTENT(in) ::   cdname
996      REAL(wp),     DIMENSION(:,:), INTENT(in) ::   pfield2d
997#if defined key_iomput
998      CALL xios_send_field(cdname, pfield2d)
999#else
1000      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield2d   ! useless test to avoid compilation warnings
1001#endif
1002   END SUBROUTINE iom_p2d
1003
1004   SUBROUTINE iom_p3d( cdname, pfield3d )
1005      CHARACTER(LEN=*)                , INTENT(in) ::   cdname
1006      REAL(wp),       DIMENSION(:,:,:), INTENT(in) ::   pfield3d
1007#if defined key_iomput
1008      CALL xios_send_field(cdname, pfield3d)
1009#else
1010      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) cdname, pfield3d   ! useless test to avoid compilation warnings
1011#endif
1012   END SUBROUTINE iom_p3d
1013   !!----------------------------------------------------------------------
1014
1015#if defined key_iomput
1016
1017   SUBROUTINE iom_set_domain_attr( cdid, ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj, zoom_ibegin, zoom_jbegin, zoom_ni, zoom_nj,   &
1018      &                                    data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj, lonvalue, latvalue, mask )
1019      CHARACTER(LEN=*)                 , INTENT(in) ::   cdid
1020      INTEGER                , OPTIONAL, INTENT(in) ::   ni_glo, nj_glo, ibegin, jbegin, ni, nj
1021      INTEGER                , OPTIONAL, INTENT(in) ::   data_dim, data_ibegin, data_ni, data_jbegin, data_nj
1022      INTEGER                , OPTIONAL, INTENT(in) ::   zoom_ibegin, zoom_jbegin, zoom_ni, zoom_nj
1023      REAL(wp), DIMENSION(:) , OPTIONAL, INTENT(in) ::   lonvalue, latvalue
1024      LOGICAL, DIMENSION(:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1025
1026      IF ( xios_is_valid_domain     (cdid) ) THEN
1027         CALL xios_set_domain_attr     ( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1028            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1029            &    zoom_ibegin=zoom_ibegin, zoom_jbegin=zoom_jbegin, zoom_ni=zoom_ni, zoom_nj=zoom_nj,                       &
1030            &    lonvalue=lonvalue, latvalue=latvalue,mask=mask )
1031      ENDIF
1032
1033      IF ( xios_is_valid_domaingroup(cdid) ) THEN
1034         CALL xios_set_domaingroup_attr( cdid, ni_glo=ni_glo, nj_glo=nj_glo, ibegin=ibegin, jbegin=jbegin, ni=ni, nj=nj,   &
1035            &    data_dim=data_dim, data_ibegin=data_ibegin, data_ni=data_ni, data_jbegin=data_jbegin, data_nj=data_nj ,   &
1036            &    zoom_ibegin=zoom_ibegin, zoom_jbegin=zoom_jbegin, zoom_ni=zoom_ni, zoom_nj=zoom_nj,                       &
1037            &    lonvalue=lonvalue, latvalue=latvalue,mask=mask )
1038      ENDIF
1039      CALL xios_solve_inheritance()
1040
1041   END SUBROUTINE iom_set_domain_attr
1042
1043
1044   SUBROUTINE iom_set_axis_attr( cdid, paxis )
1045      CHARACTER(LEN=*)      , INTENT(in) ::   cdid
1046      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in) ::   paxis
1047      IF ( xios_is_valid_axis     (cdid) )   CALL xios_set_axis_attr     ( cdid, size=size(paxis),value=paxis )
1048      IF ( xios_is_valid_axisgroup(cdid) )   CALL xios_set_axisgroup_attr( cdid, size=size(paxis),value=paxis )
1049      CALL xios_solve_inheritance()
1050   END SUBROUTINE iom_set_axis_attr
1051
1052
1053   SUBROUTINE iom_set_field_attr( cdid, freq_op, freq_offset )
1054      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1055      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_op
1056      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   freq_offset
1057      IF ( xios_is_valid_field     (cdid) )   CALL xios_set_field_attr     ( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1058      IF ( xios_is_valid_fieldgroup(cdid) )   CALL xios_set_fieldgroup_attr( cdid, freq_op=freq_op, freq_offset=freq_offset )
1059      CALL xios_solve_inheritance()
1060   END SUBROUTINE iom_set_field_attr
1061
1062
1063   SUBROUTINE iom_set_file_attr( cdid, name, name_suffix )
1064      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1065      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(in) ::   name, name_suffix
1066      IF ( xios_is_valid_file     (cdid) )   CALL xios_set_file_attr     ( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1067      IF ( xios_is_valid_filegroup(cdid) )   CALL xios_set_filegroup_attr( cdid, name=name, name_suffix=name_suffix )
