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iodef.xml in branches/2015/dev_r6946_Offline_vvl/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES_VVL/EXP00 – NEMO

source: branches/2015/dev_r6946_Offline_vvl/NEMOGCM/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES_VVL/EXP00/iodef.xml @ 8802

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Offline vvl: 1st implementation, see ticket #1775
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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2<simulation> 
3
4 <context id="nemo" time_origin="1900-01-01 00:00:00" >
5   
6    <!-- $id$ -->
7   
8    <!--
9============================================================================================================
10=                                  definition of all existing variables                                    =
11=                                            DO NOT CHANGE                                                 =
12============================================================================================================
13    -->
14    <field_definition src="./field_def.xml"/>
15    <!--
16============================================================================================================
17=                                           output files definition                                        =
18=                                            Define your own files                                         =
19=                                         put the variables you want...                                    =
20============================================================================================================
21    -->
22
23   <file_definition type="multiple_file" name="@expname@_@freq@_@startdate@_@enddate@" sync_freq="10d" min_digits="4">
24   
25      <file_group id="1ts" output_freq="1ts"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1 time step files -->
26      <file_group id="1h" output_freq="1h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 1h files -->
27      <file_group id="2h" output_freq="2h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 2h files -->
28      <file_group id="3h" output_freq="3h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3h files -->     
29      <file_group id="4h" output_freq="4h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 4h files -->
30      <file_group id="6h" output_freq="6h"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 6h files -->
31     
32      <file_group id="1d" output_freq="1d"  output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- 1d files -->
33        <file id="file1" name_suffix="_bioscalar" description="pisces sms variables" >
34           <field field_ref="tdenit"   name="tdenit"   unit="TgN/yr" operation="instant" > tdenit * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
35           <field field_ref="tnfix"    name="tnfix"    unit="TgN/yr" operation="instant" > tnfix * 14. * 86400. * 365. / 1e12 </field>
36           <field field_ref="tcflx"    name="tcflx"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcflx * -1. * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
37           <field field_ref="tcflxcum" name="tcflxcum" unit="PgC"    operation="instant" > tcflxcum * -1. * 12. / 1e15 </field>
38           <field field_ref="tcexp"    name="tcexp"    unit="PgC/yr" operation="instant" > tcexp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
39           <field field_ref="tintpp"   name="tintpp"   unit="PgC/yr" operation="instant" > tintpp * 12. * 86400. * 365. / 1e15 </field>
40           <field field_ref="pno3tot"  name="pno3tot"  unit="umolN"  > pno3tot * 16. / 122. * 1e6 </field>
41           <field field_ref="ppo4tot"  name="ppo4tot"  unit="umolP"  > ppo4tot * 1. / 122. * 1e6 </field>
42           <field field_ref="psiltot"  name="psiltot"  unit="umolC"  > psiltot * 1e6  </field>
43           <field field_ref="palktot"  name="palktot"  unit="umolC"  > palktot * 1e6  </field>
44           <field field_ref="pfertot"  name="pfertot"  unit="nmolFe" > pfertot * 1e9  </field>
45        </file>
46      </file_group>
47
48      <file_group id="3d" output_freq="3d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- 3d files -->   
49      <file_group id="5d" output_freq="5d"  output_level="10" enabled=".TRUE."/>  <!-- 5d files -->   
50
51      <file_group id="1m" output_freq="1mo" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real monthly files -->
52
53        <file id="file2" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
54          <field field_ref="DIC"       name="DIC"      operation="average" freq_op="1mo" > @DIC_E3T / @e3t </field>
55          <field field_ref="Alkalini"  name="Alkalini" operation="average" freq_op="1mo" > @Alkalini_E3T / @e3t </field>
56          <field field_ref="O2"        name="O2"       operation="average" freq_op="1mo" > @O2_E3T / @e3t </field>
