source: NEMO/trunk/src/OCE/DIA/diawri.F90 @ 11536

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trunk: merge dev_r10984_HPC-13 into the trunk

  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1MODULE diawri
2   !!======================================================================
3   !!                     ***  MODULE  diawri  ***
4   !! Ocean diagnostics :  write ocean output files
5   !!=====================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1991-03  (M.-A. Foujols)  Original code
7   !!            4.0  ! 1991-11  (G. Madec)
8   !!                 ! 1992-06  (M. Imbard)  correction restart file
9   !!                 ! 1992-07  (M. Imbard)  split into diawri and rstwri
10   !!                 ! 1993-03  (M. Imbard)  suppress writibm
11   !!                 ! 1998-01  (C. Levy)  NETCDF format using ioipsl INTERFACE
12   !!                 ! 1999-02  (E. Guilyardi)  name of netCDF files + variables
13   !!            8.2  ! 2000-06  (M. Imbard)  Original code (diabort.F)
14   !!   NEMO     1.0  ! 2002-06  (A.Bozec, E. Durand)  Original code (diainit.F)
15   !!             -   ! 2002-09  (G. Madec)  F90: Free form and module
16   !!             -   ! 2002-12  (G. Madec)  merge of diabort and diainit, F90
17   !!                 ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
18   !!            3.2  ! 2008-11  (B. Lemaire) creation from old diawri
19   !!            3.7  ! 2014-01  (G. Madec) remove eddy induced velocity from no-IOM output
20   !!                 !                     change name of output variables in dia_wri_state
21   !!----------------------------------------------------------------------
22
23   !!----------------------------------------------------------------------
24   !!   dia_wri       : create the standart output files
25   !!   dia_wri_state : create an output NetCDF file for a single instantaeous ocean state and forcing fields
26   !!----------------------------------------------------------------------
27   USE oce            ! ocean dynamics and tracers
28   USE dom_oce        ! ocean space and time domain
29   USE phycst         ! physical constants
30   USE dianam         ! build name of file (routine)
31   USE diahth         ! thermocline diagnostics
32   USE dynadv   , ONLY: ln_dynadv_vec
33   USE icb_oce        ! Icebergs
34   USE icbdia         ! Iceberg budgets
35   USE ldftra         ! lateral physics: eddy diffusivity coef.
36   USE ldfdyn         ! lateral physics: eddy viscosity   coef.
37   USE sbc_oce        ! Surface boundary condition: ocean fields
38   USE sbc_ice        ! Surface boundary condition: ice fields
39   USE sbcssr         ! restoring term toward SST/SSS climatology
40   USE sbcwave        ! wave parameters
41   USE wet_dry        ! wetting and drying
42   USE zdf_oce        ! ocean vertical physics
43   USE zdfdrg         ! ocean vertical physics: top/bottom friction
44   USE zdfmxl         ! mixed layer
45   !
46   USE lbclnk         ! ocean lateral boundary conditions (or mpp link)
47   USE in_out_manager ! I/O manager
48   USE diatmb         ! Top,middle,bottom output
49   USE dia25h         ! 25h Mean output
50   USE iom            !
51   USE ioipsl         !
52
53#if defined key_si3
54   USE ice 
55   USE icewri 
56#endif
57   USE lib_mpp         ! MPP library
58   USE timing          ! preformance summary
59   USE diurnal_bulk    ! diurnal warm layer
60   USE cool_skin       ! Cool skin
61
62   IMPLICIT NONE
63   PRIVATE
64
65   PUBLIC   dia_wri                 ! routines called by step.F90
66   PUBLIC   dia_wri_state
67   PUBLIC   dia_wri_alloc           ! Called by nemogcm module
68
69   INTEGER ::   nid_T, nz_T, nh_T, ndim_T, ndim_hT   ! grid_T file
70   INTEGER ::          nb_T              , ndim_bT   ! grid_T file
71   INTEGER ::   nid_U, nz_U, nh_U, ndim_U, ndim_hU   ! grid_U file
72   INTEGER ::   nid_V, nz_V, nh_V, ndim_V, ndim_hV   ! grid_V file
73   INTEGER ::   nid_W, nz_W, nh_W                    ! grid_W file
74   INTEGER ::   ndex(1)                              ! ???
75   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_hT, ndex_hU, ndex_hV
76   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_T, ndex_U, ndex_V
77   INTEGER, SAVE, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: ndex_bT
78
79   !! * Substitutions
80#  include "vectopt_loop_substitute.h90"
81   !!----------------------------------------------------------------------
82   !! NEMO/OCE 4.0 , NEMO Consortium (2018)
83   !! $Id$
84   !! Software governed by the CeCILL license (see ./LICENSE)
85   !!----------------------------------------------------------------------
86CONTAINS
87
88#if defined key_iomput
89   !!----------------------------------------------------------------------
90   !!   'key_iomput'                                        use IOM library
91   !!----------------------------------------------------------------------
92   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
93      !
94      dia_wri_alloc = 0
95      !
96   END FUNCTION dia_wri_alloc
97
98   
99   SUBROUTINE dia_wri( kt )
100      !!---------------------------------------------------------------------
101      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
102      !!                   
103      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
104      !!      NETCDF format is used by default
105      !!
106      !! ** Method  :  use iom_put
107      !!----------------------------------------------------------------------
108      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt      ! ocean time-step index
109      !!
110      INTEGER ::   ji, jj, jk       ! dummy loop indices
111      INTEGER ::   ikbot            ! local integer
112      REAL(wp)::   zztmp , zztmpx   ! local scalar
113      REAL(wp)::   zztmp2, zztmpy   !   -      -
114      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)     ::   z2d   ! 2D workspace
115      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) ::   z3d   ! 3D workspace
116      !!----------------------------------------------------------------------
117      !
118      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
119      !
120      ! Output the initial state and forcings
121      IF( ninist == 1 ) THEN                       
122         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
123         ninist = 0
124      ENDIF
125
126      ! Output of initial vertical scale factor
127      CALL iom_put("e3t_0", e3t_0(:,:,:) )
128      CALL iom_put("e3u_0", e3u_0(:,:,:) )
129      CALL iom_put("e3v_0", e3v_0(:,:,:) )
130      !
