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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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domain.F90 in NEMO/branches/2020/dev_r12377_KERNEL-06_techene_e3/src/OCE/DOM – NEMO

source: NEMO/branches/2020/dev_r12377_KERNEL-06_techene_e3/src/OCE/DOM/domain.F90 @ 12644

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new reference without ztilde, duplicated modules and routines to be modified from zstar MLF to zstar LF
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 35.9 KB
Line 
1MODULE domain
2   !!==============================================================================
3   !!                       ***  MODULE domain   ***
4   !! Ocean initialization : domain initialization
5   !!==============================================================================
6   !! History :  OPA  !  1990-10  (C. Levy - G. Madec)  Original code
7   !!                 !  1992-01  (M. Imbard) insert time step initialization
8   !!                 !  1996-06  (G. Madec) generalized vertical coordinate
9   !!                 !  1997-02  (G. Madec) creation of domwri.F
10   !!                 !  2001-05  (E.Durand - G. Madec) insert closed sea
11   !!   NEMO     1.0  !  2002-08  (G. Madec)  F90: Free form and module
12   !!            2.0  !  2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
13   !!            3.3  !  2010-11  (G. Madec)  initialisation in C1D configuration
14   !!            3.6  !  2013     ( J. Simeon, C. Calone, G. Madec, C. Ethe ) Online coarsening of outputs
15   !!            3.7  !  2015-11  (G. Madec, A. Coward)  time varying zgr by default
16   !!            4.0  !  2016-10  (G. Madec, S. Flavoni)  domain configuration / user defined interface
17   !!            4.x  ! 2020-02  (G. Madec, S. Techene) introduce ssh to h0 ratio
18   !!----------------------------------------------------------------------
19
20   !!----------------------------------------------------------------------
21   !!   dom_init      : initialize the space and time domain
22   !!   dom_glo       : initialize global domain <--> local domain indices
23   !!   dom_nam       : read and contral domain namelists
24   !!   dom_ctl       : control print for the ocean domain
25   !!   domain_cfg    : read the global domain size in domain configuration file
26   !!   cfg_write     : create the domain configuration file
27   !!----------------------------------------------------------------------
28   USE oce            ! ocean variables
29   USE dom_oce        ! domain: ocean
30   USE sbc_oce        ! surface boundary condition: ocean
31   USE trc_oce        ! shared ocean & passive tracers variab
32   USE phycst         ! physical constants
33   USE domhgr         ! domain: set the horizontal mesh
34   USE domzgr         ! domain: set the vertical mesh
35   USE dommsk         ! domain: set the mask system
36   USE domwri         ! domain: write the meshmask file
37   USE domvvl         ! variable volume
38   USE c1d            ! 1D configuration
39   USE dyncor_c1d     ! 1D configuration: Coriolis term    (cor_c1d routine)
40   USE wet_dry, ONLY : ll_wd
41   USE closea , ONLY : dom_clo ! closed seas
42   !
43   USE in_out_manager ! I/O manager
44   USE iom            ! I/O library
45   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary condition (or mpp link)
46   USE lib_mpp        ! distributed memory computing library
47
48   IMPLICIT NONE
49   PRIVATE
50
51   PUBLIC   dom_init     ! called by nemogcm.F90
52   PUBLIC   domain_cfg   ! called by nemogcm.F90
53
54   !!-------------------------------------------------------------------------
55   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
56   !! $Id$
57   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
58   !!-------------------------------------------------------------------------
59CONTAINS
60
61   SUBROUTINE dom_init( Kbb, Kmm, Kaa, cdstr )
62      !!----------------------------------------------------------------------
63      !!                  ***  ROUTINE dom_init  ***
64      !!
65      !! ** Purpose :   Domain initialization. Call the routines that are
66      !!              required to create the arrays which define the space
67      !!              and time domain of the ocean model.
68      !!
69      !! ** Method  : - dom_msk: compute the masks from the bathymetry file
70      !!              - dom_hgr: compute or read the horizontal grid-point position
71      !!                         and scale factors, and the coriolis factor
72      !!              - dom_zgr: define the vertical coordinate and the bathymetry
73      !!              - dom_wri: create the meshmask file (ln_meshmask=T)
74      !!              - 1D configuration, move Coriolis, u and v at T-point
75      !!----------------------------------------------------------------------
76      INTEGER          , INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa          ! ocean time level indices
77      CHARACTER (len=*), INTENT(in) :: cdstr                  ! model: NEMO or SAS. Determines core restart variables
78      !
79      INTEGER ::   ji, jj, jk, ik   ! dummy loop indices
80      INTEGER ::   iconf = 0    ! local integers
81      CHARACTER (len=64) ::   cform = "(A12, 3(A13, I7))"
82      INTEGER , DIMENSION(jpi,jpj) ::   ik_top , ik_bot       ! top and bottom ocean level
83      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   z1_hu_0, z1_hv_0
84      !!----------------------------------------------------------------------
85      !
86      IF(lwp) THEN         ! Ocean domain Parameters (control print)
87         WRITE(numout,*)
88         WRITE(numout,*) 'dom_init : domain initialization'
89         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~'
90         !
