New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
domvvl.F90 in NEMO/branches/2020/dev_r13327_KERNEL-06_2_techene_e3/src/OCE/DOM – NEMO

source: NEMO/branches/2020/dev_r13327_KERNEL-06_2_techene_e3/src/OCE/DOM/domvvl.F90 @ 13914

Last change on this file since 13914 was 13895, checked in by techene, 4 years ago

#2574 => led to restart reorganization and some cleaning
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 53.6 KB
Line 
1MODULE domvvl
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE domvvl   ***
4   !! Ocean :
5   !!======================================================================
6   !! History :  2.0  !  2006-06  (B. Levier, L. Marie)  original code
7   !!            3.1  !  2009-02  (G. Madec, M. Leclair, R. Benshila)  pure z* coordinate
8   !!            3.3  !  2011-10  (M. Leclair) totally rewrote domvvl: vvl option includes z_star and z_tilde coordinates
9   !!            3.6  !  2014-11  (P. Mathiot) add ice shelf capability
10   !!            4.1  !  2019-08  (A. Coward, D. Storkey) rename dom_vvl_sf_swp -> dom_vvl_sf_update for new timestepping
11   !!             -   !  2020-02  (G. Madec, S. Techene) introduce ssh to h0 ratio
12   !!----------------------------------------------------------------------
13
14   USE oce             ! ocean dynamics and tracers
15   USE phycst          ! physical constant
16   USE dom_oce         ! ocean space and time domain
17   USE sbc_oce         ! ocean surface boundary condition
18   USE wet_dry         ! wetting and drying
19   USE usrdef_istate   ! user defined initial state (wad only)
20   USE restart         ! ocean restart
21   !
22   USE in_out_manager  ! I/O manager
23   USE iom             ! I/O manager library
24   USE lib_mpp         ! distributed memory computing library
25   USE lbclnk          ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
26   USE timing          ! Timing
27
28   IMPLICIT NONE
29   PRIVATE
30
31   !                                                      !!* Namelist nam_vvl
32   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_zstar           = .FALSE.    ! zstar  vertical coordinate
33   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_ztilde          = .FALSE.    ! ztilde vertical coordinate
34   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_layer           = .FALSE.    ! level  vertical coordinate
35   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_ztilde_as_zstar = .FALSE.    ! ztilde vertical coordinate
36   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_zstar_at_eqtor  = .FALSE.    ! ztilde vertical coordinate
37   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_kepe            = .FALSE.    ! kinetic/potential energy transfer
38   !                                                       ! conservation: not used yet
39   REAL(wp)         :: rn_ahe3                             ! thickness diffusion coefficient
40   REAL(wp)         :: rn_rst_e3t                          ! ztilde to zstar restoration timescale [days]
41   REAL(wp)         :: rn_lf_cutoff                        ! cutoff frequency for low-pass filter  [days]
42   REAL(wp)         :: rn_zdef_max                         ! maximum fractional e3t deformation
43   LOGICAL , PUBLIC :: ln_vvl_dbg = .FALSE.                ! debug control prints
44
45   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) :: un_td, vn_td                ! thickness diffusion transport
46   REAL(wp)        , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) :: hdiv_lf                     ! low frequency part of hz divergence
47   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) :: tilde_e3t_b, tilde_e3t_n    ! baroclinic scale factors
48   REAL(wp), PUBLIC, ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) :: tilde_e3t_a, dtilde_e3t_a   ! baroclinic scale factors
49   REAL(wp)        , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   :: frq_rst_e3t                 ! retoring period for scale factors
50   REAL(wp)        , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   :: frq_rst_hdv                 ! retoring period for low freq. divergence
51
52#if defined key_qco
53   !!----------------------------------------------------------------------
54   !!   'key_qco'      EMPTY MODULE      Quasi-Eulerian vertical coordonate
55   !!----------------------------------------------------------------------
56#else
57   !!----------------------------------------------------------------------
58   !!   Default key      Old management of time varying vertical coordinate
59   !!----------------------------------------------------------------------
60   
61   !!----------------------------------------------------------------------
62   !!   dom_vvl_init     : define initial vertical scale factors, depths and column thickness
63   !!   dom_vvl_sf_nxt   : Compute next vertical scale factors
64   !!   dom_vvl_sf_update   : Swap vertical scale factors and update the vertical grid
65   !!   dom_vvl_interpol : Interpolate vertical scale factors from one grid point to another
66   !!   dom_vvl_rst      : read/write restart file
67   !!   dom_vvl_ctl      : Check the vvl options
68   !!----------------------------------------------------------------------
69
70   PUBLIC  dom_vvl_init       ! called by domain.F90
71   PUBLIC  dom_vvl_zgr        ! called by isfcpl.F90
72   PUBLIC  dom_vvl_sf_nxt     ! called by step.F90
73   PUBLIC  dom_vvl_sf_update  ! called by step.F90
74   PUBLIC  dom_vvl_interpol   ! called by dynnxt.F90
75   
76   !! * Substitutions
77#  include "do_loop_substitute.h90"
78   !!----------------------------------------------------------------------
79   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
80   !! $Id$
81   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
82   !!----------------------------------------------------------------------
83CONTAINS
84
85   INTEGER FUNCTION dom_vvl_alloc()
86      !!----------------------------------------------------------------------
87      !!                ***  FUNCTION dom_vvl_alloc  ***
88      !!----------------------------------------------------------------------
89      IF( ln_vvl_zstar )   dom_vvl_alloc = 0
90      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN
91         ALLOCATE( tilde_e3t_b(jpi,jpj,jpk)  , tilde_e3t_n(jpi,jpj,jpk) , tilde_e3t_a(jpi,jpj,jpk) ,   &
92            &      dtilde_e3t_a(jpi,jpj,jpk) , un_td  (jpi,jpj,jpk)     , vn_td  (jpi,jpj,jpk)     ,   &
93            &      STAT = dom_vvl_alloc        )
94         CALL mpp_sum ( 'domvvl', dom_vvl_alloc )
95         IF( dom_vvl_alloc /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_alloc: failed to allocate arrays' )
96         un_td = 0._wp
97         vn_td = 0._wp
98      ENDIF
99      IF( ln_vvl_ztilde ) THEN
100         ALLOCATE( frq_rst_e3t(jpi,jpj) , frq_rst_hdv(jpi,jpj) , hdiv_lf(jpi,jpj,jpk) , STAT= dom_vvl_alloc )
101         CALL mpp_sum ( 'domvvl', dom_vvl_alloc )
102         IF( dom_vvl_alloc /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_alloc: failed to allocate arrays' )
103      ENDIF
104      !
105   END FUNCTION dom_vvl_alloc
106
107
108   SUBROUTINE dom_vvl_init( Kbb, Kmm, Kaa )
109      !!----------------------------------------------------------------------
110      !!                ***  ROUTINE dom_vvl_init  ***
111      !!                   
112      !! ** Purpose :  Initialization of all scale factors, depths
113      !!               and water column heights
114      !!
115      !! ** Method  :  - use restart file and/or initialize
116      !!               - interpolate scale factors
117      !!
118      !! ** Action  : - e3t_(n/b) and tilde_e3t_(n/b)
119      !!              - Regrid: e3[u/v](:,:,:,Kmm)
120      !!                        e3[u/v](:,:,:,Kmm)       
121      !!                        e3w(:,:,:,Kmm)           
122      !!                        e3[u/v]w_b
123      !!                        e3[u/v]w_n     
124      !!                        gdept(:,:,:,Kmm), gdepw(:,:,:,Kmm) and gde3w
125      !!              - h(t/u/v)_0
126      !!              - frq_rst_e3t and frq_rst_hdv
127      !!
