Ignore:
Timestamp:
2020-05-15T19:41:01+02:00 (8 months ago)
Author:
smasson
Message:

Extra_Halo: update with trunk@12933, see #2366

Location:
NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo
Files:
1 deleted
62 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo

    • Property svn:externals
      •  

        old new  
        88 
        99# SETTE 
        10 ^/utils/CI/sette@HEAD         sette 
         10^/utils/CI/sette@12931        sette 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/BENCH/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r12807 r12939  
    6161      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(out) ::   pe1e2u, pe1e2v               ! u- & v-surfaces (if reduction in strait)   [m2] 
    6262      ! 
    63       INTEGER  ::   ji, jj   ! dummy loop indices 
     63      INTEGER  ::   ji, jj         ! dummy loop indices 
    6464      REAL(wp) ::   zres, zf0 
    65       REAL(wp) ::   zti, zui, ztj, zvj   ! local scalars 
     65      REAL(wp) ::   zti, ztj       ! local scalars 
    6666      !!------------------------------------------------------------------------------- 
    6767      ! 
     
    7272      IF(lwp) WRITE(numout,*) '          given by rn_dx and rn_dy'  
    7373      ! 
    74       !                           
    7574      ! Position coordinates (in grid points) 
    7675      !                          ========== 
    7776      DO_2D_11_11 
    7877          
    79          zti = REAL( mig(ji)-1, wp )          ;  ztj = REAL( mjg(jj)-2, wp ) 
    80          zui = REAL( mig(ji)-1, wp ) + 0.5_wp ;  zvj = REAL( mjg(jj)-2, wp ) + 0.5_wp 
     78         zti = REAL( mig0(ji) - 1, wp )   ! start at i=0 in the global grid without halos 
     79         ztj = REAL( mjg0(jj) - 1, wp )   ! start at j=0 in the global grid without halos 
    8180          
    8281         plamt(ji,jj) = zti 
    83          plamu(ji,jj) = zui 
     82         plamu(ji,jj) = zti + 0.5_wp 
    8483         plamv(ji,jj) = zti 
    85          plamf(ji,jj) = zui 
     84         plamf(ji,jj) = zti + 0.5_wp 
    8685          
    8786         pphit(ji,jj) = ztj 
    88          pphiv(ji,jj) = zvj 
    8987         pphiu(ji,jj) = ztj 
    90          pphif(ji,jj) = zvj 
     88         pphiv(ji,jj) = ztj + 0.5_wp 
     89         pphif(ji,jj) = ztj + 0.5_wp 
    9190 
    9291      END_2D 
     
    109108      kff = 1                       !  indicate not to compute Coriolis parameter afterward 
    110109      ! 
    111       zf0   = 2._wp * omega * SIN( rad * 45 )   ! constant coriolis factor corresponding to 45°N 
     110      zf0 = 2._wp * omega * SIN( rad * 45 )   ! constant coriolis factor corresponding to 45°N 
    112111      pff_f(:,:) = zf0 
    113112      pff_t(:,:) = zf0 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/BENCH/MY_SRC/usrdef_istate.F90

    r12807 r12939  
    5757      REAL(wp) ::   zfact 
    5858      INTEGER  ::   ji, jj, jk 
     59      INTEGER  ::   igloi, igloj   ! to be removed in the future, see comment bellow 
    5960      !!---------------------------------------------------------------------- 
    6061      ! 
     
    6364      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~   ' 
    6465      ! 
    65       ! define unique value on each point. z2d ranging from 0.05 to -0.05 
    66       DO_2D_11_11 
    67          z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig(ji) + (mjg(jj)-2) * jpiglo, wp ) / REAL( jpiglo * ( jpjglo - 1 ), wp ) ) 
     66      ! define unique value on each point of the inner global domain. z2d ranging from 0.05 to -0.05 
     67      ! 
     68      ! WARNING: to keep compatibility with the trunk that was including periodocity into the input data,  
     69      ! we must define z2d as bellow. 
     70      ! Once we decide to forget trunk compatibility, we must simply define z2d as: 
     71!!$      DO_2D_00_00 
     72!!$         z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig0(ji) + (mjg0(jj)-1) * Ni0glo, wp ) / REAL( Ni0glo * Nj0glo, wp ) ) 
     73!!$      END_2D 
     74      igloi = Ni0glo + 2 * COUNT( (/ jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6 .OR. jperio == 7 /) ) 
     75      igloj = Nj0glo + 2 * COUNT( (/ jperio == 2 .OR. jperio == 7 /) ) + 1 * COUNT( (/ jperio >= 4 .AND. jperio <= 6 /) ) 
     76      DO_2D_00_00 
     77         z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig0(ji) + (mjg0(jj)-1) * igloi, wp ) / REAL( igloi * igloj, wp ) ) 
    6878      END_2D 
    6979      ! 
     
    7181      pssh(:,:) = z2d(:,:)                                                ! +/- 0.05 m 
    7282      ! 
    73       DO jk = 1, jpk 
     83      DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
    7484         zfact = REAL(jk-1,wp) / REAL(jpk-1,wp)   ! 0 to 1 to add a basic stratification 
    7585         ! temperature choosen to lead to ~50% ice at the beginning if rn_thres_sst = 0.5 
     
    8191         pv(:,:,jk) = z2d(:,:) * 0.01_wp * vmask(:,:,jk)                  ! +/- 0.0005 m/s 
    8292      ENDDO 
     93      pts(:,:,jpk,:) = 0._wp 
     94      pu( :,:,jpk  ) = 0._wp 
     95      pv( :,:,jpk  ) = 0._wp 
    8396      ! 
    8497      CALL lbc_lnk('usrdef_istate', pssh, 'T',  1. )            ! apply boundary conditions 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/BENCH/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12807 r12939  
    5555      !                              !!* nammpp namelist *!! 
    5656      INTEGER          ::   jpni, jpnj 
    57       LOGICAL          ::   ln_nnogather 
     57      LOGICAL          ::   ln_nnogather, ln_listonly 
    5858      !! 
    5959      NAMELIST/namusr_def/ nn_isize, nn_jsize, nn_ksize, nn_perio 
    60       NAMELIST/nammpp/ jpni, jpnj, ln_nnogather 
     60      NAMELIST/nammpp/ jpni, jpnj, ln_nnogather, ln_listonly 
    6161      !!----------------------------------------------------------------------      
    6262      ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/BENCH/MY_SRC/usrdef_sbc.F90

    r12807 r12939  
    9999      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   z2d   ! 2D workspace 
    100100      INTEGER  ::   ji, jj 
     101      INTEGER  ::   igloi, igloj   ! to be removed in the future, see comment bellow 
    101102      !!--------------------------------------------------------------------- 
    102103#if defined key_si3 
     
    104105      ! 
    105106      ! define unique value on each point. z2d ranging from 0.05 to -0.05 
    106       DO_2D_11_11 
    107          z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig(ji) + (mjg(jj)-2) * jpiglo, wp ) / REAL( jpiglo * ( jpjglo - 1 ), wp ) ) 
     107      ! 
     108      ! WARNING: to keep compatibility with the trunk that was including periodocity into the input data,  
     109      ! we must define z2d as bellow. 
     110      ! Once we decide to forget trunk compatibility, we must simply define z2d as: 
     111!!$      DO_2D_00_00 
     112!!$         z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig0(ji) + (mjg0(jj)-1) * Ni0glo, wp ) / REAL( Ni0glo * Nj0glo, wp ) ) 
     113!!$      END_2D 
     114      igloi = Ni0glo + 2 * COUNT( (/ jperio == 1 .OR. jperio == 4 .OR. jperio == 6 .OR. jperio == 7 /) ) 
     115      igloj = Nj0glo + 2 * COUNT( (/ jperio == 2 .OR. jperio == 7 /) ) + 1 * COUNT( (/ jperio >= 4 .AND. jperio <= 6 /) ) 
     116      DO_2D_00_00 
     117         z2d(ji,jj) = 0.1 * ( 0.5 - REAL( mig0(ji) + (mjg0(jj)-1) * igloi, wp ) / REAL( igloi * igloj, wp ) ) 
    108118      END_2D 
    109       utau_ice(:,:) = 0.1_wp +  z2d(:,:) 
    110       vtau_ice(:,:) = 0.1_wp +  z2d(:,:) 
     119      utau_ice(:,:) = 0.1_wp + z2d(:,:) 
     120      vtau_ice(:,:) = 0.1_wp + z2d(:,:) 
    111121 
    112122      CALL lbc_lnk_multi( 'usrdef_sbc', utau_ice, 'U', -1., vtau_ice, 'V', -1. ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/diawri.F90

    r12489 r12939  
    2626   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2727   USE oce            ! ocean dynamics and tracers  
     28   USE isf_oce 
     29   USE isfcpl 
     30   USE abl            ! abl variables in case ln_abl = .true. 
    2831   USE dom_oce        ! ocean space and time domain 
    2932   USE phycst         ! physical constants 
     
    6568   PUBLIC   dia_wri_state 
    6669   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module 
    67  
     70#if ! defined key_iomput    
     71   PUBLIC   dia_wri_alloc_abl       ! Called by sbcabl  module (if ln_abl = .true.) 
     72#endif 
    6873   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file 
    6974   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file 
     
    7176   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file 
    7277   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file 
     78   INTEGER ::   nid_A, nz_A, nh_A, ndim_A, ndim_hA   ! grid_ABL file    
    7379   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ??? 
    7480   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV 
     81   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hA, ndex_A ! ABL 
    7582   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V 
    7683   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT 
    7784 
     85   !! * Substitutions 
     86#  include "do_loop_substitute.h90" 
    7887   !!---------------------------------------------------------------------- 
    7988   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    147156      CALL iom_put(  "sst", ts(:,:,1,jp_tem,Kmm) )    ! surface temperature 
    148157      IF ( iom_use("sbt") ) THEN 
    149          DO jj = 1, jpj 
    150             DO ji = 1, jpi 
    151                ikbot = mbkt(ji,jj) 
    152                z2d(ji,jj) = ts(ji,jj,ikbot,jp_tem,Kmm) 
    153             END DO 
    154          END DO 
     158         DO_2D_11_11 
     159            ikbot = mbkt(ji,jj) 
     160            z2d(ji,jj) = ts(ji,jj,ikbot,jp_tem,Kmm) 
     161         END_2D 
    155162         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature 
    156163      ENDIF 
     
    159166      CALL iom_put(  "sss", ts(:,:,1,jp_sal,Kmm) )    ! surface salinity 
    160167      IF ( iom_use("sbs") ) THEN 
    161          DO jj = 1, jpj 
    162             DO ji = 1, jpi 
    163                ikbot = mbkt(ji,jj) 
    164                z2d(ji,jj) = ts(ji,jj,ikbot,jp_sal,Kmm) 
    165             END DO 
    166          END DO 
     168         DO_2D_11_11 
     169            ikbot = mbkt(ji,jj) 
     170            z2d(ji,jj) = ts(ji,jj,ikbot,jp_sal,Kmm) 
     171         END_2D 
    167172         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity 
    168173      ENDIF 
     
    171176         zztmp = rho0 * 0.25 
    172177         z2d(:,:) = 0._wp 
    173          DO jj = 2, jpjm1 
    174             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    175                zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * uu(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj),Kmm)  )**2   & 
    176                   &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * uu(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj),Kmm)  )**2   & 
    177                   &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vv(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ),Kmm)  )**2   & 
    178                   &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vv(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1),Kmm)  )**2 
    179                z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1)  
    180                ! 
    181             END DO 
    182          END DO 
     178         DO_2D_00_00 
     179            zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * uu(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj),Kmm)  )**2   & 
     180               &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * uu(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj),Kmm)  )**2   & 
     181               &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vv(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ),Kmm)  )**2   & 
     182               &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vv(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1),Kmm)  )**2 
     183            z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1)  
     184            ! 
     185         END_2D 
    183186         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. ) 
    184187         CALL iom_put( "taubot", z2d )            
     
    188191      CALL iom_put(  "ssu", uu(:,:,1,Kmm) )            ! surface i-current 
    189192      IF ( iom_use("sbu") ) THEN 
    190          DO jj = 1, jpj 
    191             DO ji = 1, jpi 
    192                ikbot = mbku(ji,jj) 
    193                z2d(ji,jj) = uu(ji,jj,ikbot,Kmm) 
    194             END DO 
    195          END DO 
     193         DO_2D_11_11 
     194            ikbot = mbku(ji,jj) 
     195            z2d(ji,jj) = uu(ji,jj,ikbot,Kmm) 
     196         END_2D 
    196197         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current 
    197198      ENDIF 
     
    200201      CALL iom_put(  "ssv", vv(:,:,1,Kmm) )            ! surface j-current 
    201202      IF ( iom_use("sbv") ) THEN 
    202          DO jj = 1, jpj 
    203             DO ji = 1, jpi 
    204                ikbot = mbkv(ji,jj) 
    205                z2d(ji,jj) = vv(ji,jj,ikbot,Kmm) 
    206             END DO 
    207          END DO 
     203         DO_2D_11_11 
     204            ikbot = mbkv(ji,jj) 
     205            z2d(ji,jj) = vv(ji,jj,ikbot,Kmm) 
     206         END_2D 
    208207         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current 
    209208      ENDIF 
    210209 
     210      IF( ln_zad_Aimp ) ww = ww + wi               ! Recombine explicit and implicit parts of vertical velocity for diagnostic output 
     211      ! 
    211212      CALL iom_put( "woce", ww )                   ! vertical velocity 
    212213      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value 
     
    219220         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) ) 
    220221      ENDIF 
     222      ! 
     223      IF( ln_zad_Aimp ) ww = ww - wi               ! Remove implicit part of vertical velocity that was added for diagnostic output 
    221224 
    222225      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef. 
     
    227230      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) ) 
    228231 
    229       IF ( iom_use("salgrad") .OR. iom_use("salgrad2") ) THEN 
    230          z3d(:,:,jpk) = 0. 
    231          DO jk = 1, jpkm1 
    232             DO jj = 2, jpjm1                                    ! sal gradient 
    233                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    234                   zztmp  = ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) 
    235                   zztmpx = ( ts(ji+1,jj,jk,jp_sal,Kmm) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji-1,jj  ,jk,jp_sal,Kmm) ) * r1_e1u(ji-1,jj) 
    236                   zztmpy = ( ts(ji,jj+1,jk,jp_sal,Kmm) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji  ,jj-1,jk,jp_sal,Kmm) ) * r1_e2v(ji,jj-1) 
    237                   z3d(ji,jj,jk) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   & 
    238                      &                 * umask(ji,jj,jk) * umask(ji-1,jj,jk) * vmask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj-1,jk) 
    239                END DO 
    240             END DO 
    241          END DO 
    242          CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. ) 
    243          CALL iom_put( "salgrad2",  z3d )          ! square of module of sal gradient 
    244          z3d(:,:,:) = SQRT( z3d(:,:,:) ) 
    245          CALL iom_put( "salgrad" ,  z3d )          ! module of sal gradient 
    246       ENDIF 
    247           
    248232      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN 
    249          DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient 
    250             DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    251                zztmp  = ts(ji,jj,1,jp_tem,Kmm) 
    252                zztmpx = ( ts(ji+1,jj,1,jp_tem,Kmm) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji-1,jj  ,1,jp_tem,Kmm) ) * r1_e1u(ji-1,jj) 
    253                zztmpy = ( ts(ji,jj+1,1,jp_tem,Kmm) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji  ,jj-1,1,jp_tem,Kmm) ) * r1_e2v(ji,jj-1) 
    254                z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   & 
    255                   &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1) 
    256             END DO 
    257          END DO 
     233         DO_2D_00_00 
     234            zztmp  = ts(ji,jj,1,jp_tem,Kmm) 
     235            zztmpx = ( ts(ji+1,jj,1,jp_tem,Kmm) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji-1,jj  ,1,jp_tem,Kmm) ) * r1_e1u(ji-1,jj) 
     236            zztmpy = ( ts(ji,jj+1,1,jp_tem,Kmm) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - ts(ji  ,jj-1,1,jp_tem,Kmm) ) * r1_e2v(ji,jj-1) 
     237            z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   & 
     238               &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1) 
     239         END_2D 
    258240         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. ) 
    259241         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient 
     
    265247      IF( iom_use("heatc") ) THEN 
    266248         z2d(:,:)  = 0._wp  
    267          DO jk = 1, jpkm1 
    268             DO jj = 1, jpj 
    269                DO ji = 1, jpi 
    270                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
    271                END DO 
    272             END DO 
    273          END DO 
     249         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     250            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
     251         END_3D 
    274252         CALL iom_put( "heatc", rho0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2) 
    275253      ENDIF 
     
    277255      IF( iom_use("saltc") ) THEN 
    278256         z2d(:,:)  = 0._wp  
    279          DO jk = 1, jpkm1 
    280             DO jj = 1, jpj 
    281                DO ji = 1, jpi 
    282                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
    283                END DO 
    284             END DO 
    285          END DO 
     257         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     258            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
     259         END_3D 
    286260         CALL iom_put( "saltc", rho0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2) 
    287261      ENDIF 
     
    289263      IF( iom_use("salt2c") ) THEN 
    290264         z2d(:,:)  = 0._wp  
    291          DO jk = 1, jpkm1 
    292             DO jj = 1, jpj 
    293                DO ji = 1, jpi 
    294                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
    295                END DO 
    296             END DO 
    297          END DO 
     265         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     266            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
     267         END_3D 
    298268         CALL iom_put( "salt2c", rho0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2) 
    299269      ENDIF 
     
    301271      IF ( iom_use("eken") ) THEN 
    302272         z3d(:,:,jpk) = 0._wp  
    303          DO jk = 1, jpkm1 
    304             DO jj = 2, jpjm1 
    305                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    306                   zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t(ji,jj,jk,Kmm) 
    307                   z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  uu(ji-1,jj,jk,Kmm)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u(ji-1,jj,jk,Kmm)   & 
    308                      &                     + uu(ji  ,jj,jk,Kmm)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u(ji  ,jj,jk,Kmm)   & 
    309                      &                     + vv(ji,jj-1,jk,Kmm)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v(ji,jj-1,jk,Kmm)   & 
    310                      &                     + vv(ji,jj  ,jk,Kmm)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v(ji,jj  ,jk,Kmm)   ) 
    311                END DO 
    312             END DO 
    313          END DO 
     273         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     274            zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t(ji,jj,jk,Kmm) 
     275            z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  uu(ji-1,jj,jk,Kmm)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u(ji-1,jj,jk,Kmm)   & 
     276               &                     + uu(ji  ,jj,jk,Kmm)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u(ji  ,jj,jk,Kmm)   & 
     277               &                     + vv(ji,jj-1,jk,Kmm)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v(ji,jj-1,jk,Kmm)   & 
     278               &                     + vv(ji,jj  ,jk,Kmm)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v(ji,jj  ,jk,Kmm)   ) 
     279         END_3D 
    314280         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. ) 
    315281         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy 
     
    321287         z3d(1,:, : ) = 0._wp 
    322288         z3d(:,1, : ) = 0._wp 
    323          DO jk = 1, jpkm1 
    324             DO jj = 2, jpj 
    325                DO ji = 2, jpi 
    326                   z3d(ji,jj,jk) = 0.25_wp * ( uu(ji  ,jj,jk,Kmm) * uu(ji  ,jj,jk,Kmm) * e1e2u(ji  ,jj) * e3u(ji  ,jj,jk,Kmm)  & 
    327                      &                      + uu(ji-1,jj,jk,Kmm) * uu(ji-1,jj,jk,Kmm) * e1e2u(ji-1,jj) * e3u(ji-1,jj,jk,Kmm)  & 
    328                      &                      + vv(ji,jj  ,jk,Kmm) * vv(ji,jj  ,jk,Kmm) * e1e2v(ji,jj  ) * e3v(ji,jj  ,jk,Kmm)  & 
    329                      &                      + vv(ji,jj-1,jk,Kmm) * vv(ji,jj-1,jk,Kmm) * e1e2v(ji,jj-1) * e3v(ji,jj-1,jk,Kmm)  )  & 
    330                      &                    * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t(ji,jj,jk,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
    331                END DO 
    332             END DO 
    333          END DO 
    334           
     289         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     290            z3d(ji,jj,jk) = 0.25_wp * ( uu(ji  ,jj,jk,Kmm) * uu(ji  ,jj,jk,Kmm) * e1e2u(ji  ,jj) * e3u(ji  ,jj,jk,Kmm)  & 
     291               &                      + uu(ji-1,jj,jk,Kmm) * uu(ji-1,jj,jk,Kmm) * e1e2u(ji-1,jj) * e3u(ji-1,jj,jk,Kmm)  & 
     292               &                      + vv(ji,jj  ,jk,Kmm) * vv(ji,jj  ,jk,Kmm) * e1e2v(ji,jj  ) * e3v(ji,jj  ,jk,Kmm)  & 
     293               &                      + vv(ji,jj-1,jk,Kmm) * vv(ji,jj-1,jk,Kmm) * e1e2v(ji,jj-1) * e3v(ji,jj-1,jk,Kmm)  )  & 
     294               &                    * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t(ji,jj,jk,Kmm) * tmask(ji,jj,jk) 
     295         END_3D 
    335296         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. ) 
    336297         CALL iom_put( "ke", z3d ) ! kinetic energy 
    337298 
    338299         z2d(:,:)  = 0._wp  
    339          DO jk = 1, jpkm1 
    340             DO jj = 1, jpj 
    341                DO ji = 1, jpi 
    342                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * z3d(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 
    343                END DO 
    344             END DO 
    345          END DO 
     300         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     301            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * z3d(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 
     302         END_3D 
    346303         CALL iom_put( "ke_zint", z2d )   ! vertically integrated kinetic energy 
    347304 
     
    353310          
    354311         z3d(:,:,jpk) = 0._wp  
    355          DO jk = 1, jpkm1 
    356             DO jj = 1, jpjm1 
    357                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    358                   z3d(ji,jj,jk) = (   e2v(ji+1,jj  ) * vv(ji+1,jj  ,jk,Kmm) - e2v(ji,jj) * vv(ji,jj,jk,Kmm)    & 
    359                      &              - e1u(ji  ,jj+1) * uu(ji  ,jj+1,jk,Kmm) + e1u(ji,jj) * uu(ji,jj,jk,Kmm)  ) * r1_e1e2f(ji,jj) 
    360                END DO 
    361             END DO 
    362          END DO 
     312         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     313            z3d(ji,jj,jk) = (   e2v(ji+1,jj  ) * vv(ji+1,jj  ,jk,Kmm) - e2v(ji,jj) * vv(ji,jj,jk,Kmm)    & 
     314               &              - e1u(ji  ,jj+1) * uu(ji  ,jj+1,jk,Kmm) + e1u(ji,jj) * uu(ji,jj,jk,Kmm)  ) * r1_e1e2f(ji,jj) 
     315         END_3D 
    363316         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'F', 1. ) 
    364317         CALL iom_put( "relvor", z3d )                  ! relative vorticity 
    365318 
    366          DO jk = 1, jpkm1 
    367             DO jj = 1, jpj 
    368                DO ji = 1, jpi 
    369                   z3d(ji,jj,jk) = ff_f(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk)  
    370                END DO 
    371             END DO 
    372          END DO 
     319         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     320            z3d(ji,jj,jk) = ff_f(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk)  
     321         END_3D 
    373322         CALL iom_put( "absvor", z3d )                  ! absolute vorticity 
    374323 
    375          DO jk = 1, jpkm1 
    376             DO jj = 1, jpjm1 
    377                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    378                   ze3  = (  e3t(ji,jj+1,jk,Kmm)*tmask(ji,jj+1,jk) + e3t(ji+1,jj+1,jk,Kmm)*tmask(ji+1,jj+1,jk)   & 
    379                      &    + e3t(ji,jj  ,jk,Kmm)*tmask(ji,jj  ,jk) + e3t(ji+1,jj  ,jk,Kmm)*tmask(ji+1,jj  ,jk)  ) 
    380                   IF( ze3 /= 0._wp ) THEN   ;   ze3 = 4._wp / ze3 
    381                   ELSE                      ;   ze3 = 0._wp 
    382                   ENDIF 
    383                   z3d(ji,jj,jk) = ze3 * z3d(ji,jj,jk)  
    384                END DO 
    385             END DO 
    386          END DO 
     324         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     325            ze3  = (  e3t(ji,jj+1,jk,Kmm)*tmask(ji,jj+1,jk) + e3t(ji+1,jj+1,jk,Kmm)*tmask(ji+1,jj+1,jk)   & 
     326               &    + e3t(ji,jj  ,jk,Kmm)*tmask(ji,jj  ,jk) + e3t(ji+1,jj  ,jk,Kmm)*tmask(ji+1,jj  ,jk)  ) 
     327            IF( ze3 /= 0._wp ) THEN   ;   ze3 = 4._wp / ze3 
     328            ELSE                      ;   ze3 = 0._wp 
     329            ENDIF 
     330            z3d(ji,jj,jk) = ze3 * z3d(ji,jj,jk)  
     331         END_3D 
    387332         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'F', 1. ) 
    388333         CALL iom_put( "potvor", z3d )                  ! potential vorticity 
    389334 
    390335      ENDIF 
    391     
    392336      ! 
    393337      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN 
     
    404348      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN 
    405349         z2d(:,:) = 0._wp  
    406          DO jk = 1, jpkm1 
    407             DO jj = 2, jpjm1 
    408                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    409                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) + ts(ji+1,jj,jk,jp_tem,Kmm) ) 
    410                END DO 
    411             END DO 
    412          END DO 
     350         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     351            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) + ts(ji+1,jj,jk,jp_tem,Kmm) ) 
     352         END_3D 
    413353         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. ) 
    414354         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction 
     
    417357      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN 
    418358         z2d(:,:) = 0.e0  
    419          DO jk = 1, jpkm1 
    420             DO jj = 2, jpjm1 
    421                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    422                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) + ts(ji+1,jj,jk,jp_sal,Kmm) ) 
    423                END DO 
    424             END DO 
    425          END DO 
     359         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     360            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) + ts(ji+1,jj,jk,jp_sal,Kmm) ) 
     361         END_3D 
    426362         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. ) 
    427363         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction 
     
    439375      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN 
    440376         z2d(:,:) = 0.e0  
    441          DO jk = 1, jpkm1 
    442             DO jj = 2, jpjm1 
    443                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    444                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) + ts(ji,jj+1,jk,jp_tem,Kmm) ) 
    445                END DO 
    446             END DO 
    447          END DO 
     377         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     378            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) + ts(ji,jj+1,jk,jp_tem,Kmm) ) 
     379         END_3D 
    448380         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. ) 
    449381         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction 
     
    452384      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN 
    453385         z2d(:,:) = 0._wp  
    454          DO jk = 1, jpkm1 
    455             DO jj = 2, jpjm1 
    456                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    457                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) + ts(ji,jj+1,jk,jp_sal,Kmm) ) 
    458                END DO 
    459             END DO 
    460          END DO 
     386         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     387            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) + ts(ji,jj+1,jk,jp_sal,Kmm) ) 
     388         END_3D 
    461389         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. ) 
    462390         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction 
     
    465393      IF( iom_use("tosmint") ) THEN 
    466394         z2d(:,:) = 0._wp 
    467          DO jk = 1, jpkm1 
    468             DO jj = 2, jpjm1 
    469                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    470                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) *  ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) 
    471                END DO 
    472             END DO 
    473          END DO 
     395         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     396            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) *  ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) 
     397         END_3D 
    474398         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. ) 
    475399         CALL iom_put( "tosmint", rho0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature 
     
    477401      IF( iom_use("somint") ) THEN 
    478402         z2d(:,:)=0._wp 
    479          DO jk = 1, jpkm1 
    480             DO jj = 2, jpjm1 
    481                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    482                   z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) 
    483                END DO 
    484             END DO 
    485          END DO 
     403         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     404            z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t(ji,jj,jk,Kmm) * ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) 
     405         END_3D 
    486406         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. ) 
    487407         CALL iom_put( "somint", rho0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity 
     
    490410      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2) 
    491411      ! 
    492            
     412       
    493413      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt, Kmm )        ! 25h averaging 
    494414 
     
    506426      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr 
    507427      !!---------------------------------------------------------------------- 
    508       ierr = 0 
    509       ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     & 
    510          &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     & 
    511          &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) ) 
     428      IF( nn_write == -1 ) THEN 
     429         dia_wri_alloc = 0 
     430      ELSE     
     431         ierr = 0 
     432         ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     & 
     433            &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     & 
     434            &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) ) 
    512435         ! 
    513       dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr) 
    514       CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc ) 
     436         dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr) 
     437         CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc ) 
     438         ! 
     439      ENDIF 
    515440      ! 
    516441   END FUNCTION dia_wri_alloc 
     442  
     443   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc_abl() 
     444      !!---------------------------------------------------------------------- 
     445     ALLOCATE(   ndex_hA(jpi*jpj), ndex_A (jpi*jpj*jpkam1), STAT=dia_wri_alloc_abl) 
     446      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc_abl ) 
     447      ! 
     448   END FUNCTION dia_wri_alloc_abl 
    517449 
    518450    
     
    538470      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation 
    539471      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers 
     472      INTEGER  ::   ipka                                     ! ABL 
    540473      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers 
    541474      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars 
     
    543476      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace 
    544477      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace 
     478      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE :: zw3d_abl   ! ABL 3D workspace 
    545479      !!---------------------------------------------------------------------- 
    546480      ! 
     
