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nemogcm.F90 in branches/2011/dev_UKM0_2011/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC – NEMO

source: branches/2011/dev_UKM0_2011/NEMOGCM/NEMO/OPA_SRC/nemogcm.F90 @ 3291

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ticket #885 adding changes from branches/2011/dev_r2802_UKMO8_cice between r2802 and r3041

  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1MODULE nemogcm
2   !!======================================================================
3   !!                       ***  MODULE nemogcm   ***
4   !! Ocean system   : NEMO GCM (ocean dynamics, on-line tracers, biochemistry and sea-ice)
5   !!======================================================================
6   !! History :  OPA  ! 1990-10  (C. Levy, G. Madec)  Original code
7   !!            7.0  ! 1991-11  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec)
8   !!            7.1  ! 1993-03  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec, O. Marti, M. Guyon, A. Lazar,
9   !!                             P. Delecluse, C. Perigaud, G. Caniaux, B. Colot, C. Maes) release 7.1
10   !!             -   ! 1992-06  (L.Terray)  coupling implementation
11   !!             -   ! 1993-11  (M.A. Filiberti) IGLOO sea-ice
12   !!            8.0  ! 1996-03  (M. Imbard, C. Levy, G. Madec, O. Marti, M. Guyon, A. Lazar,
13   !!                             P. Delecluse, L.Terray, M.A. Filiberti, J. Vialar, A.M. Treguier, M. Levy) release 8.0
14   !!            8.1  ! 1997-06  (M. Imbard, G. Madec)
15   !!            8.2  ! 1999-11  (M. Imbard, H. Goosse)  LIM sea-ice model
16   !!                 ! 1999-12  (V. Thierry, A-M. Treguier, M. Imbard, M-A. Foujols)  OPEN-MP
17   !!                 ! 2000-07  (J-M Molines, M. Imbard)  Open Boundary Conditions  (CLIPPER)
18   !!   NEMO     1.0  ! 2002-08  (G. Madec)  F90: Free form and modules
19   !!             -   ! 2004-06  (R. Redler, NEC CCRLE, Germany) add OASIS[3/4] coupled interfaces
20   !!             -   ! 2004-08  (C. Talandier) New trends organization
21   !!             -   ! 2005-06  (C. Ethe) Add the 1D configuration possibility
22   !!             -   ! 2005-11  (V. Garnier) Surface pressure gradient organization
23   !!             -   ! 2006-03  (L. Debreu, C. Mazauric)  Agrif implementation
24   !!             -   ! 2006-04  (G. Madec, R. Benshila)  Step reorganization
25   !!             -   ! 2007-07  (J. Chanut, A. Sellar) Unstructured open boundaries (BDY)
26   !!            3.2  ! 2009-08  (S. Masson)  open/write in the listing file in mpp
27   !!            3.3  ! 2010-05  (K. Mogensen, A. Weaver, M. Martin, D. Lea) Assimilation interface
28   !!             -   ! 2010-10  (C. Ethe, G. Madec) reorganisation of initialisation phase
29   !!            3.3.1! 2011-01  (A. R. Porter, STFC Daresbury) dynamical allocation
30   !!            3.4  ! 2011-11  (C. Harris) decomposition changes for running with CICE
31   !!----------------------------------------------------------------------
32
33   !!----------------------------------------------------------------------
34   !!   nemo_gcm       : solve ocean dynamics, tracer, biogeochemistry and/or sea-ice
35   !!   nemo_init      : initialization of the NEMO system
36   !!   nemo_ctl       : initialisation of the contol print
37   !!   nemo_closefile : close remaining open files
38   !!   nemo_alloc     : dynamical allocation
39   !!   nemo_partition : calculate MPP domain decomposition
40   !!   factorise      : calculate the factors of the no. of MPI processes
41   !!----------------------------------------------------------------------
42   USE step_oce        ! module used in the ocean time stepping module
43   USE sbc_oce         ! surface boundary condition: ocean
44   USE cla             ! cross land advection               (tra_cla routine)
45   USE domcfg          ! domain configuration               (dom_cfg routine)
46   USE mppini          ! shared/distributed memory setting (mpp_init routine)
47   USE domain          ! domain initialization             (dom_init routine)
