New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
Changeset 14002 – NEMO

Changeset 14002


Ignore:
Timestamp:
2020-12-02T15:08:53+01:00 (3 years ago)
Author:
emanuelaclementi
Message:

phasing with trunk rev14001 - ticket #2152 #2339

Location:
NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves
Files:
121 edited
8 copied

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves

    • Property svn:externals
      •  

        old new  
        88 
        99# SETTE 
        10 ^/utils/CI/sette@13559        sette 
         10^/utils/CI/sette_MPI3_LoopFusion@13943         sette 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/cfgs/SHARED/field_def_nemo-ice.xml

    r13710 r14002  
    7777          <field id="sig1_pnorm"   long_name="P-normalized 1st principal stress component"                                                                       unit=""     /> 
    7878          <field id="sig2_pnorm"   long_name="P-normalized 2nd principal stress component"                                                                       unit=""     /> 
     79          <field id="icedlt"       long_name="delta"                                                   standard_name="delta"                                     unit=""     /> 
    7980          <field id="normstr"      long_name="Average normal stress in sea ice"                        standard_name="average_normal_stress"                     unit="N/m"  /> 
    8081          <field id="sheastr"      long_name="Maximum shear stress in sea ice"                         standard_name="maximum_shear_stress"                      unit="N/m"  /> 
     
    8283          <field id="icediv"       long_name="Divergence of the sea-ice velocity field"                standard_name="divergence_of_sea_ice_velocity"            unit="s-1"  /> 
    8384          <field id="iceshe"       long_name="Maximum shear of sea-ice velocity field"                 standard_name="maximum_shear_of_sea_ice_velocity"         unit="s-1"  /> 
     85          <field id="aniso"        long_name="anisotropy of sea ice floe orientation (0.5 - 1)"        standard_name="anisotropy"                                unit=""     /> 
     86          <field id="yield11"      long_name="yield surface tensor component 11"                       standard_name="yield11"                                   unit="N/m"  /> 
     87          <field id="yield22"      long_name="yield surface tensor component 22"                       standard_name="yield22"                                   unit="N/m"  /> 
     88          <field id="yield12"      long_name="yield surface tensor component 12"                       standard_name="yield12"                                   unit="N/m"  /> 
    8489          <field id="beta_evp"     long_name="Relaxation parameter of ice rheology (beta)"             standard_name="relaxation_parameter_of_ice_rheology"      unit=""  />    
    8590  
     
    405410     <field field_ref="sig1_pnorm"       name="sig1_pnorm"/> 
    406411     <field field_ref="sig2_pnorm"       name="sig2_pnorm"/> 
     412     <field field_ref="icedlt"           name="sidelta" /> 
    407413      
    408414     <!-- heat fluxes --> 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/cfgs/SHARED/namelist_ice_ref

    r13710 r14002  
    9292!------------------------------------------------------------------------------ 
    9393   ln_rhg_EVP       = .true.          !  EVP rheology 
     94   ln_rhg_EAP       = .false.         !  EAP rheology 
    9495      ln_aEVP       = .true.          !     adaptive rheology (Kimmritz et al. 2016 & 2017) 
    9596      rn_creepl     =   2.0e-9        !     creep limit [1/s] 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/cfgs/SHARED/namelist_ref

    r13852 r14002  
    9494   ln_use_jattr = .false.    !  use (T) the file attribute: open_ocean_jstart, if present 
    9595   !                         !  in netcdf input files, as the start j-row for reading 
     96/ 
     97!----------------------------------------------------------------------- 
     98&namtile        !   parameters of the tiling 
     99!----------------------------------------------------------------------- 
     100   ln_tile = .false.     !  Use tiling (T) or not (F) 
     101   nn_ltile_i = 10       !  Length of tiles in i 
     102   nn_ltile_j = 10       !  Length of tiles in j 
    96103/ 
    97104!----------------------------------------------------------------------- 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/latex/NEMO/main/bibliography.bib

    r12377 r14002  
    19061906} 
    19071907 
     1908@Article{        love_PRSLA1909, 
     1909  author       = "A. E. H. Love", 
     1910  title        = "The Yielding of the Earth to Disturbing Forces", 
     1911  journal      = "Proc. R. Soc. Lond. A", 
     1912  year         = "1909", 
     1913  volume       = "82", 
     1914  pages        = "73-88", 
     1915  doi          = "10.1098/rspa.1909.0008" 
     1916} 
     1917 
    19081918@article{         losch_JGR08, 
    19091919  title         = "Modeling ice shelf cavities in a z coordinate Ocean 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/latex/NEMO/subfiles/chap_DIA.tex

    r12377 r14002  
    119119\subsection{XIOS: Reading and writing restart file} 
    120120 
    121 XIOS may be used to read single file restart produced by \NEMO. Currently only the variables written to 
    122 file \forcode{numror} can be handled by XIOS. To activate restart reading using XIOS, set \np[=.true. ]{ln_xios_read}{ln\_xios\_read} 
     121XIOS may be used to read single file restart produced by \NEMO. The variables written to 
     122file \forcode{numror} (OCE), \forcode{numrir} (SI3), \forcode{numrtr} (TOP), \forcode{numrsr} (SED) can be handled by XIOS.  
     123To activate restart reading using XIOS, set \np[=.true. ]{ln_xios_read}{ln\_xios\_read} 
    123124in \textit{namelist\_cfg}. This setting will be ignored when multiple restart files are present, and default \NEMO 
    124125functionality will be used for reading. There is no need to change iodef.xml file to use XIOS to read 
     
    142143have to be rebuild before continuing the run. This option aims to reduce number of restart files generated by \NEMO\ only, 
    143144and may be useful when there is a need to change number of processors used to run simulation. 
    144  
    145 If an additional variable must be written to a restart file, the following steps are needed: 
    146 \begin{enumerate} 
    147 \item Add variable name to a list of restart variables (in subroutine \rou{iom\_set\_rst\_vars,} \mdl{iom}) and 
    148 define correct grid for the variable (\forcode{grid_N_3D} - 3D variable, \forcode{grid_N} - 2D variable, \forcode{grid_vector} - 
    149 1D variable, \forcode{grid_scalar} - scalar), 
    150 \item Add variable to the list of fields written by restart.  This can be done either in subroutine 
    151 \rou{iom\_set\_rstw\_core} (\mdl{iom}) or by calling  \rou{iom\_set\_rstw\_active} (\mdl{iom}) with the name of a variable 
    152 as an argument. This convention follows approach for writing restart using iom, where variables are 
    153 written either by \rou{rst\_write} or by calling \rou{iom\_rstput} from individual routines. 
    154 \end{enumerate} 
    155145 
    156146An older versions of XIOS do not support reading functionality. It's recommended to use at least XIOS2@1451. 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/latex/NEMO/subfiles/chap_DYN.tex

    r11693 r14002  
    12451245the atmospheric pressure is taken into account when computing the surface pressure gradient. 
    12461246 
    1247 (2) When \np[=.true.]{ln_tide_pot}{ln\_tide\_pot} and \np[=.true.]{ln_tide}{ln\_tide} (see \autoref{sec:SBC_tide}), 
     1247(2) When \np[=.true.]{ln_tide_pot}{ln\_tide\_pot} and \np[=.true.]{ln_tide}{ln\_tide} (see \autoref{sec:SBC_TDE}), 
    12481248the tidal potential is taken into account when computing the surface pressure gradient. 
    12491249 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/latex/NEMO/subfiles/chap_LBC.tex

    r11693 r14002  
    1616    Release & Author(s) & Modifications \\ 
    1717    \hline 
     18    {\em  next} & {\em Simon M{\" u}ller} & {\em Minor update of \autoref{subsec:LBC_bdy_tides}} \\[2mm] 
    1819    {\em   4.0} & {\em ...} & {\em ...} \\ 
    1920    {\em   3.6} & {\em ...} & {\em ...} \\ 
     
    665666 
    666667Tidal forcing at open boundaries requires the activation of surface 
    667 tides (i.e., in \nam{_tide}{\_tide}, \np{ln_tide}{ln\_tide} needs to be set to 
    668 \forcode{.true.} and the required constituents need to be activated by 
    669 including their names in the \np{clname}{clname} array; see 
    670 \autoref{sec:SBC_tide}). Specific options related to the reading in of 
     668tides (i.e., in \nam{_tide}{\_tide}, \np[=.true.]{ln_tide}{ln\_tide} with the active tidal 
     669constituents listed in the \np{sn_tide_cnames}{sn\_tide\_cnames} array; see 
     670\autoref{sec:SBC_TDE}). The specific options related to the reading in of 
    671671the complex harmonic amplitudes of elevation (SSH) and barotropic 
    672 velocity (u,v) at open boundaries are defined through the 
    673 \nam{bdy_tide}{bdy\_tide} namelist parameters.\\ 
     672velocity components (u,v) at the open boundaries are defined through the 
     673\nam{bdy_tide}{bdy\_tide} namelist parameters.\par 
    674674 
    675675The tidal harmonic data at open boundaries can be specified in two 
    676676different ways, either on a two-dimensional grid covering the entire 
    677677model domain or along open boundary segments; these two variants can 
    678 be selected by setting \np{ln_bdytide_2ddta }{ln\_bdytide\_2ddta } to \forcode{.true.} or 
    679 \forcode{.false.}, respectively. In either case, the real and 
    680 imaginary parts of SSH and the two barotropic velocity components for 
    681 each activated tidal constituent \textit{tcname} have to be provided 
    682 separately: when two-dimensional data is used, variables 
    683 \textit{tcname\_z1} and \textit{tcname\_z2} for real and imaginary SSH, 
    684 respectively, are expected in input file \np{filtide}{filtide} with suffix 
    685 \ifile{\_grid\_T}, variables \textit{tcname\_u1} and 
    686 \textit{tcname\_u2} for real and imaginary u, respectively, are 
    687 expected in input file \np{filtide}{filtide} with suffix \ifile{\_grid\_U}, and 
    688 \textit{tcname\_v1} and \textit{tcname\_v2} for real and imaginary v, 
    689 respectively, are expected in input file \np{filtide}{filtide} with suffix 
    690 \ifile{\_grid\_V}; when data along open boundary segments is used, 
    691 variables \textit{z1} and \textit{z2} (real and imaginary part of SSH) 
    692 are expected to be available from file \np{filtide}{filtide} with suffix 
    693 \ifile{tcname\_grid\_T}, variables \textit{u1} and \textit{u2} (real 
    694 and imaginary part of u) are expected to be available from file 
    695 \np{filtide}{filtide} with suffix \ifile{tcname\_grid\_U}, and variables 
    696 \textit{v1} and \textit{v2} (real and imaginary part of v) are 
    697 expected to be available from file \np{filtide}{filtide} with suffix 
    698 \ifile{tcname\_grid\_V}. If \np{ln_bdytide_conj}{ln\_bdytide\_conj} is set to 
    699 \forcode{.true.}, the data is expected to be in complex conjugate 
    700 form. 
     678be selected by setting \np[=.true.]{ln_bdytide_2ddta}{ln\_bdytide\_2ddta} or 
     679\np[=.false.]{ln_bdytide_2ddta}{ln\_bdytide\_2ddta}, respectively. In either 
     680case, the real and imaginary parts of SSH, u, and v amplitudes associated with 
     681each activated tidal constituent \texttt{<constituent>} have to be provided 
     682separately as fields in input files with names based on 
     683\np[=<input>]{filtide}{filtide}: when two-dimensional data is used, variables 
     684\texttt{<constituent>\_z1} and \texttt{<constituent>\_z2} for the real and imaginary parts of 
     685SSH, respectively, are expected to be available in file 
     686\ifile{<input>\_grid\_T}, variables \texttt{<constituent>\_u1} and 
     687\texttt{<constituent>\_u2} for the real and imaginary parts of u, respectively, in file 
     688\ifile{<input>\_grid\_U}, and \texttt{<constituent>\_v1} and 
     689\texttt{<constituent>\_v2} for the real and imaginary parts of v, respectively, in file 
     690\ifile{<input>\_grid\_V}; when data along open boundary segments is used, 
     691variables \texttt{z1} and \texttt{z2} (real and imaginary part of SSH) are 
     692expected to be available in file \ifile{<input><constituent>\_grid\_T}, 
     693variables \texttt{u1} and \texttt{u2} (real and imaginary part of u) in file 
     694\ifile{<input><constituent>\_grid\_U}, and variables \texttt{v1} and \texttt{v2} 
     695(real and imaginary part of v) in file 
     696\ifile{<input><constituent>\_grid\_V}.\par 
    701697 
    702698Note that the barotropic velocity components are assumed to be defined 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/latex/NEMO/subfiles/chap_SBC.tex

    r13710 r14002  
    55\begin{document} 
    66 
    7 \chapter{Surface Boundary Condition (SBC, SAS, ISF, ICB)} 
     7\chapter{Surface Boundary Condition (SBC, SAS, ISF, ICB, TDE)} 
    88\label{chap:SBC} 
    99 
     
    1818    Release & Author(s) & Modifications \\ 
    1919    \hline 
     20    {\em  next} & {\em Simon M{\" u}ller} & {\em Update of \autoref{sec:SBC_TDE}}\\[2mm] 
    2021    {\em   4.0} & {\em ...} & {\em ...} \\ 
    2122    {\em   3.6} & {\em ...} & {\em ...} \\ 
     
    10131014 
    10141015%% ================================================================================================= 
    1015 \section[Surface tides (\textit{sbctide.F90})]{Surface tides (\protect\mdl{sbctide})} 
    1016 \label{sec:SBC_tide} 
     1016\section{Surface tides (TDE)} 
     1017\label{sec:SBC_TDE} 
    10171018 
    10181019\begin{listing} 
     
    10221023\end{listing} 
    10231024 
    1024 The tidal forcing, generated by the gravity forces of the Earth-Moon and Earth-Sun sytems, 
    1025 is activated if \np{ln_tide}{ln\_tide} and \np{ln_tide_pot}{ln\_tide\_pot} are both set to \forcode{.true.} in \nam{_tide}{\_tide}. 
    1026 This translates as an additional barotropic force in the momentum \autoref{eq:MB_PE_dyn} such that: 
     1025\subsection{Tidal constituents} 
     1026Ocean model component TDE provides the common functionality for tidal forcing 
     1027and tidal analysis in the model framework. This includes the computation of the gravitational 
     1028surface forcing, as well as support for lateral forcing at open boundaries (see 
     1029\autoref{subsec:LBC_bdy_tides}) and tidal harmonic analysis (see 
     1030\autoref{subsec:DIA_diamlr} and \autoref{subsec:DIA_diadetide}). The module is 
     1031activated with \np[=.true.]{ln_tide}{ln\_tide} in namelist 
     1032\nam{_tide}{\_tide}. It provides the same 34 tidal constituents that are 
     1033included in the 
     1034\href{https://www.aviso.altimetry.fr/en/data/products/auxiliary-products/global-tide-fes.html}{FES2014 
     1035  ocean tide model}: Mf, Mm, Ssa, Mtm, Msf, Msqm, Sa, K1, O1, P1, Q1, J1, S1, 
     1036M2, S2, N2, K2, nu2, mu2, 2N2, L2, T2, eps2, lam2, R2, M3, MKS2, MN4, MS4, M4, 
     1037N4, S4, M6, and M8; see file \hf{tide} and \mdl{tide\_mod} for further 
     1038information and references\footnote{As a legacy option \np{ln_tide_var} can be 
     1039  set to \forcode{0}, in which case the 19 tidal constituents (M2, N2, 2N2, S2, 
     1040  K2, K1, O1, Q1, P1, M4, Mf, Mm, Msqm, Mtm, S1, MU2, NU2, L2, and T2; see file 
     1041  \hf{tide}) and associated parameters that have been available in NEMO version 
     1042  4.0 and earlier are available}. Constituents to be included in the tidal forcing 
     1043(surface and lateral boundaries) are selected by enumerating their respective 
     1044names in namelist array \np{sn_tide_cnames}{sn\_tide\_cnames}.\par 
     1045 
     1046\subsection{Surface tidal forcing} 
     1047Surface tidal forcing can be represented in the model through an additional 
     1048barotropic force in the momentum equation (\autoref{eq:MB_PE_dyn}) such that: 
    10271049\[ 
    1028   % \label{eq:SBC_PE_dyn_tides} 
    1029   \frac{\partial {\mathrm {\mathbf U}}_h }{\partial t}= ... 
    1030   +g\nabla (\Pi_{eq} + \Pi_{sal}) 
     1050  \frac{\partial {\mathrm {\mathbf U}}_h }{\partial t} = \ldots +g\nabla (\gamma 
     1051  \Pi_{eq} + \Pi_{sal}) 
    10311052\] 
    1032 where $\Pi_{eq}$ stands for the equilibrium tidal forcing and 
    1033 $\Pi_{sal}$ is a self-attraction and loading term (SAL). 
    1034  
    1035 The equilibrium tidal forcing is expressed as a sum over a subset of 
    1036 constituents chosen from the set of available tidal constituents 
    1037 defined in file \hf{SBC/tide} (this comprises the tidal 
    1038 constituents \textit{M2, N2, 2N2, S2, K2, K1, O1, Q1, P1, M4, Mf, Mm, 
    1039   Msqm, Mtm, S1, MU2, NU2, L2}, and \textit{T2}). Individual 
    1040 constituents are selected by including their names in the array 
    1041 \np{clname}{clname} in \nam{_tide}{\_tide} (e.g., \np{clname}{clname}\forcode{(1)='M2', } 
    1042 \np{clname}{clname}\forcode{(2)='S2'} to select solely the tidal consituents \textit{M2} 
    1043 and \textit{S2}). Optionally, when \np{ln_tide_ramp}{ln\_tide\_ramp} is set to 
    1044 \forcode{.true.}, the equilibrium tidal forcing can be ramped up 
    1045 linearly from zero during the initial \np{rdttideramp}{rdttideramp} days of the 
    1046 model run. 
     1053where $\gamma \Pi_{eq}$ stands for the equilibrium tidal forcing scaled by a spatially 
     1054uniform tilt factor $\gamma$, and $\Pi_{sal}$ is an optional 
     1055self-attraction and loading term (SAL). These additional terms are enabled when, 
     1056in addition to \np[=.true.]{ln_tide}{ln\_tide}), 
     1057\np[=.true.]{ln_tide_pot}{ln\_tide\_pot}.\par 
     1058 
     1059The equilibrium tidal forcing is expressed as a sum over the subset of 
     1060constituents listed in \np{sn_tide_cnames}{sn\_tide\_cnames} of 
     1061\nam{_tide} (e.g., 
     1062\begin{forlines} 
     1063      sn_tide_cnames(1) = 'M2' 
     1064      sn_tide_cnames(2) = 'K1' 
     1065      sn_tide_cnames(3) = 'S2' 
     1066      sn_tide_cnames(4) = 'O1' 
     1067\end{forlines} 
     1068to select the four tidal constituents of strongest equilibrium tidal 
     1069potential). The tidal tilt factor $\gamma = 1 + k - h$ includes the 
     1070Love numbers $k$ and $h$ \citep{love_prsla1909}; this factor is 
     1071configurable using \np{rn_tide_gamma} (default value 0.7). Optionally, 
     1072when \np[=.true.]{ln_tide_ramp}{ln\_tide\_ramp}, the equilibrium tidal 
     1073forcing can be ramped up linearly from zero during the initial 
     1074\np{rn_tide_ramp_dt}{rn\_tide\_ramp\_dt} days of the model run.\par 
    10471075 
    10481076The SAL term should in principle be computed online as it depends on 
    10491077the model tidal prediction itself (see \citet{arbic.garner.ea_DSR04} for a 
    1050 discussion about the practical implementation of this term). 
    1051 Nevertheless, the complex calculations involved would make this 
    1052 computationally too expensive. Here, two options are available: 
    1053 $\Pi_{sal}$ generated by an external model can be read in 
    1054 (\np[=.true.]{ln_read_load}{ln\_read\_load}), or a ``scalar approximation'' can be 
    1055 used (\np[=.true.]{ln_scal_load}{ln\_scal\_load}). In the latter case 
     1078discussion about the practical implementation of this term). The complex 
     1079calculations involved in such computations, however, are computationally very 
     1080expensive. Here, two mutually exclusive simpler variants are available: 
     1081amplitudes generated by an external model for oscillatory $\Pi_{sal}$ 
     1082contributions from each of the selected tidal constituents can be read in 
     1083(\np[=.true.]{ln_read_load}{ln\_read\_load}) from the file specified in 
     1084\np{cn_tide_load}{cn\_tide\_load} (the variable names are comprised of the 
     1085tidal-constituent name and suffixes \forcode{_z1} and \forcode{_z2} for the two 
     1086orthogonal components, respectively); alternatively, a ``scalar approximation'' 
     1087can be used (\np[=.true.]{ln_scal_load}{ln\_scal\_load}), where 
    10561088\[ 
    10571089  \Pi_{sal} = \beta \eta, 
    10581090\] 
    1059 where $\beta$ (\np{rn_scal_load}{rn\_scal\_load} with a default value of 0.094) is a 
    1060 spatially constant scalar, often chosen to minimize tidal prediction 
    1061 errors. Setting both \np{ln_read_load}{ln\_read\_load} and \np{ln_scal_load}{ln\_scal\_load} to 
    1062 \forcode{.false.} removes the SAL contribution. 
     1091with a spatially uniform coefficient $\beta$, which can be configured 
     1092via \np{rn_scal_load}{rn\_scal\_load} (default value 0.094) and is 
     1093often tuned to minimize tidal prediction errors.\par 
     1094 
     1095For diagnostic purposes, the forcing potential of the individual tidal 
     1096constituents (incl. load ptential, if activated) and the total forcing 
     1097potential (incl. load potential, if activated) can be made available 
     1098as diagnostic output by setting 
     1099\np[=.true.]{ln_tide_dia}{ln\_tide\_dia} (fields 
     1100\forcode{tide_pot_<constituent>} and \forcode{tide_pot}).\par 
    10631101 
    10641102%% ================================================================================================= 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/namelists/nam_tide

    r10075 r14002  
    33!----------------------------------------------------------------------- 
    44   ln_tide     = .false.      ! Activate tides 
    5       ln_tide_pot   = .true.                !  use tidal potential forcing 
     5      nn_tide_var   = 1          !  Variant of tidal parameter set and tide-potential computation 
     6      !                          !     (1: default; 0: compatibility with previous versions) 
     7      ln_tide_dia   = .false.    !  Enable tidal diagnostic output 
     8      ln_tide_pot   = .false.               !  use tidal potential forcing 
     9         rn_tide_gamma = 0.7                   ! Tidal tilt factor 
    610         ln_scal_load  = .false.               ! Use scalar approximation for 
    711            rn_scal_load = 0.094               !     load potential 
    812         ln_read_load  = .false.               ! Or read load potential from file 
    913            cn_tide_load = 'tide_LOAD_grid_T.nc'  ! filename for load potential 
    10             !       
     14            ! 
    1115      ln_tide_ramp  = .false.               !  Use linear ramp for tides at startup 
    12          rdttideramp   =    0.                 !  ramp duration in days 
    13       clname(1)    = 'DUMMY'               !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
     16         rn_tide_ramp_dt = 0.               !  ramp duration in days 
     17      sn_tide_cnames(1) = 'DUMMY'               !  name of constituent - all tidal components must be set in namelist_cfg 
    1418/ 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/namelists/nambdy_tide

    r10075 r14002  
    44   filtide          = 'bdydta/amm12_bdytide_'   !  file name root of tidal forcing files 
    55   ln_bdytide_2ddta = .false.                   ! 
    6    ln_bdytide_conj  = .false.                   !  
    76/ 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/doc/namelists/namdyn_rhg

    r13710 r14002  
    33!------------------------------------------------------------------------------ 
    44   ln_rhg_EVP       = .true.          !  EVP rheology 
     5   ln_rhg_EAP       = .false.          !  EAP rheology 
    56      ln_aEVP       = .false.         !     adaptive rheology (Kimmritz et al. 2016 & 2017) 
    67      rn_creepl     =   2.0e-9        !     creep limit [1/s] 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/ice.F90

    r13710 r14002  
    150150   ! 
    151151   !                                     !!** ice-rheology namelist (namdyn_rhg) ** 
     152   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_rhg_EVP       ! EVP rheology switch, used for rdgrft and rheology 
     153   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_rhg_EAP       ! EAP rheology switch, used for rdgrft and rheology 
    152154   LOGICAL , PUBLIC ::   ln_aEVP          !: using adaptive EVP (T or F)  
    153155   REAL(wp), PUBLIC ::   rn_creepl        !: creep limit : has to be under 1.0e-9 
     
    246248   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   divu_i          !: Divergence of the velocity field             [s-1] 
    247249   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   shear_i         !: Shear of the velocity field                  [s-1] 
     250   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   aniso_11, aniso_12   !: structure tensor elements 
     251   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) ::   rdg_conv 
    248252   ! 
    249253   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::   t_bo            !: Sea-Ice bottom temperature [Kelvin]      
     
    436440      ALLOCATE( u_oce    (jpi,jpj) , v_oce    (jpi,jpj) , ht_i_new  (jpi,jpj) , strength(jpi,jpj) ,  & 
    437441         &      stress1_i(jpi,jpj) , stress2_i(jpi,jpj) , stress12_i(jpi,jpj) ,                      & 
    438          &      delta_i  (jpi,jpj) , divu_i   (jpi,jpj) , shear_i   (jpi,jpj) , STAT=ierr(ii) ) 
     442         &      delta_i  (jpi,jpj) , divu_i   (jpi,jpj) , shear_i   (jpi,jpj) ,                      & 
     443         &      aniso_11 (jpi,jpj) , aniso_12 (jpi,jpj) , rdg_conv  (jpi,jpj) , STAT=ierr(ii) ) 
    439444 
    440445      ii = ii + 1 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icedia.F90

    r13710 r14002  
    261261         ! Write in numriw (if iter == nitrst) 
    262262         ! ------------------  
    263          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_voltop' , frc_voltop  ) 
    264          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_volbot' , frc_volbot  ) 
    265          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_temtop' , frc_temtop  ) 
    266          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_tembot' , frc_tembot  ) 
    267          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_sal'    , frc_sal     ) 
     263         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_voltop' , frc_voltop ) 
     264         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_volbot' , frc_volbot ) 
     265         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_temtop' , frc_temtop ) 
     266         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_tembot' , frc_tembot ) 
     267         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'frc_sal'    , frc_sal    ) 
    268268         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'vol_loc_ini', vol_loc_ini ) 
    269269         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'tem_loc_ini', tem_loc_ini ) 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icedyn_adv_pra.F90

    r13710 r14002  
    989989            DO jk = 1, nlay_s 
    990990               WRITE(zchar1,'(I2.2)') jk 
    991                znam = 'sxc0'//'_l'//zchar1  ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sxc0 (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    992                znam = 'syc0'//'_l'//zchar1  ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   syc0 (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    993                znam = 'sxxc0'//'_l'//zchar1 ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxxc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    994                znam = 'syyc0'//'_l'//zchar1 ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   syyc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    995                znam = 'sxyc0'//'_l'//zchar1 ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxyc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     991               znam = 'sxc0'//'_l'//zchar1   
     992               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sxc0 (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     993               znam = 'syc0'//'_l'//zchar1   
     994               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   syc0 (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     995               znam = 'sxxc0'//'_l'//zchar1  
     996               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxxc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     997               znam = 'syyc0'//'_l'//zchar1  
     998               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   syyc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     999               znam = 'sxyc0'//'_l'//zchar1  
     1000               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxyc0(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    9961001            END DO 
    9971002            !                                                        ! ice layers heat content 
    9981003            DO jk = 1, nlay_i 
    9991004               WRITE(zchar1,'(I2.2)') jk 
    1000                znam = 'sxe'//'_l'//zchar1   ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sxe (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    1001                znam = 'sye'//'_l'//zchar1   ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sye (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    1002                znam = 'sxxe'//'_l'//zchar1  ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxxe(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    1003                znam = 'syye'//'_l'//zchar1  ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   syye(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    1004                znam = 'sxye'//'_l'//zchar1  ;   CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxye(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     1005               znam = 'sxe'//'_l'//zchar1    
     1006               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sxe (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     1007               znam = 'sye'//'_l'//zchar1    
     1008               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d, psgn = -1._wp )   ;   sye (:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     1009               znam = 'sxxe'//'_l'//zchar1   
     1010               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxxe(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     1011               znam = 'syye'//'_l'//zchar1   
     1012               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   syye(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
     1013               znam = 'sxye'//'_l'//zchar1   
     1014               CALL iom_get( numrir, jpdom_auto, znam , z3d )   ;   sxye(:,:,jk,:) = z3d(:,:,:) 
    10051015            END DO 
    10061016            ! 
     