    576510      ijmi = 1      ;      ijma = jpj 
    577511      ipk = jpk 
     512      IF(ln_abl) ipka = jpkam1 
    578513 
    579514      ! define time axis 
     
    678613            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" ) 
    679614 
     615         IF( ln_abl ) THEN  
     616         ! Define the ABL grid FILE ( nid_A ) 
     617            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_ABL' ) 
     618            IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename 
     619            CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit 
     620               &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       & 
     621               &          nit000-1, zjulian, rn_Dt, nh_A, nid_A, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set ) 
     622            CALL histvert( nid_A, "ght_abl", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept 
     623               &           "m", ipka, ght_abl(2:jpka), nz_A, "up" ) 
     624            !                                                            ! Index of ocean points 
     625         ALLOCATE( zw3d_abl(jpi,jpj,ipka) )  
     626         zw3d_abl(:,:,:) = 1._wp  
     627         CALL wheneq( jpi*jpj*ipka, zw3d_abl, 1, 1., ndex_A , ndim_A  )      ! volume 
     628            CALL wheneq( jpi*jpj     , zw3d_abl, 1, 1., ndex_hA, ndim_hA )      ! surface 
     629         DEALLOCATE(zw3d_abl) 
     630         ENDIF 
    680631 
    681632         ! Declare all the output fields as NETCDF variables 
     
    727678         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm 
    728679            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout ) 
    729 ! 
     680         ! 
     681         IF( ln_abl ) THEN 
     682            CALL histdef( nid_A, "t_abl", "Potential Temperature"     , "K"        ,       &  ! t_abl 
     683               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout ) 
     684            CALL histdef( nid_A, "q_abl", "Humidity"                  , "kg/kg"    ,       &  ! q_abl 
     685               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout )  
     686            CALL histdef( nid_A, "u_abl", "Atmospheric U-wind   "     , "m/s"        ,     &  ! u_abl 
     687               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout ) 
     688            CALL histdef( nid_A, "v_abl", "Atmospheric V-wind   "     , "m/s"    ,         &  ! v_abl 
     689               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout )  
     690            CALL histdef( nid_A, "tke_abl", "Atmospheric TKE   "     , "m2/s2"    ,        &  ! tke_abl 
     691               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout )  
     692            CALL histdef( nid_A, "avm_abl", "Atmospheric turbulent viscosity", "m2/s"   ,  &  ! avm_abl 
     693               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout )  
     694            CALL histdef( nid_A, "avt_abl", "Atmospheric turbulent diffusivity", "m2/s2",  &  ! avt_abl 
     695               &          jpi, jpj, nh_A, ipka, 1, ipka, nz_A, 32, clop, zsto, zout )  
     696            CALL histdef( nid_A, "pblh", "Atmospheric boundary layer height "  , "m",      &  ! pblh 
     697               &          jpi, jpj, nh_A,  1  , 1, 1   , -99 , 32, clop, zsto, zout )                  
     698#if defined key_si3 
     699            CALL histdef( nid_A, "oce_frac", "Fraction of open ocean"  , " ",      &  ! ato_i 
     700               &          jpi, jpj, nh_A,  1  , 1, 1   , -99 , 32, clop, zsto, zout ) 
     701#endif 
     702            CALL histend( nid_A, snc4chunks=snc4set ) 
     703         ENDIF 
     704         ! 
    730705         IF( ln_icebergs ) THEN 
    731706            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , & 
     
    885860      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction    
    886861      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed    
    887 ! 
     862      ! 
     863      IF( ln_abl ) THEN  
     864         ALLOCATE( zw3d_abl(jpi,jpj,jpka) ) 
     865         IF( ln_mskland )   THEN  
     866            DO jk=1,jpka 
     867               zw3d_abl(:,:,jk) = tmask(:,:,1) 
     868            END DO        
     869         ELSE 
     870            zw3d_abl(:,:,:) = 1._wp      
     871         ENDIF        
     872         CALL histwrite( nid_A,  "pblh"   , it, pblh(:,:)                  *zw3d_abl(:,:,1     ), ndim_hA, ndex_hA )   ! pblh  
     873         CALL histwrite( nid_A,  "u_abl"  , it, u_abl   (:,:,2:jpka,nt_n  )*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! u_abl 
     874         CALL histwrite( nid_A,  "v_abl"  , it, v_abl   (:,:,2:jpka,nt_n  )*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! v_abl 
     875         CALL histwrite( nid_A,  "t_abl"  , it, tq_abl  (:,:,2:jpka,nt_n,1)*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! t_abl 
     876         CALL histwrite( nid_A,  "q_abl"  , it, tq_abl  (:,:,2:jpka,nt_n,2)*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! q_abl        
     877         CALL histwrite( nid_A,  "tke_abl", it, tke_abl (:,:,2:jpka,nt_n  )*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! tke_abl 
     878         CALL histwrite( nid_A,  "avm_abl", it, avm_abl (:,:,2:jpka       )*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! avm_abl 
     879         CALL histwrite( nid_A,  "avt_abl", it, avt_abl (:,:,2:jpka       )*zw3d_abl(:,:,2:jpka), ndim_A , ndex_A  )   ! avt_abl  
     880#if defined key_si3 
     881         CALL histwrite( nid_A,  "oce_frac"   , it, ato_i(:,:)                                  , ndim_hA, ndex_hA )   ! ato_i 
     882#endif 
     883         DEALLOCATE(zw3d_abl) 
     884      ENDIF 
     885      ! 
    888886      IF( ln_icebergs ) THEN 
    889887         ! 
     
    931929      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress 
    932930 
    933       CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, ww             , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current 
     931      IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
     932         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, ww + wi     , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current 
     933      ELSE 
     934         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, ww          , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current 
     935      ENDIF 
    934936      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef. 
    935937      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef. 
     
    951953         CALL histclo( nid_V ) 
    952954         CALL histclo( nid_W ) 
     955         IF(ln_abl) CALL histclo( nid_A ) 
    953956      ENDIF 
    954957      ! 
     
    974977      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created 
    975978      !! 
    976       INTEGER :: inum 
     979      INTEGER :: inum, jk 
    977980      !!---------------------------------------------------------------------- 
    978981      !  
     
    981984      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created ' 
    982985      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc' 
    983  
    984 #if defined key_si3 
    985      CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl ) 
    986 #else 
    987      CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. ) 
    988 #endif 
    989  
     986      ! 
     987      CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. ) 
     988      ! 
    990989      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', ts(:,:,:,jp_tem,Kmm) )    ! now temperature 
    991990      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) )    ! now salinity 
     
    993992      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', uu(:,:,:,Kmm)                )    ! now i-velocity 
    994993      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vv(:,:,:,Kmm)                )    ! now j-velocity 
    995       CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', ww                )    ! now k-velocity 
     994      IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
     995         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', ww + wi        )    ! now k-velocity 
     996      ELSE 
     997         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', ww             )    ! now k-velocity 
     998      ENDIF 
     999      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'risfdep', risfdep            )    ! now k-velocity 
     1000      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ht'     , ht                 )    ! now water column height 
     1001      ! 
     1002      IF ( ln_isf ) THEN 
     1003         IF (ln_isfcav_mlt) THEN 
     1004            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'fwfisf_cav', fwfisf_cav          )    ! now k-velocity 
     1005            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'rhisf_cav_tbl', rhisf_tbl_cav    )    ! now k-velocity 
     1006            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'rfrac_cav_tbl', rfrac_tbl_cav    )    ! now k-velocity 
     1007            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'misfkb_cav', REAL(misfkb_cav,wp) )    ! now k-velocity 
     1008            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'misfkt_cav', REAL(misfkt_cav,wp) )    ! now k-velocity 
     1009            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'mskisf_cav', REAL(mskisf_cav,wp), ktype = jp_i1 ) 
     1010         END IF 
     1011         IF (ln_isfpar_mlt) THEN 
     1012            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'isfmsk_par', REAL(mskisf_par,wp) )    ! now k-velocity 
     1013            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'fwfisf_par', fwfisf_par          )    ! now k-velocity 
     1014            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'rhisf_par_tbl', rhisf_tbl_par    )    ! now k-velocity 
     1015            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'rfrac_par_tbl', rfrac_tbl_par    )    ! now k-velocity 
     1016            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'misfkb_par', REAL(misfkb_par,wp) )    ! now k-velocity 
     1017            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'misfkt_par', REAL(misfkt_par,wp) )    ! now k-velocity 
     1018            CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'mskisf_par', REAL(mskisf_par,wp), ktype = jp_i1 ) 
     1019         END IF 
     1020      END IF 
     1021      ! 
    9961022      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN 
    9971023         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point 
     
    10171043         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity 
    10181044      ENDIF 
    1019   
     1045      IF ( ln_abl ) THEN 
     1046         CALL iom_rstput ( 0, 0, inum, "uz1_abl",   u_abl(:,:,2,nt_a  ) )   ! now first level i-wind 
     1047         CALL iom_rstput ( 0, 0, inum, "vz1_abl",   v_abl(:,:,2,nt_a  ) )   ! now first level j-wind 
     1048         CALL iom_rstput ( 0, 0, inum, "tz1_abl",  tq_abl(:,:,2,nt_a,1) )   ! now first level temperature 
     1049         CALL iom_rstput ( 0, 0, inum, "qz1_abl",  tq_abl(:,:,2,nt_a,2) )   ! now first level humidity 
     1050      ENDIF 
     1051      ! 
     1052      CALL iom_close( inum ) 
     1053      !  
    10201054#if defined key_si3 
    10211055      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid 
     1056         CALL iom_open( TRIM(cdfile_name)//'_ice', inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl, cdcomp = 'ICE' ) 
    10221057         CALL ice_wri_state( inum ) 
     1058         CALL iom_close( inum ) 
    10231059      ENDIF 
    10241060#endif 
    1025       ! 
    1026       CALL iom_close( inum ) 
    1027       !  
     1061 
    10281062   END SUBROUTINE dia_wri_state 
    10291063 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/domvvl.F90

    r12738 r12939  
    3737 
    3838   PUBLIC  dom_vvl_init       ! called by domain.F90 
     39   PUBLIC  dom_vvl_zgr        ! called by isfcpl.F90 
    3940   PUBLIC  dom_vvl_sf_nxt     ! called by step.F90 
    4041   PUBLIC  dom_vvl_sf_update  ! called by step.F90 
     
    6263   REAL(wp)        , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   :: frq_rst_hdv                 ! retoring period for low freq. divergence 
    6364 
     65   !! * Substitutions 
     66#  include "do_loop_substitute.h90" 
    6467   !!---------------------------------------------------------------------- 
    6568   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    116119      INTEGER, INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa 
    117120      ! 
     121      IF(lwp) WRITE(numout,*) 
     122      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_init : Variable volume activated' 
     123      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
     124      ! 
     125      CALL dom_vvl_ctl     ! choose vertical coordinate (z_star, z_tilde or layer) 
     126      ! 
     127      !                    ! Allocate module arrays 
     128      IF( dom_vvl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_init : unable to allocate arrays' ) 
     129      ! 
     130      !                    ! Read or initialize e3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and hdiv_lf 
     131      CALL dom_vvl_rst( nit000, Kbb, Kmm, 'READ' ) 
     132      e3t(:,:,jpk,Kaa) = e3t_0(:,:,jpk)  ! last level always inside the sea floor set one for all 
     133      ! 
     134      CALL dom_vvl_zgr(Kbb, Kmm, Kaa) ! interpolation scale factor, depth and water column 
     135      ! 
     136   END SUBROUTINE dom_vvl_init 
     137   ! 
     138   SUBROUTINE dom_vvl_zgr(Kbb, Kmm, Kaa) 
     139      !!---------------------------------------------------------------------- 
     140      !!                ***  ROUTINE dom_vvl_init  *** 
     141      !!                    
     142      !! ** Purpose :  Interpolation of all scale factors,  
     143      !!               depths and water column heights 
     144      !! 
     145      !! ** Method  :  - interpolate scale factors 
     146      !! 
     147      !! ** Action  : - e3t_(n/b) and tilde_e3t_(n/b) 
     148      !!              - Regrid: e3(u/v)_n 
     149      !!                        e3(u/v)_b        
     150      !!                        e3w_n            
     151      !!                        e3(u/v)w_b       
     152      !!                        e3(u/v)w_n       
     153      !!                        gdept_n, gdepw_n and gde3w_n 
     154      !!              - h(t/u/v)_0 
     155      !!              - frq_rst_e3t and frq_rst_hdv 
     156      !! 
     157      !! Reference  : Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling. 
     158      !!---------------------------------------------------------------------- 
     159      INTEGER, INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa 
     160      !!---------------------------------------------------------------------- 
    118161      INTEGER ::   ji, jj, jk 
    119162      INTEGER ::   ii0, ii1, ij0, ij1 
    120163      REAL(wp)::   zcoef 
    121164      !!---------------------------------------------------------------------- 
    122       ! 
    123       IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    124       IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_init : Variable volume activated' 
    125       IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
    126       ! 
    127       CALL dom_vvl_ctl     ! choose vertical coordinate (z_star, z_tilde or layer) 
    128       ! 
    129       !                    ! Allocate module arrays 
    130       IF( dom_vvl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_init : unable to allocate arrays' ) 
    131       ! 
    132       !                    ! Read or initialize e3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and hdiv_lf 
    133       CALL dom_vvl_rst( nit000, Kbb, Kmm, 'READ' ) 
    134       e3t(:,:,jpk,Kaa) = e3t_0(:,:,jpk)  ! last level always inside the sea floor set one for all 
    135165      ! 
    136166      !                    !== Set of all other vertical scale factors  ==!  (now and before) 
     
    160190      gdept(:,:,1,Kbb) = 0.5_wp * e3w(:,:,1,Kbb) 
    161191      gdepw(:,:,1,Kbb) = 0.0_wp 
    162       DO jk = 2, jpk                               ! vertical sum 
    163          DO jj = 1,jpj 
    164             DO ji = 1,jpi 
    165                !    zcoef = tmask - wmask    ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
    166                !                             ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf) 
    167                !                             ! 0.5 where jk = mikt      
     192      DO_3D_11_11( 2, jpk ) 
     193         !    zcoef = tmask - wmask    ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
     194         !                             ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf) 
     195         !                             ! 0.5 where jk = mikt      
    168196!!gm ???????   BUG ?  gdept(:,:,:,Kmm) as well as gde3w  does not include the thickness of ISF ?? 
    169                zcoef = ( tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk) ) 
    170                gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm) 
    171                gdept(ji,jj,jk,Kmm) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm))  & 
    172                   &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm))  
    173                gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm) 
    174                gdepw(ji,jj,jk,Kbb) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kbb) + e3t(ji,jj,jk-1,Kbb) 
    175                gdept(ji,jj,jk,Kbb) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kbb) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kbb))  & 
    176                   &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kbb) +       e3w(ji,jj,jk,Kbb))  
    177             END DO 
    178          END DO 
    179       END DO 
     197         zcoef = ( tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk) ) 
     198         gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm) 
     199         gdept(ji,jj,jk,Kmm) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm))  & 
     200            &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm))  
     201         gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm) 
     202         gdepw(ji,jj,jk,Kbb) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kbb) + e3t(ji,jj,jk-1,Kbb) 
     203         gdept(ji,jj,jk,Kbb) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kbb) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kbb))  & 
     204            &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kbb) +       e3w(ji,jj,jk,Kbb))  
     205      END_3D 
    180206      ! 
    181207      !                    !==  thickness of the water column  !!   (ocean portion only) 
     
    212238         ENDIF 
    213239         IF ( ln_vvl_zstar_at_eqtor ) THEN   ! use z-star in vicinity of the Equator 
    214             DO jj = 1, jpj 
    215                DO ji = 1, jpi 
     240            DO_2D_11_11 
    216241!!gm  case |gphi| >= 6 degrees is useless   initialized just above by default 
    217                   IF( ABS(gphit(ji,jj)) >= 6.) THEN 
    218                      ! values outside the equatorial band and transition zone (ztilde) 
    219                      frq_rst_e3t(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
    220                      frq_rst_hdv(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
    221                   ELSEIF( ABS(gphit(ji,jj)) <= 2.5) THEN    ! Equator strip ==> z-star 
    222                      ! values inside the equatorial band (ztilde as zstar) 
    223                      frq_rst_e3t(ji,jj) =  0.0_wp 
    224                      frq_rst_hdv(ji,jj) =  1.0_wp / rn_Dt 
    225                   ELSE                                      ! transition band (2.5 to 6 degrees N/S) 
    226                      !                                      ! (linearly transition from z-tilde to z-star) 
    227                      frq_rst_e3t(ji,jj) = 0.0_wp + (frq_rst_e3t(ji,jj)-0.0_wp)*0.5_wp   & 
    228                         &            * (  1.0_wp - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  & 
    229                         &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) ) 
    230                      frq_rst_hdv(ji,jj) = (1.0_wp / rn_Dt)                                & 
    231                         &            + (  frq_rst_hdv(ji,jj)-(1.e0_wp / rn_Dt) )*0.5_wp   & 
    232                         &            * (  1._wp  - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  & 
    233                         &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) ) 
    234                   ENDIF 
    235                END DO 
    236             END DO 
     242               IF( ABS(gphit(ji,jj)) >= 6.) THEN 
     243                  ! values outside the equatorial band and transition zone (ztilde) 
     244                  frq_rst_e3t(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
     245                  frq_rst_hdv(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.e0_wp ) 
     246               ELSEIF( ABS(gphit(ji,jj)) <= 2.5) THEN    ! Equator strip ==> z-star 
     247                  ! values inside the equatorial band (ztilde as zstar) 
     248                  frq_rst_e3t(ji,jj) =  0.0_wp 
     249                  frq_rst_hdv(ji,jj) =  1.0_wp / rn_Dt 
     250               ELSE                                      ! transition band (2.5 to 6 degrees N/S) 
     251                  !                                      ! (linearly transition from z-tilde to z-star) 
     252                  frq_rst_e3t(ji,jj) = 0.0_wp + (frq_rst_e3t(ji,jj)-0.0_wp)*0.5_wp   & 
     253                     &            * (  1.0_wp - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  & 
     254                     &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) ) 
     255                  frq_rst_hdv(ji,jj) = (1.0_wp / rn_Dt)                                & 
     256                     &            + (  frq_rst_hdv(ji,jj)-(1.e0_wp / rn_Dt) )*0.5_wp   & 
     257                     &            * (  1._wp  - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  & 
     258                     &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) ) 
     259               ENDIF 
     260            END_2D 
    237261            IF( cn_cfg == "orca" .OR. cn_cfg == "ORCA" ) THEN 
    238262               IF( nn_cfg == 3 ) THEN   ! ORCA2: Suppress ztilde in the Foxe Basin for ORCA2 
     
    264288      ENDIF 
    265289      ! 
    266    END SUBROUTINE dom_vvl_init 
     290   END SUBROUTINE dom_vvl_zgr 
    267291 
    268292 
     
    329353      END DO 
    330354      ! 
    331       IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer .AND. ll_do_bclinic ) THEN   ! z_tilde or layer coordinate ! 
    332          !                                                            ! ------baroclinic part------ ! 
     355      IF( (ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer) .AND. ll_do_bclinic ) THEN   ! z_tilde or layer coordinate ! 
     356         !                                                               ! ------baroclinic part------ ! 
    333357         ! I - initialization 
    334358         ! ================== 
     
    383407         zwu(:,:) = 0._wp 
    384408         zwv(:,:) = 0._wp 
    385          DO jk = 1, jpkm1        ! a - first derivative: diffusive fluxes 
    386             DO jj = 1, jpjm1 
    387                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    388                   un_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * umask(ji,jj,jk) * e2_e1u(ji,jj)           & 
    389                      &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji+1,jj  ,jk) ) 
    390                   vn_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * vmask(ji,jj,jk) * e1_e2v(ji,jj)           &  
    391                      &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji  ,jj+1,jk) ) 
    392                   zwu(ji,jj) = zwu(ji,jj) + un_td(ji,jj,jk) 
    393                   zwv(ji,jj) = zwv(ji,jj) + vn_td(ji,jj,jk) 
    394                END DO 
    395             END DO 
    396          END DO 
    397          DO jj = 1, jpj          ! b - correction for last oceanic u-v points 
    398             DO ji = 1, jpi 
    399                un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) = un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) - zwu(ji,jj) 
    400                vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) - zwv(ji,jj) 
    401             END DO 
    402          END DO 
    403          DO jk = 1, jpkm1        ! c - second derivative: divergence of diffusive fluxes 
    404             DO jj = 2, jpjm1 
    405                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    406                   tilde_e3t_a(ji,jj,jk) = tilde_e3t_a(ji,jj,jk) + (   un_td(ji-1,jj  ,jk) - un_td(ji,jj,jk)    & 
    407                      &                                          +     vn_td(ji  ,jj-1,jk) - vn_td(ji,jj,jk)    & 
    408                      &                                            ) * r1_e1e2t(ji,jj) 
    409                END DO 
    410             END DO 
    411          END DO 
     409         DO_3D_10_10( 1, jpkm1 ) 
     410            un_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * umask(ji,jj,jk) * e2_e1u(ji,jj)           & 
     411               &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji+1,jj  ,jk) ) 
     412            vn_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * vmask(ji,jj,jk) * e1_e2v(ji,jj)           &  
     413               &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji  ,jj+1,jk) ) 
     414            zwu(ji,jj) = zwu(ji,jj) + un_td(ji,jj,jk) 
     415            zwv(ji,jj) = zwv(ji,jj) + vn_td(ji,jj,jk) 
     416         END_3D 
     417         DO_2D_11_11 
     418            un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) = un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) - zwu(ji,jj) 
     419            vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) - zwv(ji,jj) 
     420         END_2D 
     421         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     422            tilde_e3t_a(ji,jj,jk) = tilde_e3t_a(ji,jj,jk) + (   un_td(ji-1,jj  ,jk) - un_td(ji,jj,jk)    & 
     423               &                                          +     vn_td(ji  ,jj-1,jk) - vn_td(ji,jj,jk)    & 
     424               &                                            ) * r1_e1e2t(ji,jj) 
     425         END_3D 
    412426         !                       ! d - thickness diffusion transport: boundary conditions 
    413427         !                             (stored for tracer advction and continuity equation) 
     
    416430         ! 4 - Time stepping of baroclinic scale factors 
    417431         ! --------------------------------------------- 
    418          ! Leapfrog time stepping 
    419          ! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 
    420432         CALL lbc_lnk( 'domvvl', tilde_e3t_a(:,:,:), 'T', 1._wp ) 
    421433         tilde_e3t_a(:,:,:) = tilde_e3t_b(:,:,:) + rDt * tmask(:,:,:) * tilde_e3t_a(:,:,:) 
     
    438450            ELSE 
    439451               ijk_max = MAXLOC( ze3t(:,:,:) ) 
    440                ijk_max(1) = ijk_max(1) + nimpp - 1 
    441                ijk_max(2) = ijk_max(2) + njmpp - 1 
     452               ijk_max(1) = mig0(ijk_max(1)) 
     453               ijk_max(2) = mjg0(ijk_max(2)) 
    442454               ijk_min = MINLOC( ze3t(:,:,:) ) 
    443                ijk_min(1) = ijk_min(1) + nimpp - 1 
    444                ijk_min(2) = ijk_min(2) + njmpp - 1 
     455               ijk_min(1) = mig0(ijk_min(1)) 
     456               ijk_min(2) = mjg0(ijk_min(2)) 
    445457            ENDIF 
    446458            IF (lwp) THEN 
     
    613625         tilde_e3t_n(:,:,:) = tilde_e3t_a(:,:,:) 
    614626      ENDIF 
    615       gdept(:,:,:,Kbb) = gdept(:,:,:,Kmm) 
    616       gdepw(:,:,:,Kbb) = gdepw(:,:,:,Kmm) 
    617  
    618       e3t(:,:,:,Kmm) = e3t(:,:,:,Kaa) 
    619       e3u(:,:,:,Kmm) = e3u(:,:,:,Kaa) 
    620       e3v(:,:,:,Kmm) = e3v(:,:,:,Kaa) 
    621627 
    622628      ! Compute all missing vertical scale factor and depths 
     
    641647      gdepw(:,:,1,Kmm) = 0.0_wp 
    642648      gde3w(:,:,1) = gdept(:,:,1,Kmm) - ssh(:,:,Kmm) 
    643       DO jk = 2, jpk 
    644          DO jj = 1,jpj 
    645             DO ji = 1,jpi 
    646               !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
    647                                                                  ! 1 for jk = mikt 
    648                zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
    649                gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm) 
    650                gdept(ji,jj,jk,Kmm) =    zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm) )  & 
    651                    &             + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm) )  
    652                gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm) 
    653             END DO 
    654          END DO 
    655       END DO 
     649      DO_3D_11_11( 2, jpk ) 
     650        !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt 
     651                                                           ! 1 for jk = mikt 
     652         zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk)) 
     653         gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm) 
     654         gdept(ji,jj,jk,Kmm) =    zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm) )  & 
     655             &             + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm) )  
     656         gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm) 
     657      END_3D 
    656658 
    657659      ! Local depth and Inverse of the local depth of the water 
     
    700702         ! 
    701703      CASE( 'U' )                   !* from T- to U-point : hor. surface weighted mean 
    702          DO jk = 1, jpk 
    703             DO jj = 1, jpjm1 
    704                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    705                   pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2u(ji,jj)   & 
    706                      &                       * (   e1e2t(ji  ,jj) * ( pe3_in(ji  ,jj,jk) - e3t_0(ji  ,jj,jk) )     & 
    707                      &                           + e1e2t(ji+1,jj) * ( pe3_in(ji+1,jj,jk) - e3t_0(ji+1,jj,jk) ) ) 
    708                END DO 
    709             END DO 
    710          END DO 
     704         DO_3D_10_10( 1, jpk ) 
     705            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2u(ji,jj)   & 
     706               &                       * (   e1e2t(ji  ,jj) * ( pe3_in(ji  ,jj,jk) - e3t_0(ji  ,jj,jk) )     & 
     707               &                           + e1e2t(ji+1,jj) * ( pe3_in(ji+1,jj,jk) - e3t_0(ji+1,jj,jk) ) ) 
     708         END_3D 
    711709         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'U', 1._wp ) 
    712710         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3u_0(:,:,:) 
    713711         ! 
    714712      CASE( 'V' )                   !* from T- to V-point : hor. surface weighted mean 
    715          DO jk = 1, jpk 
    716             DO jj = 1, jpjm1 
    717                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    718                   pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * ( vmask(ji,jj,jk)  * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2v(ji,jj)   & 
    719                      &                       * (   e1e2t(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3t_0(ji,jj  ,jk) )     & 
    720                      &                           + e1e2t(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3t_0(ji,jj+1,jk) ) ) 
    721                END DO 
    722             END DO 
    723          END DO 
     713         DO_3D_10_10( 1, jpk ) 
     714            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * ( vmask(ji,jj,jk)  * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2v(ji,jj)   & 
     715               &                       * (   e1e2t(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3t_0(ji,jj  ,jk) )     & 
     716               &                           + e1e2t(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3t_0(ji,jj+1,jk) ) ) 
     717         END_3D 
    724718         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'V', 1._wp ) 
    725719         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3v_0(:,:,:) 
    726720         ! 
    727721      CASE( 'F' )                   !* from U-point to F-point : hor. surface weighted mean 
    728          DO jk = 1, jpk 
    729             DO jj = 1, jpjm1 
    730                DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    731                   pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj+1,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) & 
    732                      &                       *    r1_e1e2f(ji,jj)                                                  & 
    733                      &                       * (   e1e2u(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3u_0(ji,jj  ,jk) )     & 
    734                      &                           + e1e2u(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3u_0(ji,jj+1,jk) ) ) 
    735                END DO 
    736             END DO 
    737          END DO 
     722         DO_3D_10_10( 1, jpk ) 
     723            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj+1,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) & 
     724               &                       *    r1_e1e2f(ji,jj)                                                  & 
     725               &                       * (   e1e2u(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3u_0(ji,jj  ,jk) )     & 
     726               &                           + e1e2u(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3u_0(ji,jj+1,jk) ) ) 
     727         END_3D 
    738728         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'F', 1._wp ) 
    739729         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3f_0(:,:,:) 
     
