Changeset 3418


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2012-06-20T13:15:00+02:00 (9 years ago)
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cetlod
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Update PISCES namelist, see ticket:976

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trunk/NEMOGCM/CONFIG
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  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    r3294 r3418  
    1616!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    1717   ln_co2int  =  .false. ! read atm pco2 from a file (T) or constant (F) 
    18    atcco2     =  287.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F 
     18   atcco2     =  280.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F 
    1919   clname     =  'atcco2.txt'  ! Name of atm pCO2 file - ln_co2int = T 
    2020   nn_offset  =  0       ! Offset model-data start year - ln_co2int = T 
     
    3535&nampisbio     !   biological parameters 
    3636!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    37    nrdttrc    =  1        ! time step frequency for biology 
     37   nrdttrc    =  4        ! time step frequency for biology 
    3838   wsbio      =  2.       ! POC sinking speed 
    39    xkmort     =  1.E-7    ! half saturation constant for mortality 
     39   xkmort     =  2.E-7    ! half saturation constant for mortality 
    4040   ferat3     =  10.E-6   ! Fe/C in zooplankton  
    4141   wsbio2     =  30.      ! Big particles sinking speed 
     
    4444&nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
    4545!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    46    conc0      =  2.e-6    ! Phosphate half saturation 
     46   conc0      =  1.e-6    ! Phosphate half saturation 
    4747   conc1      =  8E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
    48    conc2      =  2E-9     ! Iron half saturation for phyto 
    49    conc2m     =  4E-9     ! Max iron half saturation for phyto 
     48   conc2      =  1E-9     ! Iron half saturation for phyto 
     49   conc2m     =  3E-9     ! Max iron half saturation for phyto 
    5050   conc3      =  3E-9     ! Iron half saturation for diatoms 
    51    conc3m     =  9E-9     ! Maxi iron half saturation for diatoms 
    52    xsizedia   =  5.E-7    ! Minimum size criteria for diatoms 
     51   conc3m     =  8E-9     ! Maxi iron half saturation for diatoms 
     52   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    5353   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
    5454   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    55    concdnh4   =  4.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
     55   concdnh4   =  8.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    5656   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    5757   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    5858   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    59    concfebac  =  3.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
     59   concfebac  =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    6060   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
    6161   qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
     
    6565&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
    6666!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    67    pislope    =  3.       ! P-I slope 
     67   pislope    =  2.       ! P-I slope 
    6868   pislope2   =  2.       ! P-I slope  for diatoms 
    6969   excret     =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
    7070   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
    71    ln_newprod =  .false.  ! Enable new parame. of production (T/F)  
     71   ln_newprod =  .true.  ! Enable new parame. of production (T/F)  
    7272   bresp      =  0.00333  ! Basal respiration rate 
    7373   chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton 
    74    chlcdm     =  0.04     ! Minimum Chl/C in diatoms 
     74   chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms 
    7575   chlcmin    =  0.0033   ! Maximum Chl/c in phytoplankton 
    7676   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
     
    100100   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
    101101   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
    102    xthresh2phy = 2E-7     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
     102   xthresh2phy = 1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
    103103   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
    104    xthresh2   =  0.       ! Food threshold for grazing 
     104   xthresh2   =  2E-7    ! Food threshold for grazing 
    105105   xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
    106    epsher2    =  0.33     ! Efficicency of Mesozoo growth 
     106   epsher2    =  0.3      ! Efficicency of Mesozoo growth 
    107107   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
    108108   unass2     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
    109    grazflux   =  3.e3     ! flux-feeding rate 
     109   grazflux   =  2.e3     ! flux-feeding rate 
    110110/ 
    111111!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    115115   grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate 
    116116   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    117    mzrat      =  0.0      ! zooplankton mortality rate 
     117   mzrat      =  0.001    ! zooplankton mortality rate 
    118118   xpref2c    =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
    119119   xpref2p    =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto 
    120    xpref2d    =  0.6      ! Microzoo preference for Diatoms 
     120   xpref2d    =  0.5      ! Microzoo preference for Diatoms 
    121121   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton  
    122    xthreshphy =  2.E-7    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton  
     122   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton  
    123123   xthreshpoc =  1.E-8    ! POC feeding threshold for microzooplankton  
    124    xthresh    =  0.       ! Food threshold for feeding 
     124   xthresh    =  2.E-7    ! Food threshold for feeding 
    125125   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
    126    epsher     =  0.33     ! Efficiency of microzoo growth 
     126   epsher     =  0.3      ! Efficiency of microzoo growth 
    127127   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM 
    128128   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo 
     
    160160   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    161161   ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    162    ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
     162   ln_river    =  .false.   ! boolean for river input of nutrients 
    163163   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    164164   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/namelist_pisces

    r3294 r3418  
    1616!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    1717   ln_co2int  =  .false. ! read atm pco2 from a file (T) or constant (F) 
    18    atcco2     =  287.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F 
     18   atcco2     =  280.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F 
    1919   clname     =  'atcco2.txt'  ! Name of atm pCO2 file - ln_co2int = T 
    2020   nn_offset  =  0       ! Offset model-data start year - ln_co2int = T 
     
