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iodef.xml in trunk/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00 – NEMO

source: trunk/CONFIG/ORCA2_LIM_PISCES/EXP00/iodef.xml @ 1506

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Update iodef.xml for ORCA2_LIM_PISCES config according to changeset:1482
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RevLine 
[1451]1<?xml version="1.0"?>
2
3<simulation> 
[1506]4 
5  <context id="nemo">
6   
7    <!-- groups of variables definition -->
8   
9    <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" freq_op="5760" enabled=".TRUE.">
[1451]10
[1506]11      <!-- T grid -->
12     
13      <group id="grid_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
14   <field id="toce"         description="temperature"                       unit="C"    axis_ref="deptht"   />
15         <field id="soce"         description="salinity"                          unit="psu"  axis_ref="deptht"   />
16   <field id="sst"          description="sea surface temperature"           unit="C"                        />
17   <field id="sss"          description="sea surface salinity"              unit="psu"                      />
18   <field id="ssh"          description="sea surface height"                unit="m"                        />
19   <field id="mld010"       description="Mixed Layer Depth 0.01"            unit="m"                        />
20   <field id="mldturb"      description="mixing layer depth (Turbocline)"   unit="m"                        />
21   <field id="bowl"         description="Bowl Index"                        unit="W-point"                  />
22   <!-- next variables available with key_diahth -->
23   <field id="thermod"      description="Thermocline Depth"                 unit="m"                        />
24        <field id="20d"          description="Depth of 20C isotherm"             unit="m"                        />
25   <field id="28d"          description="Depth of 28C isotherm"             unit="m"                        />
26   <field id="hc300"        description="Heat content 300 m"                unit="W"                        />
27     </group>
[1451]28
[1506]29      <!-- SBC -->
30     
31      <group id="SBC" axis_ref="none" grid_ref="grid_T" freq_op="28800">
[1451]32
[1506]33   <field id="emp"          description="Net Upward Water Flux"                                        unit="kg/m2/s"  />
34   <field id="emps"         description="concentration/dilution water flux"                            unit="kg/m2/s"  />
35   <field id="snowpre"      description="Snow precipitation"                                           unit="kg/m2/s"  />
36   <field id="runoffs"      description="River Runoffs"                                                unit="Kg/m2/s"  />
[1451]37
[1506]38   <field id="qns+qsr"      description="Net Downward Heat Flux"                                       unit="W/m2"     />
39   <field id="qns"          description="non solar Downward Heat Flux"                                 unit="W/m2"     />
40   <field id="qsr"          description="Shortwave Radiation"                                          unit="W/m2"     />
41   <field id="qrp"          description="Surface Heat Flux: Damping"                                   unit="W/m2"     />
42   <field id="erp"          description="Surface Water Flux: Damping"                                  unit="Kg/m2/s"  />
43   
44   <!-- *_oce variables available with ln_blk_clio or ln_blk_core -->
45   <field id="qns_oce"      description="Non solar Downward Heat Flux over open ocean"                 unit="W/m2"     />
46   <field id="qlw_oce"      description="Longwave Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
47   <field id="qsb_oce"      description="Sensible Downward Heat Flux over open ocean"                  unit="W/m2"     />
48   <field id="qla_oce"      description="Latent Downward Heat Flux over open ocean"                    unit="W/m2"     />
[1451]49
[1506]50   <field id="ice_cover"    description="Ice fraction"                                                 unit="-"        />
[1451]51
[1506]52   <field id="ioceflxb"     description="Oceanic flux at the ice base"                                 unit="W/m2"     />
53   <field id="qsr_ai_cea"   description="Air-Ice downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
54   <field id="qns_ai_cea"   description="Air-Ice downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
55   <field id="qla_ai_cea"   description="Air-Ice downward Latent heat flux (cell average)"             unit="W/m2"     />
56   
57   <field id="qsr_io_cea"   description="Ice-Oce downward solar heat flux (cell average)"              unit="W/m2"     />
58   <field id="qns_io_cea"   description="Ice-Oce downward non-solar heat flux (cell average)"          unit="W/m2"     />
59   
60   <field id="snowthic_cea" description="Snow thickness (cell average)"                                unit="m"        />
61   <field id="icethic_cea"  description="Ice thickness (cell average)"                                 unit="m"        />
62   <field id="iceprod_cea"  description="Ice production (cell average)"                                unit="m/s"      />
63   
64   <field id="ice_pres"     description="Ice presence"                                                 unit="-"        />
65   <field id="ist_ipa"      description="Ice surface temperature (ice presence average)"               unit="Celius"   />     
66   <field id="uice_ipa"     description="Ice velocity along i-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