131      CALL iom_put( "e3t" , e3t_n(:,:,:) )
132      CALL iom_put( "e3u" , e3u_n(:,:,:) )
133      CALL iom_put( "e3v" , e3v_n(:,:,:) )
134      CALL iom_put( "e3w" , e3w_n(:,:,:) )
135      IF( iom_use("e3tdef") )   &
136         CALL iom_put( "e3tdef"  , ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2 )
137
138      IF( ll_wd ) THEN
139         CALL iom_put( "ssh" , (sshn+ssh_ref)*tmask(:,:,1) )   ! sea surface height (brought back to the reference used for wetting and drying)
140      ELSE
141         CALL iom_put( "ssh" , sshn )              ! sea surface height
142      ENDIF
143
144      IF( iom_use("wetdep") )   &                  ! wet depth
145         CALL iom_put( "wetdep" , ht_0(:,:) + sshn(:,:) )
146     
147      CALL iom_put( "toce", tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! 3D temperature
148      CALL iom_put(  "sst", tsn(:,:,1,jp_tem) )    ! surface temperature
149      IF ( iom_use("sbt") ) THEN
150         DO jj = 1, jpj
151            DO ji = 1, jpi
152               ikbot = mbkt(ji,jj)
153               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_tem)
154            END DO
155         END DO
156         CALL iom_put( "sbt", z2d )                ! bottom temperature
157      ENDIF
158     
159      CALL iom_put( "soce", tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! 3D salinity
160      CALL iom_put(  "sss", tsn(:,:,1,jp_sal) )    ! surface salinity
161      IF ( iom_use("sbs") ) THEN
162         DO jj = 1, jpj
163            DO ji = 1, jpi
164               ikbot = mbkt(ji,jj)
165               z2d(ji,jj) = tsn(ji,jj,ikbot,jp_sal)
166            END DO
167         END DO
168         CALL iom_put( "sbs", z2d )                ! bottom salinity
169      ENDIF
170
171      IF ( iom_use("taubot") ) THEN                ! bottom stress
172         zztmp = rau0 * 0.25
173         z2d(:,:) = 0._wp
174         DO jj = 2, jpjm1
175            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
176               zztmp2 = (  ( rCdU_bot(ji+1,jj)+rCdU_bot(ji  ,jj) ) * un(ji  ,jj,mbku(ji  ,jj))  )**2   &
177                  &   + (  ( rCdU_bot(ji  ,jj)+rCdU_bot(ji-1,jj) ) * un(ji-1,jj,mbku(ji-1,jj))  )**2   &
178                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj+1)+rCdU_bot(ji,jj  ) ) * vn(ji,jj  ,mbkv(ji,jj  ))  )**2   &
179                  &   + (  ( rCdU_bot(ji,jj  )+rCdU_bot(ji,jj-1) ) * vn(ji,jj-1,mbkv(ji,jj-1))  )**2
180               z2d(ji,jj) = zztmp * SQRT( zztmp2 ) * tmask(ji,jj,1) 
181               !
182            END DO
183         END DO
184         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
185         CALL iom_put( "taubot", z2d )           
186      ENDIF
187         
188      CALL iom_put( "uoce", un(:,:,:) )            ! 3D i-current
189      CALL iom_put(  "ssu", un(:,:,1) )            ! surface i-current
190      IF ( iom_use("sbu") ) THEN
191         DO jj = 1, jpj
192            DO ji = 1, jpi
193               ikbot = mbku(ji,jj)
194               z2d(ji,jj) = un(ji,jj,ikbot)
195            END DO
196         END DO
197         CALL iom_put( "sbu", z2d )                ! bottom i-current
198      ENDIF
199     
200      CALL iom_put( "voce", vn(:,:,:) )            ! 3D j-current
201      CALL iom_put(  "ssv", vn(:,:,1) )            ! surface j-current
202      IF ( iom_use("sbv") ) THEN
203         DO jj = 1, jpj
204            DO ji = 1, jpi
205               ikbot = mbkv(ji,jj)
206               z2d(ji,jj) = vn(ji,jj,ikbot)
207            END DO
208         END DO
209         CALL iom_put( "sbv", z2d )                ! bottom j-current
210      ENDIF
211
212      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn + wi               ! Recombine explicit and implicit parts of vertical velocity for diagnostic output
213      !
214      CALL iom_put( "woce", wn )                   ! vertical velocity
215      IF( iom_use('w_masstr') .OR. iom_use('w_masstr2') ) THEN   ! vertical mass transport & its square value
216         ! Caution: in the VVL case, it only correponds to the baroclinic mass transport.
217         z2d(:,:) = rau0 * e1e2t(:,:)
218         DO jk = 1, jpk
219            z3d(:,:,jk) = wn(:,:,jk) * z2d(:,:)
220         END DO
221         CALL iom_put( "w_masstr" , z3d ) 
222         IF( iom_use('w_masstr2') )   CALL iom_put( "w_masstr2", z3d(:,:,:) * z3d(:,:,:) )
223      ENDIF
224      !
225      IF( ln_zad_Aimp ) wn = wn - wi               ! Remove implicit part of vertical velocity that was added for diagnostic output