    10671077         ! 
    10681078         !                                                           ! ice thickness 
    1069          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxice' , sxice  ) 
    1070          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syice' , syice  ) 
    1071          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxice', sxxice ) 
    1072          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syyice', syyice ) 
    1073          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxyice', sxyice ) 
     1079         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxice' , sxice) 
     1080         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syice' , syice) 
     1081         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxice', sxxice) 
     1082         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syyice', syyice) 
     1083         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxyice', sxyice) 
    10741084         !                                                           ! snow thickness 
    1075          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxsn'  , sxsn   ) 
    1076          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sysn'  , sysn   ) 
    1077          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxsn' , sxxsn  ) 
    1078          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syysn' , syysn  ) 
    1079          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxysn' , sxysn  ) 
     1085         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxsn'  , sxsn ) 
     1086         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sysn'  , sysn ) 
     1087         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxsn' , sxxsn ) 
     1088         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syysn' , syysn ) 
     1089         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxysn' , sxysn ) 
    10801090         !                                                           ! ice concentration 
    1081          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxa'   , sxa    ) 
    1082          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sya'   , sya    ) 
    1083          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxa'  , sxxa   ) 
    1084          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syya'  , syya   ) 
    1085          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxya'  , sxya   ) 
     1091         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxa'   , sxa  ) 
     1092         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sya'   , sya  ) 
     1093         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxa'  , sxxa  ) 
     1094         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syya'  , syya  ) 
     1095         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxya'  , sxya  ) 
    10861096         !                                                           ! ice salinity 
    1087          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxsal' , sxsal  ) 
    1088          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sysal' , sysal  ) 
    1089          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxsal', sxxsal ) 
    1090          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syysal', syysal ) 
    1091          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxysal', sxysal ) 
     1097         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxsal' , sxsal) 
     1098         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sysal' , sysal) 
     1099         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxsal', sxxsal) 
     1100         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syysal', syysal) 
     1101         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxysal', sxysal) 
    10921102         !                                                           ! ice age 
    1093          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxage' , sxage  ) 
    1094          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syage' , syage  ) 
    1095          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxage', sxxage ) 
    1096          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syyage', syyage ) 
    1097          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxyage', sxyage ) 
     1103         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxage' , sxage) 
     1104         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syage' , syage) 
     1105         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxxage', sxxage) 
     1106         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'syyage', syyage) 
     1107         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'sxyage', sxyage) 
    10981108         !                                                           ! snow layers heat content 
    10991109         DO jk = 1, nlay_s 
    11001110            WRITE(zchar1,'(I2.2)') jk 
    1101             znam = 'sxc0'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxc0 (:,:,jk,:)  ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1102             znam = 'syc0'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = syc0 (:,:,jk,:)  ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1103             znam = 'sxxc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = sxxc0(:,:,jk,:)  ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1104             znam = 'syyc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = syyc0(:,:,jk,:)  ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1105             znam = 'sxyc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = sxyc0(:,:,jk,:)  ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
     1111            znam = 'sxc0'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxc0 (:,:,jk,:) 
     1112            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1113            znam = 'syc0'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = syc0 (:,:,jk,:) 
     1114            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1115            znam = 'sxxc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = sxxc0(:,:,jk,:) 
     1116            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1117            znam = 'syyc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = syyc0(:,:,jk,:) 
     1118            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1119            znam = 'sxyc0'//'_l'//zchar1 ;   z3d(:,:,:) = sxyc0(:,:,jk,:) 
     1120            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
    11061121         END DO 
    11071122         !                                                           ! ice layers heat content 
    11081123         DO jk = 1, nlay_i 
    11091124            WRITE(zchar1,'(I2.2)') jk 
    1110             znam = 'sxe'//'_l'//zchar1   ;   z3d(:,:,:) = sxe (:,:,jk,:)   ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1111             znam = 'sye'//'_l'//zchar1   ;   z3d(:,:,:) = sye (:,:,jk,:)   ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1112             znam = 'sxxe'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxxe(:,:,jk,:)   ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1113             znam = 'syye'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = syye(:,:,jk,:)   ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
    1114             znam = 'sxye'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxye(:,:,jk,:)   ;   CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d ) 
     1125            znam = 'sxe'//'_l'//zchar1   ;   z3d(:,:,:) = sxe (:,:,jk,:) 
     1126            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1127            znam = 'sye'//'_l'//zchar1   ;   z3d(:,:,:) = sye (:,:,jk,:) 
     1128            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1129            znam = 'sxxe'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxxe(:,:,jk,:) 
     1130            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1131            znam = 'syye'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = syye(:,:,jk,:) 
     1132            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
     1133            znam = 'sxye'//'_l'//zchar1  ;   z3d(:,:,:) = sxye(:,:,jk,:) 
     1134            CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, znam , z3d) 
    11151135         END DO 
    11161136         ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icedyn_rdgrft.F90

    r13710 r14002  
    140140      INTEGER , DIMENSION(jpij) ::   iptidx        ! compute ridge/raft or not 
    141141      REAL(wp), DIMENSION(jpij) ::   zdivu, zdelt  ! 1D divu_i & delta_i 
     142      REAL(wp), DIMENSION(jpij) ::   zconv         ! 1D rdg_conv (if EAP rheology) 
    142143      ! 
    143144      INTEGER, PARAMETER ::   jp_itermax = 20     
     
    175176         ! just needed here 
    176177         CALL tab_2d_1d( npti, nptidx(1:npti), zdelt   (1:npti)      , delta_i ) 
     178         CALL tab_2d_1d( npti, nptidx(1:npti), zconv   (1:npti)      , rdg_conv ) 
    177179         ! needed here and in the iteration loop 
    178180         CALL tab_2d_1d( npti, nptidx(1:npti), zdivu   (1:npti)      , divu_i) ! zdivu is used as a work array here (no change in divu_i) 
     
    184186            ! closing_net = rate at which open water area is removed + ice area removed by ridging  
    185187            !                                                        - ice area added in new ridges 
    186             closing_net(ji) = rn_csrdg * 0.5_wp * ( zdelt(ji) - ABS( zdivu(ji) ) ) - MIN( zdivu(ji), 0._wp ) 
     188            IF( ln_rhg_EVP )  closing_net(ji) = rn_csrdg * 0.5_wp * ( zdelt(ji) - ABS( zdivu(ji) ) ) - MIN( zdivu(ji), 0._wp ) 
     189            IF( ln_rhg_EAP )  closing_net(ji) = zconv(ji) 
    187190            ! 
    188191            IF( zdivu(ji) < 0._wp )   closing_net(ji) = MAX( closing_net(ji), -zdivu(ji) )   ! make sure the closing rate is large enough 
     
    776779      !                              !--------------------------------------------------! 
    777780         strength(:,:) = rn_pstar * SUM( v_i(:,:,:), dim=3 ) * EXP( -rn_crhg * ( 1._wp - SUM( a_i(:,:,:), dim=3 ) ) ) 
    778          ismooth = 1 
     781         ismooth = 1    ! original code 
     782!        ismooth = 0    ! try for EAP stability 
    779783         !                           !--------------------------------------------------! 
    780784      ELSE                           ! Zero strength                                    ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icedyn_rhg.F90

    r13710 r14002  
    1717   USE ice            ! sea-ice: variables 
    1818   USE icedyn_rhg_evp ! sea-ice: EVP rheology 
     19   USE icedyn_rhg_eap ! sea-ice: EAP rheology 
    1920   USE icectl         ! sea-ice: control prints 
    2021   ! 
     
    3334   !                                        ! associated indices: 
    3435   INTEGER, PARAMETER ::   np_rhgEVP = 1   ! EVP rheology 
    35 !! INTEGER, PARAMETER ::   np_rhgEAP = 2   ! EAP rheology 
     36  INTEGER, PARAMETER ::   np_rhgEAP = 2   ! EAP rheology 
    3637 
    3738   ! ** namelist (namrhg) ** 
    38    LOGICAL ::   ln_rhg_EVP       ! EVP rheology 
    3939   ! 
    4040   !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    7878         CALL ice_dyn_rhg_evp( kt, Kmm, stress1_i, stress2_i, stress12_i, shear_i, divu_i, delta_i ) 
    7979         !          
     80         !                             !----------------------------! 
     81      CASE( np_rhgEAP )                ! Elasto-Anisotropic-Plastic ! 
     82         !                             !----------------------------! 
     83         CALL ice_dyn_rhg_eap( kt, Kmm, stress1_i, stress2_i, stress12_i, shear_i, divu_i, delta_i, aniso_11, aniso_12, rdg_conv ) 
    8084      END SELECT 
    8185      ! 
    8286      IF( lrst_ice ) THEN                       !* write EVP fields in the restart file 
    8387         IF( ln_rhg_EVP )   CALL rhg_evp_rst( 'WRITE', kt ) 
     88         IF( ln_rhg_EAP )   CALL rhg_eap_rst( 'WRITE', kt ) !* write EAP fields in the restart file 
    8489      ENDIF 
    8590      ! 
     
    108113      INTEGER ::   ios, ioptio   ! Local integer output status for namelist read 
    109114      !! 
    110       NAMELIST/namdyn_rhg/  ln_rhg_EVP, ln_aEVP, rn_creepl, rn_ecc , nn_nevp, rn_relast, nn_rhg_chkcvg 
     115      NAMELIST/namdyn_rhg/  ln_rhg_EVP, ln_aEVP, ln_rhg_EAP, rn_creepl, rn_ecc , nn_nevp, rn_relast, nn_rhg_chkcvg 
    111116      !!------------------------------------------------------------------- 
    112117      ! 
     
    133138         ELSEIF( nn_rhg_chkcvg == 2 ) THEN   ;   WRITE(numout,*) '         check cvg at both main and rheology time steps' 
    134139         ENDIF 
     140         WRITE(numout,*) '      rheology EAP (icedyn_rhg_eap)                        ln_rhg_EAP = ', ln_rhg_EAP 
    135141      ENDIF 
    136142      ! 
     
    138144      ioptio = 0  
    139145      IF( ln_rhg_EVP ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;   nice_rhg = np_rhgEVP    ;   ENDIF 
    140 !!    IF( ln_rhg_EAP ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;   nice_rhg = np_rhgEAP    ;   ENDIF 
     146      IF( ln_rhg_EAP ) THEN   ;   ioptio = ioptio + 1   ;   nice_rhg = np_rhgEAP    ;   ENDIF 
    141147      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'ice_dyn_rhg_init: choose one and only one ice rheology' ) 
    142148      ! 
    143149      IF( ln_rhg_EVP  )   CALL rhg_evp_rst( 'READ' )  !* read or initialize all required files 
     150      IF( ln_rhg_EAP  )   CALL rhg_eap_rst( 'READ' )  !* read or initialize all required files 
    144151      ! 
    145152   END SUBROUTINE ice_dyn_rhg_init 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icedyn_rhg_evp.F90

    r13710 r14002  
    199199         zfmask(ji,jj) = tmask(ji,jj,1) * tmask(ji+1,jj,1) * tmask(ji,jj+1,1) * tmask(ji+1,jj+1,1) 
    200200      END_2D 
    201       CALL lbc_lnk( 'icedyn_rhg_evp', zfmask, 'F', 1._wp ) 
     201      CALL lbc_lnk( 'icedyn_rhg_evp', zfmask, 'F', 1._wp) 
    202202 
    203203      ! Lateral boundary conditions on velocity (modify zfmask) 
     
    10331033         iter = kt + nn_fsbc - 1             ! ice restarts are written at kt == nitrst - nn_fsbc + 1 
    10341034         ! 
    1035          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'stress1_i' , stress1_i  ) 
    1036          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'stress2_i' , stress2_i  ) 
     1035         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'stress1_i' , stress1_i ) 
     1036         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'stress2_i' , stress2_i ) 
    10371037         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'stress12_i', stress12_i ) 
    10381038         ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icerst.F90

    r13710 r14002  
    5555      CHARACTER(len=50)   ::   clname   ! ice output restart file name 
    5656      CHARACTER(len=256)  ::   clpath   ! full path to ice output restart file  
     57      CHARACTER(LEN=52)   ::   clpname   ! ocean output restart file name including prefix for AGRIF 
    5758      !!---------------------------------------------------------------------- 
    5859      ! 
     
    8485            ENDIF 
    8586            ! 
    86             CALL iom_open( TRIM(clpath)//TRIM(clname), numriw, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl, cdcomp = 'ICE' ) 
     87            IF(.NOT.lwxios) THEN 
     88               CALL iom_open( TRIM(clpath)//TRIM(clname), numriw, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl, cdcomp = 'ICE' ) 
     89            ELSE 
     90#if defined key_iomput 
     91               cw_icerst_cxt = "rstwi_"//TRIM(ADJUSTL(clkt)) 
     92               IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
     93                  clpname = clname 
     94               ELSE 
     95                  clpname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//clname 
     96               ENDIF 
     97               numriw = iom_xios_setid(TRIM(clpath)//TRIM(clpname)) 
     98               CALL iom_init( cw_icerst_cxt, kdid = numriw, ld_closedef = .FALSE. ) 
     99               CALL iom_swap( cxios_context ) 
     100#else 
     101               clinfo = 'Can not use XIOS in rst_opn' 
     102               CALL ctl_stop(TRIM(clinfo)) 
     103#endif 
     104            ENDIF 
    87105            lrst_ice = .TRUE. 
    88106         ENDIF 
     
    117135         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~'          
    118136      ENDIF 
    119  
     137       
    120138      ! Write in numriw (if iter == nitrst) 
    121139      ! ------------------  
     
    123141      CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'nn_fsbc', REAL( nn_fsbc, wp ) )      ! time-step  
    124142      CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'kt_ice' , REAL( iter   , wp ) )      ! date 
    125       CALL iom_delay_rst( 'WRITE', 'ICE', numriw )   ! save only ice delayed global communication variables 
     143       
     144      IF(.NOT.lwxios) CALL iom_delay_rst( 'WRITE', 'ICE', numriw )   ! save only ice delayed global communication variables 
    126145 
    127146      ! Prognostic variables 
     
    154173      IF( ln_cpl ) THEN 
    155174         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 'cnd_ice', cnd_ice ) 
    156          CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 't1_ice' , t1_ice  ) 
     175         CALL iom_rstput( iter, nitrst, numriw, 't1_ice' , t1_ice ) 
    157176      ENDIF 
    158177      ! 
     
    161180      ! ------------------ 
    162181      IF( iter == nitrst ) THEN 
    163          CALL iom_close( numriw ) 
     182         IF(.NOT.lwxios) THEN 
     183            CALL iom_close( numriw ) 
     184         ELSE 
     185            CALL iom_context_finalize(      cw_icerst_cxt          ) 
     186            iom_file(numriw)%nfid       = 0 
     187            numriw = 0 
     188         ENDIF 
    164189         lrst_ice = .FALSE. 
    165190      ENDIF 
     
    181206      CHARACTER(len=2)  ::   zchar, zchar1 
    182207      REAL(wp)          ::   zfice, ziter 
     208      CHARACTER(lc)     ::   clpname 
    183209      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpl) ::   z3d   ! 3D workspace 
    184210      !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    190216      ENDIF 
    191217 
     218      lxios_sini = .FALSE. 
    192219      CALL iom_open ( TRIM(cn_icerst_indir)//'/'//cn_icerst_in, numrir ) 
     220 
     221      IF( lrxios) THEN 
     222          cr_icerst_cxt = 'si3_rst' 
     223          IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Enable restart reading by XIOS for SI3' 
     224!         IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
     225!            clpname = cn_icerst_in 
     226!         ELSE 
     227!            clpname = TRIM(Agrif_CFixed())//"_"//cn_icerst_in    
     228!         ENDIF 
     229          CALL iom_init( cr_icerst_cxt, kdid = numrir, ld_closedef = .TRUE. ) 
     230      ENDIF 
    193231 
    194232      ! test if v_i exists  
     
    198236      IF( id0 > 0 ) THEN   ! == case of a normal restart == ! 
    199237         !                 ! ------------------------------ ! 
    200           
    201238         ! Time info 
    202239         CALL iom_get( numrir, 'nn_fsbc', zfice ) 
     
    278315         ENDIF 
    279316 
    280          CALL iom_delay_rst( 'READ', 'ICE', numrir )   ! read only ice delayed global communication variables 
    281  
     317         IF(.NOT.lrxios) CALL iom_delay_rst( 'READ', 'ICE', numrir )   ! read only ice delayed global communication variables 
    282318         !                 ! ---------------------------------- ! 
    283319      ELSE                 ! == case of a simplified restart == ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/ICE/icestp.F90

    r13852 r14002  
    291291      tn_ice(:,:,:) = t_su(:,:,:)      ! initialisation of surface temp for coupled simu 
    292292      ! 
    293       IF( ln_rstart )   CALL iom_close( numrir )  ! close input ice restart file 
     293      IF( ln_rstart )  THEN 
     294         CALL iom_close( numrir )  ! close input ice restart file 
     295         IF(lrxios) CALL iom_context_finalize(      cr_icerst_cxt         ) 
     296      ENDIF 
    294297      ! 
    295298   END SUBROUTINE ice_init 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/ASM/asminc.F90

    r13710 r14002  
    2626   USE par_oce         ! Ocean space and time domain variables 
    2727   USE dom_oce         ! Ocean space and time domain 
     28   USE domain, ONLY : dom_tile 
    2829   USE domvvl          ! domain: variable volume level 
    2930   USE ldfdyn          ! lateral diffusion: eddy viscosity coefficients 
     
    518519      ! 
    519520      INTEGER  :: ji, jj, jk 
    520       INTEGER  :: it 
     521      INTEGER  :: it, itile 
    521522      REAL(wp) :: zincwgt  ! IAU weight for current time step 
    522       REAL (wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: fzptnz ! 3d freezing point values 
     523      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk) :: fzptnz ! 3d freezing point values 
    523524      !!---------------------------------------------------------------------- 
    524525      ! 
    525526      ! freezing point calculation taken from oc_fz_pt (but calculated for all depths)  
    526527      ! used to prevent the applied increments taking the temperature below the local freezing point  
    527       DO jk = 1, jpkm1 
    528         CALL eos_fzp( pts(:,:,jk,jp_sal,Kmm), fzptnz(:,:,jk), gdept(:,:,jk,Kmm) ) 
    529       END DO 
     528      IF( ln_temnofreeze ) THEN 
     529         DO jk = 1, jpkm1 
     530           CALL eos_fzp( pts(:,:,jk,jp_sal,Kmm), fzptnz(:,:,jk), gdept(:,:,jk,Kmm) ) 
     531         END DO 
     532      ENDIF 
    530533         ! 
    531534         !                             !-------------------------------------- 
     
    538541            zincwgt = wgtiau(it) / rn_Dt   ! IAU weight for the current time step 
    539542            ! 
    540             IF(lwp) THEN 
    541                WRITE(numout,*)  
    542                WRITE(numout,*) 'tra_asm_inc : Tracer IAU at time step = ', kt,' with IAU weight = ', wgtiau(it) 
    543                WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
     543            IF( ntile == 0 .OR. ntile == 1 )  THEN                       ! Do only on the first tile 
     544               IF(lwp) THEN 
     545                  WRITE(numout,*) 
     546                  WRITE(numout,*) 'tra_asm_inc : Tracer IAU at time step = ', kt,' with IAU weight = ', wgtiau(it) 
     547                  WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
     548               ENDIF 
    544549            ENDIF 
    545550            ! 
     
    548553               IF (ln_temnofreeze) THEN 
    549554                  ! Do not apply negative increments if the temperature will fall below freezing 
    550                   WHERE(t_bkginc(:,:,jk) > 0.0_wp .OR. & 
    551                      &   pts(:,:,jk,jp_tem,Kmm) + pts(:,:,jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(:,:,jk) * wgtiau(it) > fzptnz(:,:,jk) )  
    552                      pts(:,:,jk,jp_tem,Krhs) = pts(:,:,jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(:,:,jk) * zincwgt   
     555                  WHERE(t_bkginc(A2D(0),jk) > 0.0_wp .OR. & 
     556                     &   pts(A2D(0),jk,jp_tem,Kmm) + pts(A2D(0),jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(A2D(0),jk) * wgtiau(it) > fzptnz(:,:,jk) ) 
     557                     pts(A2D(0),jk,jp_tem,Krhs) = pts(A2D(0),jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(A2D(0),jk) * zincwgt 
    553558                  END WHERE 
    554559               ELSE 
    555                   pts(:,:,jk,jp_tem,Krhs) = pts(:,:,jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(:,:,jk) * zincwgt   
     560                  DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     561                     pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_tem,Krhs) + t_bkginc(ji,jj,jk) * zincwgt 
     562                  END_2D 
    556563               ENDIF 
    557564               IF (ln_salfix) THEN 
    558565                  ! Do not apply negative increments if the salinity will fall below a specified 
    559566                  ! minimum value salfixmin 
    560                   WHERE(s_bkginc(:,:,jk) > 0.0_wp .OR. & 
    561                      &   pts(:,:,jk,jp_sal,Kmm) + pts(:,:,jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(:,:,jk) * wgtiau(it) > salfixmin )  
    562                      pts(:,:,jk,jp_sal,Krhs) = pts(:,:,jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(:,:,jk) * zincwgt 
     567                  WHERE(s_bkginc(A2D(0),jk) > 0.0_wp .OR. & 
     568                     &   pts(A2D(0),jk,jp_sal,Kmm) + pts(A2D(0),jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(A2D(0),jk) * wgtiau(it) > salfixmin ) 
     569                     pts(A2D(0),jk,jp_sal,Krhs) = pts(A2D(0),jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(A2D(0),jk) * zincwgt 
    563570                  END WHERE 
    564571               ELSE 
    565                   pts(:,:,jk,jp_sal,Krhs) = pts(:,:,jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(:,:,jk) * zincwgt 
     572                  DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     573                     pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) = pts(ji,jj,jk,jp_sal,Krhs) + s_bkginc(ji,jj,jk) * zincwgt 
     574                  END_2D 
    566575               ENDIF 
    567576            END DO 
     
    569578         ENDIF 
    570579         ! 
    571          IF ( kt == nitiaufin_r + 1  ) THEN   ! For bias crcn to work 
    572             DEALLOCATE( t_bkginc ) 
    573             DEALLOCATE( s_bkginc ) 
     580         IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile )  THEN                ! Do only on the last tile 
     581            IF ( kt == nitiaufin_r + 1  ) THEN   ! For bias crcn to work 
     582               DEALLOCATE( t_bkginc ) 
     583               DEALLOCATE( s_bkginc ) 
     584            ENDIF 
    574585         ENDIF 
    575586         !                             !-------------------------------------- 
     
    584595            IF (ln_temnofreeze) THEN 
    585596               ! Do not apply negative increments if the temperature will fall below freezing 
    586                WHERE( t_bkginc(:,:,:) > 0.0_wp .OR. pts(:,:,:,jp_tem,Kmm) + t_bkginc(:,:,:) > fzptnz(:,:,:) )  
    587                   pts(:,:,:,jp_tem,Kmm) = t_bkg(:,:,:) + t_bkginc(:,:,:)    
     597               WHERE( t_bkginc(A2D(0),:) > 0.0_wp .OR. pts(A2D(0),:,jp_tem,Kmm) + t_bkginc(A2D(0),:) > fzptnz(:,:,:) ) 
     598                  pts(A2D(0),:,jp_tem,Kmm) = t_bkg(A2D(0),:) + t_bkginc(A2D(0),:) 
    588599               END WHERE 
    589600            ELSE 
    590                pts(:,:,:,jp_tem,Kmm) = t_bkg(:,:,:) + t_bkginc(:,:,:)    
     601               DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpk ) 
     602                  pts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm) = t_bkg(ji,jj,jk) + t_bkginc(ji,jj,jk) 
     603               END_3D 
    591604            ENDIF 
    592605            IF (ln_salfix) THEN 
    593606               ! Do not apply negative increments if the salinity will fall below a specified 
    594607               ! minimum value salfixmin 
    595                WHERE( s_bkginc(:,:,:) > 0.0_wp .OR. pts(:,:,:,jp_sal,Kmm) + s_bkginc(:,:,:) > salfixmin )  
    596                   pts(:,:,:,jp_sal,Kmm) = s_bkg(:,:,:) + s_bkginc(:,:,:)    
     608               WHERE( s_bkginc(A2D(0),:) > 0.0_wp .OR. pts(A2D(0),:,jp_sal,Kmm) + s_bkginc(A2D(0),:) > salfixmin ) 
     609                  pts(A2D(0),:,jp_sal,Kmm) = s_bkg(A2D(0),:) + s_bkginc(A2D(0),:) 
    597610               END WHERE 
    598611            ELSE 
    599                pts(:,:,:,jp_sal,Kmm) = s_bkg(:,:,:) + s_bkginc(:,:,:)    
    600             ENDIF 
    601  
    602             pts(:,:,:,:,Kbb) = pts(:,:,:,:,Kmm)                 ! Update before fields 
     612               DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpk ) 
     613                  pts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) = s_bkg(ji,jj,jk) + s_bkginc(ji,jj,jk) 
     614               END_3D 
     615            ENDIF 
     616 
     617            DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpk ) 
     618               pts(ji,jj,jk,:,Kbb) = pts(ji,jj,jk,:,Kmm)             ! Update before fields 
     619            END_3D 
    603620 
    604621            CALL eos( pts(:,:,:,:,Kbb), rhd, rhop, gdept_0(:,:,:) )  ! Before potential and in situ densities 
     
    607624!!gm 
    608625 
    609             IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND. .NOT. ln_isfcav)           & 
    610                &  CALL zps_hde    ( kt, Kmm, jpts, pts(:,:,:,:,Kbb), gtsu, gtsv,        &  ! Partial steps: before horizontal gradient 
    611                &                              rhd, gru , grv               )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
    612             IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND.       ln_isfcav)                       & 
    613                &  CALL zps_hde_isf( nit000, Kmm, jpts, pts(:,:,:,:,Kbb), gtsu, gtsv, gtui, gtvi,    &  ! Partial steps for top cell (ISF) 
    614                &                                  rhd, gru , grv , grui, grvi          )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
    615  
    616             DEALLOCATE( t_bkginc ) 
    617             DEALLOCATE( s_bkginc ) 
    618             DEALLOCATE( t_bkg    ) 
    619             DEALLOCATE( s_bkg    ) 
     626            ! TEMP: [tiling] This change not necessary after extra haloes development (lbc_lnk removed from zps_hde*) 
     627            IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile )  THEN                ! Do only for the full domain 
     628               itile = ntile 
     629               IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = 0 )            ! Use full domain 
     630 
     631               IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND. .NOT. ln_isfcav)           & 
     632                  &  CALL zps_hde    ( kt, Kmm, jpts, pts(:,:,:,:,Kbb), gtsu, gtsv,        &  ! Partial steps: before horizontal gradient 
     633                  &                              rhd, gru , grv               )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     634               IF( ln_zps .AND. .NOT. lk_c1d .AND.       ln_isfcav)                       & 
     635                  &  CALL zps_hde_isf( nit000, Kmm, jpts, pts(:,:,:,:,Kbb), gtsu, gtsv, gtui, gtvi,    &  ! Partial steps for top cell (ISF) 
     636                  &                                  rhd, gru , grv , grui, grvi          )  ! of t, s, rd at the last ocean level 
     637 
     638               IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = itile )            ! Revert to tile domain 
     639            ENDIF 
     640 
     641            IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile )  THEN                ! Do only on the last tile 
     642               DEALLOCATE( t_bkginc ) 
     643               DEALLOCATE( s_bkginc ) 
     644               DEALLOCATE( t_bkg    ) 
     645               DEALLOCATE( s_bkg    ) 
     646            ENDIF 
     647         ! 
    620648         ENDIF 
    621649         !   
     
    829857      INTEGER, INTENT(in), OPTIONAL ::   kindic   ! flag for disabling the deallocation 
    830858      ! 
     859      INTEGER  ::   ji, jj 
    831860      INTEGER  ::   it 
    832861      REAL(wp) ::   zincwgt   ! IAU weight for current time step 
    833862#if defined key_si3 
    834       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   zofrld, zohicif, zseaicendg, zhicifinc 
     863      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls)) ::   zofrld, zohicif, zseaicendg, zhicifinc 
    835864      REAL(wp) ::   zhicifmin = 0.5_wp      ! ice minimum depth in metres 
    836865#endif 
     
    847876            ! note this is not a tendency so should not be divided by rn_Dt (as with the tracer and other increments) 
    848877            ! 
    849             IF(lwp) THEN 
    850                WRITE(numout,*)  
    851                WRITE(numout,*) 'seaice_asm_inc : sea ice conc IAU at time step = ', kt,' with IAU weight = ', wgtiau(it) 
    852                WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
     878            IF( ntile == 0 .OR. ntile == 1 )  THEN                       ! Do only on the first tile 
     879               IF(lwp) THEN 
     880                  WRITE(numout,*) 
     881                  WRITE(numout,*) 'seaice_asm_inc : sea ice conc IAU at time step = ', kt,' with IAU weight = ', wgtiau(it) 
     882                  WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~' 
     883               ENDIF 
    853884            ENDIF 
    854885            ! 
     
    856887            ! 
    857888#if defined key_si3 
    858             zofrld (:,:) = 1._wp - at_i(:,:) 
    859             zohicif(:,:) = hm_i(:,:) 
    860             ! 
    861             at_i  (:,:) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i  (:,:) - seaice_bkginc(:,:) * zincwgt, 0.0_wp), 1.0_wp) 
    862             at_i_b(:,:) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i_b(:,:) - seaice_bkginc(:,:) * zincwgt, 0.0_wp), 1.0_wp) 
    863             fr_i(:,:) = at_i(:,:)        ! adjust ice fraction 
    864             ! 
    865             zseaicendg(:,:) = zofrld(:,:) - (1. - at_i(:,:))   ! find out actual sea ice nudge applied 
     889            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     890               zofrld (ji,jj) = 1._wp - at_i(ji,jj) 
     891               zohicif(ji,jj) = hm_i(ji,jj) 
     892               ! 
     893               at_i  (ji,jj) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i  (ji,jj) - seaice_bkginc(ji,jj) * zincwgt, 0.0_wp), 1.0_wp) 
     894               at_i_b(ji,jj) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i_b(ji,jj) - seaice_bkginc(ji,jj) * zincwgt, 0.0_wp), 1.0_wp) 
     895               fr_i(ji,jj) = at_i(ji,jj)        ! adjust ice fraction 
     896               ! 
     897               zseaicendg(ji,jj) = zofrld(ji,jj) - (1. - at_i(ji,jj))   ! find out actual sea ice nudge applied 
     898            END_2D 
    866899            ! 
    867900            ! Nudge sea ice depth to bring it up to a required minimum depth 
    868             WHERE( zseaicendg(:,:) > 0.0_wp .AND. hm_i(:,:) < zhicifmin )  
    869                zhicifinc(:,:) = (zhicifmin - hm_i(:,:)) * zincwgt     
     901            WHERE( zseaicendg(:,:) > 0.0_wp .AND. hm_i(A2D(0)) < zhicifmin ) 
     902               zhicifinc(:,:) = (zhicifmin - hm_i(A2D(0))) * zincwgt 
    870903            ELSEWHERE 
    871904               zhicifinc(:,:) = 0.0_wp 
     
    873906            ! 
    874907            ! nudge ice depth 
    875             hm_i (:,:) = hm_i (:,:) + zhicifinc(:,:) 
     908            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     909               hm_i (ji,jj) = hm_i (ji,jj) + zhicifinc(ji,jj) 
     910            END_2D 
    876911            ! 
    877912            ! seaice salinity balancing (to add) 
     
    880915#if defined key_cice && defined key_asminc 
    881916            ! Sea-ice : CICE case. Pass ice increment tendency into CICE 
    882             ndaice_da(:,:) = seaice_bkginc(:,:) * zincwgt / rn_Dt 
    883 #endif 
    884             ! 
    885             IF ( kt == nitiaufin_r ) THEN 
    886                DEALLOCATE( seaice_bkginc ) 
     917            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     918               ndaice_da(ji,jj) = seaice_bkginc(ji,jj) * zincwgt / rn_Dt 
     919            END_2D 
     920#endif 
     921            ! 
     922            IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile )  THEN                ! Do only on the last tile 
     923               IF ( kt == nitiaufin_r ) THEN 
     924                  DEALLOCATE( seaice_bkginc ) 
     925               ENDIF 
    887926            ENDIF 
    888927            ! 
     