128      !! Reference  : Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling.
129      !!----------------------------------------------------------------------
130      INTEGER, INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa
131      !
132      IF(lwp) WRITE(numout,*)
133      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_init : Variable volume activated'
134      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~'
135      !
136      CALL dom_vvl_ctl     ! choose vertical coordinate (z_star, z_tilde or layer)
137      !
138      !                    ! Allocate module arrays
139      IF( dom_vvl_alloc() /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'dom_vvl_init : unable to allocate arrays' )
140      !
141      !                    ! Read or initialize e3t_(b/n), tilde_e3t_(b/n) and hdiv_lf
142      CALL dom_vvl_rst( nit000, Kbb, Kmm, 'READ' )
143      e3t(:,:,jpk,Kaa) = e3t_0(:,:,jpk)  ! last level always inside the sea floor set one for all
144      !
145      CALL dom_vvl_zgr(Kbb, Kmm, Kaa) ! interpolation scale factor, depth and water column
146      !
147   END SUBROUTINE dom_vvl_init
148
149
150   SUBROUTINE dom_vvl_zgr(Kbb, Kmm, Kaa)
151      !!----------------------------------------------------------------------
152      !!                ***  ROUTINE dom_vvl_init  ***
153      !!                   
154      !! ** Purpose :  Interpolation of all scale factors,
155      !!               depths and water column heights
156      !!
157      !! ** Method  :  - interpolate scale factors
158      !!
159      !! ** Action  : - e3t_(n/b) and tilde_e3t_(n/b)
160      !!              - Regrid: e3(u/v)_n
161      !!                        e3(u/v)_b       
162      !!                        e3w_n           
163      !!                        e3(u/v)w_b     
164      !!                        e3(u/v)w_n     
165      !!                        gdept_n, gdepw_n and gde3w_n
166      !!              - h(t/u/v)_0
167      !!              - frq_rst_e3t and frq_rst_hdv
168      !!
169      !! Reference  : Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling.
170      !!----------------------------------------------------------------------
171      INTEGER, INTENT(in) :: Kbb, Kmm, Kaa
172      !!----------------------------------------------------------------------
173      INTEGER ::   ji, jj, jk
174      INTEGER ::   ii0, ii1, ij0, ij1
175      REAL(wp)::   zcoef
176      !!----------------------------------------------------------------------
177      !
178      !                    !== Set of all other vertical scale factors  ==!  (now and before)
179      !                                ! Horizontal interpolation of e3t
180      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kbb), e3u(:,:,:,Kbb), 'U' )    ! from T to U
181      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kmm), e3u(:,:,:,Kmm), 'U' )
182      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kbb), e3v(:,:,:,Kbb), 'V' )    ! from T to V
183      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kmm), e3v(:,:,:,Kmm), 'V' )
184      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kmm), e3f(:,:,:), 'F' )    ! from U to F
185      !                                ! Vertical interpolation of e3t,u,v
186      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kmm), e3w (:,:,:,Kmm), 'W'  )  ! from T to W
187      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kbb), e3w (:,:,:,Kbb), 'W'  )
188      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kmm), e3uw(:,:,:,Kmm), 'UW' )  ! from U to UW
189      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kbb), e3uw(:,:,:,Kbb), 'UW' )
190      CALL dom_vvl_interpol( e3v(:,:,:,Kmm), e3vw(:,:,:,Kmm), 'VW' )  ! from V to UW
191      CALL dom_vvl_interpol( e3v(:,:,:,Kbb), e3vw(:,:,:,Kbb), 'VW' )
192
193      ! We need to define e3[tuv]_a for AGRIF initialisation (should not be a problem for the restartability...)
194      e3t(:,:,:,Kaa) = e3t(:,:,:,Kmm)
195      e3u(:,:,:,Kaa) = e3u(:,:,:,Kmm)
196      e3v(:,:,:,Kaa) = e3v(:,:,:,Kmm)
197      !
198      !                    !==  depth of t and w-point  ==!   (set the isf depth as it is in the initial timestep)
199      gdept(:,:,1,Kmm) = 0.5_wp * e3w(:,:,1,Kmm)       ! reference to the ocean surface (used for MLD and light penetration)
200      gdepw(:,:,1,Kmm) = 0.0_wp
201      gde3w(:,:,1) = gdept(:,:,1,Kmm) - ssh(:,:,Kmm)  ! reference to a common level z=0 for hpg
202      gdept(:,:,1,Kbb) = 0.5_wp * e3w(:,:,1,Kbb)
203      gdepw(:,:,1,Kbb) = 0.0_wp
204      DO_3D( 1, 1, 1, 1, 2, jpk )
205         !    zcoef = tmask - wmask    ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt
206         !                             ! 1 everywhere from mbkt to mikt + 1 or 1 (if no isf)
207         !                             ! 0.5 where jk = mikt     
208!!gm ???????   BUG ?  gdept(:,:,:,Kmm) as well as gde3w  does not include the thickness of ISF ??
209         zcoef = ( tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk) )
210         gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm)
211         gdept(ji,jj,jk,Kmm) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm))  &
212            &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm)) 
213         gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm)
214         gdepw(ji,jj,jk,Kbb) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kbb) + e3t(ji,jj,jk-1,Kbb)
215         gdept(ji,jj,jk,Kbb) =      zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kbb) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kbb))  &
216            &                + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kbb) +       e3w(ji,jj,jk,Kbb)) 
217      END_3D
218      !
219      !                    !==  thickness of the water column  !!   (ocean portion only)
220      ht(:,:) = e3t(:,:,1,Kmm) * tmask(:,:,1)   !!gm  BUG  :  this should be 1/2 * e3w(k=1) ....
221      hu(:,:,Kbb) = e3u(:,:,1,Kbb) * umask(:,:,1)
222      hu(:,:,Kmm) = e3u(:,:,1,Kmm) * umask(:,:,1)
223      hv(:,:,Kbb) = e3v(:,:,1,Kbb) * vmask(:,:,1)
224      hv(:,:,Kmm) = e3v(:,:,1,Kmm) * vmask(:,:,1)
225      DO jk = 2, jpkm1
226         ht(:,:) = ht(:,:) + e3t(:,:,jk,Kmm) * tmask(:,:,jk)
227         hu(:,:,Kbb) = hu(:,:,Kbb) + e3u(:,:,jk,Kbb) * umask(:,:,jk)
228         hu(:,:,Kmm) = hu(:,:,Kmm) + e3u(:,:,jk,Kmm) * umask(:,:,jk)
229         hv(:,:,Kbb) = hv(:,:,Kbb) + e3v(:,:,jk,Kbb) * vmask(:,:,jk)
230         hv(:,:,Kmm) = hv(:,:,Kmm) + e3v(:,:,jk,Kmm) * vmask(:,:,jk)
231      END DO
232      !