226
227      CALL iom_put( "avt" , avt )                  ! T vert. eddy diff. coef.
228      CALL iom_put( "avs" , avs )                  ! S vert. eddy diff. coef.
229      CALL iom_put( "avm" , avm )                  ! T vert. eddy visc. coef.
230
231      IF( iom_use('logavt') )   CALL iom_put( "logavt", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avt(:,:,:) ) ) )
232      IF( iom_use('logavs') )   CALL iom_put( "logavs", LOG( MAX( 1.e-20_wp, avs(:,:,:) ) ) )
233
234      IF ( iom_use("sstgrad") .OR. iom_use("sstgrad2") ) THEN
235         DO jj = 2, jpjm1                                    ! sst gradient
236            DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
237               zztmp  = tsn(ji,jj,1,jp_tem)
238               zztmpx = ( tsn(ji+1,jj,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e1u(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji-1,jj  ,1,jp_tem) ) * r1_e1u(ji-1,jj)
239               zztmpy = ( tsn(ji,jj+1,1,jp_tem) - zztmp ) * r1_e2v(ji,jj) + ( zztmp - tsn(ji  ,jj-1,1,jp_tem) ) * r1_e2v(ji,jj-1)
240               z2d(ji,jj) = 0.25 * ( zztmpx * zztmpx + zztmpy * zztmpy )   &
241                  &              * umask(ji,jj,1) * umask(ji-1,jj,1) * vmask(ji,jj,1) * umask(ji,jj-1,1)
242            END DO
243         END DO
244         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', 1. )
245         CALL iom_put( "sstgrad2",  z2d )          ! square of module of sst gradient
246         z2d(:,:) = SQRT( z2d(:,:) )
247         CALL iom_put( "sstgrad" ,  z2d )          ! module of sst gradient
248      ENDIF
249         
250      ! heat and salt contents
251      IF( iom_use("heatc") ) THEN
252         z2d(:,:)  = 0._wp 
253         DO jk = 1, jpkm1
254            DO jj = 1, jpj
255               DO ji = 1, jpi
256                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_tem) * tmask(ji,jj,jk)
257               END DO
258            END DO
259         END DO
260         CALL iom_put( "heatc", rau0_rcp * z2d )   ! vertically integrated heat content (J/m2)
261      ENDIF
262
263      IF( iom_use("saltc") ) THEN
264         z2d(:,:)  = 0._wp 
265         DO jk = 1, jpkm1
266            DO jj = 1, jpj
267               DO ji = 1, jpi
268                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal) * tmask(ji,jj,jk)
269               END DO
270            END DO
271         END DO
272         CALL iom_put( "saltc", rau0 * z2d )          ! vertically integrated salt content (PSU*kg/m2)
273      ENDIF
274      !
275      IF ( iom_use("eken") ) THEN
276         z3d(:,:,jpk) = 0._wp 
277         DO jk = 1, jpkm1
278            DO jj = 2, jpjm1
279               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
280                  zztmp  = 0.25_wp * r1_e1e2t(ji,jj) / e3t_n(ji,jj,jk)
281                  z3d(ji,jj,jk) = zztmp * (  un(ji-1,jj,jk)**2 * e2u(ji-1,jj) * e3u_n(ji-1,jj,jk)   &
282                     &                     + un(ji  ,jj,jk)**2 * e2u(ji  ,jj) * e3u_n(ji  ,jj,jk)   &
283                     &                     + vn(ji,jj-1,jk)**2 * e1v(ji,jj-1) * e3v_n(ji,jj-1,jk)   &
284                     &                     + vn(ji,jj  ,jk)**2 * e1v(ji,jj  ) * e3v_n(ji,jj  ,jk)   )
285               END DO
286            END DO
287         END DO
288         CALL lbc_lnk( 'diawri', z3d, 'T', 1. )
289         CALL iom_put( "eken", z3d )                 ! kinetic energy
290      ENDIF
291      !
292      CALL iom_put( "hdiv", hdivn )                  ! Horizontal divergence
293      !
294      IF( iom_use("u_masstr") .OR. iom_use("u_masstr_vint") .OR. iom_use("u_heattr") .OR. iom_use("u_salttr") ) THEN
295         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
296         z2d(:,:) = 0.e0
297         DO jk = 1, jpkm1
298            z3d(:,:,jk) = rau0 * un(:,:,jk) * e2u(:,:) * e3u_n(:,:,jk) * umask(:,:,jk)
299            z2d(:,:) = z2d(:,:) + z3d(:,:,jk)
300         END DO
301         CALL iom_put( "u_masstr"     , z3d )         ! mass transport in i-direction
302         CALL iom_put( "u_masstr_vint", z2d )         ! mass transport in i-direction vertical sum
303      ENDIF
304     
305      IF( iom_use("u_heattr") ) THEN
306         z2d(:,:) = 0._wp 
307         DO jk = 1, jpkm1
308            DO jj = 2, jpjm1
309               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
310                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_tem) )
311               END DO
312            END DO
313         END DO
314         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
315         CALL iom_put( "u_heattr", 0.5*rcp * z2d )    ! heat transport in i-direction
316      ENDIF
317
318      IF( iom_use("u_salttr") ) THEN
319         z2d(:,:) = 0.e0 
320         DO jk = 1, jpkm1
321            DO jj = 2, jpjm1
322               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
323                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji+1,jj,jk,jp_sal) )
324               END DO
325            END DO
326         END DO
327         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'U', -1. )
328         CALL iom_put( "u_salttr", 0.5 * z2d )        ! heat transport in i-direction
329      ENDIF
330
331     
332      IF( iom_use("v_masstr") .OR. iom_use("v_heattr") .OR. iom_use("v_salttr") ) THEN
333         z3d(:,:,jpk) = 0.e0
334         DO jk = 1, jpkm1
335            z3d(:,:,jk) = rau0 * vn(:,:,jk) * e1v(:,:) * e3v_n(:,:,jk) * vmask(:,:,jk)
336         END DO
337         CALL iom_put( "v_masstr", z3d )              ! mass transport in j-direction
338      ENDIF
339     
340      IF( iom_use("v_heattr") ) THEN
341         z2d(:,:) = 0.e0 
342         DO jk = 1, jpkm1
343            DO jj = 2, jpjm1
344               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
345                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_tem) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_tem) )
346               END DO
347            END DO
348         END DO
349         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
350         CALL iom_put( "v_heattr", 0.5*rcp * z2d )    !  heat transport in j-direction
351      ENDIF
352
353      IF( iom_use("v_salttr") ) THEN
354         z2d(:,:) = 0._wp 
355         DO jk = 1, jpkm1
356            DO jj = 2, jpjm1
357               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
358                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + z3d(ji,jj,jk) * ( tsn(ji,jj,jk,jp_sal) + tsn(ji,jj+1,jk,jp_sal) )
359               END DO
360            END DO
361         END DO
362         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'V', -1. )
363         CALL iom_put( "v_salttr", 0.5 * z2d )        !  heat transport in j-direction
364      ENDIF
365
366      IF( iom_use("tosmint") ) THEN
367         z2d(:,:) = 0._wp
368         DO jk = 1, jpkm1
369            DO jj = 2, jpjm1
370               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
371                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) *  tsn(ji,jj,jk,jp_tem)
372               END DO
373            END DO
374         END DO
375         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
376         CALL iom_put( "tosmint", rau0 * z2d )        ! Vertical integral of temperature
377      ENDIF
378      IF( iom_use("somint") ) THEN
379         z2d(:,:)=0._wp
380         DO jk = 1, jpkm1
381            DO jj = 2, jpjm1
382               DO ji = fs_2, fs_jpim1   ! vector opt.
383                  z2d(ji,jj) = z2d(ji,jj) + e3t_n(ji,jj,jk) * tsn(ji,jj,jk,jp_sal)
384               END DO
385            END DO
386         END DO
387         CALL lbc_lnk( 'diawri', z2d, 'T', -1. )
388         CALL iom_put( "somint", rau0 * z2d )         ! Vertical integral of salinity
389      ENDIF
390
391      CALL iom_put( "bn2", rn2 )                      ! Brunt-Vaisala buoyancy frequency (N^2)
392      !