1068      CALL xios_solve_inheritance()
1069   END SUBROUTINE iom_set_file_attr
1070
1071
1072   SUBROUTINE iom_get_file_attr( cdid, name, name_suffix, output_freq )
1073      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in ) ::   cdid
1074      CHARACTER(LEN=*),OPTIONAL , INTENT(out) ::   name, name_suffix, output_freq
1075      LOGICAL                                 ::   llexist1,llexist2,llexist3
1076      !---------------------------------------------------------------------
1077      IF( PRESENT( name        ) )   name = ''          ! default values
1078      IF( PRESENT( name_suffix ) )   name_suffix = ''
1079      IF( PRESENT( output_freq ) )   output_freq = ''
1080      IF ( xios_is_valid_file     (cdid) ) THEN
1081         CALL xios_solve_inheritance()
1082         CALL xios_is_defined_file_attr     ( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1083         IF(llexist1)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name = name )
1084         IF(llexist2)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, name_suffix = name_suffix )
1085         IF(llexist3)   CALL xios_get_file_attr     ( cdid, output_freq = output_freq )
1086      ENDIF
1087      IF ( xios_is_valid_filegroup(cdid) ) THEN
1088         CALL xios_solve_inheritance()
1089         CALL xios_is_defined_filegroup_attr( cdid, name = llexist1, name_suffix = llexist2, output_freq = llexist3)
1090         IF(llexist1)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name = name )
1091         IF(llexist2)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, name_suffix = name_suffix )
1092         IF(llexist3)   CALL xios_get_filegroup_attr( cdid, output_freq = output_freq )
1093      ENDIF
1094   END SUBROUTINE iom_get_file_attr
1095
1096
1097   SUBROUTINE iom_set_grid_attr( cdid, mask )
1098      CHARACTER(LEN=*)                   , INTENT(in) ::   cdid
1099      LOGICAL, DIMENSION(:,:,:), OPTIONAL, INTENT(in) ::   mask
1100      IF ( xios_is_valid_grid     (cdid) )   CALL xios_set_grid_attr     ( cdid, mask=mask )
1101      IF ( xios_is_valid_gridgroup(cdid) )   CALL xios_set_gridgroup_attr( cdid, mask=mask )
1102      CALL xios_solve_inheritance()
1103   END SUBROUTINE iom_set_grid_attr
1104
1105
1106   SUBROUTINE set_grid( cdgrd, plon, plat )
1107      !!----------------------------------------------------------------------
1108      !!                     ***  ROUTINE set_grid  ***
1109      !!
1110      !! ** Purpose :   define horizontal grids
1111      !!
1112      !!----------------------------------------------------------------------
1113      CHARACTER(LEN=1)            , INTENT(in) ::   cdgrd
1114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plon
1115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj), INTENT(in) ::   plat
1116      !
1117      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   zmask
1118      INTEGER  :: ni,nj
1119     
1120      ni=nlei-nldi+1 ; nj=nlej-nldj+1
1121
1122      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, ni_glo=jpiglo, nj_glo=jpjglo, ibegin=nimpp+nldi-1, jbegin=njmpp+nldj-1, ni=ni, nj=nj)
1123      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, data_dim=2, data_ibegin = 1-nldi, data_ni = jpi, data_jbegin = 1-nldj, data_nj = jpj)
1124      CALL iom_set_domain_attr("grid_"//cdgrd, lonvalue = RESHAPE(plon(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /)),   &
1125         &                                     latvalue = RESHAPE(plat(nldi:nlei, nldj:nlej),(/ ni*nj /))) 
1126
1127      IF ( ln_mskland ) THEN
1128         ! mask land points, keep values on coast line -> specific mask for U, V and W points
1129         SELECT CASE ( cdgrd )
1130         CASE('T')   ;   zmask(:,:,:)       = tmask(:,:,:)
1131         CASE('U')   ;   zmask(2:jpim1,:,:) = tmask(2:jpim1,:,:) + tmask(3:jpi,:,:)   ;   CALL lbc_lnk( zmask, 'U', 1. )
1132         CASE('V')   ;   zmask(:,2:jpjm1,:) = tmask(:,2:jpjm1,:) + tmask(:,3:jpi,:)   ;   CALL lbc_lnk( zmask, 'V', 1. )
1133         CASE('W')   ;   zmask(:,:,2:jpk  ) = tmask(:,:,1:jpkm1) + tmask(:,:,2:jpk)   ;   zmask(:,:,1) = tmask(:,:,1)
1134         END SELECT
1135         !
