New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
p4zflx.F90 in trunk/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z – NEMO

source: trunk/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/P4Z/p4zflx.F90 @ 6291

Last change on this file since 6291 was 6291, checked in by cetlod, 9 years ago

trunk : bugfix on PISCES carbonate chemistry, see ticket #1672

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 18.3 KB
Line 
1MODULE p4zflx
2   !!======================================================================
3   !!                         ***  MODULE p4zflx  ***
4   !! TOP :   PISCES CALCULATES GAS EXCHANGE AND CHEMISTRY AT SEA SURFACE
5   !!======================================================================
6   !! History :    -   !  1988-07  (E. MAIER-REIMER) Original code
7   !!              -   !  1998     (O. Aumont) additions
8   !!              -   !  1999     (C. Le Quere) modifications
9   !!             1.0  !  2004     (O. Aumont) modifications
10   !!             2.0  !  2007-12  (C. Ethe, G. Madec)  F90
11   !!                  !  2011-02  (J. Simeon, J. Orr) Include total atm P correction
12   !!----------------------------------------------------------------------
13#if defined key_pisces
14   !!----------------------------------------------------------------------
15   !!   'key_pisces'                                       PISCES bio-model
16   !!----------------------------------------------------------------------
17   !!   p4z_flx       :   CALCULATES GAS EXCHANGE AND CHEMISTRY AT SEA SURFACE
18   !!   p4z_flx_init  :   Read the namelist
19   !!   p4z_patm      :   Read sfc atm pressure [atm] for each grid cell
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   USE oce_trc                      !  shared variables between ocean and passive tracers
22   USE trc                          !  passive tracers common variables
23   USE sms_pisces                   !  PISCES Source Minus Sink variables
24   USE p4zche                       !  Chemical model
25   USE prtctl_trc                   !  print control for debugging
26   USE iom                          !  I/O manager
27   USE fldread                      !  read input fields
28#if defined key_cpl_carbon_cycle
29   USE sbc_oce, ONLY :  atm_co2     !  atmospheric pCO2               
30#endif
31
32   IMPLICIT NONE
33   PRIVATE
34
35   PUBLIC   p4z_flx 
36   PUBLIC   p4z_flx_init 
37   PUBLIC   p4z_flx_alloc 
38
39   !                               !!** Namelist  nampisext  **
40   REAL(wp)          ::  atcco2     !: pre-industrial atmospheric [co2] (ppm)   
41   LOGICAL           ::  ln_co2int  !: flag to read in a file and interpolate atmospheric pco2 or not
42   CHARACTER(len=34) ::  clname     !: filename of pco2 values
43   INTEGER           ::  nn_offset  !: Offset model-data start year (default = 0)
44
45   !!  Variables related to reading atmospheric CO2 time history   
46   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) :: atcco2h, years
47   INTEGER  :: nmaxrec, numco2
48
49   !                               !!* nampisatm namelist (Atmospheric PRessure) *
50   LOGICAL, PUBLIC ::   ln_presatm  !: ref. pressure: global mean Patm (F) or a constant (F)
51
52   REAL(wp) , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)  ::  patm      ! atmospheric pressure at kt                 [N/m2]
53   TYPE(FLD), ALLOCATABLE,       DIMENSION(:)    ::  sf_patm   ! structure of input fields (file informations, fields read)
54
55
56   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) :: oce_co2   !: ocean carbon flux
57   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) :: satmco2   !: atmospheric pco2
58
59   REAL(wp) ::  xconv  = 0.01_wp / 3600._wp !: coefficients for conversion
60
61   !!----------------------------------------------------------------------
62   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
63   !! $Id$
64   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
65   !!----------------------------------------------------------------------
66CONTAINS
67
68   SUBROUTINE p4z_flx ( kt, knt )
69      !!---------------------------------------------------------------------
70      !!                     ***  ROUTINE p4z_flx  ***
71      !!
72      !! ** Purpose :   CALCULATES GAS EXCHANGE AND CHEMISTRY AT SEA SURFACE
73      !!
74      !! ** Method  :
75      !!              - Include total atm P correction via Esbensen & Kushnir (1981)
76      !!              - Pressure correction NOT done for key_cpl_carbon_cycle
77      !!              - Remove Wanninkhof chemical enhancement;
78      !!              - Add option for time-interpolation of atcco2.txt 
79      !!---------------------------------------------------------------------
80      !
81      INTEGER, INTENT(in) ::   kt, knt   !
82      !