57          <field field_ref="PO4"       name="PO4"      operation="average" freq_op="1mo" > @PO4_E3T / @e3t </field>
58          <field field_ref="Si"        name="Si"       operation="average" freq_op="1mo" > @Si_E3T / @e3t </field>
59          <field field_ref="Fer"       name="Fer"      operation="average" freq_op="1mo" > @Fer_E3T / @e3t </field>
60          <field field_ref="NCHL"      name="NCHL"     operation="average" freq_op="1mo" > @NCHL_E3T / @e3t </field>
61          <field field_ref="DCHL"      name="DCHL"     operation="average" freq_op="1mo" > @DCHL_E3T / @e3t </field>
62          <field field_ref="NO3"       name="NO3"      operation="average" freq_op="1mo" > @NO3_E3T / @e3t </field>
63       </file>
64
65       <file id="file3" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
66         <field field_ref="Cflx"      name="Cflx"    />
67         <field field_ref="Dpco2"     name="Dpco2"   />
68         <field field_ref="PAR"       name="PAR"   />
69         <field field_ref="PARDM"     name="PARDM"  />
70         <field field_ref="TPP"       name="TPP"  />
71         <field field_ref="INTPP"     name="INTPP"  />
72         <field field_ref="EPC100"    name="EPC100"  />
73       </file>
74
75      </file_group>
76      <file_group id="2m" output_freq="2mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2m files -->
77      <file_group id="3m" output_freq="3mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 3m files -->
78      <file_group id="4m" output_freq="4mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 4m files -->
79      <file_group id="6m" output_freq="6mo" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 6m files -->
80
81      <file_group id="1y"  output_freq="1y" output_level="10" enabled=".TRUE."> <!-- real yearly files -->
82
83       <file id="file5" name_suffix="_ptrc_T" description="pisces sms variables" >
84          <field field_ref="DIC"       name="DIC"      operation="average" freq_op="1y" > @DIC_E3T / @e3t </field>
85          <field field_ref="Alkalini"  name="Alkalini" operation="average" freq_op="1y" > @Alkalini_E3T / @e3t </field>
86          <field field_ref="O2"        name="O2"       operation="average" freq_op="1y" > @O2_E3T / @e3t </field>
87          <field field_ref="CaCO3"     name="CaCO3"    operation="average" freq_op="1y" > @CaCO3_E3T / @e3t </field>
88          <field field_ref="PO4"       name="PO4"      operation="average" freq_op="1y" > @PO4_E3T / @e3t </field>
89          <field field_ref="POC"       name="POC"      operation="average" freq_op="1y" > @POC_E3T / @e3t </field>
90          <field field_ref="Si"        name="Si"       operation="average" freq_op="1y" > @Si_E3T / @e3t </field>
91          <field field_ref="PHY"       name="PHY"      operation="average" freq_op="1y" > @PHY_E3T / @e3t </field>
92          <field field_ref="ZOO"       name="ZOO"      operation="average" freq_op="1y" > @ZOO_E3T / @e3t </field>
93          <field field_ref="DOC"       name="DOC"      operation="average" freq_op="1y" > @DOC_E3T / @e3t </field>
94          <field field_ref="PHY2"      name="PHY2"     operation="average" freq_op="1y" > @PHY2_E3T / @e3t </field>
95          <field field_ref="ZOO2"      name="ZOO2"     operation="average" freq_op="1y" > @ZOO2_E3T / @e3t </field>
96          <field field_ref="DSi"       name="DSi"      operation="average" freq_op="1y" > @DSi_E3T / @e3t </field>
97          <field field_ref="Fer"       name="Fer"      operation="average" freq_op="1y" > @Fer_E3T / @e3t </field>
98          <field field_ref="BFe"       name="BFe"      operation="average" freq_op="1y" > @BFe_E3T / @e3t </field>
99          <field field_ref="GOC"       name="GOC"      operation="average" freq_op="1y" > @GOC_E3T / @e3t </field>
100          <field field_ref="SFe"       name="SFe"      operation="average" freq_op="1y" > @SFe_E3T / @e3t </field>
101          <field field_ref="DFe"       name="DFe"      operation="average" freq_op="1y" > @DFe_E3T / @e3t </field>
102          <field field_ref="GSi"       name="GSi"      operation="average" freq_op="1y" > @GSi_E3T / @e3t </field>
103          <field field_ref="NFe"       name="NFe"      operation="average" freq_op="1y" > @NFe_E3T / @e3t </field>
104          <field field_ref="NCHL"      name="NCHL"     operation="average" freq_op="1y" > @NCHL_E3T / @e3t </field>
105          <field field_ref="DCHL"      name="DCHL"     operation="average" freq_op="1y" > @DCHL_E3T / @e3t </field>
106          <field field_ref="NO3"       name="NO3"      operation="average" freq_op="1y" > @NO3_E3T / @e3t </field>
107          <field field_ref="NH4"       name="NH4"      operation="average" freq_op="1y" > @NH4_E3T / @e3t </field>
108       </file>
109
110   <file id="file5" name_suffix="_diad_T" description="additional pisces diagnostics" >
111          <field field_ref="PH"       />
112          <field field_ref="CO3"      />
113          <field field_ref="CO3sat"   />