48   USE obcini          ! open boundary cond. initialization (obc_ini routine)
49   USE bdyini          ! open boundary cond. initialization (bdy_init routine)
50   USE bdydta          ! open boundary cond. initialization (bdy_dta_init routine)
51   USE bdytides        ! open boundary cond. initialization (tide_init routine)
52   USE istate          ! initial state setting          (istate_init routine)
53   USE ldfdyn          ! lateral viscosity setting      (ldfdyn_init routine)
54   USE ldftra          ! lateral diffusivity setting    (ldftra_init routine)
55   USE zdfini          ! vertical physics setting          (zdf_init routine)
56   USE phycst          ! physical constant                  (par_cst routine)
57   USE trdmod          ! momentum/tracers trends       (trd_mod_init routine)
58   USE asminc          ! assimilation increments       (asm_inc_init routine)
59   USE asmtrj          ! writing out state trajectory
60   USE sshwzv          ! vertical velocity used in asm
61   USE diaptr          ! poleward transports           (dia_ptr_init routine)
62   USE diaobs          ! Observation diagnostics       (dia_obs_init routine)
63   USE step            ! NEMO time-stepping                 (stp     routine)
64#if defined key_oasis3
65   USE cpl_oasis3      ! OASIS3 coupling
66#elif defined key_oasis4
67   USE cpl_oasis4      ! OASIS4 coupling (not working)
68#endif
69   USE c1d             ! 1D configuration
70   USE step_c1d        ! Time stepping loop for the 1D configuration
71#if defined key_top
72   USE trcini          ! passive tracer initialisation
73#endif
74   USE lib_mpp         ! distributed memory computing
75#if defined key_iomput
76   USE mod_ioclient
77#endif
78
79   IMPLICIT NONE
80   PRIVATE
81
82   PUBLIC   nemo_gcm    ! called by model.F90
83   PUBLIC   nemo_init   ! needed by AGRIF
84
85   CHARACTER(lc) ::   cform_aaa="( /, 'AAAAAAAA', / ) "     ! flag for output listing
86
87   !!----------------------------------------------------------------------
88   !! NEMO/OPA 4.0 , NEMO Consortium (2011)
89   !! $Id$
90   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
91   !!----------------------------------------------------------------------
92CONTAINS
93
94   SUBROUTINE nemo_gcm
95      !!----------------------------------------------------------------------
96      !!                     ***  ROUTINE nemo_gcm  ***
97      !!
98      !! ** Purpose :   NEMO solves the primitive equations on an orthogonal
99      !!              curvilinear mesh on the sphere.
100      !!
101      !! ** Method  : - model general initialization
102      !!              - launch the time-stepping (stp routine)
103      !!              - finalize the run by closing files and communications
104      !!
105      !! References : Madec, Delecluse, Imbard, and Levy, 1997:  internal report, IPSL.
106      !!              Madec, 2008, internal report, IPSL.
107      !!----------------------------------------------------------------------
108      INTEGER ::   istp       ! time step index
109      !!----------------------------------------------------------------------
110      !
111#if defined key_agrif
112      CALL Agrif_Init_Grids()      ! AGRIF: set the meshes
113#endif
114
115      !                            !-----------------------!
116      CALL nemo_init               !==  Initialisations  ==!
117      !                            !-----------------------!
118#if defined key_agrif
119      CALL Agrif_Declare_Var       ! AGRIF: set the meshes
120# if defined key_top
121      CALL Agrif_Declare_Var_Top   ! AGRIF: set the meshes
122# endif
123#endif
124      ! check that all process are still there... If some process have an error,
125      ! they will never enter in step and other processes will wait until the end of the cpu time!
126      IF( lk_mpp )   CALL mpp_max( nstop )
127
128      IF(lwp) WRITE(numout,cform_aaa)   ! Flag AAAAAAA
129
130      !                            !-----------------------!
131      !                            !==   time stepping   ==!