67   <field id="vice_ipa"     description="Ice velocity along j-axis at I-point (ice presence average)"  unit="m/s"      />     
68   
69   <field id="utau_ice"     description="Wind stress along i-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
70   <field id="vtau_ice"     description="Wind stress along j-axis over the ice at i-point"             unit="N/m2"     />
71   
72   <!-- icealb_cea: available key_coupled -->
73   <field id="icealb_cea"   description="Ice albedo (cell average)"                                    unit="-"        />
74      </group>
75
76      <!-- U grid -->
77     
78      <group id="grid_U"  axis_ref="depthu" grid_ref="grid_U">
79   <field id="utau"        description="Wind Stress along i-axis"                  unit="N/m2" axis_ref="none" />
80   <field id="uoce"        description="ocean current along i-axis"                unit="m/s"                  />
81   <field id="uoce_eff"    description="Effective ocean current along i-axis"      unit="m/s"                  />
82   <!-- uoce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
83   <field id="uoce_eiv"    description="EIV ocean current along i-axis"            unit="m/s"                  />
84   <!-- uoce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
85   <field id="uoce_bbl"    description="BBL ocean current along i-axis"            unit="m/s"                  />
86      </group>
87     
88      <!-- V grid -->
89     
90      <group id="grid_V"  axis_ref="depthv" grid_ref="grid_V">
91   <field id="vtau"        description="Wind Stress along j-axis"                  unit="N/m2" axis_ref="none" />
92   <field id="voce"        description="ocean current along j-axis"                unit="m/s"                  />
93   <field id="voce_eff"    description="Effective ocean current along j-axis"      unit="m/s"                  />
94   <!-- voce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
95   <field id="voce_eiv"    description="EIV ocean current along j-axis"            unit="m/s"                  />
96   <!-- voce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
97   <field id="voce_bbl"    description="BBL ocean current along j-axis"            unit="m/s"                  />
98      </group>
99     
100      <!-- W grid -->
101     
102      <group id="grid_W"  axis_ref="depthw" grid_ref="grid_W">
103   <field id="woce"        description="ocean vertical velocity"                   unit="m/s"                  />
104   <field id="woce_eff"    description="effective ocean vertical velocity"         unit="m/s"                  />
105   <!-- woce_eiv: available with key_traldf_eiv and key_diaeiv -->
106   <field id="woce_eiv"    description="EIV ocean vertical velocity"               unit="m/s"                  />
107   <!-- woce_eiv: available with key_trabbl_adv -->
108   <field id="woce_bbl"    description="BBL ocean vertical velocity"               unit="m/s"                  />
109   
110   <field id="avt"         description="vertical eddy diffusivity"                 unit="m2/s"                 />
111   <field id="avm"         description="vertical eddy viscosity"                   unit="m2/s"                 />
112   <!-- avs: available with key_zdfddm -->
113   <field id="avs"         description="salt vertical eddy diffusivity"            unit="m2/s"                 />
114   <!-- avt_evd and avm_evd: available with ln_zdfevd -->
115   <field id="avt_evd"     description="enhanced vertical diffusivity"             unit="m2/s"                 />
116   <field id="avm_evd"     description="enhanced vertical viscosity"               unit="m2/s"                 />
117   <!-- aht2d and  aht2d_eiv: available with key_traldf_eiv and key_traldf_c2d -->
118   <field id="aht2d"       description="lateral eddy diffusivity"                unit="m2/s" axis_ref="none" />
119   <field id="aht2d_eiv"   description="EIV lateral eddy diffusivity"            unit="m2/s" axis_ref="none" />
120      </group>
121     
122      <!-- ptrc on T grid -->
123
124     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T">
125       <field id="DIC"         description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" />
126       <field id="Alkalini"    description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L   " />
127       <field id="O2"          description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" />
128       <field id="CaCO3"       description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" />
129       <field id="PO4"         description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" />
130       <field id="POC"         description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" />
131       <field id="Si"          description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" />
132       <field id="PHY"         description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" />
133       <field id="ZOO"         description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" />
134       <field id="PHY2"        description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" />
135       <field id="ZOO2"        description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" />
136       <field id="BSi"         description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" />
137       <field id="Fer"         description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" />
138       <field id="BFe"         description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" />
139       <field id="GOC"         description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" />