393
394      IF (ln_diatmb)   CALL dia_tmb                   ! tmb values
395         
396      IF (ln_dia25h)   CALL dia_25h( kt )             ! 25h averaging
397
398      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
399      !
400   END SUBROUTINE dia_wri
401
402#else
403   !!----------------------------------------------------------------------
404   !!   Default option                                  use IOIPSL  library
405   !!----------------------------------------------------------------------
406
407   INTEGER FUNCTION dia_wri_alloc()
408      !!----------------------------------------------------------------------
409      INTEGER, DIMENSION(2) :: ierr
410      !!----------------------------------------------------------------------
411      ierr = 0
412      ALLOCATE( ndex_hT(jpi*jpj) , ndex_T(jpi*jpj*jpk) ,     &
413         &      ndex_hU(jpi*jpj) , ndex_U(jpi*jpj*jpk) ,     &
414         &      ndex_hV(jpi*jpj) , ndex_V(jpi*jpj*jpk) , STAT=ierr(1) )
415         !
416      dia_wri_alloc = MAXVAL(ierr)
417      CALL mpp_sum( 'diawri', dia_wri_alloc )
418      !
419   END FUNCTION dia_wri_alloc
420
421   
422   SUBROUTINE dia_wri( kt )
423      !!---------------------------------------------------------------------
424      !!                  ***  ROUTINE dia_wri  ***
425      !!                   
426      !! ** Purpose :   Standard output of opa: dynamics and tracer fields
427      !!      NETCDF format is used by default
428      !!
429      !! ** Method  :   At the beginning of the first time step (nit000),
430      !!      define all the NETCDF files and fields
431      !!      At each time step call histdef to compute the mean if ncessary
432      !!      Each nn_write time step, output the instantaneous or mean fields
433      !!----------------------------------------------------------------------
434      INTEGER, INTENT( in ) ::   kt   ! ocean time-step index
435      !
436      LOGICAL ::   ll_print = .FALSE.                        ! =T print and flush numout
437      CHARACTER (len=40) ::   clhstnam, clop, clmx           ! local names
438      INTEGER  ::   inum = 11                                ! temporary logical unit
439      INTEGER  ::   ji, jj, jk                               ! dummy loop indices
440      INTEGER  ::   ierr                                     ! error code return from allocation
441      INTEGER  ::   iimi, iima, ipk, it, itmod, ijmi, ijma   ! local integers
442      INTEGER  ::   jn, ierror                               ! local integers
443      REAL(wp) ::   zsto, zout, zmax, zjulian                ! local scalars
444      !
445      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj)   :: zw2d       ! 2D workspace
446      REAL(wp), DIMENSION(jpi,jpj,jpk) :: zw3d       ! 3D workspace
447      !!----------------------------------------------------------------------
448      !
449      IF( ninist == 1 ) THEN     !==  Output the initial state and forcings  ==!
450         CALL dia_wri_state( 'output.init' )
451         ninist = 0
452      ENDIF
453      !
454      IF( nn_write == -1 )   RETURN   ! we will never do any output
455      !
456      IF( ln_timing )   CALL timing_start('dia_wri')
457      !
458      ! 0. Initialisation
459      ! -----------------
460
461      ll_print = .FALSE.                  ! local variable for debugging
462      ll_print = ll_print .AND. lwp
463
464      ! Define frequency of output and means
465      clop = "x"         ! no use of the mask value (require less cpu time and otherwise the model crashes)
466#if defined key_diainstant
467      zsto = nn_write * rdt
468      clop = "inst("//TRIM(clop)//")"
469#else
470      zsto=rdt
471      clop = "ave("//TRIM(clop)//")"
472#endif
473      zout = nn_write * rdt
474      zmax = ( nitend - nit000 + 1 ) * rdt
475
476      ! Define indices of the horizontal output zoom and vertical limit storage
477      iimi = 1      ;      iima = jpi
478      ijmi = 1      ;      ijma = jpj
479      ipk = jpk
480
481      ! define time axis
482      it = kt
483      itmod = kt - nit000 + 1
484
485
486      ! 1. Define NETCDF files and fields at beginning of first time step
487      ! -----------------------------------------------------------------
488
489      IF( kt == nit000 ) THEN
490
491         ! Define the NETCDF files (one per grid)
492
493         ! Compute julian date from starting date of the run
494         CALL ymds2ju( nyear, nmonth, nday, rdt, zjulian )
495         zjulian = zjulian - adatrj   !   set calendar origin to the beginning of the experiment
496         IF(lwp)WRITE(numout,*)
497         IF(lwp)WRITE(numout,*) 'Date 0 used :', nit000, ' YEAR ', nyear,   &
498            &                    ' MONTH ', nmonth, ' DAY ', nday, 'Julian day : ', zjulian
499         IF(lwp)WRITE(numout,*) ' indexes of zoom = ', iimi, iima, ijmi, ijma,   &
500                                 ' limit storage in depth = ', ipk
501
502         ! WRITE root name in date.file for use by postpro
503         IF(lwp) THEN
504            CALL dia_nam( clhstnam, nn_write,' ' )
505            CALL ctl_opn( inum, 'date.file', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, numout, lwp, narea )
506            WRITE(inum,*) clhstnam
507            CLOSE(inum)
508         ENDIF
509
510         ! Define the T grid FILE ( nid_T )
511
512         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_T' )
513         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
514         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
515            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
516            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_T, nid_T, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
517         CALL histvert( nid_T, "deptht", "Vertical T levels",      &  ! Vertical grid: gdept
518            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_T, "down" )
519         !                                                            ! Index of ocean points
520         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, tmask, 1, 1., ndex_T , ndim_T  )      ! volume
521         CALL wheneq( jpi*jpj    , tmask, 1, 1., ndex_hT, ndim_hT )      ! surface
522         !