    890929            ! 
    891930#if defined key_cice && defined key_asminc 
    892             ndaice_da(:,:) = 0._wp        ! Sea-ice : CICE case. Zero ice increment tendency into CICE 
     931            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     932               ndaice_da(ji,jj) = 0._wp        ! Sea-ice : CICE case. Zero ice increment tendency into CICE 
     933            END_2D 
    893934#endif 
    894935            ! 
     
    905946            ! 
    906947#if defined key_si3 
    907             zofrld (:,:) = 1._wp - at_i(:,:) 
    908             zohicif(:,:) = hm_i(:,:) 
    909             !  
    910             ! Initialize the now fields the background + increment 
    911             at_i(:,:) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i(:,:) - seaice_bkginc(:,:), 0.0_wp), 1.0_wp) 
    912             at_i_b(:,:) = at_i(:,:)  
    913             fr_i(:,:) = at_i(:,:)        ! adjust ice fraction 
    914             ! 
    915             zseaicendg(:,:) = zofrld(:,:) - (1. - at_i(:,:))   ! find out actual sea ice nudge applied 
     948            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     949               zofrld (ji,jj) = 1._wp - at_i(ji,jj) 
     950               zohicif(ji,jj) = hm_i(ji,jj) 
     951               ! 
     952               ! Initialize the now fields the background + increment 
     953               at_i(ji,jj) = 1. - MIN( MAX( 1.-at_i(ji,jj) - seaice_bkginc(ji,jj), 0.0_wp), 1.0_wp) 
     954               at_i_b(ji,jj) = at_i(ji,jj) 
     955               fr_i(ji,jj) = at_i(ji,jj)        ! adjust ice fraction 
     956               ! 
     957               zseaicendg(ji,jj) = zofrld(ji,jj) - (1. - at_i(ji,jj))   ! find out actual sea ice nudge applied 
     958            END_2D 
    916959            ! 
    917960            ! Nudge sea ice depth to bring it up to a required minimum depth 
    918             WHERE( zseaicendg(:,:) > 0.0_wp .AND. hm_i(:,:) < zhicifmin )  
    919                zhicifinc(:,:) = zhicifmin - hm_i(:,:) 
     961            WHERE( zseaicendg(:,:) > 0.0_wp .AND. hm_i(A2D(0)) < zhicifmin ) 
     962               zhicifinc(:,:) = zhicifmin - hm_i(A2D(0)) 
    920963            ELSEWHERE 
    921964               zhicifinc(:,:) = 0.0_wp 
     
    923966            ! 
    924967            ! nudge ice depth 
    925             hm_i (:,:) = hm_i (:,:) + zhicifinc(:,:) 
     968            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     969               hm_i(ji,jj) = hm_i (ji,jj) + zhicifinc(ji,jj) 
     970            END_2D 
    926971            ! 
    927972            ! seaice salinity balancing (to add) 
     
    930975#if defined key_cice && defined key_asminc 
    931976            ! Sea-ice : CICE case. Pass ice increment tendency into CICE 
    932            ndaice_da(:,:) = seaice_bkginc(:,:) / rn_Dt 
    933 #endif 
    934             IF ( .NOT. PRESENT(kindic) ) THEN 
    935                DEALLOCATE( seaice_bkginc ) 
    936             END IF 
     977            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     978               ndaice_da(ji,jj) = seaice_bkginc(ji,jj) / rn_Dt 
     979            END_2D 
     980#endif 
     981            IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile )  THEN                ! Do only on the last tile 
     982               IF ( .NOT. PRESENT(kindic) ) THEN 
     983                  DEALLOCATE( seaice_bkginc ) 
     984               END IF 
     985            ENDIF 
    937986            ! 
    938987         ELSE 
    939988            ! 
    940989#if defined key_cice && defined key_asminc 
    941             ndaice_da(:,:) = 0._wp     ! Sea-ice : CICE case. Zero ice increment tendency into CICE 
     990            DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     991               ndaice_da(ji,jj) = 0._wp     ! Sea-ice : CICE case. Zero ice increment tendency into CICE 
     992            END_2D 
    942993#endif 
    943994            ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/BDY/bdytra.F90

    r13710 r14002  
    1313   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1414   USE oce            ! ocean dynamics and tracers variables 
    15    USE dom_oce        ! ocean space and time domain variables  
     15   USE dom_oce        ! ocean space and time domain variables 
    1616   USE bdy_oce        ! ocean open boundary conditions 
    1717   USE bdylib         ! for orlanski library routines 
     
    157157      INTEGER  ::   ib_bdy         ! Loop index 
    158158      !!---------------------------------------------------------------------- 
     159      IF( ntile /= 0 .AND. ntile /= 1 ) RETURN                        ! Do only for the full domain 
    159160      ! 
    160161      IF( ln_timing )   CALL timing_start('bdy_tra_dmp') 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/C1D/step_c1d.F90

    r13710 r14002  
    122122                        CALL dyn_atf    ( kstp, Nbb, Nnn, Naa , uu, vv, e3t, e3u, e3v )  ! time filtering of "now" fields 
    123123      IF(.NOT.ln_linssh)CALL ssh_atf    ( kstp, Nbb, Nnn, Naa , ssh )                    ! time filtering of "now" sea surface height 
     124      IF( kstp == nit000 .AND. ln_linssh) THEN 
     125         ssh(:,:,Naa) = ssh(:,:,Nnn)  ! init ssh after in ln_linssh case 
     126      ENDIF 
    124127      ! 
    125128      ! Swap time levels 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DIA/diaar5.F90

    r13710 r14002  
    3434   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:  ) ::   thick0       ! ocean thickness (interior domain) 
    3535   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   sn0          ! initial salinity 
     36   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::   hstr_adv, hstr_ldf 
    3637 
    3738   LOGICAL  :: l_ar5 
     
    5455      !!---------------------------------------------------------------------- 
    5556      ! 
    56       ALLOCATE( thick0(jpi,jpj) , sn0(jpi,jpj,jpk) , STAT=dia_ar5_alloc ) 
     57      ALLOCATE( thick0(jpi,jpj) , sn0(jpi,jpj,jpk) , & 
     58         &      hstr_adv(jpi,jpj,jpts,2), hstr_ldf(jpi,jpj,jpts,2), STAT=dia_ar5_alloc ) 
    5759      ! 
    5860      CALL mpp_sum ( 'diaar5', dia_ar5_alloc ) 
     
    304306   END SUBROUTINE dia_ar5 
    305307 
    306  
    307    SUBROUTINE dia_ar5_hst( ktra, cptr, puflx, pvflx )  
     308   ! TEMP: [tiling] These changes not necessary if using XIOS (subdomain support, will not output haloes) 
     309   SUBROUTINE dia_ar5_hst( ktra, cptr, puflx, pvflx ) 
    308310      !!---------------------------------------------------------------------- 
    309311      !!                    ***  ROUTINE dia_ar5_htr *** 
     
    314316      INTEGER                         , INTENT(in )  :: ktra  ! tracer index 
    315317      CHARACTER(len=3)                , INTENT(in)   :: cptr  ! transport type  'adv'/'ldf' 
    316       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in)   :: puflx  ! u-flux of advection/diffusion 
    317       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in)   :: pvflx  ! v-flux of advection/diffusion 
     318      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)    , INTENT(in)   :: puflx  ! u-flux of advection/diffusion 
     319      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)    , INTENT(in)   :: pvflx  ! v-flux of advection/diffusion 
    318320      ! 
    319321      INTEGER    ::  ji, jj, jk 
    320       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)  :: z2d 
    321  
     322 
     323      IF( cptr /= 'adv' .AND. cptr /= 'ldf' ) RETURN 
     324      IF( ktra /= jp_tem .AND. ktra /= jp_sal ) RETURN 
     325 
     326      IF( cptr == 'adv' ) THEN 
     327         DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     328            hstr_adv(ji,jj,ktra,1) = puflx(ji,jj,1) 
     329            hstr_adv(ji,jj,ktra,2) = pvflx(ji,jj,1) 
     330         END_2D 
     331         DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
     332            hstr_adv(ji,jj,ktra,1) = hstr_adv(ji,jj,ktra,1) + puflx(ji,jj,jk) 
     333            hstr_adv(ji,jj,ktra,2) = hstr_adv(ji,jj,ktra,2) + pvflx(ji,jj,jk) 
     334         END_3D 
     335      ELSE IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
     336         DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
     337            hstr_ldf(ji,jj,ktra,1) = puflx(ji,jj,1) 
     338            hstr_ldf(ji,jj,ktra,2) = pvflx(ji,jj,1) 
     339         END_2D 
     340         DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
     341            hstr_ldf(ji,jj,ktra,1) = hstr_ldf(ji,jj,ktra,1) + puflx(ji,jj,jk) 
     342            hstr_ldf(ji,jj,ktra,2) = hstr_ldf(ji,jj,ktra,2) + pvflx(ji,jj,jk) 
     343         END_3D 
     344      ENDIF 
     345 
     346      IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile ) THEN 
     347         IF( cptr == 'adv' ) THEN 
     348            IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'uadv_heattr' , rho0_rcp * hstr_adv(:,:,ktra,1) )  ! advective heat transport in i-direction 
     349            IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'uadv_salttr' , rho0     * hstr_adv(:,:,ktra,1) )  ! advective salt transport in i-direction 
     350            IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'vadv_heattr' , rho0_rcp * hstr_adv(:,:,ktra,2) )  ! advective heat transport in j-direction 
     351            IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'vadv_salttr' , rho0     * hstr_adv(:,:,ktra,2) )  ! advective salt transport in j-direction 
     352         ENDIF 
     353         IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
     354            IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'udiff_heattr' , rho0_rcp * hstr_ldf(:,:,ktra,1) ) ! diffusive heat transport in i-direction 
     355            IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'udiff_salttr' , rho0     * hstr_ldf(:,:,ktra,1) ) ! diffusive salt transport in i-direction 
     356            IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'vdiff_heattr' , rho0_rcp * hstr_ldf(:,:,ktra,2) ) ! diffusive heat transport in j-direction 
     357            IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'vdiff_salttr' , rho0     * hstr_ldf(:,:,ktra,2) ) ! diffusive salt transport in j-direction 
     358         ENDIF 
     359      ENDIF 
    322360     
    323       z2d(:,:) = puflx(:,:,1)  
    324       DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
    325          z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + puflx(ji,jj,jk)  
    326       END_3D 
    327        CALL lbc_lnk( 'diaar5', z2d, 'U', -1.0_wp ) 
    328        IF( cptr == 'adv' ) THEN 
    329           IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'uadv_heattr' , rho0_rcp * z2d )  ! advective heat transport in i-direction 
    330           IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'uadv_salttr' , rho0     * z2d )  ! advective salt transport in i-direction 
    331        ENDIF 
    332        IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
    333           IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'udiff_heattr' , rho0_rcp * z2d ) ! diffusive heat transport in i-direction 
    334           IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'udiff_salttr' , rho0     * z2d ) ! diffusive salt transport in i-direction 
    335        ENDIF 
    336        ! 
    337        z2d(:,:) = pvflx(:,:,1)  
    338        DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
    339           z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + pvflx(ji,jj,jk)  
    340        END_3D 
    341        CALL lbc_lnk( 'diaar5', z2d, 'V', -1.0_wp ) 
    342        IF( cptr == 'adv' ) THEN 
    343           IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'vadv_heattr' , rho0_rcp * z2d )  ! advective heat transport in j-direction 
    344           IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'vadv_salttr' , rho0     * z2d )  ! advective salt transport in j-direction 
    345        ENDIF 
    346        IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
    347           IF( ktra == jp_tem ) CALL iom_put( 'vdiff_heattr' , rho0_rcp * z2d ) ! diffusive heat transport in j-direction 
    348           IF( ktra == jp_sal ) CALL iom_put( 'vdiff_salttr' , rho0     * z2d ) ! diffusive salt transport in j-direction 
    349        ENDIF 
    350            
    351361   END SUBROUTINE dia_ar5_hst 
    352362 
     
    371381         &  iom_use( 'masstot' ) .OR. iom_use( 'temptot'   )  .OR. iom_use( 'saltot' ) .OR.  &     
    372382         &  iom_use( 'botpres' ) .OR. iom_use( 'sshthster' )  .OR. iom_use( 'sshsteric' ) .OR. & 
     383         &  iom_use( 'uadv_heattr' ) .OR. iom_use( 'udiff_heattr' ) .OR. & 
     384         &  iom_use( 'uadv_salttr' ) .OR. iom_use( 'udiff_salttr' ) .OR. & 
     385         &  iom_use( 'vadv_heattr' ) .OR. iom_use( 'vdiff_heattr' ) .OR. & 
     386         &  iom_use( 'vadv_salttr' ) .OR. iom_use( 'vdiff_salttr' ) .OR. & 
    373387         &  iom_use( 'rhop' )  ) L_ar5 = .TRUE. 
    374388   
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DIA/diahsb.F90

    r13710 r14002  
    267267            IF(lwp) WRITE(numout,*) '   dia_hsb_rst : read hsb restart at it= ', kt,' date= ', ndastp 
    268268            IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    269             CALL iom_get( numror, 'frc_v', frc_v, ldxios = lrxios ) 
    270             CALL iom_get( numror, 'frc_t', frc_t, ldxios = lrxios ) 
    271             CALL iom_get( numror, 'frc_s', frc_s, ldxios = lrxios ) 
     269            CALL iom_get( numror, 'frc_v', frc_v ) 
     270            CALL iom_get( numror, 'frc_t', frc_t ) 
     271            CALL iom_get( numror, 'frc_s', frc_s ) 
    272272            IF( ln_linssh ) THEN 
    273                CALL iom_get( numror, 'frc_wn_t', frc_wn_t, ldxios = lrxios ) 
    274                CALL iom_get( numror, 'frc_wn_s', frc_wn_s, ldxios = lrxios ) 
     273               CALL iom_get( numror, 'frc_wn_t', frc_wn_t ) 
     274               CALL iom_get( numror, 'frc_wn_s', frc_wn_s ) 
    275275            ENDIF 
    276             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'surf_ini'  , surf_ini  , ldxios = lrxios ) ! ice sheet coupling 
    277             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_ini'   , ssh_ini   , ldxios = lrxios ) 
    278             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_ini'   , e3t_ini   , ldxios = lrxios ) 
    279             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tmask_ini' , tmask_ini , ldxios = lrxios ) 
    280             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'hc_loc_ini', hc_loc_ini, ldxios = lrxios ) 
    281             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sc_loc_ini', sc_loc_ini, ldxios = lrxios ) 
     276            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'surf_ini'  , surf_ini  ) ! ice sheet coupling 
     277            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_ini'   , ssh_ini    ) 
     278            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_ini'   , e3t_ini    ) 
     279            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tmask_ini' , tmask_ini ) 
     280            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'hc_loc_ini', hc_loc_ini ) 
     281            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sc_loc_ini', sc_loc_ini ) 
    282282            IF( ln_linssh ) THEN 
    283                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_hc_loc_ini', ssh_hc_loc_ini, ldxios = lrxios ) 
    284                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_sc_loc_ini', ssh_sc_loc_ini, ldxios = lrxios ) 
     283               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_hc_loc_ini', ssh_hc_loc_ini ) 
     284               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ssh_sc_loc_ini', ssh_sc_loc_ini ) 
    285285            ENDIF 
    286286         ELSE 
     
    323323         IF(lwp) WRITE(numout,*) 
    324324         ! 
    325          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          ) 
    326          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_v', frc_v, ldxios = lwxios ) 
    327          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_t', frc_t, ldxios = lwxios ) 
    328          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_s', frc_s, ldxios = lwxios ) 
     325         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_v', frc_v ) 
     326         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_t', frc_t ) 
     327         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_s', frc_s ) 
    329328         IF( ln_linssh ) THEN 
    330             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_wn_t', frc_wn_t, ldxios = lwxios ) 
    331             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_wn_s', frc_wn_s, ldxios = lwxios ) 
     329            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_wn_t', frc_wn_t ) 
     330            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'frc_wn_s', frc_wn_s ) 
    332331         ENDIF 
    333          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'surf_ini'  , surf_ini  , ldxios = lwxios )      ! ice sheet coupling 
    334          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_ini'   , ssh_ini   , ldxios = lwxios ) 
    335          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_ini'   , e3t_ini   , ldxios = lwxios ) 
    336          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tmask_ini' , tmask_ini , ldxios = lwxios ) 
    337          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'hc_loc_ini', hc_loc_ini, ldxios = lwxios ) 
    338          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sc_loc_ini', sc_loc_ini, ldxios = lwxios ) 
     332         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'surf_ini'  , surf_ini  )      ! ice sheet coupling 
     333         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_ini'   , ssh_ini    ) 
     334         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_ini'   , e3t_ini    ) 
     335         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tmask_ini' , tmask_ini ) 
     336         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'hc_loc_ini', hc_loc_ini ) 
     337         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sc_loc_ini', sc_loc_ini ) 
    339338         IF( ln_linssh ) THEN 
    340             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_hc_loc_ini', ssh_hc_loc_ini, ldxios = lwxios ) 
    341             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_sc_loc_ini', ssh_sc_loc_ini, ldxios = lwxios ) 
     339            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_hc_loc_ini', ssh_hc_loc_ini ) 
     340            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ssh_sc_loc_ini', ssh_sc_loc_ini ) 
    342341         ENDIF 
    343          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          ) 
    344342         ! 
    345343      ENDIF 
     
    385383      IF( .NOT. ln_diahsb )   RETURN 
    386384 
    387       IF(lwxios) THEN 
    388 ! define variables in restart file when writing with XIOS 
    389         CALL iom_set_rstw_var_active('frc_v') 
    390         CALL iom_set_rstw_var_active('frc_t') 
    391         CALL iom_set_rstw_var_active('frc_s') 
    392         CALL iom_set_rstw_var_active('surf_ini') 
    393         CALL iom_set_rstw_var_active('ssh_ini') 
    394         CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_ini') 
    395         CALL iom_set_rstw_var_active('hc_loc_ini') 
    396         CALL iom_set_rstw_var_active('sc_loc_ini') 
    397         IF( ln_linssh ) THEN 
    398            CALL iom_set_rstw_var_active('ssh_hc_loc_ini') 
    399            CALL iom_set_rstw_var_active('ssh_sc_loc_ini') 
    400            CALL iom_set_rstw_var_active('frc_wn_t') 
    401            CALL iom_set_rstw_var_active('frc_wn_s') 
    402         ENDIF 
    403       ENDIF 
    404385      ! ------------------- ! 
    405386      ! 1 - Allocate memory ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DIA/diaptr.F90

    r13710 r14002  
    2222   USE oce              ! ocean dynamics and active tracers 
    2323   USE dom_oce          ! ocean space and time domain 
     24   USE domain, ONLY : dom_tile 
    2425   USE phycst           ! physical constants 
    2526   ! 
     
    3233   PRIVATE 
    3334 
     35   INTERFACE ptr_sum 
     36      MODULE PROCEDURE ptr_sum_3d, ptr_sum_2d 
     37   END INTERFACE 
     38 
    3439   INTERFACE ptr_sj 
    3540      MODULE PROCEDURE ptr_sj_3d, ptr_sj_2d 
     
    3944   PUBLIC   dia_ptr_hst    ! called from tra_ldf/tra_adv routines 
    4045 
    41    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   hstr_adv, hstr_ldf, hstr_eiv   !: Heat/Salt TRansports(adv, diff, Bolus.) 
    42    REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   hstr_ove, hstr_btr, hstr_vtr   !: heat Salt TRansports(overturn, baro, merional) 
    43  
    44    LOGICAL, PUBLIC ::   l_diaptr       !: tracers  trend flag 
     46   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::   hstr_adv, hstr_ldf, hstr_eiv   !: Heat/Salt TRansports(adv, diff, Bolus.) 
     47   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)   ::   hstr_ove, hstr_btr, hstr_vtr   !: heat Salt TRansports(overturn, baro, merional) 
     48   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:,:) ::   pvtr_int, pzon_int             !: Other zonal integrals 
     49 
     50   LOGICAL, PUBLIC    ::   l_diaptr       !: tracers  trend flag 
     51   INTEGER, PARAMETER ::   jp_msk = 3 
     52   INTEGER, PARAMETER ::   jp_vtr = 4 
    4553 
    4654   REAL(wp) ::   rc_sv    = 1.e-6_wp   ! conversion from m3/s to Sverdrup 
     
    5159   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) :: btmsk34 ! mask out Southern Ocean (=0 south of 34°S) 
    5260 
    53    REAL(wp), TARGET, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:)   :: p_fval1d 
    54    REAL(wp), TARGET, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:) :: p_fval2d 
    55  
    5661   LOGICAL ::   ll_init = .TRUE.        !: tracers  trend flag 
    57     
     62 
    5863   !! * Substitutions 
    5964#  include "do_loop_substitute.h90" 
     
    7277      INTEGER                         , INTENT(in)           ::   kt     ! ocean time-step index      
    7378      INTEGER                         , INTENT(in)           ::   Kmm    ! time level index 
    74       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in), OPTIONAL ::   pvtr   ! j-effective transport 
     79      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)    , INTENT(in), OPTIONAL ::   pvtr   ! j-effective transport 
     80      !!---------------------------------------------------------------------- 
     81      ! 
     82      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_ptr') 
     83 
     84      IF( kt == nit000 .AND. ll_init )   CALL dia_ptr_init    ! -> will define l_diaptr and nbasin 
     85      ! 
     86      IF( l_diaptr ) THEN 
     87         ! Calculate zonal integrals 
     88         IF( PRESENT( pvtr ) ) THEN 
     89            CALL dia_ptr_zint( Kmm, pvtr ) 
     90         ELSE 
     91            CALL dia_ptr_zint( Kmm ) 
     92         ENDIF 
     93 
     94         ! Calculate diagnostics only when zonal integrals have finished 
     95         IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile ) CALL dia_ptr_iom(kt, Kmm, pvtr) 
     96      ENDIF 
     97 
     98      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_ptr') 
     99      ! 
     100   END SUBROUTINE dia_ptr 
     101 
     102 
     103   SUBROUTINE dia_ptr_iom( kt, Kmm, pvtr ) 
     104      !!---------------------------------------------------------------------- 
     105      !!                  ***  ROUTINE dia_ptr_iom  *** 
     106      !!---------------------------------------------------------------------- 
     107      !! ** Purpose : Calculate diagnostics and send to XIOS 
     108      !!---------------------------------------------------------------------- 
     109      INTEGER                         , INTENT(in)           ::   kt     ! ocean time-step index 
     110      INTEGER                         , INTENT(in)           ::   Kmm    ! time level index 
     111      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)    , INTENT(in), OPTIONAL ::   pvtr   ! j-effective transport 
    75112      ! 
    76113      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jn   ! dummy loop indices 
    77       REAL(wp) ::   zsfc,zvfc               ! local scalar 
    78114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::  z2d   ! 2D workspace 
    79       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zmask   ! 3D workspace 
    80       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  z3d    ! 3D workspace 
    81       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts) ::  zts   ! 3D workspace 
    82115      REAL(wp), DIMENSION(jpj)      ::  zvsum, ztsum, zssum   ! 1D workspace 
    83116      ! 
     