    810800            id4 = iom_varid( numror, 'tilde_e3t_n', ldstop = .FALSE. ) 
    811801            id5 = iom_varid( numror, 'hdiv_lf', ldstop = .FALSE. ) 
     802            ! 
    812803            !                             ! --------- ! 
    813804            !                             ! all cases ! 
    814805            !                             ! --------- ! 
     806            ! 
    815807            IF( MIN( id1, id2 ) > 0 ) THEN       ! all required arrays exist 
    816808               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lrxios ) 
     
    828820               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t(:,:,:,Kmm) not found in restart files' 
    829821               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_n set equal to e3t_b.' 
    830                IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to .true.' 
     822               IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to true' 
    831823               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lrxios ) 
    832824               e3t(:,:,:,Kmm) = e3t(:,:,:,Kbb) 
     
    835827               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t(:,:,:,Kbb) not found in restart files' 
    836828               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_b set equal to e3t_n.' 
    837                IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to .true.' 
     829               IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to true' 
    838830               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lrxios ) 
    839831               e3t(:,:,:,Kbb) = e3t(:,:,:,Kmm) 
     
    842834               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst WARNING : e3t(:,:,:,Kmm) not found in restart file' 
    843835               IF(lwp) write(numout,*) 'Compute scale factor from sshn' 
    844                IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to .true.' 
     836               IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to true' 
    845837               DO jk = 1, jpk 
    846838                  e3t(:,:,jk,Kmm) =  e3t_0(:,:,jk) * ( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kmm) ) & 
     
    895887                  ssh(:,:,Kbb) = -ssh_ref 
    896888 
    897                   DO jj = 1, jpj 
    898                      DO ji = 1, jpi 
    899                         IF( ht_0(ji,jj)-ssh_ref <  rn_wdmin1 ) THEN ! if total depth is less than min depth 
    900                            ssh(ji,jj,Kbb) = rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj) ) 
    901                            ssh(ji,jj,Kmm) = rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj) ) 
    902                         ENDIF 
    903                      ENDDO 
    904                   ENDDO 
     889                  DO_2D_11_11 
     890                     IF( ht_0(ji,jj)-ssh_ref <  rn_wdmin1 ) THEN ! if total depth is less than min depth 
     891                        ssh(ji,jj,Kbb) = rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj) ) 
     892                        ssh(ji,jj,Kmm) = rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj) ) 
     893                     ENDIF 
     894                  END_2D 
    905895               ENDIF !If test case else 
    906896 
     
    913903               e3t(:,:,:,Kbb) = e3t(:,:,:,Kmm) 
    914904 
    915                DO ji = 1, jpi 
    916                   DO jj = 1, jpj 
    917                      IF ( ht_0(ji,jj) .LE. 0.0 .AND. NINT( ssmask(ji,jj) ) .EQ. 1) THEN 
    918                        CALL ctl_stop( 'dom_vvl_rst: ht_0 must be positive at potentially wet points' ) 
    919                      ENDIF 
    920                   END DO  
    921                END DO  
     905               DO_2D_11_11 
     906                  IF ( ht_0(ji,jj) .LE. 0.0 .AND. NINT( ssmask(ji,jj) ) .EQ. 1) THEN 
     907                     CALL ctl_stop( 'dom_vvl_rst: ht_0 must be positive at potentially wet points' ) 
     908                  ENDIF 
     909               END_2D 
    922910               ! 
    923911            ELSE 
    924912               ! 
    925                ! usr_def_istate called here only to get sshb, that is needed to initialize e3t(Kbb) and e3t(Kmm) 
    926                CALL usr_def_istate( gdept_0, tmask, ts(:,:,:,:,Kbb), uu(:,:,:,Kbb), vv(:,:,:,Kbb), ssh(:,:,Kbb)  ) 
    927                ! usr_def_istate will be called again in istate_init to initialize ts(bn), ssh(bn), u(bn) and v(bn) 
     913               ! usr_def_istate called here only to get ssh(Kbb) needed to initialize e3t(Kbb) and e3t(Kmm) 
     914               ! 
     915               CALL usr_def_istate( gdept_0, tmask, ts(:,:,:,:,Kbb), uu(:,:,:,Kbb), vv(:,:,:,Kbb), ssh(:,:,Kbb)  )   
     916               ! 
     917               ! usr_def_istate will be called again in istate_init to initialize ts, ssh, u and v 
    928918               ! 
    929919               DO jk=1,jpk 
    930                   e3t(:,:,jk,Kmm) =  e3t_0(:,:,jk) * ( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kbb) ) & 
    931                     &                              / ( ht_0(:,:) + 1._wp - ssmask(:,:) ) * tmask(:,:,jk)   & 
    932                     &              + e3t_0(:,:,jk) * ( 1._wp - tmask(:,:,jk) )   ! make sure e3t_b != 0 on land points 
     920                  e3t(:,:,jk,Kbb) =  e3t_0(:,:,jk) * ( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kbb) ) & 
     921                    &                            / ( ht_0(:,:) + 1._wp - ssmask(:,:) ) * tmask(:,:,jk)   & 
     922                    &            + e3t_0(:,:,jk) * ( 1._wp - tmask(:,:,jk) )   ! make sure e3t(:,:,:,Kbb) != 0 on land points 
    933923               END DO 
    934924               e3t(:,:,:,Kmm) = e3t(:,:,:,Kbb) 
    935                ssh(:,:  ,Kmm) = ssh(:,:  ,Kbb)   ! needed later for gde3w 
     925               ssh(:,:,Kmm) = ssh(:,:,Kbb)                                     ! needed later for gde3w 
    936926               ! 
    937927            END IF           ! end of ll_wd edits 
     
    10251015      ! 
    10261016      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'Choose ONE vertical coordinate in namelist nam_vvl' ) 
    1027       IF( .NOT. ln_vvl_zstar .AND. ln_isf ) CALL ctl_stop( 'Only vvl_zstar has been tested with ice shelf cavity' ) 
    10281017      ! 
    10291018      IF(lwp) THEN                   ! Print the choice 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/stpctl.F90

    r12377 r12939  
    1919   USE dom_oce         ! ocean space and time domain variables  
    2020   USE c1d             ! 1D vertical configuration 
     21   USE zdf_oce ,  ONLY : ln_zad_Aimp       ! ocean vertical physics variables 
     22   USE wet_dry,   ONLY : ll_wd, ssh_ref    ! reference depth for negative bathy 
     23   !   
    2124   USE diawri          ! Standard run outputs       (dia_wri_state routine) 
    22    ! 
    2325   USE in_out_manager  ! I/O manager 
    2426   USE lbclnk          ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link) 
    2527   USE lib_mpp         ! distributed memory computing 
    26    USE zdf_oce ,  ONLY : ln_zad_Aimp       ! ocean vertical physics variables 
    27    USE wet_dry,   ONLY : ll_wd, ssh_ref    ! reference depth for negative bathy 
    28  
     28   ! 
    2929   USE netcdf          ! NetCDF library 
    3030   IMPLICIT NONE 
     
    3333   PUBLIC stp_ctl           ! routine called by step.F90 
    3434 
    35    INTEGER  ::   idrun, idtime, idssh, idu, ids1, ids2, idt1, idt2, idc1, idw1, istatus 
    36    LOGICAL  ::   lsomeoce 
     35   INTEGER                ::   nrunid   ! netcdf file id 
     36   INTEGER, DIMENSION(8)  ::   nvarid   ! netcdf variable id 
    3737   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3838   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    4242CONTAINS 
    4343 
    44    SUBROUTINE stp_ctl( kt, Kbb, Kmm, kindic ) 
     44   SUBROUTINE stp_ctl( kt, Kmm ) 
    4545      !!---------------------------------------------------------------------- 
    4646      !!                    ***  ROUTINE stp_ctl  *** 
     
    5050      !! ** Method  : - Save the time step in numstp 
    5151      !!              - Print it each 50 time steps 
    52       !!              - Stop the run IF problem encountered by setting indic=-3 
     52      !!              - Stop the run IF problem encountered by setting nstop > 0 
    5353      !!                Problems checked: |ssh| maximum larger than 10 m 
    5454      !!                                  |U|   maximum larger than 10 m/s  
     
    5757      !! ** Actions :   "time.step" file = last ocean time-step 
    5858      !!                "run.stat"  file = run statistics 
    59       !!                nstop indicator sheared among all local domain (lk_mpp=T) 
     59      !!                 nstop indicator sheared among all local domain 
    6060      !!---------------------------------------------------------------------- 
    6161      INTEGER, INTENT(in   ) ::   kt       ! ocean time-step index 
    62       INTEGER, INTENT(in   ) ::   Kbb, Kmm      ! ocean time level index 
    63       INTEGER, INTENT(inout) ::   kindic   ! error indicator 
    64       !! 
    65       INTEGER                ::   ji, jj, jk          ! dummy loop indices 
    66       INTEGER, DIMENSION(2)  ::   ih                  ! min/max loc indices 
    67       INTEGER, DIMENSION(3)  ::   iu, is1, is2        ! min/max loc indices 
    68       REAL(wp)               ::   zzz                 ! local real  
    69       REAL(wp), DIMENSION(9) ::   zmax 
    70       LOGICAL                ::   ll_wrtstp, ll_colruns, ll_wrtruns 
    71       CHARACTER(len=20) :: clname 
    72       !!---------------------------------------------------------------------- 
    73       ! 
    74       ll_wrtstp  = ( MOD( kt, sn_cfctl%ptimincr ) == 0 ) .OR. ( kt == nitend ) 
    75       ll_colruns = ll_wrtstp .AND. ( ln_ctl .OR. sn_cfctl%l_runstat ) 
    76       ll_wrtruns = ll_colruns .AND. lwm 
    77       IF( kt == nit000 .AND. lwp ) THEN 
    78          WRITE(numout,*) 
    79          WRITE(numout,*) 'stp_ctl : time-stepping control' 
    80          WRITE(numout,*) '~~~~~~~' 
    81          !                                ! open time.step file 
    82          IF( lwm ) CALL ctl_opn( numstp, 'time.step', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
    83          !                                ! open run.stat file(s) at start whatever 
    84          !                                ! the value of sn_cfctl%ptimincr 
    85          IF( lwm .AND. ( ln_ctl .OR. sn_cfctl%l_runstat ) ) THEN 
     62      INTEGER, INTENT(in   ) ::   Kmm      ! ocean time level index 
     63      !! 
     64      INTEGER                         ::   ji                                    ! dummy loop indices 
     65      INTEGER                         ::   idtime, istatus 
     66      INTEGER , DIMENSION(9)          ::   iareasum, iareamin, iareamax 
     67      INTEGER , DIMENSION(3,4)        ::   iloc                                  ! min/max loc indices 
     68      REAL(wp)                        ::   zzz                                   ! local real  
     69      REAL(wp), DIMENSION(9)          ::   zmax, zmaxlocal 
     70      LOGICAL                         ::   ll_wrtstp, ll_colruns, ll_wrtruns 
     71      LOGICAL, DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   llmsk 
     72      CHARACTER(len=20)               ::   clname 
     73      !!---------------------------------------------------------------------- 
     74      IF( nstop > 0 .AND. ngrdstop > -1 )   RETURN   !   stpctl was already called by a child grid 
     75      ! 
     76      ll_wrtstp  = ( MOD( kt-nit000, sn_cfctl%ptimincr ) == 0 ) .OR. ( kt == nitend ) 
     77      ll_colruns = ll_wrtstp .AND. sn_cfctl%l_runstat .AND. jpnij > 1  
     78      ll_wrtruns = ( ll_colruns .OR. jpnij == 1 ) .AND. lwm 
     79      ! 
     80      IF( kt == nit000 ) THEN 
     81         ! 
     82         IF( lwp ) THEN 
     83            WRITE(numout,*) 
     84            WRITE(numout,*) 'stp_ctl : time-stepping control' 
     85            WRITE(numout,*) '~~~~~~~' 
     86         ENDIF 
     87         !                                ! open time.step    ascii file, done only by 1st subdomain 
     88         IF( lwm )   CALL ctl_opn( numstp, 'time.step', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
     89         ! 
     90         IF( ll_wrtruns ) THEN 
     91            !                             ! open run.stat     ascii file, done only by 1st subdomain 
    8692            CALL ctl_opn( numrun, 'run.stat', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea ) 
     93            !                             ! open run.stat.nc netcdf file, done only by 1st subdomain 
    8794            clname = 'run.stat.nc' 
    8895            IF( .NOT. Agrif_Root() )   clname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//TRIM(clname) 
    89             istatus = NF90_CREATE( TRIM(clname), NF90_CLOBBER, idrun ) 
    90             istatus = NF90_DEF_DIM( idrun, 'time', NF90_UNLIMITED, idtime ) 
    91             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun, 'abs_ssh_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idssh ) 
    92             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,   'abs_u_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idu  ) 
    93             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,       's_min', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), ids1 ) 
    94             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,       's_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), ids2 ) 
    95             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,       't_min', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idt1 ) 
    96             istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,       't_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idt2 ) 
     96            istatus = NF90_CREATE( TRIM(clname), NF90_CLOBBER, nrunid ) 
     97            istatus = NF90_DEF_DIM( nrunid, 'time', NF90_UNLIMITED, idtime ) 
     98            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid, 'abs_ssh_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(1) ) 
     99            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,   'abs_u_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(2) ) 
     100            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,       's_min', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(3) ) 
     101            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,       's_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(4) ) 
     102            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,       't_min', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(5) ) 
     103            istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,       't_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(6) ) 
    97104            IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
    98                istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,   'abs_wi_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idw1 ) 
    99                istatus = NF90_DEF_VAR( idrun,       'Cu_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), idc1 ) 
     105               istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,   'Cf_max', NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(7) ) 
     106               istatus = NF90_DEF_VAR( nrunid,'abs_wi_max',NF90_DOUBLE, (/ idtime /), nvarid(8) ) 
    100107            ENDIF 
    101             istatus = NF90_ENDDEF(idrun) 
    102             zmax(8:9) = 0._wp    ! initialise to zero in case ln_zad_Aimp option is not in use 
    103          ENDIF 
    104       ENDIF 
    105       IF( kt == nit000 )   lsomeoce = COUNT( ssmask(:,:) == 1._wp ) > 0 
    106       ! 
    107       IF(lwm .AND. ll_wrtstp) THEN        !==  current time step  ==!   ("time.step" file) 
     108            istatus = NF90_ENDDEF(nrunid) 
     109         ENDIF 
     110         !     
     111      ENDIF 
     112      ! 
     113      !                                   !==              write current time step              ==! 
     114      !                                   !==  done only by 1st subdomain at writting timestep  ==! 
     115      IF( lwm .AND. ll_wrtstp ) THEN 
    108116         WRITE ( numstp, '(1x, i8)' )   kt 
    109117         REWIND( numstp ) 
    110118      ENDIF 
    111       ! 
    112       !                                   !==  test of extrema  ==! 
     119      !                                   !==            test of local extrema           ==! 
     120      !                                   !==  done by all processes at every time step  ==! 
     121      llmsk(:,:,1) = ssmask(:,:) == 1._wp 
    113122      IF( ll_wd ) THEN 
    114          zmax(1) = MAXVAL(  ABS( ssh(:,:,Kmm) + ssh_ref*tmask(:,:,1) )  )        ! ssh max  
     123         zmax(1) = MAXVAL( ABS( ssh(:,:,Kmm) + ssh_ref ), mask = llmsk(:,:,1) )   ! ssh max 
    115124      ELSE 
    116          zmax(1) = MAXVAL(  ABS( ssh(:,:,Kmm) )  )                               ! ssh max 
    117       ENDIF 
    118       zmax(2) = MAXVAL(  ABS( uu(:,:,:,Kmm) )  )                                  ! velocity max (zonal only) 
    119       zmax(3) = MAXVAL( -ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) , mask = tmask(:,:,:) == 1._wp )   ! minus salinity max 
    120       zmax(4) = MAXVAL(  ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) , mask = tmask(:,:,:) == 1._wp )   !       salinity max 
    121       zmax(5) = MAXVAL( -ts(:,:,:,jp_tem,Kmm) , mask = tmask(:,:,:) == 1._wp )   ! minus temperature max 
    122       zmax(6) = MAXVAL(  ts(:,:,:,jp_tem,Kmm) , mask = tmask(:,:,:) == 1._wp )   !       temperature max 
    123       zmax(7) = REAL( nstop , wp )                                            ! stop indicator 
    124       IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
    125          zmax(8) = MAXVAL(  ABS( wi(:,:,:) ) , mask = wmask(:,:,:) == 1._wp ) ! implicit vertical vel. max 
    126          zmax(9) = MAXVAL(   Cu_adv(:,:,:)   , mask = tmask(:,:,:) == 1._wp ) !       cell Courant no. max 
    127       ENDIF 
    128       ! 
     125         zmax(1) = MAXVAL( ABS( ssh(:,:,Kmm)           ), mask = llmsk(:,:,1) )   ! ssh max 
     126      ENDIF 
     127      llmsk(:,:,:) = umask(:,:,:) == 1._wp 
     128      zmax(2) = MAXVAL(  ABS( uu(:,:,:,Kmm) ), mask = llmsk )                     ! velocity max (zonal only) 
     129      llmsk(:,:,:) = tmask(:,:,:) == 1._wp 
     130      zmax(3) = MAXVAL( -ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), mask = llmsk )                     ! minus salinity max 
     131      zmax(4) = MAXVAL(  ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), mask = llmsk )                     !       salinity max 
     132      IF( ll_colruns ) THEN     ! following variables are used only in the netcdf file 
     133         zmax(5) = MAXVAL( -ts(:,:,:,jp_tem,Kmm), mask = llmsk )                  ! minus temperature max 
     134         zmax(6) = MAXVAL(  ts(:,:,:,jp_tem,Kmm), mask = llmsk )                  !       temperature max 
     135         IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
     136            zmax(7) = MAXVAL(   Cu_adv(:,:,:)   , mask = llmsk )                  ! partitioning coeff. max 
     137            llmsk(:,:,:) = wmask(:,:,:) == 1._wp 
     138            zmax(8) = MAXVAL(  ABS( wi(:,:,:) ) , mask = llmsk )                  ! implicit vertical vel. max 
     139         ELSE 
     140            zmax(7:8) = 0._wp 
     141         ENDIF 
     142      ELSE 
     143         zmax(5:8) = 0._wp 
     144      ENDIF 
     145      zmax(9) = REAL( nstop, wp )                                              ! stop indicator 
     146      !                                   !==               get global extrema             ==! 
     147      !                                   !==  done by all processes if writting run.stat  ==! 
    129148      IF( ll_colruns ) THEN 
     149         zmaxlocal(:) = zmax(:) 
    130150         CALL mpp_max( "stpctl", zmax )          ! max over the global domain 
    131          nstop = NINT( zmax(7) )                 ! nstop indicator sheared among all local domains 
    132       ENDIF 
    133       !                                   !==  run statistics  ==!   ("run.stat" files) 
     151         nstop = NINT( zmax(9) )                 ! update nstop indicator (now sheared among all local domains) 
     152      ENDIF 
     153      !                                   !==              write "run.stat" files              ==! 
     154      !                                   !==  done only by 1st subdomain at writting timestep  ==! 
    134155      IF( ll_wrtruns ) THEN 
    135156         WRITE(numrun,9500) kt, zmax(1), zmax(2), -zmax(3), zmax(4) 
    136          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun, idssh, (/ zmax(1)/), (/kt/), (/1/) ) 
    137          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,   idu, (/ zmax(2)/), (/kt/), (/1/) ) 
    138          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  ids1, (/-zmax(3)/), (/kt/), (/1/) ) 
    139          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  ids2, (/ zmax(4)/), (/kt/), (/1/) ) 
    140          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  idt1, (/-zmax(5)/), (/kt/), (/1/) ) 
    141          istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  idt2, (/ zmax(6)/), (/kt/), (/1/) ) 
     157         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(1), (/ zmax(1)/), (/kt/), (/1/) ) 
     158         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(2), (/ zmax(2)/), (/kt/), (/1/) ) 
     159         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(3), (/-zmax(3)/), (/kt/), (/1/) ) 
     160         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(4), (/ zmax(4)/), (/kt/), (/1/) ) 
     161         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(5), (/-zmax(5)/), (/kt/), (/1/) ) 
     162         istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(6), (/ zmax(6)/), (/kt/), (/1/) ) 
    142163         IF( ln_zad_Aimp ) THEN 
    143             istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  idw1, (/ zmax(8)/), (/kt/), (/1/) ) 
    144             istatus = NF90_PUT_VAR( idrun,  idc1, (/ zmax(9)/), (/kt/), (/1/) ) 
    145          ENDIF 
    146          IF( MOD( kt , 100 ) == 0 ) istatus = NF90_SYNC(idrun) 
    147          IF( kt == nitend         ) istatus = NF90_CLOSE(idrun) 
     164            istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(7), (/ zmax(7)/), (/kt/), (/1/) ) 
     165            istatus = NF90_PUT_VAR( nrunid, nvarid(8), (/ zmax(8)/), (/kt/), (/1/) ) 
     166         ENDIF 
     167         IF( kt == nitend )   istatus = NF90_CLOSE(nrunid) 
    148168      END IF 
    149       !                                   !==  error handling  ==! 
    150       IF( ( ln_ctl .OR. lsomeoce ) .AND. (   &             ! have use mpp_max (because ln_ctl=.T.) or contains some ocean points 
    151          &  zmax(1) >   20._wp .OR.   &                    ! too large sea surface height ( > 20 m ) 
    152          &  zmax(2) >   10._wp .OR.   &                    ! too large velocity ( > 10 m/s) 
    153 !!$      &  zmax(3) >=   0._wp .OR.   &                    ! negative or zero sea surface salinity 
    154 !!$      &  zmax(4) >= 100._wp .OR.   &                    ! too large sea surface salinity ( > 100 ) 
    155 !!$      &  zmax(4) <    0._wp .OR.   &                    ! too large sea surface salinity (keep this line for sea-ice) 
    156          &  ISNAN( zmax(1) + zmax(2) + zmax(3) ) ) ) THEN   ! NaN encounter in the tests 
    157          IF( lk_mpp .AND. ln_ctl ) THEN 
    158             CALL mpp_maxloc( 'stpctl', ABS(ssh(:,:,Kmm))        , ssmask(:,:)  , zzz, ih  ) 
    159             CALL mpp_maxloc( 'stpctl', ABS(uu(:,:,:,Kmm))          , umask (:,:,:), zzz, iu  ) 
    160             CALL mpp_minloc( 'stpctl', ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), tmask (:,:,:), zzz, is1 ) 
    161             CALL mpp_maxloc( 'stpctl', ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), tmask (:,:,:), zzz, is2 ) 
     169      !                                   !==               error handling               ==! 
     170      !                                   !==  done by all processes at every time step  ==! 
     171      ! 
     172      IF(   zmax(1) >   20._wp .OR.   &                   ! too large sea surface height ( > 20 m ) 
     173         &  zmax(2) >   10._wp .OR.   &                   ! too large velocity ( > 10 m/s) 
     174!!$         &  zmax(3) >=   0._wp .OR.   &                   ! negative or zero sea surface salinity 
     175!!$         &  zmax(4) >= 100._wp .OR.   &                   ! too large sea surface salinity ( > 100 ) 
     176!!$         &  zmax(4) <    0._wp .OR.   &                   ! too large sea surface salinity (keep this line for sea-ice) 
     177         &  ISNAN( zmax(1) + zmax(2) + zmax(3) ) .OR.   &               ! NaN encounter in the tests 
     178         &  ABS(   zmax(1) + zmax(2) + zmax(3) ) > HUGE(1._wp) ) THEN   ! Infinity encounter in the tests 
     179         ! 
     180         iloc(:,:) = 0 
     181         IF( ll_colruns ) THEN   ! zmax is global, so it is the same on all subdomains -> no dead lock with mpp_maxloc 
     182            ! first: close the netcdf file, so we can read it 
     183            IF( lwm .AND. kt /= nitend )   istatus = NF90_CLOSE(nrunid) 
     184            ! get global loc on the min/max 
     185            CALL mpp_maxloc( 'stpctl', ABS(ssh(:,:,         Kmm)), ssmask(:,:  ), zzz, iloc(1:2,1) )   ! mpp_maxloc ok if mask = F  
     186            CALL mpp_maxloc( 'stpctl', ABS( uu(:,:,:,       Kmm)),  umask(:,:,:), zzz, iloc(1:3,2) ) 
     187            CALL mpp_minloc( 'stpctl',      ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) ,  tmask(:,:,:), zzz, iloc(1:3,3) ) 
     188            CALL mpp_maxloc( 'stpctl',      ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) ,  tmask(:,:,:), zzz, iloc(1:3,4) ) 
     189            ! find which subdomain has the max. 
     190            iareamin(:) = jpnij+1   ;   iareamax(:) = 0   ;   iareasum(:) = 0 
     191            DO ji = 1, 9 
     192               IF( zmaxlocal(ji) == zmax(ji) ) THEN 
     193                  iareamin(ji) = narea   ;   iareamax(ji) = narea   ;   iareasum(ji) = 1 
     194               ENDIF 
     195            END DO 
     196            CALL mpp_min( "stpctl", iareamin )         ! min over the global domain 
     197            CALL mpp_max( "stpctl", iareamax )         ! max over the global domain 
     198            CALL mpp_sum( "stpctl", iareasum )         ! sum over the global domain 
     199         ELSE                    ! find local min and max locations: 
     200            ! if we are here, this means that the subdomain contains some oce points -> no need to test the mask used in maxloc 
     201            iloc(1:2,1) = MAXLOC( ABS( ssh(:,:,         Kmm)), mask = ssmask(:,:  ) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1    /) 
     202            iloc(1:3,2) = MAXLOC( ABS(  uu(:,:,:,       Kmm)), mask =  umask(:,:,:) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
     203            iloc(1:3,3) = MINLOC(       ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) , mask =  tmask(:,:,:) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
     204            iloc(1:3,4) = MAXLOC(       ts(:,:,:,jp_sal,Kmm) , mask =  tmask(:,:,:) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
     205            iareamin(:) = narea   ;   iareamax(:) = narea   ;   iareasum(:) = 1         ! this is local information 
     206         ENDIF 
     207         ! 
     208         WRITE(ctmp1,*) ' stp_ctl: |ssh| > 20 m  or  |U| > 10 m/s  or  S <= 0  or  S >= 100  or  NaN encounter in the tests' 
     209         CALL wrt_line( ctmp2, kt, '|ssh| max',  zmax(1), iloc(:,1), iareasum(1), iareamin(1), iareamax(1) ) 
     210         CALL wrt_line( ctmp3, kt, '|U|   max',  zmax(2), iloc(:,2), iareasum(2), iareamin(2), iareamax(2) ) 
     211         CALL wrt_line( ctmp4, kt, 'Sal   min', -zmax(3), iloc(:,3), iareasum(3), iareamin(3), iareamax(3) ) 
     212         CALL wrt_line( ctmp5, kt, 'Sal   max',  zmax(4), iloc(:,4), iareasum(4), iareamin(4), iareamax(4) ) 
     213         IF( Agrif_Root() ) THEN 
     214            WRITE(ctmp6,*) '      ===> output of last computed fields in output.abort* files' 
    162215         ELSE 
    163             ih(:)  = MAXLOC( ABS( ssh(:,:,Kmm)   )                              ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1    /) 
    164             iu(:)  = MAXLOC( ABS( uu  (:,:,:,Kmm) )                              ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
    165             is1(:) = MINLOC( ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), mask = tmask(:,:,:) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
    166             is2(:) = MAXLOC( ts(:,:,:,jp_sal,Kmm), mask = tmask(:,:,:) == 1._wp ) + (/ nimpp - 1, njmpp - 1, 0 /) 
    167          ENDIF 
    168           
    169          WRITE(ctmp1,*) ' stp_ctl: |ssh| > 20 m  or  |U| > 10 m/s  or  S <= 0  or  S >= 100  or  NaN encounter in the tests' 
    170          WRITE(ctmp2,9100) kt,   zmax(1), ih(1) , ih(2) 
    171          WRITE(ctmp3,9200) kt,   zmax(2), iu(1) , iu(2) , iu(3) 
    172          WRITE(ctmp4,9300) kt, - zmax(3), is1(1), is1(2), is1(3) 
    173          WRITE(ctmp5,9400) kt,   zmax(4), is2(1), is2(2), is2(3) 
    174          WRITE(ctmp6,*) '      ===> output of last computed fields in output.abort.nc file' 
    175           
     216            WRITE(ctmp6,*) '      ===> output of last computed fields in '//TRIM(Agrif_CFixed())//'_output.abort* files' 
     217         ENDIF 
     218         ! 
    176219         CALL dia_wri_state( Kmm, 'output.abort' )     ! create an output.abort file 
    177           
    178          IF( .NOT. ln_ctl ) THEN 
    179             WRITE(ctmp8,*) 'E R R O R message from sub-domain: ', narea 
    180             CALL ctl_stop( 'STOP', ctmp1, ' ', ctmp8, ' ', ctmp2, ctmp3, ctmp4, ctmp5, ctmp6 ) 
    181          ELSE 
    182             CALL ctl_stop( ctmp1, ' ', ctmp2, ctmp3, ctmp4, ctmp5, ' ', ctmp6, ' ' ) 
    183          ENDIF 
    184  
    185          kindic = -3 
    186          ! 
    187       ENDIF 
    188       ! 
    189 9100  FORMAT (' kt=',i8,'   |ssh| max: ',1pg11.4,', at  i j  : ',2i5) 
    190 9200  FORMAT (' kt=',i8,'   |U|   max: ',1pg11.4,', at  i j k: ',3i5) 
    191 9300  FORMAT (' kt=',i8,'   S     min: ',1pg11.4,', at  i j k: ',3i5) 
    192 9400  FORMAT (' kt=',i8,'   S     max: ',1pg11.4,', at  i j k: ',3i5) 
     220         ! 
     221         IF( ll_colruns .or. jpnij == 1 ) THEN   ! all processes synchronized -> use lwp to print in opened ocean.output files 
     222            IF(lwp)   CALL ctl_stop( ctmp1, ' ', ctmp2, ctmp3, ctmp4, ctmp5, ' ', ctmp6 ) 
     223         ELSE                                    ! only mpi subdomains with errors are here -> STOP now 
     224            CALL ctl_stop( 'STOP', ctmp1, ' ', ctmp2, ctmp3, ctmp4, ctmp5, ' ', ctmp6 ) 
     225         ENDIF 
     226         ! 
     227         IF( nstop == 0 )   nstop = 1  
     228         ngrdstop = Agrif_Fixed() 
     229         ! 
     230      ENDIF 
     231      ! 
    1932329500  FORMAT(' it :', i8, '    |ssh|_max: ', D23.16, ' |U|_max: ', D23.16,' S_min: ', D23.16,' S_max: ', D23.16) 
    194233      ! 
    195234   END SUBROUTINE stp_ctl 
     235 
     236 
     237   SUBROUTINE wrt_line( cdline, kt, cdprefix, pval, kloc, ksum, kmin, kmax ) 
     238      !!---------------------------------------------------------------------- 
     239      !!                     ***  ROUTINE wrt_line  *** 
     240      !! 
     241      !! ** Purpose :   write information line 
     242      !! 
     243      !!---------------------------------------------------------------------- 
     244      CHARACTER(len=*),      INTENT(  out) ::   cdline 
     245      CHARACTER(len=*),      INTENT(in   ) ::   cdprefix 
     246      REAL(wp),              INTENT(in   ) ::   pval 
     247      INTEGER, DIMENSION(3), INTENT(in   ) ::   kloc 
     248      INTEGER,               INTENT(in   ) ::   kt, ksum, kmin, kmax 
     249      ! 
     250      CHARACTER(len=80) ::   clsuff 
     251      CHARACTER(len=9 ) ::   clkt, clsum, clmin, clmax 
     252      CHARACTER(len=9 ) ::   cli, clj, clk 
     253      CHARACTER(len=1 ) ::   clfmt 
     254      CHARACTER(len=4 ) ::   cl4   ! needed to be able to compile with Agrif, I don't know why 
     255      INTEGER           ::   ifmtk 
     256      !!---------------------------------------------------------------------- 
     257      WRITE(clkt , '(i9)') kt 
     258       
     259      WRITE(clfmt, '(i1)') INT(LOG10(REAL(jpnij  ,wp))) + 1     ! how many digits to we need to write ? (we decide max = 9) 
     260      !!! WRITE(clsum, '(i'//clfmt//')') ksum                   ! this is creating a compilation error with AGRIF 
     261      cl4 = '(i'//clfmt//')'   ;   WRITE(clsum, cl4) ksum 
     262      WRITE(clfmt, '(i1)') INT(LOG10(REAL(jpnij-1,wp))) + 1     ! how many digits to we need to write ? (we decide max = 9) 
     263      cl4 = '(i'//clfmt//')'   ;   WRITE(clmin, cl4) kmin-1 
     264                                   WRITE(clmax, cl4) kmax-1 
     265      ! 
     266      WRITE(clfmt, '(i1)') INT(LOG10(REAL(jpiglo,wp))) + 1      ! how many digits to we need to write jpiglo? (we decide max = 9) 
     267      cl4 = '(i'//clfmt//')'   ;   WRITE(cli, cl4) kloc(1)      ! this is ok with AGRIF 
     268      WRITE(clfmt, '(i1)') INT(LOG10(REAL(jpjglo,wp))) + 1      ! how many digits to we need to write jpjglo? (we decide max = 9) 
     269      cl4 = '(i'//clfmt//')'   ;   WRITE(clj, cl4) kloc(2)      ! this is ok with AGRIF 
     270      ! 
     271      IF( ksum == 1 ) THEN   ;   WRITE(clsuff,9100) TRIM(clmin) 
     272      ELSE                   ;   WRITE(clsuff,9200) TRIM(clsum), TRIM(clmin), TRIM(clmax) 
     273      ENDIF 
     274      IF(kloc(3) == 0) THEN 
     275         ifmtk = INT(LOG10(REAL(jpk,wp))) + 1                   ! how many digits to we need to write jpk? (we decide max = 9) 
     276         clk = REPEAT(' ', ifmtk)                               ! create the equivalent in blank string 
     277         WRITE(cdline,9300) TRIM(ADJUSTL(clkt)), TRIM(ADJUSTL(cdprefix)), pval, TRIM(cli), TRIM(clj), clk(1:ifmtk), TRIM(clsuff) 
     278      ELSE 
     279         WRITE(clfmt, '(i1)') INT(LOG10(REAL(jpk,wp))) + 1      ! how many digits to we need to write jpk? (we decide max = 9) 
     280         !!! WRITE(clk, '(i'//clfmt//')') kloc(3)               ! this is creating a compilation error with AGRIF 
     281         cl4 = '(i'//clfmt//')'   ;   WRITE(clk, cl4) kloc(3)   ! this is ok with AGRIF 
     282         WRITE(cdline,9400) TRIM(ADJUSTL(clkt)), TRIM(ADJUSTL(cdprefix)), pval, TRIM(cli), TRIM(clj),    TRIM(clk), TRIM(clsuff) 
     283      ENDIF 
     284      ! 
     2859100  FORMAT('MPI rank ', a) 
     2869200  FORMAT('found in ', a, ' MPI tasks, spread out among ranks ', a, ' to ', a) 
     2879300  FORMAT('kt ', a, ' ', a, ' ', 1pg11.4, ' at i j   ', a, ' ', a, ' ', a, ' ', a) 
     2889400  FORMAT('kt ', a, ' ', a, ' ', 1pg11.4, ' at i j k ', a, ' ', a, ' ', a, ' ', a) 
     289      ! 
     290   END SUBROUTINE wrt_line 
     291 
    196292 
    197293   !!====================================================================== 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/trazdf.F90