91         WRITE(numout,*)     '   Domain info'
92         WRITE(numout,*)     '      dimension of model:'
93         WRITE(numout,*)     '             Local domain      Global domain       Data domain '
94         WRITE(numout,cform) '        ','   jpi     : ', jpi, '   jpiglo  : ', jpiglo
95         WRITE(numout,cform) '        ','   jpj     : ', jpj, '   jpjglo  : ', jpjglo
96         WRITE(numout,cform) '        ','   jpk     : ', jpk, '   jpkglo  : ', jpkglo
97         WRITE(numout,cform) '       ' ,'   jpij    : ', jpij
98         WRITE(numout,*)     '      mpp local domain info (mpp):'
99         WRITE(numout,*)     '              jpni    : ', jpni, '   nn_hls  : ', nn_hls
100         WRITE(numout,*)     '              jpnj    : ', jpnj, '   nn_hls  : ', nn_hls
101         WRITE(numout,*)     '              jpnij   : ', jpnij
102         WRITE(numout,*)     '      lateral boundary of the Global domain : jperio  = ', jperio
103         SELECT CASE ( jperio )
104         CASE( 0 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. closed)'
105         CASE( 1 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. cyclic east-west)'
106         CASE( 2 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. cyclic north-south)'
107         CASE( 3 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. north fold with T-point pivot)'
108         CASE( 4 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. cyclic east-west and north fold with T-point pivot)'
109         CASE( 5 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. north fold with F-point pivot)'
110         CASE( 6 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. cyclic east-west and north fold with F-point pivot)'
111         CASE( 7 )   ;   WRITE(numout,*) '         (i.e. cyclic east-west and north-south)'
112         CASE DEFAULT
113            CALL ctl_stop( 'jperio is out of range' )
114         END SELECT
115         WRITE(numout,*)     '      Ocean model configuration used:'
116         WRITE(numout,*)     '         cn_cfg = ', TRIM( cn_cfg ), '   nn_cfg = ', nn_cfg
117      ENDIF
118      lwxios = .FALSE.
119      ln_xios_read = .FALSE.
120      !
121      !           !==  Reference coordinate system  ==!
122      !
123      CALL dom_glo                     ! global domain versus local domain
124      CALL dom_nam                     ! read namelist ( namrun, namdom )
125      !
126      IF( lwxios ) THEN
127!define names for restart write and set core output (restart.F90)
128         CALL iom_set_rst_vars(rst_wfields)
129         CALL iom_set_rstw_core(cdstr)
130      ENDIF
131!reset namelist for SAS
132      IF(cdstr == 'SAS') THEN
133         IF(lrxios) THEN
134               IF(lwp) write(numout,*) 'Disable reading restart file using XIOS for SAS'
135               lrxios = .FALSE.
136         ENDIF
137      ENDIF
138      !
139      CALL dom_hgr                      ! Horizontal mesh
140
141      IF( ln_closea ) CALL dom_clo      ! Read in masks to define closed seas and lakes
142
143      CALL dom_zgr( ik_top, ik_bot )    ! Vertical mesh and bathymetry
144
145      CALL dom_msk( ik_top, ik_bot )    ! Masks
146      !
147      ht_0(:,:) = 0._wp  ! Reference ocean thickness
148      hu_0(:,:) = 0._wp
149      hv_0(:,:) = 0._wp
150      hf_0(:,:) = 0._wp
151      DO jk = 1, jpk
152         ht_0(:,:) = ht_0(:,:) + e3t_0(:,:,jk) * tmask(:,:,jk)
153         hu_0(:,:) = hu_0(:,:) + e3u_0(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
154         hv_0(:,:) = hv_0(:,:) + e3v_0(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
155         hf_0(:,:) = hf_0(:,:) + e3f_0(:,:,jk) * fmask(:,:,jk)
156      END DO
157      !
158      r1_ht_0(:,:) = ssmask (:,:) / ( ht_0(:,:) + 1._wp -  ssmask (:,:) )
159      r1_hu_0(:,:) = ssumask(:,:) / ( hu_0(:,:) + 1._wp -  ssumask(:,:) )
160      r1_hv_0(:,:) = ssvmask(:,:) / ( hv_0(:,:) + 1._wp -  ssvmask(:,:) )
161      r1_hf_0(:,:) = ssfmask(:,:) / ( hf_0(:,:) + 1._wp -  ssfmask(:,:) )
162      !
163      !           !==  time varying part of coordinate system  ==!
164      !
165      IF( ln_linssh ) THEN       != Fix in time : set to the reference one for all
166      !
167         !       before        !          now          !       after         !
168            gdept(:,:,:,Kbb) = gdept_0  ;   gdept(:,:,:,Kmm) = gdept_0   ;   gdept(:,:,:,Kaa) = gdept_0   ! depth of grid-points
169            gdepw(:,:,:,Kbb) = gdepw_0  ;   gdepw(:,:,:,Kmm) = gdepw_0   ;   gdepw(:,:,:,Kaa) = gdepw_0   !
170                                            gde3w            = gde3w_0   !        ---          !
171         !
172              e3t(:,:,:,Kbb) =   e3t_0  ;     e3t(:,:,:,Kmm) =   e3t_0   ;   e3t(:,:,:,Kaa) =  e3t_0    ! scale factors
173              e3u(:,:,:,Kbb) =   e3u_0  ;     e3u(:,:,:,Kmm) =   e3u_0   ;   e3u(:,:,:,Kaa) =  e3u_0    !
