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2017-02-03T14:24:58+01:00 (5 years ago)
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timgraham
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#1838 - Changes to remove XIOS1.0

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branches/2016/dev_merge_2016/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_SAS_LIM3/EXP00
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    r7404 r7635  
    11<?xml version="1.0"?> 
    2 <simulation>  
     2<simulation> 
    33 
    4  <context id="nemo" time_origin="1950-01-01 00:00:00" > 
    5      
    6     <!-- $id$ --> 
    7      
    8     <!--  
    9 ============================================================================================================ 
    10 =                                  definition of all existing variables                                    = 
    11 =                                            DO NOT CHANGE                                                 = 
    12 ============================================================================================================ 
    13     --> 
    14     <field_definition src="./field_def.xml"/> 
    15     <!--  
    16 ============================================================================================================ 
    17 =                                           output files definition                                        = 
    18 =                                            Define your own files                                         = 
    19 =                                         put the variables you want...                                    = 
    20 ============================================================================================================ 
    21     --> 
    22      
    23     <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4"> 
    24      
    25       <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files --> 
     4<!-- ============================================================================================ --> 
     5<!-- XIOS context                                                                                 --> 
     6<!-- ============================================================================================ --> 
    267 
    27       <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files --> 
    28  
    29       <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files --> 
    30  
    31       <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->      
    32  
    33       <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files --> 
    34  
    35       <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->      
    36  
    37       <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1d files --> 
    38        
    39       <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files --> 
    40        
    41       <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE.">  <!-- 5d files -->    
    42     
    43    <file id="file1" name_suffix="_grid_T" description="ocean T grid variables" > 
    44      <field field_ref="e3t"      /> 
    45      <field field_ref="toce"         name="thetao"                                                                      operation="instant" freq_op="5d" > @toce_e3t / @e3t </field> 
    46      <field field_ref="soce"         name="so"                                                                          operation="instant" freq_op="5d" > @soce_e3t / @e3t </field> 
    47      <field field_ref="sst"          name="tos"   /> 
    48      <field field_ref="sss"          name="sos"   /> 
    49      <field field_ref="ssh"          name="zos"   /> 
    50      <field field_ref="sst"          name="tosstd"       long_name="sea surface temperature standard deviation"         operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @sst2 - @sst * @sst ) </field> 
    51      <field field_ref="ssh"          name="zosstd"       long_name="sea surface height above geoid standard deviation"  operation="instant" freq_op="5d" > sqrt( @ssh2 - @ssh * @ssh ) </field> 
    52      <field field_ref="sst"          name="sstdcy"       long_name="amplitude of sst diurnal cycle"                     operation="average" freq_op="1d" > @sstmax - @sstmin </field> 
    53      <field field_ref="mldkz5"   /> 
    54      <field field_ref="mldr10_1" /> 
    55      <field field_ref="mldr10_1"     name="mldr10_1dcy"  long_name="amplitude of mldr10_1 diurnal cycle"                operation="average" freq_op="1d" > @mldr10_1max - @mldr10_1min </field> 
    56      <field field_ref="sbt"      /> 