523         IF( ln_icebergs ) THEN
524            !
525            !! allocation cant go in dia_wri_alloc because ln_icebergs is only set after
526            !! that routine is called from nemogcm, so do it here immediately before its needed
527            ALLOCATE( ndex_bT(jpi*jpj*nclasses), STAT=ierror )
528            CALL mpp_sum( 'diawri', ierror )
529            IF( ierror /= 0 ) THEN
530               CALL ctl_stop('dia_wri: failed to allocate iceberg diagnostic array')
531               RETURN
532            ENDIF
533            !
534            !! iceberg vertical coordinate is class number
535            CALL histvert( nid_T, "class", "Iceberg class",      &  ! Vertical grid: class
536               &           "number", nclasses, class_num, nb_T )
537            !
538            !! each class just needs the surface index pattern
539            ndim_bT = 3
540            DO jn = 1,nclasses
541               ndex_bT((jn-1)*jpi*jpj+1:jn*jpi*jpj) = ndex_hT(1:jpi*jpj)
542            ENDDO
543            !
544         ENDIF
545
546         ! Define the U grid FILE ( nid_U )
547
548         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_U' )
549         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam    ! filename
550         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamu, jpj, gphiu,           &  ! Horizontal grid: glamu and gphiu
551            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
552            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_U, nid_U, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
553         CALL histvert( nid_U, "depthu", "Vertical U levels",      &  ! Vertical grid: gdept
554            &           "m", ipk, gdept_1d, nz_U, "down" )
555         !                                                            ! Index of ocean points
556         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, umask, 1, 1., ndex_U , ndim_U  )      ! volume
557         CALL wheneq( jpi*jpj    , umask, 1, 1., ndex_hU, ndim_hU )      ! surface
558
559         ! Define the V grid FILE ( nid_V )
560
561         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_V' )                   ! filename
562         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
563         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamv, jpj, gphiv,           &  ! Horizontal grid: glamv and gphiv
564            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
565            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_V, nid_V, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
566         CALL histvert( nid_V, "depthv", "Vertical V levels",      &  ! Vertical grid : gdept
567            &          "m", ipk, gdept_1d, nz_V, "down" )
568         !                                                            ! Index of ocean points
569         CALL wheneq( jpi*jpj*ipk, vmask, 1, 1., ndex_V , ndim_V  )      ! volume
570         CALL wheneq( jpi*jpj    , vmask, 1, 1., ndex_hV, ndim_hV )      ! surface
571
572         ! Define the W grid FILE ( nid_W )
573
574         CALL dia_nam( clhstnam, nn_write, 'grid_W' )                   ! filename
575         IF(lwp) WRITE(numout,*) " Name of NETCDF file ", clhstnam
576         CALL histbeg( clhstnam, jpi, glamt, jpj, gphit,           &  ! Horizontal grid: glamt and gphit
577            &          iimi, iima-iimi+1, ijmi, ijma-ijmi+1,       &
578            &          nit000-1, zjulian, rdt, nh_W, nid_W, domain_id=nidom, snc4chunks=snc4set )
579         CALL histvert( nid_W, "depthw", "Vertical W levels",      &  ! Vertical grid: gdepw
580            &          "m", ipk, gdepw_1d, nz_W, "down" )
581
582
583         ! Declare all the output fields as NETCDF variables
584
585         !                                                                                      !!! nid_T : 3D
586         CALL histdef( nid_T, "votemper", "Temperature"                        , "C"      ,   &  ! tn
587            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
588         CALL histdef( nid_T, "vosaline", "Salinity"                           , "PSU"    ,   &  ! sn
589            &          jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
590         IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN
591            CALL histdef( nid_T, "vovvle3t", "Level thickness"                    , "m"      ,&  ! e3t_n
592            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
593            CALL histdef( nid_T, "vovvldep", "T point depth"                      , "m"      ,&  ! e3t_n
594            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
595            CALL histdef( nid_T, "vovvldef", "Squared level deformation"          , "%^2"    ,&  ! e3t_n
596            &             jpi, jpj, nh_T, ipk, 1, ipk, nz_T, 32, clop, zsto, zout )
597         ENDIF
598         !                                                                                      !!! nid_T : 2D
599         CALL histdef( nid_T, "sosstsst", "Sea Surface temperature"            , "C"      ,   &  ! sst
600            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
601         CALL histdef( nid_T, "sosaline", "Sea Surface Salinity"               , "PSU"    ,   &  ! sss
602            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
603         CALL histdef( nid_T, "sossheig", "Sea Surface Height"                 , "m"      ,   &  ! ssh
604            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
605         CALL histdef( nid_T, "sowaflup", "Net Upward Water Flux"              , "Kg/m2/s",   &  ! (emp-rnf)
606            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
607         CALL histdef( nid_T, "sorunoff", "River runoffs"                      , "Kg/m2/s",   &  ! runoffs
608            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
609         CALL histdef( nid_T, "sosfldow", "downward salt flux"                 , "PSU/m2/s",  &  ! sfx
610            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
611         IF(  ln_linssh  ) THEN
612            CALL histdef( nid_T, "sosst_cd", "Concentration/Dilution term on temperature"     &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_tem)
613            &                                                                  , "KgC/m2/s",  &  ! sosst_cd
614            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
615            CALL histdef( nid_T, "sosss_cd", "Concentration/Dilution term on salinity"        &  ! emp * tsn(:,:,1,jp_sal)
616            &                                                                  , "KgPSU/m2/s",&  ! sosss_cd
617            &             jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
618         ENDIF
619         CALL histdef( nid_T, "sohefldo", "Net Downward Heat Flux"             , "W/m2"   ,   &  ! qns + qsr
620            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
621         CALL histdef( nid_T, "soshfldo", "Shortwave Radiation"                , "W/m2"   ,   &  ! qsr
622            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
623         CALL histdef( nid_T, "somixhgt", "Turbocline Depth"                   , "m"      ,   &  ! hmld
624            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
625         CALL histdef( nid_T, "somxl010", "Mixed Layer Depth 0.01"             , "m"      ,   &  ! hmlp
626            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
627         CALL histdef( nid_T, "soicecov", "Ice fraction"                       , "[0,1]"  ,   &  ! fr_i
628            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
629         CALL histdef( nid_T, "sowindsp", "wind speed at 10m"                  , "m/s"    ,   &  ! wndm
630            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
631!