132      !                            !-----------------------!
133      istp = nit000
134#if defined key_c1d
135         DO WHILE ( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )
136            CALL stp_c1d( istp )
137            istp = istp + 1
138         END DO
139#else
140          IF( lk_asminc ) THEN
141             IF( ln_bkgwri ) CALL asm_bkg_wri( nit000 - 1 )    ! Output background fields
142             IF( ln_trjwri ) CALL asm_trj_wri( nit000 - 1 )    ! Output trajectory fields
143             IF( ln_asmdin ) THEN                        ! Direct initialization
144                IF( ln_trainc ) CALL tra_asm_inc( nit000 - 1 )    ! Tracers
145                IF( ln_dyninc ) THEN
146                   CALL dyn_asm_inc( nit000 - 1 )    ! Dynamics
147                   IF ( ln_asmdin ) CALL ssh_wzv ( nit000 - 1 )      ! update vertical velocity
148                ENDIF
149                IF( ln_sshinc ) CALL ssh_asm_inc( nit000 - 1 )    ! SSH
150             ENDIF
151          ENDIF
152       
153         DO WHILE ( istp <= nitend .AND. nstop == 0 )
154#if defined key_agrif
155            CALL Agrif_Step( stp )           ! AGRIF: time stepping
156#else
157            CALL stp( istp )                 ! standard time stepping
158#endif
159            istp = istp + 1
160            IF( lk_mpp )   CALL mpp_max( nstop )
161         END DO
162#endif
163
164      IF( lk_diaobs ) CALL dia_obs_wri
165       
166      !                            !------------------------!
167      !                            !==  finalize the run  ==!
168      !                            !------------------------!
169      IF(lwp) WRITE(numout,cform_aaa)   ! Flag AAAAAAA
170      !
171      IF( nstop /= 0 .AND. lwp ) THEN   ! error print
172         WRITE(numout,cform_err)
173         WRITE(numout,*) nstop, ' error have been found' 
174      ENDIF
175      !
176      CALL nemo_closefile
177#if defined key_oasis3 || defined key_oasis4
178      CALL cpl_prism_finalize           ! end coupling and mpp communications with OASIS
179#else
180      IF( lk_mpp )   CALL mppstop       ! end mpp communications
181#endif
182      !
183   END SUBROUTINE nemo_gcm
184
185
186   SUBROUTINE nemo_init
187      !!----------------------------------------------------------------------
188      !!                     ***  ROUTINE nemo_init  ***
189      !!
190      !! ** Purpose :   initialization of the NEMO GCM
191      !!----------------------------------------------------------------------
192      INTEGER ::   ji            ! dummy loop indices
193      INTEGER ::   ilocal_comm   ! local integer
194      CHARACTER(len=80), DIMENSION(16) ::   cltxt
195      !!
196      NAMELIST/namctl/ ln_ctl  , nn_print, nn_ictls, nn_ictle,   &
197         &             nn_isplt, nn_jsplt, nn_jctls, nn_jctle, nn_bench
198      !!----------------------------------------------------------------------
199      !
200      cltxt = ''
201      !
202      !                             ! open Namelist file
203      CALL ctl_opn( numnam, 'namelist', 'OLD', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, 6, .FALSE. )
204      !
205      READ( numnam, namctl )        ! Namelist namctl : Control prints & Benchmark
206      !
207      !                             !--------------------------------------------!
208      !                             !  set communicator & select the local node  !
209      !                             !--------------------------------------------!