1136         CALL iom_set_domain_attr( "grid_"//cdgrd       , mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,1),(/ni,nj    /)) /= 0. )
1137         CALL iom_set_grid_attr  ( "grid_"//cdgrd//"_3D", mask = RESHAPE(zmask(nldi:nlei,nldj:nlej,:),(/ni,nj,jpk/)) /= 0. )
1138      ENDIF
1139     
1140   END SUBROUTINE set_grid
1141
1142
1143   SUBROUTINE set_scalar
1144      !!----------------------------------------------------------------------
1145      !!                     ***  ROUTINE set_scalar  ***
1146      !!
1147      !! ** Purpose :   define fake grids for scalar point
1148      !!
1149      !!----------------------------------------------------------------------
1150      REAL(wp), DIMENSION(1,1) ::   zz = 1.
1151      !!----------------------------------------------------------------------
1152      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', ni_glo=jpnij, nj_glo=1, ibegin=narea, jbegin=1, ni=1, nj=1)
1153      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', data_dim=1)
1154      CALL iom_set_domain_attr('scalarpoint', lonvalue=(/ zz /), latvalue=(/ zz /))
1155
1156   END SUBROUTINE set_scalar
1157
1158
1159   SUBROUTINE set_xmlatt
1160      !!----------------------------------------------------------------------
1161      !!                     ***  ROUTINE set_xmlatt  ***
1162      !!
1163      !! ** Purpose :   automatic definitions of some of the xml attributs...
1164      !!
1165      !!----------------------------------------------------------------------
1166      CHARACTER(len=1),DIMENSION( 3) ::   clgrd                    ! suffix name
1167      CHARACTER(len=256)             ::   clsuff                   ! suffix name
1168      CHARACTER(len=1)               ::   cl1                      ! 1 character
1169      CHARACTER(len=2)               ::   cl2                      ! 1 character
1170      INTEGER                        ::   ji, jg                   ! loop counters
1171      INTEGER                        ::   ix, iy                   ! i-,j- index
1172      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlontao                  ! longitudes of tao    moorings
1173      REAL(wp)        ,DIMENSION( 7) ::   zlattao                  ! latitudes  of tao    moorings
1174      REAL(wp)        ,DIMENSION( 4) ::   zlonrama                 ! longitudes of rama   moorings
1175      REAL(wp)        ,DIMENSION(11) ::   zlatrama                 ! latitudes  of rama   moorings
1176      REAL(wp)        ,DIMENSION( 3) ::   zlonpira                 ! longitudes of pirata moorings
1177      REAL(wp)        ,DIMENSION( 9) ::   zlatpira                 ! latitudes  of pirata moorings
1178      !!----------------------------------------------------------------------
1179      !
1180      ! frequency of the call of iom_put (attribut: freq_op)
1181      WRITE(cl1,'(i1)')        1   ;   CALL iom_set_field_attr('field_definition', freq_op = cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1182      WRITE(cl1,'(i1)')  nn_fsbc   ;   CALL iom_set_field_attr('SBC'             , freq_op = cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1183      WRITE(cl1,'(i1)') nn_dttrc   ;   CALL iom_set_field_attr('ptrc_T'          , freq_op = cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1184      WRITE(cl1,'(i1)') nn_dttrc   ;   CALL iom_set_field_attr('diad_T'          , freq_op = cl1//'ts', freq_offset='0ts')
1185       
1186      ! output file names (attribut: name)
1187      DO ji = 1, 9
1188         WRITE(cl1,'(i1)') ji 
1189         CALL iom_update_file_name('file'//cl1)
1190      END DO
1191      DO ji = 1, 99
1192         WRITE(cl2,'(i2.2)') ji 
1193         CALL iom_update_file_name('file'//cl2)
1194      END DO
1195
1196      ! Zooms...