    57      <field field_ref="heatc"        name="heatc" /> 
    58      <field field_ref="saltc"        name="saltc" /> 
    59    </file> 
    60  
    61    <file id="file2" name_suffix="_SBC" description="surface fluxes variables" > <!-- time step automaticaly defined based on nn_fsbc --> 
    62      <field field_ref="empmr"        name="wfo"      /> 
    63       <field field_ref="emp_oce"      name="emp_oce"  long_name="Evap minus Precip over ocean"              /> 
    64       <field field_ref="emp_ice"      name="emp_ice"  long_name="Evap minus Precip over ice"                /> 
    65      <field field_ref="qsr_oce"      name="qsr_oce"  /> 
    66      <field field_ref="qns_oce"      name="qns_oce"  /> 
    67      <field field_ref="qt_oce"       name="qt_oce"   /> 
    68      <field field_ref="qsr_ice"      name="qsr_ice"  /> 
    69      <field field_ref="qns_ice"      name="qns_ice"  /> 
    70      <field field_ref="qtr_ice"      name="qtr_ice"  /> 
    71      <field field_ref="qt_ice"       name="qt_ice"   /> 
    72      <field field_ref="saltflx"      name="sfx"      /> 
    73      <field field_ref="taum"         name="taum"     /> 
    74      <field field_ref="wspd"         name="windsp"   /> 
    75      <field field_ref="precip"       name="precip"   /> 
    76      <!-- ice and snow --> 
    77      <field field_ref="snowpre" /> 
    78      <field field_ref="utau_ice"     name="utau_ice" /> 
    79      <field field_ref="vtau_ice"     name="vtau_ice" /> 
    80    </file> 
    81  
    82    <file id="file3" name_suffix="_grid_U" description="ocean U grid variables" > 
    83      <field field_ref="e3u" /> 
    84      <field field_ref="ssu"          name="uos"      /> 
    85      <field field_ref="uoce"         name="uo"       operation="instant" freq_op="5d" > @uoce_e3u / @e3u </field> 
    86      <field field_ref="utau"         name="tauuo"    /> 
    87           <!-- available with key_diaar5 --> 
    88      <field field_ref="u_masstr"     name="vozomatr" /> 
    89      <field field_ref="u_heattr"     name="sozohetr" /> 
    90       <field field_ref="u_salttr"     name="sozosatr" /> 
    91    </file> 
    92     
    93    <file id="file4" name_suffix="_grid_V" description="ocean V grid variables" > 
    94      <field field_ref="e3v" /> 
    95      <field field_ref="ssv"          name="vos"      /> 
    96      <field field_ref="voce"         name="vo"       operation="instant" freq_op="5d" > @voce_e3v / @e3v </field> 
    97      <field field_ref="vtau"         name="tauvo"    /> 
    98           <!-- available with key_diaar5 --> 
    99      <field field_ref="v_masstr"     name="vomematr" /> 
    100      <field field_ref="v_heattr"     name="somehetr" /> 
    101       <field field_ref="v_salttr"     name="somesatr" /> 
    102    </file> 
    103     
    104    <file id="file5" name_suffix="_grid_W" description="ocean W grid variables" > 
    105      <field field_ref="e3w" /> 
    106      <field field_ref="woce"         name="wo"       /> 
    107      <field field_ref="avt"          name="difvho"   /> 
    108      <field field_ref="w_masstr"     name="vovematr" /> 
    109    </file> 
    110  
    111    <file id="file6" name_suffix="_icemod" description="ice variables" enabled=".true." > 
    112           <field field_ref="snowthic_cea"    name="snthic" /> 
    113           <field field_ref="icethic_cea"     name="sithic" /> 
    114           <field field_ref="icevolu"         name="sivolu" /> 
    115           <field field_ref="snowvol"         name="snvolu" /> 
    116           <field field_ref="iceconc"         name="siconc" /> 
    117  
    118           <field field_ref="vfxbog"          name="vfxbog" /> 
    119           <field field_ref="vfxdyn"          name="vfxdyn" /> 
    120           <field field_ref="vfxopw"          name="vfxopw" /> 
    121           <field field_ref="vfxsni"          name="vfxsni" /> 
    122           <field field_ref="vfxsum"          name="vfxsum" /> 
    123           <field field_ref="vfxbom"          name="vfxbom" /> 
    124           <field field_ref="vfxres"          name="vfxres" /> 
    125           <field field_ref="vfxice"          name="vfxice" /> 
    126           <field field_ref="vfxsnw"          name="vfxsnw" /> 
    127           <field field_ref="vfxsub"          name="vfxsub" /> 
    128           <field field_ref="vfxspr"          name="vfxspr" /> 
    129  
    130           <field field_ref="icetrp"          name="sivtrp" /> 
    131           <field field_ref="snwtrp"          name="snvtrp" /> 
    132           <field field_ref="saltrp"          name="saltrp" /> 
