Ignore:
Timestamp:
2012-01-28T17:44:18+01:00 (10 years ago)
Author:
rblod
Message:

Merge of 3.4beta into the trunk

Location:
trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER
Files:
4 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/iodef.xml

    r2561 r3294  
    206206      </group> 
    207207 
     208      <!-- variables available with key_float --> 
     209      <group id="floatvar" axis_ref="nfloat" grid_ref="scalarpoint" zoom_ref="1point"> 
     210        <field id="traj_lon"   description="floats longitude"   unit="deg"  operation="inst(X)" /> 
     211        <field id="traj_lat"   description="floats latitude"    unit="deg"   /> 
     212        <field id="traj_dep"   description="floats depth"       unit="m"     /> 
     213        <field id="traj_temp"  description="floats temperature" unit="degC"  /> 
     214        <field id="traj_salt"  description="floats salinity"    unit="psu"   /> 
     215        <field id="traj_dens"  description="floats density"     unit="kg/m3" /> 
     216        <field id="traj_group" description="floats group"       unit="none"  /> 
     217      </group> 
     218 
     219 
    208220      <!-- ptrc on T grid --> 
    209221 
     
    325337          <field ref="aht2d_eiv"    name="soleaeiw" /> 
    326338        </file> 
    327    
     339  
     340       <!-- variables available with key_float, instantaneous fields --> 
     341        <file id="floats"  description="floats variables"> 
     342            <field ref="traj_lon"   name="floats_longitude"   freq_op="432000" /> 
     343            <field ref="traj_lat"   name="floats_latitude"    freq_op="432000" /> 
     344            <field ref="traj_dep"   name="floats_depth"       freq_op="432000" /> 
     345            <field ref="traj_temp"  name="floats_temperature" freq_op="432000" /> 
     346            <field ref="traj_salt"  name="floats_salinity"    freq_op="432000" /> 
     347            <field ref="traj_dens"  name="floats_density"     freq_op="432000" /> 
     348            <field ref="traj_group" name="floats_group"       freq_op="432000" /> 
     349        </file> 
     350 
    328351       <file id="5d_ptrc_T" name="auto" description="lobster sms variables" > 
    329352         <field ref="DET"      /> 
     
    404427     <axis id="depthv" description="Vertical V levels" unit="m" positive=".false." /> 
    405428     <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" positive=".false." /> 
     429     <axis id="nfloat" description="Number of float"   unit="no unit" positive=".false." /> 
    406430     <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" /> 
    407431  </axis_definition>  
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/namelist_lobster

    r2567 r3294  
    9898/ 
    9999!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    100 &namlobdia     !   additional 2D/3D tracers diagnostics ("key_trc_diaadd") 
     100&namlobdia     !   additional 2D/3D tracers diagnostics 
    101101!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    102    nn_writedia =  360  !  time step frequency for tracers diagnostics 
    103 ! 
    104102!              !    name   ! title of   ! units ! 
    105103!              !           ! the field  !       !   
     
    130128&namlobdbi     !   biological diagnostics trends      
    131129!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    132 !                !  3D bio diagnostics   units : mmole/m3/s   ("key_trc_diabio") 
    133130!                !  2D bio diagnostics   units : mmole/m2/s   ("key_trdmld_trc") 
    134  
    135    nwritebio    =   4320    !  time step frequency for biological outputs 
    136 ! 
    137131!                !  name    !       title of the field      !     units      ! 
    138132   lobdiabio(1)  = 'NO3PHY' , 'Flux from NO3 to PHY          ',  'mmole/m3/s' 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/namelist_top

