source: XIOS/trunk/xios_test_suite/TEST_SUITE/step1.py @ 1899

Last change on this file since 1899 was 1899, checked in by yushan, 4 years ago

trunk : cleanup
File size: 11.1 KB
Line 
1import glob
2import sys
3import subprocess
4import os
5import json
6import itertools
7import copy
8
9param_list = ["ATMdomain", "UsingServer2", "NumberClients", "NumberServers", "RatioServer2", "NumberPoolsServer2", "Duration"]
10param_short_list = ["ATMdom", "Srv2", "NbClnt", "NbSrv", "RatioSrv2", "NbPlSrv2", "Duration"]
11
12mode=os.getenv("mode")
13arch=os.getenv("arch")
14machine=os.getenv("xios_machine_name")
15
16nb_proc_irene=20 # this must be >= NumberClients+NumberServers for all configs for all test folders
17nb_proc_jz=36 # this must be >= sum(NumberClients+NumberServers) for each test folder
18
19def OSinfo(runthis):
20    red = lambda text: '\033[0;31m' + text + '\033[0m'
21    osstdout = subprocess.Popen(runthis, shell=True, stdin=subprocess.PIPE, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.STDOUT, close_fds=True)
22    theInfo = osstdout.communicate()[0].strip()
23    if osstdout.returncode!=0:
24        print(red(runthis+" FAILED"))
25        print(theInfo)
26        sys.exit()
27
28def product_dict(**kwargs):
29    keys = kwargs.keys()
30    vals = kwargs.values()
31    for instance in itertools.product(*vals):
32        yield dict(zip(keys, instance))
33
34def get_default_param():
35    f=open("default_param.json", 'r')
36    default_param = json.load(f)
37    f.close()
38    return default_param[0]
39
40def generate_job(fn, n):
41    if machine=="irene":
42        with open(fn, "w") as fh:
43            fh.write("#!/bin/bash\n")
44            fh.write("#====================================================\n")
45            fh.write("# Generated by step1.py\n")
46            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
47            fh.write("#====================================================\n")
48            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
49            fh.write("#MSUB -eo\n")
50            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
51            fh.write("#MSUB -e client_error.out\n")
52            fh.write("#MSUB -c 1\n")
53            fh.write("#MSUB -n "+str(n)+"\n")
54            fh.write("#MSUB -X\n")
55            fh.write("#MSUB -x\n")
56            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
57            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
58            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
59            fh.write("#MSUB -Q test\n")
60            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
61            fh.write("source ../../../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
62            fh.write("ccc_mprun -n "+str(n)+" generic_testcase.exe\n")
63
64    if machine=="jeanzay":
65        with open(fn, "w") as fh:
66            fh.write("#!/bin/bash\n")
67            fh.write("#====================================================\n")
68            fh.write("# Generated by step1.py\n")
69            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
70            fh.write("#====================================================\n")
71            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(n)+"\n")
72            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
73            fh.write("#SBATCH -o output.out\n")
74            fh.write("#SBATCH -e error.out\n")
75            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
76            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
77            fh.write("ulimit -c 0\n")
78            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
79            fh.write("source ../../../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
80            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt")
81            fh.write("srun generic_testcase.exe")
82
83
84def update_full_job(location, n):
85    global my_counter
86    if machine=="irene":
87        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
88            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; ccc_mprun -E \'--exclusive\' -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output.out 2> error.out &\n")
89            fh.write("PIDS+=($!)\n")
90            fh.write("CONFIGS+=("+location+")\n")
91    if machine=="jeanzay":
92        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
93            fh.write("\ncd ${location}/"+location+"; srun --exclusive -n "+str(n)+" generic_testcase.exe > output.out 2> error.out &\n")
94
95def main():
96
97    if machine=="irene":
98        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
99            fh.write("#!/bin/bash\n")
100            fh.write("#====================================================\n")
101            fh.write("# Generated by step1.py\n")
102            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_irene\n")
103            fh.write("#====================================================\n")
104            fh.write("#MSUB -r XIOS\n")
105            fh.write("#MSUB -eo\n")
106            fh.write("#MSUB -o client_output.out\n")
107            fh.write("#MSUB -e client_error.err\n")
108            fh.write("#MSUB -c 1\n")
109            fh.write("#MSUB -n "+str(nb_proc_irene)+"\n")
110            fh.write("#MSUB -X\n")
111            fh.write("#MSUB -x\n")
112            fh.write("#MSUB -T 1800\n")
113            fh.write("#MSUB -q skylake\n")     
114            fh.write("#MSUB -A gen0826\n")
115            fh.write("#MSUB -Q test\n")
116            fh.write("#MSUB -m work,scratch\n")
117            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
118            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
119            fh.write("source ../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
120            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
121            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
122     
123    if machine=="jeanzay":
124        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "w") as fh:
125            fh.write("#!/bin/bash\n")
126            fh.write("#====================================================\n")
127            fh.write("# Generated by step1.py\n")
128            fh.write("# Called by my_run.sh -> run_test -> run_test_jeanzay\n")