632         IF( ln_icebergs ) THEN
633            CALL histdef( nid_T, "calving"             , "calving mass input"                       , "kg/s"   , &
634               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
635            CALL histdef( nid_T, "calving_heat"        , "calving heat flux"                        , "XXXX"   , &
636               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
637            CALL histdef( nid_T, "berg_floating_melt"  , "Melt rate of icebergs + bits"             , "kg/m2/s", &
638               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
639            CALL histdef( nid_T, "berg_stored_ice"     , "Accumulated ice mass by class"            , "kg"     , &
640               &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
641            IF( ln_bergdia ) THEN
642               CALL histdef( nid_T, "berg_melt"           , "Melt rate of icebergs"                    , "kg/m2/s", &
643                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
644               CALL histdef( nid_T, "berg_buoy_melt"      , "Buoyancy component of iceberg melt rate"  , "kg/m2/s", &
645                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
646               CALL histdef( nid_T, "berg_eros_melt"      , "Erosion component of iceberg melt rate"   , "kg/m2/s", &
647                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
648               CALL histdef( nid_T, "berg_conv_melt"      , "Convective component of iceberg melt rate", "kg/m2/s", &
649                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
650               CALL histdef( nid_T, "berg_virtual_area"   , "Virtual coverage by icebergs"             , "m2"     , &
651                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
652               CALL histdef( nid_T, "bits_src"           , "Mass source of bergy bits"                , "kg/m2/s", &
653                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
654               CALL histdef( nid_T, "bits_melt"          , "Melt rate of bergy bits"                  , "kg/m2/s", &
655                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
656               CALL histdef( nid_T, "bits_mass"          , "Bergy bit density field"                  , "kg/m2"  , &
657                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
658               CALL histdef( nid_T, "berg_mass"           , "Iceberg density field"                    , "kg/m2"  , &
659                  &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
660               CALL histdef( nid_T, "berg_real_calving"   , "Calving into iceberg class"               , "kg/s"   , &
661                  &          jpi, jpj, nh_T, nclasses  , 1, nclasses  , nb_T , 32, clop, zsto, zout )
662            ENDIF
663         ENDIF
664
665         IF( ln_ssr ) THEN
666            CALL histdef( nid_T, "sohefldp", "Surface Heat Flux: Damping"         , "W/m2"   ,   &  ! qrp
667               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
668            CALL histdef( nid_T, "sowafldp", "Surface Water Flux: Damping"        , "Kg/m2/s",   &  ! erp
669               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
670            CALL histdef( nid_T, "sosafldp", "Surface salt flux: damping"         , "Kg/m2/s",   &  ! erp * sn
671               &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
672         ENDIF
673       
674         clmx ="l_max(only(x))"    ! max index on a period
675!         CALL histdef( nid_T, "sobowlin", "Bowl Index"                         , "W-point",   &  ! bowl INDEX
676!            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clmx, zsto, zout )
677#if defined key_diahth
678         CALL histdef( nid_T, "sothedep", "Thermocline Depth"                  , "m"      ,   & ! hth
679            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
680         CALL histdef( nid_T, "so20chgt", "Depth of 20C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd20
681            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
682         CALL histdef( nid_T, "so28chgt", "Depth of 28C isotherm"              , "m"      ,   & ! hd28
683            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
684         CALL histdef( nid_T, "sohtc300", "Heat content 300 m"                 , "J/m2"   ,   & ! htc3
685            &          jpi, jpj, nh_T, 1  , 1, 1  , -99 , 32, clop, zsto, zout )
686#endif
687
688         CALL histend( nid_T, snc4chunks=snc4set )
689
690         !                                                                                      !!! nid_U : 3D
691         CALL histdef( nid_U, "vozocrtx", "Zonal Current"                      , "m/s"    ,   &  ! un
692            &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
693         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
694            CALL histdef( nid_U, "sdzocrtx", "Stokes Drift Zonal Current"         , "m/s"    ,   &  ! usd
695               &          jpi, jpj, nh_U, ipk, 1, ipk, nz_U, 32, clop, zsto, zout )
696         ENDIF
697         !                                                                                      !!! nid_U : 2D
698         CALL histdef( nid_U, "sozotaux", "Wind Stress along i-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! utau
699            &          jpi, jpj, nh_U, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
700
701         CALL histend( nid_U, snc4chunks=snc4set )
702
703         !                                                                                      !!! nid_V : 3D
704         CALL histdef( nid_V, "vomecrty", "Meridional Current"                 , "m/s"    ,   &  ! vn
705            &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
706         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
707            CALL histdef( nid_V, "sdmecrty", "Stokes Drift Meridional Current"    , "m/s"    ,   &  ! vsd
708               &          jpi, jpj, nh_V, ipk, 1, ipk, nz_V, 32, clop, zsto, zout )
709         ENDIF
710         !                                                                                      !!! nid_V : 2D
711         CALL histdef( nid_V, "sometauy", "Wind Stress along j-axis"           , "N/m2"   ,   &  ! vtau
712            &          jpi, jpj, nh_V, 1  , 1, 1  , - 99, 32, clop, zsto, zout )
713
714         CALL histend( nid_V, snc4chunks=snc4set )
715
716         !                                                                                      !!! nid_W : 3D
717         CALL histdef( nid_W, "vovecrtz", "Vertical Velocity"                  , "m/s"    ,   &  ! wn
718            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
719         CALL histdef( nid_W, "votkeavt", "Vertical Eddy Diffusivity"          , "m2/s"   ,   &  ! avt
720            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
721         CALL histdef( nid_W, "votkeavm", "Vertical Eddy Viscosity"             , "m2/s"  ,   &  ! avm
722            &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