210#if defined key_iomput
211      IF( Agrif_Root() ) THEN
212# if defined key_oasis3 || defined key_oasis4
213         CALL cpl_prism_init( ilocal_comm )                 ! nemo local communicator given by oasis
214# endif
215         CALL  init_ioclient( ilocal_comm )                 ! exchange io_server nemo local communicator with the io_server
216      ENDIF
217      narea = mynode( cltxt, numnam, nstop, ilocal_comm )   ! Nodes selection
218#else
219# if defined key_oasis3 || defined key_oasis4
220      IF( Agrif_Root() ) THEN
221         CALL cpl_prism_init( ilocal_comm )                 ! nemo local communicator given by oasis
222      ENDIF
223      narea = mynode( cltxt, numnam, nstop, ilocal_comm )   ! Nodes selection (control print return in cltxt)
224# else
225      ilocal_comm = 0
226      narea = mynode( cltxt, numnam, nstop )                 ! Nodes selection (control print return in cltxt)
227# endif
228#endif
229      narea = narea + 1                                     ! mynode return the rank of proc (0 --> jpnij -1 )
230
231      lwp = (narea == 1) .OR. ln_ctl                        ! control of all listing output print
232
233      ! If dimensions of processor grid weren't specified in the namelist file
234      ! then we calculate them here now that we have our communicator size
235      IF( (jpni < 1) .OR. (jpnj < 1) )THEN
236#if   defined key_mpp_mpi
237         IF( Agrif_Root() ) CALL nemo_partition(mppsize)
238#else
239         jpni  = 1
240         jpnj  = 1
241         jpnij = jpni*jpnj
242#endif
243      END IF
244
245      ! Calculate domain dimensions given calculated jpni and jpnj
246      ! This used to be done in par_oce.F90 when they were parameters rather
247      ! than variables
248      IF( Agrif_Root() ) THEN
249         jpi = ( jpiglo-2*jpreci + (jpni-1) ) / jpni + 2*jpreci   ! first  dim.
250#if defined key_nemocice_decomp
251         jpj = ( jpjglo+1-2*jprecj + (jpnj-1) ) / jpnj + 2*jprecj ! second dim.
252#else
253         jpj = ( jpjglo-2*jprecj + (jpnj-1) ) / jpnj + 2*jprecj   ! second dim.
254#endif
255         jpk = jpkdta                                             ! third dim
256         jpim1 = jpi-1                                            ! inner domain indices
257         jpjm1 = jpj-1                                            !   "           "
258         jpkm1 = jpk-1                                            !   "           "
259         jpij  = jpi*jpj                                          !  jpi x j
260      ENDIF
261
262      IF(lwp) THEN                            ! open listing units
263         !
264         CALL ctl_opn( numout, 'ocean.output', 'REPLACE', 'FORMATTED', 'SEQUENTIAL', -1, 6, .FALSE., narea )
265         !
266         WRITE(numout,*)
267         WRITE(numout,*) '         CNRS - NERC - Met OFFICE - MERCATOR-ocean'
268         WRITE(numout,*) '                       NEMO team'
269         WRITE(numout,*) '            Ocean General Circulation Model'
270         WRITE(numout,*) '                  version 3.3  (2010) '
271         WRITE(numout,*)
272         WRITE(numout,*)
273         DO ji = 1, SIZE(cltxt) 
274            IF( TRIM(cltxt(ji)) /= '' )   WRITE(numout,*) cltxt(ji)      ! control print of mynode
275         END DO
276         WRITE(numout,cform_aaa)                                         ! Flag AAAAAAA
277         !
278      ENDIF
279
280      ! Now we know the dimensions of the grid and numout has been set we can
281      ! allocate arrays
282      CALL nemo_alloc()
283
284      !                             !-------------------------------!
285      !                             !  NEMO general initialization  !
286      !                             !-------------------------------!
287
288      CALL nemo_ctl                          ! Control prints & Benchmark
289
290      !                                      ! Domain decomposition
291      IF( jpni*jpnj == jpnij ) THEN   ;   CALL mpp_init      ! standard cutting out
292      ELSE                            ;   CALL mpp_init2     ! eliminate land processors
293      ENDIF
294      !