    3737   nrdttrc    =  4        ! time step frequency for biology 
    3838   wsbio      =  2.       ! POC sinking speed 
    39    xkmort     =  1.E-7    ! half saturation constant for mortality 
     39   xkmort     =  2.E-7    ! half saturation constant for mortality 
    4040   ferat3     =  10.E-6   ! Fe/C in zooplankton  
    4141   wsbio2     =  30.      ! Big particles sinking speed 
     
    4444&nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
    4545!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    46    conc0      =  2.e-6    ! Phosphate half saturation 
     46   conc0      =  1.e-6    ! Phosphate half saturation 
    4747   conc1      =  8E-6     ! Phosphate half saturation for diatoms 
    48    conc2      =  2E-9     ! Iron half saturation for phyto 
    49    conc2m     =  4E-9     ! Max iron half saturation for phyto 
     48   conc2      =  1E-9     ! Iron half saturation for phyto 
     49   conc2m     =  3E-9     ! Max iron half saturation for phyto 
    5050   conc3      =  3E-9     ! Iron half saturation for diatoms 
    51    conc3m     =  9E-9     ! Maxi iron half saturation for diatoms 
    52    xsizedia   =  5.E-7    ! Minimum size criteria for diatoms 
     51   conc3m     =  8E-9     ! Maxi iron half saturation for diatoms 
     52   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms 
    5353   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto 
    5454   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto 
    55    concdnh4   =  4.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
     55   concdnh4   =  8.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms 
    5656   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake 
    5757   xksi2      =  3.33E-6  ! half saturation constant for Si/C 
    5858   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization 
    59    concfebac  =  3.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
     59   concfebac  =  1.E-11   ! Half-saturation for Fe limitation of Bacteria 
    6060   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto 
    6161   qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms 
     
    6565&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
    6666!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    67    pislope    =  3.       ! P-I slope 
     67   pislope    =  2.       ! P-I slope 
    6868   pislope2   =  2.       ! P-I slope  for diatoms 
    6969   excret     =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton 
    7070   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms 
    71    ln_newprod =  .false.  ! Enable new parame. of production (T/F)  
     71   ln_newprod =  .true.  ! Enable new parame. of production (T/F)  
    7272   bresp      =  0.00333  ! Basal respiration rate 
    7373   chlcnm     =  0.033    ! Minimum Chl/C in nanophytoplankton 
    74    chlcdm     =  0.04     ! Minimum Chl/C in diatoms 
     74   chlcdm     =  0.05     ! Minimum Chl/C in diatoms 
    7575   chlcmin    =  0.0033   ! Maximum Chl/c in phytoplankton 
    7676   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton 
     
    100100   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton  
    101101   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton  
    102    xthresh2phy = 2E-7     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
     102   xthresh2phy = 1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton  
    103103   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton  
    104    xthresh2   =  0.       ! Food threshold for grazing 
     104   xthresh2   =  2E-7    ! Food threshold for grazing 
    105105   xkgraz2    =  20.E-6   ! half sturation constant for meso grazing 
    106    epsher2    =  0.33     ! Efficicency of Mesozoo growth 
     106   epsher2    =  0.3      ! Efficicency of Mesozoo growth 
    107107   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM 
    108108   unass2     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo 
    109    grazflux   =  3.e3     ! flux-feeding rate 
     109   grazflux   =  2.e3     ! flux-feeding rate 
    110110/ 
    111111!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     
    115115   grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate 
    116116   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton 
    117    mzrat      =  0.0      ! zooplankton mortality rate 
     117   mzrat      =  0.001    ! zooplankton mortality rate 
    118118   xpref2c    =  0.1      ! Microzoo preference for POM 
    119119   xpref2p    =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto 
    120    xpref2d    =  0.6      ! Microzoo preference for Diatoms 
     120   xpref2d    =  0.5      ! Microzoo preference for Diatoms 
    121121   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton  
    122    xthreshphy =  2.E-7    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton  
     122   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton  
    123123   xthreshpoc =  1.E-8    ! POC feeding threshold for microzooplankton  
    124    xthresh    =  0.       ! Food threshold for feeding 
     124   xthresh    =  2.E-7    ! Food threshold for feeding 
    125125   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing 
    126    epsher     =  0.33     ! Efficiency of microzoo growth 
     126   epsher     =  0.3      ! Efficiency of microzoo growth 
    127127   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM 
    128128   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo 
     
    160160   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files 
    161161   ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere 
    162    ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients 
     162   ln_river    =  .false.   ! boolean for river input of nutrients 
    163163   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N 
    164164   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.