83      INTEGER  ::   ji, jj, jm, iind, iindm1
84      REAL(wp) ::   ztc, ztc2, ztc3, ztc4, zws, zkgwan
85      REAL(wp) ::   zfld, zflu, zfld16, zflu16, zfact
86      REAL(wp) ::   zph, zah2, zbot, zdic, zalk, zsch_o2, zalka, zsch_co2
87      REAL(wp) ::   zyr_dec, zdco2dt
88      CHARACTER (len=25) :: charout
89      REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: zkgco2, zkgo2, zh2co3, zoflx, zw2d 
90      !!---------------------------------------------------------------------
91      !
92      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_start('p4z_flx')
93      !
94      CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zkgco2, zkgo2, zh2co3, zoflx )
95      !
96
97      ! SURFACE CHEMISTRY (PCO2 AND [H+] IN
98      !     SURFACE LAYER); THE RESULT OF THIS CALCULATION
99      !     IS USED TO COMPUTE AIR-SEA FLUX OF CO2
100
101      IF( kt /= nit000 .AND. knt == 1 ) CALL p4z_patm( kt )    ! Get sea-level pressure (E&K [1981] climatology) for use in flux calcs
102
103      IF( ln_co2int ) THEN 
104         ! Linear temporal interpolation  of atmospheric pco2.  atcco2.txt has annual values.
105         ! Caveats: First column of .txt must be in years, decimal  years preferably.
106         ! For nn_offset, if your model year is iyy, nn_offset=(years(1)-iyy)
107         ! then the first atmospheric CO2 record read is at years(1)
108         zyr_dec = REAL( nyear + nn_offset, wp ) + REAL( nday_year, wp ) / REAL( nyear_len(1), wp )
109         jm = 1
110         DO WHILE( jm <= nmaxrec .AND. years(jm) < zyr_dec ) ;  jm = jm + 1 ;  END DO
111         iind = jm  ;   iindm1 = jm - 1
112         zdco2dt = ( atcco2h(iind) - atcco2h(iindm1) ) / ( years(iind) - years(iindm1) + rtrn )
113         atcco2  = zdco2dt * ( zyr_dec - years(iindm1) ) + atcco2h(iindm1)
114         satmco2(:,:) = atcco2 
115      ENDIF
116
117#if defined key_cpl_carbon_cycle
118      satmco2(:,:) = atm_co2(:,:)
119#endif
120
121      DO jm = 1, 10
122         DO jj = 1, jpj
123            DO ji = 1, jpi
124
125               ! DUMMY VARIABLES FOR DIC, H+, AND BORATE
126               zbot  = borat(ji,jj,1)
127               zfact = rhop(ji,jj,1) / 1000. + rtrn
128               zdic  = trb(ji,jj,1,jpdic) / zfact
129               zph   = MAX( hi(ji,jj,1), 1.e-10 ) / zfact
130               zalka = trb(ji,jj,1,jptal) / zfact
131
132               ! CALCULATE [ALK]([CO3--], [HCO3-])
133               zalk  = zalka - (  akw3(ji,jj,1) / zph - zph / aphscale(ji,jj,1)    &
134               &       + zbot / ( 1.+ zph / akb3(ji,jj,1) )  )
135
136               ! CALCULATE [H+] AND [H2CO3]
137               zah2   = SQRT(  (zdic-zalk)**2 + 4.* ( zalk * ak23(ji,jj,1)   &
138                  &                                        / ak13(ji,jj,1) ) * ( 2.* zdic - zalk )  )
139               zah2   = 0.5 * ak13(ji,jj,1) / zalk * ( ( zdic - zalk ) + zah2 )
140               zh2co3(ji,jj) = ( 2.* zdic - zalk ) / ( 2.+ ak13(ji,jj,1) / zah2 ) * zfact
141               hi(ji,jj,1)   = zah2 * zfact
142            END DO
143         END DO
144      END DO
145
146
147      ! --------------
148      ! COMPUTE FLUXES
149      ! --------------
150
151      ! FIRST COMPUTE GAS EXCHANGE COEFFICIENTS
152      ! -------------------------------------------
153
154      DO jj = 1, jpj
155         DO ji = 1, jpi
156            ztc  = MIN( 35., tsn(ji,jj,1,jp_tem) )
157            ztc2 = ztc * ztc
158            ztc3 = ztc * ztc2 
159            ztc4 = ztc2 * ztc2 
160            ! Compute the schmidt Number both O2 and CO2