233      !                    !==  inverse of water column thickness   ==!   (u- and v- points)
234      r1_hu(:,:,Kbb) = ssumask(:,:) / ( hu(:,:,Kbb) + 1._wp - ssumask(:,:) )    ! _i mask due to ISF
235      r1_hu(:,:,Kmm) = ssumask(:,:) / ( hu(:,:,Kmm) + 1._wp - ssumask(:,:) )
236      r1_hv(:,:,Kbb) = ssvmask(:,:) / ( hv(:,:,Kbb) + 1._wp - ssvmask(:,:) )
237      r1_hv(:,:,Kmm) = ssvmask(:,:) / ( hv(:,:,Kmm) + 1._wp - ssvmask(:,:) )
238
239      !                    !==   z_tilde coordinate case  ==!   (Restoring frequencies)
240      IF( ln_vvl_ztilde ) THEN
241!!gm : idea: add here a READ in a file of custumized restoring frequency
242         !                                   ! Values in days provided via the namelist
243         !                                   ! use rsmall to avoid possible division by zero errors with faulty settings
244         frq_rst_e3t(:,:) = 2._wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.0_wp )
245         frq_rst_hdv(:,:) = 2._wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.0_wp )
246         !
247         IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar ) THEN   ! z-star emulation using z-tile
248            frq_rst_e3t(:,:) = 0._wp               !Ignore namelist settings
249            frq_rst_hdv(:,:) = 1._wp / rn_Dt
250         ENDIF
251         IF ( ln_vvl_zstar_at_eqtor ) THEN   ! use z-star in vicinity of the Equator
252            DO_2D( 1, 1, 1, 1 )
253!!gm  case |gphi| >= 6 degrees is useless   initialized just above by default
254               IF( ABS(gphit(ji,jj)) >= 6.) THEN
255                  ! values outside the equatorial band and transition zone (ztilde)
256                  frq_rst_e3t(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_rst_e3t  , rsmall ) * 86400.e0_wp )
257                  frq_rst_hdv(ji,jj) =  2.0_wp * rpi / ( MAX( rn_lf_cutoff, rsmall ) * 86400.e0_wp )
258               ELSEIF( ABS(gphit(ji,jj)) <= 2.5) THEN    ! Equator strip ==> z-star
259                  ! values inside the equatorial band (ztilde as zstar)
260                  frq_rst_e3t(ji,jj) =  0.0_wp
261                  frq_rst_hdv(ji,jj) =  1.0_wp / rn_Dt
262               ELSE                                      ! transition band (2.5 to 6 degrees N/S)
263                  !                                      ! (linearly transition from z-tilde to z-star)
264                  frq_rst_e3t(ji,jj) = 0.0_wp + (frq_rst_e3t(ji,jj)-0.0_wp)*0.5_wp   &
265                     &            * (  1.0_wp - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  &
266                     &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) )
267                  frq_rst_hdv(ji,jj) = (1.0_wp / rn_Dt)                                &
268                     &            + (  frq_rst_hdv(ji,jj)-(1.e0_wp / rn_Dt) )*0.5_wp   &
269                     &            * (  1._wp  - COS( rad*(ABS(gphit(ji,jj))-2.5_wp)  &
270                     &                                          * 180._wp / 3.5_wp ) )
271               ENDIF
272            END_2D
273            IF( cn_cfg == "orca" .OR. cn_cfg == "ORCA" ) THEN
274               IF( nn_cfg == 3 ) THEN   ! ORCA2: Suppress ztilde in the Foxe Basin for ORCA2
275                  ii0 = 103 + nn_hls - 1   ;   ii1 = 111 + nn_hls - 1     
276                  ij0 = 128 + nn_hls       ;   ij1 = 135 + nn_hls
277                  frq_rst_e3t( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ) =  0.0_wp
278                  frq_rst_hdv( mi0(ii0):mi1(ii1) , mj0(ij0):mj1(ij1) ) =  1.e0_wp / rn_Dt
279               ENDIF
280            ENDIF
281         ENDIF
282      ENDIF
283      !
284      IF(lwxios) THEN
285! define variables in restart file when writing with XIOS
286         CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_b')
287         CALL iom_set_rstw_var_active('e3t_n')
288         !                                           ! ----------------------- !
289         IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN  ! z_tilde and layer cases !
290            !                                        ! ----------------------- !
291            CALL iom_set_rstw_var_active('tilde_e3t_b')
292            CALL iom_set_rstw_var_active('tilde_e3t_n')
293         END IF
294         !                                           ! -------------!   
295         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN                    ! z_tilde case !
296            !                                        ! ------------ !
297            CALL iom_set_rstw_var_active('hdiv_lf')
298         ENDIF
299         !
300      ENDIF
301      !
302   END SUBROUTINE dom_vvl_zgr
303
304
305   SUBROUTINE dom_vvl_sf_nxt( kt, Kbb, Kmm, Kaa, kcall ) 
306      !!----------------------------------------------------------------------
307      !!                ***  ROUTINE dom_vvl_sf_nxt  ***
308      !!                   
309      !! ** Purpose :  - compute the after scale factors used in tra_zdf, dynnxt,
310      !!                 tranxt and dynspg routines
311      !!
312      !! ** Method  :  - z_star case:  Repartition of ssh INCREMENT proportionnaly to the level thickness.
313      !!               - z_tilde_case: after scale factor increment =
314      !!                                    high frequency part of horizontal divergence
315      !!                                  + retsoring towards the background grid
316      !!                                  + thickness difusion
317      !!                               Then repartition of ssh INCREMENT proportionnaly
318      !!                               to the "baroclinic" level thickness.
319      !!
320      !! ** Action  :  - hdiv_lf    : restoring towards full baroclinic divergence in z_tilde case
321      !!               - tilde_e3t_a: after increment of vertical scale factor
322      !!                              in z_tilde case
323      !!               - e3(t/u/v)_a
324      !!
325      !! Reference  : Leclair, M., and Madec, G. 2011, Ocean Modelling.
326      !!----------------------------------------------------------------------
327      INTEGER, INTENT( in )           ::   kt             ! time step
328      INTEGER, INTENT( in )           ::   Kbb, Kmm, Kaa  ! time step
329      INTEGER, INTENT( in ), OPTIONAL ::   kcall          ! optional argument indicating call sequence
330      !
331      INTEGER                ::   ji, jj, jk            ! dummy loop indices
332      INTEGER , DIMENSION(3) ::   ijk_max, ijk_min      ! temporary integers
333      REAL(wp)               ::   z_tmin, z_tmax        ! local scalars
334      LOGICAL                ::   ll_do_bclinic         ! local logical
335      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   zht, z_scale, zwu, zwv, zhdiv
336      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   ze3t
337      !!----------------------------------------------------------------------
338      !
339      IF( ln_linssh )   RETURN      ! No calculation in linear free surface
340      !
341      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dom_vvl_sf_nxt')
342      !
343      IF( kt == nit000 ) THEN
344         IF(lwp) WRITE(numout,*)
345         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_sf_nxt : compute after scale factors'
346         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~'
347      ENDIF
348
349      ll_do_bclinic = .TRUE.
350      IF( PRESENT(kcall) ) THEN
351         IF( kcall == 2 .AND. ln_vvl_ztilde )   ll_do_bclinic = .FALSE.
352      ENDIF
353
354      ! ******************************* !
355      ! After acale factors at t-points !
356      ! ******************************* !
357      !                                                ! --------------------------------------------- !
358      !                                                ! z_star coordinate and barotropic z-tilde part !
359      !                                                ! --------------------------------------------- !
360      !
361      z_scale(:,:) = ( ssh(:,:,Kaa) - ssh(:,:,Kbb) ) * ssmask(:,:) / ( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kmm) + 1. - ssmask(:,:) )
362      DO jk = 1, jpkm1
363         ! formally this is the same as e3t(:,:,:,Kaa) = e3t_0*(1+ssha/ht_0)
364         e3t(:,:,jk,Kaa) = e3t(:,:,jk,Kbb) + e3t(:,:,jk,Kmm) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk)
365      END DO
366      !
