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Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
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iodef.xml in trunk/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00 – NEMO

source: trunk/CONFIG/GYRE_LOBSTER/EXP00/iodef.xml @ 1451

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add xml files and upadte BB_make to take into account I/O server in TOP, see ticket:432

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Line 
1<?xml version="1.0"?>
2
3<simulation> 
4
5<context id="nemo">
6
7<!-- groups of variables definition -->
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9  <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" freq_op="7200" enabled=".TRUE.">
10   
11     <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
12       <field id="votemper" description="Temperature"                       unit="C"    axis_ref="deptht" />
13       <field id="vosaline" description="Salinity"                          unit="PSU"  axis_ref="deptht" />
14       <field id="sosstsst" description="Sea Surface temperature"           unit="C"   />
15       <field id="sosaline" description="Sea Surface Salinity"              unit="PSU"  />
16       <field id="sobarstf" description="Barotropic StreamFunction"         unit="m3/s2"  />
17       <field id="sossheig" description="Sea Surface Height"                unit="m"  />
18       <field id="sowaflup" description="Net Upward Water Flux"             unit="Kg/m2/s"   />
19       <field id="sowaflcd" description="concentration/dilution water flux" unit="Kg/m2/s"   />
20       <field id="sosalflx" description="Surface Salt Flux"                 unit="Kg/m2/s"   />
21       <field id="sohefldo" description="Net Downward Heat Flux"            unit="W/m2"   />
22       <field id="soshfldo" description="Shortwave Radiation"               unit="W/m2"   />
23       <field id="somxl010" description="Mixed Layer Depth 0.01"            unit="m"  />
24       <field id="somixhgt" description="Turbocline Depth"                  unit="m"   />
25       <field id="soicecov" description="Ice fraction"                      unit="[0,1]"   />
26       <field id="sohefldp" description="Surface Heat Flux: Damping"        unit="W/m2"      enabled=".FALSE."/>
27       <field id="sowafldp" description="Surface Water Flux: Damping"       unit="Kg/m2/s"   enabled=".FALSE."/>
28       <field id="sosafldp" description="Surface salt flux: Damping"        unit="Kg/m2/s"   enabled=".FALSE."/>
29       <field id="sosurfps" description="Surface Pressure"                  unit="cm"   />
30       <field id="sobowlin" description="Bowl Index"                        unit="W-point"  />
31       <field id="sothedep" description="Thermocline Depth"                 unit="m"   />
32       <field id="so20chgt" description="Depth of 20C isotherm"             unit="m"  />
33       <field id="so28chgt" description="Depth of 28C isotherm"             unit="m"   />
34       <field id="sohtc300" description="Heat content 300 m"                unit="W" />
35     </group>
36       
37     <group id="grid_U"  axis_ref="none" grid_ref="grid_U">
38       <field id="vozocrtx" description="Zonal Current"                   unit="m/s"  axis_ref="depthu" />
39       <field id="vozoeivu" description="Zonal EIV Current"               unit="m/s"  axis_ref="depthu" />
40       <field id="sozotaux" description="Wind Stress along i-axis"        unit="N/m2"    />
41       <field id="sozospgx" description="Zonal Surface Pressure Gradient" unit="N/kg"  />
42     </group>
43     
44     <group id="grid_V"  axis_ref="none" grid_ref="grid_V">
45       <field id="vomecrty" description="Meridional Current"                unit="m/s"  axis_ref="depthv" />
46       <field id="vomeeivv" description="Meridional EIV Current"            unit="m/s"  axis_ref="depthv" />
47       <field id="sometauy" description="Wind Stress along j-axis"          unit="N/m2"  />
48       <field id="somespgy" description="Meridional Surface Pressure Grad." unit="N/kg"  />
49     </group>
50     
51     <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
52       <field id="vovecrtz" description="Vertical Velocity"                   unit="m/s"   />
53       <field id="voveeivw" description="Vertical EIV Velocity"               unit="m/s"   />
54       <field id="votkeavt" description="Vertical Eddy Diffusivity"           unit="m2/s"  />
55       <field id="votkeevd" description="Enhanced Vertical Diffusivity"       unit="m2/s"  />
56       <field id="votkeavm" description="Vertical Eddy Viscosity"             unit="m2/s"  />
57       <field id="votkeevm" description="Enhanced Vertical Viscosity"         unit="m2/s"  />
58       <field id="voddmavs" description="Salt Vertical Eddy Diffusivity"      unit="m2/s" enabled=".FALSE." />
59       <field id="soleahtw" description="lateral eddy diffusivity"            unit="m2/s" axis_ref="none"  />
60       <field id="soleaeiw" description="eddy induced vel. coeff. at w-point" unit="m2/s" axis_ref="none"/>
61     </group>
62
63
64     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
65       <field id="DET"      description="Detritus"                            unit="mmole-N/m3" />
66       <field id="ZOO"      description="Zooplankton Concentration"           unit="mmole-N/m3" />
67       <field id="PHY"      description="Phytoplankton Concentration"         unit="mmole-N/m3" />
68       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"              unit="mmole-N/m3" />
69       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"              unit="mmole-N/m3" />
70       <field id="DOM"      description="Dissolved organic matter"            unit="mmole-N/m3" />
71     </group>
72
73     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
74       <field id="FNO3PHY"  description="FNO3PHY"                             unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
75       <field id="FNH4PHY"  description="FNH4PHY"                             unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
76       <field id="FNH4NO3"  description="FNH4NO3"                             unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
77       <field id="TNO3PHY"  description="TNO3PHY"                             unit="-"  /> 
78       <field id="TNH4PHY"  description="TNH4PHY"                             unit="-"  /> 
79       <field id="TPHYDOM"  description="TPHYDOM"                             unit="-"  /> 
80       <field id="TPHYNH4"  description="TPHYNH4"                             unit="-"  /> 
81       <field id="TPHYZOO"  description="TPHYZOO"                             unit="-"  /> 
82       <field id="TPHYDET"  description="TPHYDET"                             unit="-"  /> 
83       <field id="TDETZOO"  description="TDETZOO"                             unit="-"  /> 
84       <field id="TDETSED"  description="TDETSED"                             unit="-"  /> 
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86       <field id="TZOOBOD"  description="TZOOBOD"                             unit="-"  /> 
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88       <field id="TZOODOM"  description="TZOODOM"                             unit="-"  /> 
89       <field id="TNH4NO3"  description="TNH4NO3"                             unit="-"  /> 
90       <field id="TDOMNH4"  description="TDOMNH4"                             unit="-"  /> 
91       <field id="TDETNH4"  description="TDETNH4"                             unit="-"  /> 
92       <field id="TPHYTOT"  description="TPHYTOT"                             unit="-"  /> 
93       <field id="TZOOTOT"  description="TZOOTOT"                             unit="-"  /> 
94       <field id="TDETDOM"  description="TDETDOM"                             unit="-"  /> 
95       <field id="SEDPOC"   description="SEDPOC"                              unit="-"  /> 
96     </group>
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98  </field_definition>
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100<!-- file definition -->
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102  <file_definition output_level="10" enabled=".TRUE.">
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104     <file id="GYREL_1m_grid_T" description="ocean T grid variables" output_freq="2592000" output_level="5" >
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135    </file>
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139       <field ref="vomeeivv"  />
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191  </file_definition>
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207
208</context>
209
210</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.