161            zsch_co2 = 2116.8 - 136.25 * ztc + 4.7353 * ztc2 - 0.092307 * ztc3 + 0.0007555 * ztc4
162            zsch_o2  = 1920.4 - 135.6  * ztc + 5.2122 * ztc2 - 0.109390 * ztc3 + 0.0009377 * ztc4
163            !  wind speed
164            zws  = wndm(ji,jj) * wndm(ji,jj)
165            ! Compute the piston velocity for O2 and CO2
166            zkgwan = 0.251 * zws
167            zkgwan = zkgwan * xconv * ( 1.- fr_i(ji,jj) ) * tmask(ji,jj,1)
168# if defined key_degrad
169            zkgwan = zkgwan * facvol(ji,jj,1)
170#endif 
171            ! compute gas exchange for CO2 and O2
172            zkgco2(ji,jj) = zkgwan * SQRT( 660./ zsch_co2 )
173            zkgo2 (ji,jj) = zkgwan * SQRT( 660./ zsch_o2 )
174         END DO
175      END DO
176
177      DO jj = 1, jpj
178         DO ji = 1, jpi
179            ! Compute CO2 flux for the sea and air
180            zfld = satmco2(ji,jj) * patm(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * chemc(ji,jj) * zkgco2(ji,jj)   ! (mol/L) * (m/s)
181            zflu = zh2co3(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * zkgco2(ji,jj)                                   ! (mol/L) (m/s) ?
182            oce_co2(ji,jj) = ( zfld - zflu ) * rfact2 * e1e2t(ji,jj) * tmask(ji,jj,1) * 1000.
183            ! compute the trend
184            tra(ji,jj,1,jpdic) = tra(ji,jj,1,jpdic) + ( zfld - zflu ) * rfact2 / e3t_n(ji,jj,1)
185
186            ! Compute O2 flux
187            zfld16 = patm(ji,jj) * chemo2(ji,jj,1) * tmask(ji,jj,1) * zkgo2(ji,jj)          ! (mol/L) * (m/s)
188            zflu16 = trb(ji,jj,1,jpoxy) * tmask(ji,jj,1) * zkgo2(ji,jj)
189            zoflx(ji,jj) = zfld16 - zflu16
190            tra(ji,jj,1,jpoxy) = tra(ji,jj,1,jpoxy) + zoflx(ji,jj) * rfact2 / e3t_n(ji,jj,1)
191         END DO
192      END DO
193
194      t_oce_co2_flx     = glob_sum( oce_co2(:,:) )                    !  Total Flux of Carbon
195      t_oce_co2_flx_cum = t_oce_co2_flx_cum + t_oce_co2_flx       !  Cumulative Total Flux of Carbon
196!      t_atm_co2_flx     = glob_sum( satmco2(:,:) * e1e2t(:,:) )       ! Total atmospheric pCO2
197      t_atm_co2_flx     =  atcco2      ! Total atmospheric pCO2
198 
199      IF(ln_ctl)   THEN  ! print mean trends (used for debugging)
200         WRITE(charout, FMT="('flx ')")
201         CALL prt_ctl_trc_info(charout)
202         CALL prt_ctl_trc(tab4d=tra, mask=tmask, clinfo=ctrcnm)
203      ENDIF
204
205      IF( lk_iomput .AND. knt == nrdttrc ) THEN
206         CALL wrk_alloc( jpi, jpj, zw2d ) 
207         IF( iom_use( "Cflx"  ) )  THEN
208            zw2d(:,:) = oce_co2(:,:) / e1e2t(:,:) * rfact2r
209            CALL iom_put( "Cflx"     , zw2d ) 
210         ENDIF
211         IF( iom_use( "Oflx"  ) )  THEN
212            zw2d(:,:) =  zoflx(:,:) * 1000 * tmask(:,:,1)
213            CALL iom_put( "Oflx" , zw2d )
214         ENDIF
215         IF( iom_use( "Kg"    ) )  THEN
216            zw2d(:,:) =  zkgco2(:,:) * tmask(:,:,1)
217            CALL iom_put( "Kg"   , zw2d )
218         ENDIF
219         IF( iom_use( "Dpco2" ) ) THEN
220           zw2d(:,:) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1)
221           CALL iom_put( "Dpco2" ,  zw2d )
222         ENDIF
223         IF( iom_use( "Dpo2" ) )  THEN
224           zw2d(:,:) = ( atcox * patm(:,:) - atcox * trn(:,:,1,jpoxy) / ( chemo2(:,:,1) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1)
225           CALL iom_put( "Dpo2"  , zw2d )
226         ENDIF
227         IF( iom_use( "tcflx" ) )  CALL iom_put( "tcflx"    , t_oce_co2_flx * rfact2r )   ! molC/s
228         CALL iom_put( "tcflxcum" , t_oce_co2_flx_cum )      ! molC
229         !