    90123      !!---------------------------------------------------------------------- 
    91124      ! 
    92       IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_ptr') 
    93  
    94       IF( kt == nit000 .AND. ll_init )   CALL dia_ptr_init   ! -> will define l_diaptr and nbasin 
    95       ! 
    96       IF( .NOT. l_diaptr ) THEN 
    97          IF( ln_timing ) CALL timing_stop('dia_ptr') 
    98          RETURN 
    99       ENDIF 
    100       ! 
    101125      ALLOCATE( z3dtr(jpi,jpj,nbasin) ) 
    102       ! 
     126 
    103127      IF( PRESENT( pvtr ) ) THEN 
    104128         IF( iom_use( 'zomsf' ) ) THEN    ! effective MSF 
    105129            ALLOCATE( z4d1(jpi,jpj,jpk,nbasin) ) 
     130            ! 
    106131            DO jn = 1, nbasin                                    ! by sub-basins 
    107                z4d1(1,:,:,jn) =  ptr_sjk( pvtr(:,:,:), btmsk34(:,:,jn) )  ! zonal cumulative effective transport excluding closed seas 
    108                DO jk = jpkm1, 1, -1  
     132               z4d1(1,:,:,jn) =  pvtr_int(:,:,jp_vtr,jn)                  ! zonal cumulative effective transport excluding closed seas 
     133               DO jk = jpkm1, 1, -1 
    109134                  z4d1(1,:,jk,jn) = z4d1(1,:,jk+1,jn) - z4d1(1,:,jk,jn)    ! effective j-Stream-Function (MSF) 
    110135               END DO 
    111                DO ji = 1, jpi 
     136               DO ji = 2, jpi 
    112137                  z4d1(ji,:,:,jn) = z4d1(1,:,:,jn) 
    113138               ENDDO 
    114139            END DO 
    115140            CALL iom_put( 'zomsf', z4d1 * rc_sv ) 
     141            ! 
    116142            DEALLOCATE( z4d1 ) 
    117143         ENDIF 
     144         IF( iom_use( 'sopstove' ) .OR. iom_use( 'sophtove' ) ) THEN 
     145            ALLOCATE( sjk(jpj,jpk,nbasin), r1_sjk(jpj,jpk,nbasin), v_msf(jpj,jpk,nbasin),   & 
     146               &      zt_jk(jpj,jpk,nbasin), zs_jk(jpj,jpk,nbasin) ) 
     147            ! 
     148            DO jn = 1, nbasin 
     149               sjk(:,:,jn) = pvtr_int(:,:,jp_msk,jn) 
     150               r1_sjk(:,:,jn) = 0._wp 
     151               WHERE( sjk(:,:,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,:,jn) = 1._wp / sjk(:,:,jn) 
     152               ! i-mean T and S, j-Stream-Function, basin 
     153               zt_jk(:,:,jn) = pvtr_int(:,:,jp_tem,jn) * r1_sjk(:,:,jn) 
     154               zs_jk(:,:,jn) = pvtr_int(:,:,jp_sal,jn) * r1_sjk(:,:,jn) 
     155               v_msf(:,:,jn) = pvtr_int(:,:,jp_vtr,jn) 
     156               hstr_ove(:,jp_tem,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*zt_jk(:,:,jn), 2 ) 
     157               hstr_ove(:,jp_sal,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*zs_jk(:,:,jn), 2 ) 
     158               ! 
     159            ENDDO 
     160            DO jn = 1, nbasin 
     161               z3dtr(1,:,jn) = hstr_ove(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     162               DO ji = 2, jpi 
     163                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     164               ENDDO 
     165            ENDDO 
     166            CALL iom_put( 'sophtove', z3dtr ) 
     167            DO jn = 1, nbasin 
     168               z3dtr(1,:,jn) = hstr_ove(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     169               DO ji = 2, jpi 
     170                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     171               ENDDO 
     172            ENDDO 
     173            CALL iom_put( 'sopstove', z3dtr ) 
     174            ! 
     175            DEALLOCATE( sjk, r1_sjk, v_msf, zt_jk, zs_jk ) 
     176         ENDIF 
     177 
     178         IF( iom_use( 'sopstbtr' ) .OR. iom_use( 'sophtbtr' ) ) THEN 
     179            ! Calculate barotropic heat and salt transport here  
     180            ALLOCATE( sjk(jpj,1,nbasin), r1_sjk(jpj,1,nbasin) ) 
     181            ! 
     182            DO jn = 1, nbasin 
     183               sjk(:,1,jn) = SUM( pvtr_int(:,:,jp_msk,jn), 2 ) 
     184               r1_sjk(:,1,jn) = 0._wp 
     185               WHERE( sjk(:,1,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,1,jn) = 1._wp / sjk(:,1,jn) 
     186               ! 
     187               zvsum(:) =    SUM( pvtr_int(:,:,jp_vtr,jn), 2 ) 
     188               ztsum(:) =    SUM( pvtr_int(:,:,jp_tem,jn), 2 ) 
     189               zssum(:) =    SUM( pvtr_int(:,:,jp_sal,jn), 2 ) 
     190               hstr_btr(:,jp_tem,jn) = zvsum(:) * ztsum(:) * r1_sjk(:,1,jn) 
     191               hstr_btr(:,jp_sal,jn) = zvsum(:) * zssum(:) * r1_sjk(:,1,jn) 
     192               ! 
     193            ENDDO 
     194            DO jn = 1, nbasin 
     195               z3dtr(1,:,jn) = hstr_btr(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     196               DO ji = 2, jpi 
     197                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     198               ENDDO 
     199            ENDDO 
     200            CALL iom_put( 'sophtbtr', z3dtr ) 
     201            DO jn = 1, nbasin 
     202               z3dtr(1,:,jn) = hstr_btr(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     203               DO ji = 2, jpi 
     204                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     205               ENDDO 
     206            ENDDO 
     207            CALL iom_put( 'sopstbtr', z3dtr ) 
     208            ! 
     209            DEALLOCATE( sjk, r1_sjk ) 
     210         ENDIF 
     211         ! 
     212         hstr_ove(:,:,:) = 0._wp       ! Zero before next timestep 
     213         hstr_btr(:,:,:) = 0._wp 
     214         pvtr_int(:,:,:,:) = 0._wp 
     215      ELSE 
     216         IF( iom_use( 'zotem' ) .OR. iom_use( 'zosal' ) .OR. iom_use( 'zosrf' )  ) THEN    ! i-mean i-k-surface 
     217            ALLOCATE( z4d1(jpi,jpj,jpk,nbasin), z4d2(jpi,jpj,jpk,nbasin) ) 
     218            ! 
     219            DO jn = 1, nbasin 
     220               z4d1(1,:,:,jn) = pzon_int(:,:,jp_msk,jn) 
     221               DO ji = 2, jpi 
     222                  z4d1(ji,:,:,jn) = z4d1(1,:,:,jn) 
     223               ENDDO 
     224            ENDDO 
     225            CALL iom_put( 'zosrf', z4d1 ) 
     226            ! 
     227            DO jn = 1, nbasin 
     228               z4d2(1,:,:,jn) = pzon_int(:,:,jp_tem,jn) / MAX( z4d1(1,:,:,jn), 10.e-15 ) 
     229               DO ji = 2, jpi 
     230                  z4d2(ji,:,:,jn) = z4d2(1,:,:,jn) 
     231               ENDDO 
     232            ENDDO 
     233            CALL iom_put( 'zotem', z4d2 ) 
     234            ! 
     235            DO jn = 1, nbasin 
     236               z4d2(1,:,:,jn) = pzon_int(:,:,jp_sal,jn) / MAX( z4d1(1,:,:,jn), 10.e-15 ) 
     237               DO ji = 2, jpi 
     238                  z4d2(ji,:,:,jn) = z4d2(1,:,:,jn) 
     239               ENDDO 
     240            ENDDO 
     241            CALL iom_put( 'zosal', z4d2 ) 
     242            ! 
     243            DEALLOCATE( z4d1, z4d2 ) 
     244         ENDIF 
     245         ! 
     246         !                                ! Advective and diffusive heat and salt transport 
     247         IF( iom_use( 'sophtadv' ) .OR. iom_use( 'sopstadv' ) ) THEN   
     248            !  
     249            DO jn = 1, nbasin 
     250               z3dtr(1,:,jn) = hstr_adv(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     251               DO ji = 2, jpi 
     252                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     253               ENDDO 
     254            ENDDO 
     255            CALL iom_put( 'sophtadv', z3dtr ) 
     256            DO jn = 1, nbasin 
     257               z3dtr(1,:,jn) = hstr_adv(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     258               DO ji = 2, jpi 
     259                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     260               ENDDO 
     261            ENDDO 
     262            CALL iom_put( 'sopstadv', z3dtr ) 
     263         ENDIF 
     264         ! 
     265         IF( iom_use( 'sophtldf' ) .OR. iom_use( 'sopstldf' ) ) THEN   
     266            !  
     267            DO jn = 1, nbasin 
     268               z3dtr(1,:,jn) = hstr_ldf(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     269               DO ji = 2, jpi 
     270                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     271               ENDDO 
     272            ENDDO 
     273            CALL iom_put( 'sophtldf', z3dtr ) 
     274            DO jn = 1, nbasin 
     275               z3dtr(1,:,jn) = hstr_ldf(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     276               DO ji = 2, jpi 
     277                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     278               ENDDO 
     279            ENDDO 
     280            CALL iom_put( 'sopstldf', z3dtr ) 
     281         ENDIF 
     282         ! 
     283         IF( iom_use( 'sophteiv' ) .OR. iom_use( 'sopsteiv' ) ) THEN   
     284            !  
     285            DO jn = 1, nbasin 
     286               z3dtr(1,:,jn) = hstr_eiv(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     287               DO ji = 2, jpi 
     288                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     289               ENDDO 
     290            ENDDO 
     291            CALL iom_put( 'sophteiv', z3dtr ) 
     292            DO jn = 1, nbasin 
     293               z3dtr(1,:,jn) = hstr_eiv(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     294               DO ji = 2, jpi 
     295                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     296               ENDDO 
     297            ENDDO 
     298            CALL iom_put( 'sopsteiv', z3dtr ) 
     299         ENDIF 
     300         ! 
     301         IF( iom_use( 'sopstvtr' ) .OR. iom_use( 'sophtvtr' ) ) THEN 
     302             DO jn = 1, nbasin 
     303                z3dtr(1,:,jn) = hstr_vtr(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
     304                DO ji = 2, jpi 
     305                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     306                ENDDO 
     307             ENDDO 
     308             CALL iom_put( 'sophtvtr', z3dtr ) 
     309             DO jn = 1, nbasin 
     310               z3dtr(1,:,jn) = hstr_vtr(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
     311               DO ji = 2, jpi 
     312                  z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
     313               ENDDO 
     314            ENDDO 
     315            CALL iom_put( 'sopstvtr', z3dtr ) 
     316         ENDIF 
     317         ! 
     318         IF( iom_use( 'uocetr_vsum_cumul' ) ) THEN 
     319            IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = 0 )         ! Use full domain 
     320            CALL iom_get_var(  'uocetr_vsum_op', z2d ) ! get uocetr_vsum_op from xml 
     321            z2d(:,:) = ptr_ci_2d( z2d(:,:) )   
     322            CALL iom_put( 'uocetr_vsum_cumul', z2d ) 
     323            IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = nijtile )   ! Revert to tile domain 
     324         ENDIF 
     325         ! 
     326         hstr_adv(:,:,:) = 0._wp       ! Zero before next timestep 
     327         hstr_ldf(:,:,:) = 0._wp 
     328         hstr_eiv(:,:,:) = 0._wp 
     329         hstr_vtr(:,:,:) = 0._wp 
     330         pzon_int(:,:,:,:) = 0._wp 
     331      ENDIF 
     332      ! 
     333      DEALLOCATE( z3dtr ) 
     334      ! 
     335   END SUBROUTINE dia_ptr_iom 
     336 
     337 
     338   SUBROUTINE dia_ptr_zint( Kmm, pvtr ) 
     339      !!---------------------------------------------------------------------- 
     340      !!                    ***  ROUTINE dia_ptr_zint *** 
     341      !!---------------------------------------------------------------------- 
     342      !! ** Purpose : i and i-k sum operations on arrays 
     343      !! 
     344      !! ** Method  : - Call ptr_sjk (i sum) or ptr_sj (i-k sum) to perform the sum operation 
     345      !!              - Call ptr_sum to add this result to the sum over tiles 
     346      !! 
     347      !! ** Action  : pvtr_int - terms for volume streamfunction, heat/salt transport barotropic/overturning terms 
     348      !!              pzon_int - terms for i mean temperature/salinity 
     349      !!---------------------------------------------------------------------- 
     350      INTEGER                     , INTENT(in)           :: Kmm          ! time level index 
     351      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk), INTENT(in), OPTIONAL :: pvtr         ! j-effective transport 
     352      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE            :: zmask        ! 3D workspace 
     353      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:,:), ALLOCATABLE          :: zts          ! 4D workspace 
     354      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE            :: sjk, v_msf   ! Zonal sum: i-k surface area, j-effective transport 
     355      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE            :: zt_jk, zs_jk ! Zonal sum: i-k surface area * (T, S) 
     356      REAL(wp)                                           :: zsfc, zvfc   ! i-k surface area 
     357      INTEGER  ::   ji, jj, jk, jn                                       ! dummy loop indices 
     358      !!---------------------------------------------------------------------- 
     359 
     360      IF( PRESENT( pvtr ) ) THEN 
     361         ! i sum of effective j transport excluding closed seas 
     362         IF( iom_use( 'zomsf' ) .OR. iom_use( 'sopstove' ) .OR. iom_use( 'sophtove' ) ) THEN 
     363            ALLOCATE( v_msf(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin) ) 
     364 
     365            DO jn = 1, nbasin 
     366               v_msf(:,:,jn) = ptr_sjk( pvtr(:,:,:), btmsk34(:,:,jn) ) 
     367            ENDDO 
     368 
     369            CALL ptr_sum( pvtr_int(:,:,jp_vtr,:), v_msf(:,:,:) ) 
     370 
     371            DEALLOCATE( v_msf ) 
     372         ENDIF 
     373 
     374         ! i sum of j surface area, j surface area - temperature/salinity product on V grid 
    118375         IF(  iom_use( 'sopstove' ) .OR. iom_use( 'sophtove' ) .OR.   & 
    119376            & iom_use( 'sopstbtr' ) .OR. iom_use( 'sophtbtr' ) ) THEN 
    120             ! define fields multiplied by scalar 
     377            ALLOCATE( zmask(A2D(nn_hls),jpk), zts(A2D(nn_hls),jpk,jpts), & 
     378               &      sjk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin), & 
     379               &      zt_jk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin), zs_jk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin) ) 
     380 
    121381            zmask(:,:,:) = 0._wp 
    122382            zts(:,:,:,:) = 0._wp 
     383 
    123384            DO_3D( 1, 0, 1, 1, 1, jpkm1 ) 
    124385               zvfc = e1v(ji,jj) * e3v(ji,jj,jk,Kmm) 
    125386               zmask(ji,jj,jk)      = vmask(ji,jj,jk)      * zvfc 
    126                zts(ji,jj,jk,jp_tem) = (ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm)+ts(ji,jj+1,jk,jp_tem,Kmm)) * 0.5 * zvfc  !Tracers averaged onto V grid 
     387               zts(ji,jj,jk,jp_tem) = (ts(ji,jj,jk,jp_tem,Kmm)+ts(ji,jj+1,jk,jp_tem,Kmm)) * 0.5 * zvfc !Tracers averaged onto V grid 
    127388               zts(ji,jj,jk,jp_sal) = (ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm)+ts(ji,jj+1,jk,jp_sal,Kmm)) * 0.5 * zvfc 
    128389            END_3D 
    129          ENDIF 
    130          IF( iom_use( 'sopstove' ) .OR. iom_use( 'sophtove' ) ) THEN 
    131             DO jn = 1, nbasin 
    132                ALLOCATE( sjk(jpj,jpk,nbasin), r1_sjk(jpj,jpk,nbasin), v_msf(jpj,jpk,nbasin),   & 
    133                   &                          zt_jk(jpj,jpk,nbasin), zs_jk(jpj,jpk,nbasin) ) 
    134                sjk(:,:,jn) = ptr_sjk( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    135                r1_sjk(:,:,jn) = 0._wp 
    136                WHERE( sjk(:,:,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,:,jn) = 1._wp / sjk(:,:,jn) 
    137                ! i-mean T and S, j-Stream-Function, basin 
    138                zt_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) * r1_sjk(:,:,jn) 
    139                zs_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) * r1_sjk(:,:,jn) 
    140                v_msf(:,:,jn) = ptr_sjk( pvtr(:,:,:), btmsk34(:,:,jn) )  
    141                hstr_ove(:,jp_tem,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*zt_jk(:,:,jn), 2 ) 
    142                hstr_ove(:,jp_sal,jn) = SUM( v_msf(:,:,jn)*zs_jk(:,:,jn), 2 ) 
    143                DEALLOCATE( sjk, r1_sjk, v_msf, zt_jk, zs_jk ) 
    144                ! 
    145             ENDDO 
    146             DO jn = 1, nbasin 
    147                z3dtr(1,:,jn) = hstr_ove(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    148                DO ji = 1, jpi 
    149                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    150                ENDDO 
    151             ENDDO 
    152             CALL iom_put( 'sophtove', z3dtr ) 
    153             DO jn = 1, nbasin 
    154                z3dtr(1,:,jn) = hstr_ove(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    155                DO ji = 1, jpi 
    156                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    157                ENDDO 
    158             ENDDO 
    159             CALL iom_put( 'sopstove', z3dtr ) 
    160          ENDIF 
    161  
    162          IF( iom_use( 'sopstbtr' ) .OR. iom_use( 'sophtbtr' ) ) THEN 
    163             ! Calculate barotropic heat and salt transport here  
    164             DO jn = 1, nbasin 
    165                ALLOCATE( sjk(jpj,1,nbasin), r1_sjk(jpj,1,nbasin) ) 
    166                sjk(:,1,jn) = ptr_sj( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    167                r1_sjk(:,1,jn) = 0._wp 
    168                WHERE( sjk(:,1,jn) /= 0._wp )   r1_sjk(:,1,jn) = 1._wp / sjk(:,1,jn) 
    169                ! 
    170                zvsum(:) = ptr_sj( pvtr(:,:,:), btmsk34(:,:,jn) ) 
    171                ztsum(:) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) 
    172                zssum(:) = ptr_sj( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) 
    173                hstr_btr(:,jp_tem,jn) = zvsum(:) * ztsum(:) * r1_sjk(:,1,jn) 
    174                hstr_btr(:,jp_sal,jn) = zvsum(:) * zssum(:) * r1_sjk(:,1,jn) 
    175                DEALLOCATE( sjk, r1_sjk ) 
    176                ! 
    177             ENDDO 
    178             DO jn = 1, nbasin 
    179                z3dtr(1,:,jn) = hstr_btr(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    180                DO ji = 1, jpi 
    181                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    182                ENDDO 
    183             ENDDO 
    184             CALL iom_put( 'sophtbtr', z3dtr ) 
    185             DO jn = 1, nbasin 
    186                z3dtr(1,:,jn) = hstr_btr(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    187                DO ji = 1, jpi 
    188                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    189                ENDDO 
    190             ENDDO 
    191             CALL iom_put( 'sopstbtr', z3dtr ) 
    192          ENDIF  
    193          ! 
     390 
     391            DO jn = 1, nbasin 
     392               sjk(:,:,jn)   = ptr_sjk( zmask(:,:,:)     , btmsk(:,:,jn) ) 
     393               zt_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) 
     394               zs_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) 
     395            ENDDO 
     396 
     397            CALL ptr_sum( pvtr_int(:,:,jp_msk,:), sjk(:,:,:)   ) 
     398            CALL ptr_sum( pvtr_int(:,:,jp_tem,:), zt_jk(:,:,:) ) 
     399            CALL ptr_sum( pvtr_int(:,:,jp_sal,:), zs_jk(:,:,:) ) 
     400 
     401            DEALLOCATE( zmask, zts, sjk, zt_jk, zs_jk ) 
     402         ENDIF 
    194403      ELSE 
    195          ! 
    196          zmask(:,:,:) = 0._wp 
    197          zts(:,:,:,:) = 0._wp 
    198          IF( iom_use( 'zotem' ) .OR. iom_use( 'zosal' ) .OR. iom_use( 'zosrf' )  ) THEN    ! i-mean i-k-surface  
    199             ALLOCATE( z4d1(jpi,jpj,jpk,nbasin), z4d2(jpi,jpj,jpk,nbasin) ) 
     404         ! i sum of j surface area - temperature/salinity product on T grid 
     405         IF( iom_use( 'zotem' ) .OR. iom_use( 'zosal' ) .OR. iom_use( 'zosrf' )  ) THEN 
     406            ALLOCATE( zmask(A2D(nn_hls),jpk), zts(A2D(nn_hls),jpk,jpts), & 
     407               &      sjk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin), & 
     408               &      zt_jk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin), zs_jk(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin) ) 
     409 
     410            zmask(:,:,:) = 0._wp 
     411            zts(:,:,:,:) = 0._wp 
     412 
    200413            DO_3D( 1, 1, 1, 1, 1, jpkm1 ) 
    201414               zsfc = e1t(ji,jj) * e3t(ji,jj,jk,Kmm) 
     
    204417               zts(ji,jj,jk,jp_sal) = ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm) * zsfc 
    205418            END_3D 
    206             ! 
    207             DO jn = 1, nbasin 
    208                zmask(1,:,:) = ptr_sjk( zmask(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    209                DO ji = 1, jpi 
    210                   zmask(ji,:,:) = zmask(1,:,:) 
    211                ENDDO 
    212                z4d1(:,:,:,jn) = zmask(:,:,:) 
    213             ENDDO 
    214             CALL iom_put( 'zosrf', z4d1 ) 
    215             ! 
    216             DO jn = 1, nbasin 
    217                z4d2(1,:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) & 
    218                   &            / MAX( z4d1(1,:,:,jn), 10.e-15 ) 
    219                DO ji = 1, jpi 
    220                   z4d2(ji,:,:,jn) = z4d2(1,:,:,jn) 
    221                ENDDO 
    222             ENDDO 
    223             CALL iom_put( 'zotem', z4d2 ) 
    224             ! 
    225             DO jn = 1, nbasin 
    226                z4d2(1,:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) & 
    227                   &            / MAX( z4d1(1,:,:,jn), 10.e-15 ) 
    228                DO ji = 1, jpi 
    229                   z4d2(ji,:,:,jn) = z4d2(1,:,:,jn) 
    230                ENDDO 
    231             ENDDO 
    232             CALL iom_put( 'zosal', z4d2 ) 
    233             DEALLOCATE( z4d1, z4d2 ) 
    234             ! 
    235          ENDIF 
    236          ! 
    237          !                                ! Advective and diffusive heat and salt transport 
    238          IF( iom_use( 'sophtadv' ) .OR. iom_use( 'sopstadv' ) ) THEN   
    239             !  
    240             DO jn = 1, nbasin 
    241                z3dtr(1,:,jn) = hstr_adv(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    242                DO ji = 1, jpi 
    243                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    244                ENDDO 
    245             ENDDO 
    246             CALL iom_put( 'sophtadv', z3dtr ) 
    247             DO jn = 1, nbasin 
    248                z3dtr(1,:,jn) = hstr_adv(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    249                DO ji = 1, jpi 
    250                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    251                ENDDO 
    252             ENDDO 
    253             CALL iom_put( 'sopstadv', z3dtr ) 
    254          ENDIF 
    255          ! 
    256          IF( iom_use( 'sophtldf' ) .OR. iom_use( 'sopstldf' ) ) THEN   
    257             !  
    258             DO jn = 1, nbasin 
    259                z3dtr(1,:,jn) = hstr_ldf(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    260                DO ji = 1, jpi 
    261                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    262                ENDDO 
    263             ENDDO 
    264             CALL iom_put( 'sophtldf', z3dtr ) 
    265             DO jn = 1, nbasin 
    266                z3dtr(1,:,jn) = hstr_ldf(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    267                DO ji = 1, jpi 
    268                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    269                ENDDO 
    270             ENDDO 
    271             CALL iom_put( 'sopstldf', z3dtr ) 
    272          ENDIF 
    273          ! 
    274          IF( iom_use( 'sophteiv' ) .OR. iom_use( 'sopsteiv' ) ) THEN   
    275             !  
    276             DO jn = 1, nbasin 
    277                z3dtr(1,:,jn) = hstr_eiv(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    278                DO ji = 1, jpi 
    279                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    280                ENDDO 
    281             ENDDO 
    282             CALL iom_put( 'sophteiv', z3dtr ) 
    283             DO jn = 1, nbasin 
    284                z3dtr(1,:,jn) = hstr_eiv(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    285                DO ji = 1, jpi 
    286                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    287                ENDDO 
    288             ENDDO 
    289             CALL iom_put( 'sopsteiv', z3dtr ) 
    290          ENDIF 
    291          ! 
     419 
     420            DO jn = 1, nbasin 
     421               sjk(:,:,jn)   = ptr_sjk( zmask(:,:,:)     , btmsk(:,:,jn) ) 
     422               zt_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_tem), btmsk(:,:,jn) ) 
     423               zs_jk(:,:,jn) = ptr_sjk( zts(:,:,:,jp_sal), btmsk(:,:,jn) ) 
     424            ENDDO 
     425 
     426            CALL ptr_sum( pzon_int(:,:,jp_msk,:), sjk(:,:,:)   ) 
     427            CALL ptr_sum( pzon_int(:,:,jp_tem,:), zt_jk(:,:,:) ) 
     428            CALL ptr_sum( pzon_int(:,:,jp_sal,:), zs_jk(:,:,:) ) 
     429 
     430            DEALLOCATE( zmask, zts, sjk, zt_jk, zs_jk ) 
     431         ENDIF 
     432 
     433         ! i-k sum of j surface area - temperature/salinity product on V grid 
    292434         IF( iom_use( 'sopstvtr' ) .OR. iom_use( 'sophtvtr' ) ) THEN 
     435            ALLOCATE( zts(A2D(nn_hls),jpk,jpts) ) 
     436 
    293437            zts(:,:,:,:) = 0._wp 
     438 
    294439            DO_3D( 1, 0, 1, 1, 1, jpkm1 ) 
    295440               zvfc = e1v(ji,jj) * e3v(ji,jj,jk,Kmm) 
     
    297442               zts(ji,jj,jk,jp_sal) = (ts(ji,jj,jk,jp_sal,Kmm)+ts(ji,jj+1,jk,jp_sal,Kmm)) * 0.5 * zvfc 
    298443            END_3D 
    299              CALL dia_ptr_hst( jp_tem, 'vtr', zts(:,:,:,jp_tem) ) 
    300              CALL dia_ptr_hst( jp_sal, 'vtr', zts(:,:,:,jp_sal) ) 
    301              DO jn = 1, nbasin 
    302                 z3dtr(1,:,jn) = hstr_vtr(:,jp_tem,jn) * rc_pwatt  !  (conversion in PW) 
    303                 DO ji = 1, jpi 
    304                    z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    305                 ENDDO 
    306              ENDDO 
    307              CALL iom_put( 'sophtvtr', z3dtr ) 
    308              DO jn = 1, nbasin 
    309                z3dtr(1,:,jn) = hstr_vtr(:,jp_sal,jn) * rc_ggram !  (conversion in Gg) 
    310                DO ji = 1, jpi 
    311                   z3dtr(ji,:,jn) = z3dtr(1,:,jn) 
    312                ENDDO 
    313             ENDDO 
    314             CALL iom_put( 'sopstvtr', z3dtr ) 
    315          ENDIF 
    316          ! 
    317          IF( iom_use( 'uocetr_vsum_cumul' ) ) THEN 
    318             CALL iom_get_var(  'uocetr_vsum_op', z2d ) ! get uocetr_vsum_op from xml 
    319             z2d(:,:) = ptr_ci_2d( z2d(:,:) )   
    320             CALL iom_put( 'uocetr_vsum_cumul', z2d ) 
    321          ENDIF 
    322          ! 
     444 
     445            CALL dia_ptr_hst( jp_tem, 'vtr', zts(:,:,:,jp_tem) ) 
     446            CALL dia_ptr_hst( jp_sal, 'vtr', zts(:,:,:,jp_sal) ) 
     447 
     448            DEALLOCATE( zts ) 
     449         ENDIF 
    323450      ENDIF 
    324       ! 
    325       DEALLOCATE( z3dtr ) 
    326       ! 
    327       IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_ptr') 
    328       ! 
    329    END SUBROUTINE dia_ptr 
     451   END SUBROUTINE dia_ptr_zint 
    330452 
    331453 
     
    340462      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) :: zmsk 
    341463      !!---------------------------------------------------------------------- 
    342        
     464 
    343465      ! l_diaptr is defined with iom_use 
    344466      !   --> dia_ptr_init must be done after the call to iom_init 
     
    347469         &       iom_use( 'zosrf'    ) .OR. iom_use( 'sopstove' ) .OR. iom_use( 'sophtove' ) .OR.  & 
    348470         &       iom_use( 'sopstbtr' ) .OR. iom_use( 'sophtbtr' ) .OR. iom_use( 'sophtadv' ) .OR.  & 
    349          &       iom_use( 'sopstadv' ) .OR. iom_use( 'sophtldf' ) .OR. iom_use( 'sopstldf' ) .OR.  &  
     471         &       iom_use( 'sopstadv' ) .OR. iom_use( 'sophtldf' ) .OR. iom_use( 'sopstldf' ) .OR.  & 
    350472         &       iom_use( 'sophteiv' ) .OR. iom_use( 'sopsteiv' ) .OR. iom_use( 'sopstvtr' ) .OR.  & 
    351          &       iom_use( 'sophtvtr' ) .OR. iom_use( 'uocetr_vsum_cumul' )  
    352   
     473         &       iom_use( 'sophtvtr' ) .OR. iom_use( 'uocetr_vsum_cumul' ) 
     474       
    353475      IF(lwp) THEN                     ! Control print 
    354476         WRITE(numout,*) 
     
    398520         hstr_btr(:,:,:) = 0._wp           ! 
    399521         hstr_vtr(:,:,:) = 0._wp           ! 
     522         pvtr_int(:,:,:,:) = 0._wp 
     523         pzon_int(:,:,:,:) = 0._wp 
    400524         ! 
    401525         ll_init = .FALSE. 
     
    415539      INTEGER                         , INTENT(in )  :: ktra  ! tracer index 
    416540      CHARACTER(len=3)                , INTENT(in)   :: cptr  ! transport type  'adv'/'ldf'/'eiv' 
    417       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in)   :: pvflx   ! 3D input array of advection/diffusion 
     541      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)    , INTENT(in)   :: pvflx ! 3D input array of advection/diffusion 
     542      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls),nbasin)                 :: zsj   ! 
    418543      INTEGER                                        :: jn    ! 
    419544 
     545      DO jn = 1, nbasin 
     546         zsj(:,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
     547      ENDDO 
    420548      ! 
    421549      IF( cptr == 'adv' ) THEN 
    422          IF( ktra == jp_tem )  THEN 
    423              DO jn = 1, nbasin 
    424                 hstr_adv(:,jp_tem,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    425              ENDDO 
    426          ENDIF 
    427          IF( ktra == jp_sal )  THEN 
    428              DO jn = 1, nbasin 
    429                 hstr_adv(:,jp_sal,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    430              ENDDO 
    431          ENDIF 
     550         IF( ktra == jp_tem )  CALL ptr_sum( hstr_adv(:,jp_tem,:), zsj(:,:) ) 
     551         IF( ktra == jp_sal )  CALL ptr_sum( hstr_adv(:,jp_sal,:), zsj(:,:) ) 
     552      ELSE IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
     553         IF( ktra == jp_tem )  CALL ptr_sum( hstr_ldf(:,jp_tem,:), zsj(:,:) ) 
     554         IF( ktra == jp_sal )  CALL ptr_sum( hstr_ldf(:,jp_sal,:), zsj(:,:) ) 
     555      ELSE IF( cptr == 'eiv' ) THEN 
     556         IF( ktra == jp_tem )  CALL ptr_sum( hstr_eiv(:,jp_tem,:), zsj(:,:) ) 
     557         IF( ktra == jp_sal )  CALL ptr_sum( hstr_eiv(:,jp_sal,:), zsj(:,:) ) 
     558      ELSE IF( cptr == 'vtr' ) THEN 
     559         IF( ktra == jp_tem )  CALL ptr_sum( hstr_vtr(:,jp_tem,:), zsj(:,:) ) 
     560         IF( ktra == jp_sal )  CALL ptr_sum( hstr_vtr(:,jp_sal,:), zsj(:,:) ) 
    432561      ENDIF 
    433562      ! 
    434       IF( cptr == 'ldf' ) THEN 
    435          IF( ktra == jp_tem )  THEN 
    436              DO jn = 1, nbasin 
    437                 hstr_ldf(:,jp_tem,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    438              ENDDO 
    439          ENDIF 
    440          IF( ktra == jp_sal )  THEN 
    441              DO jn = 1, nbasin 
    442                 hstr_ldf(:,jp_sal,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    443              ENDDO 
    444          ENDIF 
     563   END SUBROUTINE dia_ptr_hst 
     564 
     565 
     566   SUBROUTINE ptr_sum_2d( phstr, pva ) 
     567      !!---------------------------------------------------------------------- 
     568      !!                    ***  ROUTINE ptr_sum_2d *** 
     569      !!---------------------------------------------------------------------- 
     570      !! ** Purpose : Add two 2D arrays with (j,nbasin) dimensions 
     571      !! 
     572      !! ** Method  : - phstr = phstr + pva 
     573      !!              - Call mpp_sum if the final tile 
     574      !! 
     575      !! ** Action  : phstr 
     576      !!---------------------------------------------------------------------- 
     577      REAL(wp), DIMENSION(jpj,nbasin) , INTENT(inout)         ::  phstr  ! 
     578      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls),nbasin), INTENT(in)            ::  pva    ! 
     579      INTEGER                                               ::  jj 
     580#if defined key_mpp_mpi 
     581      INTEGER, DIMENSION(1)           ::  ish1d 
     582      INTEGER, DIMENSION(2)           ::  ish2d 
     583      REAL(wp), DIMENSION(jpj*nbasin) ::  zwork 
     584#endif 
     585 
     586      DO jj = ntsj, ntej 
     587         phstr(jj,:) = phstr(jj,:)  + pva(jj,:) 
     588      END DO 
     589 
     590#if defined key_mpp_mpi 
     591      IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile ) THEN 
     592         ish1d(1) = jpj*nbasin 
     593         ish2d(1) = jpj ; ish2d(2) = nbasin 
     594         zwork(:) = RESHAPE( phstr(:,:), ish1d ) 
     595         CALL mpp_sum( 'diaptr', zwork, ish1d(1), ncomm_znl ) 
     596         phstr(:,:) = RESHAPE( zwork, ish2d ) 
    445597      ENDIF 
    446       ! 
    447       IF( cptr == 'eiv' ) THEN 
    448          IF( ktra == jp_tem )  THEN 
    449              DO jn = 1, nbasin 
    450                 hstr_eiv(:,jp_tem,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    451              ENDDO 
    452          ENDIF 
    453          IF( ktra == jp_sal )  THEN 
    454              DO jn = 1, nbasin 
    455                 hstr_eiv(:,jp_sal,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    456              ENDDO 
    457          ENDIF 
     598#endif 
     599   END SUBROUTINE ptr_sum_2d 
     600 
     601 
     602   SUBROUTINE ptr_sum_3d( phstr, pva ) 
     603      !!---------------------------------------------------------------------- 
     604      !!                    ***  ROUTINE ptr_sum_3d *** 
     605      !!---------------------------------------------------------------------- 
     606      !! ** Purpose : Add two 3D arrays with (j,k,nbasin) dimensions 
     607      !! 
     608      !! ** Method  : - phstr = phstr + pva 
     609      !!              - Call mpp_sum if the final tile 
     610      !! 
     611      !! ** Action  : phstr 
     612      !!---------------------------------------------------------------------- 
     613      REAL(wp), DIMENSION(jpj,jpk,nbasin) , INTENT(inout)     ::  phstr  ! 
     614      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls),jpk,nbasin), INTENT(in)        ::  pva    ! 
     615      INTEGER                                               ::  jj, jk 
     616#if defined key_mpp_mpi 
     617      INTEGER, DIMENSION(1)              ::  ish1d 
     618      INTEGER, DIMENSION(3)              ::  ish3d 
     619      REAL(wp), DIMENSION(jpj*jpk*nbasin)  ::  zwork 
     620#endif 
     621 
     622      DO jk = 1, jpk 
     623         DO jj = ntsj, ntej 
     624            phstr(jj,jk,:) = phstr(jj,jk,:)  + pva(jj,jk,:) 
     625         END DO 
     626      END DO 
     627 
     628#if defined key_mpp_mpi 
     629      IF( ntile == 0 .OR. ntile == nijtile ) THEN 
     630         ish1d(1) = jpj*jpk*nbasin 
     631         ish3d(1) = jpj ; ish3d(2) = jpk ; ish3d(3) = nbasin 
     632         zwork(:) = RESHAPE( phstr(:,:,:), ish1d ) 
     633         CALL mpp_sum( 'diaptr', zwork, ish1d(1), ncomm_znl ) 
     634         phstr(:,:,:) = RESHAPE( zwork, ish3d ) 
    458635      ENDIF 
    459       ! 
    460       IF( cptr == 'vtr' ) THEN 
    461          IF( ktra == jp_tem )  THEN 
    462              DO jn = 1, nbasin 
    463                 hstr_vtr(:,jp_tem,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    464              ENDDO 
    465          ENDIF 
    466          IF( ktra == jp_sal )  THEN 
    467              DO jn = 1, nbasin 
    468                 hstr_vtr(:,jp_sal,jn) = ptr_sj( pvflx(:,:,:), btmsk(:,:,jn) ) 
    469              ENDDO 
    470          ENDIF 
    471       ENDIF 
    472       ! 
    473    END SUBROUTINE dia_ptr_hst 
     636#endif 
     637   END SUBROUTINE ptr_sum_3d 
    474638 
    475639 
     
