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sms_pisces.F90 in branches/2012/dev_r3438_LOCEAN15_PISLOB/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES – NEMO

source: branches/2012/dev_r3438_LOCEAN15_PISLOB/NEMOGCM/NEMO/TOP_SRC/PISCES/sms_pisces.F90 @ 3461

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branch:2012/dev_r3438_LOCEAN15_PISLOB : 2nd step new PISCES updates from Olivier, see ticket #972
  • Property svn:keywords set to Id
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Line 
1MODULE sms_pisces   
2   !!----------------------------------------------------------------------
3   !!                     ***  sms_pisces.F90  *** 
4   !! TOP :   PISCES Source Minus Sink variables
5   !!----------------------------------------------------------------------
6   !! History :   1.0  !  2000-02 (O. Aumont) original code
7   !!             3.2  !  2009-04 (C. Ethe & NEMO team) style
8   !!----------------------------------------------------------------------
9#if defined key_pisces || defined key_pisces_reduced 
10   !!----------------------------------------------------------------------
11   !!   'key_pisces'                                         PISCES model
12   !!----------------------------------------------------------------------
13   USE par_oce
14   USE par_trc
15
16   IMPLICIT NONE
17   PUBLIC
18
19   INTEGER ::   numnatp
20
21   !!*  Biological fluxes for light : variables shared by pisces & lobster
22   INTEGER , ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::  neln  !: number of T-levels + 1 in the euphotic layer
23   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::  heup  !: euphotic layer depth
24   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::  etot  !: par (photosynthetic available radiation)
25   !
26   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:)   ::  xksi  !:  LOBSTER : zooplakton closure
27   !                                                       !:  PISCES  : silicon dependant half saturation
28
29#if defined key_pisces 
30   !!*  Time variables
31   INTEGER  ::   nrdttrc           !: ???
32   INTEGER  ::   ndayflxtr         !: ???
33   REAL(wp) ::   rfact , rfactr    !: ???
34   REAL(wp) ::   rfact2, rfact2r   !: ???
35   REAL(wp) ::   xstep             !: Time step duration for biology
36
37   !!*  Biological parameters
38   INTEGER  ::   niter1max, niter2max   !: Maximum number of iterations for sinking
39   REAL(wp) ::   rno3              !: ???
40   REAL(wp) ::   o2ut              !: ???
41   REAL(wp) ::   po4r              !: ???
42   REAL(wp) ::   rdenit            !: ???
43   REAL(wp) ::   rdenita           !: ???
44   REAL(wp) ::   o2nit             !: ???
45   REAL(wp) ::   wsbio, wsbio2     !: ???
46   REAL(wp) ::   xkmort            !: ???
47   REAL(wp) ::   ferat3            !: ???
48
49   !!* Damping
50   LOGICAL  ::   ln_pisdmp         !: relaxation or not of nutrients to a mean value
51   INTEGER  ::   nn_pisdmp         !: frequency of relaxation or not of nutrients to a mean value
52   LOGICAL  ::   ln_pisclo         !: Restoring or not of nutrients to initial value
53                                   !: on close seas
54
55   !!*  Biological fluxes for primary production
56   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE,   DIMENSION(:,:)  ::   xksimax    !: ???
57   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xnanono3   !: ???
58   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xdiatno3   !: ???
59   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xnanonh4   !: ???
60   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xdiatnh4   !: ???
61   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xlimphy    !: ???
62   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xlimdia    !: ???
63   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   concdfe    !: ???
64   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   concnfe    !: ???
65   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xlimnfe    !: ???
66   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xlimdfe    !: ???
67   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   xlimsi     !: ???
68   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:)  ::   biron      !: bioavailable fraction of iron
69
70
71   !!*  SMS for the organic matter
72   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   xfracal    !: ??
73   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   nitrfac    !: ??
74   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   xlimbac    !: ??
75   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   xlimbacl   !: ??
76   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   xdiss      !: ??
77   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   prodcal    !: Calcite production
78
79   !!* Variable for chemistry of the CO2 cycle
80   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   akb3       !: ???
81   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   ak13       !: ???
82   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   ak23       !: ???
83   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   aksp       !: ???
84   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   akw3       !: ???
85   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   borat      !: ???
86   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   hi         !: ???
87   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   excess     !: ???