    133           <field field_ref="deitrp"          name="deitrp" /> 
    134           <field field_ref="destrp"          name="destrp" /> 
    135  
    136           <field field_ref="sfxbri"          name="sfxbri" /> 
    137           <field field_ref="sfxdyn"          name="sfxdyn" /> 
    138           <field field_ref="sfxres"          name="sfxres" /> 
    139           <field field_ref="sfxbog"          name="sfxbog" /> 
    140           <field field_ref="sfxbom"          name="sfxbom" /> 
    141           <field field_ref="sfxsum"          name="sfxsum" /> 
    142           <field field_ref="sfxsni"          name="sfxsni" /> 
    143           <field field_ref="sfxopw"          name="sfxopw" /> 
    144           <field field_ref="sfx"             name="sfx"    /> 
    145  
    146           <field field_ref="hfxsum"          name="hfxsum"     /> 
    147           <field field_ref="hfxbom"          name="hfxbom"     /> 
    148           <field field_ref="hfxbog"          name="hfxbog"     /> 
    149           <field field_ref="hfxdif"          name="hfxdif"     /> 
    150           <field field_ref="hfxopw"          name="hfxopw"     /> 
    151           <field field_ref="hfxout"          name="hfxout"     /> 
    152           <field field_ref="hfxin"           name="hfxin"      /> 
    153           <field field_ref="hfxsnw"          name="hfxsnw"     /> 
    154           <field field_ref="hfxerr"          name="hfxerr"     /> 
    155           <field field_ref="hfxerr_rem"      name="hfxerr_rem" /> 
    156  
    157      <!-- ice-ocean heat flux from mass exchange --> 
    158           <field field_ref="hfxdyn"          name="hfxdyn" /> 
    159           <field field_ref="hfxres"          name="hfxres" /> 
    160           <field field_ref="hfxthd"          name="hfxthd" /> 
    161      <!-- ice-atm. heat flux from mass exchange --> 
    162           <field field_ref="hfxsub"          name="hfxsub" /> 
    163           <field field_ref="hfxspr"          name="hfxspr" /> 
    164  
    165      <!-- diags --> 
    166           <field field_ref="hfxdhc"          name="hfxdhc" /> 
    167           <field field_ref="hfxtur"          name="hfxtur" /> 
    168  
    169           <field field_ref="isst"            name="sst"    /> 
    170           <field field_ref="isss"            name="sss"    /> 
    171           <field field_ref="micesalt"        name="sisali" /> 
    172           <field field_ref="micet"           name="sitemp" /> 
    173           <field field_ref="icest"           name="sistem" /> 
    174           <field field_ref="icehc"           name="siheco" /> 
    175           <field field_ref="isnowhc"         name="snheco" /> 
    176           <field field_ref="miceage"         name="siages" /> 
    177  
    178           <field field_ref="uice_ipa"        name="sivelu" /> 
    179           <field field_ref="vice_ipa"        name="sivelv" /> 
    180           <field field_ref="icevel"          name="sivelo" /> 
    181           <field field_ref="idive"           name="sidive" /> 
    182           <field field_ref="ishear"          name="sishea" /> 
    183           <field field_ref="icestr"          name="sistre" /> 
    184  
    185           <field field_ref="ibrinv"          name="sibrin" /> 
    186           <field field_ref="icecolf"         name="sicolf" /> 
    187  
    188           <field field_ref="iceage_cat"      name="siagecat" /> 
    189           <field field_ref="iceconc_cat"     name="siconcat" /> 
    190           <field field_ref="icethic_cat"     name="sithicat" /> 
    191           <field field_ref="snowthic_cat"    name="snthicat" /> 
    192           <field field_ref="salinity_cat"    name="salincat" /> 
    193           <field field_ref="brinevol_cat"    name="sibricat" /> 
    194      <field field_ref="icetemp_cat"     name="sitemcat" /> 
    195      <field field_ref="snwtemp_cat"     name="sntemcat" /> 
    196  
    197    </file> 
    198  
    199         <file id="file7" name_suffix="_scalar" description="scalar variables" enabled=".true." > 
    200           <field field_ref="voltot"       name="scvoltot"   /> 
    201           <field field_ref="sshtot"       name="scsshtot"   /> 
    202           <field field_ref="sshsteric"    name="scsshste"   /> 
    203           <field field_ref="sshthster"    name="scsshtst"   /> 
    204           <field field_ref="masstot"      name="scmastot"   /> 
    205           <field field_ref="temptot"      name="sctemtot"   /> 
    206           <field field_ref="saltot"       name="scsaltot"   /> 
    207  
    208           <field field_ref="bgtemper"     name="bgtemper"   /> 