174              e3v(:,:,:,Kbb) =   e3v_0  ;     e3v(:,:,:,Kmm) =   e3v_0   ;   e3v(:,:,:,Kaa) =  e3v_0    !
175                                     e3f =   e3f_0   !        ---          !
176              e3w(:,:,:,Kbb) =   e3w_0  ;     e3w(:,:,:,Kmm) =   e3w_0   ;    e3w(:,:,:,Kaa) =   e3w_0   !
177             e3uw(:,:,:,Kbb) =  e3uw_0  ;    e3uw(:,:,:,Kmm) =  e3uw_0   ;   e3uw(:,:,:,Kaa) =  e3uw_0   !
178             e3vw(:,:,:,Kbb) =  e3vw_0  ;    e3vw(:,:,:,Kmm) =  e3vw_0   ;   e3vw(:,:,:,Kaa) =  e3vw_0   !
179         !
180! !!st new variable h1_hu_0 h1_hv_0
181!          z1_hu_0(:,:) = ssumask(:,:) / ( hu_0(:,:) + 1._wp - ssumask(:,:) )     ! _i mask due to ISF
182!          z1_hv_0(:,:) = ssvmask(:,:) / ( hv_0(:,:) + 1._wp - ssvmask(:,:) )
183         !
184         !        before       !          now          !       after         !
185                                      ht =    ht_0   !                     ! water column thickness
186               hu(:,:,Kbb) =    hu_0  ;      hu(:,:,Kmm) =    hu_0   ;    hu(:,:,Kaa) =    hu_0   !
187               hv(:,:,Kbb) =    hv_0  ;      hv(:,:,Kmm) =    hv_0   ;    hv(:,:,Kaa) =    hv_0   !
188            r1_hu(:,:,Kbb) = r1_hu_0  ;   r1_hu(:,:,Kmm) = r1_hu_0   ; r1_hu(:,:,Kaa) = r1_hu_0   ! inverse of water column thickness
189            r1_hv(:,:,Kbb) = r1_hv_0  ;   r1_hv(:,:,Kmm) = r1_hv_0   ; r1_hv(:,:,Kaa) = r1_hv_0   !
190         !
191         !
192      ELSE                       != time varying : initialize before/now/after variables
193         !
194         IF( .NOT.l_offline )  CALL dom_vvl_init( Kbb, Kmm, Kaa )
195         !
196      ENDIF
197      !
198      IF( lk_c1d         )   CALL cor_c1d       ! 1D configuration: Coriolis set at T-point
199      !
200      IF( ln_meshmask    )   CALL dom_wri       ! Create a domain file
201      IF( .NOT.ln_rstart )   CALL dom_ctl       ! Domain control
202      !
203      IF( ln_write_cfg   )   CALL cfg_write     ! create the configuration file
204      !
205      IF(lwp) THEN
206         WRITE(numout,*)
207         WRITE(numout,*) 'dom_init :   ==>>>   END of domain initialization'
208         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~'
209         WRITE(numout,*)
210      ENDIF
211      !
212   END SUBROUTINE dom_init
213
214
215   SUBROUTINE dom_glo
216      !!----------------------------------------------------------------------
217      !!                     ***  ROUTINE dom_glo  ***
218      !!
219      !! ** Purpose :   initialization of global domain <--> local domain indices
220      !!
221      !! ** Method  :
222      !!
223      !! ** Action  : - mig , mjg : local  domain indices ==> global domain indices
224      !!              - mi0 , mi1 : global domain indices ==> local  domain indices
225      !!              - mj0,, mj1   (global point not in the local domain ==> mi0>mi1 and/or mj0>mj1)
226      !!----------------------------------------------------------------------
227      INTEGER ::   ji, jj   ! dummy loop argument
228      !!----------------------------------------------------------------------
229      !
230      DO ji = 1, jpi                 ! local domain indices ==> global domain indices
231        mig(ji) = ji + nimpp - 1
232      END DO
233      DO jj = 1, jpj
234        mjg(jj) = jj + njmpp - 1
235      END DO
236      !                              ! global domain indices ==> local domain indices
237      !                                   ! (return (m.0,m.1)=(1,0) if data domain gridpoint is to the west/south of the
238      !                                   ! local domain, or (m.0,m.1)=(jp.+1,jp.) to the east/north of local domain.