    479643      !!---------------------------------------------------------------------- 
    480644      INTEGER               ::   dia_ptr_alloc   ! return value 
    481       INTEGER, DIMENSION(3) ::   ierr 
     645      INTEGER, DIMENSION(2) ::   ierr 
    482646      !!---------------------------------------------------------------------- 
    483647      ierr(:) = 0 
     
    491655            &      hstr_ldf(jpj,jpts,nbasin), hstr_vtr(jpj,jpts,nbasin), STAT=ierr(1)  ) 
    492656            ! 
    493          ALLOCATE( p_fval1d(jpj), p_fval2d(jpj,jpk), Stat=ierr(2)) 
     657         ALLOCATE( pvtr_int(jpj,jpk,jpts+2,nbasin), & 
     658            &      pzon_int(jpj,jpk,jpts+1,nbasin), STAT=ierr(2) ) 
    494659         ! 
    495660         dia_ptr_alloc = MAXVAL( ierr ) 
     
    511676      !! ** Action  : - p_fval: i-k-mean poleward flux of pvflx 
    512677      !!---------------------------------------------------------------------- 
    513       REAL(wp), INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj,jpk)  ::   pvflx  ! mask flux array at V-point 
    514       REAL(wp), INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj)      ::   pmsk   ! Optional 2D basin mask 
     678      REAL(wp), INTENT(in), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk)  ::   pvflx  ! mask flux array at V-point 
     679      REAL(wp), INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj)  ::   pmsk   ! Optional 2D basin mask 
    515680      ! 
    516681      INTEGER                  ::   ji, jj, jk   ! dummy loop arguments 
    517       INTEGER                  ::   ijpj         ! ??? 
    518       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:) :: p_fval  ! function value 
     682      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls)) :: p_fval  ! function value 
    519683      !!-------------------------------------------------------------------- 
    520684      ! 
    521       p_fval => p_fval1d 
    522  
    523       ijpj = jpj 
    524685      p_fval(:) = 0._wp 
    525686      DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 ) 
    526687         p_fval(jj) = p_fval(jj) + pvflx(ji,jj,jk) * pmsk(ji,jj) * tmask_i(ji,jj) 
    527688      END_3D 
    528 #if defined key_mpp_mpi 
    529       CALL mpp_sum( 'diaptr', p_fval, ijpj, ncomm_znl) 
    530 #endif 
    531       ! 
    532689   END FUNCTION ptr_sj_3d 
    533690 
     
    544701      !! ** Action  : - p_fval: i-k-mean poleward flux of pvflx 
    545702      !!---------------------------------------------------------------------- 
    546       REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj) ::   pvflx  ! mask flux array at V-point 
     703      REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(A2D(nn_hls))    ::   pvflx  ! mask flux array at V-point 
    547704      REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj) ::   pmsk   ! Optional 2D basin mask 
    548705      ! 
    549706      INTEGER                  ::   ji,jj       ! dummy loop arguments 
    550       INTEGER                  ::   ijpj        ! ??? 
    551       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:) :: p_fval ! function value 
     707      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls)) :: p_fval ! function value 
    552708      !!-------------------------------------------------------------------- 
    553       !  
    554       p_fval => p_fval1d 
    555  
    556       ijpj = jpj 
     709      ! 
    557710      p_fval(:) = 0._wp 
    558711      DO_2D( 0, 0, 0, 0 ) 
    559712         p_fval(jj) = p_fval(jj) + pvflx(ji,jj) * pmsk(ji,jj) * tmask_i(ji,jj) 
    560713      END_2D 
    561 #if defined key_mpp_mpi 
    562       CALL mpp_sum( 'diaptr', p_fval, ijpj, ncomm_znl ) 
    563 #endif 
    564       !  
    565714   END FUNCTION ptr_sj_2d 
    566715 
     
    588737            p_fval(ji,jj) = p_fval(ji,jj-1) + pva(ji,jj) * tmask_i(ji,jj) 
    589738         END_2D 
    590          CALL lbc_lnk( 'diaptr', p_fval, 'U', -1.0_wp ) 
    591739      END DO 
    592740      !  
     
    607755      !! 
    608756      IMPLICIT none 
    609       REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   pta    ! mask flux array at V-point 
    610       REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   pmsk   ! Optional 2D basin mask 
     757      REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk) ::   pta    ! mask flux array at V-point 
     758      REAL(wp) , INTENT(in), DIMENSION(jpi,jpj) ::   pmsk   ! Optional 2D basin mask 
    611759      !! 
    612760      INTEGER                           :: ji, jj, jk ! dummy loop arguments 
    613       REAL(wp), POINTER, DIMENSION(:,:) :: p_fval     ! return function value 
    614 #if defined key_mpp_mpi 
    615       INTEGER, DIMENSION(1) ::   ish 
    616       INTEGER, DIMENSION(2) ::   ish2 
    617       INTEGER               ::   ijpjjpk 
    618       REAL(wp), DIMENSION(jpj*jpk) ::   zwork    ! mask flux array at V-point 
    619 #endif 
     761      REAL(wp), DIMENSION(A1Dj(nn_hls),jpk) :: p_fval     ! return function value 
    620762      !!-------------------------------------------------------------------- 
    621763      ! 
    622       p_fval => p_fval2d 
    623  
    624764      p_fval(:,:) = 0._wp 
    625765      ! 
     
    627767         p_fval(jj,jk) = p_fval(jj,jk) + pta(ji,jj,jk) * pmsk(ji,jj) * tmask_i(ji,jj) 
    628768      END_3D 
    629       ! 
    630 #if defined key_mpp_mpi 
    631       ijpjjpk = jpj*jpk 
    632       ish(1) = ijpjjpk  ;   ish2(1) = jpj   ;   ish2(2) = jpk 
    633       zwork(1:ijpjjpk) = RESHAPE( p_fval, ish ) 
    634       CALL mpp_sum( 'diaptr', zwork, ijpjjpk, ncomm_znl ) 
    635       p_fval(:,:) = RESHAPE( zwork, ish2 ) 
    636 #endif 
    637       ! 
    638769   END FUNCTION ptr_sjk 
    639770 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/daymod.F90

    r13710 r14002  
    149149      CALL day( nit000 ) 
    150150      ! 
    151       IF( lwxios ) THEN 
    152 ! define variables in restart file when writing with XIOS 
    153           CALL iom_set_rstw_var_active('kt') 
    154           CALL iom_set_rstw_var_active('ndastp') 
    155           CALL iom_set_rstw_var_active('adatrj') 
    156           CALL iom_set_rstw_var_active('ntime') 
    157       ENDIF 
    158  
    159151   END SUBROUTINE day_init 
    160152 
     
    324316 
    325317      IF( TRIM(cdrw) == 'READ' ) THEN 
    326  
    327318         IF( iom_varid( numror, 'kt', ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN 
    328319            ! Get Calendar informations 
    329             CALL iom_get( numror, 'kt', zkt, ldxios = lrxios )   ! last time-step of previous run 
     320            CALL iom_get( numror, 'kt', zkt )   ! last time-step of previous run 
    330321            IF(lwp) THEN 
    331322               WRITE(numout,*) ' *** Info read in restart : ' 
     
    346337            IF ( nrstdt == 2 ) THEN 
    347338               ! read the parameters corresponding to nit000 - 1 (last time step of previous run) 
    348                CALL iom_get( numror, 'ndastp', zndastp, ldxios = lrxios ) 
     339               CALL iom_get( numror, 'ndastp', zndastp ) 
    349340               ndastp = NINT( zndastp ) 
    350                CALL iom_get( numror, 'adatrj', adatrj , ldxios = lrxios ) 
    351           CALL iom_get( numror, 'ntime' , ktime  , ldxios = lrxios ) 
     341               CALL iom_get( numror, 'adatrj', adatrj ) 
     342          CALL iom_get( numror, 'ntime' , ktime  ) 
    352343               nn_time0 = NINT(ktime) 
    353344               ! calculate start time in hours and minutes 
     
    410401         ENDIF 
    411402         ! calendar control 
    412          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          ) 
    413          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'kt'     , REAL( kt    , wp)  , ldxios = lwxios )   ! time-step 
    414          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ndastp' , REAL( ndastp, wp)  , ldxios = lwxios )   ! date 
    415          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'adatrj' , adatrj             , ldxios = lwxios            )   ! number of elapsed days since 
     403         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'kt'     , REAL( kt    , wp)   )   ! time-step 
     404         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ndastp' , REAL( ndastp, wp)   )   ! date 
     405         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'adatrj' , adatrj              )   ! number of elapsed days since 
    416406         !                                                                                                   ! the begining of the run [s] 
    417          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ntime'  , REAL( nn_time0, wp), ldxios = lwxios ) ! time 
    418          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          ) 
     407         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ntime'  , REAL( nn_time0, wp) ) ! time 
    419408      ENDIF 
    420409      ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/dom_oce.F90

    r13710 r14002  
    7474   LOGICAL, PUBLIC ::   l_Iperio, l_Jperio   !   should we explicitely take care I/J periodicity  
    7575 
     76   ! Tiling namelist 
     77   LOGICAL, PUBLIC ::   ln_tile 
     78   INTEGER         ::   nn_ltile_i, nn_ltile_j 
     79 
     80   ! Domain tiling (all tiles) 
     81   INTEGER, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) ::   ntsi_a       !: start of internal part of tile domain 
     82   INTEGER, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) ::   ntsj_a       ! 
     83   INTEGER, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) ::   ntei_a       !: end of internal part of tile domain 
     84   INTEGER, PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:) ::   ntej_a       ! 
     85 
    7686   !                             !: domain MPP decomposition parameters 
    7787   INTEGER             , PUBLIC ::   nimpp, njmpp     !: i- & j-indexes for mpp-subdomain left bottom 
     
    8797   INTEGER, PUBLIC ::   noea, nowe        !: index of the local neighboring processors in 
    8898   INTEGER, PUBLIC ::   noso, nono        !: east, west, south and north directions 
     99   INTEGER, PUBLIC ::   nones, nonws        !: north-east, north-west directions for sending  
     100   INTEGER, PUBLIC ::   noses, nosws        !: south-east, south-west directions for sending 
     101   INTEGER, PUBLIC ::   noner, nonwr        !: north-east, north-west directions for receiving 
     102   INTEGER, PUBLIC ::   noser, noswr        !: south-east, south-west directions for receiving 
    89103   INTEGER, PUBLIC ::   nidom             !: ??? 
    90104 
     
    296310      ALLOCATE( e3t(jpi,jpj,jpk,jpt) , e3u (jpi,jpj,jpk,jpt) , e3v (jpi,jpj,jpk,jpt) , e3f(jpi,jpj,jpk) ,      & 
    297311         &      e3w(jpi,jpj,jpk,jpt) , e3uw(jpi,jpj,jpk,jpt) , e3vw(jpi,jpj,jpk,jpt)                    ,  STAT=ierr(ii) ) 
    298 #endif   
     312#endif 
    299313         ! 
    300314      ii = ii+1 
    301315      ALLOCATE( r3t  (jpi,jpj,jpt)   , r3u  (jpi,jpj,jpt)    , r3v  (jpi,jpj,jpt)    , r3f  (jpi,jpj) ,  & 
    302          &      r3t_f(jpi,jpj)       , r3u_f(jpi,jpj)        , r3v_f(jpi,jpj)                         ,  STAT=ierr(ii) )        
     316         &      r3t_f(jpi,jpj)       , r3u_f(jpi,jpj)        , r3v_f(jpi,jpj)                         ,  STAT=ierr(ii) ) 
    303317         ! 
    304318      ii = ii+1 
     
    317331         ! 
    318332      ii = ii+1 
    319       ALLOCATE( risfdep(jpi,jpj) , bathy(jpi,jpj) , STAT=ierr(ii)  )  
     333      ALLOCATE( risfdep(jpi,jpj) , bathy(jpi,jpj) , STAT=ierr(ii)  ) 
    320334         ! 
    321335      ii = ii+1 
     
    323337         ! 
    324338      ii = ii+1 
    325       ALLOCATE( tmask_i(jpi,jpj) , tmask_h(jpi,jpj) ,                        &  
     339      ALLOCATE( tmask_i(jpi,jpj) , tmask_h(jpi,jpj) ,                        & 
    326340         &      ssmask (jpi,jpj) , ssumask(jpi,jpj) , ssvmask(jpi,jpj) , ssfmask(jpi,jpj) ,     & 
    327341         &      mbkt   (jpi,jpj) , mbku   (jpi,jpj) , mbkv   (jpi,jpj) ,                    STAT=ierr(ii) ) 
     
    331345         ! 
    332346      ii = ii+1 
    333       ALLOCATE( tmask(jpi,jpj,jpk) , umask(jpi,jpj,jpk) ,     &  
     347      ALLOCATE( tmask(jpi,jpj,jpk) , umask(jpi,jpj,jpk) ,     & 
    334348         &      vmask(jpi,jpj,jpk) , fmask(jpi,jpj,jpk) , STAT=ierr(ii) ) 
    335349         ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/domain.F90

    r13710 r14002  
    4545   USE closea , ONLY : dom_clo ! closed seas 
    4646   ! 
     47   USE prtctl         ! Print control (prt_ctl_info routine) 
    4748   USE in_out_manager ! I/O manager 
    4849   USE iom            ! I/O library 
     
    5556   PUBLIC   dom_init     ! called by nemogcm.F90 
    5657   PUBLIC   domain_cfg   ! called by nemogcm.F90 
     58   PUBLIC   dom_tile     ! called by step.F90 
    5759 
    5860   !!------------------------------------------------------------------------- 
     
    6365CONTAINS 
    6466 
    65    SUBROUTINE dom_init( Kbb, Kmm, Kaa, cdstr ) 
     67   SUBROUTINE dom_init( Kbb, Kmm, Kaa ) 
    6668      !!---------------------------------------------------------------------- 
    6769      !!                  ***  ROUTINE dom_init  *** 
     
    7981      !!---------------------------------------------------------------------- 
    8082      INTEGER          , INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa          ! ocean time level indices 
    81       CHARACTER (len=*), INTENT(in) :: cdstr                  ! model: NEMO or SAS. Determines core restart variables 
    8283      ! 
    8384      INTEGER ::   ji, jj, jk, jt   ! dummy loop indices 
     
    120121         WRITE(numout,*)     '         cn_cfg = ', TRIM( cn_cfg ), '   nn_cfg = ', nn_cfg 
    121122      ENDIF 
     123      nn_wxios = 0 
     124      ln_xios_read = .FALSE. 
    122125      ! 
    123126      !           !==  Reference coordinate system  ==! 
    124127      ! 
    125       CALL dom_glo                     ! global domain versus local domain 
    126       CALL dom_nam                     ! read namelist ( namrun, namdom ) 
    127       ! 
    128       IF( lwxios ) THEN 
    129 !define names for restart write and set core output (restart.F90) 
    130          CALL iom_set_rst_vars(rst_wfields) 
    131          CALL iom_set_rstw_core(cdstr) 
    132       ENDIF 
    133 !reset namelist for SAS 
    134       IF(cdstr == 'SAS') THEN 
    135          IF(lrxios) THEN 
    136                IF(lwp) write(numout,*) 'Disable reading restart file using XIOS for SAS' 
    137                lrxios = .FALSE. 
    138          ENDIF 
    139       ENDIF 
     128      CALL dom_glo                            ! global domain versus local domain 
     129      CALL dom_nam                            ! read namelist ( namrun, namdom ) 
     130      CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej ) ! Tile domain 
     131 
    140132      ! 
    141133      CALL dom_hgr                      ! Horizontal mesh 
     
    285277 
    286278 
     279   SUBROUTINE dom_tile( ktsi, ktsj, ktei, ktej, ktile ) 
     280      !!---------------------------------------------------------------------- 
     281      !!                     ***  ROUTINE dom_tile  *** 
     282      !! 
     283      !! ** Purpose :   Set tile domain variables 
     284      !! 
     285      !! ** Action  : - ktsi, ktsj     : start of internal part of domain 
     286      !!              - ktei, ktej     : end of internal part of domain 
     287      !!              - ntile          : current tile number 
     288      !!              - nijtile        : total number of tiles 
     289      !!---------------------------------------------------------------------- 
     290      INTEGER, INTENT(out) :: ktsi, ktsj, ktei, ktej      ! Tile domain indices 
     291      INTEGER, INTENT(in), OPTIONAL :: ktile              ! Tile number 
     292      INTEGER ::   jt                                     ! dummy loop argument 
     293      INTEGER ::   iitile, ijtile                         ! Local integers 
     294      CHARACTER (len=11) ::   charout 
     295      !!---------------------------------------------------------------------- 
     296      IF( PRESENT(ktile) .AND. ln_tile ) THEN 
     297         ntile = ktile                 ! Set domain indices for tile 
     298         ktsi = ntsi_a(ktile) 
     299         ktsj = ntsj_a(ktile) 
     300         ktei = ntei_a(ktile) 
     301         ktej = ntej_a(ktile) 
     302 
     303         IF(sn_cfctl%l_prtctl) THEN 
     304            WRITE(charout, FMT="('ntile =', I4)") ktile 
     305            CALL prt_ctl_info( charout ) 
     306         ENDIF 
     307      ELSE 
     308         ntile = 0                     ! Initialise to full domain 
     309         nijtile = 1 
     310         ktsi = Nis0 
     311         ktsj = Njs0 
     312         ktei = Nie0 
     313         ktej = Nje0 
     314 
     315         IF( ln_tile ) THEN            ! Calculate tile domain indices 
     316            iitile = Ni_0 / nn_ltile_i       ! Number of tiles 
     317            ijtile = Nj_0 / nn_ltile_j 
     318            IF( MOD( Ni_0, nn_ltile_i ) /= 0 ) iitile = iitile + 1 
     319            IF( MOD( Nj_0, nn_ltile_j ) /= 0 ) ijtile = ijtile + 1 
     320 
     321            nijtile = iitile * ijtile 
     322            ALLOCATE( ntsi_a(0:nijtile), ntsj_a(0:nijtile), ntei_a(0:nijtile), ntej_a(0:nijtile) ) 
     323 
     324            ntsi_a(0) = ktsi                 ! Full domain 
     325            ntsj_a(0) = ktsj 
     326            ntei_a(0) = ktei 
     327            ntej_a(0) = ktej 
     328 
     329            DO jt = 1, nijtile               ! Tile domains 
     330               ntsi_a(jt) = Nis0 + nn_ltile_i * MOD(jt - 1, iitile) 
     331               ntsj_a(jt) = Njs0 + nn_ltile_j * ((jt - 1) / iitile) 
     332               ntei_a(jt) = MIN(ntsi_a(jt) + nn_ltile_i - 1, Nie0) 
     333               ntej_a(jt) = MIN(ntsj_a(jt) + nn_ltile_j - 1, Nje0) 
     334            ENDDO 
     335         ENDIF 
     336 
     337         IF(lwp) THEN                  ! control print 
     338            WRITE(numout,*) 
     339            WRITE(numout,*) 'dom_tile : Domain tiling decomposition' 
     340            WRITE(numout,*) '~~~~~~~~' 
     341            IF( ln_tile ) THEN 
     342               WRITE(numout,*) iitile, 'tiles in i' 
     343               WRITE(numout,*) '    Starting indices' 
     344               WRITE(numout,*) '        ', (ntsi_a(jt), jt=1, iitile) 
     345               WRITE(numout,*) '    Ending indices' 
     346               WRITE(numout,*) '        ', (ntei_a(jt), jt=1, iitile) 
     347               WRITE(numout,*) ijtile, 'tiles in j' 
     348               WRITE(numout,*) '    Starting indices' 
     349               WRITE(numout,*) '        ', (ntsj_a(jt), jt=1, nijtile, iitile) 
     350               WRITE(numout,*) '    Ending indices' 
     351               WRITE(numout,*) '        ', (ntej_a(jt), jt=1, nijtile, iitile) 
     352            ELSE 
     353               WRITE(numout,*) 'No domain tiling' 
     354               WRITE(numout,*) '    i indices =', ktsi, ':', ktei 
     355               WRITE(numout,*) '    j indices =', ktsj, ':', ktej 
     356            ENDIF 
     357         ENDIF 
     358      ENDIF 
     359   END SUBROUTINE dom_tile 
     360 
     361 
    287362   SUBROUTINE dom_nam 
    288363      !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    293368      !! ** input   : - namrun namelist 
    294369      !!              - namdom namelist 
     370      !!              - namtile namelist 
    295371      !!              - namnc4 namelist   ! "key_netcdf4" only 
    296372      !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    305381         &             ln_cfmeta, ln_xios_read, nn_wxios 
    306382      NAMELIST/namdom/ ln_linssh, rn_Dt, rn_atfp, ln_crs, ln_meshmask 
     383      NAMELIST/namtile/ ln_tile, nn_ltile_i, nn_ltile_j 
    307384#if defined key_netcdf4 
    308385      NAMELIST/namnc4/ nn_nchunks_i, nn_nchunks_j, nn_nchunks_k, ln_nc4zip 
     
    441518      r1_Dt = 1._wp / rDt 
    442519 
     520      READ  ( numnam_ref, namtile, IOSTAT = ios, ERR = 905 ) 
     521905   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtile in reference namelist' ) 
     522      READ  ( numnam_cfg, namtile, IOSTAT = ios, ERR = 906 ) 
     523906   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namtile in configuration namelist' ) 
     524      IF(lwm) WRITE( numond, namtile ) 
     525 
     526      IF(lwp) THEN 
     527         WRITE(numout,*) 
     528         WRITE(numout,*)    '   Namelist : namtile   ---   Domain tiling decomposition' 
     529         WRITE(numout,*)    '      Tiling (T) or not (F)                ln_tile    = ', ln_tile 
     530         WRITE(numout,*)    '      Length of tile in i                  nn_ltile_i = ', nn_ltile_i 
     531         WRITE(numout,*)    '      Length of tile in j                  nn_ltile_j = ', nn_ltile_j 
     532         WRITE(numout,*) 
     533         IF( ln_tile ) THEN 
     534            WRITE(numout,*) '      The domain will be decomposed into tiles of size', nn_ltile_i, 'x', nn_ltile_j 
     535         ELSE 
     536            WRITE(numout,*) '      Domain tiling will NOT be used' 
     537         ENDIF 
     538      ENDIF 
     539 
    443540      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
    444541         lrxios = ln_xios_read.AND.ln_rstart 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/domqco.F90

    r13710 r14002  
    9191      ! 
    9292      CALL dom_qco_zgr(Kbb, Kmm, Kaa) ! interpolation scale factor, depth and water column 
    93       ! 
    94       ! IF(lwxios) THEN   ! define variables in restart file when writing with XIOS 
    95       !    CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_b') 
    96       !    CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_n') 
    97       ! ENDIF 
    9893      ! 
    9994   END SUBROUTINE dom_qco_init 
     
    217212            ! 
    218213            IF( MIN( id1, id2 ) > 0 ) THEN       ! all required arrays exist 
    219                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb'   , ssh(:,:,Kbb), ldxios = lrxios    ) 
    220                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn'   , ssh(:,:,Kmm), ldxios = lrxios    ) 
     214               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb'   , ssh(:,:,Kbb)    ) 
     215               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn'   , ssh(:,:,Kmm)    ) 
    221216               ! needed to restart if land processor not computed 
    222217               IF(lwp) write(numout,*) 'qe_rst_read : ssh(:,:,Kbb) and ssh(:,:,Kmm) found in restart files' 
     
    232227               IF(lwp) write(numout,*) 'sshn set equal to sshb.' 
    233228               IF(lwp) write(numout,*) 'neuler is forced to 0' 
    234                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb', ssh(:,:,Kbb), ldxios = lrxios ) 
     229               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb', ssh(:,:,Kbb) ) 
    235230               ssh(:,:,Kmm) = ssh(:,:,Kbb) 
    236231               l_1st_euler = .TRUE. 
     
    239234               IF(lwp) write(numout,*) 'sshb set equal to sshn.' 
    240235               IF(lwp) write(numout,*) 'neuler is forced to 0' 
    241                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn', ssh(:,:,Kmm), ldxios = lrxios ) 
     236               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn', ssh(:,:,Kmm) ) 
    242237               ssh(:,:,Kbb) = ssh(:,:,Kmm) 
    243238               l_1st_euler = .TRUE. 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/domutl.F90

    r13710 r14002  
    2121   PRIVATE 
    2222 
     23   INTERFACE is_tile 
     24      MODULE PROCEDURE is_tile_2d, is_tile_3d, is_tile_4d 
     25   END INTERFACE is_tile 
     26 
    2327   PUBLIC dom_ngb    ! routine called in iom.F90 module 
    2428   PUBLIC dom_uniq   ! Called by dommsk and domwri 
     29   PUBLIC is_tile 
    2530 
    2631   !!---------------------------------------------------------------------- 
     
    109114      ! 
    110115   END SUBROUTINE dom_uniq 
    111     
     116 
     117 
     118   FUNCTION is_tile_2d( pt ) 
     119      !! 
     120      REAL(wp), DIMENSION(:,:), INTENT(in) ::   pt 
     121      INTEGER :: is_tile_2d 
     122      !! 
     123      IF( ln_tile .AND. (SIZE(pt, 1) < jpi .OR. SIZE(pt, 2) < jpj) ) THEN 
     124         is_tile_2d = 1 
     125      ELSE 
     126         is_tile_2d = 0 
     127      ENDIF 
     128   END FUNCTION is_tile_2d 
     129 
     130 
     131   FUNCTION is_tile_3d( pt ) 
     132      !! 
     133      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), INTENT(in) ::   pt 
     134      INTEGER :: is_tile_3d 
     135      !! 
     136      IF( ln_tile .AND. (SIZE(pt, 1) < jpi .OR. SIZE(pt, 2) < jpj) ) THEN 
     137         is_tile_3d = 1 
     138      ELSE 
     139         is_tile_3d = 0 
     140      ENDIF 
     141   END FUNCTION is_tile_3d 
     142 
     143 
     144   FUNCTION is_tile_4d( pt ) 
     145      !! 
     146      REAL(wp), DIMENSION(:,:,:,:), INTENT(in) ::   pt 
     147      INTEGER :: is_tile_4d 
     148      !! 
     149      IF( ln_tile .AND. (SIZE(pt, 1) < jpi .OR. SIZE(pt, 2) < jpj) ) THEN 
     150         is_tile_4d = 1 
     151      ELSE 
     152         is_tile_4d = 0 
     153      ENDIF 
     154   END FUNCTION is_tile_4d 
     155 
    112156   !!====================================================================== 
    113157END MODULE domutl 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/domvvl.F90

    r13710 r14002  
    282282      ENDIF 
    283283      ! 
    284       IF(lwxios) THEN 
    285 ! define variables in restart file when writing with XIOS 
    286          CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_b') 
    287          CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_n') 
    288          !                                           ! ----------------------- ! 
    289          IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN  ! z_tilde and layer cases ! 
    290             !                                        ! ----------------------- ! 
    291             CALL iom_set_rstw_var_active('tilde_e3t_b') 
    292             CALL iom_set_rstw_var_active('tilde_e3t_n') 
    293          END IF 
    294          !                                           ! -------------!     
    295          IF( ln_vvl_ztilde ) THEN                    ! z_tilde case ! 
    296             !                                        ! ------------ ! 
    297             CALL iom_set_rstw_var_active('hdiv_lf') 
    298          ENDIF 
    299          ! 
    300       ENDIF 
    301       ! 
    302284   END SUBROUTINE dom_vvl_zgr 
    303285 
     
    440422         !                             (stored for tracer advction and continuity equation) 
    441423         CALL lbc_lnk_multi( 'domvvl', un_td , 'U' , -1._wp, vn_td , 'V' , -1._wp) 
    442  
    443424         ! 4 - Time stepping of baroclinic scale factors 
    444425         ! --------------------------------------------- 
     
    803784         IF( ln_rstart ) THEN                   !* Read the restart file 
    804785            CALL rst_read_open                  !  open the restart file if necessary 
    805             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn'   , ssh(:,:,Kmm), ldxios = lrxios    ) 
     786            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshn'   , ssh(:,:,Kmm)    ) 
    806787            ! 
    807788            id1 = iom_varid( numror, 'e3t_b', ldstop = .FALSE. ) 
     
    816797            ! 
    817798            IF( MIN( id1, id2 ) > 0 ) THEN       ! all required arrays exist 
    818                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lrxios ) 
    819                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lrxios ) 
     799               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb) ) 
     800               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm) ) 
    820801               ! needed to restart if land processor not computed  
    821802               IF(lwp) write(numout,*) 'dom_vvl_rst : e3t(:,:,:,Kbb) and e3t(:,:,:,Kmm) found in restart files' 
     
    831812               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_n set equal to e3t_b.' 
    832813               IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to true' 
    833                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lrxios ) 
     814               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb) ) 
    834815               e3t(:,:,:,Kmm) = e3t(:,:,:,Kbb) 
    835816               l_1st_euler = .true. 
     