367      IF( (ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer) .AND. ll_do_bclinic ) THEN   ! z_tilde or layer coordinate !
368         !                                                               ! ------baroclinic part------ !
369         ! I - initialization
370         ! ==================
371
372         ! 1 - barotropic divergence
373         ! -------------------------
374         zhdiv(:,:) = 0._wp
375         zht(:,:)   = 0._wp
376         DO jk = 1, jpkm1
377            zhdiv(:,:) = zhdiv(:,:) + e3t(:,:,jk,Kmm) * hdiv(:,:,jk)
378            zht  (:,:) = zht  (:,:) + e3t(:,:,jk,Kmm) * tmask(:,:,jk)
379         END DO
380         zhdiv(:,:) = zhdiv(:,:) / ( zht(:,:) + 1. - tmask_i(:,:) )
381
382         ! 2 - Low frequency baroclinic horizontal divergence  (z-tilde case only)
383         ! --------------------------------------------------
384         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN
385            IF( kt > nit000 ) THEN
386               DO jk = 1, jpkm1
387                  hdiv_lf(:,:,jk) = hdiv_lf(:,:,jk) - rn_Dt * frq_rst_hdv(:,:)   &
388                     &          * ( hdiv_lf(:,:,jk) - e3t(:,:,jk,Kmm) * ( hdiv(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) )
389               END DO
390            ENDIF
391         ENDIF
392
393         ! II - after z_tilde increments of vertical scale factors
394         ! =======================================================
395         tilde_e3t_a(:,:,:) = 0._wp  ! tilde_e3t_a used to store tendency terms
396
397         ! 1 - High frequency divergence term
398         ! ----------------------------------
399         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN     ! z_tilde case
400            DO jk = 1, jpkm1
401               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - ( e3t(:,:,jk,Kmm) * ( hdiv(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) - hdiv_lf(:,:,jk) )
402            END DO
403         ELSE                         ! layer case
404            DO jk = 1, jpkm1
405               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) -   e3t(:,:,jk,Kmm) * ( hdiv(:,:,jk) - zhdiv(:,:) ) * tmask(:,:,jk)
406            END DO
407         ENDIF
408
409         ! 2 - Restoring term (z-tilde case only)
410         ! ------------------
411         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN
412            DO jk = 1, jpk
413               tilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - frq_rst_e3t(:,:) * tilde_e3t_b(:,:,jk)
414            END DO
415         ENDIF
416
417         ! 3 - Thickness diffusion term
418         ! ----------------------------
419         zwu(:,:) = 0._wp
420         zwv(:,:) = 0._wp
421         DO_3D( 1, 0, 1, 0, 1, jpkm1 )
422            un_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * umask(ji,jj,jk) * e2_e1u(ji,jj)           &
423               &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji+1,jj  ,jk) )
424            vn_td(ji,jj,jk) = rn_ahe3 * vmask(ji,jj,jk) * e1_e2v(ji,jj)           & 
425               &            * ( tilde_e3t_b(ji,jj,jk) - tilde_e3t_b(ji  ,jj+1,jk) )
426            zwu(ji,jj) = zwu(ji,jj) + un_td(ji,jj,jk)
427            zwv(ji,jj) = zwv(ji,jj) + vn_td(ji,jj,jk)
428         END_3D
429         DO_2D( 1, 1, 1, 1 )
430            un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) = un_td(ji,jj,mbku(ji,jj)) - zwu(ji,jj)
431            vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) = vn_td(ji,jj,mbkv(ji,jj)) - zwv(ji,jj)
432         END_2D
433         DO_3D( 0, 0, 0, 0, 1, jpkm1 )
434            tilde_e3t_a(ji,jj,jk) = tilde_e3t_a(ji,jj,jk) + (   un_td(ji-1,jj  ,jk) - un_td(ji,jj,jk)    &
435               &                                          +     vn_td(ji  ,jj-1,jk) - vn_td(ji,jj,jk)    &
436               &                                            ) * r1_e1e2t(ji,jj)
437         END_3D
438         !                       ! d - thickness diffusion transport: boundary conditions
439         !                             (stored for tracer advction and continuity equation)
440         CALL lbc_lnk_multi( 'domvvl', un_td , 'U' , -1._wp, vn_td , 'V' , -1._wp)
441
442         ! 4 - Time stepping of baroclinic scale factors
443         ! ---------------------------------------------
444         CALL lbc_lnk( 'domvvl', tilde_e3t_a(:,:,:), 'T', 1._wp )
445         tilde_e3t_a(:,:,:) = tilde_e3t_b(:,:,:) + rDt * tmask(:,:,:) * tilde_e3t_a(:,:,:)
446
447         ! Maximum deformation control
448         ! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
449         ze3t(:,:,jpk) = 0._wp
450         DO jk = 1, jpkm1
451            ze3t(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) / e3t_0(:,:,jk) * tmask(:,:,jk) * tmask_i(:,:)
452         END DO
453         z_tmax = MAXVAL( ze3t(:,:,:) )
454         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                 ! max over the global domain
455         z_tmin = MINVAL( ze3t(:,:,:) )
456         CALL mpp_min( 'domvvl', z_tmin )                 ! min over the global domain
457         ! - ML - test: for the moment, stop simulation for too large e3_t variations
458         IF( ( z_tmax >  rn_zdef_max ) .OR. ( z_tmin < - rn_zdef_max ) ) THEN
459            IF( lk_mpp ) THEN
460               CALL mpp_maxloc( 'domvvl', ze3t, tmask, z_tmax, ijk_max )
461               CALL mpp_minloc( 'domvvl', ze3t, tmask, z_tmin, ijk_min )
462            ELSE
463               ijk_max = MAXLOC( ze3t(:,:,:) )
464               ijk_max(1) = ijk_max(1) + nimpp - 1
465               ijk_max(2) = ijk_max(2) + njmpp - 1
466               ijk_min = MINLOC( ze3t(:,:,:) )
467               ijk_min(1) = ijk_min(1) + nimpp - 1
468               ijk_min(2) = ijk_min(2) + njmpp - 1
469            ENDIF
470            IF (lwp) THEN
471               WRITE(numout, *) 'MAX( tilde_e3t_a(:,:,:) / e3t_0(:,:,:) ) =', z_tmax
472               WRITE(numout, *) 'at i, j, k=', ijk_max
473               WRITE(numout, *) 'MIN( tilde_e3t_a(:,:,:) / e3t_0(:,:,:) ) =', z_tmin
474               WRITE(numout, *) 'at i, j, k=', ijk_min           
475               CALL ctl_stop( 'STOP', 'MAX( ABS( tilde_e3t_a(:,:,: ) ) / e3t_0(:,:,:) ) too high')
476            ENDIF
477         ENDIF
478         ! - ML - end test
479         ! - ML - Imposing these limits will cause a baroclinicity error which is corrected for below
480         tilde_e3t_a(:,:,:) = MIN( tilde_e3t_a(:,:,:),   rn_zdef_max * e3t_0(:,:,:) )
481         tilde_e3t_a(:,:,:) = MAX( tilde_e3t_a(:,:,:), - rn_zdef_max * e3t_0(:,:,:) )
482
483         !