1197      clgrd = (/ 'T', 'U', 'W' /) 
1198      DO jg = 1, SIZE(clgrd)                                                                   ! grid type
1199         cl1 = clgrd(jg)
1200         ! Equatorial section (attributs: jbegin, ni, name_suffix)
1201         CALL dom_ngb( 0., 0., ix, iy, cl1 )
1202         CALL iom_set_domain_attr ('Eq'//cl1, zoom_jbegin=iy, zoom_ni=jpiglo)
1203         CALL iom_get_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = clsuff             )
1204         CALL iom_set_file_attr   ('Eq'//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_Eq')
1205         CALL iom_update_file_name('Eq'//cl1)
1206      END DO
1207      ! TAO moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1208      zlontao = (/ 137.0, 147.0, 156.0, 165.0, -180.0, -170.0, -155.0, -140.0, -125.0, -110.0, -95.0 /)
1209      zlattao = (/  -8.0,  -5.0,  -2.0,   0.0,    2.0,    5.0,    8.0 /)
1210      CALL set_mooring( zlontao, zlattao )
1211      ! RAMA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1212      zlonrama = (/  55.0,  67.0, 80.5, 90.0 /)
1213      zlatrama = (/ -16.0, -12.0, -8.0, -4.0, -1.5, 0.0, 1.5, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0 /)
1214      CALL set_mooring( zlonrama, zlatrama )
1215      ! PIRATA moorings (attributs: ibegin, jbegin, name_suffix)
1216      zlonpira = (/ -38.0, -23.0, -10.0 /)
1217      zlatpira = (/ -19.0, -14.0,  -8.0, 0.0, 4.0, 8.0, 12.0, 15.0, 20.0 /)
1218      CALL set_mooring( zlonpira, zlatpira )
1219     
1220   END SUBROUTINE set_xmlatt
1221
1222
1223   SUBROUTINE set_mooring( plon, plat)
1224      !!----------------------------------------------------------------------
1225      !!                     ***  ROUTINE set_mooring  ***
1226      !!
1227      !! ** Purpose :   automatic definitions of moorings xml attributs...
1228      !!
1229      !!----------------------------------------------------------------------
1230      REAL(wp), DIMENSION(:), INTENT(in) ::  plon, plat           ! longitudes/latitudes oft the mooring
1231      !
1232!!$      CHARACTER(len=1),DIMENSION(4) ::   clgrd = (/ 'T', 'U', 'V', 'W' /)   ! suffix name
1233      CHARACTER(len=1),DIMENSION(1) ::   clgrd = (/ 'T' /)        ! suffix name
1234      CHARACTER(len=256)            ::   clname                   ! file name
1235      CHARACTER(len=256)            ::   clsuff                   ! suffix name
1236      CHARACTER(len=1)              ::   cl1                      ! 1 character
1237      CHARACTER(len=6)              ::   clon,clat                ! name of longitude, latitude
1238      INTEGER                       ::   ji, jj, jg               ! loop counters
1239      INTEGER                       ::   ix, iy                   ! i-,j- index
1240      REAL(wp)                      ::   zlon, zlat
1241      !!----------------------------------------------------------------------
1242      DO jg = 1, SIZE(clgrd)
1243         cl1 = clgrd(jg)
1244         DO ji = 1, SIZE(plon)
1245            DO jj = 1, SIZE(plat)
1246               zlon = plon(ji)
1247               zlat = plat(jj)
1248               ! modifications for RAMA moorings
1249               IF( zlon ==  67. .AND. zlat ==  15. )   zlon =  65.
1250               IF( zlon ==  90. .AND. zlat <=  -4. )   zlon =  95.
1251               IF( zlon ==  95. .AND. zlat ==  -4. )   zlat =  -5.
1252               ! modifications for PIRATA moorings
1253               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -19. )   zlon = -34.
1254               IF( zlon == -38. .AND. zlat == -14. )   zlon = -32.
1255               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==  -8. )   zlon = -30.
1256               IF( zlon == -38. .AND. zlat ==   0. )   zlon = -35.
1257               IF( zlon == -23. .AND. zlat ==  20. )   zlat =  21.
1258               IF( zlon == -10. .AND. zlat == -14. )   zlat = -10.
1259               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==  -8. )   zlat =  -6.