    838819               IF(lwp) write(numout,*) 'e3t_b set equal to e3t_n.' 
    839820               IF(lwp) write(numout,*) 'l_1st_euler is forced to true' 
    840                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lrxios ) 
     821               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm) ) 
    841822               e3t(:,:,:,Kbb) = e3t(:,:,:,Kmm) 
    842823               l_1st_euler = .true. 
     
    863844               !                          ! ----------------------- ! 
    864845               IF( MIN( id3, id4 ) > 0 ) THEN  ! all required arrays exist 
    865                   CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:), ldxios = lrxios ) 
    866                   CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:), ldxios = lrxios ) 
     846                  CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:) ) 
     847                  CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:) ) 
    867848               ELSE                            ! one at least array is missing 
    868849                  tilde_e3t_b(:,:,:) = 0.0_wp 
     
    873854                  !                       ! ------------ ! 
    874855                  IF( id5 > 0 ) THEN  ! required array exists 
    875                      CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:), ldxios = lrxios ) 
     856                     CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:) ) 
    876857                  ELSE                ! array is missing 
    877858                     hdiv_lf(:,:,:) = 0.0_wp 
     
    946927         !                                   ! =================== 
    947928         IF(lwp) WRITE(numout,*) '---- dom_vvl_rst ----' 
    948          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          ) 
    949929         !                                           ! --------- ! 
    950930         !                                           ! all cases ! 
    951931         !                                           ! --------- ! 
    952          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lwxios ) 
    953          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lwxios ) 
     932         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb) ) 
     933         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm) ) 
    954934         !                                           ! ----------------------- ! 
    955935         IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN  ! z_tilde and layer cases ! 
    956936            !                                        ! ----------------------- ! 
    957             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:), ldxios = lwxios) 
    958             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:), ldxios = lwxios) 
     937            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:)) 
     938            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:)) 
    959939         END IF 
    960940         !                                           ! -------------!     
    961941         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN                    ! z_tilde case ! 
    962942            !                                        ! ------------ ! 
    963             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:), ldxios = lwxios) 
     943            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:)) 
    964944         ENDIF 
    965945         ! 
    966          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          ) 
    967946      ENDIF 
    968947      ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DOM/dtatsd.F90

    r13710 r14002  
    1818   USE phycst          ! physical constants 
    1919   USE dom_oce         ! ocean space and time domain 
     20   USE domain, ONLY : dom_tile 
    2021   USE fldread         ! read input fields 
    2122   ! 
     
    135136      !! ** Action  :   ptsd   T-S data on medl mesh and interpolated at time-step kt 
    136137      !!---------------------------------------------------------------------- 
    137       INTEGER                              , INTENT(in   ) ::   kt     ! ocean time-step 
    138       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk,jpts), INTENT(  out) ::   ptsd   ! T & S data 
     138      INTEGER                          , INTENT(in   ) ::   kt     ! ocean time-step 
     139      REAL(wp), DIMENSION(A2D(nn_hls),jpk,jpts), INTENT(  out) ::   ptsd   ! T & S data 
    139140      ! 
    140141      INTEGER ::   ji, jj, jk, jl, jkk   ! dummy loop indicies 
    141142      INTEGER ::   ik, il0, il1, ii0, ii1, ij0, ij1   ! local integers 
     143      INTEGER ::   itile 
    142144      REAL(wp)::   zl, zi                             ! local scalars 
    143145      REAL(wp), DIMENSION(jpk) ::  ztp, zsp   ! 1D workspace 
    144146      !!---------------------------------------------------------------------- 
    145147      ! 
    146       CALL fld_read( kt, 1, sf_tsd )      !==   read T & S data at kt time step   ==! 
     148      IF( ntile == 0 .OR. ntile == 1 )  THEN                                         ! Do only for the full domain 
     149         itile = ntile 
     150         IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = 0 )            ! Use full domain 
     151            CALL fld_read( kt, 1, sf_tsd )   !==   read T & S data at kt time step   ==! 
    147152      ! 
    148153      ! 
    149154!!gm  This should be removed from the code   ===>>>>  T & S files has to be changed 
    150       ! 
    151       !                                   !==   ORCA_R2 configuration and T & S damping   ==!  
    152       IF( cn_cfg == "orca" .OR. cn_cfg == "ORCA" ) THEN 
    153          IF( nn_cfg == 2 .AND. ln_tsd_dmp ) THEN    ! some hand made alterations 
    154             ! 
    155             ij0 = 101 + nn_hls       ;   ij1 = 109 + nn_hls                       ! Reduced T & S in the Alboran Sea 
    156             ii0 = 141 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 155 + nn_hls - 1 
    157             DO jj = mj0(ij0), mj1(ij1) 
    158                DO ji = mi0(ii0), mi1(ii1) 
    159                   sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,13:13) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,13:13) - 0.20_wp 
    160                   sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,14:15) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,14:15) - 0.35_wp 
    161                   sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,16:25) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,16:25) - 0.40_wp 
    162                   ! 
    163                   sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,13:13) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,13:13) - 0.15_wp 
    164                   sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,14:15) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,14:15) - 0.25_wp 
    165                   sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,16:17) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,16:17) - 0.30_wp 
    166                   sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,18:25) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,18:25) - 0.35_wp 
     155         ! 
     156         !                                   !==   ORCA_R2 configuration and T & S damping   ==! 
     157         IF( cn_cfg == "orca" .OR. cn_cfg == "ORCA" ) THEN 
     158            IF( nn_cfg == 2 .AND. ln_tsd_dmp ) THEN    ! some hand made alterations 
     159               ! 
     160               ij0 = 101 + nn_hls       ;   ij1 = 109 + nn_hls                       ! Reduced T & S in the Alboran Sea 
     161               ii0 = 141 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 155 + nn_hls - 1 
     162               DO jj = mj0(ij0), mj1(ij1) 
     163                  DO ji = mi0(ii0), mi1(ii1) 
     164                     sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,13:13) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,13:13) - 0.20_wp 
     165                     sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,14:15) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,14:15) - 0.35_wp 
     166                     sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,16:25) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,16:25) - 0.40_wp 
     167                     ! 
     168                     sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,13:13) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,13:13) - 0.15_wp 
     169                     sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,14:15) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,14:15) - 0.25_wp 
     170                     sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,16:17) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,16:17) - 0.30_wp 
     171                     sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,18:25) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,18:25) - 0.35_wp 
     172                  END DO 
    167173               END DO 
    168             END DO 
    169             ij0 =  87 + nn_hls       ;   ij1 =  96 + nn_hls                       ! Reduced temperature in Red Sea 
    170             ii0 = 148 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 160 + nn_hls - 1 
    171             sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ,  4:10 ) = 7.0_wp 
    172             sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) , 11:13 ) = 6.5_wp 
    173             sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) , 14:20 ) = 6.0_wp 
    174          ENDIF 
    175       ENDIF 
     174               ij0 =  87 + nn_hls       ;   ij1 =  96 + nn_hls                       ! Reduced temperature in Red Sea 
     175               ii0 = 148 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 160 + nn_hls - 1 
     176               sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ,  4:10 ) = 7.0_wp 
     177               sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) , 11:13 ) = 6.5_wp 
     178               sf_tsd(jp_tem)%fnow( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) , 14:20 ) = 6.0_wp 
     179            ENDIF 
     180         ENDIF 
    176181!!gm end 
    177       ! 
    178       ptsd(:,:,:,jp_tem) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(:,:,:)    ! NO mask 
    179       ptsd(:,:,:,jp_sal) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(:,:,:)  
     182         IF( ln_tile ) CALL dom_tile( ntsi, ntsj, ntei, ntej, ktile = itile )            ! Revert to tile domain 
     183      ENDIF 
     184      ! 
     185      DO_3D( nn_hls, nn_hls, nn_hls, nn_hls, 1, jpk ) 
     186         ptsd(ji,jj,jk,jp_tem) = sf_tsd(jp_tem)%fnow(ji,jj,jk)    ! NO mask 
     187         ptsd(ji,jj,jk,jp_sal) = sf_tsd(jp_sal)%fnow(ji,jj,jk) 
     188      END_3D 
    180189      ! 
    181190      IF( ln_sco ) THEN                   !==   s- or mixed s-zps-coordinate   ==! 
    182191         ! 
    183          IF( kt == nit000 .AND. lwp )THEN 
    184             WRITE(numout,*) 
    185             WRITE(numout,*) 'dta_tsd: interpolates T & S data onto the s- or mixed s-z-coordinate mesh' 
    186          ENDIF 
    187          ! 
    188          DO_2D( 1, 1, 1, 1 )                  ! vertical interpolation of T & S 
     192         IF( ntile == 0 .OR. ntile == 1 )  THEN                       ! Do only on the first tile 
     193            IF( kt == nit000 .AND. lwp )THEN 
     194               WRITE(numout,*) 
     195               WRITE(numout,*) 'dta_tsd: interpolates T & S data onto the s- or mixed s-z-coordinate mesh' 
     196            ENDIF 
     197         ENDIF 
     198         ! 
     199         ! NOTE: [tiling-comms-merge] This fix was necessary to take out tra_adv lbc_lnk statements in the zps case, but did not work in the zco case 
     200         DO_2D( nn_hls, nn_hls, nn_hls, nn_hls )                  ! vertical interpolation of T & S 
    189201            DO jk = 1, jpk                        ! determines the intepolated T-S profiles at each (i,j) points 
    190202               zl = gdept_0(ji,jj,jk) 
     
    215227      ELSE                                !==   z- or zps- coordinate   ==! 
    216228         !                              
    217          ptsd(:,:,:,jp_tem) = ptsd(:,:,:,jp_tem) * tmask(:,:,:)    ! Mask 
    218          ptsd(:,:,:,jp_sal) = ptsd(:,:,:,jp_sal) * tmask(:,:,:) 
     229         DO_3D( nn_hls, nn_hls, nn_hls, nn_hls, 1, jpk ) 
     230            ptsd(ji,jj,jk,jp_tem) = ptsd(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)    ! Mask 
     231            ptsd(ji,jj,jk,jp_sal) = ptsd(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk) 
     232         END_3D 
    219233         ! 
    220234         IF( ln_zps ) THEN                      ! zps-coordinate (partial steps) interpolation at the last ocean level 
    221             DO_2D( 1, 1, 1, 1 ) 
     235            ! NOTE: [tiling-comms-merge] This fix was necessary to take out tra_adv lbc_lnk statements in the zps case 
     236            DO_2D( nn_hls, nn_hls, nn_hls, nn_hls ) 
    222237               ik = mbkt(ji,jj)  
    223238               IF( ik > 1 ) THEN 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DYN/dynhpg.F90

    r13710 r14002  
    302302      INTEGER  ::   iku, ikv                         ! temporary integers 
    303303      REAL(wp) ::   zcoef0, zcoef1, zcoef2, zcoef3   ! temporary scalars 
    304       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::  zhpi, zhpj 
    305       REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) :: zgtsu, zgtsv, zgru, zgrv 
     304      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zhpi, zhpj 
     305      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpts)   :: zgtsu, zgtsv 
     306      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     :: zgru, zgrv 
    306307      !!---------------------------------------------------------------------- 
    307308      ! 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/DYN/dynspg_ts.F90

    r13710 r14002  
    900900         !                                   ! --------------- 
    901901         IF( ln_rstart .AND. ln_bt_fw .AND. (.NOT.l_1st_euler) ) THEN    !* Read the restart file 
    902             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub2_b'  , ub2_b  (:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )    
    903             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb2_b'  , vb2_b  (:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )  
    904             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'un_bf'  , un_bf  (:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )    
    905             CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vn_bf'  , vn_bf  (:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )  
     902            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub2_b'  , ub2_b  (:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp )    
     903            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb2_b'  , vb2_b  (:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp )  
     904            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'un_bf'  , un_bf  (:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp )    
     905            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vn_bf'  , vn_bf  (:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp )  
    906906            IF( .NOT.ln_bt_av ) THEN 
    907                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshbb_e'  , sshbb_e(:,:), cd_type = 'T', psgn =  1._wp, ldxios = lrxios )    
    908                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ubb_e'    ,   ubb_e(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )    
    909                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vbb_e'    ,   vbb_e(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios ) 
    910                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb_e'   ,  sshb_e(:,:), cd_type = 'T', psgn =  1._wp, ldxios = lrxios )  
    911                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub_e'     ,    ub_e(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )    
    912                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb_e'     ,    vb_e(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios ) 
     907               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshbb_e'  , sshbb_e(:,:), cd_type = 'T', psgn =  1._wp )    
     908               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ubb_e'    ,   ubb_e(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp )    
     909               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vbb_e'    ,   vbb_e(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp ) 
     910               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'sshb_e'   ,  sshb_e(:,:), cd_type = 'T', psgn =  1._wp )  
     911               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub_e'     ,    ub_e(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp )    
     912               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb_e'     ,    vb_e(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp ) 
    913913            ENDIF 
    914914#if defined key_agrif 
    915915            ! Read time integrated fluxes 
    916916            IF ( .NOT.Agrif_Root() ) THEN 
    917                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub2_i_b'  , ub2_i_b(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios )    
    918                CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb2_i_b'  , vb2_i_b(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp, ldxios = lrxios ) 
     917               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'ub2_i_b'  , ub2_i_b(:,:), cd_type = 'U', psgn = -1._wp )    
     918               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'vb2_i_b'  , vb2_i_b(:,:), cd_type = 'V', psgn = -1._wp ) 
    919919            ELSE 
    920920               ub2_i_b(:,:) = 0._wp   ;   vb2_i_b(:,:) = 0._wp   ! used in the 1st update of agrif 
     
    935935         !                                   ! ------------------- 
    936936         IF(lwp) WRITE(numout,*) '---- ts_rst ----' 
    937          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          ) 
    938          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub2_b'   , ub2_b  (:,:), ldxios = lwxios ) 
    939          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb2_b'   , vb2_b  (:,:), ldxios = lwxios ) 
    940          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'un_bf'   , un_bf  (:,:), ldxios = lwxios ) 
    941          CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vn_bf'   , vn_bf  (:,:), ldxios = lwxios ) 
     937         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub2_b'   , ub2_b  (:,:) ) 
     938         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb2_b'   , vb2_b  (:,:) ) 
     939         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'un_bf'   , un_bf  (:,:) ) 
     940         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vn_bf'   , vn_bf  (:,:) ) 
    942941         ! 
    943942         IF (.NOT.ln_bt_av) THEN 
    944             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshbb_e'  , sshbb_e(:,:), ldxios = lwxios )  
    945             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ubb_e'    ,   ubb_e(:,:), ldxios = lwxios ) 
    946             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vbb_e'    ,   vbb_e(:,:), ldxios = lwxios ) 
    947             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshb_e'   ,  sshb_e(:,:), ldxios = lwxios ) 
    948             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub_e'     ,    ub_e(:,:), ldxios = lwxios ) 
    949             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb_e'     ,    vb_e(:,:), ldxios = lwxios ) 
     943            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshbb_e'  , sshbb_e(:,:) )  
     944            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ubb_e'    ,   ubb_e(:,:) ) 
     945            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vbb_e'    ,   vbb_e(:,:) ) 
     946            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'sshb_e'   ,  sshb_e(:,:) ) 
     947            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub_e'     ,    ub_e(:,:) ) 
     948            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb_e'     ,    vb_e(:,:) ) 
    950949         ENDIF 
    951950#if defined key_agrif 
    952951         ! Save time integrated fluxes 
    953952         IF ( .NOT.Agrif_Root() ) THEN 
    954             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub2_i_b'  , ub2_i_b(:,:), ldxios = lwxios ) 
    955             CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb2_i_b'  , vb2_i_b(:,:), ldxios = lwxios ) 
     953            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'ub2_i_b'  , ub2_i_b(:,:) ) 
     954            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'vb2_i_b'  , vb2_i_b(:,:) ) 
    956955         ENDIF 
    957956#endif 
    958          IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          ) 
    959957      ENDIF 
    960958      ! 
     
    10481046      !                             ! read restart when needed 
    10491047      CALL ts_rst( nit000, 'READ' ) 
    1050       ! 
    1051       IF( lwxios ) THEN 
    1052 ! define variables in restart file when writing with XIOS 
    1053          CALL iom_set_rstw_var_active('ub2_b') 
    1054          CALL iom_set_rstw_var_active('vb2_b') 
    1055          CALL iom_set_rstw_var_active('un_bf') 
    1056          CALL iom_set_rstw_var_active('vn_bf') 
    1057          ! 
    1058          IF (.NOT.ln_bt_av) THEN 
    1059             CALL iom_set_rstw_var_active('sshbb_e') 
    1060             CALL iom_set_rstw_var_active('ubb_e') 
    1061             CALL iom_set_rstw_var_active('vbb_e') 
    1062             CALL iom_set_rstw_var_active('sshb_e') 
    1063             CALL iom_set_rstw_var_active('ub_e') 
    1064             CALL iom_set_rstw_var_active('vb_e') 
    1065          ENDIF 
    1066 #if defined key_agrif 
    1067          ! Save time integrated fluxes 
    1068          IF ( .NOT.Agrif_Root() ) THEN 
    1069             CALL iom_set_rstw_var_active('ub2_i_b') 
    1070             CALL iom_set_rstw_var_active('vb2_i_b') 
    1071          ENDIF 
    1072 #endif 
    1073       ENDIF 
    10741048      ! 
    10751049   END SUBROUTINE dyn_spg_ts_init 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/IOM/in_out_manager.F90

    r13710 r14002  
    8989   LOGICAL ::   lrst_abl              !: logical to control the abl restart write  
    9090   INTEGER ::   numror = 0            !: logical unit for ocean restart (read). Init to 0 is needed for SAS (in daymod.F90) 
    91    INTEGER ::   numrir                !: logical unit for ice   restart (read) 
    92    INTEGER ::   numrar                !: logical unit for abl   restart (read) 
    93    INTEGER ::   numrow                !: logical unit for ocean restart (write) 
    94    INTEGER ::   numriw                !: logical unit for ice   restart (write) 
    95    INTEGER ::   numraw                !: logical unit for abl   restart (write) 
     91   INTEGER ::   numrir = 0            !: logical unit for ice   restart (read) 
     92   INTEGER ::   numrar = 0            !: logical unit for abl   restart (read) 
     93   INTEGER ::   numrow = 0            !: logical unit for ocean restart (write) 
     94   INTEGER ::   numriw = 0            !: logical unit for ice   restart (write) 
     95   INTEGER ::   numraw = 0            !: logical unit for abl   restart (write) 
     96   INTEGER ::   numrtr = 0            !: trc restart (read ) 
     97   INTEGER ::   numrtw = 0            !: trc restart (write ) 
     98   INTEGER ::   numrsr = 0            !: logical unit for sed restart (read) 
     99   INTEGER ::   numrsw = 0            !: logical unit for sed restart (write) 
     100 
    96101   INTEGER ::   nrst_lst              !: number of restart to output next 
    97102 
     
    165170   LOGICAL       ::   lwp      = .FALSE.    !: boolean : true on the 1st processor only .OR. sn_cfctl%l_oceout=T 
    166171   LOGICAL       ::   lsp_area = .TRUE.     !: to make a control print over a specific area 
    167    CHARACTER(lc) ::   cxios_context         !: context name used in xios 
    168    CHARACTER(lc) ::   crxios_context         !: context name used in xios to read restart 
    169    CHARACTER(lc) ::   cwxios_context        !: context name used in xios to write restart file 
     172   CHARACTER(LEN=lc) ::   cxios_context     !: context name used in xios 
     173   CHARACTER(LEN=lc) ::   cr_ocerst_cxt     !: context name used in xios to read OCE restart 
     174   CHARACTER(LEN=lc) ::   cw_ocerst_cxt     !: context name used in xios to write OCE restart file 
     175   CHARACTER(LEN=lc) ::   cr_icerst_cxt     !: context name used in xios to read SI3 restart 
     176   CHARACTER(LEN=lc) ::   cw_icerst_cxt     !: context name used in xios to write SI3 restart file 
     177   CHARACTER(LEN=lc) ::   cr_toprst_cxt     !: context name used in xios to read TOP restart 
     178   CHARACTER(LEN=lc) ::   cw_toprst_cxt     !: context name used in xios to write TOP restart file 
     179   CHARACTER(LEN=lc) ::   cr_sedrst_cxt     !: context name used in xios to read SEDIMENT restart 
     180   CHARACTER(LEN=lc) ::   cw_sedrst_cxt     !: context name used in xios to write SEDIMENT restart file 
     181 
     182 
     183 
    170184 
    171185   !! * Substitutions 
  • NEMO/branches/2020/dev_r12702_ASINTER-02_emanuelaclementi_Waves/src/OCE/IOM/iom.F90

    r13852 r14002  
    4646   USE lib_fortran  
    4747   USE diu_bulk, ONLY : ln_diurnal_only, ln_diurnal 
     48   USE iom_nf90 
     49   USE netcdf 
    4850 
    4951   IMPLICIT NONE 
     
    5860   PUBLIC iom_chkatt, iom_getatt, iom_putatt, iom_getszuld, iom_rstput, iom_delay_rst, iom_put 
    5961   PUBLIC iom_use, iom_context_finalize, iom_update_file_name, iom_miss_val 
     62   PUBLIC iom_xios_setid 
    6063 
    6164   PRIVATE iom_rp0d_sp, iom_rp1d_sp, iom_rp2d_sp, iom_rp3d_sp 
     
    6972   PRIVATE iom_set_domain_attr, iom_set_axis_attr, iom_set_field_attr, iom_set_file_attr, iom_get_file_attr, iom_set_grid_attr 
    7073   PRIVATE set_grid, set_grid_bounds, set_scalar, set_xmlatt, set_mooring, iom_sdate 
    71    PRIVATE iom_set_rst_context, iom_set_rstw_active, iom_set_rstr_active 
     74   PRIVATE iom_set_rst_context, iom_set_vars_active 
    7275# endif 
    73    PUBLIC iom_set_rstw_var_active, iom_set_rstw_core, iom_set_rst_vars 
     76   PRIVATE set_xios_context 
     77   PRIVATE iom_set_rstw_active 
    7478 
    7579   INTERFACE iom_get 
     
    101105CONTAINS 
    102106 
    103    SUBROUTINE iom_init( cdname, fname, ld_closedef )  
     107   SUBROUTINE iom_init( cdname, kdid, ld_closedef )  
    104108      !!---------------------------------------------------------------------- 
    105109      !!                     ***  ROUTINE   *** 
     
    109113      !!---------------------------------------------------------------------- 
    110114      CHARACTER(len=*),           INTENT(in)  :: cdname 
    111       CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(in)  :: fname 
     115      INTEGER         , OPTIONAL, INTENT(in)  :: kdid           
    112116      LOGICAL         , OPTIONAL, INTENT(in)  :: ld_closedef 
    113117#if defined key_iomput 
     
    118122      INTEGER             :: irefyear, irefmonth, irefday 
    119123      INTEGER           :: ji 
    120       LOGICAL :: llrst_context              ! is context related to restart 
     124      LOGICAL           :: llrst_context              ! is context related to restart 
     125      LOGICAL           :: llrstr, llrstw  
     126      INTEGER           :: inum 
    121127      ! 
    122128      REAL(wp), ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: zt_bnds, zw_bnds 
    123129      REAL(wp), DIMENSION(2,jpkam1)         :: za_bnds   ! ABL vertical boundaries 
    124       LOGICAL ::   ll_closedef = .TRUE. 
     130      LOGICAL ::   ll_closedef 
    125131      LOGICAL ::   ll_exist 
    126132      !!---------------------------------------------------------------------- 
    127133      ! 
     134      ll_closedef = .TRUE. 
    128135      IF ( PRESENT(ld_closedef) ) ll_closedef = ld_closedef 
    129136      ! 
     
    134141      CALL xios_context_initialize(TRIM(clname), mpi_comm_oce) 
    135142      CALL iom_swap( cdname ) 
    136       llrst_context =  (TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) .OR. TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context)) 
     143 
     144      llrstr = (cdname == cr_ocerst_cxt) .OR. (cdname == cr_icerst_cxt) 
     145      llrstr = llrstr .OR. (cdname == cr_toprst_cxt) 
     146      llrstr = llrstr .OR. (cdname == cr_sedrst_cxt) 
     147 
     148      llrstw = (cdname == cw_ocerst_cxt) .OR. (cdname == cw_icerst_cxt) 
     149      llrstw = llrstw .OR. (cdname == cw_toprst_cxt) 
     150      llrstw = llrstw .OR. (cdname == cw_sedrst_cxt) 
     151 
     152      llrst_context = llrstr .OR. llrstw 
    137153 
    138154      ! Calendar type is now defined in xml file  
     
    153169      IF(.NOT.llrst_context) CALL set_scalar 
    154170      ! 
    155       IF( TRIM(cdname) == TRIM(cxios_context) ) THEN   
     171      IF( cdname == cxios_context ) THEN   
    156172         CALL set_grid( "T", glamt, gphit, .FALSE., .FALSE. )  
    157173         CALL set_grid( "U", glamu, gphiu, .FALSE., .FALSE. ) 
     