    r2528 r3294  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! NEMO/TOP1 :  1 - tracer definition                     (namtrc    ) 
    3 !! namelists    2 - dynamical tracer trends               (namtrc_trd) 
    4 !!              3 - tracer advection                      (namtrc_adv) 
    5 !!              4 - tracer lateral diffusion              (namtrc_ldf) 
    6 !!              5 - tracer vertical physics               (namtrc_zdf) 
    7 !!              6 - tracer newtonian damping              (namtrc_dmp) 
     2!! NEMO/TOP2 namelits :  1 - tracer definition                     (namtrc    ) 
     3!!                       2 - tracer advection                      (namtrc_adv) 
     4!!                       3 - tracer lateral diffusion              (namtrc_ldf) 
     5!!                       4 - tracer vertical physics               (namtrc_zdf) 
     6!!                       5 - tracer newtonian damping              (namtrc_dmp) 
     7!!                       6 - dynamical tracer trends               (namtrc_trd) 
     8!!                       7 - tracer output                         (namtrc_wri) 
    89!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    910!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    1011&namtrc     !   tracers definition 
    1112!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     13! 
    1214   nn_dttrc      =  1        !  time step frequency for passive sn_tracers 
    13    nn_writetrc   =  360      !  time step frequency for sn_tracer outputs 
     15   nn_writetrc   =  60      !  time step frequency for sn_tracer outputs 
    1416   ln_rsttr      = .false.   !  start from a restart file (T) or not (F) 
    15    nn_rsttr      =   0       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
     17   nn_rsttr      =   1       !  restart control = 0 initial time step is not compared to the restart file value 
    1618                           !                  = 1 do not use the value in the restart file 
    1719                           !                  = 2 calendar parameters read in the restart file 
    18    cn_trcrst_in  = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
     20   cn_trcrst_in  = "restart_trc.nc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (input) 
    1921   cn_trcrst_out = "restart_trc"   !  suffix of pass. sn_tracer restart name (output) 
     22   ln_trcdta     =   .false.    !  Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    2023! 
    21 !              ! name  !     title of the field       !   units       ! initial data ! save   ! 
    22 !              !       !                              !               ! from file    ! or not !  
    23 !              !       !                              !               ! or not       !        ! 
    24    sn_tracer(1)   = 'DET' , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    25    sn_tracer(2)   = 'ZOO' , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    26    sn_tracer(3)   = 'PHY' , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    27    sn_tracer(4)   = 'NO3' , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    28    sn_tracer(5)   = 'NH4' , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
    29    sn_tracer(6)   = 'DOM' , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     24!                ! name  !     title of the field          !   units       ! initial data ! save   ! 
     25!                !       !                                 !               ! from file    ! or not !  
     26!                !       !                                 !               ! or not       !        ! 
     27   sn_tracer(1)   = 'DET'   , 'Detritus                   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
     28   sn_tracer(2)   = 'ZOO'   , 'Zooplankton concentration  ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
     29   sn_tracer(3)   = 'PHY'   , 'Phytoplankton concentration',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
     30   sn_tracer(4)   = 'NO3'   , 'Nitrate concentration      ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .true. 
     31   sn_tracer(5)   = 'NH4'   , 'Ammonium concentration     ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
     32   sn_tracer(6)   = 'DOM'   , 'Dissolved organic matter   ',  'mmole-N/m3' ,  .false.     ,  .false. 
    3033/ 
    3134!----------------------------------------------------------------------- 
    32 &namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer 
     35&namtrc_dta      !    Initialisation from data input file (T) or not (F) 
    3336!----------------------------------------------------------------------- 
    34    ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme 
     37! 
     38!                !  file name  ! frequency (hours) ! variable   ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! 
     39!                !             !  (if <0  months)  !   name     !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! 
     40   sn_trcdta(4)  = 'NO3_R1'    ,        -12        ,  'NO3'     ,    .false.   , .true. , 'yearly'  , ''       , '' 
     41 
     42   cn_dir        =     './'    !  root directory for the location of the runoff files 
     43   rn_trfac(4)   =    1.0      !   -       -       -       -      - 
     44/ 
     45!----------------------------------------------------------------------- 
     46&namtrc_adv    !   advection scheme for passive tracer  
     47!----------------------------------------------------------------------- 
     48   ln_trcadv_cen2   =  .false.  !  2nd order centered scheme    
    3549   ln_trcadv_tvd    =  .true.   !  TVD scheme 
    3650   ln_trcadv_muscl  =  .false.  !  MUSCL scheme 
     
    5165   ln_trcldf_iso    =  .true.   !     iso-neutral                       (require "key_ldfslp") 
    5266!                               !  Coefficient 
     67   rn_ahtrc_0       =  1000.    !  horizontal eddy diffusivity for tracers [m2/s] 
    5368   rn_ahtrb_0       =     0.    !     background eddy diffusivity for ldf_iso [m2/s] 
    5469/ 
     
    6075/ 
    6176!----------------------------------------------------------------------- 
    62 &namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations 
     77&namtrc_rad        !  treatment of negative concentrations  
    6378!----------------------------------------------------------------------- 
    6479   ln_trcrad   =  .false.  !  artificially correct negative concentrations (T) or not (F) 
    6580/ 
    6681!----------------------------------------------------------------------- 
    67 &namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping    ('key_tradmp && key_trcdmp') 
     82&namtrc_dmp    !   passive tracer newtonian damping   
    6883!----------------------------------------------------------------------- 
     84   ln_trcdmp   =  .false.  !  add a damping termn (T) or not (F) 
    6985   nn_hdmp_tr  =   -1      !  horizontal shape =-1, damping in Med and Red Seas only 
    7086                           !                   =XX, damping poleward of XX degrees (XX>0) 
     
    7995/ 
    8096!----------------------------------------------------------------------- 
    81 &namtrc_trd       !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
    82 !                          or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
     97&namtrc_trd                !   diagnostics on tracer trends        ('key_trdtrc') 
     98!                                   or mixed-layer trends          ('key_trdmld_trc') 
    8399!---------------------------------------------------------------------- 
    84    nn_trd_trc   =  360      !  time step frequency and tracers trends 
    85    nn_ctls_trc  =   0       !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
    86    rn_ucf_trc   =  86400    !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
     100   nn_trd_trc  =  5475      !  time step frequency and tracers trends 
     101   nn_ctls_trc =   0        !  control surface type in mixed-layer trends (0,1 or n<jpk) 
     102   rn_ucf_trc  =   1        !  unit conversion factor (=1 -> /seconds ; =86400. -> /day) 
    87103   ln_trdmld_trc_restart = .false.  !  restart for ML diagnostics 
    88    ln_trdmld_trc_instant = .false.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
     104   ln_trdmld_trc_instant = .true.  !  flag to diagnose trends of instantantaneous or mean ML T/S 
    89105   ln_trdtrc(1)  =   .true. 
    90    ln_trdtrc(2)  =   .true. 
    91    ln_trdtrc(3)  =   .true. 
    92    ln_trdtrc(4)  =   .true. 
    93    ln_trdtrc(5)  =   .true. 
    94    ln_trdtrc(6)  =   .true. 
    95106/ 
     107!----------------------------------------------------------------------- 
     108&namtrc_dia       !   parameters for passive tracer additional diagnostics 
     109!---------------------------------------------------------------------- 
     110   ln_diatrc     =  .true.   !  save additional diag. (T) or not (F) 
     111   nn_writedia   =  60     !  time step frequency for diagnostics 
     112/ 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_LOBSTER/cpp_GYRE_LOBSTER.fcm

    r2670 r3294  
    1 bld::tool::fppkeys  key_gyre key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_vectopt_loop key_top key_lobster key_diatrc key_iomput  
     1bld::tool::fppkeys  key_gyre key_dynspg_flt key_ldfslp key_zdftke key_top key_lobster key_iomput  
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.