source: branches/2016/dev_r7012_ROBUST5_CNRS/NEMOGCM/CONFIG/SHARED/namelist_pisces_ref @ 7041

Last change on this file since 7041 was 7041, checked in by cetlod, 4 years ago

ROBUST5_CNRS : implementation of part I of new TOP interface - 1st step -, see ticket #1782

File size: 21.8 KB
Line 
1!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
2!! PISCES  (key_pisces) reference namelist (see below for key_pisces_reduced)
3!!              1  - air-sea exchange                         (nampisext)
4!!              2  - biological parameters                    (nampisbio)
5!!              3  - parameters for nutrient limitations      (nampislim)   
6!!              4  - parameters for phytoplankton             (nampisprod,nampismort)
7!!              5  - parameters for zooplankton               (nampismes,nampiszoo)
8!!              6  - parameters for remineralization          (nampisrem)
9!!              7  - parameters for calcite chemistry         (nampiscal)
10!!              8  - parameters for inputs deposition         (nampissed)
11!!              11 - Damping                                  (nampisdmp)
12!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
13!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
14&nampismod     !  Model used
15!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
16  ln_p2z = .false.        !  LOBSTER model used
17  ln_p4z = .true.         !  PISCES model used
18/
19!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
20!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
21&nampisext     !   air-sea exchange
22!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
23   ln_co2int  =  .false. ! read atm pco2 from a file (T) or constant (F)
24   atcco2     =  280.    ! Constant value atmospheric pCO2 - ln_co2int = F
25   clname     =  'atcco2.txt'  ! Name of atm pCO2 file - ln_co2int = T
26   nn_offset  =  0       ! Offset model-data start year - ln_co2int = T
27!                        ! If your model year is iyy, nn_offset=(years(1)-iyy)
28!                        ! then the first atmospheric CO2 record read is at years(1)
29/
30!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
31&nampisatm     !  Atmospheric prrssure
32!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
33!              !  file name   ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
34!              !              !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
35   sn_patm     = 'presatm'    ,     -1            , 'patm'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
36   cn_dir      = './'     !  root directory for the location of the dynamical files
37!
38   ln_presatm  = .false.   ! constant atmopsheric pressure (F) or from a file (T)
39/
40!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
41&nampisbio     !   biological parameters
42!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
43   nrdttrc    =  1        ! time step frequency for biology
44   wsbio      =  2.       ! POC sinking speed
45   xkmort     =  2.E-7    ! half saturation constant for mortality
46   ferat3     =  10.E-6   ! Fe/C in zooplankton
47   wsbio2     =  30.      ! Big particles sinking speed
48   niter1max  =  1        ! Maximum number of iterations for POC
49   niter2max  =  1        ! Maximum number of iterations for GOC
50/
51!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
52&nampislim     !   parameters for nutrient limitations
53!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
54   concnno3   =  1.e-6    ! Nitrate half saturation of nanophytoplankton
55   concdno3   =  3.E-6    ! Nitrate half saturation for diatoms
56   concnnh4   =  1.E-7    ! NH4 half saturation for phyto
57   concdnh4   =  3.E-7    ! NH4 half saturation for diatoms
58   concnfer   =  1.E-9    ! Iron half saturation for phyto
59   concdfer   =  3.E-9    ! Iron half saturation for diatoms
60   concbfe    =  1.E-11   ! Iron half-saturation for DOC remin.
61   concbnh4   =  2.E-8    ! NH4 half saturation for DOC remin.
62   concbno3   =  2.E-7    ! Nitrate half saturation for DOC remin.