484         ! "tilda" change in the after scale factor
485         ! ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
486         DO jk = 1, jpkm1
487            dtilde_e3t_a(:,:,jk) = tilde_e3t_a(:,:,jk) - tilde_e3t_b(:,:,jk)
488         END DO
489         ! III - Barotropic repartition of the sea surface height over the baroclinic profile
490         ! ==================================================================================
491         ! add ( ssh increment + "baroclinicity error" ) proportionly to e3t(n)
492         ! - ML - baroclinicity error should be better treated in the future
493         !        i.e. locally and not spread over the water column.
494         !        (keep in mind that the idea is to reduce Eulerian velocity as much as possible)
495         zht(:,:) = 0.
496         DO jk = 1, jpkm1
497            zht(:,:)  = zht(:,:) + tilde_e3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk)
498         END DO
499         z_scale(:,:) =  - zht(:,:) / ( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kmm) + 1. - ssmask(:,:) )
500         DO jk = 1, jpkm1
501            dtilde_e3t_a(:,:,jk) = dtilde_e3t_a(:,:,jk) + e3t(:,:,jk,Kmm) * z_scale(:,:) * tmask(:,:,jk)
502         END DO
503
504      ENDIF
505
506      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer )  THEN   ! z_tilde or layer coordinate !
507      !                                           ! ---baroclinic part--------- !
508         DO jk = 1, jpkm1
509            e3t(:,:,jk,Kaa) = e3t(:,:,jk,Kaa) + dtilde_e3t_a(:,:,jk) * tmask(:,:,jk)
510         END DO
511      ENDIF
512
513      IF( ln_vvl_dbg .AND. .NOT. ll_do_bclinic ) THEN   ! - ML - test: control prints for debuging
514         !
515         IF( lwp ) WRITE(numout, *) 'kt =', kt
516         IF ( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN
517            z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( zht(:,:) ) )
518            CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                             ! max over the global domain
519            IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(SUM(tilde_e3t_a))) =', z_tmax
520         END IF
521         !
522         zht(:,:) = 0.0_wp
523         DO jk = 1, jpkm1
524            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t(:,:,jk,Kmm) * tmask(:,:,jk)
525         END DO
526         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kmm) - zht(:,:) ) )
527         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
528         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshn-SUM(e3t(:,:,:,Kmm)))) =', z_tmax
529         !
530         zht(:,:) = 0.0_wp
531         DO jk = 1, jpkm1
532            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t(:,:,jk,Kaa) * tmask(:,:,jk)
533         END DO
534         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kaa) - zht(:,:) ) )
535         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
536         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+ssha-SUM(e3t(:,:,:,Kaa)))) =', z_tmax
537         !
538         zht(:,:) = 0.0_wp
539         DO jk = 1, jpkm1
540            zht(:,:) = zht(:,:) + e3t(:,:,jk,Kbb) * tmask(:,:,jk)
541         END DO
542         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) * tmask_i(:,:) * ABS( ht_0(:,:) + ssh(:,:,Kbb) - zht(:,:) ) )
543         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
544         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ht_0+sshb-SUM(e3t(:,:,:,Kbb)))) =', z_tmax
545         !
546         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) *  ABS( ssh(:,:,Kbb) ) )
547         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
548         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ssh(:,:,Kbb)))) =', z_tmax
549         !
550         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) *  ABS( ssh(:,:,Kmm) ) )
551         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
552         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ssh(:,:,Kmm)))) =', z_tmax
553         !
554         z_tmax = MAXVAL( tmask(:,:,1) *  ABS( ssh(:,:,Kaa) ) )
555         CALL mpp_max( 'domvvl', z_tmax )                                ! max over the global domain
556         IF( lwp    ) WRITE(numout, *) kt,' MAXVAL(abs(ssh(:,:,Kaa)))) =', z_tmax
557      END IF
558
559      ! *********************************** !
560      ! After scale factors at u- v- points !
561      ! *********************************** !
562
563      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kaa), e3u(:,:,:,Kaa), 'U' )
564      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kaa), e3v(:,:,:,Kaa), 'V' )
565
566      ! *********************************** !
567      ! After depths at u- v points         !
568      ! *********************************** !
569
570      hu(:,:,Kaa) = e3u(:,:,1,Kaa) * umask(:,:,1)
571      hv(:,:,Kaa) = e3v(:,:,1,Kaa) * vmask(:,:,1)
572      DO jk = 2, jpkm1
573         hu(:,:,Kaa) = hu(:,:,Kaa) + e3u(:,:,jk,Kaa) * umask(:,:,jk)
574         hv(:,:,Kaa) = hv(:,:,Kaa) + e3v(:,:,jk,Kaa) * vmask(:,:,jk)
575      END DO
576      !                                        ! Inverse of the local depth
577!!gm BUG ?  don't understand the use of umask_i here .....
578      r1_hu(:,:,Kaa) = ssumask(:,:) / ( hu(:,:,Kaa) + 1._wp - ssumask(:,:) )
579      r1_hv(:,:,Kaa) = ssvmask(:,:) / ( hv(:,:,Kaa) + 1._wp - ssvmask(:,:) )
580      !
581      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dom_vvl_sf_nxt')
582      !
583   END SUBROUTINE dom_vvl_sf_nxt
584
585
586   SUBROUTINE dom_vvl_sf_update( kt, Kbb, Kmm, Kaa )
587      !!----------------------------------------------------------------------
588      !!                ***  ROUTINE dom_vvl_sf_update  ***
589      !!                   
590      !! ** Purpose :  for z tilde case: compute time filter and swap of scale factors
591      !!               compute all depths and related variables for next time step
592      !!               write outputs and restart file
593      !!
594      !! ** Method  :  - swap of e3t with trick for volume/tracer conservation (ONLY FOR Z TILDE CASE)
595      !!               - reconstruct scale factor at other grid points (interpolate)
596      !!               - recompute depths and water height fields
597      !!
598      !! ** Action  :  - tilde_e3t_(b/n) ready for next time step
599      !!               - Recompute:
600      !!                    e3(u/v)_b       
601      !!                    e3w(:,:,:,Kmm)           
602      !!                    e3(u/v)w_b     
603      !!                    e3(u/v)w_n     
604      !!                    gdept(:,:,:,Kmm), gdepw(:,:,:,Kmm)  and gde3w
605      !!                    h(u/v) and h(u/v)r
606      !!
607      !! Reference  : Leclair, M., and G. Madec, 2009, Ocean Modelling.
608      !!              Leclair, M., and G. Madec, 2011, Ocean Modelling.
609      !!----------------------------------------------------------------------
610      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt              ! time step
611      INTEGER, INTENT( in ) ::   Kbb, Kmm, Kaa   ! time level indices
612      !
613      INTEGER  ::   ji, jj, jk   ! dummy loop indices
614      REAL(wp) ::   zcoef        ! local scalar
615      !!----------------------------------------------------------------------
616      !
617      IF( ln_linssh )   RETURN      ! No calculation in linear free surface
618      !
619      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dom_vvl_sf_update')
620      !
621      IF( kt == nit000 )   THEN
622         IF(lwp) WRITE(numout,*)
623         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dom_vvl_sf_update : - interpolate scale factors and compute depths for next time step'
624         IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~~~~~'
625      ENDIF
626      !
627      ! Time filter and swap of scale factors
628      ! =====================================
629      ! - ML - e3(t/u/v)_b are allready computed in dynnxt.