239      DO ji = 1, jpiglo
240        mi0(ji) = MAX( 1 , MIN( ji - nimpp + 1, jpi+1 ) )
241        mi1(ji) = MAX( 0 , MIN( ji - nimpp + 1, jpi   ) )
242      END DO
243      DO jj = 1, jpjglo
244        mj0(jj) = MAX( 1 , MIN( jj - njmpp + 1, jpj+1 ) )
245        mj1(jj) = MAX( 0 , MIN( jj - njmpp + 1, jpj   ) )
246      END DO
247      IF(lwp) THEN                   ! control print
248         WRITE(numout,*)
249         WRITE(numout,*) 'dom_glo : domain: global <<==>> local '
250         WRITE(numout,*) '~~~~~~~ '
251         WRITE(numout,*) '   global domain:   jpiglo = ', jpiglo, ' jpjglo = ', jpjglo, ' jpkglo = ', jpkglo
252         WRITE(numout,*) '   local  domain:   jpi    = ', jpi   , ' jpj    = ', jpj   , ' jpk    = ', jpk
253         WRITE(numout,*)
254         WRITE(numout,*) '   conversion from local to global domain indices (and vise versa) done'
255         IF( nn_print >= 1 ) THEN
256            WRITE(numout,*)
257            WRITE(numout,*) '          conversion local  ==> global i-index domain (mig)'
258            WRITE(numout,25)              (mig(ji),ji = 1,jpi)
259            WRITE(numout,*)
260            WRITE(numout,*) '          conversion global ==> local  i-index domain'
261            WRITE(numout,*) '             starting index (mi0)'
262            WRITE(numout,25)              (mi0(ji),ji = 1,jpiglo)
263            WRITE(numout,*) '             ending index (mi1)'
264            WRITE(numout,25)              (mi1(ji),ji = 1,jpiglo)
265            WRITE(numout,*)
266            WRITE(numout,*) '          conversion local  ==> global j-index domain (mjg)'
267            WRITE(numout,25)              (mjg(jj),jj = 1,jpj)
268            WRITE(numout,*)
269            WRITE(numout,*) '          conversion global ==> local  j-index domain'
270            WRITE(numout,*) '             starting index (mj0)'
271            WRITE(numout,25)              (mj0(jj),jj = 1,jpjglo)
272            WRITE(numout,*) '             ending index (mj1)'
273            WRITE(numout,25)              (mj1(jj),jj = 1,jpjglo)
274         ENDIF
275      ENDIF
276 25   FORMAT( 100(10x,19i4,/) )
277      !
278   END SUBROUTINE dom_glo
279
280
281   SUBROUTINE dom_nam
282      !!----------------------------------------------------------------------
283      !!                     ***  ROUTINE dom_nam  ***
284      !!
285      !! ** Purpose :   read domaine namelists and print the variables.
286      !!
287      !! ** input   : - namrun namelist
288      !!              - namdom namelist
289      !!              - namnc4 namelist   ! "key_netcdf4" only
290      !!----------------------------------------------------------------------
291      USE ioipsl
292      !!
293      INTEGER  ::   ios   ! Local integer
294      !
295      NAMELIST/namrun/ cn_ocerst_indir, cn_ocerst_outdir, nn_stocklist, ln_rst_list,                 &
296         &             nn_no   , cn_exp   , cn_ocerst_in, cn_ocerst_out, ln_rstart , nn_rstctl ,     &
297         &             nn_it000, nn_itend , nn_date0    , nn_time0     , nn_leapy  , nn_istate ,     &
298         &             nn_stock, nn_write , ln_mskland  , ln_clobber   , nn_chunksz, nn_euler  ,     &
299         &             ln_cfmeta, ln_xios_read, nn_wxios
300      NAMELIST/namdom/ ln_linssh, rn_rdt, rn_atfp, ln_crs, ln_meshmask
301#if defined key_netcdf4
302      NAMELIST/namnc4/ nn_nchunks_i, nn_nchunks_j, nn_nchunks_k, ln_nc4zip
303#endif
304      !!----------------------------------------------------------------------
305      !
306      IF(lwp) THEN
307         WRITE(numout,*)
308         WRITE(numout,*) 'dom_nam : domain initialization through namelist read'
309         WRITE(numout,*) '~~~~~~~ '
310      ENDIF
311      !
312      !
313      READ  ( numnam_ref, namrun, IOSTAT = ios, ERR = 901)
314901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namrun in reference namelist' )
315      READ  ( numnam_cfg, namrun, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
316902   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namrun in configuration namelist' )
317      IF(lwm) WRITE ( numond, namrun )
318      !