114          <field field_ref="PAR"      />
115          <field field_ref="PPPHY"    />
116          <field field_ref="PPPHY2"   />
117          <field field_ref="PPNEWN"   />
118          <field field_ref="PPNEWD"   />
119          <field field_ref="PBSi"     />
120          <field field_ref="PFeN"     />
121          <field field_ref="PFeD"     />
122          <field field_ref="xfracal"  />
123          <field field_ref="PCAL"     />
124          <field field_ref="DCAL"     />
125          <field field_ref="GRAZ1"    />
126          <field field_ref="GRAZ2"    />
127          <field field_ref="EPC100"   />
128          <field field_ref="EPFE100"  />
129          <field field_ref="EPSI100"  />
130          <field field_ref="EPCAL100" />
131          <field field_ref="Cflx"     />
132          <field field_ref="Oflx"     />
133          <field field_ref="Kg"       />
134          <field field_ref="Dpco2"    />
135          <field field_ref="Dpo2"     />
136          <field field_ref="Heup"     />
137          <field field_ref="Irondep"  />
138          <field field_ref="Ironsed"  />
139          <field field_ref="Ironice"  />
140          <field field_ref="Nfix"     />
141          <field field_ref="MuN"      />
142          <field field_ref="MuD"      />
143          <field field_ref="LNnut"    />
144          <field field_ref="LDnut"    />
145          <field field_ref="LNFe"     />
146          <field field_ref="LDFe"     />
147          <field field_ref="LNlight"  />
148          <field field_ref="LDlight"  />
149          <field field_ref="pdust"    />
150          <field field_ref="Fe2"      />
151          <field field_ref="Fe3"      />
152          <field field_ref="FeL1"     />
153          <field field_ref="FeL2"     />
154          <field field_ref="FeP"      />
155          <field field_ref="TL1"      />
156          <field field_ref="TL2"      />
157          <field field_ref="Sdenit"   />
158          <field field_ref="Totlig"   />
159   </file>
160
161      </file_group>
162      <file_group id="2y"  output_freq="2y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 2y files -->
163      <file_group id="5y"  output_freq="5y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 5y files -->
164      <file_group id="10y" output_freq="10y" output_level="10" enabled=".TRUE."/> <!-- real 10y files -->
165
166   </file_definition>
167   
168    <!--
169============================================================================================================
170= grid definition = = DO NOT CHANGE =
171============================================================================================================
172    -->
173   
174   <axis_definition> 
175      <axis id="deptht"  long_name="Vertical T levels"  unit="m" positive="down" />
176      <axis id="depthu"  long_name="Vertical U levels"  unit="m" positive="down" />
177      <axis id="depthv"  long_name="Vertical V levels"  unit="m" positive="down" />
178      <axis id="depthw"  long_name="Vertical W levels"  unit="m" positive="down" />
179      <axis id="nfloat"  long_name="Float number"       unit="1"                 />
180      <axis id="icbcla"  long_name="Iceberg class"      unit="1"                 />
181      <axis id="ncatice" long_name="Ice category"       unit="1"                 />
182      <axis id="iax_20C" long_name="20 degC isotherm"   unit="degC"              />
183      <axis id="iax_28C" long_name="28 degC isotherm"   unit="degC"              />
184   </axis_definition> 
185   
186   <domain_definition src="./domain_def.xml"/>
187   
188   <grid_definition>   
189     <grid id="grid_T_2D" domain_ref="grid_T"/>
190     <grid id="grid_T_3D" domain_ref="grid_T" axis_ref="deptht"/>
191     <grid id="grid_U_2D" domain_ref="grid_U"/>
192     <grid id="grid_U_3D" domain_ref="grid_U" axis_ref="depthu"/>
193     <grid id="grid_V_2D" domain_ref="grid_V"/>
194     <grid id="grid_V_3D" domain_ref="grid_V" axis_ref="depthv"/>
195     <grid id="grid_W_2D" domain_ref="grid_W"/>
196     <grid id="grid_W_3D" domain_ref="grid_W" axis_ref="depthw"/>
197    </grid_definition>   
198 
199  </context>
200 
201
202  <context id="xios">
203
204      <variable_definition>
205   
206     <!--
207        We must have buffer_size > jpi*jpj*jpk*8 (with jpi and jpj the subdomain size)
208-->
209     <variable id="buffer_size"               type="integer">50000000</variable>
210     <variable id="buffer_server_factor_size" type="integer">2</variable>
211     <variable id="info_level"                type="integer">0</variable>
212     <variable id="using_server"              type="boolean">false</variable>
213     <variable id="using_oasis"               type="boolean">false</variable>
214     <variable id="oasis_codes_id"            type="string" >oceanx</variable>
215   
216      </variable_definition>
217               
218  </context>
219 
220</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.