630      IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN
631         IF( l_1st_euler ) THEN
632            tilde_e3t_b(:,:,:) = tilde_e3t_n(:,:,:)
633         ELSE
634            tilde_e3t_b(:,:,:) = tilde_e3t_n(:,:,:) & 
635            &         + rn_atfp * ( tilde_e3t_b(:,:,:) - 2.0_wp * tilde_e3t_n(:,:,:) + tilde_e3t_a(:,:,:) )
636         ENDIF
637         tilde_e3t_n(:,:,:) = tilde_e3t_a(:,:,:)
638      ENDIF
639
640      ! Compute all missing vertical scale factor and depths
641      ! ====================================================
642      ! Horizontal scale factor interpolations
643      ! --------------------------------------
644      ! - ML - e3u(:,:,:,Kbb) and e3v(:,:,:,Kbb) are already computed in dynnxt
645      ! - JC - hu(:,:,:,Kbb), hv(:,:,:,:,Kbb), hur_b, hvr_b also
646     
647      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kmm), e3f(:,:,:), 'F'  )
648     
649      ! Vertical scale factor interpolations
650      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kmm),  e3w(:,:,:,Kmm), 'W'  )
651      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kmm), e3uw(:,:,:,Kmm), 'UW' )
652      CALL dom_vvl_interpol( e3v(:,:,:,Kmm), e3vw(:,:,:,Kmm), 'VW' )
653      CALL dom_vvl_interpol( e3t(:,:,:,Kbb),  e3w(:,:,:,Kbb), 'W'  )
654      CALL dom_vvl_interpol( e3u(:,:,:,Kbb), e3uw(:,:,:,Kbb), 'UW' )
655      CALL dom_vvl_interpol( e3v(:,:,:,Kbb), e3vw(:,:,:,Kbb), 'VW' )
656
657      ! t- and w- points depth (set the isf depth as it is in the initial step)
658      gdept(:,:,1,Kmm) = 0.5_wp * e3w(:,:,1,Kmm)
659      gdepw(:,:,1,Kmm) = 0.0_wp
660      gde3w(:,:,1) = gdept(:,:,1,Kmm) - ssh(:,:,Kmm)
661      DO_3D( 1, 1, 1, 1, 2, jpk )
662        !    zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))   ! 0 everywhere tmask = wmask, ie everywhere expect at jk = mikt
663                                                           ! 1 for jk = mikt
664         zcoef = (tmask(ji,jj,jk) - wmask(ji,jj,jk))
665         gdepw(ji,jj,jk,Kmm) = gdepw(ji,jj,jk-1,Kmm) + e3t(ji,jj,jk-1,Kmm)
666         gdept(ji,jj,jk,Kmm) =    zcoef  * ( gdepw(ji,jj,jk  ,Kmm) + 0.5 * e3w(ji,jj,jk,Kmm) )  &
667             &             + (1-zcoef) * ( gdept(ji,jj,jk-1,Kmm) +       e3w(ji,jj,jk,Kmm) ) 
668         gde3w(ji,jj,jk) = gdept(ji,jj,jk,Kmm) - ssh(ji,jj,Kmm)
669      END_3D
670
671      ! Local depth and Inverse of the local depth of the water
672      ! -------------------------------------------------------
673      !
674      ht(:,:) = e3t(:,:,1,Kmm) * tmask(:,:,1)
675      DO jk = 2, jpkm1
676         ht(:,:) = ht(:,:) + e3t(:,:,jk,Kmm) * tmask(:,:,jk)
677      END DO
678
679      ! write restart file
680      ! ==================
681      IF( lrst_oce  )   CALL dom_vvl_rst( kt, Kbb, Kmm, 'WRITE' )
682      !
683      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dom_vvl_sf_update')
684      !
685   END SUBROUTINE dom_vvl_sf_update
686
687
688   SUBROUTINE dom_vvl_interpol( pe3_in, pe3_out, pout )
689      !!---------------------------------------------------------------------
690      !!                  ***  ROUTINE dom_vvl__interpol  ***
691      !!
692      !! ** Purpose :   interpolate scale factors from one grid point to another
693      !!
694      !! ** Method  :   e3_out = e3_0 + interpolation(e3_in - e3_0)
695      !!                - horizontal interpolation: grid cell surface averaging
696      !!                - vertical interpolation: simple averaging
697      !!----------------------------------------------------------------------
698      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(in   ) ::  pe3_in    ! input e3 to be interpolated
699      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk), INTENT(inout) ::  pe3_out   ! output interpolated e3
700      CHARACTER(LEN=*)                , INTENT(in   ) ::  pout      ! grid point of out scale factors
701      !                                                             !   =  'U', 'V', 'W, 'F', 'UW' or 'VW'
702      !
703      INTEGER ::   ji, jj, jk                                       ! dummy loop indices
704      REAL(wp) ::  zlnwd                                            ! =1./0. when ln_wd_il = T/F
705      !!----------------------------------------------------------------------
706      !
707      IF(ln_wd_il) THEN
708        zlnwd = 1.0_wp
709      ELSE
710        zlnwd = 0.0_wp
711      END IF
712      !
713      SELECT CASE ( pout )    !==  type of interpolation  ==!
714         !
715      CASE( 'U' )                   !* from T- to U-point : hor. surface weighted mean
716         DO_3D( 1, 0, 1, 0, 1, jpk )
717            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2u(ji,jj)   &
718               &                       * (   e1e2t(ji  ,jj) * ( pe3_in(ji  ,jj,jk) - e3t_0(ji  ,jj,jk) )     &
719               &                           + e1e2t(ji+1,jj) * ( pe3_in(ji+1,jj,jk) - e3t_0(ji+1,jj,jk) ) )
720         END_3D
721         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'U', 1._wp )
722         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3u_0(:,:,:)
723         !
724      CASE( 'V' )                   !* from T- to V-point : hor. surface weighted mean
725         DO_3D( 1, 0, 1, 0, 1, jpk )
726            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * ( vmask(ji,jj,jk)  * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) * r1_e1e2v(ji,jj)   &
727               &                       * (   e1e2t(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3t_0(ji,jj  ,jk) )     &
728               &                           + e1e2t(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3t_0(ji,jj+1,jk) ) )
729         END_3D
730         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'V', 1._wp )
731         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3v_0(:,:,:)
732         !
733      CASE( 'F' )                   !* from U-point to F-point : hor. surface weighted mean
734         DO_3D( 1, 0, 1, 0, 1, jpk )
735            pe3_out(ji,jj,jk) = 0.5_wp * (  umask(ji,jj,jk) * umask(ji,jj+1,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) &
736               &                       *    r1_e1e2f(ji,jj)                                                  &
737               &                       * (   e1e2u(ji,jj  ) * ( pe3_in(ji,jj  ,jk) - e3u_0(ji,jj  ,jk) )     &
738               &                           + e1e2u(ji,jj+1) * ( pe3_in(ji,jj+1,jk) - e3u_0(ji,jj+1,jk) ) )
739         END_3D
740         CALL lbc_lnk( 'domvvl', pe3_out(:,:,:), 'F', 1._wp )
741         pe3_out(:,:,:) = pe3_out(:,:,:) + e3f_0(:,:,:)
742         !
743      CASE( 'W' )                   !* from T- to W-point : vertical simple mean
744         !