295      !                                      ! General initialization
296                            CALL     phy_cst    ! Physical constants
297                            CALL     eos_init   ! Equation of state
298                            CALL     dom_cfg    ! Domain configuration
299                            CALL     dom_init   ! Domain
300
301      IF( ln_ctl        )   CALL prt_ctl_init   ! Print control
302
303      IF( lk_obc        )   CALL     obc_init   ! Open boundaries
304      IF( lk_bdy        )   CALL     bdy_init       ! Open boundaries initialisation
305      IF( lk_bdy        )   CALL     bdy_dta_init   ! Open boundaries initialisation of external data arrays
306      IF( lk_bdy        )   CALL     tide_init      ! Open boundaries initialisation of tidal harmonic forcing
307
308                            CALL  istate_init   ! ocean initial state (Dynamics and tracers)
309
310      !                                     ! Ocean physics
311                            CALL     sbc_init   ! Forcings : surface module
312      !                                         ! Vertical physics
313                            CALL     zdf_init      ! namelist read
314                            CALL zdf_bfr_init      ! bottom friction
315      IF( lk_zdfric     )   CALL zdf_ric_init      ! Richardson number dependent Kz
316      IF( lk_zdftke     )   CALL zdf_tke_init      ! TKE closure scheme
317      IF( lk_zdfgls     )   CALL zdf_gls_init      ! GLS closure scheme
318      IF( lk_zdfkpp     )   CALL zdf_kpp_init      ! KPP closure scheme
319      IF( lk_zdftmx     )   CALL zdf_tmx_init      ! tidal vertical mixing
320      IF( lk_zdfddm .AND. .NOT. lk_zdfkpp )   & 
321         &                  CALL zdf_ddm_init      ! double diffusive mixing
322      !                                         ! Lateral physics
323                            CALL ldf_tra_init      ! Lateral ocean tracer physics
324                            CALL ldf_dyn_init      ! Lateral ocean momentum physics
325      IF( lk_ldfslp     )   CALL ldf_slp_init      ! slope of lateral mixing
326
327      !                                     ! Active tracers
328                            CALL tra_qsr_init   ! penetrative solar radiation qsr
329                            CALL tra_bbc_init   ! bottom heat flux
330      IF( lk_trabbl     )   CALL tra_bbl_init   ! advective (and/or diffusive) bottom boundary layer scheme
331      IF( lk_tradmp     )   CALL tra_dmp_init   ! internal damping trends
332                            CALL tra_adv_init   ! horizontal & vertical advection
333                            CALL tra_ldf_init   ! lateral mixing
334                            CALL tra_zdf_init   ! vertical mixing and after tracer fields
335
336      !                                     ! Dynamics
337                            CALL dyn_adv_init   ! advection (vector or flux form)
338                            CALL dyn_vor_init   ! vorticity term including Coriolis
339                            CALL dyn_ldf_init   ! lateral mixing
340                            CALL dyn_hpg_init   ! horizontal gradient of Hydrostatic pressure
341                            CALL dyn_zdf_init   ! vertical diffusion
342                            CALL dyn_spg_init   ! surface pressure gradient
343                           
344      !                                     ! Misc. options
345      IF( nn_cla == 1   )   CALL cla_init       ! Cross Land Advection
346     
347#if defined key_top
348      !                                     ! Passive tracers
349                            CALL     trc_init
350#endif
351      !                                     ! Diagnostics
352                            CALL     iom_init   ! iom_put initialization
353      IF( lk_floats     )   CALL     flo_init   ! drifting Floats
354      IF( lk_diaar5     )   CALL dia_ar5_init   ! ar5 diag
355                            CALL dia_ptr_init   ! Poleward TRansports initialization
356                            CALL dia_hsb_init   ! heat content, salt content and volume budgets
357                            CALL trd_mod_init   ! Mixed-layer/Vorticity/Integral constraints trends
358      IF( lk_diaobs     ) THEN                  ! Observation & model comparison
359                            CALL dia_obs_init            ! Initialize observational data
360                            CALL dia_obs( nit000 - 1 )   ! Observation operator for restart
361      ENDIF     
362      !                                     ! Assimilation increments
363      IF( lk_asminc     )   CALL asm_inc_init   ! Initialize assimilation increments
364      IF(lwp) WRITE(numout,*) 'Euler time step switch is ', neuler
365      !
366   END SUBROUTINE nemo_init
367
368
369   SUBROUTINE nemo_ctl
370      !!----------------------------------------------------------------------
371      !!                     ***  ROUTINE nemo_ctl  ***
372      !!