723
724         IF( ln_zdfddm ) THEN
725            CALL histdef( nid_W,"voddmavs","Salt Vertical Eddy Diffusivity"    , "m2/s"   ,   &  ! avs
726               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
727         ENDIF
728         
729         IF( ln_wave .AND. ln_sdw) THEN
730            CALL histdef( nid_W, "sdvecrtz", "Stokes Drift Vertical Current"   , "m/s"    ,   &  ! wsd
731               &          jpi, jpj, nh_W, ipk, 1, ipk, nz_W, 32, clop, zsto, zout )
732         ENDIF
733         !                                                                                      !!! nid_W : 2D
734         CALL histend( nid_W, snc4chunks=snc4set )
735
736         IF(lwp) WRITE(numout,*)
737         IF(lwp) WRITE(numout,*) 'End of NetCDF Initialization'
738         IF(ll_print) CALL FLUSH(numout )
739
740      ENDIF
741
742      ! 2. Start writing data
743      ! ---------------------
744
745      ! ndex(1) est utilise ssi l'avant dernier argument est different de
746      ! la taille du tableau en sortie. Dans ce cas , l'avant dernier argument
747      ! donne le nombre d'elements, et ndex la liste des indices a sortir
748
749      IF( lwp .AND. MOD( itmod, nn_write ) == 0 ) THEN
750         WRITE(numout,*) 'dia_wri : write model outputs in NetCDF files at ', kt, 'time-step'
751         WRITE(numout,*) '~~~~~~ '
752      ENDIF
753
754      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
755         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! heat content
756         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) * e3t_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! salt content
757         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface heat content
758         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) * e3t_n(:,:,1) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity content
759      ELSE
760         CALL histwrite( nid_T, "votemper", it, tsn(:,:,:,jp_tem) , ndim_T , ndex_T  )   ! temperature
761         CALL histwrite( nid_T, "vosaline", it, tsn(:,:,:,jp_sal) , ndim_T , ndex_T  )   ! salinity
762         CALL histwrite( nid_T, "sosstsst", it, tsn(:,:,1,jp_tem) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface temperature
763         CALL histwrite( nid_T, "sosaline", it, tsn(:,:,1,jp_sal) , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface salinity
764      ENDIF
765      IF( .NOT.ln_linssh ) THEN
766         zw3d(:,:,:) = ( ( e3t_n(:,:,:) - e3t_0(:,:,:) ) / e3t_0(:,:,:) * 100 * tmask(:,:,:) ) ** 2
767         CALL histwrite( nid_T, "vovvle3t", it, e3t_n (:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness
768         CALL histwrite( nid_T, "vovvldep", it, gdept_n(:,:,:) , ndim_T , ndex_T  )   ! t-point depth
769         CALL histwrite( nid_T, "vovvldef", it, zw3d             , ndim_T , ndex_T  )   ! level thickness deformation
770      ENDIF
771      CALL histwrite( nid_T, "sossheig", it, sshn          , ndim_hT, ndex_hT )   ! sea surface height
772      CALL histwrite( nid_T, "sowaflup", it, ( emp-rnf )   , ndim_hT, ndex_hT )   ! upward water flux
773      CALL histwrite( nid_T, "sorunoff", it, rnf           , ndim_hT, ndex_hT )   ! river runoffs
774      CALL histwrite( nid_T, "sosfldow", it, sfx           , ndim_hT, ndex_hT )   ! downward salt flux
775                                                                                  ! (includes virtual salt flux beneath ice
776                                                                                  ! in linear free surface case)
777      IF( ln_linssh ) THEN
778         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_tem)
779         CALL histwrite( nid_T, "sosst_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sst
780         zw2d(:,:) = emp (:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal)
781         CALL histwrite( nid_T, "sosss_cd", it, zw2d, ndim_hT, ndex_hT )          ! c/d term on sss
782      ENDIF
783      CALL histwrite( nid_T, "sohefldo", it, qns + qsr     , ndim_hT, ndex_hT )   ! total heat flux
784      CALL histwrite( nid_T, "soshfldo", it, qsr           , ndim_hT, ndex_hT )   ! solar heat flux
785      CALL histwrite( nid_T, "somixhgt", it, hmld          , ndim_hT, ndex_hT )   ! turbocline depth
786      CALL histwrite( nid_T, "somxl010", it, hmlp          , ndim_hT, ndex_hT )   ! mixed layer depth
787      CALL histwrite( nid_T, "soicecov", it, fr_i          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ice fraction   
788      CALL histwrite( nid_T, "sowindsp", it, wndm          , ndim_hT, ndex_hT )   ! wind speed   
789!
790      IF( ln_icebergs ) THEN
791         !
792         CALL histwrite( nid_T, "calving"             , it, berg_grid%calving      , ndim_hT, ndex_hT ) 
793         CALL histwrite( nid_T, "calving_heat"        , it, berg_grid%calving_hflx , ndim_hT, ndex_hT )         
794         CALL histwrite( nid_T, "berg_floating_melt"  , it, berg_grid%floating_melt, ndim_hT, ndex_hT ) 
795         !
796         CALL histwrite( nid_T, "berg_stored_ice"     , it, berg_grid%stored_ice   , ndim_bT, ndex_bT )
797         !
798         IF( ln_bergdia ) THEN
799            CALL histwrite( nid_T, "berg_melt"           , it, berg_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
800            CALL histwrite( nid_T, "berg_buoy_melt"      , it, buoy_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
801            CALL histwrite( nid_T, "berg_eros_melt"      , it, eros_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
802            CALL histwrite( nid_T, "berg_conv_melt"      , it, conv_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
803            CALL histwrite( nid_T, "berg_virtual_area"   , it, virtual_area     , ndim_hT, ndex_hT   ) 
804            CALL histwrite( nid_T, "bits_src"            , it, bits_src         , ndim_hT, ndex_hT   ) 
805            CALL histwrite( nid_T, "bits_melt"           , it, bits_melt        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
806            CALL histwrite( nid_T, "bits_mass"           , it, bits_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
807            CALL histwrite( nid_T, "berg_mass"           , it, berg_mass        , ndim_hT, ndex_hT   ) 
808            !
809            CALL histwrite( nid_T, "berg_real_calving"   , it, real_calving     , ndim_bT, ndex_bT   )
810         ENDIF
811      ENDIF
812
813      IF( ln_ssr ) THEN
814         CALL histwrite( nid_T, "sohefldp", it, qrp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! heat flux damping
815         CALL histwrite( nid_T, "sowafldp", it, erp           , ndim_hT, ndex_hT )   ! freshwater flux damping
816         zw2d(:,:) = erp(:,:) * tsn(:,:,1,jp_sal) * tmask(:,:,1)
817         CALL histwrite( nid_T, "sosafldp", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! salt flux damping
818      ENDIF
819!      zw2d(:,:) = FLOAT( nmln(:,:) ) * tmask(:,:,1)
820!      CALL histwrite( nid_T, "sobowlin", it, zw2d          , ndim_hT, ndex_hT )   ! ???