230         CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zw2d )
231      ELSE
232         IF( ln_diatrc ) THEN
233            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d    ) = oce_co2(:,:) / e1e2t(:,:) * rfact2r 
234            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 1) = zoflx(:,:) * 1000 * tmask(:,:,1) 
235            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 2) = zkgco2(:,:) * tmask(:,:,1) 
236            trc2d(:,:,jp_pcs0_2d + 3) = ( satmco2(:,:) * patm(:,:) - zh2co3(:,:) / ( chemc(:,:) + rtrn ) ) * tmask(:,:,1) 
237         ENDIF
238      ENDIF
239      !
240      CALL wrk_dealloc( jpi, jpj, zkgco2, zkgo2, zh2co3, zoflx )
241      !
242      IF( nn_timing == 1 )  CALL timing_stop('p4z_flx')
243      !
244   END SUBROUTINE p4z_flx
245
246
247   SUBROUTINE p4z_flx_init
248      !!----------------------------------------------------------------------
249      !!                  ***  ROUTINE p4z_flx_init  ***
250      !!
251      !! ** Purpose :   Initialization of atmospheric conditions
252      !!
253      !! ** Method  :   Read the nampisext namelist and check the parameters
254      !!      called at the first timestep (nittrc000)
255      !! ** input   :   Namelist nampisext
256      !!----------------------------------------------------------------------
257      NAMELIST/nampisext/ln_co2int, atcco2, clname, nn_offset
258      INTEGER :: jm
259      INTEGER :: ios                 ! Local integer output status for namelist read
260      !!----------------------------------------------------------------------
261      !
262
263      REWIND( numnatp_ref )              ! Namelist nampisext in reference namelist : Pisces atm. conditions
264      READ  ( numnatp_ref, nampisext, IOSTAT = ios, ERR = 901)
265901   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nampisext in reference namelist', lwp )
266
267      REWIND( numnatp_cfg )              ! Namelist nampisext in configuration namelist : Pisces atm. conditions
268      READ  ( numnatp_cfg, nampisext, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
269902   IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nampisext in configuration namelist', lwp )
270      IF(lwm) WRITE ( numonp, nampisext )
271      !
272      IF(lwp) THEN                         ! control print
273         WRITE(numout,*) ' '
274         WRITE(numout,*) ' Namelist parameters for air-sea exchange, nampisext'
275         WRITE(numout,*) ' ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~'
276         WRITE(numout,*) '    Choice for reading in the atm pCO2 file or constant value, ln_co2int =', ln_co2int
277         WRITE(numout,*) ' '
278      ENDIF
279      IF( .NOT.ln_co2int ) THEN
280         IF(lwp) THEN                         ! control print
281            WRITE(numout,*) '    Constant Atmospheric pCO2 value  atcco2    =', atcco2
282            WRITE(numout,*) ' '
283         ENDIF
284         satmco2(:,:)  = atcco2      ! Initialisation of atmospheric pco2
285      ELSE
286         IF(lwp)  THEN
287            WRITE(numout,*) '    Atmospheric pCO2 value  from file clname      =', TRIM( clname )
288            WRITE(numout,*) '    Offset model-data start year      nn_offset   =', nn_offset
289            WRITE(numout,*) ' '
290         ENDIF
291         CALL ctl_opn( numco2, TRIM( clname) , 'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1 , numout, lwp )
292         jm = 0                      ! Count the number of record in co2 file
293         DO
294           READ(numco2,*,END=100) 
295           jm = jm + 1
296         END DO
297 100     nmaxrec = jm - 1 
298         ALLOCATE( years  (nmaxrec) )     ;      years  (:) = 0._wp
299         ALLOCATE( atcco2h(nmaxrec) )     ;      atcco2h(:) = 0._wp
300
301         REWIND(numco2)
302         DO jm = 1, nmaxrec          ! get  xCO2 data
303            READ(numco2, *)  years(jm), atcco2h(jm)
304            IF(lwp) WRITE(numout, '(f6.0,f7.2)')  years(jm), atcco2h(jm)
305         END DO
306         CLOSE(numco2)
307      ENDIF
308      !