373      !! ** Purpose :   control print setting
374      !!
375      !! ** Method  : - print namctl information and check some consistencies
376      !!----------------------------------------------------------------------
377      !
378      IF(lwp) THEN                  ! control print
379         WRITE(numout,*)
380         WRITE(numout,*) 'nemo_ctl: Control prints & Benchmark'
381         WRITE(numout,*) '~~~~~~~ '
382         WRITE(numout,*) '   Namelist namctl'
383         WRITE(numout,*) '      run control (for debugging)     ln_ctl     = ', ln_ctl
384         WRITE(numout,*) '      level of print                  nn_print   = ', nn_print
385         WRITE(numout,*) '      Start i indice for SUM control  nn_ictls   = ', nn_ictls
386         WRITE(numout,*) '      End i indice for SUM control    nn_ictle   = ', nn_ictle
387         WRITE(numout,*) '      Start j indice for SUM control  nn_jctls   = ', nn_jctls
388         WRITE(numout,*) '      End j indice for SUM control    nn_jctle   = ', nn_jctle
389         WRITE(numout,*) '      number of proc. following i     nn_isplt   = ', nn_isplt
390         WRITE(numout,*) '      number of proc. following j     nn_jsplt   = ', nn_jsplt
391         WRITE(numout,*) '      benchmark parameter (0/1)       nn_bench   = ', nn_bench
392      ENDIF
393      !
394      nprint    = nn_print          ! convert DOCTOR namelist names into OLD names
395      nictls    = nn_ictls
396      nictle    = nn_ictle
397      njctls    = nn_jctls
398      njctle    = nn_jctle
399      isplt     = nn_isplt
400      jsplt     = nn_jsplt
401      nbench    = nn_bench
402      !                             ! Parameter control
403      !
404      IF( ln_ctl ) THEN                 ! sub-domain area indices for the control prints
405         IF( lk_mpp ) THEN
406            isplt = jpni   ;   jsplt = jpnj   ;   ijsplt = jpni*jpnj   ! the domain is forced to the real split domain
407         ELSE
408            IF( isplt == 1 .AND. jsplt == 1  ) THEN
409               CALL ctl_warn( ' - isplt & jsplt are equal to 1',   &
410                  &           ' - the print control will be done over the whole domain' )
411            ENDIF
412            ijsplt = isplt * jsplt            ! total number of processors ijsplt
413         ENDIF
414         IF(lwp) WRITE(numout,*)'          - The total number of processors over which the'
415         IF(lwp) WRITE(numout,*)'            print control will be done is ijsplt : ', ijsplt
416         !
417         !                              ! indices used for the SUM control
418         IF( nictls+nictle+njctls+njctle == 0 )   THEN    ! print control done over the default area
419            lsp_area = .FALSE.                       
420         ELSE                                             ! print control done over a specific  area
421            lsp_area = .TRUE.
422            IF( nictls < 1 .OR. nictls > jpiglo )   THEN
423               CALL ctl_warn( '          - nictls must be 1<=nictls>=jpiglo, it is forced to 1' )
424               nictls = 1
425            ENDIF
426            IF( nictle < 1 .OR. nictle > jpiglo )   THEN
427               CALL ctl_warn( '          - nictle must be 1<=nictle>=jpiglo, it is forced to jpiglo' )
428               nictle = jpiglo
429            ENDIF
430            IF( njctls < 1 .OR. njctls > jpjglo )   THEN
431               CALL ctl_warn( '          - njctls must be 1<=njctls>=jpjglo, it is forced to 1' )
432               njctls = 1
433            ENDIF
434            IF( njctle < 1 .OR. njctle > jpjglo )   THEN
435               CALL ctl_warn( '          - njctle must be 1<=njctle>=jpjglo, it is forced to jpjglo' )
436               njctle = jpjglo
437            ENDIF
438         ENDIF
439      ENDIF
440      !