140       <field id="SFe"         description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" />
141       <field id="DFe"         description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" />
142       <field id="DSi"         description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" />
143       <field id="NFe"         description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" />
144       <field id="NCHL"        description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" />
145       <field id="DCHL"        description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" />
146       <field id="NO3"         description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" />
147       <field id="NH4"         description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" />
[1451]148     </group>
149
[1506]150      <!-- diad on T grid -->
[1451]151
[1506]152     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T">
153       <field id="PH"          description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" />
154       <field id="CO3"         description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
155       <field id="CO3sat"      description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
156       <field id="PAR"         description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" />
157       <field id="PPPHY"       description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
158       <field id="PPPHY2"      description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
159       <field id="PPZOO"       description="Primary production of microzoo"           unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
160       <field id="PPZOO2"      description="Primary production of mesozoo"            unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
161       <field id="PBSi"        description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m2/s" axis_ref="deptht" />
162       <field id="PFeN"        description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
163       <field id="PFeD"        description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
164       <field id="Cflx"        description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s" />
165       <field id="Oflx"        description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s" />
166       <field id="Kg"          description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" />
167       <field id="DelC"        description="Delta CO2"                                unit="uatm" />
168       <field id="PMO"         description="POC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
169       <field id="PMO2"        description="GOC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
170       <field id="ExpFe1"      description="Nano iron export"                         unit="mol-Fe/m2/s" />
171       <field id="ExpFe2"      description="Diatoms iron export"                      unit="mol-Fe/m2/s" />
172       <field id="ExpSi"       description="Silicate export"                          unit="mol-Si/m2/s" />
173       <field id="ExpCaCO3"    description="Calcite export"                           unit="mol-C/m2/s" />
174       <field id="heup"        description="euphotic layer depth"                     unit="m" />
175       <field id="Fedep"       description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s" />
176       <field id="Nfix"        description="Nitrogen fixation"                        unit="mol-N/m2/s" />
177     </group>
[1451]178
[1506]179    </field_definition>
180   
181    <!-- file definition -->
182   
183    <file_definition output_level="10" enabled=".TRUE.">
184      <file id="ORCA2_5d_grid_T" description="ocean T grid variables" output_freq="432000" output_level="5" >
185   <field ref="toce"         name="votemper"  />
186   <field ref="soce"         name="vosaline"  />
187   <field ref="sst"          name="sosstsst"  />
188   <field ref="sss"          name="sosaline"  />
189   <field ref="ssh"          name="sossheig"  />
190   <field ref="emp"          name="sowaflup"  />
191   <field ref="qsr"          name="soshfldo"  />
192   <field ref="emps"         name="sowaflcd"  />
193   <field ref="qns+qsr"      name="sohefldo"  />
194   <field ref="mld010"       name="somxl010"  />
195   <field ref="mldturb"      name="somixhgt"  />
196   <field ref="ice_cover"    name="soicecov"  />
197   <field ref="qrp"          name="sohefldp"  />
198   <field ref="erp"          name="sowafldp"  />
199   <field ref="bowl"         name="sobowlin"  />
200   <field ref="thermod"      name="sothedep"  />
201   <field ref="20d"          name="so20chgt"  />
202   <field ref="28d"          name="so28chgt"  />
203   <field ref="hc300"        name="sohtc300"  />
204   <field ref="ist_ipa"      name="soicetem"  />
205   <field ref="icealb_cea"   name="soicealb"  />   
206      </file>
207     
208      <file id="ORCA2_5d_grid_U" description="ocean U grid variables" output_freq="432000" level="5" >
209   <field ref="uoce"         name="vozocrtx"  />
210   <field ref="uoce_eiv"     name="vozoeivu"  />
211   <field ref="utau"         name="sozotaux"  />
212      </file>
213     
214      <file id="ORCA2_5d_grid_V" description="ocean V grid variables" output_freq="432000" level="5" >
215   <field ref="voce"         name="vomecrty"  />
216   <field ref="voce_eiv"     name="vomeeivv"  />
217   <field ref="vtau"         name="sometauy"  />
218      </file>
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Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.