63   xsizedia   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for diatoms
64   xsizephy   =  1.E-6    ! Minimum size criteria for phyto
65   xsizern    =  3.0      ! Size ratio for nanophytoplankton
66   xsizerd    =  3.0      ! Size ratio for diatoms
67   xksi1      =  2.E-6    ! half saturation constant for Si uptake
68   xksi2      =  20E-6    ! half saturation constant for Si/C
69   xkdoc      =  417.E-6  ! half-saturation constant of DOC remineralization
70   qnfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of phyto
71   qdfelim    =  7.E-6    ! Optimal quota of diatoms
72   caco3r     =  0.3      ! mean rain ratio
73   oxymin    =  1.E-6     ! Half-saturation constant for anoxia
74/
75!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
76&nampisopt     !   parameters for optics
77!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
78!              !  file name       ! frequency (hours) ! variable  ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
79!              !                  !  (if <0  months)  !   name    !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
80   sn_par      = 'par.orca'       ,     24            , 'fr_par'  ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''       , ''
81   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files
82   ln_varpar   =  .true.   ! boolean for PAR variable
83   parlux      =  0.43      ! Fraction of shortwave as PAR
84/ 
85!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
86&nampisprod     !   parameters for phytoplankton growth
87!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
88   pislope    =  2.       ! P-I slope
89   pislope2   =  2.       ! P-I slope  for diatoms
90   xadap      =  0.       ! Adaptation factor to low light
91   excret     =  0.05     ! excretion ratio of phytoplankton
92   excret2    =  0.05     ! excretion ratio of diatoms
93   ln_newprod =  .true.   ! Enable new parame. of production (T/F)
94   bresp      =  0.033    ! Basal respiration rate
95   chlcnm     =  0.033    ! Maximum Chl/C in nanophytoplankton
96   chlcdm     =  0.05     ! Maximum Chl/C in diatoms
97   chlcmin    =  0.004    ! Minimum Chl/c in phytoplankton
98   fecnm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in nanophytoplankton
99   fecdm      =  40E-6    ! Maximum Fe/C in diatoms
100   grosip     =  0.159    ! mean Si/C ratio
101/
102!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
103&nampismort     !   parameters for phytoplankton sinks
104!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
105   wchl       =  0.01    ! quadratic mortality of phytoplankton
106   wchld      =  0.01     ! maximum quadratic mortality of diatoms
107   wchldm     =  0.03     ! maximum quadratic mortality of diatoms
108   mprat      =  0.01     ! phytoplankton mortality rate
109   mprat2     =  0.01     ! Diatoms mortality rate
110/
111!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
112&nampismes     !   parameters for mesozooplankton
113!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
114   part2      =  0.75     ! part of calcite not dissolved in mesozoo guts
115   grazrat2   =  0.75     ! maximal mesozoo grazing rate
116   resrat2    =  0.005    ! exsudation rate of mesozooplankton
117   mzrat2     =  0.03     ! mesozooplankton mortality rate
118   xprefc     =  1.       ! mesozoo preference for diatoms
119   xprefp     =  0.3      ! mesozoo preference for nanophyto.
120   xprefz     =  1.       ! mesozoo preference for microzoo.
121   xprefpoc   =  0.3      ! mesozoo preference for poc
122   xthresh2zoo = 1E-8     ! zoo feeding threshold for mesozooplankton
123   xthresh2dia = 1E-8     ! diatoms feeding threshold for mesozooplankton
124   xthresh2phy = 1E-8     ! nanophyto feeding threshold for mesozooplankton
125   xthresh2poc = 1E-8     ! poc feeding threshold for mesozooplankton
126   xthresh2   =  3E-7     ! Food threshold for grazing
127   xkgraz2    =  20.E-6   ! half saturation constant for meso grazing
128   epsher2    =  0.35     ! Efficicency of Mesozoo growth
129   sigma2     =  0.6      ! Fraction of mesozoo excretion as DOM
130   unass2     =  0.3      ! non assimilated fraction of P by mesozoo
131   grazflux   =  2.e3     ! flux-feeding rate
132/
133!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
134&nampiszoo     !   parameters for microzooplankton
135!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