319      IF(lwp) THEN                  ! control print
320         WRITE(numout,*) '   Namelist : namrun   ---   run parameters'
321         WRITE(numout,*) '      Assimilation cycle              nn_no           = ', nn_no
322         WRITE(numout,*) '      experiment name for output      cn_exp          = ', TRIM( cn_exp           )
323         WRITE(numout,*) '      file prefix restart input       cn_ocerst_in    = ', TRIM( cn_ocerst_in     )
324         WRITE(numout,*) '      restart input directory         cn_ocerst_indir = ', TRIM( cn_ocerst_indir  )
325         WRITE(numout,*) '      file prefix restart output      cn_ocerst_out   = ', TRIM( cn_ocerst_out    )
326         WRITE(numout,*) '      restart output directory        cn_ocerst_outdir= ', TRIM( cn_ocerst_outdir )
327         WRITE(numout,*) '      restart logical                 ln_rstart       = ', ln_rstart
328         WRITE(numout,*) '      start with forward time step    nn_euler        = ', nn_euler
329         WRITE(numout,*) '      control of time step            nn_rstctl       = ', nn_rstctl
330         WRITE(numout,*) '      number of the first time step   nn_it000        = ', nn_it000
331         WRITE(numout,*) '      number of the last time step    nn_itend        = ', nn_itend
332         WRITE(numout,*) '      initial calendar date aammjj    nn_date0        = ', nn_date0
333         WRITE(numout,*) '      initial time of day in hhmm     nn_time0        = ', nn_time0
334         WRITE(numout,*) '      leap year calendar (0/1)        nn_leapy        = ', nn_leapy
335         WRITE(numout,*) '      initial state output            nn_istate       = ', nn_istate
336         IF( ln_rst_list ) THEN
337            WRITE(numout,*) '      list of restart dump times      nn_stocklist    =', nn_stocklist
338         ELSE
339            WRITE(numout,*) '      frequency of restart file       nn_stock        = ', nn_stock
340         ENDIF
341#if ! defined key_iomput
342         WRITE(numout,*) '      frequency of output file        nn_write        = ', nn_write
343#endif
344         WRITE(numout,*) '      mask land points                ln_mskland      = ', ln_mskland
345         WRITE(numout,*) '      additional CF standard metadata ln_cfmeta       = ', ln_cfmeta
346         WRITE(numout,*) '      overwrite an existing file      ln_clobber      = ', ln_clobber
347         WRITE(numout,*) '      NetCDF chunksize (bytes)        nn_chunksz      = ', nn_chunksz
348         IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
349            WRITE(numout,*) '      READ restart for a single file using XIOS ln_xios_read =', ln_xios_read
350            WRITE(numout,*) '      Write restart using XIOS        nn_wxios   = ', nn_wxios
351         ELSE
352            WRITE(numout,*) "      AGRIF: nn_wxios will be ingored. See setting for parent"
353            WRITE(numout,*) "      AGRIF: ln_xios_read will be ingored. See setting for parent"
354         ENDIF
355      ENDIF
356
357      cexper = cn_exp         ! conversion DOCTOR names into model names (this should disappear soon)
358      nrstdt = nn_rstctl
359      nit000 = nn_it000
360      nitend = nn_itend
361      ndate0 = nn_date0
362      nleapy = nn_leapy
363      ninist = nn_istate
364      neuler = nn_euler
365      IF( neuler == 1 .AND. .NOT. ln_rstart ) THEN
366         IF(lwp) WRITE(numout,*)
367         IF(lwp) WRITE(numout,*)'   ==>>>   Start from rest (ln_rstart=F)'
368         IF(lwp) WRITE(numout,*)'           an Euler initial time step is used : nn_euler is forced to 0 '
369         neuler = 0
370      ENDIF
371      !                             ! control of output frequency
372      IF( .NOT. ln_rst_list ) THEN     ! we use nn_stock
373         IF( nn_stock == -1 )   CALL ctl_warn( 'nn_stock = -1 --> no restart will be done' )
374         IF( nn_stock == 0 .OR. nn_stock > nitend ) THEN
375            WRITE(ctmp1,*) 'nn_stock = ', nn_stock, ' it is forced to ', nitend
376            CALL ctl_warn( ctmp1 )
377            nn_stock = nitend
378         ENDIF
379      ENDIF
380#if ! defined key_iomput
381      IF( nn_write == -1 )   CALL ctl_warn( 'nn_write = -1 --> no output files will be done' )
382      IF ( nn_write == 0 ) THEN
383         WRITE(ctmp1,*) 'nn_write = ', nn_write, ' it is forced to ', nitend
384         CALL ctl_warn( ctmp1 )
385         nn_write = nitend
386      ENDIF
387#endif
388
389#if defined key_agrif
390      IF( Agrif_Root() ) THEN
391#endif
392      IF(lwp) WRITE(numout,*)
393      SELECT CASE ( nleapy )        ! Choose calendar for IOIPSL
394      CASE (  1 )
395         CALL ioconf_calendar('gregorian')
396         IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   The IOIPSL calendar is "gregorian", i.e. leap year'
397      CASE (  0 )
398         CALL ioconf_calendar('noleap')
399         IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   The IOIPSL calendar is "noleap", i.e. no leap year'
400      CASE ( 30 )
401         CALL ioconf_calendar('360d')
402         IF(lwp) WRITE(numout,*) '   ==>>>   The IOIPSL calendar is "360d", i.e. 360 days in a year'
403      END SELECT
404#if defined key_agrif
405      ENDIF
406#endif
407
408      READ  ( numnam_ref, namdom, IOSTAT = ios, ERR = 903)
409903   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namdom in reference namelist' )
410      READ  ( numnam_cfg, namdom, IOSTAT = ios, ERR = 904 )
411904   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namdom in configuration namelist' )
412      IF(lwm) WRITE( numond, namdom )
413      !
414      IF(lwp) THEN
415         WRITE(numout,*)
416         WRITE(numout,*) '   Namelist : namdom   ---   space & time domain'
417         WRITE(numout,*) '      linear free surface (=T)                ln_linssh   = ', ln_linssh
418         WRITE(numout,*) '      create mesh/mask file                   ln_meshmask = ', ln_meshmask
419         WRITE(numout,*) '      ocean time step                         rn_rdt      = ', rn_rdt
420         WRITE(numout,*) '      asselin time filter parameter           rn_atfp     = ', rn_atfp
421         WRITE(numout,*) '      online coarsening of dynamical fields   ln_crs      = ', ln_crs
422      ENDIF
423      !