821
822#if defined key_diahth
823      CALL histwrite( nid_T, "sothedep", it, hth           , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the thermocline
824      CALL histwrite( nid_T, "so20chgt", it, hd20          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 20 isotherm
825      CALL histwrite( nid_T, "so28chgt", it, hd28          , ndim_hT, ndex_hT )   ! depth of the 28 isotherm
826      CALL histwrite( nid_T, "sohtc300", it, htc3          , ndim_hT, ndex_hT )   ! first 300m heaat content
827#endif
828
829      CALL histwrite( nid_U, "vozocrtx", it, un            , ndim_U , ndex_U )    ! i-current
830      CALL histwrite( nid_U, "sozotaux", it, utau          , ndim_hU, ndex_hU )   ! i-wind stress
831
832      CALL histwrite( nid_V, "vomecrty", it, vn            , ndim_V , ndex_V  )   ! j-current
833      CALL histwrite( nid_V, "sometauy", it, vtau          , ndim_hV, ndex_hV )   ! j-wind stress
834
835      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
836         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn + wi     , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
837      ELSE
838         CALL histwrite( nid_W, "vovecrtz", it, wn          , ndim_T, ndex_T )    ! vert. current
839      ENDIF
840      CALL histwrite( nid_W, "votkeavt", it, avt            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy diff. coef.
841      CALL histwrite( nid_W, "votkeavm", it, avm            , ndim_T, ndex_T )    ! T vert. eddy visc. coef.
842      IF( ln_zdfddm ) THEN
843         CALL histwrite( nid_W, "voddmavs", it, avs         , ndim_T, ndex_T )    ! S vert. eddy diff. coef.
844      ENDIF
845
846      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
847         CALL histwrite( nid_U, "sdzocrtx", it, usd         , ndim_U , ndex_U )    ! i-StokesDrift-current
848         CALL histwrite( nid_V, "sdmecrty", it, vsd         , ndim_V , ndex_V )    ! j-StokesDrift-current
849         CALL histwrite( nid_W, "sdvecrtz", it, wsd         , ndim_T , ndex_T )    ! StokesDrift vert. current
850      ENDIF
851
852      ! 3. Close all files
853      ! ---------------------------------------
854      IF( kt == nitend ) THEN
855         CALL histclo( nid_T )
856         CALL histclo( nid_U )
857         CALL histclo( nid_V )
858         CALL histclo( nid_W )
859      ENDIF
860      !
861      IF( ln_timing )   CALL timing_stop('dia_wri')
862      !
863   END SUBROUTINE dia_wri
864#endif
865
866   SUBROUTINE dia_wri_state( cdfile_name )
867      !!---------------------------------------------------------------------
868      !!                 ***  ROUTINE dia_wri_state  ***
869      !!       
870      !! ** Purpose :   create a NetCDF file named cdfile_name which contains
871      !!      the instantaneous ocean state and forcing fields.
872      !!        Used to find errors in the initial state or save the last
873      !!      ocean state in case of abnormal end of a simulation
874      !!
875      !! ** Method  :   NetCDF files using ioipsl
876      !!      File 'output.init.nc'  is created if ninist = 1 (namelist)
877      !!      File 'output.abort.nc' is created in case of abnormal job end
878      !!----------------------------------------------------------------------
879      CHARACTER (len=* ), INTENT( in ) ::   cdfile_name      ! name of the file created
880      !!
881      INTEGER :: inum
882      !!----------------------------------------------------------------------
883      !
884      IF(lwp) WRITE(numout,*)
885      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'dia_wri_state : single instantaneous ocean state'
886      IF(lwp) WRITE(numout,*) '~~~~~~~~~~~~~   and forcing fields file created '
887      IF(lwp) WRITE(numout,*) '                and named :', cdfile_name, '...nc'
888
889#if defined key_si3
890     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE., kdlev = jpl )
891#else
892     CALL iom_open( TRIM(cdfile_name), inum, ldwrt = .TRUE. )
893#endif
894
895      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'votemper', tsn(:,:,:,jp_tem) )    ! now temperature
896      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vosaline', tsn(:,:,:,jp_sal) )    ! now salinity
897      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sossheig', sshn              )    ! sea surface height
898      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vozocrtx', un                )    ! now i-velocity
899      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vomecrty', vn                )    ! now j-velocity
900      IF( ln_zad_Aimp ) THEN
901         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn + wi        )    ! now k-velocity
902      ELSE
903         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovecrtz', wn             )    ! now k-velocity
904      ENDIF
905      IF( ALLOCATED(ahtu) ) THEN
906         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtu', ahtu              )    ! aht at u-point
907         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahtv', ahtv              )    ! aht at v-point
908      ENDIF
909      IF( ALLOCATED(ahmt) ) THEN
910         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmt', ahmt              )    ! ahmt at u-point
911         CALL iom_rstput( 0, 0, inum,  'ahmf', ahmf              )    ! ahmf at v-point
912      ENDIF
913      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sowaflup', emp - rnf         )    ! freshwater budget
914      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sohefldo', qsr + qns         )    ! total heat flux
915      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soshfldo', qsr               )    ! solar heat flux
916      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'soicecov', fr_i              )    ! ice fraction
917      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sozotaux', utau              )    ! i-wind stress
918      CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sometauy', vtau              )    ! j-wind stress
919      IF(  .NOT.ln_linssh  ) THEN             
920         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvldep', gdept_n        )    !  T-cell depth
921         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'vovvle3t', e3t_n          )    !  T-cell thickness 
922      END IF
923      IF( ln_wave .AND. ln_sdw ) THEN
924         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdzocrtx', usd            )    ! now StokesDrift i-velocity
925         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdmecrty', vsd            )    ! now StokesDrift j-velocity
926         CALL iom_rstput( 0, 0, inum, 'sdvecrtz', wsd            )    ! now StokesDrift k-velocity
927      ENDIF
928 
929#if defined key_si3
930      IF( nn_ice == 2 ) THEN   ! condition needed in case agrif + ice-model but no-ice in child grid
931         CALL ice_wri_state( inum )
932      ENDIF
933#endif
934      !
935      CALL iom_close( inum )
936      !
937   END SUBROUTINE dia_wri_state
938
939   !!======================================================================
940END MODULE diawri
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.