1260               IF( zlon == -10. .AND. zlat ==   4. ) THEN   ;   zlon = 0.   ;   zlat = 0.   ;   ENDIF
1261               CALL dom_ngb( zlon, zlat, ix, iy, cl1 )
1262               IF( zlon >= 0. ) THEN 
1263                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT( zlon), 'e'
1264                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')       zlon , 'e'
1265                  ENDIF
1266               ELSE             
1267                  IF( zlon == REAL(NINT(zlon), wp) ) THEN   ;   WRITE(clon, '(i3,  a)') NINT(-zlon), 'w'
1268                  ELSE                                      ;   WRITE(clon, '(f5.1,a)')      -zlon , 'w'
1269                  ENDIF
1270               ENDIF
1271               IF( zlat >= 0. ) THEN 
1272                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT( zlat), 'n'
1273                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')       zlat , 'n'
1274                  ENDIF
1275               ELSE             
1276                  IF( zlat == REAL(NINT(zlat), wp) ) THEN   ;   WRITE(clat, '(i2,  a)') NINT(-zlat), 's'
1277                  ELSE                                      ;   WRITE(clat, '(f4.1,a)')      -zlat , 's'
1278                  ENDIF
1279               ENDIF
1280               clname = TRIM(ADJUSTL(clat))//TRIM(ADJUSTL(clon))
1281               CALL iom_set_domain_attr (TRIM(clname)//cl1, zoom_ibegin= ix, zoom_jbegin= iy)
1282               CALL iom_get_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = clsuff                         )
1283               CALL iom_set_file_attr   (TRIM(clname)//cl1, name_suffix = TRIM(clsuff)//'_'//TRIM(clname))
1284               CALL iom_update_file_name(TRIM(clname)//cl1)
1285            END DO
1286         END DO
1287      END DO
1288     
1289   END SUBROUTINE set_mooring
1290
1291   
1292   SUBROUTINE iom_update_file_name( cdid )
1293      !!----------------------------------------------------------------------
1294      !!                     ***  ROUTINE iom_update_file_name  ***
1295      !!
1296      !! ** Purpose :   
1297      !!
1298      !!----------------------------------------------------------------------
1299      CHARACTER(LEN=*)          , INTENT(in) ::   cdid
1300      !
1301      CHARACTER(LEN=256) ::   clname
1302      CHARACTER(LEN=20)  ::   clfreq
1303      CHARACTER(LEN=20)  ::   cldate
1304      INTEGER            ::   idx
1305      INTEGER            ::   jn
1306      INTEGER            ::   itrlen
1307      INTEGER            ::   iyear, imonth, iday, isec
1308      REAL(wp)           ::   zsec
1309      LOGICAL            ::   llexist
1310      !!----------------------------------------------------------------------
1311
1312      DO jn = 1,2
1313
1314         IF( jn == 1 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name        = clname, output_freq = clfreq )
1315         IF( jn == 2 )   CALL iom_get_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
1316
1317         IF ( TRIM(clname) /= '' ) THEN
1318
1319            idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
1320            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1321               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cexper)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
1322               idx = INDEX(clname,'@expname@') + INDEX(clname,'@EXPNAME@')
1323            END DO
1324
1325            idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
1326            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1327               IF ( TRIM(clfreq) /= '' ) THEN
1328                  itrlen = LEN_TRIM(clfreq)
1329                  IF ( clfreq(itrlen-1:itrlen) == 'mo' ) clfreq = clfreq(1:itrlen-1)
1330                  clname = clname(1:idx-1)//TRIM(clfreq)//clname(idx+6:LEN_TRIM(clname))
1331               ELSE
1332                  CALL ctl_stop('error in the name of file id '//TRIM(cdid),   &
1333                     & ' attribute output_freq is undefined -> cannot replace @freq@ in '//TRIM(clname) )
1334               ENDIF
1335               idx = INDEX(clname,'@freq@') + INDEX(clname,'@FREQ@')
1336            END DO
1337
1338            idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
1339            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1340               cldate = iom_sdate( fjulday - rdttra(1) / rday )
1341               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+11:LEN_TRIM(clname))
1342               idx = INDEX(clname,'@startdate@') + INDEX(clname,'@STARTDATE@')