    209           <field field_ref="bgsaline"     name="bgsaline"   /> 
    210           <field field_ref="bgheatco"     name="bgheatco"   /> 
    211           <field field_ref="bgsaltco"     name="bgsaltco"   /> 
    212           <field field_ref="bgvolssh"     name="bgvolssh"   />  
    213           <field field_ref="bgvole3t"     name="bgvole3t"   /> 
    214           <field field_ref="bgfrcvol"     name="bgfrcvol"   /> 
    215           <field field_ref="bgfrctem"     name="bgfrctem"   /> 
    216           <field field_ref="bgfrcsal"     name="bgfrcsal"   /> 
    217  
    218           <field field_ref="ibgvoltot"    name="ibgvoltot"  /> 
    219           <field field_ref="sbgvoltot"    name="sbgvoltot"  /> 
    220           <field field_ref="ibgarea"      name="ibgarea"    /> 
    221           <field field_ref="ibgsaline"    name="ibgsaline"  /> 
    222           <field field_ref="ibgtemper"    name="ibgtemper"  /> 
    223           <field field_ref="ibgheatco"    name="ibgheatco"  /> 
    224           <field field_ref="sbgheatco"    name="sbgheatco"  /> 
    225           <field field_ref="ibgsaltco"    name="ibgsaltco"  /> 
    226  
    227           <field field_ref="ibgvfx"       name="ibgvfx"     /> 
    228           <field field_ref="ibgvfxbog"    name="ibgvfxbog"  /> 
    229           <field field_ref="ibgvfxopw"    name="ibgvfxopw"  /> 
    230           <field field_ref="ibgvfxsni"    name="ibgvfxsni"  /> 
    231           <field field_ref="ibgvfxdyn"    name="ibgvfxdyn"  /> 
    232           <field field_ref="ibgvfxbom"    name="ibgvfxbom"  /> 
    233           <field field_ref="ibgvfxsum"    name="ibgvfxsum"  /> 
    234           <field field_ref="ibgvfxres"    name="ibgvfxres"  /> 
    235           <field field_ref="ibgvfxspr"    name="ibgvfxspr"  /> 
    236           <field field_ref="ibgvfxsnw"    name="ibgvfxsnw"  /> 
    237           <field field_ref="ibgvfxsub"    name="ibgvfxsub"  /> 
    238  
    239           <field field_ref="ibgsfx"       name="ibgsfx"     /> 
    240           <field field_ref="ibgsfxbri"    name="ibgsfxbri"  /> 
    241           <field field_ref="ibgsfxdyn"    name="ibgsfxdyn"  /> 
    242           <field field_ref="ibgsfxres"    name="ibgsfxres"  /> 
    243           <field field_ref="ibgsfxbog"    name="ibgsfxbog"  /> 
    244           <field field_ref="ibgsfxopw"    name="ibgsfxopw"  /> 
    245           <field field_ref="ibgsfxsni"    name="ibgsfxsni"  /> 
    246           <field field_ref="ibgsfxbom"    name="ibgsfxbom"  /> 
    247           <field field_ref="ibgsfxsum"    name="ibgsfxsum"  /> 
    248  
    249           <field field_ref="ibghfxdhc"    name="ibghfxdhc"  /> 
    250           <field field_ref="ibghfxspr"    name="ibghfxspr"  /> 
    251  
    252           <field field_ref="ibghfxres"    name="ibghfxres"  /> 
    253           <field field_ref="ibghfxsub"    name="ibghfxsub"  /> 
    254           <field field_ref="ibghfxdyn"    name="ibghfxdyn"  /> 
    255           <field field_ref="ibghfxthd"    name="ibghfxthd"  /> 
    256           <field field_ref="ibghfxsum"    name="ibghfxsum"  /> 
    257           <field field_ref="ibghfxbom"    name="ibghfxbom"  /> 
    258           <field field_ref="ibghfxbog"    name="ibghfxbog"  /> 
    259           <field field_ref="ibghfxdif"    name="ibghfxdif"  /> 
    260           <field field_ref="ibghfxopw"    name="ibghfxopw"  /> 
    261           <field field_ref="ibghfxout"    name="ibghfxout"  /> 
    262           <field field_ref="ibghfxin"     name="ibghfxin"   /> 
    263           <field field_ref="ibghfxsnw"    name="ibghfxsnw"  /> 
    264  
    265           <field field_ref="ibgfrcvol"    name="ibgfrcvol"  /> 
    266           <field field_ref="ibgfrcsfx"    name="ibgfrcsfx"  /> 
    267           <field field_ref="ibgvolgrm"    name="ibgvolgrm"  /> 
    268  
    269         </file> 
    270  
    271    <!-- 
    272    <file id="file8" name_suffix="_Tides" description="tidal harmonics" > 
    273      <field field_ref="M2x"          name="M2x"      long_name="M2 Elevation harmonic real part"                       /> 
    274      <field field_ref="M2y"          name="M2y"      long_name="M2 Elevation harmonic imaginary part"                  /> 
    275      <field field_ref="M2x_u"        name="M2x_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic real part "       /> 
    276      <field field_ref="M2y_u"        name="M2y_u"    long_name="M2 current barotrope along i-axis harmonic imaginary part "  /> 
    277      <field field_ref="M2x_v"        name="M2x_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic real part "       /> 
