INCA Helium

(Auteur : Anne Cozic)

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extraire le modèle et la configuration correspondante

• extraire modipsl
• modifier le fichier util/mod.def ainsi :

   #-C- LMDZORINCA_v5  IOIPSL/tags/v2_2_2/src		HEAD			8	IOIPSL/src	modeles
   #-C- LMDZORINCA_v5  tags/ORCHIDEE_1_9_5/ORCHIDEE	HEAD			14	ORCHIDEE	modeles
   #-C- LMDZORINCA_v5  LMDZ5/trunk			1729			11 	LMDZ		modeles
  -#-C- LMDZORINCA_v5  tags/INCA4.1.2			HEAD			9	INCA		modeles
  +#-C- LMDZORINCA_v5  branches/INCA_HELIUM/INCA		HEAD			9	INCA		modeles
   #-C- LMDZORINCA_v5  tags/libIGCM_v2.1    		HEAD			10	libIGCM		.
  -#-C- LMDZORINCA_v5  CONFIG/UNIFORM/v5/LMDZORINCA_v5	HEAD			8	LMDZORINCA_v5	config
  +#-C- LMDZORINCA_v5  CONFIG/UNIFORM/v5_dev/LMDZORINCA_v5/HELIUM/LMDZORINCA_v5	HEAD 8  LMDZORINCA_v5	config
  

• extraire la configuration LMDZORINCA_v5

compiler

Pour compiler il faut utiliser la résolution HELIUMxLMD9695-L39

cd modipsl/config/LMDZORINCA_v5
gmake HELIUMxLMD9695-L39

créer un répertoire d'expérience

• Rappel : dans le répertoire modipsl/config/LMDZORINCA_v5/ il y a un fichier README qui redonne les grandes lignes de la création d'un répertoire d'expérience.
• Toutes les étapes sont disponibles dans la ​documentation igcmg

  cd modipsl/config/LMDZORINCA_v5
  cp EXPERIMENTS/LMDZORINCA/HELIUM/config.card .
  vi config.card >> modifier le JobName
  ../../util/ins_job   >> creation du répertoire d'expérience correspondant au config.card choisit
  

Pour guider le modèle

• modifier dans COMP/lmdz.card le paramètre ok_guide. Et ajoutez la liste des fichiers de vents au paragraphe [BoundaryFiles]. Important : n'oubliez pas d'ajouter un \ en fin de première ligne pour indiquer au script qu'il y aura d'autres fichiers. Et ne pas oubliez que les espaces sont interdits en fin de ligne.

  exemple : 
  [BoundaryFiles]
  List=   (${R_BC}/CHM/LMDZORINCA/${RESOL_ATM}_leap/EL-${RESOL_ATM}_${year}1231_limit.nc , limit.nc),\
     (${R_BC}/ATM/LMDZORINCA/${RESOL_ATM}/NUDGE_FILES/u_ecmwf_${year}${month}.nc , u.nc      ),\
     (${R_BC}/ATM/LMDZORINCA/${RESOL_ATM}/NUDGE_FILES/v_ecmwf_${year}${month}.nc , v.nc      )
  
  

• Les fichiers de vents sont stockés ici :
  • /ccc/work/cont003/subipsl/subipsl

Trucs et astuces

• si la compilation plante les erreurs et les numéros de lignes font références aux fichiers pré-processé par le compilateur et stockés dans modipsl/modeles/INCA/config/ppsrc. Attention : il faut bien modifier le fichier d'origine et non pas le fichier pré-processé avant de recompiler
• Le pré-processeur utilise un fichier d'input du type INCA/INP/inca_HELIUM.def, à partir de celui-ci il en créera un second nommé INCA/INP/inca_HELIUM.inp. C'est le .def qu'il faut éventuellement modifier et pas le second qui est écrasé à chaque compilation.
• si l'on modifie le INP/*.def il faut forcer la recompilation totale de INCA

  cd modipsl/modeles/INCA
  rm -rf config/ 
  

• la simulation tourne sur le scratchdir

  cd $SCRATCHDIR/RUN_DIR/n°IDJob_****/****/
  

• Tous les prints sont stockés dans le fichier out_execution (Fichier stocké au final dans IGCM_OUT/.../JobName?/DEBUG/)
• Les write du modèle INCA sont stockés dans le fichier inca_out. (Fichier stocké au final dans IGCM_OUT/..../JobName?/DEBUG/)
• Pour savoir analyser un fichier Script_Output il faut se référer à la documentation ​suivante