    r12489 r12939  
    3535   PUBLIC   tra_zdf_imp   ! called by trczdf.F90 
    3636 
     37   !! * Substitutions 
     38#  include "do_loop_substitute.h90" 
    3739   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3840   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    7779      ! JMM avoid negative salinities near river outlet ! Ugly fix 
    7880      ! JMM : restore negative salinities to small salinities: 
    79 !!$   WHERE( pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) < 0._wp )   pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) = 0.1_wp 
     81!!$      WHERE( pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) < 0._wp )   pts(:,:,:,jp_sal,Kaa) = 0.1_wp 
    8082!!gm 
    8183 
     
    9597      ENDIF 
    9698      !                                          ! print mean trends (used for debugging) 
    97       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Kaa), clinfo1=' zdf  - Ta: ', mask1=tmask,               & 
    98          &                       tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Kaa), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' ) 
     99      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Kaa), clinfo1=' zdf  - Ta: ', mask1=tmask,               & 
     100         &                                  tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Kaa), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' ) 
    99101      ! 
    100102      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('tra_zdf') 
     
    154156            IF( l_ldfslp ) THEN            ! isoneutral diffusion: add the contribution  
    155157               IF( ln_traldf_msc  ) THEN     ! MSC iso-neutral operator  
    156                   DO jk = 2, jpkm1 
    157                      DO jj = 2, jpjm1 
    158                         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    159                            zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + akz(ji,jj,jk)   
    160                         END DO 
    161                      END DO 
    162                   END DO 
     158                  DO_3D_00_00( 2, jpkm1 ) 
     159                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + akz(ji,jj,jk)   
     160                  END_3D 
    163161               ELSE                          ! standard or triad iso-neutral operator 
    164                   DO jk = 2, jpkm1 
    165                      DO jj = 2, jpjm1 
    166                         DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    167                            zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + ah_wslp2(ji,jj,jk) 
    168                         END DO 
    169                      END DO 
    170                   END DO 
     162                  DO_3D_00_00( 2, jpkm1 ) 
     163                     zwt(ji,jj,jk) = zwt(ji,jj,jk) + ah_wslp2(ji,jj,jk) 
     164                  END_3D 
    171165               ENDIF 
    172166            ENDIF 
     
    174168            ! Diagonal, lower (i), upper (s)  (including the bottom boundary condition since avt is masked) 
    175169            IF( ln_zad_Aimp ) THEN         ! Adaptive implicit vertical advection 
    176                DO jk = 1, jpkm1 
    177                   DO jj = 2, jpjm1 
    178                      DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. (ensure same order of calculation as below if wi=0.) 
    179                         zzwi = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk  ,Kmm) 
    180                         zzws = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm) 
    181                         zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zzwi - zzws   & 
    182                            &                 + p2dt * ( MAX( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) - MIN( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) ) 
    183                         zwi(ji,jj,jk) = zzwi + p2dt *   MIN( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) 
    184                         zws(ji,jj,jk) = zzws - p2dt *   MAX( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) 
    185                     END DO 
    186                   END DO 
    187                END DO 
     170               DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     171                  zzwi = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk  ,Kmm) 
     172                  zzws = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm) 
     173                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zzwi - zzws   & 
     174                     &                 + p2dt * ( MAX( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) - MIN( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) ) 
     175                  zwi(ji,jj,jk) = zzwi + p2dt *   MIN( wi(ji,jj,jk  ) , 0._wp ) 
     176                  zws(ji,jj,jk) = zzws - p2dt *   MAX( wi(ji,jj,jk+1) , 0._wp ) 
     177               END_3D 
    188178            ELSE 
    189                DO jk = 1, jpkm1 
    190                   DO jj = 2, jpjm1 
    191                      DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    192                         zwi(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk,Kmm) 
    193                         zws(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm) 
    194                         zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zwi(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk) 
    195                     END DO 
    196                   END DO 
    197                END DO 
     179               DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     180                  zwi(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk  ) / e3w(ji,jj,jk,Kmm) 
     181                  zws(ji,jj,jk) = - p2dt * zwt(ji,jj,jk+1) / e3w(ji,jj,jk+1,Kmm) 
     182                  zwd(ji,jj,jk) = e3t(ji,jj,jk,Kaa) - zwi(ji,jj,jk) - zws(ji,jj,jk) 
     183               END_3D 
    198184            ENDIF 
    199185            ! 
     
    217203            !   used as a work space array: its value is modified. 
    218204            ! 
    219             DO jj = 2, jpjm1        !* 1st recurrence:   Tk = Dk - Ik Sk-1 / Tk-1   (increasing k) 
    220                DO ji = fs_2, fs_jpim1            ! done one for all passive tracers (so included in the IF instruction) 
    221                   zwt(ji,jj,1) = zwd(ji,jj,1) 
    222                END DO 
    223             END DO 
    224             DO jk = 2, jpkm1 
    225                DO jj = 2, jpjm1 
    226                   DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    227                      zwt(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwt(ji,jj,jk-1) 
    228                   END DO 
    229                END DO 
    230             END DO 
     205            DO_2D_00_00 
     206               zwt(ji,jj,1) = zwd(ji,jj,1) 
     207            END_2D 
     208            DO_3D_00_00( 2, jpkm1 ) 
     209               zwt(ji,jj,jk) = zwd(ji,jj,jk) - zwi(ji,jj,jk) * zws(ji,jj,jk-1) / zwt(ji,jj,jk-1) 
     210            END_3D 
    231211            ! 
    232212         ENDIF  
    233213         !          
    234          DO jj = 2, jpjm1           !* 2nd recurrence:    Zk = Yk - Ik / Tk-1  Zk-1 
    235             DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    236                pt(ji,jj,1,jn,Kaa) = e3t(ji,jj,1,Kbb) * pt(ji,jj,1,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,1,Kmm) * pt(ji,jj,1,jn,Krhs) 
    237             END DO 
    238          END DO 
    239          DO jk = 2, jpkm1 
    240             DO jj = 2, jpjm1 
    241                DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    242                   zrhs = e3t(ji,jj,jk,Kbb) * pt(ji,jj,jk,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,jk,Kmm) * pt(ji,jj,jk,jn,Krhs)   ! zrhs=right hand side 
    243                   pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = zrhs - zwi(ji,jj,jk) / zwt(ji,jj,jk-1) * pt(ji,jj,jk-1,jn,Kaa) 
    244                END DO 
    245             END DO 
    246          END DO 
     214         DO_2D_00_00 
     215            pt(ji,jj,1,jn,Kaa) = e3t(ji,jj,1,Kbb) * pt(ji,jj,1,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,1,Kmm) * pt(ji,jj,1,jn,Krhs) 
     216         END_2D 
     217         DO_3D_00_00( 2, jpkm1 ) 
     218            zrhs = e3t(ji,jj,jk,Kbb) * pt(ji,jj,jk,jn,Kbb) + p2dt * e3t(ji,jj,jk,Kmm) * pt(ji,jj,jk,jn,Krhs)   ! zrhs=right hand side 
     219            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = zrhs - zwi(ji,jj,jk) / zwt(ji,jj,jk-1) * pt(ji,jj,jk-1,jn,Kaa) 
     220         END_3D 
    247221         ! 
    248          DO jj = 2, jpjm1           !* 3d recurrence:    Xk = (Zk - Sk Xk+1 ) / Tk   (result is the after tracer) 
    249             DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    250                pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) = pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) / zwt(ji,jj,jpkm1) * tmask(ji,jj,jpkm1) 
    251             END DO 
    252          END DO 
    253          DO jk = jpk-2, 1, -1 
    254             DO jj = 2, jpjm1 
    255                DO ji = fs_2, fs_jpim1 
    256                   pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = ( pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) - zws(ji,jj,jk) * pt(ji,jj,jk+1,jn,Kaa) )   & 
    257                      &             / zwt(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 
    258                END DO 
    259             END DO 
    260          END DO 
     222         DO_2D_00_00 
     223            pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) = pt(ji,jj,jpkm1,jn,Kaa) / zwt(ji,jj,jpkm1) * tmask(ji,jj,jpkm1) 
     224         END_2D 
     225         DO_3DS_00_00( jpk-2, 1, -1 ) 
     226            pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) = ( pt(ji,jj,jk,jn,Kaa) - zws(ji,jj,jk) * pt(ji,jj,jk+1,jn,Kaa) )   & 
     227               &             / zwt(ji,jj,jk) * tmask(ji,jj,jk) 
     228         END_3D 
    261229         !                                            ! ================= ! 
    262230      END DO                                          !  end tracer loop  ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10074 r12939  
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    6163      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(out) ::   pe1e2u, pe1e2v               ! u- & v-surfaces (if reduction in strait)   [m2] 
    6264      ! 
    63       INTEGER  ::   ji, jj   ! dummy loop indices 
     65      INTEGER  ::   ji, jj     ! dummy loop indices 
    6466      REAL(wp) ::   zphi0, zlam0, zbeta, zf0 
    65       REAL(wp) ::   zti, zui, ztj, zvj   ! local scalars 
     67      REAL(wp) ::   zti, ztj   ! local scalars 
    6668      !!------------------------------------------------------------------------------- 
    6769      ! 
     
    7577      ! Position coordinates (in kilometers) 
    7678      !                          ========== 
    77       zlam0 = -REAL(NINT(jpiglo*rn_0xratio)-1, wp) * rn_dx 
    78       zphi0 = -REAL(NINT(jpjglo*rn_0yratio)-1, wp) * rn_dy  
     79      zlam0 = -REAL(NINT(Ni0glo*rn_0xratio)-1, wp) * rn_dx 
     80      zphi0 = -REAL(NINT(Nj0glo*rn_0yratio)-1, wp) * rn_dy  
    7981 
    8082#if defined key_agrif 
     
    8890#endif 
    8991          
    90       DO jj = 1, jpj 
    91          DO ji = 1, jpi 
    92             zti = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 )          ;  ztj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) 
    93             zui = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 ) + 0.5_wp ;  zvj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) + 0.5_wp 
    94  
    95             plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * zti 
    96             plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * zui 
    97             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
    98             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
    99     
    100             pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * ztj 
    101             pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * zvj 
    102             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
    103             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
    104          END DO 
    105       END DO 
     92      DO_2D_11_11          
     93         zti = REAL( mig0(ji) - 1, wp )   ! start at i=0 in the global grid without halos 
     94         ztj = REAL( mjg0(jj) - 1, wp )   ! start at j=0 in the global grid without halos 
     95          
     96         plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx *   zti 
     97         plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * ( zti + 0.5_wp )  
     98         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
     99         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
     100          
     101         pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy *   ztj 
     102         pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * ( ztj + 0.5_wp )  
     103         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
     104         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
     105      END_2D 
    106106      !      
    107107      ! Horizontal scale factors (in meters) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/usrdef_istate.F90

    r12807 r12939  
    2828   PUBLIC   usr_def_istate   ! called by istate.F90 
    2929 
     30   !! * Substitutions 
     31#  include "do_loop_substitute.h90" 
    3032   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3133   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    164166         pssh(:,1) = - ff_t(:,1) / grav * pu(:,1,1) * e2t(:,1) 
    165167         DO jl=1, jpnj 
    166             DO jj=Njs0, Nje0 
    167                DO ji=Nis0, Nie0 
    168                   pssh(ji,jj) = pssh(ji,jj-1) - ff_t(ji,jj) / grav * pu(ji,jj,1) * e2t(ji,jj) 
    169                END DO 
    170             END DO 
     168            DO_2D_00_00 
     169               pssh(ji,jj) = pssh(ji,jj-1) - ff_t(ji,jj) / grav * pu(ji,jj,1) * e2t(ji,jj) 
     170            END_2D 
    171171            CALL lbc_lnk( 'usrdef_istate', pssh, 'T',  1. ) 
    172172         END DO 
     
    183183      CASE(4)    ! geostrophic zonal pulse 
    184184    
    185          DO jj=1, jpj 
    186             DO ji=1, jpi 
    187                IF ( ABS(glamt(ji,jj)) <= zjetx ) THEN 
    188                   zdu = rn_uzonal 
    189                ELSEIF ( ABS(glamt(ji,jj)) <= zjetx + 100. ) THEN 
    190                   zdu = rn_uzonal * ( ( zjetx-ABS(glamt(ji,jj)) )/100. + 1. ) 
    191                ELSE 
    192                   zdu = 0. 
    193                END IF 
    194                IF ( ABS(gphit(ji,jj)) <= zjety ) THEN 
    195                   pssh(ji,jj) = - ff_t(ji,jj) * zdu * gphit(ji,jj) * 1.e3 / grav 
    196                   pu(ji,jj,:) = zdu 
    197                   pts(ji,jj,:,jp_sal) = zdu / rn_uzonal + 1. 
    198                ELSE 
    199                   pssh(ji,jj) = - ff_t(ji,jj) * zdu * SIGN(zjety,gphit(ji,jj)) * 1.e3 / grav  
    200                   pu(ji,jj,:) = 0. 
    201                   pts(ji,jj,:,jp_sal) = 1. 
    202                END IF 
    203             END DO 
    204          END DO 
     185         DO_2D_11_11 
     186            IF ( ABS(glamt(ji,jj)) <= zjetx ) THEN 
     187               zdu = rn_uzonal 
     188            ELSEIF ( ABS(glamt(ji,jj)) <= zjetx + 100. ) THEN 
     189               zdu = rn_uzonal * ( ( zjetx-ABS(glamt(ji,jj)) )/100. + 1. ) 
     190            ELSE 
     191               zdu = 0. 
     192            END IF 
     193            IF ( ABS(gphit(ji,jj)) <= zjety ) THEN 
     194               pssh(ji,jj) = - ff_t(ji,jj) * zdu * gphit(ji,jj) * 1.e3 / grav 
     195               pu(ji,jj,:) = zdu 
     196               pts(ji,jj,:,jp_sal) = zdu / rn_uzonal + 1. 
     197            ELSE 
     198               pssh(ji,jj) = - ff_t(ji,jj) * zdu * SIGN(zjety,gphit(ji,jj)) * 1.e3 / grav  
     199               pu(ji,jj,:) = 0. 
     200               pts(ji,jj,:,jp_sal) = 1. 
     201            END IF 
     202         END_2D 
    205203          
    206204         ! temperature: 
    207205         pts(:,:,:,jp_tem) = 10._wp * ptmask(:,:,:)         
    208206         pv(:,:,:) = 0. 
    209           
    210207          
    211208       CASE(5)    ! vortex 
     
    220217         zP0 = rho0 * zf0 * zumax * zlambda * SQRT(EXP(1._wp)/2._wp) 
    221218         ! 
    222          DO jj=1, jpj 
    223             DO ji=1, jpi 
    224                zx = glamt(ji,jj) * 1.e3 
    225                zy = gphit(ji,jj) * 1.e3 
    226                ! Surface pressure: P(x,y,z) = F(z) * Psurf(x,y) 
    227                zpsurf = zP0 * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) - rho0 * ff_t(ji,jj) * rn_uzonal * zy 
    228                ! Sea level: 
    229                pssh(ji,jj) = 0. 
    230                DO jl=1,5 
    231                   zdt = pssh(ji,jj) 
    232                   zdzF = (1._wp - EXP(zdt-zH)) / (zH - 1._wp + EXP(-zH))   ! F'(z) 
    233                   zrho1 = rho0 * (1._wp + zn2*zdt/grav) - zdzF * zpsurf / grav    ! -1/g Dz(P) = -1/g * F'(z) * Psurf(x,y) 
    234                   pssh(ji,jj) = zpsurf / (zrho1*grav) * ptmask(ji,jj,1)   ! ssh = Psurf / (Rho*g) 
    235                END DO 
    236                ! temperature: 
    237                DO jk=1,jpk 
    238                   zdt =  pdept(ji,jj,jk)  
    239                   zrho1 = rho0 * (1._wp + zn2*zdt/grav) 
    240                   IF (zdt < zH) THEN 
    241                      zdzF = (1._wp-EXP(zdt-zH)) / (zH-1._wp + EXP(-zH))   ! F'(z) 
    242                      zrho1 = zrho1 - zdzF * zpsurf / grav    ! -1/g Dz(P) = -1/g * F'(z) * Psurf(x,y) 
    243                   ENDIF 
    244                   !               pts(ji,jj,jk,jp_tem) = (20._wp + (rho0-zrho1) / 0.28_wp) * ptmask(ji,jj,jk) 
    245                   pts(ji,jj,jk,jp_tem) = (10._wp + (rho0-zrho1) / 0.28_wp) * ptmask(ji,jj,jk) 
    246                END DO 
    247             END DO 
    248          END DO 
     219         DO_2D_11_11 
     220            zx = glamt(ji,jj) * 1.e3 
     221            zy = gphit(ji,jj) * 1.e3 
     222            ! Surface pressure: P(x,y,z) = F(z) * Psurf(x,y) 
     223            zpsurf = zP0 * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) - rho0 * ff_t(ji,jj) * rn_uzonal * zy 
     224            ! Sea level: 
     225            pssh(ji,jj) = 0. 
     226            DO jl=1,5 
     227               zdt = pssh(ji,jj) 
     228               zdzF = (1._wp - EXP(zdt-zH)) / (zH - 1._wp + EXP(-zH))   ! F'(z) 
     229               zrho1 = rho0 * (1._wp + zn2*zdt/grav) - zdzF * zpsurf / grav    ! -1/g Dz(P) = -1/g * F'(z) * Psurf(x,y) 
     230               pssh(ji,jj) = zpsurf / (zrho1*grav) * ptmask(ji,jj,1)   ! ssh = Psurf / (Rho*g) 
     231            END DO 
     232            ! temperature: 
     233            DO jk=1,jpk 
     234               zdt =  pdept(ji,jj,jk)  
     235               zrho1 = rho0 * (1._wp + zn2*zdt/grav) 
     236               IF (zdt < zH) THEN 
     237                  zdzF = (1._wp-EXP(zdt-zH)) / (zH-1._wp + EXP(-zH))   ! F'(z) 
     238                  zrho1 = zrho1 - zdzF * zpsurf / grav    ! -1/g Dz(P) = -1/g * F'(z) * Psurf(x,y) 
     239               ENDIF 
     240               !               pts(ji,jj,jk,jp_tem) = (20._wp + (rho0-zrho1) / 0.28_wp) * ptmask(ji,jj,jk) 
     241               pts(ji,jj,jk,jp_tem) = (10._wp + (rho0-zrho1) / 0.28_wp) * ptmask(ji,jj,jk) 
     242            END DO 
     243         END_2D 
    249244         ! 
    250245         ! salinity:   
     
    253248         ! velocities: 
    254249         za = 2._wp * zP0 / zlambda**2 
    255          DO jj=1, jpj 
    256             DO ji=1, jpim1 
    257                zx = glamu(ji,jj) * 1.e3 
    258                zy = gphiu(ji,jj) * 1.e3 
    259                DO jk=1, jpk 
    260                   zdu = 0.5_wp * (pdept(ji,jj,jk) + pdept(ji+1,jj,jk)) 
    261                   IF (zdu < zH) THEN 
    262                      zf = (zH-1._wp-zdu+EXP(zdu-zH)) / (zH-1._wp+EXP(-zH)) 
    263                      zdyPs = - za * zy * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) - rho0 * ff_t(ji,jj) * rn_uzonal 
    264                      pu(ji,jj,jk) = - zf / ( rho0 * ff_t(ji,jj) ) * zdyPs * ptmask(ji,jj,jk) * ptmask(ji+1,jj,jk) 
    265                   ELSE 
    266                      pu(ji,jj,jk) = 0._wp 
    267                   ENDIF 
    268                END DO 
    269             END DO 
    270          END DO 
    271          ! 
    272          DO jj=1, jpjm1 
    273             DO ji=1, jpi 
    274                zx = glamv(ji,jj) * 1.e3 
    275                zy = gphiv(ji,jj) * 1.e3 
    276                DO jk=1, jpk 
    277                   zdv = 0.5_wp * (pdept(ji,jj,jk) + pdept(ji,jj+1,jk)) 
    278                   IF (zdv < zH) THEN 
    279                      zf = (zH-1._wp-zdv+EXP(zdv-zH)) / (zH-1._wp+EXP(-zH)) 
    280                      zdxPs = - za * zx * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) 
    281                      pv(ji,jj,jk) = zf / ( rho0 * ff_f(ji,jj) ) * zdxPs * ptmask(ji,jj,jk) * ptmask(ji,jj+1,jk) 
    282                   ELSE 
    283                      pv(ji,jj,jk) = 0._wp 
    284                   ENDIF 
    285                END DO 
    286             END DO 
    287          END DO 
     250         DO_2D_00_00 
     251            zx = glamu(ji,jj) * 1.e3 
     252            zy = gphiu(ji,jj) * 1.e3 
     253            DO jk=1, jpk 
     254               zdu = 0.5_wp * (pdept(ji,jj,jk) + pdept(ji+1,jj,jk)) 
     255               IF (zdu < zH) THEN 
     256                  zf = (zH-1._wp-zdu+EXP(zdu-zH)) / (zH-1._wp+EXP(-zH)) 
     257                  zdyPs = - za * zy * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) - rho0 * ff_t(ji,jj) * rn_uzonal 
     258                  pu(ji,jj,jk) = - zf / ( rho0 * ff_t(ji,jj) ) * zdyPs * ptmask(ji,jj,jk) * ptmask(ji+1,jj,jk) 
     259               ELSE 
     260                  pu(ji,jj,jk) = 0._wp 
     261               ENDIF 
     262            END DO 
     263         END_2D 
     264         ! 
     265         DO_2D_00_00 
     266            zx = glamv(ji,jj) * 1.e3 
     267            zy = gphiv(ji,jj) * 1.e3 
     268            DO jk=1, jpk 
     269               zdv = 0.5_wp * (pdept(ji,jj,jk) + pdept(ji,jj+1,jk)) 
     270               IF (zdv < zH) THEN 
     271                  zf = (zH-1._wp-zdv+EXP(zdv-zH)) / (zH-1._wp+EXP(-zH)) 
     272                  zdxPs = - za * zx * EXP(-(zx**2+zy**2)*zr_lambda2) 
     273                  pv(ji,jj,jk) = zf / ( rho0 * ff_f(ji,jj) ) * zdxPs * ptmask(ji,jj,jk) * ptmask(ji,jj+1,jk) 
     274               ELSE 
     275                  pv(ji,jj,jk) = 0._wp 
     276               ENDIF 
     277            END DO 
     278         END_2D 
    288279         !             
    289280      END SELECT 
    290  
     281       
    291282      IF (ln_sshnoise) THEN 
    292283         CALL RANDOM_NUMBER(zrandom) 
     
    294285      END IF 
    295286      CALL lbc_lnk( 'usrdef_istate', pssh, 'T',  1. ) 
    296       CALL lbc_lnk(  'usrdef_istate', pts, 'T',  1. ) 
    297       CALL lbc_lnk(   'usrdef_istate', pu, 'U', -1. ) 
    298       CALL lbc_lnk(   'usrdef_istate', pv, 'V', -1. ) 
     287      CALL lbc_lnk( 'usrdef_istate', pts , 'T',  1. ) 
     288      CALL lbc_lnk_multi( 'usrdef_istate', pu, 'U', -1., pv, 'V', -1. ) 
    299289 
    300290   END SUBROUTINE usr_def_istate 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
     16   USE dom_oce 
    1717   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
    1818   USE phycst         ! physical constants 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/usrdef_sbc.F90

    r12377 r12939  
    3838CONTAINS 
    3939 
    40    SUBROUTINE usrdef_sbc_oce( kt, Kmm, Kbb ) 
     40   SUBROUTINE usrdef_sbc_oce( kt, Kbb ) 
    4141      !!--------------------------------------------------------------------- 
    4242      !!                    ***  ROUTINE usr_def_sbc  *** 
     
    5353      !!---------------------------------------------------------------------- 
    5454      INTEGER, INTENT(in) ::   kt        ! ocean time step 
    55       INTEGER, INTENT(in) ::   Kbb, Kmm  ! ocean time index 
     55      INTEGER, INTENT(in) ::   Kbb       ! ocean time index 
    5656      INTEGER  ::   ji, jj               ! dummy loop indices 
    5757      REAL(wp) :: zrhoair = 1.22     ! approximate air density [Kg/m3] 
     
    8686          
    8787         WHERE( ABS(gphit) <= rn_windszy/2. ) 
    88             zwndrel(:,:) = rn_u10 - rn_uofac * uu(:,:,1,Kmm) 
     88            zwndrel(:,:) = rn_u10 - rn_uofac * uu(:,:,1,Kbb) 
    8989         ELSEWHERE 
    90             zwndrel(:,:) =        - rn_uofac * uu(:,:,1,Kmm) 
     90            zwndrel(:,:) =        - rn_uofac * uu(:,:,1,Kbb) 
    9191         END WHERE 
    9292         utau(:,:) = zrhocd * zwndrel(:,:) * zwndrel(:,:) 
    9393 
    94          zwndrel(:,:) = - rn_uofac * vv(:,:,1,Kmm) 
     94         zwndrel(:,:) = - rn_uofac * vv(:,:,1,Kbb) 
    9595         vtau(:,:) = zrhocd * zwndrel(:,:) * zwndrel(:,:) 
    9696 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/CANAL/MY_SRC/usrdef_zgr.F90

    r12377 r12939  
    204204      CALL lbc_lnk( 'usrdef_zgr', z2d, 'T', 1. )           ! set surrounding land to zero (here jperio=0 ==>> closed) 
    205205      ! 
    206       k_bot(:,:) = INT( z2d(:,:) )           ! =jpkm1 over the ocean point, =0 elsewhere 
     206      k_bot(:,:) = NINT( z2d(:,:) )          ! =jpkm1 over the ocean point, =0 elsewhere 
    207207      ! 
    208208      k_top(:,:) = MIN( 1 , k_bot(:,:) )     ! = 1    over the ocean point, =0 elsewhere 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_ADV1D/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10513 r12939  
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    6264      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(out) ::   pe1e2u, pe1e2v               ! u- & v-surfaces (if reduction in strait)   [m2] 
    6365      ! 
    64       INTEGER  ::   ji, jj   ! dummy loop indices 
     66      INTEGER  ::   ji, jj     ! dummy loop indices 
    6567      REAL(wp) ::   zphi0, zlam0, zbeta, zf0 
    66       REAL(wp) ::   zti, zui, ztj, zvj   ! local scalars 
     68      REAL(wp) ::   zti, ztj   ! local scalars 
    6769      !!------------------------------------------------------------------------------- 
    6870      ! 
     