1343            END DO
1344
1345            idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
1346            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1347               cldate = iom_sdate( fjulday - rdttra(1) / rday, ldfull = .TRUE. )
1348               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+15:LEN_TRIM(clname))
1349               idx = INDEX(clname,'@startdatefull@') + INDEX(clname,'@STARTDATEFULL@')
1350            END DO
1351
1352            idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
1353            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1354               cldate = iom_sdate( fjulday + rdttra(1) / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE. )
1355               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+9:LEN_TRIM(clname))
1356               idx = INDEX(clname,'@enddate@') + INDEX(clname,'@ENDDATE@')
1357            END DO
1358
1359            idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
1360            DO WHILE ( idx /= 0 ) 
1361               cldate = iom_sdate( fjulday + rdttra(1) / rday * REAL( nitend - nit000, wp ), ld24 = .TRUE., ldfull = .TRUE. )
1362               clname = clname(1:idx-1)//TRIM(cldate)//clname(idx+13:LEN_TRIM(clname))
1363               idx = INDEX(clname,'@enddatefull@') + INDEX(clname,'@ENDDATEFULL@')
1364            END DO
1365
1366            IF( jn == 1 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name        = clname )
1367            IF( jn == 2 )   CALL iom_set_file_attr( cdid, name_suffix = clname )
1368
1369         ENDIF
1370
1371      END DO
1372
1373   END SUBROUTINE iom_update_file_name
1374
1375
1376   FUNCTION iom_sdate( pjday, ld24, ldfull )
1377      !!----------------------------------------------------------------------
1378      !!                     ***  ROUTINE iom_sdate  ***
1379      !!
1380      !! ** Purpose :   send back the date corresponding to the given julian day
1381      !!
1382      !!----------------------------------------------------------------------
1383      REAL(wp), INTENT(in   )           ::   pjday         ! julian day
1384      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ld24          ! true to force 24:00 instead of 00:00
1385      LOGICAL , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldfull        ! true to get the compleate date: yyyymmdd_hh:mm:ss
1386      !
1387      CHARACTER(LEN=20) ::   iom_sdate
1388      CHARACTER(LEN=50) ::   clfmt                         !  format used to write the date
1389      INTEGER           ::   iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec
1390      REAL(wp)          ::   zsec
1391      LOGICAL           ::   ll24, llfull
1392      !
1393      IF( PRESENT(ld24) ) THEN   ;   ll24 = ld24
1394      ELSE                       ;   ll24 = .FALSE.
1395      ENDIF
1396
1397      IF( PRESENT(ldfull) ) THEN   ;   llfull = ldfull
1398      ELSE                         ;   llfull = .FALSE.
1399      ENDIF
1400
1401      CALL ju2ymds( pjday, iyear, imonth, iday, zsec )
1402      isec = NINT(zsec)
1403
1404      IF ( ll24 .AND. isec == 0 ) THEN   ! 00:00 of the next day -> move to 24:00 of the current day
1405         CALL ju2ymds( pjday - 1., iyear, imonth, iday, zsec )
1406         isec = 86400
1407      ENDIF
1408
1409      IF( iyear < 10000 ) THEN   ;   clfmt = "i4.4,2i2.2"                ! format used to write the date
1410      ELSE                       ;   WRITE(clfmt, "('i',i1,',2i2.2')") INT(LOG10(REAL(iyear,wp))) + 1
1411      ENDIF
1412     
1413      IF( llfull ) THEN
1414         clfmt = TRIM(clfmt)//",'_',i2.2,':',i2.2,':',i2.2"
1415         ihour   = isec / 3600
1416         isec    = MOD(isec, 3600)
1417         iminute = isec / 60
1418         isec    = MOD(isec, 60)
1419         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday, ihour, iminute, isec    ! date of the end of run
1420      ELSE
1421         WRITE(iom_sdate, '('//TRIM(clfmt)//')') iyear, imonth, iday                          ! date of the end of run
1422      ENDIF
1423
1424   END FUNCTION iom_sdate
1425
1426#else
1427
1428   SUBROUTINE iom_setkt( kt )
1429      INTEGER, INTENT(in   )::   kt 
1430      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) kt   ! useless test to avoid compilation warnings
1431   END SUBROUTINE iom_setkt
1432
1433#endif
1434   
1435   !!======================================================================
1436END MODULE iom
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.