309      oce_co2(:,:)  = 0._wp                ! Initialization of Flux of Carbon
310      t_oce_co2_flx = 0._wp
311      t_atm_co2_flx = 0._wp
312      !
313      CALL p4z_patm( nit000 )
314      !
315   END SUBROUTINE p4z_flx_init
316
317   SUBROUTINE p4z_patm( kt )
318
319      !!----------------------------------------------------------------------
320      !!                  ***  ROUTINE p4z_atm  ***
321      !!
322      !! ** Purpose :   Read and interpolate the external atmospheric sea-levl pressure
323      !! ** Method  :   Read the files and interpolate the appropriate variables
324      !!
325      !!----------------------------------------------------------------------
326      !! * arguments
327      INTEGER, INTENT( in  ) ::   kt   ! ocean time step
328      !
329      INTEGER            ::  ierr
330      INTEGER            ::  ios      ! Local integer output status for namelist read
331      CHARACTER(len=100) ::  cn_dir   ! Root directory for location of ssr files
332      TYPE(FLD_N)        ::  sn_patm  ! informations about the fields to be read
333      !!
334      NAMELIST/nampisatm/ ln_presatm, sn_patm, cn_dir
335
336      !                                         ! ----------------------- !
337      IF( kt == nit000 ) THEN                   ! First call kt=nittrc000 !
338
339         REWIND( numnatp_ref )              ! Namelist nampisatm in reference namelist : Pisces atm. sea level pressure file
340         READ  ( numnatp_ref, nampisatm, IOSTAT = ios, ERR = 901)
341901      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nampisatm in reference namelist', lwp )
342
343         REWIND( numnatp_cfg )              ! Namelist nampisatm in configuration namelist : Pisces atm. sea level pressure file
344         READ  ( numnatp_cfg, nampisatm, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
345902      IF( ios /= 0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nampisatm in configuration namelist', lwp )
346         IF(lwm) WRITE ( numonp, nampisatm )
347         !
348         !
349         IF(lwp) THEN                                 !* control print
350            WRITE(numout,*)
351            WRITE(numout,*) '   Namelist nampisatm : Atmospheric Pressure as external forcing'
352            WRITE(numout,*) '      constant atmopsheric pressure (F) or from a file (T)  ln_presatm = ', ln_presatm
353            WRITE(numout,*)
354         ENDIF
355         !
356         IF( ln_presatm ) THEN
357            ALLOCATE( sf_patm(1), STAT=ierr )           !* allocate and fill sf_patm (forcing structure) with sn_patm
358            IF( ierr > 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'p4z_flx: unable to allocate sf_patm structure' )
359            !
360            CALL fld_fill( sf_patm, (/ sn_patm /), cn_dir, 'p4z_flx', 'Atmospheric pressure ', 'nampisatm' )
361                                   ALLOCATE( sf_patm(1)%fnow(jpi,jpj,1)   )
362            IF( sn_patm%ln_tint )  ALLOCATE( sf_patm(1)%fdta(jpi,jpj,1,2) )
363         ENDIF
364         !                                         
365         IF( .NOT.ln_presatm )   patm(:,:) = 1.e0    ! Initialize patm if no reading from a file
366         !
367      ENDIF
368      !
369      IF( ln_presatm ) THEN
370         CALL fld_read( kt, 1, sf_patm )               !* input Patm provided at kt + 1/2
371         patm(:,:) = sf_patm(1)%fnow(:,:,1)                        ! atmospheric pressure
372      ENDIF
373      !
374   END SUBROUTINE p4z_patm
375
376   INTEGER FUNCTION p4z_flx_alloc()
377      !!----------------------------------------------------------------------
378      !!                     ***  ROUTINE p4z_flx_alloc  ***
379      !!----------------------------------------------------------------------
380      ALLOCATE( oce_co2(jpi,jpj), satmco2(jpi,jpj), patm(jpi,jpj), STAT=p4z_flx_alloc )
381      !
382      IF( p4z_flx_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('p4z_flx_alloc : failed to allocate arrays')
383      !
384   END FUNCTION p4z_flx_alloc
385
386#else
387   !!======================================================================
388   !!  Dummy module :                                   No PISCES bio-model
389   !!======================================================================
390CONTAINS
391   SUBROUTINE p4z_flx( kt )                   ! Empty routine
392      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt
393      WRITE(*,*) 'p4z_flx: You should not have seen this print! error?', kt
394   END SUBROUTINE p4z_flx
395#endif 
396
397   !!======================================================================
398END MODULE p4zflx
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.