    7375 
    7476      !                          ========== 
    75       zlam0 = -(jpiglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dx 
    76       zphi0 = -(jpjglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dy 
     77      zlam0 = -REAL(Ni0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dx 
     78      zphi0 = -REAL(Nj0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dy 
    7779 
    78       DO jj = 1, jpj 
    79          DO ji = 1, jpi 
    80             zti = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 )          ;  ztj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) 
    81             zui = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 ) + 0.5_wp ;  zvj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) + 0.5_wp 
    82  
    83             plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zti 
    84             plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zui 
    85             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
    86             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
    87     
    88             pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ztj 
    89             pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * zvj 
    90             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
    91             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
    92          END DO 
    93       END DO 
     80      DO_2D_11_11 
     81         zti = REAL( mig0(ji) - 1, wp )   ! start at i=0 in the global grid without halos 
     82         ztj = REAL( mjg0(jj) - 1, wp )   ! start at j=0 in the global grid without halos 
     83          
     84         plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 *   zti 
     85         plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * ( zti + 0.5_wp ) 
     86         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
     87         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
     88          
     89         pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 *   ztj 
     90         pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ( ztj + 0.5_wp ) 
     91         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
     92         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
     93      END_2D 
    9494          
    9595      ! constant scale factors 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_ADV1D/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
    1716   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
    1817   USE phycst         ! physical constants 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_ADV2D/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10515 r12939  
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    6264      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(out) ::   pe1e2u, pe1e2v               ! u- & v-surfaces (if reduction in strait)   [m2] 
    6365      ! 
    64       INTEGER  ::   ji, jj   ! dummy loop indices 
     66      INTEGER  ::   ji, jj     ! dummy loop indices 
    6567      REAL(wp) ::   zphi0, zlam0, zbeta, zf0 
    66       REAL(wp) ::   zti, zui, ztj, zvj   ! local scalars 
     68      REAL(wp) ::   zti, ztj   ! local scalars 
    6769      !!------------------------------------------------------------------------------- 
    6870      ! 
     
    7476 
    7577      !                          ========== 
    76       zlam0 = -(jpiglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dx 
    77       zphi0 = -(jpjglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dy 
     78      zlam0 = -REAL(Ni0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dx 
     79      zphi0 = -REAL(Nj0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dy  
    7880 
    7981#if defined key_agrif  
     
    8890#endif          
    8991 
    90       DO jj = 1, jpj 
    91          DO ji = 1, jpi 
    92             zti = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 )          ;  ztj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) 
    93             zui = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 ) + 0.5_wp ;  zvj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) + 0.5_wp 
    94  
    95             plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zti 
    96             plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zui 
    97             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
    98             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
    99     
    100             pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ztj 
    101             pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * zvj 
    102             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
    103             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
    104          END DO 
    105       END DO 
     92      DO_2D_11_11 
     93         zti = REAL( mig0(ji) - 1, wp )   ! start at i=0 in the global grid without halos 
     94         ztj = REAL( mjg0(jj) - 1, wp )   ! start at j=0 in the global grid without halos 
     95          
     96         plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 *   zti 
     97         plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * ( zti + 0.5_wp ) 
     98         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
     99         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
     100          
     101         pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 *   ztj 
     102         pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ( ztj + 0.5_wp ) 
     103         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
     104         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
     105      END_2D 
    106106          
    107107         ! Horizontal scale factors (in meters) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_ADV2D/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
     16   USE dom_oce 
    1717   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
    1818   USE phycst         ! physical constants 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_AGRIF/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10516 r12939  
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    6264      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(out) ::   pe1e2u, pe1e2v               ! u- & v-surfaces (if reduction in strait)   [m2] 
    6365      ! 
    64       INTEGER  ::   ji, jj   ! dummy loop indices 
     66      INTEGER  ::   ji, jj     ! dummy loop indices 
    6567      REAL(wp) ::   zphi0, zlam0, zbeta, zf0 
    66       REAL(wp) ::   zti, zui, ztj, zvj   ! local scalars 
     68      REAL(wp) ::   zti, ztj   ! local scalars 
    6769      !!------------------------------------------------------------------------------- 
    6870      ! 
     
    7476 
    7577      !                          ========== 
    76       zlam0 = -(jpiglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dx 
    77       zphi0 = -(jpjglo-1)/2 * 1.e-3 * rn_dy 
     78      zlam0 = -REAL(Ni0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dx 
     79      zphi0 = -REAL(Nj0glo-1)/2, wp) * 1.e-3 * rn_dy  
    7880 
    7981#if defined key_agrif  
     
    8890#endif          
    8991 
    90       DO jj = 1, jpj 
    91          DO ji = 1, jpi 
    92             zti = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 )          ;  ztj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) 
    93             zui = FLOAT( ji - 1 + nimpp - 1 ) + 0.5_wp ;  zvj = FLOAT( jj - 1 + njmpp - 1 ) + 0.5_wp 
    94  
    95             plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zti 
    96             plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * zui 
    97             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
    98             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
    99     
    100             pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ztj 
    101             pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * zvj 
    102             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
    103             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
    104          END DO 
    105       END DO 
     92      DO_2D_11_11 
     93         zti = REAL( mig0(ji) - 1, wp )   ! start at i=0 in the global grid without halos 
     94         ztj = REAL( mjg0(jj) - 1, wp )   ! start at j=0 in the global grid without halos 
     95          
     96         plamt(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 *   zti 
     97         plamu(ji,jj) = zlam0 + rn_dx * 1.e-3 * ( zti + 0.5_wp ) 
     98         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj)  
     99         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj)  
     100          
     101         pphit(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 *   ztj 
     102         pphiv(ji,jj) = zphi0 + rn_dy * 1.e-3 * ( ztj + 0.5_wp ) 
     103         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj)  
     104         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj)  
     105      END_2D 
    106106          
    107107         ! Horizontal scale factors (in meters) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_AGRIF/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
     16   USE dom_oce 
    1717   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
    1818   USE phycst         ! physical constants 
     
    8989         kpj = nbcellsy + 2 + 2*nbghostcells 
    9090      ENDIF 
    91       kpk = 1 
     91      kpk = 2 
    9292      ! 
    9393!!      zlx = (kpi-2)*rn_dx*1.e-3 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ICE_AGRIF/MY_SRC/usrdef_zgr.F90

    r12377 r12939  
    8989      !                       !==  z-coordinate  ==!   (step-like topography) 
    9090      !                                !* bottom ocean compute from the depth of grid-points 
    91       jpkm1 = jpk 
     91      jpkm1 = jpk-1 
    9292      k_bot(:,:) = 1    ! here use k_top as a land mask 
    9393      !                                !* horizontally uniform coordinate (reference z-co everywhere) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/EXPREF/file_def_nemo-oce.xml

    r11889 r12939  
    2121      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->   
    2222 
    23       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    24    <file id="file1" output_freq="1mo" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    25      <field field_ref="toce"         name="votemper"  /> 
    26      <field field_ref="soce"         name="vosaline"  /> 
    27      <field field_ref="ssh"          name="sossheig"  /> 
     23   <file id="file1" output_freq="5d" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
     24     <field field_ref="toce"         name="votemper"  operation="average" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
     25     <field field_ref="soce"         name="vosaline"  operation="average" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
     26     <field field_ref="ssh"          name="sossheig" /> 
    2827          <!-- variable for ice shelf --> 
    29           <field field_ref="fwfisf_cav"       name="sowflisf"  /> 
    30           <field field_ref="isfgammat"    name="sogammat"  /> 
    31           <field field_ref="isfgammas"    name="sogammas"  /> 
     28          <field field_ref="fwfisf_cav"  name="sowflisf"  /> 
     29          <field field_ref="isfgammat"   name="sogammat"  /> 
     30          <field field_ref="isfgammas"   name="sogammas"  /> 
    3231          <field field_ref="ttbl_cav"    name="ttbl"  /> 
    33           <field field_ref="stbl"    name="stbl"  /> 
    34           <field field_ref="utbl"    name="utbl"  /> 
    35           <field field_ref="vtbl"    name="vtbl"  /> 
     32          <field field_ref="stbl"        name="stbl"  /> 
     33          <field field_ref="utbl"        name="utbl"  /> 
     34          <field field_ref="vtbl"        name="vtbl"  /> 
    3635        </file> 
    37    <file id="file2" output_freq="1mo" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    38           <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx" /> 
     36   <file id="file2" output_freq="5d" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
     37          <field field_ref="uoce"         name="vozocrtx" operation="average" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> /> 
    3938        </file> 
    40    <file id="file3" output_freq="1mo" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    41           <field field_ref="voce"         name="vomecrty" />  
     39   <file id="file3" output_freq="5d" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
     40          <field field_ref="voce"         name="vomecrty" operation="average" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> />  
    4241        </file> 
    4342      </file_group> 
     43 
     44      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    4445      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    4546      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/EXPREF/namelist_cfg

    r12489 r12939  
    114114 
    115115   ln_usr      = .true.   !  user defined formulation                  (T => check usrdef_sbc) 
    116    nn_fwb      = 1 
     116   nn_fwb      = 4 
    117117/ 
    118118!----------------------------------------------------------------------- 
     
    308308&nameos        !   ocean Equation Of Seawater                           (default: NO selection) 
    309309!----------------------------------------------------------------------- 
    310    ln_teos10   = .false.         !  = Use TEOS-10 
    311    ln_eos80    = .false.         !  = Use EOS80 
    312    ln_leos     = .true.          !  = Use S-EOS (simplified Eq.) 
     310   ln_leos     = .true.          !  = Use L-EOS (linear Eq.) 
    313311                                 ! 
    314312   !                     ! S-EOS coefficients (ln_seos=T): 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/dtatsd.F90

    r12077 r12939  
    3636   TYPE(FLD), ALLOCATABLE, DIMENSION(:) ::   sf_tsddmp ! structure of input SST (file informations, fields read) 
    3737 
     38   !! * Substitutions 
     39#  include "do_loop_substitute.h90" 
    3840   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3941   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    6769      ierr0 = 0  ;  ierr1 = 0  ;  ierr2 = 0  ;  ierr3 = 0 
    6870      ! 
    69       REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namtsd in reference namelist :  
    7071      READ  ( numnam_ref, namtsd, IOSTAT = ios, ERR = 901) 
    7172901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtsd in reference namelist' ) 
    72       REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namtsd in configuration namelist : Parameters of the run 
    7373      READ  ( numnam_cfg, namtsd, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
    7474902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtsd in configuration namelist' ) 
     
    191191         ENDIF 
    192192         ! 
    193          DO jj = 1, jpj                         ! vertical interpolation of T & S 
    194             DO ji = 1, jpi 
    195                DO jk = 1, jpk                        ! determines the intepolated T-S profiles at each (i,j) points 
    196                   zl = gdept_0(ji,jj,jk) 
    197                   IF(     zl < gdept_1d(1  ) ) THEN          ! above the first level of data 
    198                      ztp(jk) =  ptsd(ji,jj,1    ,jp_tem) 
    199                      zsp(jk) =  ptsd(ji,jj,1    ,jp_sal) 
    200                   ELSEIF( zl > gdept_1d(jpk) ) THEN          ! below the last level of data 
    201                      ztp(jk) =  ptsd(ji,jj,jpkm1,jp_tem) 
    202                      zsp(jk) =  ptsd(ji,jj,jpkm1,jp_sal) 
    203                   ELSE                                      ! inbetween : vertical interpolation between jkk & jkk+1 
    204                      DO jkk = 1, jpkm1                                  ! when  gdept(jkk) < zl < gdept(jkk+1) 
    205                         IF( (zl-gdept_1d(jkk)) * (zl-gdept_1d(jkk+1)) <= 0._wp ) THEN 
    206                            zi = ( zl - gdept_1d(jkk) ) / (gdept_1d(jkk+1)-gdept_1d(jkk)) 
    207                            ztp(jk) = ptsd(ji,jj,jkk,jp_tem) + ( ptsd(ji,jj,jkk+1,jp_tem) - ptsd(ji,jj,jkk,jp_tem) ) * zi  
    208                            zsp(jk) = ptsd(ji,jj,jkk,jp_sal) + ( ptsd(ji,jj,jkk+1,jp_sal) - ptsd(ji,jj,jkk,jp_sal) ) * zi 
    209                         ENDIF 
    210                      END DO 
    211                   ENDIF 
    212                END DO 
    213                DO jk = 1, jpkm1 
    214                   ptsd(ji,jj,jk,jp_tem) = ztp(jk) * tmask(ji,jj,jk)     ! mask required for mixed zps-s-coord 
    215                   ptsd(ji,jj,jk,jp_sal) = zsp(jk) * tmask(ji,jj,jk) 
    216                END DO 
    217                ptsd(ji,jj,jpk,jp_tem) = 0._wp 
    218                ptsd(ji,jj,jpk,jp_sal) = 0._wp 
     193         DO_2D_11_11 
     194            DO jk = 1, jpk                        ! determines the intepolated T-S profiles at each (i,j) points 
     195               zl = gdept_0(ji,jj,jk) 
     196               IF(     zl < gdept_1d(1  ) ) THEN          ! above the first level of data 
     197                  ztp(jk) =  ptsd(ji,jj,1    ,jp_tem) 
     198                  zsp(jk) =  ptsd(ji,jj,1    ,jp_sal) 
     199               ELSEIF( zl > gdept_1d(jpk) ) THEN          ! below the last level of data 
     200                  ztp(jk) =  ptsd(ji,jj,jpkm1,jp_tem) 
     201                  zsp(jk) =  ptsd(ji,jj,jpkm1,jp_sal) 
     202               ELSE                                      ! inbetween : vertical interpolation between jkk & jkk+1 
     203                  DO jkk = 1, jpkm1                                  ! when  gdept(jkk) < zl < gdept(jkk+1) 
     204                     IF( (zl-gdept_1d(jkk)) * (zl-gdept_1d(jkk+1)) <= 0._wp ) THEN 
     205                        zi = ( zl - gdept_1d(jkk) ) / (gdept_1d(jkk+1)-gdept_1d(jkk)) 
     206                        ztp(jk) = ptsd(ji,jj,jkk,jp_tem) + ( ptsd(ji,jj,jkk+1,jp_tem) - ptsd(ji,jj,jkk,jp_tem) ) * zi  
     207                        zsp(jk) = ptsd(ji,jj,jkk,jp_sal) + ( ptsd(ji,jj,jkk+1,jp_sal) - ptsd(ji,jj,jkk,jp_sal) ) * zi 
     208                     ENDIF 
     209                  END DO 
     210               ENDIF 
    219211            END DO 
    220          END DO 
     212            DO jk = 1, jpkm1 
     213               ptsd(ji,jj,jk,jp_tem) = ztp(jk) * tmask(ji,jj,jk)     ! mask required for mixed zps-s-coord 
     214               ptsd(ji,jj,jk,jp_sal) = zsp(jk) * tmask(ji,jj,jk) 
     215            END DO 
     216            ptsd(ji,jj,jpk,jp_tem) = 0._wp 
     217            ptsd(ji,jj,jpk,jp_sal) = 0._wp 
     218         END_2D 
    221219         !  
    222220      ELSE                                !==   z- or zps- coordinate   ==! 
     
    226224         ! 
    227225         IF( ln_zps ) THEN                      ! zps-coordinate (partial steps) interpolation at the last ocean level 
    228             DO jj = 1, jpj 
    229                DO ji = 1, jpi 
    230                   ik = mbkt(ji,jj)  
    231                   IF( ik > 1 ) THEN 
    232                      zl = ( gdept_1d(ik) - gdept_0(ji,jj,ik) ) / ( gdept_1d(ik) - gdept_1d(ik-1) ) 
    233                      ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) + zl * ptsd(ji,jj,ik-1,jp_tem) 
    234                      ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) + zl * ptsd(ji,jj,ik-1,jp_sal) 
    235                   ENDIF 
    236                   ik = mikt(ji,jj) 
    237                   IF( ik > 1 ) THEN 
    238                      zl = ( gdept_0(ji,jj,ik) - gdept_1d(ik) ) / ( gdept_1d(ik+1) - gdept_1d(ik) )  
    239                      ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) + zl * ptsd(ji,jj,ik+1,jp_tem) 
    240                      ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) + zl * ptsd(ji,jj,ik+1,jp_sal) 
    241                   END IF 
    242                END DO 
    243             END DO 
     226            DO_2D_11_11 
     227               ik = mbkt(ji,jj)  
     228               IF( ik > 1 ) THEN 
     229                  zl = ( gdept_1d(ik) - gdept_0(ji,jj,ik) ) / ( gdept_1d(ik) - gdept_1d(ik-1) ) 
     230                  ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) + zl * ptsd(ji,jj,ik-1,jp_tem) 
     231                  ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) + zl * ptsd(ji,jj,ik-1,jp_sal) 
     232               ENDIF 
     233               ik = mikt(ji,jj) 
     234               IF( ik > 1 ) THEN 
     235                  zl = ( gdept_0(ji,jj,ik) - gdept_1d(ik) ) / ( gdept_1d(ik+1) - gdept_1d(ik) )  
     236                  ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_tem) + zl * ptsd(ji,jj,ik+1,jp_tem) 
     237                  ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) = (1.-zl) * ptsd(ji,jj,ik,jp_sal) + zl * ptsd(ji,jj,ik+1,jp_sal) 
     238               END IF 
     239            END_2D 
    244240         ENDIF 
    245241         ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/eosbn2.F90

    r12489 r12939  
    180180   REAL(wp) ::   BPE002 
    181181 
     182   !! * Substitutions 
     183#  include "do_loop_substitute.h90" 
    182184   !!---------------------------------------------------------------------- 
    183185   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    241243      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    242244         ! 
    243          DO jk = 1, jpkm1 
    244             DO jj = 1, jpj 
    245                DO ji = 1, jpi 
    246                   ! 
    247                   zh  = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
    248                   zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    249                   zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    250                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
     245         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     246            ! 
     247            zh  = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
     248            zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     249            zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     250            ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
     251            ! 
     252            zn3 = EOS013*zt   & 
     253               &   + EOS103*zs+EOS003 
     254               ! 
     255            zn2 = (EOS022*zt   & 
     256               &   + EOS112*zs+EOS012)*zt   & 
     257               &   + (EOS202*zs+EOS102)*zs+EOS002 
     258               ! 
     259            zn1 = (((EOS041*zt   & 
     260               &   + EOS131*zs+EOS031)*zt   & 
     261               &   + (EOS221*zs+EOS121)*zs+EOS021)*zt   & 
     262               &   + ((EOS311*zs+EOS211)*zs+EOS111)*zs+EOS011)*zt   & 
     263               &   + (((EOS401*zs+EOS301)*zs+EOS201)*zs+EOS101)*zs+EOS001 
     264               ! 
     265            zn0 = (((((EOS060*zt   & 
     266               &   + EOS150*zs+EOS050)*zt   & 
     267               &   + (EOS240*zs+EOS140)*zs+EOS040)*zt   & 
     268               &   + ((EOS330*zs+EOS230)*zs+EOS130)*zs+EOS030)*zt   & 
     269               &   + (((EOS420*zs+EOS320)*zs+EOS220)*zs+EOS120)*zs+EOS020)*zt   & 
     270               &   + ((((EOS510*zs+EOS410)*zs+EOS310)*zs+EOS210)*zs+EOS110)*zs+EOS010)*zt   & 
     271               &   + (((((EOS600*zs+EOS500)*zs+EOS400)*zs+EOS300)*zs+EOS200)*zs+EOS100)*zs+EOS000 
     272               ! 
     273            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     274            ! 
     275            prd(ji,jj,jk) = (  zn * r1_rho0 - 1._wp  ) * ztm  ! density anomaly (masked) 
     276            ! 
     277         END_3D 
     278         ! 
     279      CASE( np_seos )                !==  simplified EOS  ==! 
     280         ! 
     281         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     282            zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp 
     283            zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp 
     284            zh  = pdep (ji,jj,jk) 
     285            ztm = tmask(ji,jj,jk) 
     286            ! 
     287            zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) * zt   & 
     288               &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) * zs   & 
     289               &  - rn_nu * zt * zs 
     290               !                                  
     291            prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm                ! density anomaly (masked) 
     292         END_3D 
     293         ! 
     294      CASE( np_leos )                !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
     295         ! 
     296         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     297            zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
     298            zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp 
     299            zh  = pdep (ji,jj,jk) 
     300            ztm = tmask(ji,jj,jk) 
     301            ! 
     302            zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
     303            !                                  
     304            prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm                ! density anomaly (masked) 
     305         END_3D 
     306         ! 
     307      END SELECT 
     308      ! 
     309      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=prd, clinfo1=' eos-insitu  : ', kdim=jpk ) 
     310      ! 
     311      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos-insitu') 
     312      ! 
     313   END SUBROUTINE eos_insitu 
     314 
     315 
     316   SUBROUTINE eos_insitu_pot( pts, prd, prhop, pdep ) 
     317      !!---------------------------------------------------------------------- 
     318      !!                  ***  ROUTINE eos_insitu_pot  *** 
     319      !! 
     320      !! ** Purpose :   Compute the in situ density (ratio rho/rho0) and the 
     321      !!      potential volumic mass (Kg/m3) from potential temperature and 
     322      !!      salinity fields using an equation of state selected in the 
     323      !!     namelist. 
     324      !! 
     325      !! ** Action  : - prd  , the in situ density (no units) 
     326      !!              - prhop, the potential volumic mass (Kg/m3) 
     327      !! 
     328      !!---------------------------------------------------------------------- 
     329      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts), INTENT(in   ) ::   pts    ! 1 : potential temperature  [Celsius] 
     330      !                                                                ! 2 : salinity               [psu] 
     331      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(  out) ::   prd    ! in situ density            [-] 
     332      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(  out) ::   prhop  ! potential density (surface referenced) 
     333      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(in   ) ::   pdep   ! depth                      [m] 
     334      ! 
     335      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jsmp             ! dummy loop indices 
     336      INTEGER  ::   jdof 
     337      REAL(wp) ::   zt , zh , zstemp, zs , ztm   ! local scalars 
     338      REAL(wp) ::   zn , zn0, zn1, zn2, zn3      !   -      - 
     339      REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE :: zn0_sto, zn_sto, zsign    ! local vectors 
     340      !!---------------------------------------------------------------------- 
     341      ! 
     342      IF( ln_timing )   CALL timing_start('eos-pot') 
     343      ! 
     344      SELECT CASE ( neos ) 
     345      ! 
     346      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
     347         ! 
     348         ! Stochastic equation of state 
     349         IF ( ln_sto_eos ) THEN 
     350            ALLOCATE(zn0_sto(1:2*nn_sto_eos)) 
     351            ALLOCATE(zn_sto(1:2*nn_sto_eos)) 
     352            ALLOCATE(zsign(1:2*nn_sto_eos)) 
     353            DO jsmp = 1, 2*nn_sto_eos, 2 
     354              zsign(jsmp)   = 1._wp 
     355              zsign(jsmp+1) = -1._wp 
     356            END DO 
     357            ! 
     358            DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     359               ! 
     360               ! compute density (2*nn_sto_eos) times: 
     361               ! (1) for t+dt, s+ds (with the random TS fluctutation computed in sto_pts) 
     362               ! (2) for t-dt, s-ds (with the opposite fluctuation) 
     363               DO jsmp = 1, nn_sto_eos*2 
     364                  jdof   = (jsmp + 1) / 2 
     365                  zh     = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
     366                  zt     = (pts (ji,jj,jk,jp_tem) + pts_ran(ji,jj,jk,jp_tem,jdof) * zsign(jsmp)) * r1_T0    ! temperature 
     367                  zstemp = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) + pts_ran(ji,jj,jk,jp_sal,jdof) * zsign(jsmp) 
     368                  zs     = SQRT( ABS( zstemp + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     369                  ztm    = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    251370                  ! 
    252371                  zn3 = EOS013*zt   & 
     
    263382                     &   + (((EOS401*zs+EOS301)*zs+EOS201)*zs+EOS101)*zs+EOS001 
    264383                     ! 
    265                   zn0 = (((((EOS060*zt   & 
     384                  zn0_sto(jsmp) = (((((EOS060*zt   & 
    266385                     &   + EOS150*zs+EOS050)*zt   & 
    267386                     &   + (EOS240*zs+EOS140)*zs+EOS040)*zt   & 
     