129            fh.write("#====================================================\n")
130            fh.write("#SBATCH --ntasks="+str(nb_proc_jz)+"\n")
131            fh.write("#SBATCH --hint=nomultithread\n")
132            fh.write("#SBATCH -t 00:10:00\n")
133            fh.write("#SBATCH --account=psl@cpu\n")
134            fh.write("ulimit -c 0\n")
135            fh.write("cd ${SLURM_SUBMIT_DIR}\n")
136            fh.write("source ../BUILD/build_"+arch+"_"+mode+"/arch.env\n")
137            fh.write("source $I_MPI_ROOT/intel64/bin/mpivars.sh release_mt\n")
138            fh.write("export location="+os.getcwd()+"\n")
139            fh.write("export log_location="+os.getcwd()+"\n")
140            fh.write("echo \"parallel launch arch="+arch+" mode="+mode+"\" >> ${log_location}/Log.txt\n")
141            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
142
143
144
145    test_folder_list = glob.glob('test_*')
146    all_config=dict()
147
148    default_param = get_default_param()
149    # print(default_param)
150
151    for test_folder in test_folder_list:
152        config_list=[]
153        config_name=[]
154        with open(test_folder+"/user_param.json", "r") as f:
155            config_dict = json.load(f)
156
157        for i in range(len(config_dict)):
158            config_list.extend(list(product_dict(**config_dict[i])))
159            #print(config_list)
160        for i in range(len(config_list)):
161            # print(config_list[i])
162            keylist = list(config_list[i].keys())
163            # print(keylist)
164            full_config = copy.deepcopy(default_param)
165            for j in range(len(keylist)):
166                full_config[ keylist[j] ] = config_list[i][keylist[j]]
167
168            #print(full_config)
169            mystr = str(full_config)
170            mystr = mystr.replace("{", "")
171            mystr = mystr.replace("}", "")
172            mystr = mystr.replace("[", "")
173            mystr = mystr.replace("]", "")
174            mystr = mystr.replace(",", "")
175            mystr = mystr.replace(":", "")
176            mystr = mystr.replace("'", "")
177            mystr = mystr.replace("b'", "")
178            mystr = mystr.replace(" ", "_")
179            for j in range(len(param_list)):
180                mystr = mystr.replace(param_list[j], param_short_list[j])
181            if not mystr in config_name:
182                config_name.append(mystr)
183            #print(mystr)
184            OSinfo("mkdir -p "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
185            OSinfo("cp build_"+arch+"_"+mode+"/bin/generic_testcase.exe "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr)
186            OSinfo("cp iodef.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
187
188            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp", "r") as f:
189                lines = f.readlines()
190                for i in range(len(lines)):
191                    if "XIOS::" in lines[i]:
192                        config_keys = list(full_config.keys())
193                        for idx in range(len(config_keys)):
194                            lines[i] = lines[i].replace("XIOS::"+config_keys[idx], str(full_config[config_keys[idx]]))
195                with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml", "w") as g:
196                    for line in lines:
197                        g.write(line)
198
199            OSinfo("rm -f "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/iodef.xml.tmp")
200            OSinfo("cp "+test_folder+"/context_atm.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
201            OSinfo("cp context_grid_dynamico.xml "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
202            OSinfo("cp dynamico_grid.nc "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
203            OSinfo("cp "+test_folder+"/checkfile.def "+test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/")
204            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/param.def", "w") as fh:
205                fh.write("&params_run\n")
206                fh.write("duration=\'"+full_config["Duration"]+"\'\n")
207                fh.write("nb_proc_atm="+str(full_config["NumberClients"])+"\n")
208                fh.write("/\n")
209            with open(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/all_param.def", "w") as fh:
210                fh.write("&params_run\n")
211                for param in param_list:
212                    fh.write(param+"="+str(full_config[param])+"\n")
213                fh.write("/\n")
214
215            generate_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr+"/job.sh", full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
216            update_full_job(test_folder+"/CONFIG_"+mystr, full_config['NumberClients']+full_config['NumberServers'])
217
218        #print(config_name)
219        if machine=="jeanzay":
220            with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
221                fh.write("wait\nwait\n")
222                fh.write("echo \"tests in "+test_folder+" finished\"\n")
223        all_config[test_folder] = config_name
224 
225
226    if machine=="irene":
227        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
228            fh.write("\nfor pid in ${PIDS[@]}; do\n")
229            fh.write("wait ${pid}\n")
230            fh.write("STATUS+=($?)\ndone\n")
231            fh.write("\ni=0\n")
232            fh.write("#for st in ${STATUS[@]}; do\n")
233            fh.write("#if [[ ${st} -ne 0 ]]; then\n")
234            fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} -1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
235            fh.write("#else\n")
236            fh.write("#echo \"${CONFIGS[${i}]} 1\" >> ${location}/plain_report.txt\n")
237            fh.write("#fi\n")
238            fh.write("#((i+=1))\n")
239            fh.write("#done\n\n")
240            fh.write("#wait\n")
241            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
242    if machine=="jeanzay":
243        with open("full_job_"+arch+"_"+mode+".sh", "a") as fh:
244            fh.write("date >> ${log_location}/Log.txt\n")
245
246   
247    #print(all_config)
248
249if __name__== "__main__":
250  main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.