    278      <field field_ref="M2y_v"        name="M2y_v"    long_name="M2 current barotrope along j-axis harmonic imaginary part "  /> 
    279    </file> 
    280    --> 
    281  
    282       </file_group> 
    283  
    284       <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real monthly files --> 
    285       <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files --> 
    286       <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files --> 
    287       <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files --> 
    288       <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files --> 
    289  
    290       <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real yearly files --> 
    291       <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files --> 
    292       <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files --> 
    293       <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files --> 
    294  
    295    </file_definition> 
    296      
    297     <!--  
    298 ============================================================================================================ 
    299 = grid definition = = DO NOT CHANGE = 
    300 ============================================================================================================ 
    301     --> 
    302      
    303    <axis_definition>   
    304       <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" /> 
    305       <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" /> 
    306       <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" /> 
    307       <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" /> 
    308       <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 /> 
    309       <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 /> 
    310       <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 /> 
    311       <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    312       <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              /> 
    313    </axis_definition>  
    314      
    315    <domain_definition src="./domain_def.xml"/> 
    316     
    317    <grid_definition>     
    318      <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/> 
    319      <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/> 
    320      <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/> 
    321      <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/> 
    322      <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/> 
    323      <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/> 
    324      <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/> 
    325      <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/> 
    326      <grid id="gznl_T_2D" domain_ref="gznl"/> 
    327      <grid id="gznl_T_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="deptht"/> 
    328      <grid id="gznl_W_3D" domain_ref="gznl" axis_ref="depthw"/> 
    329     </grid_definition>    
    330   </context> 
    331    
    332  
    333   <context id="xios"> 
     8  <context id="xios" > 
    3349 
    33510      <variable_definition> 
    336     
    337      <!--  
    338         We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size) 
    339 --> 
    340      <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable> 
    341      <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable> 
    342      <variable id="info_level"                type="integer">0</variable> 
    343      <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable> 
    344      <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable> 
    345      <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
    346     
     11 
     12          <variable id="info_level"                type="int">10</variable> 
     13          <variable id="using_server"              type="bool">true</variable> 
     14          <variable id="using_oasis"               type="bool">false</variable> 
     15          <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable> 
     16 
    34717      </variable_definition> 
    348                 
    34918  </context> 
    350    
     19 
     20<!-- ============================================================================================ --> 
     21<!-- NEMO  CONTEXT add and suppress the components you need                                       --> 
     22<!-- ============================================================================================ --> 
     23 
     24  <context id="nemo" src="./context_nemo.xml"/>       <!--  NEMO       --> 
     25 
    35126</simulation> 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.