441      IF( nbench == 1 ) THEN              ! Benchmark
442         SELECT CASE ( cp_cfg )
443         CASE ( 'gyre' )   ;   CALL ctl_warn( ' The Benchmark is activated ' )
444         CASE DEFAULT      ;   CALL ctl_stop( ' The Benchmark is based on the GYRE configuration:',   &
445            &                                 ' key_gyre must be used or set nbench = 0' )
446         END SELECT
447      ENDIF
448      !
449      IF( lk_c1d .AND. .NOT.lk_iomput )   CALL ctl_stop( 'nemo_ctl: The 1D configuration must be used ',   &
450         &                                               'with the IOM Input/Output manager. '         ,   &
451         &                                               'Compile with key_iomput enabled' )
452      !
453   END SUBROUTINE nemo_ctl
454
455
456   SUBROUTINE nemo_closefile
457      !!----------------------------------------------------------------------
458      !!                     ***  ROUTINE nemo_closefile  ***
459      !!
460      !! ** Purpose :   Close the files
461      !!----------------------------------------------------------------------
462      !
463      IF( lk_mpp )   CALL mppsync
464      !
465      CALL iom_close                                 ! close all input/output files managed by iom_*
466      !
467      IF( numstp     /= -1 )   CLOSE( numstp     )   ! time-step file
468      IF( numsol     /= -1 )   CLOSE( numsol     )   ! solver file
469      IF( numnam     /= -1 )   CLOSE( numnam     )   ! oce namelist
470      IF( numnam_ice /= -1 )   CLOSE( numnam_ice )   ! ice namelist
471      IF( numevo_ice /= -1 )   CLOSE( numevo_ice )   ! ice variables (temp. evolution)
472      IF( numout     /=  6 )   CLOSE( numout     )   ! standard model output file
473      !
474      numout = 6                                     ! redefine numout in case it is used after this point...
475      !
476   END SUBROUTINE nemo_closefile
477
478
479   SUBROUTINE nemo_alloc
480      !!----------------------------------------------------------------------
481      !!                     ***  ROUTINE nemo_alloc  ***
482      !!
483      !! ** Purpose :   Allocate all the dynamic arrays of the OPA modules
484      !!
485      !! ** Method  :
486      !!----------------------------------------------------------------------
487      USE diawri    , ONLY: dia_wri_alloc
488      USE dom_oce   , ONLY: dom_oce_alloc
489      USE ldfdyn_oce, ONLY: ldfdyn_oce_alloc
490      USE ldftra_oce, ONLY: ldftra_oce_alloc
491      USE trc_oce   , ONLY: trc_oce_alloc
492      USE wrk_nemo  , ONLY: wrk_alloc
493      !
494      INTEGER :: ierr
495      !!----------------------------------------------------------------------
496      !
497      ierr =        oce_alloc       ()          ! ocean
498      ierr = ierr + dia_wri_alloc   ()
499      ierr = ierr + dom_oce_alloc   ()          ! ocean domain
500      ierr = ierr + ldfdyn_oce_alloc()          ! ocean lateral  physics : dynamics
501      ierr = ierr + ldftra_oce_alloc()          ! ocean lateral  physics : tracers
502      ierr = ierr + zdf_oce_alloc   ()          ! ocean vertical physics
503      !
504      ierr = ierr + lib_mpp_alloc   (numout)    ! mpp exchanges
505      ierr = ierr + trc_oce_alloc   ()          ! shared TRC / TRA arrays
506      !
507      ierr = ierr + wrk_alloc(numout, lwp)      ! workspace
508      !
509      IF( lk_mpp    )   CALL mpp_sum( ierr )
510      IF( ierr /= 0 )   CALL ctl_stop( 'STOP', 'nemo_alloc : unable to allocate standard ocean arrays' )
511      !
512   END SUBROUTINE nemo_alloc
513
514
515   SUBROUTINE nemo_partition( num_pes )
516      !!----------------------------------------------------------------------
517      !!                 ***  ROUTINE nemo_partition  ***
518      !!
519      !! ** Purpose :   
520      !!
521      !! ** Method  :
522      !!----------------------------------------------------------------------
523      INTEGER, INTENT(in) :: num_pes ! The number of MPI processes we have
524      !