    271390                     &   + (((((EOS600*zs+EOS500)*zs+EOS400)*zs+EOS300)*zs+EOS200)*zs+EOS100)*zs+EOS000 
    272391                     ! 
    273                   zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     392                  zn_sto(jsmp)  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0_sto(jsmp) 
     393               END DO 
     394               ! 
     395               ! compute stochastic density as the mean of the (2*nn_sto_eos) densities 
     396               prhop(ji,jj,jk) = 0._wp ; prd(ji,jj,jk) = 0._wp 
     397               DO jsmp = 1, nn_sto_eos*2 
     398                  prhop(ji,jj,jk) = prhop(ji,jj,jk) + zn0_sto(jsmp)                      ! potential density referenced at the surface 
    274399                  ! 
    275                   prd(ji,jj,jk) = (  zn * r1_rho0 - 1._wp  ) * ztm  ! density anomaly (masked) 
    276                   ! 
     400                  prd(ji,jj,jk) = prd(ji,jj,jk) + (  zn_sto(jsmp) * r1_rho0 - 1._wp  )   ! density anomaly (masked) 
    277401               END DO 
    278             END DO 
    279          END DO 
    280          ! 
    281       CASE( np_seos )                !==  simplified EOS  ==! 
    282          ! 
    283          DO jk = 1, jpkm1 
    284             DO jj = 1, jpj 
    285                DO ji = 1, jpi 
    286                   zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp 
    287                   zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp 
    288                   zh  = pdep (ji,jj,jk) 
    289                   ztm = tmask(ji,jj,jk) 
    290                   ! 
    291                   zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) * zt   & 
    292                      &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) * zs   & 
    293                      &  - rn_nu * zt * zs 
    294                      !                                  
    295                   prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm                ! density anomaly (masked) 
    296                END DO 
    297             END DO 
    298          END DO 
    299          ! 
    300       CASE( np_leos )                !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
    301          ! 
    302          DO jk = 1, jpkm1 
    303             DO jj = 1, jpj 
    304                DO ji = 1, jpi 
    305                   zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
    306                   zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp 
    307                   zh  = pdep (ji,jj,jk) 
    308                   ztm = tmask(ji,jj,jk) 
    309                   ! 
    310                   zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
    311                   !                                  
    312                   prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm                ! density anomaly (masked) 
    313                END DO 
    314             END DO 
    315          END DO 
    316          ! 
    317       END SELECT 
    318       ! 
    319       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=prd, clinfo1=' eos-insitu  : ', kdim=jpk ) 
    320       ! 
    321       IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos-insitu') 
    322       ! 
    323    END SUBROUTINE eos_insitu 
    324  
    325  
    326    SUBROUTINE eos_insitu_pot( pts, prd, prhop, pdep ) 
    327       !!---------------------------------------------------------------------- 
    328       !!                  ***  ROUTINE eos_insitu_pot  *** 
    329       !! 
    330       !! ** Purpose :   Compute the in situ density (ratio rho/rho0) and the 
    331       !!      potential volumic mass (Kg/m3) from potential temperature and 
    332       !!      salinity fields using an equation of state selected in the 
    333       !!     namelist. 
    334       !! 
    335       !! ** Action  : - prd  , the in situ density (no units) 
    336       !!              - prhop, the potential volumic mass (Kg/m3) 
    337       !! 
    338       !!---------------------------------------------------------------------- 
    339       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts), INTENT(in   ) ::   pts    ! 1 : potential temperature  [Celsius] 
    340       !                                                                ! 2 : salinity               [psu] 
    341       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(  out) ::   prd    ! in situ density            [-] 
    342       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(  out) ::   prhop  ! potential density (surface referenced) 
    343       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk     ), INTENT(in   ) ::   pdep   ! depth                      [m] 
    344       ! 
    345       INTEGER  ::   ji, jj, jk, jsmp             ! dummy loop indices 
    346       INTEGER  ::   jdof 
    347       REAL(wp) ::   zt , zh , zstemp, zs , ztm   ! local scalars 
    348       REAL(wp) ::   zn , zn0, zn1, zn2, zn3      !   -      - 
    349       REAL(wp), DIMENSION(:), ALLOCATABLE :: zn0_sto, zn_sto, zsign    ! local vectors 
    350       !!---------------------------------------------------------------------- 
    351       ! 
    352       IF( ln_timing )   CALL timing_start('eos-pot') 
    353       ! 
    354       SELECT CASE ( neos ) 
    355       ! 
    356       CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    357          ! 
    358          ! Stochastic equation of state 
    359          IF ( ln_sto_eos ) THEN 
    360             ALLOCATE(zn0_sto(1:2*nn_sto_eos)) 
    361             ALLOCATE(zn_sto(1:2*nn_sto_eos)) 
    362             ALLOCATE(zsign(1:2*nn_sto_eos)) 
    363             DO jsmp = 1, 2*nn_sto_eos, 2 
    364               zsign(jsmp)   = 1._wp 
    365               zsign(jsmp+1) = -1._wp 
    366             END DO 
    367             ! 
    368             DO jk = 1, jpkm1 
    369                DO jj = 1, jpj 
    370                   DO ji = 1, jpi 
    371                      ! 
    372                      ! compute density (2*nn_sto_eos) times: 
    373                      ! (1) for t+dt, s+ds (with the random TS fluctutation computed in sto_pts) 
    374                      ! (2) for t-dt, s-ds (with the opposite fluctuation) 
    375                      DO jsmp = 1, nn_sto_eos*2 
    376                         jdof   = (jsmp + 1) / 2 
    377                         zh     = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
    378                         zt     = (pts (ji,jj,jk,jp_tem) + pts_ran(ji,jj,jk,jp_tem,jdof) * zsign(jsmp)) * r1_T0    ! temperature 
    379                         zstemp = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) + pts_ran(ji,jj,jk,jp_sal,jdof) * zsign(jsmp) 
    380                         zs     = SQRT( ABS( zstemp + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    381                         ztm    = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    382                         ! 
    383                         zn3 = EOS013*zt   & 
    384                            &   + EOS103*zs+EOS003 
    385                            ! 
    386                         zn2 = (EOS022*zt   & 
    387                            &   + EOS112*zs+EOS012)*zt   & 
    388                            &   + (EOS202*zs+EOS102)*zs+EOS002 
    389                            ! 
    390                         zn1 = (((EOS041*zt   & 
    391                            &   + EOS131*zs+EOS031)*zt   & 
    392                            &   + (EOS221*zs+EOS121)*zs+EOS021)*zt   & 
    393                            &   + ((EOS311*zs+EOS211)*zs+EOS111)*zs+EOS011)*zt   & 
    394                            &   + (((EOS401*zs+EOS301)*zs+EOS201)*zs+EOS101)*zs+EOS001 
    395                            ! 
    396                         zn0_sto(jsmp) = (((((EOS060*zt   & 
    397                            &   + EOS150*zs+EOS050)*zt   & 
    398                            &   + (EOS240*zs+EOS140)*zs+EOS040)*zt   & 
    399                            &   + ((EOS330*zs+EOS230)*zs+EOS130)*zs+EOS030)*zt   & 
    400                            &   + (((EOS420*zs+EOS320)*zs+EOS220)*zs+EOS120)*zs+EOS020)*zt   & 
    401                            &   + ((((EOS510*zs+EOS410)*zs+EOS310)*zs+EOS210)*zs+EOS110)*zs+EOS010)*zt   & 
    402                            &   + (((((EOS600*zs+EOS500)*zs+EOS400)*zs+EOS300)*zs+EOS200)*zs+EOS100)*zs+EOS000 
    403                            ! 
    404                         zn_sto(jsmp)  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0_sto(jsmp) 
    405                      END DO 
    406                      ! 
    407                      ! compute stochastic density as the mean of the (2*nn_sto_eos) densities 
    408                      prhop(ji,jj,jk) = 0._wp ; prd(ji,jj,jk) = 0._wp 
    409                      DO jsmp = 1, nn_sto_eos*2 
    410                         prhop(ji,jj,jk) = prhop(ji,jj,jk) + zn0_sto(jsmp)                      ! potential density referenced at the surface 
    411                         ! 
    412                         prd(ji,jj,jk) = prd(ji,jj,jk) + (  zn_sto(jsmp) * r1_rho0 - 1._wp  )   ! density anomaly (masked) 
    413                      END DO 
    414                      prhop(ji,jj,jk) = 0.5_wp * prhop(ji,jj,jk) * ztm / nn_sto_eos 
    415                      prd  (ji,jj,jk) = 0.5_wp * prd  (ji,jj,jk) * ztm / nn_sto_eos 
    416                   END DO 
    417                END DO 
    418             END DO 
     402               prhop(ji,jj,jk) = 0.5_wp * prhop(ji,jj,jk) * ztm / nn_sto_eos 
     403               prd  (ji,jj,jk) = 0.5_wp * prd  (ji,jj,jk) * ztm / nn_sto_eos 
     404            END_3D 
    419405            DEALLOCATE(zn0_sto,zn_sto,zsign) 
    420406         ! Non-stochastic equation of state 
    421407         ELSE 
    422             DO jk = 1, jpkm1 
    423                DO jj = 1, jpj 
    424                   DO ji = 1, jpi 
    425                      ! 
    426                      zh  = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
    427                      zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    428                      zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    429                      ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    430                      ! 
    431                      zn3 = EOS013*zt   & 
    432                         &   + EOS103*zs+EOS003 
    433                         ! 
    434                      zn2 = (EOS022*zt   & 
    435                         &   + EOS112*zs+EOS012)*zt   & 
    436                         &   + (EOS202*zs+EOS102)*zs+EOS002 
    437                         ! 
    438                      zn1 = (((EOS041*zt   & 
    439                         &   + EOS131*zs+EOS031)*zt   & 
    440                         &   + (EOS221*zs+EOS121)*zs+EOS021)*zt   & 
    441                         &   + ((EOS311*zs+EOS211)*zs+EOS111)*zs+EOS011)*zt   & 
    442                         &   + (((EOS401*zs+EOS301)*zs+EOS201)*zs+EOS101)*zs+EOS001 
    443                         ! 
    444                      zn0 = (((((EOS060*zt   & 
    445                         &   + EOS150*zs+EOS050)*zt   & 
    446                         &   + (EOS240*zs+EOS140)*zs+EOS040)*zt   & 
    447                         &   + ((EOS330*zs+EOS230)*zs+EOS130)*zs+EOS030)*zt   & 
    448                         &   + (((EOS420*zs+EOS320)*zs+EOS220)*zs+EOS120)*zs+EOS020)*zt   & 
    449                         &   + ((((EOS510*zs+EOS410)*zs+EOS310)*zs+EOS210)*zs+EOS110)*zs+EOS010)*zt   & 
    450                         &   + (((((EOS600*zs+EOS500)*zs+EOS400)*zs+EOS300)*zs+EOS200)*zs+EOS100)*zs+EOS000 
    451                         ! 
    452                      zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    453                      ! 
    454                      prhop(ji,jj,jk) = zn0 * ztm                           ! potential density referenced at the surface 
    455                      ! 
    456                      prd(ji,jj,jk) = (  zn * r1_rho0 - 1._wp  ) * ztm      ! density anomaly (masked) 
    457                   END DO 
    458                END DO 
    459             END DO 
    460          ENDIF 
    461           
    462       CASE( np_seos )                !==  simplified EOS  ==! 
    463          ! 
    464          DO jk = 1, jpkm1 
    465             DO jj = 1, jpj 
    466                DO ji = 1, jpi 
    467                   zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp 
    468                   zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp 
    469                   zh  = pdep (ji,jj,jk) 
    470                   ztm = tmask(ji,jj,jk) 
    471                   !                                                     ! potential density referenced at the surface 
    472                   zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt ) * zt   & 
    473                      &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs ) * zs   & 
    474                      &  - rn_nu * zt * zs 
    475                   prhop(ji,jj,jk) = ( rho0 + zn ) * ztm 
    476                   !                                                     ! density anomaly (masked) 
    477                   zn = zn - ( rn_a0 * rn_mu1 * zt + rn_b0 * rn_mu2 * zs ) * zh 
    478                   prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm 
    479                   ! 
    480                END DO 
    481             END DO 
    482          END DO 
    483          ! 
    484       CASE( np_leos )                !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
    485          ! 
    486          DO jk = 1, jpkm1 
    487             DO jj = 1, jpj 
    488                DO ji = 1, jpi 
    489                   zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
    490                   zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp 
    491                   zh  = pdep (ji,jj,jk) 
    492                   ztm = tmask(ji,jj,jk) 
    493                   !                                                     ! potential density referenced at the surface 
    494                   zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
    495                   prhop(ji,jj,jk) = ( rho0 + zn ) * ztm 
    496                   !                                                     ! density anomaly (masked) 
    497                   prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm 
    498                   ! 
    499                END DO 
    500             END DO 
    501          END DO 
    502          ! 
    503       END SELECT 
    504       ! 
    505       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=prd, clinfo1=' eos-pot: ', tab3d_2=prhop, clinfo2=' pot : ', kdim=jpk ) 
    506       ! 
    507       IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos-pot') 
    508       ! 
    509    END SUBROUTINE eos_insitu_pot 
    510  
    511  
    512    SUBROUTINE eos_insitu_2d( pts, pdep, prd ) 
    513       !!---------------------------------------------------------------------- 
    514       !!                  ***  ROUTINE eos_insitu_2d  *** 
    515       !! 
    516       !! ** Purpose :   Compute the in situ density (ratio rho/rho0) from 
    517       !!      potential temperature and salinity using an equation of state 
    518       !!      selected in the nameos namelist. * 2D field case 
    519       !! 
    520       !! ** Action  : - prd , the in situ density (no units) (unmasked) 
    521       !! 
    522       !!---------------------------------------------------------------------- 
    523       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpts), INTENT(in   ) ::   pts   ! 1 : potential temperature  [Celsius] 
    524       !                                                           ! 2 : salinity               [psu] 
    525       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     , INTENT(in   ) ::   pdep  ! depth                      [m] 
    526       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     , INTENT(  out) ::   prd   ! in situ density 
    527       ! 
    528       INTEGER  ::   ji, jj, jk                ! dummy loop indices 
    529       REAL(wp) ::   zt , zh , zs              ! local scalars 
    530       REAL(wp) ::   zn , zn0, zn1, zn2, zn3   !   -      - 
    531       !!---------------------------------------------------------------------- 
    532       ! 
    533       IF( ln_timing )   CALL timing_start('eos2d') 
    534       ! 
    535       prd(:,:) = 0._wp 
    536       ! 
    537       SELECT CASE( neos ) 
    538       ! 
    539       CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    540          ! 
    541          DO jj = 1, jpjm1 
    542             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    543                ! 
    544                zh  = pdep(ji,jj) * r1_Z0                                  ! depth 
    545                zt  = pts (ji,jj,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    546                zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     408            DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     409               ! 
     410               zh  = pdep(ji,jj,jk) * r1_Z0                                  ! depth 
     411               zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     412               zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     413               ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    547414               ! 
    548415               zn3 = EOS013*zt   & 
     
    569436               zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    570437               ! 
    571                prd(ji,jj) = zn * r1_rho0 - 1._wp               ! unmasked in situ density anomaly 
    572                ! 
    573             END DO 
    574          END DO 
    575          ! 
    576          CALL lbc_lnk( 'eosbn2', prd, 'T', 1. )                    ! Lateral boundary conditions 
    577          ! 
     438               prhop(ji,jj,jk) = zn0 * ztm                           ! potential density referenced at the surface 
     439               ! 
     440               prd(ji,jj,jk) = (  zn * r1_rho0 - 1._wp  ) * ztm      ! density anomaly (masked) 
     441            END_3D 
     442         ENDIF 
     443          
    578444      CASE( np_seos )                !==  simplified EOS  ==! 
    579445         ! 
    580          DO jj = 1, jpjm1 
    581             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    582                ! 
    583                zt    = pts  (ji,jj,jp_tem)  - 10._wp 
    584                zs    = pts  (ji,jj,jp_sal)  - 35._wp 
    585                zh    = pdep (ji,jj)                         ! depth at the partial step level 
    586                ! 
    587                zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) * zt   & 
    588                   &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) * zs   & 
    589                   &  - rn_nu * zt * zs 
    590                   ! 
    591                prd(ji,jj) = zn * r1_rho0               ! unmasked in situ density anomaly 
    592                ! 
    593             END DO 
    594          END DO 
    595          ! 
    596          CALL lbc_lnk( 'eosbn2', prd, 'T', 1. )                    ! Lateral boundary conditions 
     446         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     447            zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp 
     448            zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp 
     449            zh  = pdep (ji,jj,jk) 
     450            ztm = tmask(ji,jj,jk) 
     451            !                                                     ! potential density referenced at the surface 
     452            zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt ) * zt   & 
     453               &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs ) * zs   & 
     454               &  - rn_nu * zt * zs 
     455            prhop(ji,jj,jk) = ( rho0 + zn ) * ztm 
     456            !                                                     ! density anomaly (masked) 
     457            zn = zn - ( rn_a0 * rn_mu1 * zt + rn_b0 * rn_mu2 * zs ) * zh 
     458            prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm 
     459            ! 
     460         END_3D 
     461         ! 
     462      CASE( np_leos )                !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
     463         ! 
     464         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     465            zt  = pts  (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
     466            zs  = pts  (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp 
     467            zh  = pdep (ji,jj,jk) 
     468            ztm = tmask(ji,jj,jk) 
     469            !                                                     ! potential density referenced at the surface 
     470            zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
     471            prhop(ji,jj,jk) = ( rho0 + zn ) * ztm 
     472            !                                                     ! density anomaly (masked) 
     473            prd(ji,jj,jk) = zn * r1_rho0 * ztm 
     474            ! 
     475         END_3D 
     476         ! 
     477      END SELECT 
     478      ! 
     479      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=prd, clinfo1=' eos-pot: ', tab3d_2=prhop, clinfo2=' pot : ', kdim=jpk ) 
     480      ! 
     481      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos-pot') 
     482      ! 
     483   END SUBROUTINE eos_insitu_pot 
     484 
     485 
     486   SUBROUTINE eos_insitu_2d( pts, pdep, prd ) 
     487      !!---------------------------------------------------------------------- 
     488      !!                  ***  ROUTINE eos_insitu_2d  *** 
     489      !! 
     490      !! ** Purpose :   Compute the in situ density (ratio rho/rho0) from 
     491      !!      potential temperature and salinity using an equation of state 
     492      !!      selected in the nameos namelist. * 2D field case 
     493      !! 
     494      !! ** Action  : - prd , the in situ density (no units) (unmasked) 
     495      !! 
     496      !!---------------------------------------------------------------------- 
     497      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpts), INTENT(in   ) ::   pts   ! 1 : potential temperature  [Celsius] 
     498      !                                                           ! 2 : salinity               [psu] 
     499      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     , INTENT(in   ) ::   pdep  ! depth                      [m] 
     500      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     , INTENT(  out) ::   prd   ! in situ density 
     501      ! 
     502      INTEGER  ::   ji, jj, jk                ! dummy loop indices 
     503      REAL(wp) ::   zt , zh , zs              ! local scalars 
     504      REAL(wp) ::   zn , zn0, zn1, zn2, zn3   !   -      - 
     505      !!---------------------------------------------------------------------- 
     506      ! 
     507      IF( ln_timing )   CALL timing_start('eos2d') 
     508      ! 
     509      prd(:,:) = 0._wp 
     510      ! 
     511      SELECT CASE( neos ) 
     512      ! 
     513      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
     514         ! 
     515         DO_2D_11_11 
     516            ! 
     517            zh  = pdep(ji,jj) * r1_Z0                                  ! depth 
     518            zt  = pts (ji,jj,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     519            zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     520            ! 
     521            zn3 = EOS013*zt   & 
     522               &   + EOS103*zs+EOS003 
     523               ! 
     524            zn2 = (EOS022*zt   & 
     525               &   + EOS112*zs+EOS012)*zt   & 
     526               &   + (EOS202*zs+EOS102)*zs+EOS002 
     527               ! 
     528            zn1 = (((EOS041*zt   & 
     529               &   + EOS131*zs+EOS031)*zt   & 
     530               &   + (EOS221*zs+EOS121)*zs+EOS021)*zt   & 
     531               &   + ((EOS311*zs+EOS211)*zs+EOS111)*zs+EOS011)*zt   & 
     532               &   + (((EOS401*zs+EOS301)*zs+EOS201)*zs+EOS101)*zs+EOS001 
     533               ! 
     534            zn0 = (((((EOS060*zt   & 
     535               &   + EOS150*zs+EOS050)*zt   & 
     536               &   + (EOS240*zs+EOS140)*zs+EOS040)*zt   & 
     537               &   + ((EOS330*zs+EOS230)*zs+EOS130)*zs+EOS030)*zt   & 
     538               &   + (((EOS420*zs+EOS320)*zs+EOS220)*zs+EOS120)*zs+EOS020)*zt   & 
     539               &   + ((((EOS510*zs+EOS410)*zs+EOS310)*zs+EOS210)*zs+EOS110)*zs+EOS010)*zt   & 
     540               &   + (((((EOS600*zs+EOS500)*zs+EOS400)*zs+EOS300)*zs+EOS200)*zs+EOS100)*zs+EOS000 
     541               ! 
     542            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     543            ! 
     544            prd(ji,jj) = zn * r1_rho0 - 1._wp               ! unmasked in situ density anomaly 
     545            ! 
     546         END_2D 
     547         ! 
     548      CASE( np_seos )                !==  simplified EOS  ==! 
     549         ! 
     550         DO_2D_11_11 
     551            ! 
     552            zt    = pts  (ji,jj,jp_tem)  - 10._wp 
     553            zs    = pts  (ji,jj,jp_sal)  - 35._wp 
     554            zh    = pdep (ji,jj)                         ! depth at the partial step level 
     555            ! 
     556            zn =  - rn_a0 * ( 1._wp + 0.5_wp*rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) * zt   & 
     557               &  + rn_b0 * ( 1._wp - 0.5_wp*rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) * zs   & 
     558               &  - rn_nu * zt * zs 
     559               ! 
     560            prd(ji,jj) = zn * r1_rho0               ! unmasked in situ density anomaly 
     561            ! 
     562         END_2D 
    597563         ! 
    598564      CASE( np_leos )                !==  ISOMIP EOS  ==! 
    599565         ! 
    600          DO jj = 1, jpjm1 
    601             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    602                ! 
    603                zt    = pts  (ji,jj,jp_tem)  - (-1._wp) 
    604                zs    = pts  (ji,jj,jp_sal)  - 34.2_wp 
    605                zh    = pdep (ji,jj)                         ! depth at the partial step level 
    606                ! 
    607                zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
    608                   ! 
    609                prd(ji,jj) = zn * r1_rho0               ! unmasked in situ density anomaly 
    610                ! 
    611             END DO 
    612          END DO 
    613          ! 
    614          CALL lbc_lnk( 'eosbn2', prd, 'T', 1. )                    ! Lateral boundary conditions 
     566         DO_2D_11_11 
     567            ! 
     568            zt    = pts  (ji,jj,jp_tem)  - (-1._wp) 
     569            zs    = pts  (ji,jj,jp_sal)  - 34.2_wp 
     570            zh    = pdep (ji,jj)                         ! depth at the partial step level 
     571            ! 
     572            zn =  rho0 * ( - rn_a0 * zt + rn_b0 * zs ) 
     573            ! 
     574            prd(ji,jj) = zn * r1_rho0               ! unmasked in situ density anomaly 
     575            ! 
     576         END_2D 
     577         ! 
    615578         ! 
    616579      END SELECT 
    617580      ! 
    618       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=prd, clinfo1=' eos2d: ' ) 
     581      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=prd, clinfo1=' eos2d: ' ) 
    619582      ! 
    620583      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos2d') 
     
    648611      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    649612         ! 
    650          DO jk = 1, jpkm1 
    651             DO jj = 1, jpj 
    652                DO ji = 1, jpi 
    653                   ! 
    654                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm) * r1_Z0                                ! depth 
    655                   zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    656                   zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    657                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    658                   ! 
    659                   ! alpha 
    660                   zn3 = ALP003 
    661                   ! 
    662                   zn2 = ALP012*zt + ALP102*zs+ALP002 
    663                   ! 
    664                   zn1 = ((ALP031*zt   & 
    665                      &   + ALP121*zs+ALP021)*zt   & 
    666                      &   + (ALP211*zs+ALP111)*zs+ALP011)*zt   & 
    667                      &   + ((ALP301*zs+ALP201)*zs+ALP101)*zs+ALP001 
    668                      ! 
    669                   zn0 = ((((ALP050*zt   & 
    670                      &   + ALP140*zs+ALP040)*zt   & 
    671                      &   + (ALP230*zs+ALP130)*zs+ALP030)*zt   & 
    672                      &   + ((ALP320*zs+ALP220)*zs+ALP120)*zs+ALP020)*zt   & 
    673                      &   + (((ALP410*zs+ALP310)*zs+ALP210)*zs+ALP110)*zs+ALP010)*zt   & 
    674                      &   + ((((ALP500*zs+ALP400)*zs+ALP300)*zs+ALP200)*zs+ALP100)*zs+ALP000 
    675                      ! 
    676                   zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    677                   ! 
    678                   pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm 
    679                   ! 
    680                   ! beta 
    681                   zn3 = BET003 
    682                   ! 
    683                   zn2 = BET012*zt + BET102*zs+BET002 
    684                   ! 
    685                   zn1 = ((BET031*zt   & 
    686                      &   + BET121*zs+BET021)*zt   & 
    687                      &   + (BET211*zs+BET111)*zs+BET011)*zt   & 
    688                      &   + ((BET301*zs+BET201)*zs+BET101)*zs+BET001 
    689                      ! 
    690                   zn0 = ((((BET050*zt   & 
    691                      &   + BET140*zs+BET040)*zt   & 
    692                      &   + (BET230*zs+BET130)*zs+BET030)*zt   & 
    693                      &   + ((BET320*zs+BET220)*zs+BET120)*zs+BET020)*zt   & 
    694                      &   + (((BET410*zs+BET310)*zs+BET210)*zs+BET110)*zs+BET010)*zt   & 
    695                      &   + ((((BET500*zs+BET400)*zs+BET300)*zs+BET200)*zs+BET100)*zs+BET000 
    696                      ! 
    697                   zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    698                   ! 
    699                   pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn / zs * r1_rho0 * ztm 
    700                   ! 
    701                END DO 
    702             END DO 
    703          END DO 
     613         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     614            ! 
     615            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm) * r1_Z0                                ! depth 
     616            zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     617            zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     618            ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
     619            ! 
     620            ! alpha 
     621            zn3 = ALP003 
     622            ! 
     623            zn2 = ALP012*zt + ALP102*zs+ALP002 
     624            ! 
     625            zn1 = ((ALP031*zt   & 
     626               &   + ALP121*zs+ALP021)*zt   & 
     627               &   + (ALP211*zs+ALP111)*zs+ALP011)*zt   & 
     628               &   + ((ALP301*zs+ALP201)*zs+ALP101)*zs+ALP001 
     629               ! 
     630            zn0 = ((((ALP050*zt   & 
     631               &   + ALP140*zs+ALP040)*zt   & 
     632               &   + (ALP230*zs+ALP130)*zs+ALP030)*zt   & 
     633               &   + ((ALP320*zs+ALP220)*zs+ALP120)*zs+ALP020)*zt   & 
     634               &   + (((ALP410*zs+ALP310)*zs+ALP210)*zs+ALP110)*zs+ALP010)*zt   & 
     635               &   + ((((ALP500*zs+ALP400)*zs+ALP300)*zs+ALP200)*zs+ALP100)*zs+ALP000 
     636               ! 
     637            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     638            ! 
     639            pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm 
     640            ! 
     641            ! beta 
     642            zn3 = BET003 
     643            ! 
     644            zn2 = BET012*zt + BET102*zs+BET002 
     645            ! 
     646            zn1 = ((BET031*zt   & 
     647               &   + BET121*zs+BET021)*zt   & 
     648               &   + (BET211*zs+BET111)*zs+BET011)*zt   & 
     649               &   + ((BET301*zs+BET201)*zs+BET101)*zs+BET001 
     650               ! 
     651            zn0 = ((((BET050*zt   & 
     652               &   + BET140*zs+BET040)*zt   & 
     653               &   + (BET230*zs+BET130)*zs+BET030)*zt   & 
     654               &   + ((BET320*zs+BET220)*zs+BET120)*zs+BET020)*zt   & 
     655               &   + (((BET410*zs+BET310)*zs+BET210)*zs+BET110)*zs+BET010)*zt   & 
     656               &   + ((((BET500*zs+BET400)*zs+BET300)*zs+BET200)*zs+BET100)*zs+BET000 
     657               ! 
     658            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     659            ! 
     660            pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn / zs * r1_rho0 * ztm 
     661            ! 
     662         END_3D 
    704663         ! 
    705664      CASE( np_seos )                  !==  simplified EOS  ==! 
    706665         ! 
    707          DO jk = 1, jpkm1 
    708             DO jj = 1, jpj 
    709                DO ji = 1, jpi 
    710                   zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
    711                   zs  = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    712                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                ! depth in meters at t-point 
    713                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                  ! land/sea bottom mask = surf. mask 
    714                   ! 
    715                   zn  = rn_a0 * ( 1._wp + rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) + rn_nu*zs 
    716                   pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm   ! alpha 
    717                   ! 
    718                   zn  = rn_b0 * ( 1._wp - rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) - rn_nu*zt 
    719                   pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn * r1_rho0 * ztm   ! beta 
    720                   ! 
    721                END DO 
    722             END DO 
    723          END DO 
     666         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     667            zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
     668            zs  = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     669            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                ! depth in meters at t-point 
     670            ztm = tmask(ji,jj,jk)                  ! land/sea bottom mask = surf. mask 
     671            ! 
     672            zn  = rn_a0 * ( 1._wp + rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) + rn_nu*zs 
     673            pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm   ! alpha 
     674            ! 
     675            zn  = rn_b0 * ( 1._wp - rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) - rn_nu*zt 
     676            pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn * r1_rho0 * ztm   ! beta 
     677            ! 
     678         END_3D 
    724679         ! 
    725680      CASE( np_leos )                  !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
    726681         ! 
    727          DO jk = 1, jpkm1 
    728             DO jj = 1, jpj 
    729                DO ji = 1, jpi 
    730                   zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
    731                   zs  = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    732                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                 ! depth in meters at t-point 
    733                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                   ! land/sea bottom mask = surf. mask 
    734                   ! 
    735                   zn  = rn_a0 * rho0 
    736                   pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm   ! alpha 
    737                   ! 
    738                   zn  = rn_b0 * rho0 
    739                   pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn * r1_rho0 * ztm   ! beta 
    740                   ! 
    741                END DO 
    742             END DO 
    743          END DO 
     682         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     683            zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp) 
     684            zs  = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     685            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                 ! depth in meters at t-point 
     686            ztm = tmask(ji,jj,jk)                   ! land/sea bottom mask = surf. mask 
     687            ! 
     688            zn  = rn_a0 * rho0 
     689            pab(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * r1_rho0 * ztm   ! alpha 
     690            ! 
     691            zn  = rn_b0 * rho0 
     692            pab(ji,jj,jk,jp_sal) = zn * r1_rho0 * ztm   ! beta 
     693            ! 
     694         END_3D 
    744695         ! 
    745696      CASE DEFAULT 
     
