New URL for NEMO forge!   http://forge.nemo-ocean.eu

Since March 2022 along with NEMO 4.2 release, the code development moved to a self-hosted GitLab.
This present forge is now archived and remained online for history.
iodef.xml in trunk/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00 – NEMO

source: trunk/CONFIG/ORCA2_OFF_PISCES/EXP00/iodef.xml @ 1552

Last change on this file since 1552 was 1451, checked in by cetlod, 15 years ago

add xml files and upadte BB_make to take into account I/O server in TOP, see ticket:432

File size: 7.7 KB
Line 
1<?xml version="1.0"?>
2
3<simulation> 
4
5<context id="nemo">
6
7<!-- groups of variables definition -->
8
9  <field_definition level="1" prec="4" operation="ave(X)" freq_op="21600" enabled=".TRUE.">
10           
11     <group id="ptrc_T" axis_ref="deptht" grid_ref="grid_T"> 
12       <field id="DIC"      description="Dissolved inorganic Concentration"        unit="mol-C/L" />
13       <field id="Alkalini" description="Total Alkalinity Concentration"           unit="eq/L   " />
14       <field id="O2"       description="Calcite Concentration"                    unit="mol-C/L" />
15       <field id="CaCO3"    description="Phosphate Concentration"                  unit="mol-C/L" />
16       <field id="PO4"      description="Small organic carbon Concentration"       unit="mol-C/L" />
17       <field id="POC"      description="Silicate Concentration"                   unit="mol-C/L" />
18       <field id="Si"       description="Nanophytoplankton Concentration"          unit="mol-C/L" />
19       <field id="PHY"      description="Microzooplankton Concentration"           unit="mol-C/L" />
20       <field id="ZOO"      description="Dissolved organic Concentration"          unit="mol-C/L" />
21       <field id="PHY2"     description="Diatoms Concentration"                    unit="mol-C/L" />
22       <field id="ZOO2"     description="Mesozooplankton Concentration"            unit="mol-C/L" />
23       <field id="BSi"      description="Diatoms Silicate Concentration"           unit="mol-C/L" />
24       <field id="Fer"      description="Dissolved Iron Concentration"             unit="mol-C/L" />
25       <field id="BFe"      description="Big iron particles Concentration"         unit="mol-C/L" />
26       <field id="GOC"      description="Big organic carbon Concentration"         unit="mol-C/L" />
27       <field id="SFe"      description="Small iron particles Concentration"       unit="mol-C/L" />
28       <field id="DFe"      description="Diatoms iron  Concentration"              unit="mol-C/L" />
29       <field id="DSi"      description="Sinking biogenic Silicate Concentration"  unit="mol-C/L" />
30       <field id="NFe"      description="Nano iron Concentration"                  unit="mol-C/L" />
31       <field id="NCHL"     description="Nano chlorophyl Concentration"            unit="mol-C/L" />
32       <field id="DCHL"     description="Diatoms chlorophyl Concentration"         unit="mol-C/L" />
33       <field id="NO3"      description="Nitrates Concentration"                   unit="mol-C/L" />
34       <field id="NH4"      description="Ammonium Concentration"                   unit="mol-C/L" />
35     </group>
36
37     <group id="diad_T" axis_ref="none" grid_ref="grid_T"> 
38       <field id="PH"       description="PH"                                       unit="-"           axis_ref="deptht" /> 
39       <field id="CO3"      description="Bicarbonates"                             unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
40       <field id="CO3sat"   description="CO3 saturation"                           unit="mol/L"       axis_ref="deptht" />
41       <field id="PAR"      description="Photosynthetically Available Radiation"   unit="W/m2"        axis_ref="deptht" />
42       <field id="PPPHY"    description="Primary production of nanophyto"          unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
43       <field id="PPPHY2"   description="Primary production of diatoms"            unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
44       <field id="PPZOO"    description="Primary production of microzoo"           unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
45       <field id="PPZOO2"   description="Primary production of mesozoo"            unit="mol-C/m3/s"  axis_ref="deptht" />
46       <field id="PBSi"     description="Primary production of Si diatoms"         unit="mol-Si/m2/s" axis_ref="deptht" />