88
89   !!* Temperature dependancy of SMS terms
90   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   tgfunc    !: Temp. dependancy of various biological rates
91   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   tgfunc2   !: Temp. dependancy of mesozooplankton rates
92
93   !!* Array used to indicate negative tracer values
94   REAL(wp), ALLOCATABLE, SAVE, DIMENSION(:,:,:) ::   xnegtr     !: ???
95
96#if defined key_kriest
97   !!*  Kriest parameter for aggregation
98   REAL(wp) ::   xkr_eta                            !: ???
99   REAL(wp) ::   xkr_zeta                           !: ???
100   REAL(wp) ::   xkr_massp                          !: ???
101   REAL(wp) ::   xkr_mass_min, xkr_mass_max         !: ???
102#endif
103
104#endif
105   !!----------------------------------------------------------------------
106   !! NEMO/TOP 3.3 , NEMO Consortium (2010)
107   !! $Id$
108   !! Software governed by the CeCILL licence     (NEMOGCM/NEMO_CeCILL.txt)
109   !!----------------------------------------------------------------------
110CONTAINS
111
112   INTEGER FUNCTION sms_pisces_alloc()
113      !!----------------------------------------------------------------------
114      !!        *** ROUTINE sms_pisces_alloc ***
115      !!----------------------------------------------------------------------
116      USE lib_mpp , ONLY: ctl_warn
117      INTEGER ::   ierr(6)        ! Local variables
118      !!----------------------------------------------------------------------
119      ierr(:) = 0
120      !*  Biological fluxes for light : shared variables for pisces & lobster
121      ALLOCATE( etot(jpi,jpj,jpk), neln(jpi,jpj), heup(jpi,jpj), xksi(jpi,jpj), STAT=ierr(1) )
122      !
123#if defined key_pisces
124      !*  Biological fluxes for primary production
125      ALLOCATE( xksimax(jpi,jpj)     , biron   (jpi,jpj,jpk),       &
126         &      xnanono3(jpi,jpj,jpk), xdiatno3(jpi,jpj,jpk),       &
127         &      xnanonh4(jpi,jpj,jpk), xdiatnh4(jpi,jpj,jpk),       &
128         &      xlimphy (jpi,jpj,jpk), xlimdia (jpi,jpj,jpk),       &
129         &      xlimnfe (jpi,jpj,jpk), xlimdfe (jpi,jpj,jpk),       &
130         &      xlimsi  (jpi,jpj,jpk), concdfe (jpi,jpj,jpk),       &
131         &      concnfe (jpi,jpj,jpk),                           STAT=ierr(2) ) 
132         !
133      !*  SMS for the organic matter
134      ALLOCATE( xfracal (jpi,jpj,jpk), nitrfac(jpi,jpj,jpk),       &
135         &      xlimbac (jpi,jpj,jpk), xdiss  (jpi,jpj,jpk),       & 
136         &      xlimbacl(jpi,jpj,jpk), prodcal(jpi,jpj,jpk),     STAT=ierr(3) )
137
138      !* Variable for chemistry of the CO2 cycle
139      ALLOCATE( akb3(jpi,jpj,jpk)    , ak13  (jpi,jpj,jpk) ,       &
140         &      ak23(jpi,jpj,jpk)    , aksp  (jpi,jpj,jpk) ,       &
141         &      akw3(jpi,jpj,jpk)    , borat (jpi,jpj,jpk) ,       &
142         &      hi  (jpi,jpj,jpk)    , excess(jpi,jpj,jpk) ,     STAT=ierr(4) )
143         !
144      !* Temperature dependancy of SMS terms
145      ALLOCATE( tgfunc(jpi,jpj,jpk)  , tgfunc2(jpi,jpj,jpk) ,    STAT=ierr(5) )
146         !
147      !* Array used to indicate negative tracer values 
148      ALLOCATE( xnegtr(jpi,jpj,jpk)  ,                           STAT=ierr(6) )
149#endif
150      !
151      sms_pisces_alloc = MAXVAL( ierr )
152      !
153      IF( sms_pisces_alloc /= 0 )   CALL ctl_warn('sms_pisces_alloc: failed to allocate arrays') 
154      !
155   END FUNCTION sms_pisces_alloc
156
157#else
158   !!----------------------------------------------------------------------   
159   !!  Empty module :                                     NO PISCES model
160   !!----------------------------------------------------------------------
161#endif
162   
163   !!======================================================================   
164END MODULE sms_pisces   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.