745         pe3_out(:,:,1) = e3w_0(:,:,1) + pe3_in(:,:,1) - e3t_0(:,:,1)
746         ! - ML - The use of mask in this formulea enables the special treatment of the last w-point without indirect adressing
747!!gm BUG? use here wmask in case of ISF ?  to be checked
748         DO jk = 2, jpk
749            pe3_out(:,:,jk) = e3w_0(:,:,jk) + ( 1.0_wp - 0.5_wp * ( tmask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) )   &
750               &                            * ( pe3_in(:,:,jk-1) - e3t_0(:,:,jk-1) )                               &
751               &                            +            0.5_wp * ( tmask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd )     &
752               &                            * ( pe3_in(:,:,jk  ) - e3t_0(:,:,jk  ) )
753         END DO
754         !
755      CASE( 'UW' )                  !* from U- to UW-point : vertical simple mean
756         !
757         pe3_out(:,:,1) = e3uw_0(:,:,1) + pe3_in(:,:,1) - e3u_0(:,:,1)
758         ! - ML - The use of mask in this formaula enables the special treatment of the last w- point without indirect adressing
759!!gm BUG? use here wumask in case of ISF ?  to be checked
760         DO jk = 2, jpk
761            pe3_out(:,:,jk) = e3uw_0(:,:,jk) + ( 1.0_wp - 0.5_wp * ( umask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) )  &
762               &                             * ( pe3_in(:,:,jk-1) - e3u_0(:,:,jk-1) )                              &
763               &                             +            0.5_wp * ( umask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd )    &
764               &                             * ( pe3_in(:,:,jk  ) - e3u_0(:,:,jk  ) )
765         END DO
766         !
767      CASE( 'VW' )                  !* from V- to VW-point : vertical simple mean
768         !
769         pe3_out(:,:,1) = e3vw_0(:,:,1) + pe3_in(:,:,1) - e3v_0(:,:,1)
770         ! - ML - The use of mask in this formaula enables the special treatment of the last w- point without indirect adressing
771!!gm BUG? use here wvmask in case of ISF ?  to be checked
772         DO jk = 2, jpk
773            pe3_out(:,:,jk) = e3vw_0(:,:,jk) + ( 1.0_wp - 0.5_wp * ( vmask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd ) )  &
774               &                             * ( pe3_in(:,:,jk-1) - e3v_0(:,:,jk-1) )                              &
775               &                             +            0.5_wp * ( vmask(:,:,jk) * (1.0_wp - zlnwd) + zlnwd )    &
776               &                             * ( pe3_in(:,:,jk  ) - e3v_0(:,:,jk  ) )
777         END DO
778      END SELECT
779      !
780   END SUBROUTINE dom_vvl_interpol
781
782
783   SUBROUTINE dom_vvl_rst( kt, Kbb, Kmm, cdrw )
784      !!---------------------------------------------------------------------
785      !!                   ***  ROUTINE dom_vvl_rst  ***
786      !!                     
787      !! ** Purpose :   Read or write VVL file in restart file
788      !!
789      !! ** Method  : * restart comes from a linear ssh simulation :
790      !!                   an attempt to read e3t_n stops simulation
791      !!              * restart comes from a z-star, z-tilde, or layer :
792      !!                   read e3t_n and e3t_b
793      !!              * restart comes from a z-star :
794      !!                   set tilde_e3t_n, tilde_e3t_n, and hdiv_lf to 0
795      !!              * restart comes from layer :
796      !!                   read tilde_e3t_n and tilde_e3t_b
797      !!                   set hdiv_lf to 0
798      !!              * restart comes from a z-tilde:
799      !!                   read tilde_e3t_n, tilde_e3t_b, and hdiv_lf
800      !!
801      !!              NB: if l_1st_euler = T (ln_1st_euler or ssh_b not found)
802      !!                   Kbb fields set to Kmm ones
803      !!----------------------------------------------------------------------
804      INTEGER         , INTENT(in) ::   kt        ! ocean time-step
805      INTEGER         , INTENT(in) ::   Kbb, Kmm  ! ocean time level indices
806      CHARACTER(len=*), INTENT(in) ::   cdrw      ! "READ"/"WRITE" flag
807      !
808      INTEGER ::   ji, jj, jk      ! dummy loop indices
809      INTEGER ::   id3, id4, id5   ! local integers
810      !!----------------------------------------------------------------------
811      !
812      !                                      !=====================!
813      IF( TRIM(cdrw) == 'READ' ) THEN        !  Read / initialise  !
814         !                                   !=====================!
815         !
816         IF( ln_rstart ) THEN                   !==  Read the restart file  ==!
817            !
818            CALL rst_read_open                                          !*  open the restart file if necessary
819            !                                         ! --------- !
820            !                                         ! all cases !
821            !                                         ! --------- !
822            !
823            id3 = iom_varid( numror, 'tilde_e3t_b', ldstop = .FALSE. )  !*  check presence
824            id4 = iom_varid( numror, 'tilde_e3t_n', ldstop = .FALSE. )
825            id5 = iom_varid( numror, 'hdiv_lf'    , ldstop = .FALSE. )
826            !
827            !                                                           !*  scale factors
828            IF(lwp) WRITE(numout,*)    '          Kmm scale factor read in the restart file'
829            CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lrxios )
830            WHERE ( tmask(:,:,:) == 0.0_wp ) 
831               e3t(:,:,:,Kmm) = e3t_0(:,:,:)
832            END WHERE
833            IF( l_1st_euler ) THEN                       ! euler
834               IF(lwp) WRITE(numout,*) '          Euler first time step : e3t(Kbb) = e3t(Kmm)'
835               e3t(:,:,:,Kmm) = e3t(:,:,:,Kbb)
836            ELSE                                         ! leap frog
837               IF(lwp) WRITE(numout,*) '          Kbb scale factor read in the restart file'
838               CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lrxios )
839               WHERE ( tmask(:,:,:) == 0.0_wp ) 
840                  e3t(:,:,:,Kbb) = e3t_0(:,:,:)
841               END WHERE
842            ENDIF
843            !                                         ! ------------ !
844            IF( ln_vvl_zstar ) THEN                   !  z_star case !
845               !                                      ! ------------ !
846               IF( MIN( id3, id4 ) > 0 ) THEN
847                  CALL ctl_stop( 'dom_vvl_rst: z_star cannot restart from a z_tilde or layer run' )
848               ENDIF
849               !                                      ! ------------------------ !
850            ELSE                                      !  z_tilde and layer cases !
851               !                                      ! ------------------------ !
852               !
853               IF( id4 > 0 ) THEN                                       !*  scale factor increments
854                  IF(lwp) WRITE(numout,*)    '          Kmm scale factor increments read in the restart file'
855                  CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:), ldxios = lrxios )
856                  IF( l_1st_euler ) THEN                 ! euler
857                     IF(lwp) WRITE(numout,*) '          Euler first time step : tilde_e3t(Kbb) = tilde_e3t(Kmm)'
858                     tilde_e3t_b(:,:,:) = tilde_e3t_n(:,:,:)
859                  ELSE                                   ! leap frog
860                     IF(lwp) WRITE(numout,*) '          Kbb scale factor increments read in the restart file'
861                     CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:), ldxios = lrxios )
862                  ENDIF
863               ELSE
864                  tilde_e3t_b(:,:,:) = 0.0_wp
865                  tilde_e3t_n(:,:,:) = 0.0_wp
866               ENDIF
867               !                                      ! ------------ !
868               IF( ln_vvl_ztilde ) THEN               ! z_tilde case !
869                  !                                   ! ------------ !
870                  IF( id5 > 0 ) THEN  ! required array exists
871                     CALL iom_get( numror, jpdom_auto, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:), ldxios = lrxios )
872                  ELSE                ! array is missing
873                     hdiv_lf(:,:,:) = 0.0_wp 
874                  ENDIF
875               ENDIF
876            ENDIF
877            !