    197213      ! vertical grid definition 
    198214      IF(.NOT.llrst_context) THEN 
    199           CALL iom_set_axis_attr(  "deptht", paxis = gdept_1d ) 
    200           CALL iom_set_axis_attr(  "depthu", paxis = gdept_1d ) 
    201           CALL iom_set_axis_attr(  "depthv", paxis = gdept_1d ) 
    202           CALL iom_set_axis_attr(  "depthw", paxis = gdepw_1d ) 
     215         CALL iom_set_axis_attr(  "deptht", paxis = gdept_1d ) 
     216         CALL iom_set_axis_attr(  "depthu", paxis = gdept_1d ) 
     217         CALL iom_set_axis_attr(  "depthv", paxis = gdept_1d ) 
     218         CALL iom_set_axis_attr(  "depthw", paxis = gdepw_1d ) 
    203219 
    204220          ! ABL 
    205           IF( .NOT. ALLOCATED(ght_abl) ) THEN   ! force definition for xml files (xios)  
    206              ALLOCATE( ght_abl(jpka), ghw_abl(jpka), e3t_abl(jpka), e3w_abl(jpka) )   ! default allocation needed by iom 
    207              ght_abl(:) = -1._wp   ;   ghw_abl(:) = -1._wp 
    208              e3t_abl(:) = -1._wp   ;   e3w_abl(:) = -1._wp 
    209           ENDIF 
    210           CALL iom_set_axis_attr( "ght_abl", ght_abl(2:jpka) ) 
    211           CALL iom_set_axis_attr( "ghw_abl", ghw_abl(2:jpka) ) 
     221         IF( .NOT. ALLOCATED(ght_abl) ) THEN   ! force definition for xml files (xios)  
     222            ALLOCATE( ght_abl(jpka), ghw_abl(jpka), e3t_abl(jpka), e3w_abl(jpka) )   ! default allocation needed by iom 
     223            ght_abl(:) = -1._wp   ;   ghw_abl(:) = -1._wp 
     224            e3t_abl(:) = -1._wp   ;   e3w_abl(:) = -1._wp 
     225         ENDIF 
     226         CALL iom_set_axis_attr( "ght_abl", ght_abl(2:jpka) ) 
     227         CALL iom_set_axis_attr( "ghw_abl", ghw_abl(2:jpka) ) 
    212228           
    213           ! Add vertical grid bounds 
    214           zt_bnds(2,:      ) = gdept_1d(:) 
    215           zt_bnds(1,2:jpk  ) = gdept_1d(1:jpkm1) 
    216           zt_bnds(1,1      ) = gdept_1d(1) - e3w_1d(1) 
    217           zw_bnds(1,:      ) = gdepw_1d(:) 
    218           zw_bnds(2,1:jpkm1) = gdepw_1d(2:jpk) 
    219           zw_bnds(2,jpk:   ) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk) 
    220           CALL iom_set_axis_attr(  "deptht", bounds=zw_bnds ) 
    221           CALL iom_set_axis_attr(  "depthu", bounds=zw_bnds ) 
    222           CALL iom_set_axis_attr(  "depthv", bounds=zw_bnds ) 
    223           CALL iom_set_axis_attr(  "depthw", bounds=zt_bnds ) 
    224  
    225           ! ABL 
    226           za_bnds(1,:) = ghw_abl(1:jpkam1) 
    227           za_bnds(2,:) = ghw_abl(2:jpka  ) 
    228           CALL iom_set_axis_attr( "ght_abl", bounds=za_bnds ) 
    229           za_bnds(1,:) = ght_abl(2:jpka  ) 
    230           za_bnds(2,:) = ght_abl(2:jpka  ) + e3w_abl(2:jpka) 
    231           CALL iom_set_axis_attr( "ghw_abl", bounds=za_bnds ) 
    232  
    233           CALL iom_set_axis_attr(  "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpnfl) /) ) 
     229         ! Add vertical grid bounds 
     230         zt_bnds(2,:      ) = gdept_1d(:) 
     231         zt_bnds(1,2:jpk  ) = gdept_1d(1:jpkm1) 
     232         zt_bnds(1,1      ) = gdept_1d(1) - e3w_1d(1) 
     233         zw_bnds(1,:      ) = gdepw_1d(:) 
     234         zw_bnds(2,1:jpkm1) = gdepw_1d(2:jpk) 
     235         zw_bnds(2,jpk:   ) = gdepw_1d(jpk) + e3t_1d(jpk) 
     236         CALL iom_set_axis_attr(  "deptht", bounds=zw_bnds ) 
     237         CALL iom_set_axis_attr(  "depthu", bounds=zw_bnds ) 
     238         CALL iom_set_axis_attr(  "depthv", bounds=zw_bnds ) 
     239         CALL iom_set_axis_attr(  "depthw", bounds=zt_bnds ) 
     240 
     241         ! ABL 
     242         za_bnds(1,:) = ghw_abl(1:jpkam1) 
     243         za_bnds(2,:) = ghw_abl(2:jpka  ) 
     244         CALL iom_set_axis_attr( "ght_abl", bounds=za_bnds ) 
     245         za_bnds(1,:) = ght_abl(2:jpka  ) 
     246         za_bnds(2,:) = ght_abl(2:jpka  ) + e3w_abl(2:jpka) 
     247         CALL iom_set_axis_attr( "ghw_abl", bounds=za_bnds ) 
     248 
     249         CALL iom_set_axis_attr(  "nfloat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpnfl) /) ) 
    234250# if defined key_si3 
    235           CALL iom_set_axis_attr( "ncatice", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) ) 
    236           ! SIMIP diagnostics (4 main arctic straits) 
    237           CALL iom_set_axis_attr( "nstrait", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,4) /) ) 
     251         CALL iom_set_axis_attr( "ncatice", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) ) 
     252         ! SIMIP diagnostics (4 main arctic straits) 
     253         CALL iom_set_axis_attr( "nstrait", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,4) /) ) 
    238254# endif 
    239255#if defined key_top 
    240           IF( ALLOCATED(profsed) ) CALL iom_set_axis_attr( "profsed", paxis = profsed ) 
    241 #endif 
    242           CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num ) 
    243           CALL iom_set_axis_attr( "iax_20C", (/ REAL(20,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
    244           CALL iom_set_axis_attr( "iax_26C", (/ REAL(26,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
    245           CALL iom_set_axis_attr( "iax_28C", (/ REAL(28,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
    246           ! for diaprt, we need to define an axis which size can be 1 (default) or 5 (if the file subbasins.nc exists) 
    247           INQUIRE( FILE = 'subbasins.nc', EXIST = ll_exist ) 
    248           nbasin = 1 + 4 * COUNT( (/ll_exist/) ) 
    249           CALL iom_set_axis_attr( "basin"  , (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nbasin) /) ) 
     256         IF( ALLOCATED(profsed) ) CALL iom_set_axis_attr( "profsed", paxis = profsed ) 
     257#endif 
     258         CALL iom_set_axis_attr( "icbcla", class_num ) 
     259         CALL iom_set_axis_attr( "iax_20C", (/ REAL(20,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
     260         CALL iom_set_axis_attr( "iax_26C", (/ REAL(26,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
     261         CALL iom_set_axis_attr( "iax_28C", (/ REAL(28,wp) /) )   ! strange syntaxe and idea... 
     262         ! for diaprt, we need to define an axis which size can be 1 (default) or 5 (if the file subbasins.nc exists) 
     263         INQUIRE( FILE = 'subbasins.nc', EXIST = ll_exist ) 
     264         nbasin = 1 + 4 * COUNT( (/ll_exist/) ) 
     265         CALL iom_set_axis_attr( "basin"  , (/ (REAL(ji,wp), ji=1,nbasin) /) ) 
    250266      ENDIF 
    251267      ! 
    252268      ! automatic definitions of some of the xml attributs 
    253       IF( TRIM(cdname) == TRIM(crxios_context) ) THEN 
    254 !set names of the fields in restart file IF using XIOS to read data 
    255           CALL iom_set_rst_context(.TRUE.) 
    256           CALL iom_set_rst_vars(rst_rfields) 
    257 !set which fields are to be read from restart file 
    258           CALL iom_set_rstr_active() 
    259       ELSE IF( TRIM(cdname) == TRIM(cwxios_context) ) THEN 
    260 !set names of the fields in restart file IF using XIOS to write data 
    261           CALL iom_set_rst_context(.FALSE.) 
    262           CALL iom_set_rst_vars(rst_wfields) 
    263 !set which fields are to be written to a restart file 
    264           CALL iom_set_rstw_active(fname) 
     269      IF(llrstr) THEN 
     270         IF(PRESENT(kdid)) THEN 
     271            CALL iom_set_rst_context(.TRUE.) 
     272!set which fields will be read from restart file 
     273            CALL iom_set_vars_active(kdid) 
     274         ELSE 
     275            CALL ctl_stop( 'iom_init:', 'restart read with XIOS: missing pointer to NETCDF file' ) 
     276         ENDIF 
     277      ELSE IF(llrstw) THEN 
     278         CALL iom_set_rstw_file(iom_file(kdid)%name) 
    265279      ELSE 
    266           CALL set_xmlatt 
     280         CALL set_xmlatt 
    267281      ENDIF 
    268282      ! 
     
    280294   END SUBROUTINE iom_init 
    281295 
    282    SUBROUTINE iom_init_closedef 
     296   SUBROUTINE iom_init_closedef(cdname) 
    283297      !!---------------------------------------------------------------------- 
    284298      !!            ***  SUBROUTINE iom_init_closedef  *** 
     
    288302      !! 
    289303      !!---------------------------------------------------------------------- 
    290  
     304      CHARACTER(len=*), OPTIONAL, INTENT(IN) :: cdname 
    291305#if defined key_iomput 
    292       CALL xios_close_context_definition() 
    293       CALL xios_update_calendar( 0 ) 
     306      LOGICAL :: llrstw 
     307 
     308      llrstw = .FALSE. 
     309      IF(PRESENT(cdname)) THEN 
     310         llrstw = (cdname == cw_ocerst_cxt) 
     311         llrstw = llrstw .OR. (cdname == cw_icerst_cxt) 
     312         llrstw = llrstw .OR. (cdname == cw_toprst_cxt) 
     313         llrstw = llrstw .OR. (cdname == cw_sedrst_cxt) 
     314      ENDIF 
     315 
     316      IF( llrstw ) THEN 
     317!set names of the fields in restart file IF using XIOS to write data 
     318         CALL iom_set_rst_context(.FALSE.) 
     319         CALL xios_close_context_definition() 
     320      ELSE 
     321         CALL xios_close_context_definition() 
     322         CALL xios_update_calendar( 0 ) 
     323      ENDIF 
    294324#else 
    295325      IF( .FALSE. )   WRITE(numout,*) 'iom_init_closedef: should not see this'   ! useless statement to avoid compilation warnings 
     
    298328   END SUBROUTINE iom_init_closedef 
    299329 
    300    SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active(field) 
     330   SUBROUTINE iom_set_vars_active(idnum) 
    301331      !!--------------------------------------------------------------------- 
    302       !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_var_active  *** 
    303       !! 
    304       !! ** Purpose :  enable variable in restart file when writing with XIOS  
     332      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_vars_active  *** 
     333      !! 
     334      !! ** Purpose :  define filename in XIOS context for reading file, 
     335      !!               enable variables present in a file for reading with XIOS  
     336      !!               id of the file is assumed to be rrestart. 
    305337      !!--------------------------------------------------------------------- 
    306    CHARACTER(len = *), INTENT(IN) :: field 
    307    INTEGER :: i 
    308    LOGICAL :: llis_set 
    309    CHARACTER(LEN=256) :: clinfo    ! info character 
    310  
     338      INTEGER, INTENT(IN) :: idnum  
     339       
    311340#if defined key_iomput 
    312    llis_set = .FALSE. 
    313  
    314    DO i = 1, max_rst_fields 
    315        IF(TRIM(rst_wfields(i)%vname) == field) THEN  
    316           rst_wfields(i)%active = .TRUE. 
    317           llis_set = .TRUE. 
    318           EXIT 
    319        ENDIF 
    320    ENDDO 
    321 !Warn if variable is not in defined in rst_wfields 
    322    IF(.NOT.llis_set) THEN 
    323       WRITE(ctmp1,*) 'iom_set_rstw_var_active: variable ', field ,' is available for writing but not defined'  
    324       CALL ctl_stop( 'iom_set_rstw_var_active:', ctmp1 ) 
    325    ENDIF 
    326 #else 
    327         clinfo = 'iom_set_rstw_var_active: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality' 
    328         CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo)) 
    329 #endif 
    330  
    331    END SUBROUTINE iom_set_rstw_var_active 
    332  
    333    SUBROUTINE iom_set_rstr_active() 
     341      INTEGER                                    :: ndims, nvars, natts, unlimitedDimId, dimlen, xtype,mdims 
     342      TYPE(xios_field)                           :: field_hdl 
     343      TYPE(xios_file)                            :: file_hdl 
     344      TYPE(xios_filegroup)                       :: filegroup_hdl 
     345      INTEGER                                    :: dimids(4), jv,i, idim 
     346      CHARACTER(LEN=256)                         :: clinfo               ! info character 
     347      INTEGER, ALLOCATABLE                       :: indimlens(:) 
     348      CHARACTER(LEN=nf90_max_name), ALLOCATABLE  :: indimnames(:) 
     349      CHARACTER(LEN=nf90_max_name)               :: dimname, varname 
     350      INTEGER                                    :: iln 
     351      CHARACTER(LEN=lc)                          :: fname 
     352      LOGICAL                                    :: lmeta 
     353!metadata in restart file for restart read with XIOS 
     354      INTEGER, PARAMETER                         :: NMETA = 10 
     355      CHARACTER(LEN=lc)                          :: meta(NMETA) 
     356 
     357 
     358      meta(1) = "nav_lat" 
     359      meta(2) = "nav_lon" 
     360      meta(3) = "nav_lev" 
     361      meta(4) = "time_instant" 
     362      meta(5) = "time_instant_bounds" 
     363      meta(6) = "time_counter" 
     364      meta(7) = "time_counter_bounds" 
     365      meta(8) = "x" 
     366      meta(9) = "y" 
     367      meta(10) = "numcat" 
     368 
     369      clinfo = '          iom_set_vars_active, file: '//TRIM(iom_file(idnum)%name) 
     370 
     371      iln = INDEX( iom_file(idnum)%name, '.nc' ) 
     372!XIOS doee not need .nc 
     373      IF(iln > 0) THEN 
     374        fname =  iom_file(idnum)%name(1:iln-1) 
     375      ELSE 
     376        fname =  iom_file(idnum)%name 
     377      ENDIF 
     378 
     379!set name of the restart file and enable available fields 
     380      CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl ) 
     381      CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'rrestart') 
     382      CALL xios_set_file_attr( "rrestart", name=fname, type="one_file",      & 
     383           par_access="collective", enabled=.TRUE., mode="read",              & 
     384                                                    output_freq=xios_timestep ) 
     385 
     386      CALL iom_nf90_check( nf90_inquire(iom_file(idnum)%nfid, ndims, nvars, natts ), clinfo ) 
     387      ALLOCATE(indimlens(ndims), indimnames(ndims)) 
     388      CALL iom_nf90_check( nf90_inquire(iom_file(idnum)%nfid, unlimitedDimId = unlimitedDimId ), clinfo ) 
     389 
     390      DO idim = 1, ndims 
     391         CALL iom_nf90_check( nf90_inquire_dimension(iom_file(idnum)%nfid, idim, dimname, dimlen ), clinfo ) 
     392         indimlens(idim) = dimlen 
     393         indimnames(idim) = dimname 
     394      ENDDO 
     395 
     396      DO jv =1, nvars 
     397         lmeta = .FALSE. 
     398         CALL iom_nf90_check( nf90_inquire_variable(iom_file(idnum)%nfid, jv, varname, xtype, ndims, dimids, natts ), clinfo ) 
     399         DO i = 1, NMETA 
     400           IF(varname == meta(i)) THEN 
     401             lmeta = .TRUE. 
     402           ENDIF 
     403         ENDDO 
     404         IF(.NOT.lmeta) THEN 
     405            CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, varname) 
     406            mdims = ndims 
     407 
     408            IF(ANY(dimids(1:ndims) == unlimitedDimId)) THEN 
     409               mdims = mdims - 1 
     410            ENDIF 
     411 
     412            IF(mdims == 3) THEN 
     413               CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = varname,   & 
     414                                   domain_ref="grid_N",                           & 
     415                                   axis_ref=iom_axis(indimlens(dimids(mdims))),   & 
     416                                   prec = 8, operation = "instant"                ) 
     417            ELSEIF(mdims == 2) THEN 
     418               CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = varname,  & 
     419                                   domain_ref="grid_N", prec = 8,                & 
     420                                   operation = "instant"                         )  
     421            ELSEIF(mdims == 1) THEN 
     422               CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = varname, & 
     423                                   axis_ref=iom_axis(indimlens(dimids(mdims))), & 
     424                                   prec = 8, operation = "instant"              ) 
     425            ELSEIF(mdims == 0) THEN 
     426               CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = varname, & 
     427                                   scalar_ref = "grid_scalar", prec = 8,        & 
     428                                   operation = "instant"                        ) 
     429            ELSE 
     430               WRITE(ctmp1,*) 'iom_set_vars_active: variable ', TRIM(varname) ,' incorrect number of dimensions'  
     431               CALL ctl_stop( 'iom_set_vars_active:', ctmp1 ) 
     432            ENDIF 
     433         ENDIF 
     434      ENDDO 
     435      DEALLOCATE(indimlens, indimnames) 
     436#endif 
     437   END SUBROUTINE iom_set_vars_active 
     438 
     439   SUBROUTINE iom_set_rstw_file(cdrst_file) 
    334440      !!--------------------------------------------------------------------- 
    335       !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstr_active  *** 
    336       !! 
    337       !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for reading restart file, 
    338       !!               enable variables present in restart file for reading with XIOS  
     441      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rstw_file   *** 
     442      !! 
     443      !! ** Purpose :  define file name in XIOS context for writing restart 
    339444      !!--------------------------------------------------------------------- 
    340  
    341 !sets enabled = .TRUE. for each field in restart file 
    342    CHARACTER(len=256) :: rst_file 
    343  
     445      CHARACTER(len=*) :: cdrst_file 
    344446#if defined key_iomput 
    345    TYPE(xios_field) :: field_hdl 
    346    TYPE(xios_file) :: file_hdl 
    347    TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl 
    348    INTEGER :: i 
    349    CHARACTER(lc)  ::   clpath 
    350  
    351         clpath = TRIM(cn_ocerst_indir) 
    352         IF( clpath(LEN_TRIM(clpath):) /= '/' ) clpath = TRIM(clpath) // '/' 
    353         IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
    354            rst_file = TRIM(clpath)//TRIM(cn_ocerst_in) 
    355         ELSE 
    356            rst_file = TRIM(clpath)//TRIM(Agrif_CFixed())//'_'//TRIM(cn_ocerst_in) 
    357         ENDIF 
     447      TYPE(xios_file) :: file_hdl 
     448      TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl 
     449 
    358450!set name of the restart file and enable available fields 
    359         if(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS) to: ',rst_file 
    360         CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl ) 
    361         CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'rrestart') 
    362         CALL xios_set_file_attr( "rrestart", name=trim(rst_file), type="one_file", & 
    363              par_access="collective", enabled=.TRUE., mode="read",                 & 
    364              output_freq=xios_timestep) 
    365 !define variables for restart context 
    366         DO i = 1, max_rst_fields 
    367          IF( TRIM(rst_rfields(i)%vname) /= "NO_NAME") THEN 
    368            IF( iom_varid( numror, TRIM(rst_rfields(i)%vname), ldstop = .FALSE. ) > 0 ) THEN 
    369                 CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_rfields(i)%vname)) 
    370                 SELECT CASE (TRIM(rst_rfields(i)%grid)) 
    371                  CASE ("grid_N_3D") 
    372                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), & 
    373                         domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", operation = "instant") 
    374                  CASE ("grid_N") 
    375                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), & 
    376                         domain_ref="grid_N", operation = "instant")  
    377                 CASE ("grid_vector") 
    378                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), & 
    379                          axis_ref="nav_lev", operation = "instant") 
    380                  CASE ("grid_scalar") 
    381                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_rfields(i)%vname), & 
    382                         scalar_ref = "grid_scalar", operation = "instant") 
    383                 END SELECT 
    384                 IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS read: ', TRIM(rst_rfields(i)%vname), ' enabled in ', TRIM(rst_file) 
    385            ENDIF 
    386          ENDIF 
    387         END DO 
    388 #endif 
    389    END SUBROUTINE iom_set_rstr_active 
    390  
    391    SUBROUTINE iom_set_rstw_core(cdmdl) 
    392       !!--------------------------------------------------------------------- 
    393       !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rstw_core  *** 
    394       !! 
    395       !! ** Purpose :  set variables which are always in restart file  
    396       !!--------------------------------------------------------------------- 
    397    CHARACTER (len=*), INTENT (IN) :: cdmdl ! model OPA or SAS 
    398    CHARACTER(LEN=256)             :: clinfo    ! info character 
    399 #if defined key_iomput 
    400    IF(cdmdl == "OPA") THEN 
    401 !from restart.F90 
    402    CALL iom_set_rstw_var_active("rn_Dt") 
    403    IF ( .NOT. ln_diurnal_only ) THEN 
    404         CALL iom_set_rstw_var_active('ub'  ) 
    405         CALL iom_set_rstw_var_active('vb'  ) 
    406         CALL iom_set_rstw_var_active('tb'  ) 
    407         CALL iom_set_rstw_var_active('sb'  ) 
    408         CALL iom_set_rstw_var_active('sshb') 
    409         ! 
    410         CALL iom_set_rstw_var_active('un'  ) 
    411         CALL iom_set_rstw_var_active('vn'  ) 
    412         CALL iom_set_rstw_var_active('tn'  ) 
    413         CALL iom_set_rstw_var_active('sn'  ) 
    414         CALL iom_set_rstw_var_active('sshn') 
    415         CALL iom_set_rstw_var_active('rhop') 
    416       ENDIF 
    417       IF(ln_diurnal) CALL iom_set_rstw_var_active('Dsst') 
    418 !from trasbc.F90 
    419          CALL iom_set_rstw_var_active('sbc_hc_b') 
    420          CALL iom_set_rstw_var_active('sbc_sc_b') 
    421    ENDIF 
    422 #else 
    423         clinfo = 'iom_set_rstw_core: key_iomput is needed to use XIOS restart read/write functionality' 
    424         CALL ctl_stop('STOP', TRIM(clinfo)) 
    425 #endif 
    426    END SUBROUTINE iom_set_rstw_core 
    427  
    428    SUBROUTINE iom_set_rst_vars(fields) 
    429       !!--------------------------------------------------------------------- 
    430       !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rst_vars   *** 
    431       !! 
    432       !! ** Purpose :  Fill array fields with the information about all  
    433       !!               possible variables and corresponding grids definition  
    434       !!               for reading/writing restart with XIOS 
    435       !!--------------------------------------------------------------------- 
    436    TYPE(RST_FIELD), INTENT(INOUT) :: fields(max_rst_fields) 
    437    INTEGER :: i 
    438  
    439         i = 0 
    440         i = i + 1; fields(i)%vname="rn_Dt";            fields(i)%grid="grid_scalar" 
    441         i = i + 1; fields(i)%vname="un";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    442         i = i + 1; fields(i)%vname="ub";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    443         i = i + 1; fields(i)%vname="vn";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    444         i = i + 1; fields(i)%vname="vb";             fields(i)%grid="grid_N_3D"   
    445         i = i + 1; fields(i)%vname="tn";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    446         i = i + 1; fields(i)%vname="tb";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    447         i = i + 1; fields(i)%vname="sn";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    448         i = i + 1; fields(i)%vname="sb";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    449         i = i + 1; fields(i)%vname="sshn";           fields(i)%grid="grid_N" 
    450         i = i + 1; fields(i)%vname="sshb";           fields(i)%grid="grid_N" 
    451         i = i + 1; fields(i)%vname="rhop";           fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    452         i = i + 1; fields(i)%vname="kt";             fields(i)%grid="grid_scalar" 
    453         i = i + 1; fields(i)%vname="ndastp";         fields(i)%grid="grid_scalar" 
    454         i = i + 1; fields(i)%vname="adatrj";         fields(i)%grid="grid_scalar" 
    455         i = i + 1; fields(i)%vname="utau_b";         fields(i)%grid="grid_N" 
    456         i = i + 1; fields(i)%vname="vtau_b";         fields(i)%grid="grid_N" 
    457         i = i + 1; fields(i)%vname="qns_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    458         i = i + 1; fields(i)%vname="emp_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    459         i = i + 1; fields(i)%vname="sfx_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    460         i = i + 1; fields(i)%vname="en" ;            fields(i)%grid="grid_N_3D"  
    461         i = i + 1; fields(i)%vname="avt_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    462         i = i + 1; fields(i)%vname="avm_k";            fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    463         i = i + 1; fields(i)%vname="dissl";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    464         i = i + 1; fields(i)%vname="sbc_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    465         i = i + 1; fields(i)%vname="sbc_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    466         i = i + 1; fields(i)%vname="qsr_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    467         i = i + 1; fields(i)%vname="fraqsr_1lev";    fields(i)%grid="grid_N" 
    468         i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass" 
    469                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    470         i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_timelapsed" 
    471                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    472         i = i + 1; fields(i)%vname="greenland_icesheet_mass_roc" 
    473                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    474         i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass" 
    475                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    476         i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_timelapsed" 
    477                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    478         i = i + 1; fields(i)%vname="antarctica_icesheet_mass_roc" 
    479                                                fields(i)%grid="grid_scalar" 
    480         i = i + 1; fields(i)%vname="frc_v";          fields(i)%grid="grid_scalar" 
    481         i = i + 1; fields(i)%vname="frc_t";          fields(i)%grid="grid_scalar" 
    482         i = i + 1; fields(i)%vname="frc_s";          fields(i)%grid="grid_scalar" 
    483         i = i + 1; fields(i)%vname="frc_wn_t";       fields(i)%grid="grid_scalar" 
    484         i = i + 1; fields(i)%vname="frc_wn_s";       fields(i)%grid="grid_scalar" 
    485         i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_ini";        fields(i)%grid="grid_N" 
    486         i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_ini";        fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    487         i = i + 1; fields(i)%vname="hc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    488         i = i + 1; fields(i)%vname="sc_loc_ini";     fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    489         i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_hc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N" 
    490         i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_sc_loc_ini"; fields(i)%grid="grid_N" 
    491         i = i + 1; fields(i)%vname="tilde_e3t_b";    fields(i)%grid="grid_N" 
    492         i = i + 1; fields(i)%vname="tilde_e3t_n";    fields(i)%grid="grid_N" 
    493         i = i + 1; fields(i)%vname="hdiv_lf";        fields(i)%grid="grid_N" 
    494         i = i + 1; fields(i)%vname="ub2_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    495         i = i + 1; fields(i)%vname="vb2_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    496         i = i + 1; fields(i)%vname="sshbb_e";        fields(i)%grid="grid_N" 
    497         i = i + 1; fields(i)%vname="ubb_e";          fields(i)%grid="grid_N" 
    498         i = i + 1; fields(i)%vname="vbb_e";          fields(i)%grid="grid_N" 
    499         i = i + 1; fields(i)%vname="sshb_e";         fields(i)%grid="grid_N" 
    500         i = i + 1; fields(i)%vname="ub_e";           fields(i)%grid="grid_N" 
    501         i = i + 1; fields(i)%vname="vb_e";           fields(i)%grid="grid_N" 
    502         i = i + 1; fields(i)%vname="fwf_isf_b";      fields(i)%grid="grid_N" 
    503         i = i + 1; fields(i)%vname="isf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    504         i = i + 1; fields(i)%vname="isf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    505         i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_ibb";        fields(i)%grid="grid_N" 
    506         i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_b";          fields(i)%grid="grid_N" 
    507         i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_hc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    508         i = i + 1; fields(i)%vname="rnf_sc_b";       fields(i)%grid="grid_N" 
    509         i = i + 1; fields(i)%vname="nn_fsbc";        fields(i)%grid="grid_scalar" 
    510         i = i + 1; fields(i)%vname="ssu_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    511         i = i + 1; fields(i)%vname="ssv_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    512         i = i + 1; fields(i)%vname="sst_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    513         i = i + 1; fields(i)%vname="sss_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    514         i = i + 1; fields(i)%vname="ssh_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    515         i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    516         i = i + 1; fields(i)%vname="frq_m";          fields(i)%grid="grid_N" 
    517         i = i + 1; fields(i)%vname="avmb";           fields(i)%grid="grid_vector" 
    518         i = i + 1; fields(i)%vname="avtb";           fields(i)%grid="grid_vector" 
    519         i = i + 1; fields(i)%vname="ub2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N" 
    520         i = i + 1; fields(i)%vname="vb2_i_b";        fields(i)%grid="grid_N" 
    521         i = i + 1; fields(i)%vname="ntime";          fields(i)%grid="grid_scalar" 
    522         i = i + 1; fields(i)%vname="Dsst";           fields(i)%grid="grid_scalar" 
    523         i = i + 1; fields(i)%vname="tmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    524         i = i + 1; fields(i)%vname="umask";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    525         i = i + 1; fields(i)%vname="vmask";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    526         i = i + 1; fields(i)%vname="smask";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    527         i = i + 1; fields(i)%vname="gdepw_n";        fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    528         i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    529         i = i + 1; fields(i)%vname="e3u_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    530         i = i + 1; fields(i)%vname="e3v_n";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    531         i = i + 1; fields(i)%vname="surf_ini";       fields(i)%grid="grid_N" 
    532         i = i + 1; fields(i)%vname="e3t_b";          fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    533         i = i + 1; fields(i)%vname="hmxl_n";         fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    534         i = i + 1; fields(i)%vname="un_bf";          fields(i)%grid="grid_N" 
    535         i = i + 1; fields(i)%vname="vn_bf";          fields(i)%grid="grid_N" 
    536         i = i + 1; fields(i)%vname="hbl";            fields(i)%grid="grid_N" 
    537         i = i + 1; fields(i)%vname="hbli";           fields(i)%grid="grid_N" 
    538         i = i + 1; fields(i)%vname="wn";             fields(i)%grid="grid_N_3D" 
    539  
    540         IF( i-1 > max_rst_fields) THEN 
    541            WRITE(ctmp1,*) 'E R R O R : iom_set_rst_vars SIZE of RST_FIELD array is too small' 
    542            CALL ctl_stop( 'iom_set_rst_vars:', ctmp1 ) 
    543         ENDIF 
    544    END SUBROUTINE iom_set_rst_vars 
    545  
    546  
    547    SUBROUTINE iom_set_rstw_active(cdrst_file) 
     451      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS write) to: ', TRIM(cdrst_file) 
     452      CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl ) 
     453      CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'wrestart') 
     454      IF(nxioso.eq.1) THEN  
     455         CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="one_file", enabled=.TRUE.,&  
     456                                       mode="write", output_freq=xios_timestep)  
     457         IF(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in one_file mode'  
     458      ELSE   
     459         CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="multiple_file", enabled=.TRUE.,&  
     460                                            mode="write", output_freq=xios_timestep)  
     461         IF(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in multiple_file mode'  
     462      ENDIF  
     463      CALL xios_set_file_attr( "wrestart", name=trim(cdrst_file)) 
     464#endif 
     465   END SUBROUTINE iom_set_rstw_file 
     466 
     467 
     468   SUBROUTINE iom_set_rstw_active(sdfield, rd0, rs0, rd1, rs1, rd2, rs2, rd3, rs3) 
    548469      !!--------------------------------------------------------------------- 
    549470      !!                   ***  SUBROUTINE iom_set_rstw_active   *** 
     