47       <field id="PFeN"     description="Primary production of nano iron"          unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
48       <field id="PFeD"     description="Primary production of diatoms iron"       unit="mol-Fe/m3/s" axis_ref="deptht" />
49       <field id="Cflx"     description="DIC flux"                                 unit="mol-C/m2/s" />
50       <field id="Oflx"     description="Oxygen flux"                              unit="mol-C/m2/s" />
51       <field id="Kg"       description="Gas transfer"                             unit="mol-C/m2/s/uatm" />
52       <field id="DelC"     description="Delta CO2"                                unit="uatm" />
53       <field id="PMO"      description="POC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
54       <field id="PMO2"     description="GOC export"                               unit="mol-C/m2/s" />
55       <field id="ExpFe1"   description="Nano iron export"                         unit="mol-Fe/m2/s" />
56       <field id="ExpFe2"   description="Diatoms iron export"                      unit="mol-Fe/m2/s" />
57       <field id="ExpSi"    description="Silicate export"                          unit="mol-Si/m2/s" />
58       <field id="ExpCaCO3" description="Calcite export"                           unit="mol-C/m2/s" />
59       <field id="heup"     description="euphotic layer depth"                     unit="m" />
60       <field id="Fedep"    description="Iron deposition"                          unit="mol-Fe/m2/s" />
61       <field id="Nfix"     description="Nitrogen fixation"                        unit="mol-N/m2/s" />
62     </group>
63
64  </field_definition>
65
66<!-- file definition -->
67
68  <file_definition output_level="10" enabled=".TRUE.">
69   
70    <file id="PISCES_1y_ptrc_T" description="pisces sms variables" output_freq="31536000" output_level="5" >
71       <field ref="DIC"      />
72       <field ref="Alkalini" />
73       <field ref="O2"       />
74       <field ref="CaCO3"    />
75       <field ref="PO4"      />
76       <field ref="POC"      />
77       <field ref="Si"       />
78       <field ref="PHY"      />
79       <field ref="ZOO"      />
80       <field ref="PHY2"     />
81       <field ref="ZOO2"     />
82       <field ref="BSi"      />
83       <field ref="Fer"      />
84       <field ref="BFe"      />
85       <field ref="GOC"      />
86       <field ref="SFe"      />
87       <field ref="DFe"      />
88       <field ref="DSi"      />
89       <field ref="NFe"      />
90       <field ref="NCHL"     />
91       <field ref="DCHL"     />
92       <field ref="NO3"      />
93       <field ref="NH4"      />
94    </file>
95
96    <file id="PISCES_1y_diad_T" description="additional pisces diagnostics" output_freq="31536000" level="5" > 
97       <field ref="PH"       /> 
98       <field ref="CO3"      />
99       <field ref="CO3sat"   />
100       <field ref="PAR"      />
101       <field ref="PPPHY"    />
102       <field ref="PPPHY2"   />
103       <field ref="PPZOO"    />
104       <field ref="PPZOO2"   />
105       <field ref="PBSi"     />
106       <field ref="PFeN"     />
107       <field ref="PFeD"     />
108       <field ref="Cflx"     />
109       <field ref="Oflx"     />
110       <field ref="Kg"       />
111       <field ref="DelC"     />
112       <field ref="PMO"      />
113       <field ref="PMO2"     />
114       <field ref="ExpFe1"   />
115       <field ref="ExpFe2"   />
116       <field ref="ExpSi"    />
117       <field ref="ExpCaCO3" />
118       <field ref="heup"     />
119       <field ref="Fedep"    />
120       <field ref="Nfix"     />
121   </file>
122 
123  </file_definition>
124
125
126  <axis_definition> 
127     <axis id="deptht" description="Vertical T levels" unit="m" />
128     <axis id="depthu" description="Vertical U levels" unit="m" />
129     <axis id="depthv" description="Vertical V levels" unit="m" />
130     <axis id="depthw" description="Vertical W levels" unit="m" />
131     <axis id="none" description="axe non defini" unit="none" size="1" />
132  </axis_definition> 
133
134  <grid_definition>
135    <grid id="grid_T" description="grid T" />
136    <grid id="grid_U" description="grid U" />
137    <grid id="grid_V" description="grid V" />
138    <grid id="grid_W" description="grid W" />
139  </grid_definition>
140
141</context>
142
143</simulation>
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.