    749700      END SELECT 
    750701      ! 
    751       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pab(:,:,:,jp_tem), clinfo1=' rab_3d_t: ', & 
    752          &                       tab3d_2=pab(:,:,:,jp_sal), clinfo2=' rab_3d_s : ', kdim=jpk ) 
     702      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pab(:,:,:,jp_tem), clinfo1=' rab_3d_t: ', & 
     703         &                                  tab3d_2=pab(:,:,:,jp_sal), clinfo2=' rab_3d_s : ', kdim=jpk ) 
    753704      ! 
    754705      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('rab_3d') 
     
    783734      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    784735         ! 
    785          DO jj = 1, jpjm1 
    786             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    787                ! 
    788                zh  = pdep(ji,jj) * r1_Z0                                  ! depth 
    789                zt  = pts (ji,jj,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    790                zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    791                ! 
    792                ! alpha 
    793                zn3 = ALP003 
    794                ! 
    795                zn2 = ALP012*zt + ALP102*zs+ALP002 
    796                ! 
    797                zn1 = ((ALP031*zt   & 
    798                   &   + ALP121*zs+ALP021)*zt   & 
    799                   &   + (ALP211*zs+ALP111)*zs+ALP011)*zt   & 
    800                   &   + ((ALP301*zs+ALP201)*zs+ALP101)*zs+ALP001 
    801                   ! 
    802                zn0 = ((((ALP050*zt   & 
    803                   &   + ALP140*zs+ALP040)*zt   & 
    804                   &   + (ALP230*zs+ALP130)*zs+ALP030)*zt   & 
    805                   &   + ((ALP320*zs+ALP220)*zs+ALP120)*zs+ALP020)*zt   & 
    806                   &   + (((ALP410*zs+ALP310)*zs+ALP210)*zs+ALP110)*zs+ALP010)*zt   & 
    807                   &   + ((((ALP500*zs+ALP400)*zs+ALP300)*zs+ALP200)*zs+ALP100)*zs+ALP000 
    808                   ! 
    809                zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    810                ! 
    811                pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0 
    812                ! 
    813                ! beta 
    814                zn3 = BET003 
    815                ! 
    816                zn2 = BET012*zt + BET102*zs+BET002 
    817                ! 
    818                zn1 = ((BET031*zt   & 
    819                   &   + BET121*zs+BET021)*zt   & 
    820                   &   + (BET211*zs+BET111)*zs+BET011)*zt   & 
    821                   &   + ((BET301*zs+BET201)*zs+BET101)*zs+BET001 
    822                   ! 
    823                zn0 = ((((BET050*zt   & 
    824                   &   + BET140*zs+BET040)*zt   & 
    825                   &   + (BET230*zs+BET130)*zs+BET030)*zt   & 
    826                   &   + ((BET320*zs+BET220)*zs+BET120)*zs+BET020)*zt   & 
    827                   &   + (((BET410*zs+BET310)*zs+BET210)*zs+BET110)*zs+BET010)*zt   & 
    828                   &   + ((((BET500*zs+BET400)*zs+BET300)*zs+BET200)*zs+BET100)*zs+BET000 
    829                   ! 
    830                zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    831                ! 
    832                pab(ji,jj,jp_sal) = zn / zs * r1_rho0 
    833                ! 
    834                ! 
    835             END DO 
    836          END DO 
    837          !                            ! Lateral boundary conditions 
    838          CALL lbc_lnk_multi( 'eosbn2', pab(:,:,jp_tem), 'T', 1. , pab(:,:,jp_sal), 'T', 1. )                     
     736         DO_2D_11_11 
     737            ! 
     738            zh  = pdep(ji,jj) * r1_Z0                                  ! depth 
     739            zt  = pts (ji,jj,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     740            zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     741            ! 
     742            ! alpha 
     743            zn3 = ALP003 
     744            ! 
     745            zn2 = ALP012*zt + ALP102*zs+ALP002 
     746            ! 
     747            zn1 = ((ALP031*zt   & 
     748               &   + ALP121*zs+ALP021)*zt   & 
     749               &   + (ALP211*zs+ALP111)*zs+ALP011)*zt   & 
     750               &   + ((ALP301*zs+ALP201)*zs+ALP101)*zs+ALP001 
     751               ! 
     752            zn0 = ((((ALP050*zt   & 
     753               &   + ALP140*zs+ALP040)*zt   & 
     754               &   + (ALP230*zs+ALP130)*zs+ALP030)*zt   & 
     755               &   + ((ALP320*zs+ALP220)*zs+ALP120)*zs+ALP020)*zt   & 
     756               &   + (((ALP410*zs+ALP310)*zs+ALP210)*zs+ALP110)*zs+ALP010)*zt   & 
     757               &   + ((((ALP500*zs+ALP400)*zs+ALP300)*zs+ALP200)*zs+ALP100)*zs+ALP000 
     758               ! 
     759            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     760            ! 
     761            pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0 
     762            ! 
     763            ! beta 
     764            zn3 = BET003 
     765            ! 
     766            zn2 = BET012*zt + BET102*zs+BET002 
     767            ! 
     768            zn1 = ((BET031*zt   & 
     769               &   + BET121*zs+BET021)*zt   & 
     770               &   + (BET211*zs+BET111)*zs+BET011)*zt   & 
     771               &   + ((BET301*zs+BET201)*zs+BET101)*zs+BET001 
     772               ! 
     773            zn0 = ((((BET050*zt   & 
     774               &   + BET140*zs+BET040)*zt   & 
     775               &   + (BET230*zs+BET130)*zs+BET030)*zt   & 
     776               &   + ((BET320*zs+BET220)*zs+BET120)*zs+BET020)*zt   & 
     777               &   + (((BET410*zs+BET310)*zs+BET210)*zs+BET110)*zs+BET010)*zt   & 
     778               &   + ((((BET500*zs+BET400)*zs+BET300)*zs+BET200)*zs+BET100)*zs+BET000 
     779               ! 
     780            zn  = ( ( zn3 * zh + zn2 ) * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     781            ! 
     782            pab(ji,jj,jp_sal) = zn / zs * r1_rho0 
     783            ! 
     784            ! 
     785         END_2D 
    839786         ! 
    840787      CASE( np_seos )                  !==  simplified EOS  ==! 
    841788         ! 
    842          DO jj = 1, jpjm1 
    843             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    844                ! 
    845                zt    = pts  (ji,jj,jp_tem) - 10._wp   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
    846                zs    = pts  (ji,jj,jp_sal) - 35._wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    847                zh    = pdep (ji,jj)                   ! depth at the partial step level 
    848                ! 
    849                zn  = rn_a0 * ( 1._wp + rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) + rn_nu*zs 
    850                pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0   ! alpha 
    851                ! 
    852                zn  = rn_b0 * ( 1._wp - rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) - rn_nu*zt 
    853                pab(ji,jj,jp_sal) = zn * r1_rho0   ! beta 
    854                ! 
    855             END DO 
    856          END DO 
    857          !                            ! Lateral boundary conditions 
    858          CALL lbc_lnk_multi( 'eosbn2', pab(:,:,jp_tem), 'T', 1. , pab(:,:,jp_sal), 'T', 1. )                     
     789         DO_2D_11_11 
     790            ! 
     791            zt    = pts  (ji,jj,jp_tem) - 10._wp   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
     792            zs    = pts  (ji,jj,jp_sal) - 35._wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     793            zh    = pdep (ji,jj)                   ! depth at the partial step level 
     794            ! 
     795            zn  = rn_a0 * ( 1._wp + rn_lambda1*zt + rn_mu1*zh ) + rn_nu*zs 
     796            pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0   ! alpha 
     797            ! 
     798            zn  = rn_b0 * ( 1._wp - rn_lambda2*zs - rn_mu2*zh ) - rn_nu*zt 
     799            pab(ji,jj,jp_sal) = zn * r1_rho0   ! beta 
     800            ! 
     801         END_2D 
    859802         ! 
    860803      CASE( np_leos )                  !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
    861804         ! 
    862          DO jj = 1, jpjm1 
    863             DO ji = 1, fs_jpim1   ! vector opt. 
    864                ! 
    865                zt    = pts  (ji,jj,jp_tem) - (-1._wp)   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
    866                zs    = pts  (ji,jj,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    867                zh    = pdep (ji,jj)                   ! depth at the partial step level 
    868                ! 
    869                zn  = rn_a0 * rho0 
    870                pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0   ! alpha 
    871                ! 
    872                zn  = rn_b0 * rho0 
    873                pab(ji,jj,jp_sal) = zn * r1_rho0   ! beta 
    874                ! 
    875             END DO 
    876          END DO 
    877          ! 
    878          CALL lbc_lnk_multi( 'eosbn2', pab(:,:,jp_tem), 'T', 1. , pab(:,:,jp_sal), 'T', 1. )                    ! Lateral boundary conditions 
     805         DO_2D_11_11 
     806            ! 
     807            zt    = pts  (ji,jj,jp_tem) - (-1._wp)   ! pot. temperature anomaly (t-T0) 
     808            zs    = pts  (ji,jj,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     809            zh    = pdep (ji,jj)                   ! depth at the partial step level 
     810            ! 
     811            zn  = rn_a0 * rho0 
     812            pab(ji,jj,jp_tem) = zn * r1_rho0   ! alpha 
     813            ! 
     814            zn  = rn_b0 * rho0 
     815            pab(ji,jj,jp_sal) = zn * r1_rho0   ! beta 
     816            ! 
     817         END_2D 
    879818         ! 
    880819      CASE DEFAULT 
     
    884823      END SELECT 
    885824      ! 
    886       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=pab(:,:,jp_tem), clinfo1=' rab_2d_t: ', & 
    887          &                       tab2d_2=pab(:,:,jp_sal), clinfo2=' rab_2d_s : ' ) 
     825      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab2d_1=pab(:,:,jp_tem), clinfo1=' rab_2d_t: ', & 
     826         &                                  tab2d_2=pab(:,:,jp_sal), clinfo2=' rab_2d_s : ' ) 
    888827      ! 
    889828      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('rab_2d') 
     
    1026965      IF( ln_timing )   CALL timing_start('bn2') 
    1027966      ! 
    1028       DO jk = 2, jpkm1           ! interior points only (2=< jk =< jpkm1 ) 
    1029          DO jj = 1, jpj          ! surface and bottom value set to zero one for all in istate.F90 
    1030             DO ji = 1, jpi 
    1031                zrw =   ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) - gdept(ji,jj,jk,Kmm) )   & 
    1032                   &  / ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) - gdept(ji,jj,jk,Kmm) )  
    1033                   ! 
    1034                zaw = pab(ji,jj,jk,jp_tem) * (1. - zrw) + pab(ji,jj,jk-1,jp_tem) * zrw  
    1035                zbw = pab(ji,jj,jk,jp_sal) * (1. - zrw) + pab(ji,jj,jk-1,jp_sal) * zrw 
    1036                ! 
    1037                pn2(ji,jj,jk) = grav * (  zaw * ( pts(ji,jj,jk-1,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem) )     & 
    1038                   &                    - zbw * ( pts(ji,jj,jk-1,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal) )  )  & 
    1039                   &            / e3w(ji,jj,jk,Kmm) * wmask(ji,jj,jk) 
    1040             END DO 
    1041          END DO 
    1042       END DO 
    1043       ! 
    1044       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pn2, clinfo1=' bn2  : ', kdim=jpk ) 
     967      DO_3D_11_11( 2, jpkm1 ) 
     968         zrw =   ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) - gdept(ji,jj,jk,Kmm) )   & 
     969            &  / ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) - gdept(ji,jj,jk,Kmm) )  
     970            ! 
     971         zaw = pab(ji,jj,jk,jp_tem) * (1. - zrw) + pab(ji,jj,jk-1,jp_tem) * zrw  
     972         zbw = pab(ji,jj,jk,jp_sal) * (1. - zrw) + pab(ji,jj,jk-1,jp_sal) * zrw 
     973         ! 
     974         pn2(ji,jj,jk) = grav * (  zaw * ( pts(ji,jj,jk-1,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem) )     & 
     975            &                    - zbw * ( pts(ji,jj,jk-1,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal) )  )  & 
     976            &            / e3w(ji,jj,jk,Kmm) * wmask(ji,jj,jk) 
     977      END_3D 
     978      ! 
     979      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pn2, clinfo1=' bn2  : ', kdim=jpk ) 
    1045980      ! 
    1046981      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('bn2') 
     
    10781013      z1_T0   = 1._wp/40._wp 
    10791014      ! 
    1080       DO jj = 1, jpj 
    1081          DO ji = 1, jpi 
    1082             ! 
    1083             zt  = ctmp   (ji,jj) * z1_T0 
    1084             zs  = SQRT( ABS( psal(ji,jj) + zdeltaS ) * r1_S0 ) 
    1085             ztm = tmask(ji,jj,1) 
    1086             ! 
    1087             zn = ((((-2.1385727895e-01_wp*zt   & 
    1088                &   - 2.7674419971e-01_wp*zs+1.0728094330_wp)*zt   & 
    1089                &   + (2.6366564313_wp*zs+3.3546960647_wp)*zs-7.8012209473_wp)*zt   & 
    1090                &   + ((1.8835586562_wp*zs+7.3949191679_wp)*zs-3.3937395875_wp)*zs-5.6414948432_wp)*zt   & 
    1091                &   + (((3.5737370589_wp*zs-1.5512427389e+01_wp)*zs+2.4625741105e+01_wp)*zs   & 
    1092                &      +1.9912291000e+01_wp)*zs-3.2191146312e+01_wp)*zt   & 
    1093                &   + ((((5.7153204649e-01_wp*zs-3.0943149543_wp)*zs+9.3052495181_wp)*zs   & 
    1094                &      -9.4528934807_wp)*zs+3.1066408996_wp)*zs-4.3504021262e-01_wp 
    1095                ! 
    1096             zd = (2.0035003456_wp*zt   & 
    1097                &   -3.4570358592e-01_wp*zs+5.6471810638_wp)*zt   & 
    1098                &   + (1.5393993508_wp*zs-6.9394762624_wp)*zs+1.2750522650e+01_wp 
    1099                ! 
    1100             ptmp(ji,jj) = ( zt / z1_T0 + zn / zd ) * ztm 
    1101                ! 
    1102          END DO 
    1103       END DO 
     1015      DO_2D_11_11 
     1016         ! 
     1017         zt  = ctmp   (ji,jj) * z1_T0 
     1018         zs  = SQRT( ABS( psal(ji,jj) + zdeltaS ) * r1_S0 ) 
     1019         ztm = tmask(ji,jj,1) 
     1020         ! 
     1021         zn = ((((-2.1385727895e-01_wp*zt   & 
     1022            &   - 2.7674419971e-01_wp*zs+1.0728094330_wp)*zt   & 
     1023            &   + (2.6366564313_wp*zs+3.3546960647_wp)*zs-7.8012209473_wp)*zt   & 
     1024            &   + ((1.8835586562_wp*zs+7.3949191679_wp)*zs-3.3937395875_wp)*zs-5.6414948432_wp)*zt   & 
     1025            &   + (((3.5737370589_wp*zs-1.5512427389e+01_wp)*zs+2.4625741105e+01_wp)*zs   & 
     1026            &      +1.9912291000e+01_wp)*zs-3.2191146312e+01_wp)*zt   & 
     1027            &   + ((((5.7153204649e-01_wp*zs-3.0943149543_wp)*zs+9.3052495181_wp)*zs   & 
     1028            &      -9.4528934807_wp)*zs+3.1066408996_wp)*zs-4.3504021262e-01_wp 
     1029            ! 
     1030         zd = (2.0035003456_wp*zt   & 
     1031            &   -3.4570358592e-01_wp*zs+5.6471810638_wp)*zt   & 
     1032            &   + (1.5393993508_wp*zs-6.9394762624_wp)*zs+1.2750522650e+01_wp 
     1033            ! 
     1034         ptmp(ji,jj) = ( zt / z1_T0 + zn / zd ) * ztm 
     1035            ! 
     1036      END_2D 
    11041037      ! 
    11051038      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('eos_pt_from_ct') 
     
    11331066         ! 
    11341067         z1_S0 = 1._wp / 35.16504_wp 
    1135          DO jj = 1, jpj 
    1136             DO ji = 1, jpi 
    1137                zs= SQRT( ABS( psal(ji,jj) ) * z1_S0 )           ! square root salinity 
    1138                ptf(ji,jj) = ((((1.46873e-03_wp*zs-9.64972e-03_wp)*zs+2.28348e-02_wp)*zs & 
    1139                   &          - 3.12775e-02_wp)*zs+2.07679e-02_wp)*zs-5.87701e-02_wp 
    1140             END DO 
    1141          END DO 
     1068         DO_2D_11_11 
     1069            zs= SQRT( ABS( psal(ji,jj) ) * z1_S0 )           ! square root salinity 
     1070            ptf(ji,jj) = ((((1.46873e-03_wp*zs-9.64972e-03_wp)*zs+2.28348e-02_wp)*zs & 
     1071               &          - 3.12775e-02_wp)*zs+2.07679e-02_wp)*zs-5.87701e-02_wp 
     1072         END_2D 
    11421073         ptf(:,:) = ptf(:,:) * psal(:,:) 
    11431074         ! 
    11441075         IF( PRESENT( pdep ) )   ptf(:,:) = ptf(:,:) - 7.53e-4 * pdep(:,:) 
    11451076         ! 
    1146       CASE ( np_eos80, np_leos )                !==  PT,SP (UNESCO formulation)  ==! 
     1077      CASE ( np_eos80 )                !==  PT,SP (UNESCO formulation)  ==! 
    11471078         ! 
    11481079         ptf(:,:) = ( - 0.0575_wp + 1.710523e-3_wp * SQRT( psal(:,:) )   & 
     
    11901121         IF( PRESENT( pdep ) )   ptf = ptf - 7.53e-4 * pdep 
    11911122         ! 
    1192       CASE ( np_eos80, np_leos )                !==  PT,SP (UNESCO formulation)  ==! 
     1123      CASE ( np_eos80 )                !==  PT,SP (UNESCO formulation)  ==! 
    11931124         ! 
    11941125         ptf = ( - 0.0575_wp + 1.710523e-3_wp * SQRT( psal )   & 
     
    12421173      CASE( np_teos10, np_eos80 )                !==  polynomial TEOS-10 / EOS-80 ==! 
    12431174         ! 
    1244          DO jk = 1, jpkm1 
    1245             DO jj = 1, jpj 
    1246                DO ji = 1, jpi 
    1247                   ! 
    1248                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm) * r1_Z0                                ! depth 
    1249                   zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
    1250                   zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
    1251                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
    1252                   ! 
    1253                   ! potential energy non-linear anomaly 
    1254                   zn2 = (PEN012)*zt   & 
    1255                      &   + PEN102*zs+PEN002 
    1256                      ! 
    1257                   zn1 = ((PEN021)*zt   & 
    1258                      &   + PEN111*zs+PEN011)*zt   & 
    1259                      &   + (PEN201*zs+PEN101)*zs+PEN001 
    1260                      ! 
    1261                   zn0 = ((((PEN040)*zt   & 
    1262                      &   + PEN130*zs+PEN030)*zt   & 
    1263                      &   + (PEN220*zs+PEN120)*zs+PEN020)*zt   & 
    1264                      &   + ((PEN310*zs+PEN210)*zs+PEN110)*zs+PEN010)*zt   & 
    1265                      &   + (((PEN400*zs+PEN300)*zs+PEN200)*zs+PEN100)*zs+PEN000 
    1266                      ! 
    1267                   zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    1268                   ! 
    1269                   ppen(ji,jj,jk)  = zn * zh * r1_rho0 * ztm 
    1270                   ! 
    1271                   ! alphaPE non-linear anomaly 
    1272                   zn2 = APE002 
    1273                   ! 
    1274                   zn1 = (APE011)*zt   & 
    1275                      &   + APE101*zs+APE001 
    1276                      ! 
    1277                   zn0 = (((APE030)*zt   & 
    1278                      &   + APE120*zs+APE020)*zt   & 
    1279                      &   + (APE210*zs+APE110)*zs+APE010)*zt   & 
    1280                      &   + ((APE300*zs+APE200)*zs+APE100)*zs+APE000 
    1281                      ! 
    1282                   zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    1283                   !                               
    1284                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * zh * r1_rho0 * ztm 
    1285                   ! 
    1286                   ! betaPE non-linear anomaly 
    1287                   zn2 = BPE002 
    1288                   ! 
    1289                   zn1 = (BPE011)*zt   & 
    1290                      &   + BPE101*zs+BPE001 
    1291                      ! 
    1292                   zn0 = (((BPE030)*zt   & 
    1293                      &   + BPE120*zs+BPE020)*zt   & 
    1294                      &   + (BPE210*zs+BPE110)*zs+BPE010)*zt   & 
    1295                      &   + ((BPE300*zs+BPE200)*zs+BPE100)*zs+BPE000 
    1296                      ! 
    1297                   zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
    1298                   !                               
    1299                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) = zn / zs * zh * r1_rho0 * ztm 
    1300                   ! 
    1301                END DO 
    1302             END DO 
    1303          END DO 
     1175         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     1176            ! 
     1177            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm) * r1_Z0                                ! depth 
     1178            zt  = pts (ji,jj,jk,jp_tem) * r1_T0                           ! temperature 
     1179            zs  = SQRT( ABS( pts(ji,jj,jk,jp_sal) + rdeltaS ) * r1_S0 )   ! square root salinity 
     1180            ztm = tmask(ji,jj,jk)                                         ! tmask 
     1181            ! 
     1182            ! potential energy non-linear anomaly 
     1183            zn2 = (PEN012)*zt   & 
     1184               &   + PEN102*zs+PEN002 
     1185               ! 
     1186            zn1 = ((PEN021)*zt   & 
     1187               &   + PEN111*zs+PEN011)*zt   & 
     1188               &   + (PEN201*zs+PEN101)*zs+PEN001 
     1189               ! 
     1190            zn0 = ((((PEN040)*zt   & 
     1191               &   + PEN130*zs+PEN030)*zt   & 
     1192               &   + (PEN220*zs+PEN120)*zs+PEN020)*zt   & 
     1193               &   + ((PEN310*zs+PEN210)*zs+PEN110)*zs+PEN010)*zt   & 
     1194               &   + (((PEN400*zs+PEN300)*zs+PEN200)*zs+PEN100)*zs+PEN000 
     1195               ! 
     1196            zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     1197            ! 
     1198            ppen(ji,jj,jk)  = zn * zh * r1_rho0 * ztm 
     1199            ! 
     1200            ! alphaPE non-linear anomaly 
     1201            zn2 = APE002 
     1202            ! 
     1203            zn1 = (APE011)*zt   & 
     1204               &   + APE101*zs+APE001 
     1205               ! 
     1206            zn0 = (((APE030)*zt   & 
     1207               &   + APE120*zs+APE020)*zt   & 
     1208               &   + (APE210*zs+APE110)*zs+APE010)*zt   & 
     1209               &   + ((APE300*zs+APE200)*zs+APE100)*zs+APE000 
     1210               ! 
     1211            zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     1212            !                               
     1213            pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = zn * zh * r1_rho0 * ztm 
     1214            ! 
     1215            ! betaPE non-linear anomaly 
     1216            zn2 = BPE002 
     1217            ! 
     1218            zn1 = (BPE011)*zt   & 
     1219               &   + BPE101*zs+BPE001 
     1220               ! 
     1221            zn0 = (((BPE030)*zt   & 
     1222               &   + BPE120*zs+BPE020)*zt   & 
     1223               &   + (BPE210*zs+BPE110)*zs+BPE010)*zt   & 
     1224               &   + ((BPE300*zs+BPE200)*zs+BPE100)*zs+BPE000 
     1225               ! 
     1226            zn  = ( zn2 * zh + zn1 ) * zh + zn0 
     1227            !                               
     1228            pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) = zn / zs * zh * r1_rho0 * ztm 
     1229            ! 
     1230         END_3D 
    13041231         ! 
    13051232      CASE( np_seos )                !==  Vallis (2006) simplified EOS  ==! 
    13061233         ! 
    1307          DO jk = 1, jpkm1 
    1308             DO jj = 1, jpj 
    1309                DO ji = 1, jpi 
    1310                   zt  = pts(ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp  ! temperature anomaly (t-T0) 
    1311                   zs = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp  ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    1312                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)              ! depth in meters  at t-point 
    1313                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                ! tmask 
    1314                   zn  = 0.5_wp * zh * r1_rho0 * ztm 
    1315                   !                                    ! Potential Energy 
    1316                   ppen(ji,jj,jk) = ( rn_a0 * rn_mu1 * zt + rn_b0 * rn_mu2 * zs ) * zn 
    1317                   !                                    ! alphaPE 
    1318                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = - rn_a0 * rn_mu1 * zn 
    1319                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) =   rn_b0 * rn_mu2 * zn 
    1320                   ! 
    1321                END DO 
    1322             END DO 
    1323          END DO 
     1234         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     1235            zt  = pts(ji,jj,jk,jp_tem) - 10._wp  ! temperature anomaly (t-T0) 
     1236            zs = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 35._wp  ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     1237            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)              ! depth in meters  at t-point 
     1238            ztm = tmask(ji,jj,jk)                ! tmask 
     1239            zn  = 0.5_wp * zh * r1_rho0 * ztm 
     1240            !                                    ! Potential Energy 
     1241            ppen(ji,jj,jk) = ( rn_a0 * rn_mu1 * zt + rn_b0 * rn_mu2 * zs ) * zn 
     1242            !                                    ! alphaPE 
     1243            pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = - rn_a0 * rn_mu1 * zn 
     1244            pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) =   rn_b0 * rn_mu2 * zn 
     1245            ! 
     1246         END_3D 
    13241247         ! 
    13251248      CASE( np_leos )                !==  linear ISOMIP EOS  ==! 
    13261249         ! 
    1327          DO jk = 1, jpkm1 
    1328             DO jj = 1, jpj 
    1329                DO ji = 1, jpi 
    1330                   zt  = pts(ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp)  ! temperature anomaly (t-T0) 
    1331                   zs = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
    1332                   zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                ! depth in meters  at t-point 
    1333                   ztm = tmask(ji,jj,jk)                  ! tmask 
    1334                   zn  = 0.5_wp * zh * r1_rho0 * ztm 
    1335                   !                                    ! Potential Energy 
    1336                   ppen(ji,jj,jk) = 0. 
    1337                   !                                    ! alphaPE 
    1338                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = 0. 
    1339                   pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) = 0. 
    1340                   ! 
    1341                END DO 
    1342             END DO 
    1343          END DO 
     1250         DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     1251            zt  = pts(ji,jj,jk,jp_tem) - (-1._wp)  ! temperature anomaly (t-T0) 
     1252            zs = pts (ji,jj,jk,jp_sal) - 34.2_wp   ! abs. salinity anomaly (s-S0) 
     1253            zh  = gdept(ji,jj,jk,Kmm)                ! depth in meters  at t-point 
     1254            ztm = tmask(ji,jj,jk)                  ! tmask 
     1255            zn  = 0.5_wp * zh * r1_rho0 * ztm 
     1256            !                                    ! Potential Energy 
     1257            ppen(ji,jj,jk) = 0. 
     1258            !                                    ! alphaPE 
     1259            pab_pe(ji,jj,jk,jp_tem) = 0. 
     1260            pab_pe(ji,jj,jk,jp_sal) = 0. 
     1261            ! 
     1262         END_3D 
    13441263         ! 
    13451264      CASE DEFAULT 
     