136   part       =  0.5      ! part of calcite not dissolved in microzoo gutsa
137   grazrat    =  3.0      ! maximal zoo grazing rate
138   resrat     =  0.03     ! exsudation rate of zooplankton
139   mzrat      =  0.004    ! zooplankton mortality rate
140   xpref2c    =  0.1      ! Microzoo preference for POM
141   xpref2p    =  1.       ! Microzoo preference for Nanophyto
142   xpref2d    =  0.5      ! Microzoo preference for Diatoms
143   xthreshdia =  1.E-8    ! Diatoms feeding threshold for microzooplankton
144   xthreshphy =  1.E-8    ! Nanophyto feeding threshold for microzooplankton
145   xthreshpoc =  1.E-8    ! POC feeding threshold for microzooplankton
146   xthresh    =  3.E-7    ! Food threshold for feeding
147   xkgraz     =  20.E-6   ! half sturation constant for grazing
148   epsher     =  0.3      ! Efficiency of microzoo growth
149   sigma1     =  0.6      ! Fraction of microzoo excretion as DOM
150   unass      =  0.3      ! non assimilated fraction of phyto by zoo
151/
152!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
153&nampisfer     !   parameters for iron chemistry
154!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
155   ln_fechem =  .false.   ! complex iron chemistry ( T/F )
156   ln_ligvar =  .false.   ! variable ligand concentration
157   xlam1     =  0.005     ! scavenging rate of Iron
158   xlamdust  =  150.0     ! Scavenging rate of dust
159   ligand    =  0.6E-9    ! Ligands concentration
160/ 
161!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
162&nampisrem     !   parameters for remineralization
163!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
164   xremik    =  0.3       ! remineralization rate of DOC
165   xremip    =  0.025     ! remineralisation rate of POC
166   nitrif    =  0.05      ! NH4 nitrification rate
167   xsirem    =  0.003     ! remineralization rate of Si
168   xsiremlab =  0.03      ! fast remineralization rate of Si
169   xsilab    =  0.5       ! Fraction of labile biogenic silica
170/
171!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
172&nampiscal     !   parameters for Calcite chemistry
173!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
174   kdca       =  6.       ! calcite dissolution rate constant (1/time)
175   nca        =  1.       ! order of dissolution reaction (dimensionless)
176/
177!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
178&nampissbc     !   parameters for inputs deposition
179!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
180!              !  file name        ! frequency (hours) ! variable      ! time interp. !  clim  ! 'yearly'/ ! weights  ! rotation ! land/sea mask !
181!              !                   !  (if <0  months)  !   name        !   (logical)  !  (T/F) ! 'monthly' ! filename ! pairing  ! filename      !
182   sn_dust     = 'dust.orca'       ,     -1            , 'dust'        ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
183   sn_solub    = 'solubility.orca' ,    -12            , 'solubility1' ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
184   sn_riverdic = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdic'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
185   sn_riverdoc = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdoc'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
186   sn_riverdin = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdin'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
187   sn_riverdon = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdon'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
188   sn_riverdip = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdip'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
189   sn_riverdop = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdop'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
190   sn_riverdsi = 'river.orca'      ,    120            , 'riverdsi'    ,  .true.      , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
191   sn_ndepo    = 'ndeposition.orca',    -12            , 'ndep'        ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
192   sn_ironsed  = 'bathy.orca'      ,    -12            , 'bathy'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
193   sn_hydrofe  = 'hydrofe.orca'    ,    -12            , 'epsdb'       ,  .false.     , .true. , 'yearly'  , ''       , ''    , ''
194!
