Boîte à outils IPython

Avant toute chose

Déclarer un port pour l'utilisation de Ipython. Pour cela il faut updater le tableau sur cette ​page

Premier test depuis obelix

Depuis sa machine locale (si le port est 70XX et le login sur obelix : YYYY)

ssh -X -t -L 70XX:localhost:70XX YYYY@obelix.lscelb.extra.cea.fr

Loader les modules nécessaires

module load python/2.7.5

Sourcer pyferret (en csh)

source ~brock/pyferret-1.0.2/ferret_paths.csh

Créer un répertoire de travail

mkdir ~/IPy_Notebooks

Lancer ipython

ipython notebook --no-browser --port=70XX --notebook-dir=~/IPy_Notebooks

Sur sa machine locale ouvrir la page suivante ​http://localhost:70XX/ dans un navigateur web. Cette page est votre bibliothèque de notebook.

Créer un premier notebook

• créer un nouveau notebook avec le bouton "new notebook". Un nouvel onglet s'ouvre alors pour ce nouveau notebook.
• Sur cette nouvelle page, vous pouvez changer le nom du notebook en cliquant sur "untitled0". Le nom est immédiatement changé dans votre bibliothèque
• Pour utiliser ferret

  In[1]: %install_ext https://raw.github.com/PBrockmann/ipython-ferretmagic/master/ferretmagic.py
  In[2]: %load_ext ferretmagic
  

• Pour lancer l'exécution d'une cellule : appuyer sur la touche "play", ou "ctrl + entree"
• Pour utiliser un fichier sous le dods store du tgcc

  %%ferret 
  use "http://dods.extra.cea.fr/cgi-bin/nph-dods/store/login/path_on_store"
  

• Pour écrire du texte entre deux cellules : il faut changer le type de la cellule "Cell > Cell Type > heading 1 (2, 3, ...) / ou dans le menu déroulant "code / Markdown / .../ Heading 1 / ..."
• Pour partager le notebook
  • solution 1 : partager le résultat sous forme html. > file > download as > html.
  • solution 2 : partager pour échanger et éventuellement modifier le fichier : il faut le partager sous svn ou git.