Ignore:
Timestamp:
2017-02-06T10:25:03+01:00 (5 years ago)
Author:
timgraham
Message:

Merge of dev_merge_2016 into trunk. UPDATE TO ARCHFILES NEEDED for XIOS2.
LIM_SRC_s/limrhg.F90 to follow in next commit due to change of kind (I'm unable to do it in this commit).
Merged using the following steps:

1) svn merge —reintegrate svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk .
2) Resolve minor conflicts in sette.sh and namelist_cfg for ORCA2LIM3 (due to a change in trunk after branch was created)
3) svn commit
4) svn switch svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/trunk
5) svn merge svn+ssh://forge.ipsl.jussieu.fr/ipsl/forge/projets/nemo/svn/branches/2016/dev_merge_2016 .
6) At this stage I checked out a clean copy of the branch to compare against what is about to be committed to the trunk.
6) svn commit #Commit code to the trunk

In this commit I have also reverted a change to Fcheck_archfile.sh which was causing problems on the Paris machine.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • trunk/NEMOGCM/CONFIG/GYRE_PISCES/EXP00/namelist_pisces_cfg

    r4147 r7646  
    11!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    2 !! GYRE_PISCES: Configuration namelist used to overwrite SHARED/namelist_pisces_ref 
     2!! PISCES  (key_pisces) reference namelist (see below for key_pisces_reduced) 
     3!!              1  - air-sea exchange                         (nampisext) 
     4!!              2  - biological parameters                    (nampisbio) 
     5!!              3  - parameters for nutrient limitations      (nampislim)     
     6!!              4  - parameters for phytoplankton             (nampisprod,nampismort) 
     7!!              5  - parameters for zooplankton               (nampismes,nampiszoo) 
     8!!              6  - parameters for remineralization          (nampisrem) 
     9!!              7  - parameters for calcite chemistry         (nampiscal) 
     10!!              8  - parameters for inputs deposition         (nampissed) 
     11!!              11 - Damping                                  (nampisdmp) 
     12!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     13!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     14&nampismod     !  Model used  
     15!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     16    ln_p4z = .false. 
     17    ln_p2z = .true. 
     18/ 
     19!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     20&nampisext     !   air-sea exchange 
     21!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     22/ 
     23!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     24&nampisatm     !  Atmospheric prrssure  
     25!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     26/ 
     27!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     28&nampisbio     !   biological parameters 
     29!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     30/ 
     31!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     32&nampislim     !   parameters for nutrient limitations 
     33!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     34/ 
     35!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     36&nampisopt     !   parameters for optics 
     37!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     38/  
     39!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     40&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth 
     41!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     42/ 
     43!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     44&nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks 
     45!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     46/ 
     47!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     48&nampismes     !   parameters for mesozooplankton 
     49!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     50/ 
     51!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     52&nampiszoo     !   parameters for microzooplankton 
     53!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     54/ 
     55!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     56&nampisfer     !   parameters for iron chemistry 
     57!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     58 
     59!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     60&nampisrem     !   parameters for remineralization 
     61!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     62/ 
     63!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     64&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry 
     65!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     66/ 
     67!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     68&nampissbc     !   parameters for inputs deposition 
     69!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     70/ 
     71!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     72&nampisice      !  Prescribed sea ice tracers 
     73!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     74/ 
     75!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     76&nampisdmp     !  Damping  
     77!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     78/ 
     79!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
     80&nampismass     !  Mass conservation 
     81!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
     82/ 
     83!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
     84!! PISCES reduced (key_pisces_reduced, ex LOBSTER) : namelists 
     85!!              1  - biological parameters for phytoplankton    (namlobphy) 
     86!!              2  - biological parameters for nutrients        (namlobnut) 
     87!!              3  - biological parameters for zooplankton      (namlobzoo)     
     88!!              4  - biological parameters for detritus         (namlobdet) 
     89!!              5  - biological parameters for DOM              (namlobdom) 
     90!!              6  - parameters from aphotic layers to sediment (namlobsed) 
     91!!              7  - general coefficients                       (namlobrat) 
     92!!              8  - optical parameters                         (namlobopt) 
     93!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>> 
    394!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    495&namlobphy     !   biological parameters for phytoplankton 
     
    15106!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
    16107&namlobdet     !   biological parameters for detritus 
    17 !,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,        
     108!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, 
    18109/ 
    19110!''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''' 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.