195   cn_dir      = './'      !  root directory for the location of the dynamical files
196   ln_dust     =  .true.   ! boolean for dust input from the atmosphere
197   ln_solub    =  .true.   ! boolean for variable solubility of atm. Iron
198   ln_river    =  .true.   ! boolean for river input of nutrients
199   ln_ndepo    =  .true.   ! boolean for atmospheric deposition of N
200   ln_ironsed  =  .true.   ! boolean for Fe input from sediments
201   ln_ironice  =  .true.   ! boolean for Fe input from sea ice
202   ln_hydrofe  =  .false.  ! boolean for from hydrothermal vents
203   sedfeinput  =  2.e-9    ! Coastal release of Iron
204   dustsolub   =  0.02     ! Solubility of the dusta
205   mfrac       =  0.035    ! Fe mineral fraction of dust
206   wdust       =  2.0      ! Dust sinking speed
207   icefeinput  =  15.e-9   ! Iron concentration in sea ice
208   nitrfix     =  1.e-7    ! Nitrogen fixation rate
209   diazolight  =  50.      ! Diazotrophs sensitivity to light (W/m2)
210   concfediaz  =  1.e-10   ! Diazotrophs half-saturation Cste for Iron
211   hratio      =  1.e+7    ! Fe to 3He ratio assumed for vent iron supply
212/
213!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
214&nampisice      !  Prescribed sea ice tracers
215!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
216! constant ocean tracer concentrations are defined in trcice_pisces.F90 (Global, Arctic, Antarctic and Baltic)
217! trc_ice_ratio     * betw 0 and 1: prescribed ice/ocean tracer concentration ratio
218!                   * -1 => the ice-ocean tracer concentration ratio follows the
219!                           ice-ocean salinity ratio
220!                   * -2 => tracer concentration in sea ice is prescribed and
221!                           trc_ice_prescr is used
222! trc_ice_prescr    * prescribed tracer concentration. used only if
223!                     trc_ice_ratio = -2. equals -99 if not used.
224! cn_trc_o          * 'GL' use global ocean values making the Baltic distinction only
225!                     'AA' use specific Arctic/Antarctic/Baltic values
226!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
227!    sn_tri_ ! trc_ice_ratio ! trc_ice_prescr !     cn_trc_o
228   sn_tri_dic =           -1.,           -99.,          'AA'
229   sn_tri_doc =            0.,           -99.,          'AA'
230   sn_tri_tal =           -1.,           -99.,          'AA'
231   sn_tri_oxy =           -1.,           -99.,          'AA'
232   sn_tri_cal =            0.,           -99.,          'AA'
233   sn_tri_po4 =           -1.,           -99.,          'AA'
234   sn_tri_poc =            0.,           -99.,          'AA'
235   sn_tri_goc =            0.,           -99.,          'AA'
236   sn_tri_bfe =            0.,           -99.,          'AA'
237   sn_tri_num =            0.,           -99.,          'AA'
238   sn_tri_sil =           -1.,           -99.,          'AA'
239   sn_tri_dsi =            0.,           -99.,          'AA'
240   sn_tri_gsi =            0.,           -99.,          'AA'
241   sn_tri_phy =            0.,           -99.,          'AA'
242   sn_tri_dia =            0.,           -99.,          'AA'
243   sn_tri_zoo =            0.,           -99.,          'AA'
244   sn_tri_mes =            0.,           -99.,          'AA'
245   sn_tri_fer =           -2.,          15E-9,          'AA'
246   sn_tri_sfe =            0.,           -99.,          'AA'
247   sn_tri_dfe =            0.,           -99.,          'AA'
248   sn_tri_nfe =            0.,           -99.,          'AA'
249   sn_tri_nch =            0.,           -99.,          'AA'
250   sn_tri_dch =            0.,           -99.,          'AA'
251   sn_tri_no3 =           -1.,           -99.,          'AA'
252   sn_tri_nh4 =            1.,           -99.,          'AA'
253/
254!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
255&nampisdmp     !  Damping
256!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
257   ln_pisdmp    =  .true.     !  Relaxation fo some tracers to a mean value
258   nn_pisdmp    =  5475       !  Frequency of Relaxation
259/
260!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
261&nampismass     !  Mass conservation
262!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
263   ln_check_mass =  .false.    !  Check mass conservation
264/
265!!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
266!! PISCES reduced (key_pisces_reduced, ex LOBSTER) : namelists
267!!              1  - biological parameters for phytoplankton    (namlobphy)
268!!              2  - biological parameters for nutrients        (namlobnut)
269!!              3  - biological parameters for zooplankton      (namlobzoo)   
270!!              4  - biological parameters for detritus         (namlobdet)