525      INTEGER, PARAMETER :: nfactmax = 20
526      INTEGER :: nfact ! The no. of factors returned
527      INTEGER :: ierr  ! Error flag
528      INTEGER :: ji
529      INTEGER :: idiff, mindiff, imin ! For choosing pair of factors that are closest in value
530      INTEGER, DIMENSION(nfactmax) :: ifact ! Array of factors
531      !!----------------------------------------------------------------------
532
533      ierr = 0
534
535      CALL factorise( ifact, nfactmax, nfact, num_pes, ierr )
536
537      IF( nfact <= 1 ) THEN
538         WRITE (numout, *) 'WARNING: factorisation of number of PEs failed'
539         WRITE (numout, *) '       : using grid of ',num_pes,' x 1'
540         jpnj = 1
541         jpni = num_pes
542      ELSE
543         ! Search through factors for the pair that are closest in value
544         mindiff = 1000000
545         imin    = 1
546         DO ji = 1, nfact-1, 2
547            idiff = ABS( ifact(ji) - ifact(ji+1) )
548            IF( idiff < mindiff ) THEN
549               mindiff = idiff
550               imin = ji
551            ENDIF
552         END DO
553         jpnj = ifact(imin)
554         jpni = ifact(imin + 1)
555      ENDIF
556      !
557      jpnij = jpni*jpnj
558      !
559   END SUBROUTINE nemo_partition
560
561
562   SUBROUTINE factorise( kfax, kmaxfax, knfax, kn, kerr )
563      !!----------------------------------------------------------------------
564      !!                     ***  ROUTINE factorise  ***
565      !!
566      !! ** Purpose :   return the prime factors of n.
567      !!                knfax factors are returned in array kfax which is of
568      !!                maximum dimension kmaxfax.
569      !! ** Method  :
570      !!----------------------------------------------------------------------
571      INTEGER                    , INTENT(in   ) ::   kn, kmaxfax
572      INTEGER                    , INTENT(  out) ::   kerr, knfax
573      INTEGER, DIMENSION(kmaxfax), INTENT(  out) ::   kfax
574      !
575      INTEGER :: ifac, jl, inu
576      INTEGER, PARAMETER :: ntest = 14
577      INTEGER :: ilfax(ntest)
578
579      ! lfax contains the set of allowed factors.
580      data (ilfax(jl),jl=1,ntest) / 16384, 8192, 4096, 2048, 1024, 512, 256,  &
581         &                            128,   64,   32,   16,    8,   4,   2  /
582      !!----------------------------------------------------------------------
583
584      ! Clear the error flag and initialise output vars
585      kerr = 0
586      kfax = 1
587      knfax = 0
588
589      ! Find the factors of n.
590      IF( kn == 1 )   GOTO 20
591
592      ! nu holds the unfactorised part of the number.
593      ! knfax holds the number of factors found.
594      ! l points to the allowed factor list.
595      ! ifac holds the current factor.
596
597      inu   = kn
598      knfax = 0
599
600      DO jl = ntest, 1, -1
601         !
602         ifac = ilfax(jl)
603         IF( ifac > inu )   CYCLE
604
605         ! Test whether the factor will divide.
606
607         IF( MOD(inu,ifac) == 0 ) THEN
608            !
609            knfax = knfax + 1            ! Add the factor to the list
610            IF( knfax > kmaxfax ) THEN
611               kerr = 6
612               write (*,*) 'FACTOR: insufficient space in factor array ', knfax
613               return
614            ENDIF
615            kfax(knfax) = ifac
616            ! Store the other factor that goes with this one
617            knfax = knfax + 1
618            kfax(knfax) = inu / ifac
619            !WRITE (*,*) 'ARPDBG, factors ',knfax-1,' & ',knfax,' are ', kfax(knfax-1),' and ',kfax(knfax)
620         ENDIF
621         !
622      END DO
623
624   20 CONTINUE      ! Label 20 is the exit point from the factor search loop.
625      !
626   END SUBROUTINE factorise
627
628   !!======================================================================
629END MODULE nemogcm
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.