[1729] | 1 | #!/bin/bash |
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| 2 | ##SBATCH --nodes=2 |
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| 3 | #SBATCH --ntasks=8 # Nombre total de processus MPI |
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| 4 | #SBATCH --ntasks-per-node=16 |
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| 5 | ##SBATCH --cpus-per-task=1 |
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| 6 | #SBATCH --hint=nomultithread |
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| 7 | #SBATCH -t 00:10:00 # Temps elapsed maximum d'exécution |
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[1771] | 8 | #SBATCH -o output.out # Nom du fichier de sortie |
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| 9 | #SBATCH -e error.err # Nom du fichier d'erreur |
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[1729] | 10 | ##SBATCH -p cpu_port # Nom de la partition d'exécution |
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| 11 | ##SBATCH -A sos@cpu |
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| 12 | ##SBATCH --distribution=arbitrary |
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| 13 | #SBATCH --account=psl@cpu |
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| 14 | |
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| 15 | |
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| 16 | cd ${SLURM_SUBMIT_DIR} |
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[1779] | 17 | module unload intel-all hdf5 netcdf netcdf-cxx netcdf-fortran |
---|
[1729] | 18 | module load intel-all/19.0.4 |
---|
[1779] | 19 | module load hdf5/1.10.5/intel-19.0.4-mpi |
---|
| 20 | module load netcdf/4.7.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
[1729] | 21 | module load netcdf-cxx/4.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
[1779] | 22 | module load netcdf-fortran/4.5.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
| 23 | |
---|
| 24 | #module purge |
---|
| 25 | #module load intel-all/19.0.4 |
---|
| 26 | #module load netcdf/4.7.0/intel-19.0.4-mpi |
---|
| 27 | #module load netcdf-cxx/4.2/intel-19.0.4-mpi |
---|
| 28 | #module load netcdf-fortran/4.4.5/intel-19.0.4-mpi |
---|
| 29 | #module load gcc/6.5.0/gcc-4.8.5 |
---|
[1729] | 30 | module load cmake |
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| 31 | module load cdo |
---|
[1776] | 32 | module load subversion |
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[1729] | 33 | #module load arm-forge |
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| 34 | |
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| 35 | ulimit -c 0 |
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| 36 | #export ALLINEA_NO_TIMEOUT=1 |
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| 37 | |
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| 38 | #ddt --connect srun --mpi=pmi2 -K1 -m block:block --multi-prog ./mpmd_srun.conf |
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| 39 | #srun --mpi=pmi2 -K1 --multi-prog -m cyclic ./mpmd_srun.conf |
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| 40 | export machine_name=jeanzay |
---|
[1743] | 41 | export xios_dir=/gpfswork/rech/psl/rpsl954/xios/dev_trunk_omp |
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| 42 | export build_dir=build_prod |
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[1729] | 43 | |
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[1734] | 44 | # python user_config.py |
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[1737] | 45 | |
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[1771] | 46 | rm -f plein_report.txt |
---|
[1776] | 47 | echo -n "#revision " >> plein_report.txt |
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| 48 | svn info --show-item revision .. >> plein_report.txt |
---|
| 49 | # echo -n "#url " >> plein_report.txt |
---|
| 50 | # svn info --show-item url .. >> plein_report.txt |
---|
| 51 | echo -n "#relurl " >> plein_report.txt |
---|
| 52 | svn info --show-item relative-url .. >> plein_report.txt |
---|
| 53 | echo -n "#machine " >> plein_report.txt |
---|
| 54 | echo $machine_name >> plein_report.txt |
---|
| 55 | echo -n "#build_dir " >> plein_report.txt |
---|
| 56 | echo $build_dir >> plein_report.txt |
---|
[1771] | 57 | |
---|
[1776] | 58 | export arch_dir=$(readlink ../$build_dir/arch.fcm .. 2>&1) |
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| 59 | echo $arch_dir |
---|
| 60 | my_arch=$(echo $arch_dir | sed 's|.*/arch-||' | sed 's|\(.*\).fcm.*|\1|' 2>&1) |
---|
| 61 | echo $my_arch |
---|
| 62 | |
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| 63 | |
---|
| 64 | echo -n "#arch " >> plein_report.txt |
---|
| 65 | echo $my_arch >> plein_report.txt |
---|
| 66 | |
---|
| 67 | export xios_revision=$(svn info --show-item revision .. 2>&1) |
---|
| 68 | echo $xios_revision |
---|
| 69 | |
---|
[1737] | 70 | rm -f setup.sh |
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| 71 | touch setup.sh |
---|
| 72 | >setup.sh |
---|
| 73 | for i in $(ls -d test_*/) |
---|
| 74 | do |
---|
| 75 | cp setup.py ${i%%/} |
---|
| 76 | cp run_sub_test.sh ${i%%/} |
---|
[1771] | 77 | echo "bash -c \"cd " ${i%%/} " && python setup.py \" ">> setup.sh |
---|
[1737] | 78 | echo "echo \"setup.py called from " ${i%%/} "\"">> setup.sh |
---|
| 79 | done |
---|
| 80 | |
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[1734] | 81 | export output=$(python user_config.py 2>&1 >/dev/null) |
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| 82 | |
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| 83 | if [ "$output" -ne 0 ] |
---|
| 84 | then |
---|
| 85 | echo "user_config.py failed" |
---|
| 86 | exit |
---|
| 87 | else |
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| 88 | echo "user_config.py OK" |
---|
| 89 | fi |
---|
| 90 | |
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[1737] | 91 | |
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[1729] | 92 | cmake . |
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[1771] | 93 | ctest -V |
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| 94 | #ctest --output-on-failure |
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[1729] | 95 | make report |
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| 96 | |
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[1771] | 97 | #echo "Generic testcase report" | mailx -s "report" -a report.html yushan.wang@lsce.ipsl.fr |
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[1737] | 98 | |
---|
| 99 | rm -f test_*/setup.py |
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| 100 | rm -f test_*/run_sub_test.sh |
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| 101 | rm -f test_*/run_test_*.py |
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| 102 | rm -f test_*/CMakeLists.txt |
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[1743] | 103 | rm -f test_*/context_grid_dynamico.xml |
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| 104 | rm -f test_*/dynamico_grid.nc |
---|
| 105 | rm -f test_*/default_param.pyc |
---|
| 106 | rm -f test_*/user_param.pyc |
---|
| 107 | rm -f test_*/user_param.py.* |
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[1737] | 108 | |
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| 109 | |
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[1729] | 110 | #srun --mpi=pmi2 -K1 --multi-prog -m cyclic ./srun.conf |
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| 111 | #srun --mpi=pmi2 ../bin/test_client.exe |
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| 112 | |
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[1779] | 113 | #cp plein_report.txt ../Web/plein_report_$xios_revision.txt |
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