271!!              5  - biological parameters for DOM              (namlobdom)
272!!              6  - parameters from aphotic layers to sediment (namlobsed)
273!!              7  - general coefficients                       (namlobrat)
274!!              8  - optical parameters                         (namlobopt)
275!>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
276!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
277&namlobphy     !   biological parameters for phytoplankton
278!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
279   tmumax  =  1.21e-5   ! maximal phytoplankton growth rate            [s-1]
280   rgamma  =  0.05      ! phytoplankton exudation fraction             [%]
281   fphylab =  0.75      ! NH4 fraction of phytoplankton exsudation     
282   tmminp  =  5.8e-7    ! minimal phytoplancton mortality rate         [0.05/86400 s-1=20 days]
283   aki     =  33.       ! light photosynthesis half saturation constant[W/m2]
284/
285!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
286&namlobnut     !   biological parameters for nutrients
287!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
288   akno3   =  0.7       ! nitrate limitation half-saturation value     [mmol/m3]
289   aknh4   =  0.001     ! ammonium limitation half-saturation value    [mmol/m3]
290   taunn   =  5.80e-7   ! nitrification rate                           [s-1] 
291   psinut  =  3.        ! inhibition of nitrate uptake by ammonium
292/
293!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
294&namlobzoo     !   biological parameters for zooplankton
295!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
296   rppz    = 0.8        ! zooplankton nominal preference for phytoplancton food  [%]
297   taus    = 9.26E-6    ! specific zooplankton maximal grazing rate              [s-1]
298!                       ! 0.75/86400 s-1=8.680555E-6    1/86400 = 1.15e-5
299   aks     = 1.         ! half-saturation constant for total zooplankton grazing [mmolN.m-3]
300   rpnaz   = 0.3        ! non-assimilated phytoplankton by zooplancton           [%]
301   rdnaz   = 0.3        ! non-assimilated detritus by zooplankton                [%]
302   tauzn   = 8.1e-7     ! zooplancton specific excretion rate                    [0.1/86400 s-1=10 days]
303   fzoolab = 0.5        ! NH4 fraction of zooplankton excretion
304   fdbod   = 0.5        ! zooplankton mortality fraction that goes to detritus
305   tmminz  = 2.31e-6    ! minimal zooplankton mortality rate                     [(mmolN/m3)-1 d-1]
306/
307!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
308&namlobdet     !   biological parameters for detritus
309!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
310   taudn   = 5.80e-7    ! detritus breakdown rate                        [0.1/86400 s-1=10 days]
311   fdetlab = 0.         ! NH4 fraction of detritus dissolution           
312/
313!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
314&namlobdom     !   biological parameters for DOM
315!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
316   taudomn = 6.43e-8    ! DOM breakdown rate                             [s-1]
317!                       ! slow remineralization rate of semi-labile dom to nh4 (1 month)
318/
319!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
320&namlobsed     !   parameters from aphotic layers to sediment
321!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
322   sedlam     = 3.86e-7    ! time coefficient of POC remineralization in sediments [s-1]
323   sedlostpoc = 0.         ! mass of POC lost in sediments
324   vsed       = 3.47e-5    ! detritus sedimentation speed                   [m/s]
325   xhr        = -0.858     ! coeff for martin''s remineralisation profile
326/
327!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
328&namlobrat     !   general coefficients
329!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
330   rcchl   = 60.       ! Carbone/Chlorophyl ratio                     [mgC.mgChla-1]
331   redf    = 6.56       ! redfield ratio (C:N) for phyto
332   reddom  = 6.56       ! redfield ratio (C:N) for DOM
333/
334!'''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''
335&namlobopt     !   optical parameters
336!,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
337   xkg0   = 0.0232     ! green absorption coefficient of water
338   xkr0   = 0.225      ! red absorption coefficent of water
339   xkgp   = 0.074      ! green absorption coefficient of chl
340   xkrp   = 0.037      ! red absorption coefficient of chl
341   xlg    = 0.674      ! green chl exposant for absorption
342   xlr    = 0.629      ! red chl exposant for absorption
343   rpig   = 0.7        ! chla/chla+pheo ratio
344/
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.