878         ELSE                                   !==  Initialize at "rest" with ssh  ==!
879            !
880            DO jk = 1, jpk
881               e3t(:,:,jk,Kmm) =  e3t_0(:,:,jk) * ( 1._wp + ssh(:,:,Kmm) * r1_ht_0(:,:) * tmask(:,:,jk) )
882            END DO
883            e3t(:,:,:,Kbb) = e3t(:,:,:,Kmm)
884            !
885            IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer) THEN
886               tilde_e3t_b(:,:,:) = 0._wp
887               tilde_e3t_n(:,:,:) = 0._wp
888               IF( ln_vvl_ztilde ) hdiv_lf(:,:,:) = 0._wp
889            ENDIF
890         ENDIF
891         !                                       !=======================!
892      ELSEIF( TRIM(cdrw) == 'WRITE' ) THEN       !  Create restart file  !
893         !                                       !=======================!
894         !
895         IF(lwp) WRITE(numout,*) '---- dom_vvl_rst ----'
896         IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cwxios_context          )
897         !                                           ! --------- !
898         !                                           ! all cases !
899         !                                           ! --------- !
900         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_b', e3t(:,:,:,Kbb), ldxios = lwxios )
901         CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'e3t_n', e3t(:,:,:,Kmm), ldxios = lwxios )
902         !                                           ! ----------------------- !
903         IF( ln_vvl_ztilde .OR. ln_vvl_layer ) THEN  ! z_tilde and layer cases !
904            !                                        ! ----------------------- !
905            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_b', tilde_e3t_b(:,:,:), ldxios = lwxios)
906            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'tilde_e3t_n', tilde_e3t_n(:,:,:), ldxios = lwxios)
907         END IF
908         !                                           ! -------------!   
909         IF( ln_vvl_ztilde ) THEN                    ! z_tilde case !
910            !                                        ! ------------ !
911            CALL iom_rstput( kt, nitrst, numrow, 'hdiv_lf', hdiv_lf(:,:,:), ldxios = lwxios)
912         ENDIF
913         !
914         IF( lwxios ) CALL iom_swap(      cxios_context          )
915      ENDIF
916      !
917   END SUBROUTINE dom_vvl_rst
918
919
920   SUBROUTINE dom_vvl_ctl
921      !!---------------------------------------------------------------------
922      !!                  ***  ROUTINE dom_vvl_ctl  ***
923      !!               
924      !! ** Purpose :   Control the consistency between namelist options
925      !!                for vertical coordinate
926      !!----------------------------------------------------------------------
927      INTEGER ::   ioptio, ios
928      !!
929      NAMELIST/nam_vvl/ ln_vvl_zstar, ln_vvl_ztilde, ln_vvl_layer, ln_vvl_ztilde_as_zstar, &
930         &              ln_vvl_zstar_at_eqtor      , rn_ahe3     , rn_rst_e3t            , &
931         &              rn_lf_cutoff               , rn_zdef_max , ln_vvl_dbg                ! not yet implemented: ln_vvl_kepe
932      !!----------------------------------------------------------------------
933      !
934      READ  ( numnam_ref, nam_vvl, IOSTAT = ios, ERR = 901)
935901   IF( ios /= 0 )   CALL ctl_nam ( ios , 'nam_vvl in reference namelist' )
936      READ  ( numnam_cfg, nam_vvl, IOSTAT = ios, ERR = 902 )
937902   IF( ios >  0 ) CALL ctl_nam ( ios , 'nam_vvl in configuration namelist' )
938      IF(lwm) WRITE ( numond, nam_vvl )
939      !
940      IF(lwp) THEN                    ! Namelist print
941         WRITE(numout,*)
942         WRITE(numout,*) 'dom_vvl_ctl : choice/control of the variable vertical coordinate'
943         WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~'
944         WRITE(numout,*) '   Namelist nam_vvl : chose a vertical coordinate'
945         WRITE(numout,*) '      zstar                      ln_vvl_zstar   = ', ln_vvl_zstar
946         WRITE(numout,*) '      ztilde                     ln_vvl_ztilde  = ', ln_vvl_ztilde
947         WRITE(numout,*) '      layer                      ln_vvl_layer   = ', ln_vvl_layer
948         WRITE(numout,*) '      ztilde as zstar   ln_vvl_ztilde_as_zstar  = ', ln_vvl_ztilde_as_zstar
949         WRITE(numout,*) '      ztilde near the equator    ln_vvl_zstar_at_eqtor  = ', ln_vvl_zstar_at_eqtor
950         WRITE(numout,*) '      !'
951         WRITE(numout,*) '      thickness diffusion coefficient                      rn_ahe3      = ', rn_ahe3
952         WRITE(numout,*) '      maximum e3t deformation fractional change            rn_zdef_max  = ', rn_zdef_max
953         IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar ) THEN
954            WRITE(numout,*) '      ztilde running in zstar emulation mode (ln_vvl_ztilde_as_zstar=T) '
955            WRITE(numout,*) '         ignoring namelist timescale parameters and using:'
956            WRITE(numout,*) '            hard-wired : z-tilde to zstar restoration timescale (days)'
957            WRITE(numout,*) '                         rn_rst_e3t     = 0.e0'
958            WRITE(numout,*) '            hard-wired : z-tilde cutoff frequency of low-pass filter (days)'
959            WRITE(numout,*) '                         rn_lf_cutoff   = 1.0/rn_Dt'
960         ELSE
961            WRITE(numout,*) '      z-tilde to zstar restoration timescale (days)        rn_rst_e3t   = ', rn_rst_e3t
962            WRITE(numout,*) '      z-tilde cutoff frequency of low-pass filter (days)   rn_lf_cutoff = ', rn_lf_cutoff
963         ENDIF
964         WRITE(numout,*) '         debug prints flag                                 ln_vvl_dbg   = ', ln_vvl_dbg
965      ENDIF
966      !
967      ioptio = 0                      ! Parameter control
968      IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar )   ln_vvl_ztilde = .true.
969      IF( ln_vvl_zstar           )   ioptio = ioptio + 1
970      IF( ln_vvl_ztilde          )   ioptio = ioptio + 1
971      IF( ln_vvl_layer           )   ioptio = ioptio + 1
972      !
973      IF( ioptio /= 1 )   CALL ctl_stop( 'Choose ONE vertical coordinate in namelist nam_vvl' )
974      !
975      IF(lwp) THEN                   ! Print the choice
976         WRITE(numout,*)
977         IF( ln_vvl_zstar           ) WRITE(numout,*) '      ==>>>   zstar vertical coordinate is used'
978         IF( ln_vvl_ztilde          ) WRITE(numout,*) '      ==>>>   ztilde vertical coordinate is used'
979         IF( ln_vvl_layer           ) WRITE(numout,*) '      ==>>>   layer vertical coordinate is used'
980         IF( ln_vvl_ztilde_as_zstar ) WRITE(numout,*) '      ==>>>   to emulate a zstar coordinate'
981      ENDIF
982      !
983#if defined key_agrif
984      IF( (.NOT.Agrif_Root()).AND.(.NOT.ln_vvl_zstar) )   CALL ctl_stop( 'AGRIF is implemented with zstar coordinate only' )
985#endif
986      !
987   END SUBROUTINE dom_vvl_ctl
988
989#endif
990
991   !!======================================================================
992END MODULE domvvl
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.