    553474      !!--------------------------------------------------------------------- 
    554475!sets enabled = .TRUE. for each field in restart file 
    555    CHARACTER(len=*) :: cdrst_file 
     476      CHARACTER(len = *), INTENT(IN)                     :: sdfield 
     477      REAL(dp), OPTIONAL, INTENT(IN)                     :: rd0 
     478      REAL(sp), OPTIONAL, INTENT(IN)                     :: rs0 
     479      REAL(dp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:)       :: rd1 
     480      REAL(sp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:)       :: rs1 
     481      REAL(dp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:, :)    :: rd2 
     482      REAL(sp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:, :)    :: rs2 
     483      REAL(dp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:, :, :) :: rd3   
     484      REAL(sp), OPTIONAL, INTENT(IN), DIMENSION(:, :, :) :: rs3 
    556485#if defined key_iomput 
    557    TYPE(xios_field) :: field_hdl 
    558    TYPE(xios_file) :: file_hdl 
    559    TYPE(xios_filegroup) :: filegroup_hdl 
    560    INTEGER :: i 
    561    CHARACTER(lc)  ::   clpath 
    562  
    563 !set name of the restart file and enable available fields 
    564         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Setting restart filename (for XIOS write) to: ',cdrst_file 
    565         CALL xios_get_handle("file_definition", filegroup_hdl ) 
    566         CALL xios_add_child(filegroup_hdl, file_hdl, 'wrestart') 
    567         IF(nxioso.eq.1) THEN  
    568            CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="one_file", enabled=.TRUE.,&  
    569                                     mode="write", output_freq=xios_timestep)  
    570            if(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in one_file mode'  
    571         ELSE   
    572            CALL xios_set_file_attr( "wrestart", type="multiple_file", enabled=.TRUE.,&  
    573                                     mode="write", output_freq=xios_timestep)  
    574            if(lwp) write(numout,*) 'OPEN ', trim(cdrst_file), ' in multiple_file mode'  
    575         ENDIF  
    576         CALL xios_set_file_attr( "wrestart", name=trim(cdrst_file)) 
     486      TYPE(xios_field) :: field_hdl 
     487      TYPE(xios_file) :: file_hdl 
     488 
     489      CALL xios_get_handle("wrestart", file_hdl) 
    577490!define fields for restart context 
    578         DO i = 1, max_rst_fields 
    579          IF( rst_wfields(i)%active ) THEN 
    580                 CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, TRIM(rst_wfields(i)%vname)) 
    581                 SELECT CASE (TRIM(rst_wfields(i)%grid)) 
    582                  CASE ("grid_N_3D") 
    583                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), & 
    584                         domain_ref="grid_N", axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant") 
    585                  CASE ("grid_N") 
    586                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), & 
    587                         domain_ref="grid_N", prec = 8, operation = "instant")  
    588                  CASE ("grid_vector") 
    589                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), & 
    590                          axis_ref="nav_lev", prec = 8, operation = "instant") 
    591                  CASE ("grid_scalar") 
    592                     CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = TRIM(rst_wfields(i)%vname), & 
    593                         scalar_ref = "grid_scalar", prec = 8, operation = "instant") 
    594                 END SELECT 
    595          ENDIF 
    596         END DO 
     491      CALL xios_add_child(file_hdl, field_hdl, sdfield) 
     492 
     493      IF(PRESENT(rd3)) THEN 
     494         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     495                             domain_ref = "grid_N",                       & 
     496                             axis_ref = iom_axis(size(rd3, 3)),           & 
     497                             prec = 8, operation = "instant"              ) 
     498      ELSEIF(PRESENT(rs3)) THEN 
     499         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     500                             domain_ref = "grid_N",                       & 
     501                             axis_ref = iom_axis(size(rd3, 3)),           & 
     502                             prec = 4, operation = "instant"              ) 
     503      ELSEIF(PRESENT(rd2)) THEN 
     504         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     505                             domain_ref = "grid_N", prec = 8,             & 
     506                             operation = "instant"                        )  
     507      ELSEIF(PRESENT(rs2)) THEN 
     508         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     509                             domain_ref = "grid_N", prec = 4,             & 
     510                             operation = "instant"                        ) 
     511      ELSEIF(PRESENT(rd1)) THEN 
     512         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     513                             axis_ref = iom_axis(size(rd1, 1)),           & 
     514                             prec = 8, operation = "instant"              ) 
     515      ELSEIF(PRESENT(rs1)) THEN 
     516         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     517                             axis_ref = iom_axis(size(rd1, 1)),           & 
     518                             prec = 4, operation = "instant"              ) 
     519      ELSEIF(PRESENT(rd0)) THEN 
     520         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     521                             scalar_ref = "grid_scalar", prec = 8,        & 
     522                             operation = "instant"                        ) 
     523      ELSEIF(PRESENT(rs0)) THEN 
     524         CALL xios_set_attr (field_hdl, enabled = .TRUE., name = sdfield, & 
     525                             scalar_ref = "grid_scalar", prec = 4,        & 
     526                             operation = "instant"                        ) 
     527      ENDIF 
    597528#endif 
    598529   END SUBROUTINE iom_set_rstw_active 
    599530 
     531   FUNCTION iom_axis(idlev) result(axis_ref) 
     532      !!--------------------------------------------------------------------- 
     533      !!                   ***  FUNCTION  iom_axis  *** 
     534      !! 
     535      !! ** Purpose : Used for grid definition when XIOS is used to read/write 
     536      !!              restart. Returns axis corresponding to the number of levels 
     537      !!              given as an input variable. Axes are defined in routine  
     538      !!              iom_set_rst_context 
     539      !!--------------------------------------------------------------------- 
     540      INTEGER, INTENT(IN) :: idlev 
     541      CHARACTER(len=lc)   :: axis_ref 
     542      CHARACTER(len=12)   :: str 
     543      IF(idlev == jpk) THEN 
     544         axis_ref="nav_lev" 
     545#if defined key_si3 
     546      ELSEIF(idlev == jpl) THEN 
     547         axis_ref="numcat" 
     548#endif          
     549      ELSE 
     550         write(str, *) idlev 
     551         CALL ctl_stop( 'iom_axis', 'Definition for axis with '//TRIM(ADJUSTL(str))//' levels missing') 
     552      ENDIF 
     553   END FUNCTION iom_axis 
     554 
     555   FUNCTION iom_xios_setid(cdname) result(kid) 
     556     !!--------------------------------------------------------------------- 
     557      !!                   ***  FUNCTION    *** 
     558      !! 
     559      !! ** Purpose : this function returns first available id to keep information about file  
     560      !!              sets filename in iom_file structure and sets name 
     561      !!              of XIOS context depending on cdcomp 
     562      !!              corresponds to iom_nf90_open 
     563      !!--------------------------------------------------------------------- 
     564      CHARACTER(len=*), INTENT(in   ) :: cdname      ! File name 
     565      INTEGER                         :: kid      ! identifier of the opened file 
     566      INTEGER                         :: jl 
     567 
     568      kid = 0 
     569      DO jl = jpmax_files, 1, -1 
     570         IF( iom_file(jl)%nfid == 0 )   kid = jl 
     571      ENDDO 
     572 
     573      iom_file(kid)%name   = TRIM(cdname) 
     574      iom_file(kid)%nfid   = 1 
     575      iom_file(kid)%nvars  = 0 
     576      iom_file(kid)%irec   = -1 
     577 
     578   END FUNCTION iom_xios_setid 
     579 
    600580   SUBROUTINE iom_set_rst_context(ld_rstr)  
    601      !!--------------------------------------------------------------------- 
     581      !!--------------------------------------------------------------------- 
    602582      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rst_context  *** 
    603583      !! 
     
    606586      !!                
    607587      !!--------------------------------------------------------------------- 
    608    LOGICAL, INTENT(IN)               :: ld_rstr 
    609 !ld_rstr is true for restart context. There is no need to define grid for  
    610 !restart read, because it's read from file 
     588      LOGICAL, INTENT(IN)               :: ld_rstr 
     589      INTEGER :: ji 
    611590#if defined key_iomput 
    612    TYPE(xios_domaingroup)            :: domaingroup_hdl  
    613    TYPE(xios_domain)                 :: domain_hdl  
    614    TYPE(xios_axisgroup)              :: axisgroup_hdl  
    615    TYPE(xios_axis)                   :: axis_hdl  
    616    TYPE(xios_scalar)                 :: scalar_hdl  
    617    TYPE(xios_scalargroup)            :: scalargroup_hdl  
    618  
    619      CALL xios_get_handle("domain_definition",domaingroup_hdl)  
    620      CALL xios_add_child(domaingroup_hdl, domain_hdl, "grid_N")  
    621      CALL set_grid("N", glamt, gphit, .TRUE., ld_rstr)  
     591      TYPE(xios_domaingroup)            :: domaingroup_hdl  
     592      TYPE(xios_domain)                 :: domain_hdl  
     593      TYPE(xios_axisgroup)              :: axisgroup_hdl  
     594      TYPE(xios_axis)                   :: axis_hdl  
     595      TYPE(xios_scalar)                 :: scalar_hdl  
     596      TYPE(xios_scalargroup)            :: scalargroup_hdl  
     597 
     598      CALL xios_get_handle("domain_definition",domaingroup_hdl)  
     599      CALL xios_add_child(domaingroup_hdl, domain_hdl, "grid_N")  
     600      CALL set_grid("N", glamt, gphit, .TRUE., ld_rstr)  
    622601  
    623      CALL xios_get_handle("axis_definition",axisgroup_hdl)  
    624      CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nav_lev")  
     602      CALL xios_get_handle("axis_definition",axisgroup_hdl)  
     603      CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "nav_lev")  
    625604!AGRIF fails to compile when unit= is in call to xios_set_axis_attr 
    626 !    CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels",  unit="m", positive="down")  
    627      CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels in meters", positive="down") 
    628      CALL iom_set_axis_attr( "nav_lev", paxis = gdept_1d )  
    629  
    630      CALL xios_get_handle("scalar_definition", scalargroup_hdl)  
    631      CALL xios_add_child(scalargroup_hdl, scalar_hdl, "grid_scalar")  
     605!     CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name="Vertical levels",  unit="m", positive="down")  
     606      CALL xios_set_axis_attr( "nav_lev", long_name = "Vertical levels in meters", positive = "down") 
     607      CALL iom_set_axis_attr( "nav_lev", paxis = gdept_1d )  
     608#if defined key_si3 
     609      CALL xios_add_child(axisgroup_hdl, axis_hdl, "numcat") 
     610      CALL iom_set_axis_attr( "numcat", (/ (REAL(ji,wp), ji=1,jpl) /) ) 
     611#endif 
     612      CALL xios_get_handle("scalar_definition", scalargroup_hdl)  
     613      CALL xios_add_child(scalargroup_hdl, scalar_hdl, "grid_scalar")  
    632614#endif 
    633615   END SUBROUTINE iom_set_rst_context 
     616 
     617 
     618   SUBROUTINE set_xios_context(kdid, cdcont)  
     619      !!--------------------------------------------------------------------- 
     620      !!                   ***  SUBROUTINE  iom_set_rst_context  *** 
     621      !! 
     622      !! ** Purpose : set correct XIOS context based on kdid 
     623      !!                
     624      !!--------------------------------------------------------------------- 
     625      INTEGER,           INTENT(IN)     :: kdid           ! Identifier of the file 
     626      CHARACTER(LEN=lc), INTENT(OUT)    :: cdcont         ! name of the context for XIOS read/write 
     627       
     628      cdcont = "NONE" 
     629 
     630      IF(lrxios) THEN 
     631         IF(kdid == numror) THEN 
     632            cdcont = cr_ocerst_cxt 
     633         ELSEIF(kdid == numrir) THEN 
     634            cdcont = cr_icerst_cxt  
     635         ELSEIF(kdid == numrtr) THEN 
     636            cdcont = cr_toprst_cxt 
     637         ELSEIF(kdid == numrsr) THEN 
     638            cdcont = cr_sedrst_cxt 
     639         ENDIF 
     640      ENDIF 
     641 
     642      IF(lwxios) THEN 
     643         IF(kdid == numrow) THEN 
     644            cdcont = cw_ocerst_cxt 
     645         ELSEIF(kdid == numriw) THEN 
     646            cdcont = cw_icerst_cxt 
     647         ELSEIF(kdid == numrtw) THEN 
     648            cdcont = cw_toprst_cxt 
     649         ELSEIF(kdid == numrsw) THEN 
     650            cdcont = cw_sedrst_cxt 
     651         ENDIF 
     652      ENDIF 
     653   END SUBROUTINE set_xios_context 
     654 
    634655 
    635656   SUBROUTINE iom_swap( cdname ) 
     
    642663#if defined key_iomput 
    643664      TYPE(xios_context) :: nemo_hdl 
    644  
    645665      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN 
    646666        CALL xios_get_handle(TRIM(cdname),nemo_hdl) 
     
    892912   !!                   INTERFACE iom_get 
    893913   !!---------------------------------------------------------------------- 
    894    SUBROUTINE iom_g0d_sp( kiomid, cdvar, pvar, ktime, ldxios ) 
     914   SUBROUTINE iom_g0d_sp( kiomid, cdvar, pvar, ktime ) 
    895915      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    896916      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable 
     
    898918      REAL(dp)                                        ::   ztmp_pvar ! tmp var to read field 
    899919      INTEGER         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ktime     ! record number 
    900       LOGICAL         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ldxios    ! use xios to read restart 
    901920      ! 
    902921      INTEGER                                         ::   idvar     ! variable id 
     
    906925      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clname    ! file name 
    907926      CHARACTER(LEN=1)                                ::   cldmspc   ! 
    908       LOGICAL                                         ::   llxios 
    909       ! 
    910       llxios = .FALSE. 
    911       IF( PRESENT(ldxios) ) llxios = ldxios 
    912  
    913       IF(.NOT.llxios) THEN  ! read data using default library 
     927      CHARACTER(LEN=lc)                               ::   context 
     928      ! 
     929      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
     930 
     931      IF(context == "NONE") THEN  ! read data using default library 
    914932         itime = 1 
    915933         IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime 
     
    934952#if defined key_iomput 
    935953         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (0D): ', trim(cdvar) 
    936          CALL iom_swap( TRIM(crxios_context) ) 
     954         CALL iom_swap(context) 
    937955         CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pvar) 
    938          CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) ) 
     956         CALL iom_swap(cxios_context) 
    939957#else 
    940958         WRITE(ctmp1,*) 'Can not use XIOS in iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar) 
     
    944962   END SUBROUTINE iom_g0d_sp 
    945963 
    946    SUBROUTINE iom_g0d_dp( kiomid, cdvar, pvar, ktime, ldxios ) 
     964   SUBROUTINE iom_g0d_dp( kiomid, cdvar, pvar, ktime ) 
    947965      INTEGER         , INTENT(in   )                 ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    948966      CHARACTER(len=*), INTENT(in   )                 ::   cdvar     ! Name of the variable 
    949967      REAL(dp)        , INTENT(  out)                 ::   pvar      ! read field 
    950968      INTEGER         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ktime     ! record number 
    951       LOGICAL         , INTENT(in   ),     OPTIONAL   ::   ldxios    ! use xios to read restart 
    952969      ! 
    953970      INTEGER                                         ::   idvar     ! variable id 
     
    957974      CHARACTER(LEN=100)                              ::   clname    ! file name 
    958975      CHARACTER(LEN=1)                                ::   cldmspc   ! 
    959       LOGICAL                                         ::   llxios 
    960       ! 
    961       llxios = .FALSE. 
    962       IF( PRESENT(ldxios) ) llxios = ldxios 
    963  
    964       IF(.NOT.llxios) THEN  ! read data using default library 
     976      CHARACTER(LEN=lc)                               ::   context 
     977      ! 
     978      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
     979 
     980      IF(context == "NONE") THEN  ! read data using default library 
    965981         itime = 1 
    966982         IF( PRESENT(ktime) ) itime = ktime 
     
    9841000#if defined key_iomput 
    9851001         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (0D): ', trim(cdvar) 
    986          CALL iom_swap( TRIM(crxios_context) ) 
     1002         CALL iom_swap(context) 
    9871003         CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pvar) 
    988          CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) ) 
     1004         CALL iom_swap(cxios_context) 
    9891005#else 
    9901006         WRITE(ctmp1,*) 'Can not use XIOS in iom_g0d, file: '//trim(clname)//', var:'//trim(cdvar) 
     
    9941010   END SUBROUTINE iom_g0d_dp 
    9951011 
    996    SUBROUTINE iom_g1d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, ldxios ) 
     1012   SUBROUTINE iom_g1d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount ) 
    9971013      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    9981014      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    10031019      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    10041020      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1005       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    10061021      ! 
    10071022      IF( kiomid > 0 ) THEN 
     
    10091024            ALLOCATE(ztmp_pvar(size(pvar,1))) 
    10101025            CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=ztmp_pvar,   & 
    1011               &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, & 
    1012               &                                                     ldxios=ldxios ) 
     1026              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount ) 
    10131027            pvar = ztmp_pvar 
    10141028            DEALLOCATE(ztmp_pvar) 
     
    10181032 
    10191033 
    1020    SUBROUTINE iom_g1d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount, ldxios ) 
     1034   SUBROUTINE iom_g1d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, kstart, kcount ) 
    10211035      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    10221036      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    10261040      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    10271041      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(1), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1028       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    10291042      ! 
    10301043      IF( kiomid > 0 ) THEN 
    10311044         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom       , cdvar        , pv_r1d=pvar,   & 
    1032               &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount, & 
    1033               &                                                     ldxios=ldxios ) 
     1045              &                                                     ktime=ktime, kstart=kstart, kcount=kcount) 
    10341046      ENDIF 
    10351047   END SUBROUTINE iom_g1d_dp 
    10361048 
    1037    SUBROUTINE iom_g2d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount, ldxios) 
     1049   SUBROUTINE iom_g2d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount) 
    10381050      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    10391051      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    10471059      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    10481060      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1049       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    10501061      ! 
    10511062      IF( kiomid > 0 ) THEN 
     
    10541065            CALL iom_get_123d( kiomid, kdom, cdvar      , pv_r2d = ztmp_pvar  , ktime = ktime,   & 
    10551066             &                                                      cd_type = cd_type, psgn   = psgn  , kfill = kfill,   & 
    1056              &                                                      kstart  = kstart , kcount = kcount, ldxios=ldxios  ) 
     1067             &                                                      kstart  = kstart , kcount = kcount  ) 
    10571068            pvar = ztmp_pvar 
    10581069            DEALLOCATE(ztmp_pvar) 
     
    10611072   END SUBROUTINE iom_g2d_sp 
    10621073 
    1063    SUBROUTINE iom_g2d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount, ldxios) 
     1074   SUBROUTINE iom_g2d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount) 
    10641075      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    10651076      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    10721083      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    10731084      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(2), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1074       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    10751085      ! 
    10761086      IF( kiomid > 0 ) THEN 
    10771087         IF( iom_file(kiomid)%nfid > 0 ) CALL iom_get_123d( kiomid, kdom, cdvar      , pv_r2d = pvar  , ktime = ktime,   & 
    10781088            &                                                       cd_type = cd_type, psgn   = psgn  , kfill = kfill,   & 
    1079             &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount, ldxios=ldxios  ) 
     1089            &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount                ) 
    10801090      ENDIF 
    10811091   END SUBROUTINE iom_g2d_dp 
    10821092 
    1083    SUBROUTINE iom_g3d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount, ldxios ) 
     1093   SUBROUTINE iom_g3d_sp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount ) 
    10841094      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    10851095      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    10931103      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    10941104      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1095       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    10961105      ! 
    10971106      IF( kiomid > 0 ) THEN 
     
    11001109            CALL iom_get_123d( kiomid, kdom, cdvar      , pv_r3d = ztmp_pvar  , ktime = ktime,   & 
    11011110            &                                                       cd_type = cd_type, psgn   = psgn  , kfill = kfill,   & 
    1102             &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount, ldxios=ldxios  ) 
     1111            &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount                ) 
    11031112            pvar = ztmp_pvar 
    11041113            DEALLOCATE(ztmp_pvar) 
     
    11071116   END SUBROUTINE iom_g3d_sp 
    11081117 
    1109    SUBROUTINE iom_g3d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount, ldxios ) 
     1118   SUBROUTINE iom_g3d_dp( kiomid, kdom, cdvar, pvar, ktime, cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount ) 
    11101119      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kiomid    ! Identifier of the file 
    11111120      INTEGER         , INTENT(in   )                         ::   kdom      ! Type of domain to be read 
     
    11181127      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3), OPTIONAL ::   kstart    ! start axis position of the reading  
    11191128      INTEGER         , INTENT(in   ), DIMENSION(3), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points in each axis 
    1120       LOGICAL         , INTENT(in   ),               OPTIONAL ::   ldxios    ! read data using XIOS 
    11211129      ! 
    11221130      IF( kiomid > 0 ) THEN 
     
    11241132            CALL iom_get_123d( kiomid, kdom, cdvar      , pv_r3d = pvar  , ktime = ktime,   & 
    11251133            &                                                       cd_type = cd_type, psgn   = psgn  , kfill = kfill,   & 
    1126             &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount, ldxios=ldxios  ) 
     1134            &                                                       kstart  = kstart , kcount = kcount                ) 
    11271135         END IF 
    11281136      ENDIF 
     
    11321140 
    11331141   SUBROUTINE iom_get_123d( kiomid , kdom, cdvar, pv_r1d, pv_r2d, pv_r3d, ktime ,   & 
    1134          &                  cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount, ldxios ) 
     1142         &                  cd_type, psgn, kfill, kstart, kcount ) 
    11351143      !!----------------------------------------------------------------------- 
    11361144      !!                  ***  ROUTINE  iom_get_123d  *** 
     
    11521160      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kstart    ! start position of the reading in each axis  
    11531161      INTEGER , DIMENSION(:)     , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   kcount    ! number of points to be read in each axis 
    1154       LOGICAL                    , INTENT(in   ), OPTIONAL ::   ldxios    ! use XIOS to read restart 
    11551162      ! 
    11561163      LOGICAL                        ::   llok        ! true if ok! 
    1157       LOGICAL                        ::   llxios      ! local definition for XIOS read 
    11581164      INTEGER                        ::   jl          ! loop on number of dimension  
    11591165      INTEGER                        ::   idom        ! type of domain 
     
    11821188      REAL(dp)                       ::   gma, gmi 
    11831189      !--------------------------------------------------------------------- 
    1184       ! 
     1190      CHARACTER(LEN=lc)                               ::   context 
     1191      ! 
     1192      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
    11851193      inlev = -1 
    11861194      IF( PRESENT(pv_r3d) )   inlev = SIZE(pv_r3d, 3) 
    11871195      ! 
    1188       llxios = .FALSE. 
    1189       IF( PRESENT(ldxios) )   llxios = ldxios 
    1190       ! 
    11911196      idom = kdom 
    11921197      istop = nstop 
    11931198      ! 
    1194       IF(.NOT.llxios) THEN 
     1199      IF(context == "NONE") THEN 
    11951200         clname = iom_file(kiomid)%name   !   esier to read 
    11961201         clinfo = '          iom_get_123d, file: '//trim(clname)//', var: '//trim(cdvar) 
     
    13591364#if defined key_iomput 
    13601365!would be good to be able to check which context is active and swap only if current is not restart 
    1361          CALL iom_swap( TRIM(crxios_context) )  
     1366         idvar = iom_varid( kiomid, cdvar ) 
     1367         CALL iom_swap(context) 
     1368         zsgn = 1._wp 
     1369         IF( PRESENT(psgn   ) )   zsgn    = psgn 
     1370         cl_type = 'T' 
     1371         IF( PRESENT(cd_type) )   cl_type = cd_type 
     1372 
    13621373         IF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN 
    13631374            IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (3D): ',TRIM(cdvar) 
    1364             CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r3d) 
    1365             IF(idom /= jpdom_unknown )   CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d,'Z', -999., kfillmode = jpfillnothing) 
     1375            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r3d(:, :, :)) 
     1376            IF(idom /= jpdom_unknown .AND. cl_type /= 'Z' ) THEN 
     1377               CALL lbc_lnk( 'iom', pv_r3d, cl_type, zsgn, kfillmode = kfill) 
     1378            ENDIF 
    13661379         ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN 
    13671380            IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (2D): ', TRIM(cdvar) 
    1368             CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r2d) 
    1369             IF(idom /= jpdom_unknown )   CALL lbc_lnk('iom', pv_r2d,'Z',-999., kfillmode = jpfillnothing) 
     1381            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r2d(:, :)) 
     1382            IF(idom /= jpdom_unknown .AND. cl_type /= 'Z' ) THEN 
     1383               CALL lbc_lnk('iom', pv_r2d, cl_type, zsgn, kfillmode = kfill) 
     1384            ENDIF 
    13701385         ELSEIF( PRESENT(pv_r1d) ) THEN 
    13711386            IF(lwp) WRITE(numout,*) 'XIOS RST READ (1D): ', TRIM(cdvar) 
    13721387            CALL xios_recv_field( trim(cdvar), pv_r1d) 
    13731388         ENDIF 
    1374          CALL iom_swap( TRIM(cxios_context) ) 
     1389         CALL iom_swap(cxios_context) 
    13751390#else 
    13761391         istop = istop + 1  
     
    13871402      zofs = iom_file(kiomid)%ofs(idvar)      ! offset 
    13881403      IF(     PRESENT(pv_r1d) ) THEN 
    1389          IF( zscf /= 1. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf  
    1390          IF( zofs /= 0. )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs 
     1404         IF( zscf /= 1._wp )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) * zscf  
     1405         IF( zofs /= 0._wp )   pv_r1d(:) = pv_r1d(:) + zofs 
    13911406      ELSEIF( PRESENT(pv_r2d) ) THEN 
    1392          IF( zscf /= 1.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf 
    1393          IF( zofs /= 0.)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs 
     1407         IF( zscf /= 1._wp)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) * zscf 
     1408         IF( zofs /= 0._wp)   pv_r2d(:,:) = pv_r2d(:,:) + zofs 
    13941409      ELSEIF( PRESENT(pv_r3d) ) THEN 
    1395          IF( zscf /= 1.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf 
    1396          IF( zofs /= 0.)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs 
     1410         IF( zscf /= 1._wp)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) * zscf 
     1411         IF( zofs /= 0._wp)   pv_r3d(:,:,:) = pv_r3d(:,:,:) + zofs 
    13971412      ENDIF 
    13981413      ! 
     
    15681583   !!                   INTERFACE iom_rstput 
    15691584   !!---------------------------------------------------------------------- 
    1570    SUBROUTINE iom_rp0d_sp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios ) 
     1585   SUBROUTINE iom_rp0d_sp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype ) 
    15711586      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step 
    15721587      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step 
     
    15751590      REAL(sp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field 
    15761591      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type 
    1577       LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag 
    1578       LOGICAL :: llx                ! local xios write flag 
    1579       INTEGER :: ivid   ! variable id 
    1580  
    1581       llx = .FALSE. 
    1582       IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios 
     1592      ! 
     1593      LOGICAL           :: llx                ! local xios write flag 
     1594      INTEGER           :: ivid   ! variable id 
     1595      CHARACTER(LEN=lc) :: context 
     1596      ! 
     1597      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
     1598 
     1599      llx = .NOT. (context == "NONE") 
     1600 
    15831601      IF( llx ) THEN 
    15841602#ifdef key_iomput 
    1585       IF( kt == kwrite ) THEN 
    1586           IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
    1587           CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar) 
    1588       ENDIF 
     1603         IF( kt == kwrite ) THEN 
     1604            IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
     1605            CALL iom_swap(context) 
     1606            CALL iom_put(trim(cdvar), pvar) 
     1607            CALL iom_swap(cxios_context) 
     1608         ELSE 
     1609            IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: define (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
     1610            CALL iom_swap(context) 
     1611            CALL iom_set_rstw_active( trim(cdvar), rs0 = pvar )  
     1612            CALL iom_swap(cxios_context) 
     1613         ENDIF 
    15891614#endif 
    15901615      ELSE 
     
    15981623   END SUBROUTINE iom_rp0d_sp 
    15991624 
    1600    SUBROUTINE iom_rp0d_dp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios ) 
     1625   SUBROUTINE iom_rp0d_dp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype ) 
    16011626      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step 
    16021627      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step 
     
    16051630      REAL(dp)        , INTENT(in)                         ::   pvar     ! written field 
    16061631      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type 
    1607       LOGICAL, OPTIONAL :: ldxios   ! xios write flag 
    1608       LOGICAL :: llx                ! local xios write flag 
    1609       INTEGER :: ivid   ! variable id 
    1610  
    1611       llx = .FALSE. 
    1612       IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios 
     1632      ! 
     1633      LOGICAL           :: llx                ! local xios write flag 
     1634      INTEGER           :: ivid   ! variable id 
     1635      CHARACTER(LEN=lc) :: context 
     1636      ! 
     1637      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
     1638 
     1639      llx = .NOT. (context == "NONE") 
     1640 
    16131641      IF( llx ) THEN 
    16141642#ifdef key_iomput 
    1615       IF( kt == kwrite ) THEN 
    1616           IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
    1617           CALL xios_send_field(trim(cdvar), pvar) 
    1618       ENDIF 
     1643         IF( kt == kwrite ) THEN 
     1644            IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: write (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
     1645            CALL iom_swap(context) 
     1646            CALL iom_put(trim(cdvar), pvar) 
     1647            CALL iom_swap(cxios_context) 
     1648         ELSE 
     1649            IF(lwp) write(numout,*) 'RESTART: define (XIOS 0D) ',trim(cdvar) 
     1650            CALL iom_swap(context) 
     1651            CALL iom_set_rstw_active( trim(cdvar), rd0 = pvar )  
     1652            CALL iom_swap(cxios_context) 
     1653         ENDIF 
    16191654#endif 
    16201655      ELSE 
     
    16291664 
    16301665 
    1631    SUBROUTINE iom_rp1d_sp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype, ldxios ) 
     1666   SUBROUTINE iom_rp1d_sp( kt, kwrite, kiomid, cdvar, pvar, ktype ) 
    16321667      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kt       ! ocean time-step 
    16331668      INTEGER         , INTENT(in)                         ::   kwrite   ! writing time-step 
     
    16361671      REAL(sp)        , INTENT(in), DIMENSION(          :) ::   pvar     ! written field 
    16371672      INTEGER         , INTENT(in), OPTIONAL               ::   ktype    ! variable external type 
    1638       LOGICAL, OPTIONAL                                    ::   ldxios   ! xios write flag 
    1639       LOGICAL :: llx                ! local xios write flag 
    1640       INTEGER :: ivid   ! variable id 
    1641  
    1642       llx = .FALSE. 
    1643       IF(PRESENT(ldxios)) llx = ldxios 
     1673      ! 
     1674      LOGICAL           :: llx                ! local xios write flag 
     1675      INTEGER           :: ivid   ! variable id 
     1676      CHARACTER(LEN=lc) :: context 
     1677      ! 
     1678      CALL set_xios_context(kiomid, context) 
     1679 
     1680      llx = .NOT. (context == "NONE") 
     1681 
    16441682      IF( llx ) THEN