    13651284      INTEGER  ::   ioptio   ! local integer 
    13661285      !! 
    1367       NAMELIST/nameos/ ln_TEOS10, ln_EOS80, ln_SEOS   , ln_LEOS, & 
    1368          &             rn_a0    , rn_b0   , rn_lambda1, rn_mu1 , & 
    1369          &                                  rn_lambda2, rn_mu2 , rn_nu 
    1370       !!---------------------------------------------------------------------- 
    1371       ! 
    1372       REWIND( numnam_ref )              ! Namelist nameos in reference namelist : equation of state 
     1286      NAMELIST/nameos/ ln_TEOS10, ln_EOS80, ln_SEOS, ln_LEOS, rn_a0, rn_b0, & 
     1287         &             rn_lambda1, rn_mu1, rn_lambda2, rn_mu2, rn_nu 
     1288      !!---------------------------------------------------------------------- 
     1289      ! 
    13731290      READ  ( numnam_ref, nameos, IOSTAT = ios, ERR = 901 ) 
    13741291901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'nameos in reference namelist' ) 
    13751292      ! 
    1376       REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist nameos in configuration namelist : equation of state 
    13771293      READ  ( numnam_cfg, nameos, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
    13781294902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'nameos in configuration namelist' ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/isfcavgam.F90

    r12077 r12939  
    9191         pgs(:,:) = rn_gammas0 
    9292      CASE ( 'vel' ) ! gamma is proportional to u* 
    93          CALL gammats_vel      (                   zutbl, zvtbl, rCd0_top, r_ke0_top,               pgt, pgs ) 
     93         CALL gammats_vel      (                   zutbl, zvtbl, rCd0_top, rn_vtide**2,               pgt, pgs ) 
    9494      CASE ( 'vel_stab' ) ! gamma depends of stability of boundary layer and u* 
    95          CALL gammats_vel_stab (Kmm, pttbl, pstbl, zutbl, zvtbl, rCd0_top, r_ke0_top, pqoce, pqfwf, pgt, pgs ) 
     95         CALL gammats_vel_stab (Kmm, pttbl, pstbl, zutbl, zvtbl, rCd0_top, rn_vtide**2, pqoce, pqfwf, pgt, pgs ) 
    9696      CASE DEFAULT 
    9797         CALL ctl_stop('STOP','method to compute gamma (cn_gammablk) is unknown (should not see this)') 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/isfstp.F90

    r12077 r12939  
    250250      IF ( l_isfoasis .AND. ln_isf ) THEN 
    251251         ! 
    252          CALL ctl_stop( ' ln_ctl and ice shelf not tested' ) 
     252         CALL ctl_stop( 'namelist combination ln_cpl and ln_isf not tested' ) 
    253253         ! 
    254254         ! NEMO coupled to ATMO model with isf cavity need oasis method for melt computation  
     
    291291      !!---------------------------------------------------------------------- 
    292292      ! 
    293       REWIND( numnam_ref )              ! Namelist namsbc_rnf in reference namelist : Runoffs  
    294293      READ  ( numnam_ref, namisf, IOSTAT = ios, ERR = 901) 
    295294901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namisf in reference namelist' ) 
    296295      ! 
    297       REWIND( numnam_cfg )              ! Namelist namsbc_rnf in configuration namelist : Runoffs 
    298296      READ  ( numnam_cfg, namisf, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
    299297902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namisf in configuration namelist' ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/istate.F90

    r12353 r12939  
    4141   PUBLIC   istate_init   ! routine called by step.F90 
    4242 
     43   !! * Substitutions 
     44#  include "do_loop_substitute.h90" 
    4345   !!---------------------------------------------------------------------- 
    4446   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    7577      rhd  (:,:,:  ) = 0._wp   ;   rhop (:,:,:  ) = 0._wp      ! set one for all to 0 at level jpk 
    7678      rn2b (:,:,:  ) = 0._wp   ;   rn2  (:,:,:  ) = 0._wp      ! set one for all to 0 at levels 1 and jpk 
    77       ts   (:,:,:,:,Kaa) = 0._wp                               ! set one for all to 0 at level jpk 
     79      ts  (:,:,:,:,Kaa) = 0._wp                                   ! set one for all to 0 at level jpk 
    7880      rab_b(:,:,:,:) = 0._wp   ;   rab_n(:,:,:,:) = 0._wp      ! set one for all to 0 at level jpk 
    7981#if defined key_agrif 
     
    9092         !                                    ! --------------- 
    9193         numror = 0                           ! define numror = 0 -> no restart file to read 
    92          neuler = 0                           ! Set time-step indicator at nit000 (euler forward) 
     94         l_1st_euler = .true.                 ! Set time-step indicator at nit000 (euler forward) 
    9395         CALL day_init                        ! model calendar (using both namelist and restart infos) 
    9496         !                                    ! Initialization of ocean to zero 
     
    103105               ! Apply minimum wetdepth criterion 
    104106               ! 
    105                DO jj = 1,jpj 
    106                   DO ji = 1,jpi 
    107                      IF( ht_0(ji,jj) + ssh(ji,jj,Kbb)  < rn_wdmin1 ) THEN 
    108                         ssh(ji,jj,Kbb) = tmask(ji,jj,1)*( rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj)) ) 
    109                      ENDIF 
    110                   END DO 
    111                END DO  
     107               DO_2D_11_11 
     108                  IF( ht_0(ji,jj) + ssh(ji,jj,Kbb)  < rn_wdmin1 ) THEN 
     109                     ssh(ji,jj,Kbb) = tmask(ji,jj,1)*( rn_wdmin1 - (ht_0(ji,jj)) ) 
     110                  ENDIF 
     111               END_2D 
    112112            ENDIF  
    113113            uu  (:,:,:,Kbb) = 0._wp 
     
    159159      ! 
    160160!!gm  the use of umsak & vmask is not necessary below as uu(:,:,:,Kmm), vv(:,:,:,Kmm), uu(:,:,:,Kbb), vv(:,:,:,Kbb) are always masked 
    161       DO jk = 1, jpkm1 
    162          DO jj = 1, jpj 
    163             DO ji = 1, jpi 
    164                uu_b(ji,jj,Kmm) = uu_b(ji,jj,Kmm) + e3u(ji,jj,jk,Kmm) * uu(ji,jj,jk,Kmm) * umask(ji,jj,jk) 
    165                vv_b(ji,jj,Kmm) = vv_b(ji,jj,Kmm) + e3v(ji,jj,jk,Kmm) * vv(ji,jj,jk,Kmm) * vmask(ji,jj,jk) 
    166                ! 
    167                uu_b(ji,jj,Kbb) = uu_b(ji,jj,Kbb) + e3u(ji,jj,jk,Kbb) * uu(ji,jj,jk,Kbb) * umask(ji,jj,jk) 
    168                vv_b(ji,jj,Kbb) = vv_b(ji,jj,Kbb) + e3v(ji,jj,jk,Kbb) * vv(ji,jj,jk,Kbb) * vmask(ji,jj,jk) 
    169             END DO 
    170          END DO 
    171       END DO 
     161      DO_3D_11_11( 1, jpkm1 ) 
     162         uu_b(ji,jj,Kmm) = uu_b(ji,jj,Kmm) + e3u(ji,jj,jk,Kmm) * uu(ji,jj,jk,Kmm) * umask(ji,jj,jk) 
     163         vv_b(ji,jj,Kmm) = vv_b(ji,jj,Kmm) + e3v(ji,jj,jk,Kmm) * vv(ji,jj,jk,Kmm) * vmask(ji,jj,jk) 
     164         ! 
     165         uu_b(ji,jj,Kbb) = uu_b(ji,jj,Kbb) + e3u(ji,jj,jk,Kbb) * uu(ji,jj,jk,Kbb) * umask(ji,jj,jk) 
     166         vv_b(ji,jj,Kbb) = vv_b(ji,jj,Kbb) + e3v(ji,jj,jk,Kbb) * vv(ji,jj,jk,Kbb) * vmask(ji,jj,jk) 
     167      END_3D 
    172168      ! 
    173169      uu_b(:,:,Kmm) = uu_b(:,:,Kmm) * r1_hu(:,:,Kmm) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/sbcfwb.F90

    r12489 r12939  
    151151         ENDIF    
    152152         !                                         ! Update fwfold if new year start 
    153          ikty = 365 * 86400 / rn_Dt               !!bug  use of 365 days leap year or 360d year !!!!!!! 
     153         ikty = 365 * 86400 / rn_Dt                  !!bug  use of 365 days leap year or 360d year !!!!!!! 
    154154         IF( MOD( kt, ikty ) == 0 ) THEN 
    155155            a_fwb_b = a_fwb                           ! mean sea level taking into account the ice+snow 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP+/MY_SRC/tradmp.F90

    r12738 r12939  
    5151   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   resto    !: restoring coeff. on T and S (s-1) 
    5252 
     53   !! * Substitutions 
     54#  include "do_loop_substitute.h90" 
    5355   !!---------------------------------------------------------------------- 
    5456   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    110112      CASE( 0 )                        !*  newtonian damping throughout the water column  *! 
    111113         DO jn = 1, jpts 
    112             DO jk = 1, jpkm1 
    113                DO jj = 2, jpjm1 
    114                   DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    115                      pts(ji,jj,jk,jn,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jn,Krhs)           & 
    116                         &                  + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jn) - pts(ji,jj,jk,jn,Kbb) ) 
    117                   END DO 
    118                END DO 
    119             END DO 
     114            DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     115               pts(ji,jj,jk,jn,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jn,Krhs)           & 
     116                  &                  + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jn) - pts(ji,jj,jk,jn,Kbb) ) 
     117            END_3D 
    120118         END DO 
    121119         ! 
    122120      CASE ( 1 )                       !*  no damping in the turbocline (avt > 5 cm2/s)  *! 
    123          DO jk = 1, jpkm1 
    124             DO jj = 2, jpjm1 
    125                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    126                   IF( avt(ji,jj,jk) <= avt_c ) THEN 
    127                      pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs)   & 
    128                         &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem,Kbb) ) 
    129                      pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs)   & 
    130                         &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal,Kbb) ) 
    131                   ENDIF 
    132                END DO 
    133             END DO 
    134          END DO 
     121         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     122            IF( avt(ji,jj,jk) <= avt_c ) THEN 
     123               pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs)   & 
     124                  &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem,Kbb) ) 
     125               pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs)   & 
     126                  &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal,Kbb) ) 
     127            ENDIF 
     128         END_3D 
    135129         ! 
    136130      CASE ( 2 )                       !*  no damping in the mixed layer   *! 
    137          DO jk = 1, jpkm1 
    138             DO jj = 2, jpjm1 
    139                DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt. 
    140                   IF( gdept(ji,jj,jk,Kmm) >= hmlp (ji,jj) ) THEN 
    141                      pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs)   & 
    142                         &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem,Kbb) ) 
    143                      pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs)   & 
    144                         &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal,Kbb) ) 
    145                   ENDIF 
    146                END DO 
    147             END DO 
    148          END DO 
     131         DO_3D_00_00( 1, jpkm1 ) 
     132            IF( gdept(ji,jj,jk,Kmm) >= hmlp (ji,jj) ) THEN 
     133               pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs)   & 
     134                  &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_tem) - pts(ji,jj,jk,jp_tem,Kbb) ) 
     135               pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs)   & 
     136                  &                      + resto(ji,jj,jk) * ( zts_dta(ji,jj,jk,jp_sal) - pts(ji,jj,jk,jp_sal,Kbb) ) 
     137            ENDIF 
     138         END_3D 
    149139         ! 
    150140      END SELECT 
     
    157147      ENDIF 
    158148      !                           ! Control print 
    159       IF(ln_ctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Krhs), clinfo1=' dmp  - Ta: ', mask1=tmask,   & 
    160          &                       tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Krhs), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' ) 
     149      IF(sn_cfctl%l_prtctl)   CALL prt_ctl( tab3d_1=pts(:,:,:,jp_tem,Krhs), clinfo1=' dmp  - Ta: ', mask1=tmask,   & 
     150         &                                  tab3d_2=pts(:,:,:,jp_sal,Krhs), clinfo2=       ' Sa: ', mask2=tmask, clinfo3='tra' ) 
    161151      ! 
    162152      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('tra_dmp') 
     
    178168      !!---------------------------------------------------------------------- 
    179169      ! 
    180       REWIND( numnam_ref )   ! Namelist namtra_dmp in reference namelist : T & S relaxation 
    181170      READ  ( numnam_ref, namtra_dmp, IOSTAT = ios, ERR = 901) 
    182171901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtra_dmp in reference namelist' ) 
    183172      ! 
    184       REWIND( numnam_cfg )   ! Namelist namtra_dmp in configuration namelist : T & S relaxation 
    185173      READ  ( numnam_cfg, namtra_dmp, IOSTAT = ios, ERR = 902 ) 
    186174902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtra_dmp in configuration namelist' ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10074 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr    : initialize the horizontal mesh for ISOMIP configuration 
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  ,  ONLY: nimpp, njmpp       ! ocean space and time domain 
     16   USE dom_oce 
    1717   USE par_oce         ! ocean space and time domain 
    1818   USE phycst          ! physical constants 
     
    2727   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2828 
     29   !! * Substitutions 
     30#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2931   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3032   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    7577      ! 
    7678      !                       !==  grid point position  ==!   (in degrees) 
    77       DO jj = 1, jpj 
    78          DO ji = 1, jpi             ! longitude   (west coast at lon=0°) 
    79             plamt(ji,jj) = rn_e1deg * (  - 0.5 + REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  )   
    80             plamu(ji,jj) = rn_e1deg * (          REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  ) 
    81             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
    82             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
    83             !                       ! latitude   (south coast at lat= 81°) 
    84             pphit(ji,jj) = rn_e2deg * (  - 0.5 + REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) - 80._wp 
    85             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
    86             pphiv(ji,jj) = rn_e2deg * (          REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) - 80_wp 
    87             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
    88          END DO 
    89       END DO 
     79      DO_2D_11_11 
     80         !                       ! longitude   (west coast at lon=0°) 
     81         plamt(ji,jj) = rn_e1deg * (  - 0.5 + REAL( mig0(ji)-1 , wp )  )   
     82         plamu(ji,jj) = rn_e1deg * (          REAL( mig0(ji)-1 , wp )  ) 
     83         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
     84         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
     85         !                       ! latitude   (south coast at lat= 81°) 
     86         pphit(ji,jj) = rn_e2deg * (  - 0.5 + REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) - 80._wp 
     87         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
     88         pphiv(ji,jj) = rn_e2deg * (          REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) - 80_wp 
     89         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
     90      END_2D 
    9091      ! 
    9192      !                       !==  Horizontal scale factors  ==!   (in meters) 
    92       DO jj = 1, jpj 
    93          DO ji = 1, jpi 
    94             !                       ! e1   (zonal) 
    95             pe1t(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphit(ji,jj) ) * rn_e1deg 
    96             pe1u(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphiu(ji,jj) ) * rn_e1deg 
    97             pe1v(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphiv(ji,jj) ) * rn_e1deg 
    98             pe1f(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphif(ji,jj) ) * rn_e1deg 
    99             !                       ! e2   (meridional) 
    100             pe2t(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
    101             pe2u(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
    102             pe2v(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
    103             pe2f(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
    104          END DO 
    105       END DO 
     93      DO_2D_11_11 
     94         !                       ! e1   (zonal) 
     95         pe1t(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphit(ji,jj) ) * rn_e1deg 
     96         pe1u(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphiu(ji,jj) ) * rn_e1deg 
     97         pe1v(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphiv(ji,jj) ) * rn_e1deg 
     98         pe1f(ji,jj) = ra * rad * COS( rad * pphif(ji,jj) ) * rn_e1deg 
     99         !                       ! e2   (meridional) 
     100         pe2t(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
     101         pe2u(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
     102         pe2v(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
     103         pe2f(ji,jj) = ra * rad * rn_e2deg 
     104      END_2D 
    106105      !                             ! NO reduction of grid size in some straits  
    107106      ke1e2u_v    = 0               !    ==>> u_ & v_surfaces will be computed in dom_ghr routine 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1515   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1616   !!---------------------------------------------------------------------- 
    17    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
    1817   USE dom_oce  , ONLY: ln_zco, ln_zps, ln_sco   ! flag of type of coordinate 
    1918   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/ISOMIP/MY_SRC/usrdef_zgr.F90

    r12377 r12939  
    1616   !!--------------------------------------------------------------------- 
    1717   USE oce            ! ocean variables 
    18    USE dom_oce ,  ONLY: mj0   , mj1   , nimpp , njmpp  ! ocean space and time domain 
    19    USE dom_oce ,  ONLY: glamt , gphit                   ! ocean space and time domain 
     18   USE dom_oce ,  ONLY: mj0   , mj1    ! ocean space and time domain 
     19   USE dom_oce ,  ONLY: glamt , gphit  ! ocean space and time domain 
    2020   USE usrdef_nam     ! User defined : namelist variables 
    2121   ! 
     
    3030   PUBLIC   usr_def_zgr   ! called by domzgr.F90 
    3131 
     32   !! * Substitutions 
     33#  include "do_loop_substitute.h90" 
    3234   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3335   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    132134            pe3vw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk) 
    133135         END DO 
    134          DO jj = 1, jpj                      ! top scale factors and depth at T- and W-points 
    135             DO ji = 1, jpi 
    136                ik = k_top(ji,jj) 
    137                IF ( ik > 2 ) THEN 
    138                   ! pdeptw at the interface 
    139                   pdepw(ji,jj,ik  ) = MAX( zhisf(ji,jj) , pdepw(ji,jj,ik) ) 
    140                   ! e3t in both side of the interface 
    141                   pe3t (ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik+1) - pdepw(ji,jj,ik) 
    142                   ! pdept in both side of the interface (from previous e3t) 
    143                   pdept(ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik  ) + pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp 
    144                   pdept(ji,jj,ik-1) = pdepw(ji,jj,ik  ) - pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp 
    145                   ! pe3w on both side of the interface 
    146                   pe3w (ji,jj,ik+1) = pdept(ji,jj,ik+1) - pdept(ji,jj,ik  ) 
    147                   pe3w (ji,jj,ik  ) = pdept(ji,jj,ik  ) - pdept(ji,jj,ik-1) 
    148                   ! e3t into the ice shelf 
    149                   pe3t (ji,jj,ik-1) = pdepw(ji,jj,ik  ) - pdepw(ji,jj,ik-1) 
    150                   pe3w (ji,jj,ik-1) = pdept(ji,jj,ik-1) - pdept(ji,jj,ik-2) 
    151                END IF 
    152             END DO 
    153          END DO          
    154          DO jj = 1, jpj                      ! bottom scale factors and depth at T- and W-points 
    155             DO ji = 1, jpi 
    156                ik = k_bot(ji,jj) 
    157                pdepw(ji,jj,ik+1) = MIN( zht(ji,jj) , pdepw_1d(ik+1) ) 
     136         ! top scale factors and depth at T- and W-points 
     137         DO_2D_11_11 
     138            ik = k_top(ji,jj) 
     139            IF ( ik > 2 ) THEN 
     140               ! pdeptw at the interface 
     141               pdepw(ji,jj,ik  ) = MAX( zhisf(ji,jj) , pdepw(ji,jj,ik) ) 
     142               ! e3t in both side of the interface 
    158143               pe3t (ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik+1) - pdepw(ji,jj,ik) 
    159                pe3t (ji,jj,ik+1) = pe3t (ji,jj,ik  )  
    160                ! 
     144               ! pdept in both side of the interface (from previous e3t) 
    161145               pdept(ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik  ) + pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp 
    162                pdept(ji,jj,ik+1) = pdepw(ji,jj,ik+1) + pe3t (ji,jj,ik+1) * 0.5_wp 
    163                pe3w (ji,jj,ik+1) = pdept(ji,jj,ik+1) - pdept(ji,jj,ik) 
    164             END DO 
    165          END DO          
     146               pdept(ji,jj,ik-1) = pdepw(ji,jj,ik  ) - pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp 
     147               ! pe3w on both side of the interface 
     148               pe3w (ji,jj,ik+1) = pdept(ji,jj,ik+1) - pdept(ji,jj,ik  ) 
     149               pe3w (ji,jj,ik  ) = pdept(ji,jj,ik  ) - pdept(ji,jj,ik-1) 
     150               ! e3t into the ice shelf 
     151               pe3t (ji,jj,ik-1) = pdepw(ji,jj,ik  ) - pdepw(ji,jj,ik-1) 
     152               pe3w (ji,jj,ik-1) = pdept(ji,jj,ik-1) - pdept(ji,jj,ik-2) 
     153            END IF 
     154         END_2D 
     155         ! bottom scale factors and depth at T- and W-points 
     156         DO_2D_11_11 
     157            ik = k_bot(ji,jj) 
     158            pdepw(ji,jj,ik+1) = MIN( zht(ji,jj) , pdepw_1d(ik+1) ) 
     159            pe3t (ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik+1) - pdepw(ji,jj,ik) 
     160            pe3t (ji,jj,ik+1) = pe3t (ji,jj,ik  )  
     161            ! 
     162            pdept(ji,jj,ik  ) = pdepw(ji,jj,ik  ) + pe3t (ji,jj,ik  ) * 0.5_wp 
     163            pdept(ji,jj,ik+1) = pdepw(ji,jj,ik+1) + pe3t (ji,jj,ik+1) * 0.5_wp 
     164            pe3w (ji,jj,ik+1) = pdept(ji,jj,ik+1) - pdept(ji,jj,ik) 
     165         END_2D        
    166166         !                                   ! bottom scale factors and depth at  U-, V-, UW and VW-points 
    167167         pe3u (:,:,:) = pe3t(:,:,:) 
    168168         pe3uw(:,:,:) = pe3w(:,:,:) 
    169          DO jk = 1, jpk                      ! Computed as the minimum of neighbooring scale factors 
    170             DO jj = 1, jpjm1 
    171                DO ji = 1, jpi 
    172                   pe3v (ji,jj,jk) = MIN( pe3t(ji,jj,jk), pe3t(ji,jj+1,jk) ) 
    173                   pe3vw(ji,jj,jk) = MIN( pe3w(ji,jj,jk), pe3w(ji,jj+1,jk) ) 
    174                   pe3f (ji,jj,jk) = pe3v(ji,jj,jk) 
    175                END DO 
    176             END DO 
    177          END DO 
     169         DO_3D_00_00( 1, jpk ) 
     170         !                                   ! Computed as the minimum of neighbooring scale factors 
     171            pe3v (ji,jj,jk) = MIN( pe3t(ji,jj,jk), pe3t(ji,jj+1,jk) ) 
     172            pe3vw(ji,jj,jk) = MIN( pe3w(ji,jj,jk), pe3w(ji,jj+1,jk) ) 
     173            pe3f (ji,jj,jk) = pe3v(ji,jj,jk) 
     174         END_3D 
    178175         CALL lbc_lnk( 'usrdef_zgr', pe3v , 'V', 1._wp )   ;   CALL lbc_lnk( 'usrdef_zgr', pe3vw, 'V', 1._wp ) 
    179176         CALL lbc_lnk( 'usrdef_zgr', pe3f , 'F', 1._wp ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/LOCK_EXCHANGE/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10074 r12939  
    1313   !!   usr_def_hgr    : initialize the horizontal mesh for LOCK_EXCHANGE configuration 
    1414   !!---------------------------------------------------------------------- 
    15    USE dom_oce  ,  ONLY: nimpp, njmpp       ! ocean space and time domain 
     15   USE dom_oce 
    1616   USE par_oce         ! ocean space and time domain 
    1717   USE phycst          ! physical constants 
     
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    7274      !                       !==  grid point position  ==!   (in kilometers) 
    7375      zfact = rn_dx * 1.e-3         ! conversion in km 
    74       DO jj = 1, jpj 
    75          DO ji = 1, jpi             ! longitude 
    76             plamt(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  )   
    77             plamu(ji,jj) = zfact * (          REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  ) 
    78             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
    79             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
    80             !                       ! latitude 
    81             pphit(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) 
    82             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
    83             pphiv(ji,jj) = zfact * (          REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) 
    84             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
    85          END DO 
    86       END DO 
     76      DO_2D_11_11 
     77         !                       ! longitude 
     78         plamt(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( mig0(ji)-1 , wp )  )   
     79         plamu(ji,jj) = zfact * (          REAL( mig0(ji)-1 , wp )  ) 
     80         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
     81         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
     82         !                       ! latitude 
     83         pphit(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) 
     84         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
     85         pphiv(ji,jj) = zfact * (          REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) 
     86         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
     87      END_2D 
    8788      ! 
    8889      !                       !==  Horizontal scale factors  ==!   (in meters)  
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/LOCK_EXCHANGE/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
    1716   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
    1817   USE phycst         ! physical constants 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/OVERFLOW/MY_SRC/usrdef_hgr.F90

    r10074 r12939  
    1313   !!   usr_def_hgr    : initialize the horizontal mesh for OVERFLOW configuration 
    1414   !!---------------------------------------------------------------------- 
    15    USE dom_oce  ,  ONLY: nimpp, njmpp       ! ocean space and time domain 
     15   USE dom_oce 
    1616   USE par_oce         ! ocean space and time domain 
    1717   USE phycst          ! physical constants 
     
    2626   PUBLIC   usr_def_hgr   ! called by domhgr.F90 
    2727 
     28   !! * Substitutions 
     29#  include "do_loop_substitute.h90" 
    2830   !!---------------------------------------------------------------------- 
    2931   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    7274      !                       !==  grid point position  ==!   (in kilometers) 
    7375      zfact = rn_dx * 1.e-3         ! conversion in km 
    74       DO jj = 1, jpj 
    75          DO ji = 1, jpi             ! longitude 
    76             plamt(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  )   
    77             plamu(ji,jj) = zfact * (          REAL( ji-1 + nimpp-1 , wp )  ) 
    78             plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
    79             plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
    80             !                       ! latitude 
    81             pphit(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) 
    82             pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
    83             pphiv(ji,jj) = zfact * (          REAL( jj-1 + njmpp-1 , wp )  ) 
    84             pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
    85          END DO 
    86       END DO 
     76      DO_2D_11_11 
     77         !                       ! longitude 
     78         plamt(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( mig0(ji)-1 , wp )  )   
     79         plamu(ji,jj) = zfact * (          REAL( mig0(ji)-1 , wp )  ) 
     80         plamv(ji,jj) = plamt(ji,jj) 
     81         plamf(ji,jj) = plamu(ji,jj) 
     82         !                       ! latitude 
     83         pphit(ji,jj) = zfact * (  - 0.5 + REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) 
     84         pphiu(ji,jj) = pphit(ji,jj) 
     85         pphiv(ji,jj) = zfact * (          REAL( mjg0(jj)-1 , wp )  ) 
     86         pphif(ji,jj) = pphiv(ji,jj) 
     87      END_2D 
    8788      ! 
    8889      !                       !==  Horizontal scale factors  ==!   (in meters)  
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/OVERFLOW/MY_SRC/usrdef_nam.F90

    r12377 r12939  
    1414   !!   usr_def_hgr   : initialize the horizontal mesh  
    1515   !!---------------------------------------------------------------------- 
    16    USE dom_oce  , ONLY: nimpp , njmpp            ! i- & j-indices of the local domain 
    1716   USE dom_oce  , ONLY: ln_zco, ln_zps, ln_sco   ! flag of type of coordinate 
    1817   USE par_oce        ! ocean space and time domain 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12558_HPC-08_epico_Extra_Halo/tests/OVERFLOW/MY_SRC/usrdef_zgr.F90

    r12377 r12939  
    1515   !!--------------------------------------------------------------------- 
    1616   USE oce            ! ocean variables 
    17    USE dom_oce ,  ONLY: mi0, mi1, nimpp, njmpp   ! ocean space and time domain 
    18    USE dom_oce ,  ONLY: glamt                    ! ocean space and time domain 
     17   USE dom_oce ,  ONLY: mi0, mi1   ! ocean space and time domain 
     18   USE dom_oce ,  ONLY: glamt      ! ocean space and time domain 
    1919   USE usrdef_nam     ! User defined : namelist variables 
    2020   ! 
     
    2929   PUBLIC   usr_def_zgr   ! called by domzgr.F90 
    3030 
     31   !! * Substitutions 
     32#  include "do_loop_substitute.h90" 
    3133   !!---------------------------------------------------------------------- 
    3234   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018) 
     
    182184            pe3vw(:,:,jk) = pe3w_1d (jk) 
    183185         END DO 
    184          DO jj = 1, jpj                      ! bottom scale factors and depth at T- and W-points 
    185             DO ji = 1, jpi 
    186                ik = k_bot(ji,jj) 
    187</