424      !          ! conversion DOCTOR names into model names (this should disappear soon)
425      atfp = rn_atfp
426      rdt  = rn_rdt
427
428      IF( TRIM(Agrif_CFixed()) == '0' ) THEN
429         lrxios = ln_xios_read.AND.ln_rstart
430!set output file type for XIOS based on NEMO namelist
431         IF (nn_wxios > 0) lwxios = .TRUE.
432         nxioso = nn_wxios
433      ENDIF
434
435#if defined key_netcdf4
436      !                             ! NetCDF 4 case   ("key_netcdf4" defined)
437      READ  ( numnam_ref, namnc4, IOSTAT = ios, ERR = 907)
438907   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namnc4 in reference namelist' )
439      READ  ( numnam_cfg, namnc4, IOSTAT = ios, ERR = 908 )
440908   IF( ios >  0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'namnc4 in configuration namelist' )
441      IF(lwm) WRITE( numond, namnc4 )
442
443      IF(lwp) THEN                        ! control print
444         WRITE(numout,*)
445         WRITE(numout,*) '   Namelist namnc4 - Netcdf4 chunking parameters'
446         WRITE(numout,*) '      number of chunks in i-dimension             nn_nchunks_i = ', nn_nchunks_i
447         WRITE(numout,*) '      number of chunks in j-dimension             nn_nchunks_j = ', nn_nchunks_j
448         WRITE(numout,*) '      number of chunks in k-dimension             nn_nchunks_k = ', nn_nchunks_k
449         WRITE(numout,*) '      apply netcdf4/hdf5 chunking & compression   ln_nc4zip    = ', ln_nc4zip
450      ENDIF
451
452      ! Put the netcdf4 settings into a simple structure (snc4set, defined in in_out_manager module)
453      ! Note the chunk size in the unlimited (time) dimension will be fixed at 1
454      snc4set%ni   = nn_nchunks_i
455      snc4set%nj   = nn_nchunks_j
456      snc4set%nk   = nn_nchunks_k
457      snc4set%luse = ln_nc4zip
458#else
459      snc4set%luse = .FALSE.        ! No NetCDF 4 case
460#endif
461      !
462   END SUBROUTINE dom_nam
463
464
465   SUBROUTINE dom_ctl
466      !!----------------------------------------------------------------------
467      !!                     ***  ROUTINE dom_ctl  ***
468      !!
469      !! ** Purpose :   Domain control.
470      !!
471      !! ** Method  :   compute and print extrema of masked scale factors
472      !!----------------------------------------------------------------------
473      INTEGER, DIMENSION(2) ::   imi1, imi2, ima1, ima2
474      INTEGER, DIMENSION(2) ::   iloc   !
475      REAL(wp) ::   ze1min, ze1max, ze2min, ze2max
476      !!----------------------------------------------------------------------
477      !
478      IF(lk_mpp) THEN
479         CALL mpp_minloc( 'domain', e1t(:,:), tmask_i(:,:), ze1min, imi1 )
480         CALL mpp_minloc( 'domain', e2t(:,:), tmask_i(:,:), ze2min, imi2 )
481         CALL mpp_maxloc( 'domain', e1t(:,:), tmask_i(:,:), ze1max, ima1 )
482         CALL mpp_maxloc( 'domain', e2t(:,:), tmask_i(:,:), ze2max, ima2 )
483      ELSE
484         ze1min = MINVAL( e1t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
485         ze2min = MINVAL( e2t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
486         ze1max = MAXVAL( e1t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
487         ze2max = MAXVAL( e2t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
488         !
489         iloc  = MINLOC( e1t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
490         imi1(1) = iloc(1) + nimpp - 1
491         imi1(2) = iloc(2) + njmpp - 1
492         iloc  = MINLOC( e2t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
493         imi2(1) = iloc(1) + nimpp - 1
494         imi2(2) = iloc(2) + njmpp - 1
495         iloc  = MAXLOC( e1t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
496         ima1(1) = iloc(1) + nimpp - 1
497         ima1(2) = iloc(2) + njmpp - 1
498         iloc  = MAXLOC( e2t(:,:), mask = tmask_i(:,:) == 1._wp )
499         ima2(1) = iloc(1) + nimpp - 1
500         ima2(2) = iloc(2) + njmpp - 1
501      ENDIF
502      IF(lwp) THEN
503         WRITE(numout,*)
504         WRITE(numout,*) 'dom_ctl : extrema of the masked scale factors'
505         WRITE(numout,*) '~~~~~~~'
506         WRITE(numout,"(14x,'e1t maxi: ',1f10.2,' at i = ',i5,' j= ',i5)") ze1max, ima1(1), ima1(2)
507         WRITE(numout,"(14x,'e1t mini: ',1f10.2,' at i = ',i5,' j= ',i5)") ze1min, imi1(1), imi1(2)
508         WRITE(numout,"(14x,'e2t maxi: ',1f10.2,' at i = ',i5,' j= ',i5)") ze2max, ima2(1), ima2(2)
509         WRITE(numout,"(14x,'e2t mini: ',1f10.2,' at i = ',i5,' j= ',i5)") ze2min, imi2(1), imi2(2)
510      ENDIF
511      !
512   END SUBROUTINE dom_ctl
513
514
515   SUBROUTINE domain_cfg( cd_cfg, kk_cfg, kpi, kpj, kpk, kperio )
516      !!----------------------------------------------------------------------
517      !!                     ***  ROUTINE dom_nam  ***
518      !!
519      !! ** Purpose :   read the domain size in domain configuration file
520      !!
521      !! ** Method  :   read the cn_domcfg NetCDF file
522      !!----------------------------------------------------------------------
523      CHARACTER(len=*)              , INTENT(out) ::   cd_cfg          ! configuration name
524      INTEGER                       , INTENT(out) ::   kk_cfg          ! configuration resolution
525      INTEGER                       , INTENT(out) ::   kpi, kpj, kpk   ! global domain sizes
526      INTEGER                       , INTENT(out) ::   kperio          ! lateral global domain b.c.
527      !
528      INTEGER ::   inum   ! local integer
529      REAL(wp) ::   zorca_res                     ! local scalars
530      REAL(wp) ::   zperio                        !   -      -
531      INTEGER, DIMENSION(4) ::   idvar, idimsz    ! size   of dimensions
532      !!----------------------------------------------------------------------
533      !
534      IF(lwp) THEN
535         WRITE(numout,*) '           '
536         WRITE(numout,*) 'domain_cfg : domain size read in ', TRIM( cn_domcfg ), ' file'
537         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~ '
538      ENDIF
539      !
540      CALL iom_open( cn_domcfg, inum )
541      !
542      !                                   !- ORCA family specificity
543      IF(  iom_varid( inum, 'ORCA'       , ldstop = .FALSE. ) > 0  .AND.  &
544         & iom_varid( inum, 'ORCA_index' , ldstop = .FALSE. ) > 0    ) THEN
545         !
546         cd_cfg = 'ORCA'
547         CALL iom_get( inum, 'ORCA_index', zorca_res )   ;   kk_cfg = NINT( zorca_res )
548         !
549         IF(lwp) THEN
550            WRITE(numout,*) '   .'
551            WRITE(numout,*) '   ==>>>   ORCA configuration '
552            WRITE(numout,*) '   .'
553         ENDIF
554         !
555      ELSE                                !- cd_cfg & k_cfg are not used
556         cd_cfg = 'UNKNOWN'
557         kk_cfg = -9999999
558                                          !- or they may be present as global attributes
559                                          !- (netcdf only)
560         CALL iom_getatt( inum, 'cn_cfg', cd_cfg )  ! returns   !  if not found
561         CALL iom_getatt( inum, 'nn_cfg', kk_cfg )  ! returns -999 if not found
562         IF( TRIM(cd_cfg) == '!') cd_cfg = 'UNKNOWN'
563         IF( kk_cfg == -999     ) kk_cfg = -9999999
564         !
565      ENDIF
566       !
567      idvar = iom_varid( inum, 'e3t_0', kdimsz = idimsz )   ! use e3t_0, that must exist, to get jp(ijk)glo
568      kpi = idimsz(1)
569      kpj = idimsz(2)
570      kpk = idimsz(3)
571      CALL iom_get( inum, 'jperio', zperio )   ;   kperio = NINT( zperio )
572      CALL iom_close( inum )
573      !
574      IF(lwp) THEN
575         WRITE(numout,*) '      cn_cfg = ', TRIM(cd_cfg), '   nn_cfg = ', kk_cfg
576         WRITE(numout,*) '      jpiglo = ', kpi
577         WRITE(numout,*) '      jpjglo = ', kpj
578         WRITE(numout,*) '      jpkglo = ', kpk
579         WRITE(numout,*) '      type of global domain lateral boundary   jperio = ', kperio
580      ENDIF
581      !
582   END SUBROUTINE domain_cfg
583
584
585   SUBROUTINE cfg_write
586      !!----------------------------------------------------------------------
587      !!                  ***  ROUTINE cfg_write  ***
588      !!
589      !! ** Purpose :   Create the "cn_domcfg_out" file, a NetCDF file which
590      !!              contains all the ocean domain informations required to
591      !!              define an ocean configuration.
592      !!
593      !! ** Method  :   Write in a file all the arrays required to set up an
594      !!              ocean configuration.
595      !!
596      !! ** output file :   domcfg_out.nc : domain size, characteristics, horizontal
597      !!                       mesh, Coriolis parameter, and vertical scale factors
598      !!                    NB: also contain ORCA family information
599      !!----------------------------------------------------------------------
600      INTEGER           ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indices
601      INTEGER           ::   izco, izps, isco, icav
602      INTEGER           ::   inum     ! local units
603      CHARACTER(len=21) ::   clnam    ! filename (mesh and mask informations)
604      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj) ::   z2d   ! workspace
605      !!----------------------------------------------------------------------
606      !
607      IF(lwp) WRITE(numout,*)
608      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'cfg_write : create the domain configuration file (', TRIM(cn_domcfg_out),'.nc)'
609      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~'
610      !
611      !                       ! ============================= !
612      !                       !  create 'domcfg_out.nc' file  !
613      !                       ! ============================= !
614      !
615      clnam = cn_domcfg_out  ! filename (configuration information)
616      CALL iom_open( TRIM(clnam), inum, ldwrt = .TRUE. )
617
618      !
619      !                             !==  ORCA family specificities  ==!
620      IF( cn_cfg == "ORCA" ) THEN
621         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ORCA'      , 1._wp            , ktype = jp_i4 )
622         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ORCA_index', REAL( nn_cfg, wp), ktype = jp_i4 )
623      ENDIF
624      !
625      !                             !==  global domain size  ==!
626      !
627      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'jpiglo', REAL( jpiglo, wp), ktype = jp_i4 )
628      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'jpjglo', REAL( jpjglo, wp), ktype = jp_i4 )
629      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'jpkglo', REAL( jpk   , wp), ktype = jp_i4 )
630      !
631      !                             !==  domain characteristics  ==!
632      !
633      !                                   ! lateral boundary of the global domain
634      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'jperio', REAL( jperio, wp), ktype = jp_i4 )
635      !
636      !                                   ! type of vertical coordinate
637      IF( ln_zco    ) THEN   ;   izco = 1   ;   ELSE   ;   izco = 0   ;   ENDIF
638      IF( ln_zps    ) THEN   ;   izps = 1   ;   ELSE   ;   izps = 0   ;   ENDIF
639      IF( ln_sco    ) THEN   ;   isco = 1   ;   ELSE   ;   isco = 0   ;   ENDIF
640      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ln_zco'   , REAL( izco, wp), ktype = jp_i4 )
641      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ln_zps'   , REAL( izps, wp), ktype = jp_i4 )
642      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ln_sco'   , REAL( isco, wp), ktype = jp_i4 )
643      !
644      !                                   ! ocean cavities under iceshelves
645      IF( ln_isfcav ) THEN   ;   icav = 1   ;   ELSE   ;   icav = 0   ;   ENDIF
646      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ln_isfcav', REAL( icav, wp), ktype = jp_i4 )
647      !
648      !                             !==  horizontal mesh  !
649      !
650      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'glamt', glamt, ktype = jp_r8 )   ! latitude
651      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'glamu', glamu, ktype = jp_r8 )
652      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'glamv', glamv, ktype = jp_r8 )
653      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'glamf', glamf, ktype = jp_r8 )
654      !
655      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'gphit', gphit, ktype = jp_r8 )   ! longitude
656      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'gphiu', gphiu, ktype = jp_r8 )
657      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'gphiv', gphiv, ktype = jp_r8 )
658      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'gphif', gphif, ktype = jp_r8 )
659      !
660      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e1t'  , e1t  , ktype = jp_r8 )   ! i-scale factors (e1.)
661      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e1u'  , e1u  , ktype = jp_r8 )
662      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e1v'  , e1v  , ktype = jp_r8 )
663      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e1f'  , e1f  , ktype = jp_r8 )
664      !
665      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e2t'  , e2t  , ktype = jp_r8 )   ! j-scale factors (e2.)
666      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e2u'  , e2u  , ktype = jp_r8 )
667      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e2v'  , e2v  , ktype = jp_r8 )
668      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e2f'  , e2f  , ktype = jp_r8 )
669      !
670      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ff_f' , ff_f , ktype = jp_r8 )   ! coriolis factor
671      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ff_t' , ff_t , ktype = jp_r8 )
672      !
673      !                             !==  vertical mesh  ==!
674      !
675      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3t_1d'  , e3t_1d , ktype = jp_r8 )   ! reference 1D-coordinate
676      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3w_1d'  , e3w_1d , ktype = jp_r8 )
677      !
678      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3t_0'   , e3t_0  , ktype = jp_r8 )   ! vertical scale factors
679      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3u_0'   , e3u_0  , ktype = jp_r8 )
680      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3v_0'   , e3v_0  , ktype = jp_r8 )
681      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3f_0'   , e3f_0  , ktype = jp_r8 )
682      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3w_0'   , e3w_0  , ktype = jp_r8 )
683      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3uw_0'  , e3uw_0 , ktype = jp_r8 )
684      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'e3vw_0'  , e3vw_0 , ktype = jp_r8 )
685      !
686      !                             !==  wet top and bottom level  ==!   (caution: multiplied by ssmask)
687      !
688      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'top_level'    , REAL( mikt, wp )*ssmask , ktype = jp_i4 )   ! nb of ocean T-points (ISF)
689      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'bottom_level' , REAL( mbkt, wp )*ssmask , ktype = jp_i4 )   ! nb of ocean T-points
690      !
691      IF( ln_sco ) THEN             ! s-coordinate: store grid stiffness ratio  (Not required anyway)
692         CALL dom_stiff( z2d )
693         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'stiffness', z2d )        !    ! Max. grid stiffness ratio
694      ENDIF
695      !
696      IF( ll_wd ) THEN              ! wetting and drying domain
697         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'ht_0'   , ht_0   , ktype = jp_r8 )
698      ENDIF
699      !
700      ! Add some global attributes ( netcdf only )
701      CALL iom_putatt( inum, 'nn_cfg', nn_cfg )
702      CALL iom_putatt( inum, 'cn_cfg', TRIM(cn_cfg) )
703      !
704      !                                ! ============================
705      !                                !        close the files
706      !                                ! ============================
707      CALL iom_close( inum )
708      !
709   END SUBROUTINE cfg_write
710
711   !!======================================================================
712END MODULE domain
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.